Diapositive 1 - Europole Mer
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Comparaison des mécanismes de virulence-résistance chez trois modèles d’interaction vibrions-mollusques. (VIVREM) (2009-2011) Jean-Louis Nicolas2 , Christine Paillard1 ,Franck Brulle 1 & 2, Mohamed Houmed Aboubaker 1 & 2, Stéphanie Madec et Masters LEMAR, IUEM-UBO-CNRS 2 LEMAR IFREMER Laboratoire de physiologie des invertébrés, Le but de ce projet était de caractériser les mécanismes moléculaires qui gouvernent les Vibrio tapetis interactions mollusques-vibrions en Ruditapes privilégiant les stades précoces philippinarum (attachements, les facteurs invasifs et les relations avec les hémocytes) Vibrions: approche génomique (génome) et protéomique pour rechercher les facteurs de virulence et mutagenèse dirigée Hôte: Carcatérisation de la réponse immunitaire par des banques SSH et sélection de gènes pour des essais en PCR en temps réels durant l’infection (Palourde et Ormeau) Vibrio harveyi Haliotis tuberculata Vibrio aestuarianus Crassostrea gigas Quelques caractéristiques Vibrio tapetis – Palourde Maladie progressive avec un attachement sur le periostracum Vibrio harveyi - ormeau Maladie très rapide (pas ou peu de portage sain) Vibrio aestuarianus – huître creuse Maladie rapide avec portage dans l’hémolymphe action d’une métalo-protéase Phagocytose Formation de biofilm Echappement à la Phagocytose Echappement à la Phagocytose Approche génomique Séqauençage des génomes Genome size (nt) GC% CDS Genomes Size GC% CDS Ribosomal operons Mobile elements ME/Mb Vibrio harveyi ORM4 5824241 Vibrio tapetis CECT 4600 5 630 933 Vibrio cholerae el tor (N16961) 4 033 464 Vibrio aestuarianus 02/041 3 916 050 44,80% 5671 I +II P1 5,8 Mb 8 Kb 43.64% 5417 I II pVT1 3.64 Mb 1.91 Mb 82.27 kb 47.43% 4006 42.91% 3693 44,8 5725 nd nd 14 nd 43.61 3484 5 43.63 1848 0 45.46 85 0 I 2.96 Mb 47.69 2830 8 18 2 29 57 11 3,1 25 8 30 1375 Publication comparaison des génomes II I II 1.07 Mb 3.31 Mb 0.61 Mb 46.91 1176 0 43.00 3121 3 42.45 572 0 14 13 67 24 4.7 13 20 39 Projet Vibrioscope (Génoscope Les facteurs de virulence e Adhésion flagelle pilus type IV, II, MSHA OmpU V. aestuarianus V. tapetis V. harveyi 41 23 43 60 62 15 >50 >50 >50 Défense capsule antigène 7 11 10 Enzymes Protéases lipase chitinase 31(5) 4(1) 1 19 (3) 15(6) 2 33(9) 6 (2) 8 Toxine hémolysines 6 10 3 Systèmes de secrétion type II 5 38 4 Type III Type IV Type V 4 3 6 8 3 Nombre de gènes impliqués Les systèmes de secrétion Outer membrane periplasmic Inner membrane Approche protéomique: Comparaison des secrétomes Secrétome: protéines à l’extérieur de la cellule sous frme libre ou de vésicules 90 80 OMP other enzyme Lipoprotein Transporters flagella Other 77 70 60 50 Catabolism Unknown exp 46 40 30 16 20 10 Séparation par électrophorèe 1D Publication en cours de rédaction Stéphanie Madec 0 V. aestu Protéases Lipase Omp common OmpU prc V. tapetis Chitinase Omp Mutagenèse dirigée plasmide portant le gène muté et contenant un gène suicide CmR LGP32 ccdB ccdB Zoë + Glu + Ara - V. tapetis La souche mutante djlA- a complétement perdu son activité cytotoxique. -Transfert du gène de la métalloprotéase de V. aestuarianus chez V. tasmaniensis les ECPs sont devenus toxiques - Conjugaison réussie avec les 3 vibrions pour transférer le plasmide contenant la GFP (Green Fluorescent Protein) - mutagenèse en cours chez V. harveyi Publication Mohamed Houmed et coll, 2012 in veterinary microbiology Les voies d’entrée du pathogène Vibrio aestuarianus et V. tapetis chez l’huître creuse. V. tapetis palourde Adhésion Par les pilis sur la lame périostracale vibrions dans l'hémolymphe de C. gigas après 1H et 5H 1,E+06 1,E+05 1,E+04 