resistance bacterienne au senegal

RESISTANCE BACTERIENNE
AU SENEGAL
Professeur
-Bouh BOYE
ProfesseurCheikh
CheikhSaad
Saad-Bouh
BOYE
M I CR O
C SB
Sy st e m
Unité de Recherche et de Biotechnologie
Microbienne /Bactériologie-Virologie
FMPOS/UCAD/DAKAR
.Fr
équence des
.Fréquence
des Infections
Infections
.Surveillance
.Surveillance de
de la
la Resistance
Resistance
..Efficacit
é th
érapeutique
Efficacité
thérapeutique
PALM
PALM
EGEM
EGEM
INSPEAR
INSPEAR
OBSAIRV
OBSAIRV
BASKETT
BASKETT
INSPIRATION
INSPIRATION
M I CR O
C SB
Sy st e m
DEMARCHE QUALITE
Isolement Bactérien
Cytologie
M I CR O
C SB
Sy st e m
Coloration
Flore bactérienne
- Isolement , Identification
-Etude de la Sensibilite( ABG , CMI… )
-Contrôle Qualité ( Références ATCC )
M I CR O
C SB
Sy st e m
DEMARCHE QUALITE
Streptococcus pneumoniae
Haemophilus influenzae , Moraxella catarrhalis
Bactéries Atypiques
à Dakar ( SENEGAL) ( 1996-2007)
IRBC
IRBC
IRH
IRH (( OTITES
OTITES ET
ET SINUSITES
SINUSITES AIGUES
AIGUES
M I CR O
C SB
Sy st e m
Unité de Recherche et de Biotechnologie
Microbienne /Bactériologie-Virologie
FMPOS/UCAD/DAKAR
Observatoire Sénégalais pour
l ’Antibiothérapie dans les
Infections Respiratoires de Ville
PROJET OBSAIRV
M I CR O
C SB
Sy st e m
ETIOLOGIE BACTERIENNE CAP
Bacteries atypiques:
Legionella spp
Chlamydia spp
Mycoplasma spp
S. pneumoniae
22%
34%
6%
S. aureus
15%
15%
8%
H. influenzae
et M. catarrhalis
BGN
23/02/2004
Autres
M I CR O
C SB
Sy st e m
(OMA) (n = 113 souches)
Autres
Autres
21
Haemophilus
17
Haemophilus
36
35
15
Moraxella
13
Moraxella
32
31 S.pneumoniae
S.pneumoniae
Enfants
n= 63 souches
Adultes n= 50 souches
M I CR O
C SB
Sy st e m
(Sinusites Aigues) (n = 66 souches)
7
17
Autres
Autre
s
10
Moraxella
38
48
Haemophil
us
18
Haemophilus
Moraxella
35
S.pneumoniae
Adultes n= 24 souches
29
S.pneumoniae
Enfants n= 42 souches
M I CR O
C SB
Sy st e m
Profil des Souches isolées
Souches
%
% Afrique
% Monde
15-50
> 50
S.pneumoniae (DRSP)
32
S.pneumoniae (DSSP)
68
H.influenzae (Ampi S)
32
H.influenzae(AmpiR/BL+
26
25-40
30-80
H.influenzae(Ampi R/BL-
02
1-5
2-4
M.catarrhalis ( BL+)
70
M.catarrhalis ( BL-)
30
70-90
M I CR O
C SB
Sy st e m
Profil des Souches isolées
Souches
%
IRB
IRH
S.pneumoniae (DRSP)
32
23
35
S.pneumoniae (DSSP)
68
H.influenzae (Ampi S)
72
H.influenzae(AmpiR/BL
+
H.influenzae(Ampi R/BL-
26
35
28
M.catarrhalis ( BL+)
70
68
75
M.catarrhalis ( BL-)
30
02
Beta Lactamines
Penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae
Tunisia
24.0% 11.0%
Rwanda
21.0% 0.0%
M I CR O
C SB
Sy st e m
Penicillin-intermediate (MIC 0.12–1 µg/mL)
Penicillin-resistant (MIC ≥ 2 µg/mL)
Algeria
11.4% 5.7%
Senegal
2% 30%
Ghana
17.0% 0.0%
Zambia
14% 0.0%
Zimbabwe
Botswana
7%
25% 0.0%
Namibia
21% 9%
South Africa
20.9% 51.0%
Egypt
29.1% 0.0%
Kenya
41.2% 1.8%
Ethiopia
17% 0.0%
INSPIRATION , BASKETT
Data from various sources and various years.
