M2 Sc Genome GGS - Université Evry Val d`Essonne

MASTER M2
2013 - 2014
Mention Sciences du Génome et des
Organismes
M2 : Spécialité Génomique et Génétique Statistique
Recherche ou Professionnalisant
BAC + 1 2 3 4 5
1. Editorial du responsable
L’identification des facteurs génétiques à l’origine des
maladies fréquentes dans les populations (cancers,
maladies cardio-vasculaires, …) a pris un nouvel essor
suite à l’émergence des technologies de génotypage à
haut débit qui permettent de disposer de milliers de
données génotypiques sur des milliers de sujets. Cette
révolution technologique nécessite en parallèle le
développement et l’application de méthodologies
statistiques et de programmes informatiques capables
d’appréhender cette quantité massive de données.
L’objectif de la spécialité Génomique et Génétique
Statistique est de former les étudiants au domaine de
la génétique statistique pour répondre à ces nouveaux
besoins.
Cette spécialité est co-habilitée avec la Faculté de
Médecine Paris-Sud, l’Université Paris-Descartes et
l’Université Paris-Diderot et en partenariat avec
l’Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et
l’Université Pierre&Marie Curie.
2. Organisation des études
La formation est semestrielle et organisée en Unités
d’Enseignements (UE) compensables et capitalisables.
Les UE sont dispensées principalement au premier
semestre. Selon l'orientation à visée professionnelle
ou de recherche, les étudiants définiront leurs
parcours parmi les différentes UE proposées. La
plupart des UE comportera une partie de Travaux
Dirigés sur machines.
• Pour les étudiants ayant choisi le parcours
professionnalisant, l’objectif est l’acquisition
des concepts méthodologiques du domaine et
leurs applications au domaine biomédical.
• Pour les étudiants ayant choisi le parcours
recherche, l’objectif est l’acquisition des
concepts méthodologiques du domaine de la
Génétique Statistique, associant les
développements particuliers liés à la génomique
et à la génétique épidémiologique, dans une
optique de futurs travaux propres de recherche.
Domaine :
Sciences et Ingénierie
Mention :
Sciences du Génome et des
Organismes
Spécialités de la mention:
> Génomique et Génétique
Statistique (GGS)
Responsable Mention :
Bruno COLOMBO
Mèl : [email protected]
Responsables M2 GGS:
Valérie CHAUDRU
Mèl : [email protected]
Marie-Luce TAUPIN
Mèl: [email protected]
Contacts :
Scolarité :
Aurélie DEKONINCK
Tél. : 01 64 85 34 13
Mèl : [email protected]
Formation Continue :
Sylvie BARREAU
Tél. : 01 69 47 70 67
Fax : 01 69 47 71 05
Mèl : [email protected]
Conseils sur votre Orientation
PIOLE
Bâtiment Maupertuis
Rue du Père Jarlan
91025 EVRY CEDEX
Tél. : 01 69 47 76 17
Mèl : [email protected]
Le second semestre est dédié au stage qui sera effectué
dans un des laboratoires agréés pour la spécialité.
PIOLE (Pôle d’Information et d’Orientation des Lycéens et des Etudiants) - 01 69 47 76 17 - [email protected]
30/10/2012 - 1
Les enseignements théoriques seront validés à partir d’épreuves écrites ou de projets
correspondant aux modules
enseignés. À la fin du stage, l'étudiant devra rédiger un mémoire. La soutenance du
mémoire sera publique.
A l’issue de ce Master et selon le parcours choisi (« recherche » ou « professionnalisant »),
les diplômés seront capables de développer de manière autonome un projet de recherche ou
de prendre en charge des analyses statistiques en génomique et génétique grâce aux
enseignements théoriques dispensés et aux enseignements permettant la pratique les
logiciels d’analyse génétiques. Les diplômés auront également acquis les bases nécessaires
pour développer des méthodes statistiques nouvelles permettant d'appréhender au mieux
les informations issues des biotechnologies de la génomique.
3. Conditions d’admission
Les inscriptions en M2 se font à la suite d’une sélection sur dossier. Le dossier est à
télécharger sur le site de l’UEVE (www.univ-evry.fr).
Date limite de retour des dossiers : mi-juin 2013
•
Conditions d’accès :
- Étudiants titulaires du M1 Biologie et Génome de l’UEVE ou de tout autre M1 de Biologie
jugé équivalent.
- Étudiants titulaires d'unités d'enseignement en Mathématiques Appliquées, Biostatistique,
Épidémiologie, Génétique des populations, Génétique formelle et quantitative constitutives
d’un Master (M1).
- Etudiants en dernière année d’une École d’ingénieur (ISUP, ENSAI, ENSAE, Institut
National d’Agronomie, ENS,…).
