Compte rendu bactériologie moléculaire 161 \(EN.CRBACM
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Compte rendu bactériologie moléculaire 161 \(EN.CRBACM
COMPTE RENDU : n°161 EEQ : Bactériologie Moléculaire Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrhoeae Centre Toulousain pour le Contrôle de qualité en Biologie clinique Association déclarée à la Préfecture de la Haute-Garonne le 30 Octobre 1973 et enregistrée sous le n° W313002633 CTCB - 33 route de Bayonne - 31300 TOULOUSE ℡ : 05 34 51 49 80 – Fax : 01 57 67 25 90 Email : [email protected] – site Internet : www.ctcb.com Siret : 428 789 853 000 28 – APE : 8559A Date d’édition : 12/05/2016 Statut du document : Définitif PROGRAMME GÉRÉ PAR LE CTCB ET MUTUALISÉ AVEC L’ASSOCIATION BIOLOGIE PROSPECTIVE (BP). Expert biologiste Coordonnateur des programmes Sérologie infectieuse Dr C. DELMAS [email protected] Dr S. ALBAREDE Pharmacien Biologiste [email protected] Vérification du contenu scientifique et autorisation du rapport d’essai d’aptitude Signature numérique de Stéphanie ALBAREDE Date : 2016.05.12 15:55:12 +02'00' Documentation Le compte rendu comporte les éléments suivants : - Une partie commune pour tous les laboratoires : Pages explicatives : présentation du programme, présentation d’évaluation des laboratoires et informations générales, Exploitation statistique, Commentaire éventuel sur les réponses des participants. - du système Une partie propre à chaque laboratoire « Résultats individuels » en annexe 1 : Résultats du laboratoire Evaluation de la performance du laboratoire Sommaire 1. 2. 3. 4. 4.1 4.2 Présentation du programme d’inter-comparaison Détermination de la notation du laboratoire Réponse attendue Analyse des résultats et commentaires Chlamydia trachomatis Neisseria gonorrhoeae page 2 page 2 page 2 page 2 page 2 page 4 Compte rendu Bactériologie Moléculaire : Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrheae 161 Campagne 2016 EN.CRBACM.12.05.16 Page 1 sur 5 1 - PRESENTATION DU PROGRAMME D’INTERCOMPARAISON Expert du programme : Mme DELMAS, Service de Bactériologie - Hygiène, CHU Toulouse - Institut Fédératif de Biologie, [email protected] Ce programme comprend 2 opérations annuelles avec 2 échantillons par envoi. Ces échantillons sont préparés à partir des tubes de cobas*PCR media de patients. INFORMATION : Les échantillons sont préparés et testés par notre sous-traitant, le laboratoire de Bactériologie - Hygiène du CHU de Toulouse (IFB Purpan), selon les modalités internes (procédures et modes opératoires disponibles sur demande). Les échantillons sont ensuite acheminés au CTCB pour l’emballage et l’expédition. Tous les essais réalisés permettent de : • • • vérifier l’homogénéité des échantillons au sein d’un même lot, vérifier la stabilité des échantillons afin de garantir qu’ils ne subiront pas de modifications significatives tout au long de l’essai, déterminer les valeurs assignées. 2 - DETERMINATION DE LA NOTATION DU LABORATOIRE Le système de notation qualitatif repose sur l’échelle d'évaluation suivante : • A = Réponse attendue • B = Réponse acceptable • C = Réponse à analyser par le laboratoire • D = Réponse erronée Le résultat attendu est la valeur transmise par l’expert selon le protocole qu’il a défini. Cette valeur est confirmée après l’exploitation des résultats des adhérents : elle devient alors la valeur assignée. 3 – REPONSE ATTENDUE Recherche de l’ADN de Chlamydia trachomatis et/ou de Neisseria gonorrhoeae dans un prélèvement génital (tout prélèvement excepté les urines). Réponse attendue : Chlamydia trachomatis : Recherche positive. Neisseria gonorrhoeae : Recherche positive. 