Connotea - URFIST de Lyon

2Collab – Bibsonomy – citeulike – Connotea
LARDY Jean-Pierre
URFIST de LYON - UCBL
http://urfist.univ-lyon1.fr DADI : http://dadi.enssib.fr
Maj : mai 2010
CiteUlike, Connotea, BibSonomy et 2collab sont un type particulier de services de
bookmarking social, d’aide à la gestion de collections de références bibliographiques.
Gratuits, il s utilisent le principe du "social bookmarking" dont le plus connu est Delicious,
pour aider les chercheurs à conserver et partager leurs références bibliographiques.
Ces services ne gèrent pas le texte intégral des articles.
De plus en plus de plateformes de journaux électroniques
proposent des boutons pour récupérer les références d’articles :
exemple d’edpSciences.
Les utilisateurs peuvent décrire les ressources avec des mots-clés
arbitraires, appelés tags ou étiquettes. Ces services ne sont pas interfacés avec les logiciels de
traitement de texte mais on peut utiliser Zotero comme intermédiaire.
Nom
2collab
BibSonomy
CiteULike
Connotea
Origine
Elsevier
Université de Kassel
Oversity Ltd Springer
Nature Publishing
Date de lancement
Nov 2007
Jan 2006
Nov 2004
Déc 2004
Coût
Gratuit
Gratuit
Gratuit
Gratuit
Open
Non
Oui
Non
Oui
Volumétrie
Nom
2collab
BibSonomy
CiteULike
Connotea
références signets
références signets
références
références signets
Vus par Google
22 400
366 000
565 000
56 200
Vus par Exalead
annoncé
73 000
166 350
71 500
1 970 000
L’importation de signets est facilitée par la possibilité d’installer des plugins dans le
navigateur.
Nom
2collab
BibSonomy
CiteULike
Connotea
http://www.2collab.com/addtocollabFF?version=3
http://www.bibsonomy.org/help/basic/buttons
http://www.citeulike.org/post
http://www.connotea.org/bookmarklets
LARDY Jean-Pierre
URFIST de LYON
1
2collab
http://www.2collab.com
Lancé par Elsevier en novembre 2007.
2Collab permet aux chercheurs de :
 stocker, gérer et partager des références et des signets de pages web
 naviguer et rechercher des signets d'autres experts
 découvrir, évaluer et initier des contacts avec d'autres utilisateurs 2collab
 exporter et importer des signets / références depuis EndNote et RefWorks
 utiliser le bouton de navigation 2collab
Les signets (références) individuels peuvent être ajoutés manuellement ou en utilisant le
bouton 2collab installé sur les navigateurs des utilisateurs ou des sites de ressources qui
signalent les articles de Scopus ou ScienceDirect. Habituellement, les utilisateurs doivent
entrer des informations supplémentaires. Toutefois, lorsqu'un signet est enregistré à partir
d'une référence complète de Scopus ou ScienceDirect, toutes les informations de référence
sont récupérées automatiquement. Les signets peuvent être rendus publics ou privés. L’auteur
peut être indiqué si les utilisateurs sont les auteurs ou les coauteurs du contenu d'un signet des
ressources, et un lien sera affiché dans leur profil.
2collab permet de créer une liste de références formatée (Export  Create bibliography)
selon le style souhaité (11) au format html.
Tout le monde peut imprimer ou créer un fil RSS à partir d’une liste de signets. Seuls les
utilisateurs enregistrés peuvent envoyer par mail, exporter, supprimer ou partager des signets
sélectionnés avec des groupes.
Limites
 Les utilisateurs doivent se connecter à 2collab pour la recherche de favoris. Les
recherches sont limitées aux titres des bookmarks, groupes ou utilisateurs.
 La page d'aide s'affiche dans une fenêtre pop-up et en format de trame, il est difficile
d'imprimer une section particulière de l'aide.
 Une note sur un signet ne peut pas être changée une fois qu'elle est votée.
 Les performances du serveur sont médiocres.
