Mode opératoire V3 SSEIA
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Mode opératoire V3 SSEIA
03/09/02 MODE OPERATOIRE SEROTYPAGE VIH *V3 A-B-C-D-AE / O / 2 *TM (cons + D) / O / 2 1/7 03/09/02 Sensibilisation de 10 plaques TM M+D 1. O V3 VIH-2 O VIH-2 V3 A B C D AE 100% 0% mél. peptide Tp PBS Décongeler les peptides de sensibilisation (peptides V3 longs avec Cystéine à 30AA). l TM : gp M, D, O, VIH-2 (sm) à 100 µg/ml l V3 : A, B, C, D, AE, O, VIH-2 (sm) à 100 µg/ml Préparer du tampon PBS 2. Préparer la solution de sensibilisation TM cons M + D à 1 µg/ml : + 50 µl de peptide TM D 50 µl de peptide TM cons M qsp 10 ml de PBS 1X (soit + 9,900 ml) Préparer la solution de sensibilisation TM O à 1 µg/ml : 100 µl de peptide O qsp 10 ml de PBS 1X (soit + 9,900 ml) Préparer la solution de sensibilisation TM VIH-2/sm à 1 µg/ml : 100 µl de peptide sm qsp 10 ml de PBS 1X (soit + 9,900 ml) Préparer la solution de sensibilisation V3 O à 2,5 µg/ml : 250 µl de peptide O qsp 10 ml de PBS 1X (soit + 9,750 ml) 2/7 03/09/02 Préparer la solution de sensibilisation V3 VIH-2/sm à 2,5 µg/ml : 250 µl de peptide sm qsp 10 ml de PBS 1X (soit + 9,750 ml) Préparer la solution de sensibilisation V3 A-B-C-D-AE à 2,5 µg/ml soit 0,5 µg/ml de chaque peptide : + + + + 3. 300 µl de peptide A 300 µl de peptide B 300 µl de peptide C 300 µl de peptide D 300 µl de peptide AE qsp 60 ml PBS 1X (soit + 58,5 ml) Distribuer 100 µl de solution de sensibilisation TM cons M + D, O, VIH-2/sm et V3 O dans leurs colonnes respectives. Distribuer 100 µl de solution de sensibilisation V3 A-B-C-D-AE dans les colonnes A, B, C, D, AE, mél. peptide et Tp PBS. 4. Incuber une nuit (20h) à 37°C sans couvrir les plaques dans une étuve autre que CO2. Vérifier au bout de 20h que les solutions soient évaporées. 5. Préparer la solution de lavage PBS 1X + Tween 20 – 0,5% = 1 l PBS + 5 ml Tween 20 6. + 7. Préparer la solution de saturation des puits PBS 1X + 2% Sérum de Veau Nouveau Né (SVNN) 200 ml de PBS 1X 4 ml de SVNN Faire 3 lavages (200µl par puits) Tapoter les plaques 8. Distribuer 200 µl de solution de saturation des puits dans les tous les puits Incuber 45 minutes à + 37°C sans couvrir les plaques dans une étuve autre que CO2. 9. Faire 3 lavages Tapoter les plaques Laisser sécher les plaques environ 30 minutes à température ambiante ; Stocker les plaques, enveloppées 2 par 2 dans du papier aluminium, à –20°C (stable 2 mois). Indiquer la date de la sensibilisation. 3/7 03/09/02 SEROTYPAGE 2 plaques l Décongeler : - Sérum de veau nouveau né (SVNN) - 2 plaques sensibilisées - Peptides d'inhibition A, B, C, D, AE et le mélange A-B-C-D-AE à 100 µg/ml - Echantillons à tester et 1 témoin négatif et positif (1 témoin négatif et 1 témoin positif par série) l Préparer : - Tampon de lavage : PBS 1X / 0,5% Tween 20 - Tampon de dilution de sérums : Nacl 5M – PBS – 10% SVNN – 0,05% Tween 20 18 ml Nacl 5M + 10 ml SVNN + 50 µl TW 20 + 72 ml PBS l Diluer les échantillons et les témoins : 1/100° 1,5 ml Tp de dilution +15 µl