- Etudiants titulaires de diplômes jugés suffisants par le comité de Master.
La validation d’UE jugées équivalentes au sein d’autres mentions de Masters, permettra,
après avis de l’équipe de formation, d’accéder au M2 en vue de l’acquisition de la spécialité
de la mention de Master.
4. Organisation des enseignements
L'enseignement est accessible par un ou plusieurs parcours de type « recherche » ou
« professionnalisant ». Ces parcours seront individualisés selon la formation initiale de
l'étudiant. Chaque parcours nécessitera l’approbation de l’équipe pédagogique.
La formation comportera trois parties :
- Un ensemble de « Mises à niveau » : enseignées sur 3 semaines et proposées aux
étudiants au début du premier semestre selon la formation initiale.
- Un ensemble de « Modules de cours » : enseignés principalement sur le premier semestre
- Un stage dans un laboratoire d'accueil du M2. Le sujet du stage est défini en accord avec
les responsables de la spécialité. Le stage se déroule durant le second semestre.
Eléments
Unités
constitutifs de l’unité
d’enseignement
d’enseignement
Obligatoire
1er semestre du M2
Option
CM
TD
UE0c 1 : Génétique
X
17
6
UE0c 2 : Statistique
X
12.5
12
X (P ou
12.5
12
UE 0 : Mise à
niveau
UE 1 : UE de choix
et programmation
en R (6 ECTS)
UE1c 1 :
PIOLE (Pôle d’Information et d’Orientation des Lycéens et des Etudiants) - 01 69 47 76 17 - [email protected]
30/10/2012 - 2
Bioinformatique
UE1c 2 :
Programmation en R
UE1c 3 : Réseaux
bayésiens pour
l'analyse statistiques de
données postgénomiques
UE1c 4 : Génomique
fonctionnelle -Proteome
R)
X
12.5
12.5
X (P ou
R)
12.5
12
X (P)
15
10
UE 2 : Statistique
Mathématique (3
ECTS)
U2c1 : Statistique
Mathématique
x
16
4
UE3c 1 : Etudes
d’association génétique
X
16
4
UE4c 1 : Génétique
des populations
X
16
4
UE5c 1 : Génétique
quantitative et formelle
X
16
4
UE6c 1 : Analyse de
liaison génétique
X
16
4
UE7c 1 : Logiciel
d’analyse génétique
X
UE 3 : Etudes
d’association
génétique (3 ECTS)
UE 4 : Génétique
des populations (3
ECTS)
UE 5 : Génétique
quantitative et
formelle (3 ECTS)
UE 6 : Analyse de
liaison génétique (3
ECTS)
UE 7 : Logiciel
d’analyse génétique
(3 ECTS)
15
UE 8 : UE de
spécialisation (pro
ou recherche - 2
UEc) (6 ECTS)
UE8c 1 : Modélisation
UE8c 2 : Génétique
Médicale
UE8c 3 : Recherche
biomédicale et
génomique statistique Projets
UE8c 4 :
Epidémiologie
quantitative
2ème semestre du M2
UE 9 : Stage (30
ECTS)
UE9c 1 : Stage
X (R)
15
2
X (P)
X (R)
15
2
X (P)
X (R)
15
2
X (R)
12
6
X
≈ 6 mois
Note: P = parcours professionnalisant ; R = parcours recherche
CM : Cours Magistraux - TD : Travaux Dirigés
PIOLE (Pôle d’Information et d’Orientation des Lycéens et des Etudiants) - 01 69 47 76 17 - [email protected]
30/10/2012 - 3
5. Partenaires de la formation
> Les laboratoires de recherches et partenaires académiques
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Laboratoire "Statistique et Génome" (UMR CNRS 8071) - Evry
GenHotel - Laboratoire de Recherche Européen pour la Polyarthrite Rhumatoïde - Evry
INSERM U 946 "Variabilité Génétique et Maladies Humaines" – Paris
INSERM U669 "Troubles du comportement alimentaire de l'adolescent" - Villejuif
INSERM U 550 "Génétique Humaine des Maladies Infectieuses" – Paris
INSERM
U937Génétique
épidémiologique
et
moléculaire
des
pathologies
cardiovasculaires – Paris
INSERM U 900 - Mines Paris Tech-Institut Curie, "Cancer et Génome :
Bioinformatique, Biostatistiques et Epidémiologie d’un Système Complexe" – Paris
INSERM U 558 "Épidémiologie et Analyses en Santé Publique : Risques, Maladies
chroniques et Handicaps" – Toulouse
INSERM U 563, Département de Génétique – Toulouse
> Les Professionnels
•
Centre National de Génotypage (Développement Technologique ou Statistique
Génétique)- Evry
• Département Communications Images et Traitement de l'Information (Telecom and
Management Sud Paris) – Evry
• Sanofi-Aventis (Centre de Génétique) – Evry
• Laboratoire Roche (Génétique statistique)
L'ouverture prochaine de l'Hôpital Sud Francilien et du centre de recherche en thérapies
géniques et cellulaires qui lui sera "adossé" permettra d'associer de nouveaux laboratoires
de stage.