LARDY Jean-Pierre
URFIST de LYON
2
Bibsonomy
http://www.bibsonomy.org
Outil gratuit en ligne, développé à l’Université de Kassel, très lié à l’environnement de
publication LateX. BibSonomy gère séparément des signets et des références
bibliographiques.
Options d’importation :
Ex : Firefox ; Zotero (format BibTex) ; données venant de Delicious
On dispose de 2 boutons à installer dans le navigateur :
 postPublication pour importer une référence d’article
 postBookmark pour enregistrer un signet de page web
A chaque import, BibSonomy vérifie si la référence de la publication contient un DOI. Si tel
est le cas, un "DOI-link" est automatiquement créé dans la liste des publications. Si ce n'est
pas le cas, le nom DOI peut être inséré dans les champs "Divers". L'entrée DOI a toujours
besoin d'avoir le format suivant :
doi = {DOI name} (for example "doi = {doi:10.1145/1379092.1379123"})
Signets publics, privés + création de groupes
Formats d’exportation
Organisation hiérarchique des tags
Le nuage de tags
Plus vous utilisez BibSonomy, plus votre nuage de mots-clès grandit et devienyt moins
attractif. Pour éviter ce fait et en plus vous donner une meilleure vue sur les tags les plus
utilisés, le nouveau TagCloud ne montrera que les tags supérieurs (top X).
Détection de doublons
Pour les références scientifiques il y a le problème de détection des doublons, car il existe de
grandes variations dans la façon dont les auteurs entrent des métadonnées telles que nom de la
revue ou de l'auteur. D'une part il est souhaitable de permettre à un utilisateur d'avoir
plusieurs entrées qui diffèrent légèrement. D'autre part un auteur peut avoir envie de trouver
d'autres entrées qui se réfèrent au même document ou un livre, même si elles ne sont pas
tout à fait identiques.
Permet la création d’un CV.
LARDY Jean-Pierre
URFIST de LYON
3
citeulike
http://www.citeulike.org
Lancé en décembre 2006, CiteULike est un service de gestion bibliographique collaborative
développé par Richard Cameron et maintenant sponsorisé par Springer. En juin 2010 : plus de
3 900 000 articles. Les fonctionnalités sont très proches de celles de Connotea.
citeulike est un outil de gestion bibliographique collaborative. On peut :
 constituer une base de références pour les journaux dont les éditeurs sont présélectionnés (13 480 journaux) ;
 alimenter un espace personnel (register puis login), où seront stockés ses propres
références, éventuels commentaires sur les articles et pdf attachés ;
 naviguer sur les références bibliographiques des autres participants et ainsi enrichir son
espace personnel ;
 naviguer sur les mots-clés de la communauté (Everyone’s Tags) classés par usage ;
 importer automatiquement les références (formats RIS ou BibTeX...) ou les saisir
manuellement
 exporter des références (formats RIS, BibTeX ou texte) ;
 créer un forum thématique (groups) ou participer à une liste de discussion ;
 faire de la veille sur les listes de références de certains participants (watchlists) et créer
un flux RSS.
citeulike propose maintenant de créer une bibliographie en formatant les références suivant
différents formats bibliographiques :  RTF/PDF : 15 styles de citation
Commencer par s'inscrire : http://www.citeulike.org/register
Installer le lien Bookmarklets : http://www.citeulike.org/post
Recherche dans citeulike par champs et opérateurs booléens.
Création de groupes
MyCiteULike  Groups  you can create it
Il faut entrer un nom, une description et choisir le statut du groupe : public ou privé.
Une fois le groupe créé, on peut y entrer des références par importation depuis un fichier (au
format RIS ou BibTeX) ou depuis une ressource électronique.
On peut afficher les auteurs dans un nuage de noms.
LARDY Jean-Pierre
URFIST de LYON
4
Connotea
http://www.connotea.org
Créé par Nature Publishing Group en décembre 2004 permet de :
 créer une base bibliographique en ligne par importation directe
 gérer ses références
 partager et accéder aux éléments bibliographiques ajoutés par les autres utilisateurs
Il n'y a aucune limite au nombre de références ou au nombre de tags que l’on peutz enregistrer
sur Connotea. Le service gère les références bibliographiques et les signets de page web.