4 - ANALYSE DES RESULTATS ET COMMENTAIRES 1. Chlamydia trachomatis – Echantillon 1611 : Traitement statistique qualitatif : Compte rendu Bactériologie Moléculaire : Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrheae 161 Campagne 2016 EN.CRBACM.12.05.16 Page 2 sur 5 Traitement statistique qualitatif par trousse : Très bons résultats: 99,6% (236/237) des participants qui ont rentré un résultat ont donné la réponse exacte. Un laboratoire (1,7%) a rendu négatif à tort, seul à avoir utilisé cette technique (voir tableau des résultats par technique). Deux biologistes ont répondu "non réalisé" sans préciser la raison. Ce contrôle de recherche directe de Chlamydia trachomatis est proposé sans scénario, le prélèvement génital n’étant pas identifié pour pouvoir être traité par le maximum de trousses. Compte rendu Bactériologie Moléculaire : Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrheae 161 Campagne 2016 EN.CRBACM.12.05.16 Page 3 sur 5 2. Neisseria gonorrhoeae – Echantillon 1612 : Traitement statistique qualitatif : Traitement statistique qualitatif par trousse : Excellents résultats, 100% de réponses exactes (197/197) pour ceux qui ont rendu un résultat. Trois participants ont répondu ininterprétable: deux avec la trousse CEPHEID GeneXpert CT/NG (63/65 réponses positives avec cette trousse); un avec la trousse ABBOTT-Real Time CT/NG (25/26 réponses positives avec cette trousse), ce laboratoire a trouvé positif pour Chlamydia trachomatis et Neisseria gonorrhoeae dans le tube 1611 mais pas d’amplification pour Neisseria gonorrhoeae dans le tube 1612. Je n'ai pas d'explication étant donné que tous les tubes contenaient le même échantillon. On peut cependant exclure une incompatibilité échantillon et réactif, étant donné le Compte rendu Bactériologie Moléculaire : Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrheae 161 Campagne 2016 EN.CRBACM.12.05.16 Page 4 sur 5 nombre de laboratoires ayant rendu un résultat positif avec les réactifs pour lesquels sont observés les trois résultats ininterprétables. Nous incorporerons dans notre listing les nouvelles trousses employées. Nous vous remercions pour votre participation, si vous avez des questions ou des suggestions vous pouvez me contacter par mail : [email protected] Rédaction : Dr. Catherine DELMAS Laboratoire de Bactériologie Hygiène CHU de Toulouse - Institut Fédératif de Biologie --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PS : Ces documents doivent être archivés selon la réglementation en vigueur. Pour tout renseignement : COORDONNATEUR / BIOLOGISTE : Stéphanie ALBAREDE - [email protected] ADMINISTRATIF : Marie-Christine ONDERBEKE, Tél. : 05.34.51.49.80 - Fax : 01.57.67.25.90 - [email protected] TECHNIQUE : Delphine GARIMBAY, Tél. : 05.34.51.49.81 - [email protected] QUALITE : Erick SANCHEZ, Tél. : 05.34.51.49.82 - [email protected] INFORMATIQUE : Philippe GONZALVO - [email protected] Information : Les essais d’homogénéité et de stabilité se sont avérés conformes aux modalités décrites dans la procédure de contrôle. Les documents utilisés pour réaliser ce programme d’intercomparaison (préparation des objets d’essai, détermination des valeurs indicatives et assignées, traitement statistique, …) sont disponibles sur demande auprès du CTCB. L’interprétation de ces résultats ne doit pas se faire isolément et doit être rapprochée de ceux obtenus lors des autres opérations de contrôle effectuées dans le cadre de l’évaluation interne et de l’évaluation externe du laboratoire. Compte rendu Bactériologie Moléculaire : Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrheae 161 Campagne 2016 EN.CRBACM.12.05.16 Page 5 sur 5