6. Modalités de professionnalisation et débouchés
> Stages
La durée du stage est équivalente à 6 mois temps plein. Il se déroule au second semestre
dans un laboratoire de recherche agréé par le Master. Le sujet du stage est défini en accord
avec les responsables de la spécialité et selon le parcours « recherche » ou
« professionnalisant ».
Le stage donne lieu à la rédaction d'un mémoire et à une
soutenance devant le jury de la spécialité.
>Poursuite d’études en Doctorat
Les étudiants se destinant aux métiers de la recherche ou de l’enseignement pourront
préparer un doctorat au sein de l’école doctorale 423 « Des génomes aux organismes »
(conjointe entre l’UEVE et Versailles Saint Quentin), de l’école doctorale 420 « Santé
Publique » (Paris-Sud, Paris-V), mais également au sein d’autres écoles doctorales
auxquelles sont rattachés certains laboratoires (i.e. « Diversité du vivant » ED 392 (Paris
6,co-accrédité Paris 7) associés à la spécialité.
>Métiers possibles à l’issue du Master
Pour le parcours « Recherche » : l’évolution professionnelle pourra se faire en tant que
chercheur ou enseignant-chercheur de niveau au sein d’équipes reconnues de l’Université,
des EPST ou d’organisme international de recherche.
Pour le parcours « professionnalisant », l’objectif est de former les cadres de l’investigation
et de l’expertise dans le domaine de l’analyse de données de génomique et de génétique
dans l’industrie pharmaceutique, les sociétés de service, les sociétés de biotechnologies, les
plate-formes de Biotechnologies publiques ou privées.
> La PAE
PIOLE (Pôle d’Information et d’Orientation des Lycéens et des Etudiants) - 01 69 47 76 17 - [email protected]
30/10/2012 - 4
L’Université d’Evry-Val-d’Essonne a été parmi les premières universités à mettre en place une
interface avec le monde socio-économique, la Plateforme d’Accès à l’Emploi (PAE), dont les
missions :
- suivre
l’insertion professionnelle des diplômés via des analyses qualitatives et
quantitatives d’enquêtes réalisées auprès d’anciens étudiants,
- assurer les relations avec les entreprises -structures publiques et privées- pour relier
formations, métiers et compétences mais aussi réfléchir sur les emplois de demain
- développer les actions de préparation des étudiants à l’insertion professionnelle,
concourent à une meilleure employabilité de ses diplômés.
En tant qu’étudiant de l’université, vous pouvez bénéficier dans votre cursus d’un
accompagnement personnalisé de la PAE pour la structuration de votre projet professionnel
et pour la recherche de stages qui font partie intégrante de votre formation.
La PAE assure également l’organisation :
- de conférences pour vous faire découvrir le monde économique et l’entreprenariat,
- de forums où des représentants d’entreprises vous reçoivent individuellement afin
vous faire connaître les attentes et besoins en compétences des entreprises.
7. Informations pratiques
Pour continuer à vous informer, conforter votre orientation, valider vos choix, venez nous
rencontrer :
> Sur la page perso du M2IF: www.univ-evry.fr/m2if
> Au Pôle d’Information et d’Orientation des Lycéens et des Etudiants (Bâtiment
Maupertuis) pour toutes informations sur l’orientation, les métiers, les parcours, etc.,
> Lors de la Journée Portes Ouvertes, en février, pour une première approche concrète de
l’Université, des rencontres avec les enseignants, et les étudiants,
> Sur les salons (Salon de l’étudiant, de l’éducation, des Masters, APB).
N’oubliez pas de consulter régulièrement notre site internet pour toutes les actualités et les
dates des évènements vous concernant :
www.univ-evry.fr
L’Université d’Evry-Val-d’Essonne est une université à taille humaine de 10 000 étudiants et
accessible par un grand nombre de moyens de transport.
Pour s’y rendre :
Voie ferrée : SNCF, RER Ligne D, station Evry-Courcouronnes, RER Ligne C avec changement
à Juvisy sur Orge.
Voie routière : Autobus TICE et ALBATRANS, arrêt Gare Evry-Courcouronnes.
Voiture : A partir de Paris, prendre l’A6 et suivre la direction Evry-Courcouronnes (N104)
puis sortir à Evry-Courcouronnes (sortie 36) et suivre Evry centre.
PIOLE (Pôle d’Information et d’Orientation des Lycéens et des Etudiants) - 01 69 47 76 17 - [email protected]
30/10/2012 - 5