S'inscrire sur Connotea
Allez sur la page web d’accueil.
Il est utile d’installer le bouton Add to Connotea dans le navigateur.
Alimentation de sa base (My library). On peut :
 Ajouter une référence avec le bouton Add to Connotea
 Ajouter une référence directement à partir de son DOI
 Importer des références depuis un fichier (BibTeX, RIS, EndNote …)
Connotea reconnaît Nature.com, PubMed, PubMed Central, Science, PloS, BioMed Central,
Supported EPrints repositories, Supported Highwire Press publications, Blackwell Synergy,
Wiley Interscience, Scitation, arXiv.org, NASA Astrophysics Data System, Amazon.
Exemple
arXiv : afficher la référence  icône Connotea
WoS : afficher la référence  utiliser le DOI
On peut éditer chaque référence (bouton Edit). Il faut attribuer des mots-clés (tags) pour
organiser la base et écrire un résumé. Il n’y a pas de dossiers et sous-dossiers.
Les références peuvent être publiques, privées ou partagées au sein d’un groupe :
Permet de suivre ce que les collègues lisent, coopérer, créer des collections de références
communes. Création d’un groupe : Create a new group
Ex : collection sur l’Open Access - tag "oa.new" http://www.connotea.org/tag/oa.new
Ou http://www.connotea.org/user/bibliogum/bibliothecaire/cercamon/tag/droits
Abonnement par fils RSS pour suivre un sujet.
Il est possible de s'abonner par fil RSS aux listes d'autres utilisateurs de Connotea ou à des
tags spécifiques. Ex : fils RSS correspondant http://www.connotea.org/rss/tag/oa.new
Exporter des références
Formats utilisables : BibTeX, RIS, EndNote
Recherche dans Connotea avec la syntaxe des moteurs de recherche
Popular Links – Popular Tags
En bas de page, liste des références les plus commentées, des utilisateurs (pseudo) les plus
actifs et des tags les plus utilisés
LARDY Jean-Pierre
URFIST de LYON
5
Comparaison
Les problèmes rencontrés concernet en général l’importation directe de références de
journaux électroniques : si les plateformes des éditeurs commerciaux anglo-saxons permettent
l’importation des métadonnées, cette possibilité n’est pas offerte sur les plateformes
francophones (Revues.org, Persée et Erudit), ni sur HAL lors de l’affichage de l’article ; il est
cependant possible d’importer la description via le processus d’exportation de liste. Il est
aussi possible de passer par Google Scholar qui n’est cependant pas exhaustif.
Pour les livres, ni le Sudoc, ni les catalogues des bibliothèques nationales (BnF) n’offrent de
possibilité d’importation des notices ; seul WorldCat intègre un lien pour générer un fichier de
citation en format RIS. Par contre, depuis Amazon.con ou .fr, la description est
automatiquement importée.
Formats de fichier d’importation
Nom
2Collab
BibTeX
EndNote/Refer
BibSonomy
oui
oui
CiteULike
Connotea
oui
oui
ModXML
RIS
oui
oui
oui
oui
autre
Delicious,
Connetea,
CiteULike,
Scopus
author ID
Signets IE
et firefox
Delicious,
Firefox
Firefox
Bibliographie
Personal Bibliography Management Software: Analysis and Comparison of Some Packages
Francesco Dell'Orso http://www.burioni.it/forum/dellorso/bms/index.html
BibSonomy Blog
CiteULike Blog
2Collab
BibSonomy
CiteULike
Connotea
BibTeX
http://bibsonomy.blogspot.com
http://blog.citeulike.org
http://en.wikipedia.org/wiki/2collab
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2706438/
http://en.wikipedia.org/wiki/BibSonomy
http://www2007.org/workshops/paper_25.pdf
http://en.wikipedia.org/wiki/CiteULike
http://ilk.uvt.nl/~toine/publications/bogers.2008.recsys2008-paper.pdf
http://en.wikipedia.org/wiki/Connotea
http://en.wikipedia.org/wiki/BibTeX
LARDY Jean-Pierre
URFIST de LYON
6