12. Extraction des données

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Extraction des données
L’extraction des données a un double but :
1. la description des caractéristiques des essais : méthodologie, traitements et
populations,
2. l’obtention des données nécessaires à l’estimation de l’effet traitement cumulé.
12.1. Réalisation pratique
L’extraction des données doit s’appuyer sur une fiche de recueil préétablie d’après
le protocole. Elle peut intégrer la liste de contrôle nécessaire à la phase précédente
de sélection. De ce fait, la distinction théorique faite précédemment entre ces deux
phases disparaît, et elles deviennent simultanées en pratique.
Au moins deux lecteurs participeront à l’extraction des données en appliquant la
procédure décrite pour la phase de sélection.
La constitution de la fiche de recueil est délicate. La tendance est de la faire trop
détaillée, donc trop lourde à utiliser, surtout quand le nombre d’essais est grand.
Une étude pilote pour tester cette fiche et les critères de sélection est parfois nécessaire sur un petit échantillon d’essais tiré au hasard. L’étude pilote permet aussi
de mettre en évidence des divergences d’interprétation entre les lecteurs. Ces divergences seront supprimées par un travail de standardisation, avec la production d’un
document précisant le sens de chaque item de la fiche.
Une fiche de recueil informatisée grâce à un gestionnaire de base de données sur
micro ordinateur peut remplacer un support papier traditionnel. Cette solution présente l’avantage de faciliter ensuite la manipulation des données pour la suite de la
méta-analyse. Des logiciels standards de gestion de base de données sont utilisables
pour cette application, ainsi que des développements spécifiques comme le logiciel
RevMan de la Collaboration Cochrane.
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12.2. Exemple de fiche d’extraction
A titre d’exemple nous présentons à la fin de ce chapitre une fiche type d’extraction
de données. Les éléments recueillis dans ce type de fiche dépendent fortement du
domaine de la méta-analyse et il n’existe pas de fiche universelle.Une difficulté rencontrée dans la mise au point de ces fiches est d’éviter de recueillir trop de données
qui ne seront pas exploitées par la suite. Cette inflation, même si elle part d’une
bonne intention, qui est de ne pas oublier de recueillir une information pertinente,
entraîne une lourdeur d’utilisation pouvant être parfois rédhibitoire.
12.3. Confirmation des données
Les données extraites doivent être confirmées auprès des investigateurs des essais
pour plusieurs raisons :
– Les erreurs typographiques sont plus fréquentes qu’on peut l’imaginer. Ces
erreurs sont parfois évidentes quand une somme de pourcentages ne fait
pas 100% ou lorsqu’il existe des discordances entre plusieurs parties de la
publication. Mais la plupart du temps, ces erreurs ne sont pas détéctables et
ne seront corrigées que par les auteurs de la publication. Parfois, les auteurs
font paraître un erratum. Ces errata sont signalés par MEDLINE et doivent être
impérativement consultés.
– Des données complémentaires ne figurant pas dans la publication peuvent
être spécifiquement demandées aux investigateurs (par exemple un critère de
jugement ou un sous-groupe). Ceci est particulièrement utile lorsque l’objectif
de la méta-analyse diffère de celui des essais. De plus la correspondance directe
avec les investigateurs permet d’essayer d’obtenir des données en intention de
traiter si la publication ne les mentionne pas. Pour une étude de mortalité par
exemple, le devenir de certains patients perdus de vue au moment de l’analyse a
pu être obtenu ultérieurement par les investigateurs et récupéré à cette occasion.
– Le contact direct avec les investigateurs débouche parfois sur la constitution
d’un groupe collaboratif autour de la méta-analyse, apportant des échanges
d’idées constructifs. Par exemple, certains investigateurs connaissent des
travaux non publiés ou en cours. Une retombée possible est la constitution d’un
groupe de travail pour une méta-analyse sur données individuelles.
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