Am ic ill
ox in
C /c la
ef
ur v
ox
i
C me
ef
C ac l
ef
or
tr i
Az ax o
ith
ne
r
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C
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om
O yc in
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C
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ox
Te azo
tr a
le
C
hl
c
y
or
am cl in
ph e
en
i co
l
Pe
n
M I CR O
C SB
Sy st e m
Streptococcus pneumoniae
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
Resistant
Intermediate
Susceptible
M I CR O
C SB
Sy st e m
S.pneumoniae (n= 135)
ATB
PSSP(68%)
PISP(30%)
PRSP(2%)
AminoPeni
S
S(60%)
R
AminoP+Inhib
S
S(98%)
R
CSP1,2,3
S
S(93%)
R
Macrolides
S
S
S(87%)
Tetracycline
S
R(72%)
R
Vancomycin
S
S
S
Macrolides
Macrolide-resistant S.
pneumoniae
M I CR O
C SB
Sy st e m
Tunisia
28.0%
Algeria
21.7%
Egypt
2.5%
Senegal 4%
Erythromycin-resistant (MIC ≥ 1 µg/mL)
South Africa
52.7%
INSPIRATION , BASKETT
Data from various sources and various years.
Haemophilus influenzae
Important
M I CR O
C SB
Sy st e m
pathogène dans IRA
de 30% β-lactamase
positive4
Plus
Haemophilus influenzae
Haemophilus influenzae
β-lactams
pi
Am cill i
n
ox
C /cla
ef
ur v
ox
im
e
C
ef
C acl
or
ef
tri
Az axo
n
ith
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C
m
la
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n
hr
om
yc
O
i
flo n
C
oxa
tri
m ci n
ox
Te azo
tra
le
C
cy
hl
or
c
am lin
e
ph
en
ic
ol
Am
M I CR O
C SB
Sy st e m
Haemophilus influenzae
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
Resistant
Intermediate
Susceptible
Senegal. Antimicrobial Resistance Trends
Among Respiratory Tract Pathogens
M I CR O
C SB
Sy st e m
100
Resistance
mechanism
:
M. catarrhalis
% Resistant
75
Betalactamase
50
H. influenzae
Altered PBPs
25
S.
0
1960
23/02/2004
1970
1980
1990
Betapneumoniae lactamase
Altered PBPs
2000
2010
M I CR O
C SB
Sy st e m
M.catarrhalis (n= 28)
ATB
BL+ ( 70%)
BL-(30%)
Aminopenicilline
R
S
AminoP+Inhib
S
S
CEFADROXIL
S
S
CSP2,3
S
S
Macrolides
S
S
Tetracycline
S
S
M I CR O
C SB
Sy st e m
1996-2007
Staphylocoques
Staphylocoques
Streptocoques
Streptocoques
Enterocoques
Enterocoques
Entrobact
éries
Entrobactéries
Autres
Autres BGN
BGN
M I CR O
C SB
Sy st e m
M I CR O
C SB
Sy st e m
INFECTIONS NOSOCOMIALES
Bactériémies,
15%
Pneumonie post ventilation, 21%
Infection urinaire (UTI),
38%
Infection respiratoire basse, 4%
Infections gastro intestinales , cutanées,
cardiovasculaires,
10%
Infections du site opératoire, 10%
Infections respiratoires hautes 2%
M I CR O
C SB
Sy st e m
INFECTIONS URINAIRES
Enterobactéries,
GNNF
,
Enterocoques,
Autres
50%
35%
10%
5%
M I CR O
C SB
Sy st e m
BACTERIEMIES NOSOCOMIALES
Enterobacteries
,
Enterocoques,
Staphylococcus
aureus,
Staphylocoques CN ,
Pseudomonas,
Acinetobacter
Autres
50%
11%
12%
10%
11%
5%
1%
M I CR O
C SB
Sy st e m
INFECTIONS DU SITE OPERATOIRE
S aureus,
Pseudomonas,
Staphylocoques CN ,
Enterobacteries
Enterocoques
Autres BGN
20%
16%
15%
25
12
12
SENSIBILITE
AUX
ANTIBIOTIQUES
M I CR O
C SB
Sy st e m
Staphylococcus aureus ( n:653)
ATB
MehiR 43%)
Methi S(57%)
Aminopenicilline
R
S
AminoP+Inhib
R
S
CSP2,3
R
S
Macrolides
S
S
Tetracycline
S
S
Aminosides
