Projets - Terres Inovia

PHENOME
Réseau Français de Phénotypage des plantes
PHENOME
- Réseau de 9 plateformes coordonnées par l’INRA
- 2012-2019 : Budget total de 42 millions d’euros dont un
soutien de 24 millions d’euros du commissariat aux
investissements d’avenir et de l’ANR
9 PLATEFORMES
Plateforme en serre de l’INRA Montpellier : capacité de 2000 plantes
- 2 plateformes de métabolomique : Nantes et
Bordeaux (INRA)
- 2 plateformes de phénotypage en conditions
contrôlées : Montpellier et Dijon (INRA)
- 2 Plateformes au champ semi-contrôlées :
Clermont-Ferrand (INRA) et Ouzouer (Arvalis)
- 3 Plateformes au champ : Toulouse,
Montpellier (INRA), Dijon (CETIOM)
La génétique et la caractérisation moléculaire des végétaux ont fait des progrès
spectaculaires ces dernières années.
Pour mieux valoriser ces progrès,
OBJECTIFS
les techniques et méthodes
- Fournir à la communauté végétale française une
d’expérimentation, en serre,
infrastructure à haut débit
au champ, doivent évoluer et
- Caractériser de grandes séries de génotypes
être mises à disposition de
- Faire des gains de productivité dans la caractérisation
l’ensemble des disciplines
des plantes et des couverts
agronomiques.
- Mettre au point et Introduire des méthodes nouvelles
- Améliorer la description des milieux d’expérimentation
- Transférer techniques et méthodes aux professionnels
de l’expérimentation
CONTRIBUTION DU CETIOM
1) Responsabilité de la plateforme au champ de Dijon,
en collaboration avec l’Unité expérimentale INRA de
Dijon-Epoisses
2) Contributions sur le site de Toulouse
3) Participation au groupe méthodologique coordonné
par l’INRA d’Avignon (Collaboration INRA et CEA)
Plateforme au champ de Dijon : un essai pois pour
le projet PEAMUST et un essai Colza pour RAPSODYN
Près de 700 parcelles en 2012-13
Pour plus d’informations :
Coordinateurs : François Tardieu (INRA Montpellier) Jacques Legouis (INRA Clermont-Ferrand)
Administration du projet : Pamela Lucas INRA Transfert
Contact CETIOM : Xavier Pinochet CETIOM
RAPSODYN : Un projet ambitieux pour
optimiser l’efficacité de la nutrition azotée
chez le colza
• Un projet d’une durée de 7 ans et 6 mois (2012-2019)
• Soutenu dans le cadre des investissements d’avenir
• Budget : 20.3 millions d’euros au total dont 6 m€ de soutien
du commissariat général aux investissements et de l'ANR
• Partenariat : 9 équipes publiques (INRA, Universités, Ecoles
d’ingénieurs agronomes), 6 sociétés privées et le CETIOM
Des ressources végétales d’une grande diversité dont :
- des populations de cartographie génétique (~ 3500 individus),
- une collection de référence (~ 200 accessions) maximisant
la diversité génétique du colza d’hiver oléagineux,
- des germplasms exotiques (colzas de printemps, asiatiques…),
- des colza synthétiques exploitant la diversité des
progéniteurs (chou et navette),
- des mutants.
Contexte
• Hausse de la consommation d’huiles alimentaires
• Besoins en protéines pour l’alimentation animale
• Développement des utilisations industrielles
(biocarburants, chimie verte)
Objectifs du projet RAPSODYN
• Optimiser le rendement et la teneur en huile du
colza
• Améliorer l'efficacité de l’utilisation de l'azote par
le colza
• Proposer des pratiques culturales innovantes
Caen
RENNES
Versailles-Grignon
Verneuil
B. rapa (navettes)
Dijon
B. oleracea (choux)
Clermont-Ferrand
Des ressources génétiques et génomiques haut débit :
- des cartes génétiques saturées,
- les séquences des génomes de Brassica (B. napus, B. rapa,
B. oleracea),
- des marqueurs ADN haute densité (SNPs),
- des outils « omics »,
- Arabidopsis comme plante modèle.
Phénotypage
- un effort important en expérimentation de plein champ
(~50.000 parcelles),
- du phénotypage en conditions contrôlées,
- des nouvelles méthodes de phénotypage pour les caractères
liés à l’azote.
Méthodologies
- des approches de modélisation,
- des nouvelles méthodes de sélection des hybrides,
- évaluation des impacts économiques et environnementaux.
Pour plus d’informations :
Coordinatrice : Nathalie Nesi – UMR1349 IGEPP Rennes [email protected]
Administration du projet : Eric Monsinjon – INRA Transfert [email protected]
Valorisation-communication : Xavier Pinochet – CETIOM [email protected]
Mont de Marsan
Rodez
Grenoble
Toulouse
Variétés améliorées
Pratiques de fertilisation optimisées
Prise en compte des interactions
Génotype x Milieu x Conduite
SUNRISE
www.sunrise-project.fr
L’amélioration de la stabilité de production d’huile
sous contrainte hydrique du tournesol
Un projet de 7 ans et 4 mois
(2012-2019)
• Soutenu dans le cadre des investissements d’avenir
• Budget : 22 millions d’euros au total dont 7 millions
de soutien du commissariat aux investissements
d’avenir et de l’ANR
• Partenariat : 10 équipes publiques (INRA, Universités),
6 sociétés privées et le CETIOM
Contexte
• Besoins en huile et en tourteaux
• Diversification des rotations avec des espèces peu
utilisatrices de produits phytosanitaires
• Gestion des ressources en eau
• Risques de changements climatiques
Objectifs
• Définir des idéotypes de plante capables d’assurer
la compétitivité économique du tournesol en France
• Bénéficier de synergies interdisciplinaires
• Renforcer la communauté de recherche française
sur le tournesol principalement situé en région
toulousaine
Activités
• Développement de génotypes et de populations pour les études génétiques et la validation de gènes candidats
• Séquençages, identification de marqueurs SNP, génotypage à haut débit, identification de mutants
• Phénotypage en conditions contrôlées, au champ, caractérisations physiologiques, chimiques et moléculaires
(« omics »), nouvelles méthodes
• Etude des interactions génotypes –milieux-conduites, amélioration des outils de modélisation, définition
d’idéotypes variétaux
• Etudes de génétique quantitative, validation de marqueurs liés aux caractères d’intérêt pour la sélection
• Gestion des données et bioinformatique
• Impacts socio-économiques de nouveaux idéotypes variétaux
• Dissémination des résultats, formation , colloques
Contribution du CETIOM
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Prise en charge d’expérimentations au champ (environ 5000 parcelles)
Méthodes de phénotypage
Modélisation, analyse des interactions génotypes x milieux x conduites
Contribution à l’étude des impacts économiques
Valorisation et dissémination des résultats
Pour plus d’informations :
Coordinateur : Patrick Vincourt LIPM INRA Toulouse [email protected]
Administration du projet : Laure Trannoy– INRA Transfert [email protected]
Valorisation-communication : Xavier Pinochet – CETIOM [email protected]
www.sunrise-project.fr