Agenae 3: l`expérience d`un partenariat public/privé exemplaire en

Agenae 3: l’expérience d’un partenariat public/privé
p
en g
génomique
q animale
exemplaire
C. Huyghe
yg
INRA, Directeur Scientifique Adjoint « Agriculture »
Président du GIS Agenae
g
ALIMENTATION
AGRICULTURE
ENVIRONNEMENT
Le partenariat d’Agenae 3
•
Dans l’univers de la recherche publique
–
–
–
–
•
Des partenaires privés structurés autour de filière
–
–
–
–
–
•
•
Inra
Cirad
Ifremer
IFCE
Apis-Gène
p
((filière bovine et p
petits ruminants))
Bioporc (filière porcine)
Agenavi (filière volailles)
Ci (filière
Cipa
(filiè piscicole)
i i l )
Fondation Hippolia (filière équine)
Une volonté forte d’irriguer
g
de façon
ç collective l’ensemble des
acteurs de chaque filière
Une volonté de favoriser les transversalités entre filières
ALIMENTATION
AGRICULTURE
ENVIRONNEMENT
Le contexte et les enjeux
•
Le développement de la génomique et de la biologie intégrative
– Des marqueurs
q
nouveaux disponibles
p
en g
grand nombre ((SNP))
– Des débits de marquage et de séquençage considérables, avec un effondrement
des prix
– Des capacités de stockage de données et de traitement de l’information
l information en
augmentation considérable
– Des capacités croissantes, mais à un rythme plus lent, de phénotypage d’un
nombre accru de caractères (de l’animal
l animal à sa valeur dans un système de
production)
– Une concurrence mondiale forte en génomique et en biologie moléculaire
•
La diversité génétique
– Exploiter la diversité génétique des populations en identifiant des variants
q
contribuant à la variabilité des caractères d’intérêt agronomique,
g
q , ou
alléliques
expliquant des tares
– Préserver la diversité des races (un patrimoine, une ressource pour le futur)
ALIMENTATION
AGRICULTURE
ENVIRONNEMENT
Les atouts d’Agenae 3: les acquis des deux phases
précédentes
•
Des résultats scientifiques remarquables. Citons
–
–
–
–
•
Connaissances de la structure des génomes
g
Création d’outils de génotypage et de génomique fonctionnelle
Découverte de gènes d’intérêt majeur
Mise au point d
d’une
une méthode de sélection génomique
Des ressources. Par exemple:
– Construction de matériels biologiques
gq
uniques
q
– Phénotypage de caractères biologiques complexes (qualité des viande)
– Collection d’ADN dans différentes espèces et de génotypage
•
I f t t
Infrastructures
ett compétences
ét
– Le Centre National de Ressources Génomiques pour les animaux
– Une plateforme
p
nationale de bioinformatique
q dédiée aux espèces
p
animales
• Une expérience de partenariat fructueux, entre les partenaires
g
d’Agenae
ALIMENTATION
AGRICULTURE
ENVIRONNEMENT
Agenae 3 a des cibles plus larges que les éditions
précédentes
é éd t
•
•
•
•
Poursuivre en génomique structurale et fonctionnelle
Poursuivre le travail de p
phénotypage
yp g de caractères d’intérêt
agronomique
Entreprendre des travaux sur le microbiote du système digestif
Prendre en compte explicitement la dimension Santé Animale
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AGRICULTURE
ENVIRONNEMENT
Des objectifs généraux ambitieux. Ils ne sont réalisables
qu’en
’ partenariat
t
i t
•
Faire progresser les connaissances fondamentales
– La structure et le fonctionnement des génomes
– L’épigenèse
– L
L’interaction
interaction génome de l’hôte
l hôte x microbiote digestif x nutriments
•
Créer des ressources uniques
– Biologiques et technologiques
– Données et bases de données en génomique animale
– Systèmes bioinformatiques
•
Stimuler l’activité
l activité économique et l’innovation
l innovation dans les entreprises
– Poursuivre et amplifier la formation des cadres des entreprises aux technologies
– Mettre à la disposition des filières les outils issus de la génomique
– Générer des activités innovantes dans les filières s’appuyant sur les acquis de la
recherche d’Agenae
•
Avoir une réelle ambition européenne vers la recherche universitaire
et les acteurs économiques
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AGRICULTURE
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Les atouts d’un partenariat public - privé
•
L’organisation d’Agenae permet d’explorer les 3 dimensions du
partenariat
– D’orientation: Prendre en compte de façon très précoce les demandes des
filières et intégrer ces enjeux dans les objectifs de la recherche
– De
D recherche
h h :C
Conduire
d i ett dé
développer
l
ensemble
bl d
des projets
j t ett d
des ressources
uniques (génotypage et phénotypage)
– De transfert : Favoriser l’appropriation et l’utilisation des résultats de recherche
par les professionnels, au bénéfice de l’activité économique
•
Accompagner les acteurs économiques pour anticiper les transitions
du secteur
– L’émergence de la sélection génomique modifie en profondeur la position des
différents acteurs et leur compétitivité
– La
L nutrigénomique
ti é
i
iinduira
d i aussii d
des changements
h
t majeurs.
j
•
Rechercher ensemble une position à l’international
– Le PEI (Partenariat Européen pour l’Innovation)
l Innovation) offre un cadre totalement
nouveau et des opportunités majeures
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ENVIRONNEMENT
Conclusions
•
•
•
Une agriculture doublement performante (performance économique
et respect de l’environnement) est un défi majeur qui exige des
progrès et de l’innovation
Le partenariat public/privé est la voie la plus rapide et la plus
efficace pour combiner excellence scientifique et efficacité de
transfert au service de l’innovation
Agenae 3, fort des acquis des éditions précédentes, permet de
poursuivre, d’élargir le champ des cibles (processus
physiologiques/espèces),
h i l i
/
è
) d’
d’avoir
i une vraie
i ambition
biti européenne,
é
tout en préservant un atout stratégique, la diversité génétique
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ENVIRONNEMENT
Merci de votre attention
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