S/R
S
M I CR O
C SB
Sy st e m
Streptocoques ( n:443)
ATB
Enterococcus(84)
Streptococcus(359)
Aminopenicilline
S(63%)
S
AminoP+Inhib
S(72%)
S
CSP1,2,3
S( 76%)
S
Macrolides
S
S
Tetracycline
S
S
M I CR O
C SB
Sy st e m
Enterobactéries ( n:335)
ATB
Aminopenicilline
BSLE+(42%)
R
BSLE- (58%)
S
AminoP+Inhib
R
S
CSP2,3
R
S
M I CR O
C SB
Sy st e m
Klebsiella pneumoniae
ATB
Souches
Klebsielles
BétaAminosides Quinolones
lactamines
Cotrimoxazole
Sauvages
(12%)
S
S
S
R
PHN
( 22%)
MS
S
S
R
BLSE
(63%)
S
MS
S
R
M I CR O
C SB
Sy st e m
Pseudomonas aeruginosa
ATB
Souches
BétaAminosides
lactamines
Quinolones
Sulfa- triméto
Sauvages
(40%)
R
S
S
Pénicillinase
Haut niveau
(28%)
R
S
S
R
R/MS
S
S
R
Céphalosporinase
(16%)
R
M I CR O
C SB
Sy st e m
1999-2007
M I CR O
C SB
Sy st e m
Données sur les bactéries entéropathogènes: Tendances et
Antibiorésistance
Les données sur les les bactéries entéropathogènes proviennent
du Centre National Sénégalais des Entérobactéries (CNSE) sis à
l’Institut Pasteur de Dakar.
Missions du CNSE:
•Assurer pour l’ensemble des structures sanitaires du Sénégal
l’identification
complète
et
l’antibiogramme
des
souches
d’entérobactéries, en particulier les salmonelles et les shigelles,
•Suivre l’évolution épidémiologique des souches et de leur résistance
aux antimicrobiens
M I CR O
C SB
Sy st e m
Salmonella:
Entre 1999 et 2007, le CNSE a collecté 1426
souches de salmonelles dont 985 d’origine
humaine et 441 d’origine alimentaire.Quatre
nouveaux sérotypes ont été identifiés : Salmonella
Keurmassar, Salmonella Ketiabargny, Salmonella
Yombesali, Salmonella Yagounasally. Tous ces
nouveaux sérotypes ont été isolés exclusivement
de l’alimentation, à l’exception de Salmonella
Keurmassar présent également dans des
prélèvements d’origine humaine.
M I CR O
C SB
Sy st e m
•Grande sensibilité des souches aux antibiotiques testés.
Cependant des résistances inquiétantes ont été notées chez les souches de
Salmonella Agona, Kentucky et Keurmassar isolées d’aliments:
•production d’une BLSE : le typage moléculaire a révélé la circulation
au Sénégal de BLSE de type CTX-M15, SHV-12
•d’intégrons: éléments génétiques mobiles porteurs de facteurs de
résistance et capables de les disséminer au sein du monde bactérien et
portant des cassettes. Des intégrons de classe 1 ont été détectés chez S.
Keurmassar avec des cassettes codant la résistance à la streptomycine
(gènes de résistance aadA) et la cassette codant la codant la résistance à
l’érythromycine (gène de résistance ereA2), une macrolide largement
utilisée en antibioprophylaxie dans les élevages de poulets de chair au
Sénégal.
M I CR O
C SB
Sy st e m
Shigella:
Entre 1999 et 2007, le CNSE a reçu 538 souches de
shigelles, toute d’origine humaine.La tendance au
niveau des sérotypes montre un recul de flexneri . Le
sérotype sonnei prend la place de leader.
L’épidémiologie de la résistance aux antibiotiques est
caractérisée par une résistance importante vis-à-vis des
cyclines et du cotrimoxazole, pour l’ensemble des
espèces et une circulation de souches avec une
diminution de la sensibilité aux quinolones.
M I CR O
C SB
Sy st e m
Merci de votre attention