Fiche d`offre de stage

Fiche d'offre de stage
Société :
Service :
Lieu du stage :
Adresse :
Code Postal :
Ville :
Nombre de salariés :
Activité principale :
Site Web :
Limagrain Europe
Biostatistique
Centre de Recherche de Chappes, La Garenne
Route d'Ennezat
63720
Chappes
Limagrain Europe ≈ 1400, Groupe Limagrain ≈ 8000
Sélection variétale et commercialisation de semences de grandes cultures
http://www.limagrain-europe.com/, http://www.limagrain.com/
Le Groupe Limagrain consacre 13% du CA professionnel (165 M€) à la recherche et emploie 1550
personnes en recherche, reparties sur ≈ 100 centres de recherche à travers le monde (dont 185
personnes en Auvergne). Le traitement et l’analyse des données sont une préoccupation majeure
pour la recherche Limagrain, et l'équipe biostatistique, actuellement composée d'une dizaine de
personnes, connaît une croissance soutenue depuis quelques années.
Sujet de stage :
Bio-informatique HPC : le calcul par le GPU NVIDIA Tesla K20X
Conçus à partir de l’architecture de calcul révolutionnaire NVIDIA Kepler™, les nouveaux
accélérateurs de calcul GPU Tesla K20X fournissent 90% des performances de Titan, le
superordinateur couronné le plus rapide à ce jour. Fournissant les performances de calcul les plus
élevées jamais disponibles sur un seul processeur, le modèle K20X surpasse tous les autres
processeurs selon deux mesures habituelles des performances de calcul : 3,95 téraflops en simple
précision et 1,31 téraflops en double précision virgule flottante.
Nous tirons parti des architectures des GPU NVIDIA pour accélérer de façon significative nos calculs
bioinfomatique. Pour ce stage nous proposons d’étudier et d’implémenter de certains algorithmes
très utilisés en génétique quantitative tels que le calcul de distances génétiques, linkage
disequilibrium et d’autres calculs matriciels et stochastiques (optionnel).
Le candidat sera intégré dans une équipe de haut niveau scientifique. Il sera initié aux technologies
industrielles dernier cri et aura l’opportunité de laisser s’exprimer sa créativité ainsi qu’approfondir
ses connaissances.
Le stage durera environ 6 mois, et déroulera au Centre de Recherche Limagrain Europe à Chappes. Il
sera rémunéré.
Profil recherché :







Etudiant en Master 2 ou en Ecole d’Ingénieur
Solide formation en informatique et en mathématiques appliquées
Intérêt pour la biologie et la génétique
Une bonne maîtrise de C/C++ et/ou Fortran serait appréciée
Connaissance de CUDA et/ou OpenAAC et/ou OpenCL sera un plus
Autonomie
Bon relationnel

Montant de la rémunération / indemnité mensuelle (en 2013, sujet à revalorisation) :
436€ nets + 440€ soumis à charges + 200€ si hors domicile habituel
Nom et fonction de la personne qui coordonne les stages :
Sylvie Gauthier, Assistante Ressources Humaines
Rue de la Vilaine
49250 Saint Mathurin sur Loire
Tél. : 02 41 79 61 36
Fax : 02 41 79 61 46
E-mail : [email protected]
Nom et fonction de la personne responsable de l'étudiant pendant le stage :
Vitaliy Feoktistov
Tél. : 04 73 67 87 72
E-mail : [email protected]