Dépôt de conchyoline 1H 1,E+03 5H 1,E+02 1,E+01 1,E+00 V. aes 02/41 Affaiblissement baisse des défenses pénétration V. aes 01/308 V. tapetis Balnéation avec 105 bact/mL d’eau de mer Pénétration bord du manteau ? Relation hémocytes-bactéries • Test de phagocytose par immuno-marquage :V. tapetis • Hémocytes avec bactéries en marquage FITC (vert) et Phycoérythrine (rouge) + Saponine pourcentage de bacteries marquées % Immunomarquage bactérien 100 FL1 80 FL2 60 40 20 0 Cells Cells surnageantes adherentes Publication en cours hémocyte de palourde Relation hémocytes-bactéries • Test de phagocytose par immuno-marquage :V. tapetis Persistance de V. tapetis dans les hémocytes : perte des pseudopodes, inhibition de la production d’oxyde nitrique, … Pour V. aestuarianus et V. harveyi Pas de reconnaissance, pas d’adhésion, pas de phagocytose Quel mécanisme actif ou passif? Expression des gènes Banque SSH hémocytes en cours Palourde Ormeau Banque SSH hémocytes établie huître creuse Banque d’EST Julien de Lorgeril 1) in vitro exposure of Ruditapes philippinarum hemocytes to V. tapetis ( palourde) Sélection de 20 gènes dont une partie en commun puis mise au point qPCR Coll Arnaud et 2) in vivo exposure of clams by injection of pathogenic V. tapetis strain in their pallial cavity Hemolymph collection. Then 3h exposure to Vibrio tapetis. To 1 day 14 days 6 weeks At the end of each exposure period, mantle edge were collected in control (n=20) and infected clam (n=20) clams Control : Hemocytes with Sterile sea water Infected : Hemocytes with V. tapetis SSH Identification of differentially expressed genes SSH Identification of differentially expressed genes Expression des gènes ( palourde) * 3 2,5 2 1,5 1 0,5 0 SSW Vt Vt ECP SSW dead Vt SSW Génes liés à la synthèse du cytosquelette et à l’apoptose -Activation de la Beta-actin , Beta-cell, thymosin, translocation cytochome P450,stimulés chez les hémocytes des palourdes infectés par V. tapetis - Inhibition de la matrix Metalloproteinase … Publication F. Brulle et al. Vs Bilan Deux post-docs: -Franck Brulle (12 mois) -Stéphanie Madec (6 mois) Trois doctorants : -Mohamed Houmed (V. aestuarianus) -Fanny Jeffroy, (V. tapetis) -Marie Agnès Travers (V. harveyi) des Masters Des techniciennes: Nelly le Goïc, Adeline Toffin 5 publications: Publis Travers Marie-Agnes; Meistertzheim Anne-Leila; Cardinaud Marion; et al. (2010) Gene expression patterns of abalone, Haliotis tuberculata, during successive infections by the pathogen Vibrio harveyi.JOURNAL OF INVERTEBRATE PATHOLOGY Volume: 105 Issue: 3 Pages: 289-297 DOI: : Erauso, G , Lakhal, F ; Bidault-Toffin, A 3; Le Chevalier,; Bouloc, P; Paillard, C; Jacq.(2011)<. Evidence for the Role of Horizontal Transfer in Generating pVT1, a Large Mosaic Conjugative Plasmid from the Clam Pathogen, Vibrio tapetis.PLOS ONE Volume: 6 Issue: 2 Jeffroy Fanny; Paillard Christine.Involvement of nitric oxide in the in vitro interaction between Manila clam, Ruditapes philippinarum, hemocytes and the bacterium Vibrio tapetis FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY Volume: 31 Issue: 6 Pages: 1137-1141 Franck Brulle, Fanny Jeffroy, Stéphanie Madec, Jean-Louis Nicolas, Christine Paillard (2012) Transcriptomic analysis of Ruditapes philippinarum hemocytes reveals cytoskeletondisruption after in vitro Vibrio tapetis challengeDevelopmental & Comparative Immunology 10.1016/j.dci.2012.03.003 Mohamed Houmed Aboubaker, Justine Sabrié1, Jean-Louis Nicolas, and Marcel Koken Establishment of stable GFP-tagged Vibrio aestuarianus strains for the analysis of bacterial infection-dynamics in the Pacific oyster, Crassostrea gigas. (en révision, Vétérinary microbiology) .