échantillon l Distribuer les peptides d'inhibition : 10 µl Peptide A dans colonne 6 Peptide B dans colonne 7 Peptide C dans colonne 8 Peptide D dans colonne 9 Peptide AE dans colonne 10 Mélange A-B-C-D-AE dans colonne 11 (100% d'inhibition) Tampon PBS dans colonne 12 (0% d'inhibition) l Distribuer les échantillons et les témoins : 100 µl (lignes 1 à 8) l Incubation 30 minutes à température ambiante (pièce climatisée) l 5 lavages PBS-Tween 20 l Avant la fin des lavages, préparer le conjugué : 1/5000° 25 ml Tp de dilution + 5 µl Conjugué (Fab'2 de chèvre anti IgG humaines) 4/7 03/09/02 l Tapoter la plaque l Distribuer le conjugué : 100 µl l Incubation 30 minutes à température ambiante (pièce climatisée) l Avant la fin de l'incubation, préparer le substrat : 20 ml H2O 1 cp Buffer Urea H2O2 1 cp OPD BIEN AGITER POUR DISSOUDRE l 3 lavages PBS-Tween 20 l Tapoter la plaque l Distribuer le substrat : 100 µl l Incubation 15 minutes à température ambiante et à l'obscurité l Arrêt de la réaction avec H2SO4 2N / 50 µl l Lecture de la densité optique : 492 nm /620-630nm l Remplir la feuille de traçabilité RESULTATS Test valide si : DO mélange 100% inhibition ≤ DO PBS O% inhibition/2 Cocher la DO la plus faible = blocage maximum = sous-type VALEUR SEUIL pour TM cons M + D, TM O, TM VIH-2/sm et V3 VIH-2/sm, V3 O : N+0.100 Il est possible que les VIH 1 M réagissent à la fois sur TM cons M + D et TM O avec une DO < en TM O % inhibition = [ (DO Tp PBS – DO peptide) / (DO Tp PBS – DO Mél A-B-C-D-AE)]*100 5/7 03/09/02 PREPARATION DES REACTIFS 1. Préparation des solutions mères de peptides longs (30 AA avec Cystéine) de sensibilisation à 1 mg/ml - dissoudre chaque peptide lyophilisé dans de l'eau distillée stérile pour obtenir une solution mère à 1 mg/ml - aliquoter par 1 ml - stoker à –20°C 2. Préparation des solutions mères de peptides courts (sans Cystéine) d'inhibition à 1 mg/ml - dissoudre chaque peptide lyophilisé dans de l'eau distillé pour obtenir une solution mère à 1 mg/ml - aliquoter par 1 ml - stoker à –20°C 3. Préparation des solutions stocks de peptides d'inhibition à 100 µg/ml -diluer chaque solution mère au 1/10 ° dans du tampon PBS pH 9.6 pour obtenir une solution stock à 100 µg/ml ( 100 µl de la solution mère + 900 µl de tampon PBS) -Pour le mélange A-B-C-D-AE : prélever 20 µl de chaque peptide à 1 mg/ml + 900 µl de tampon PBS. 4. Solution de saturation / PBS + 2% SVNN Pour 10 plaques : 200 ml de PBS 1X + 4 ml de SVNN 5. Tampon de dilution de sérum / NaCl 5M – PBS 10% SVNN 0.05% Tw 20 Pour 100 ml : 18 ml NaCl 5M + 10 ml SVNN + 50 µl Tw 20 + 72 ml PBS 6. Conjugué ( Fab'2 de chèvre anti IgG humaines) Dilution au 1/5000° : 5 µl de conjugué + 25 ml de tampon de dilution de sérum. 6/7 03/09/02 REFERENCE DES REACTIFS 1. Plaques : Plaques FD PLAT Becton Dikinson Falcon 96 pts Flex ( par 50 pq) Réf : 5633 2. Sérum Veau Nouveau Né Gibco par 100ml Life Technology Invitrogen. Réf : 16010 – 167 Prix = 9 Euros 40 cts. 3. Conjugué Fab'2 de chèvre anti IgG humaine, HRP 1ml Cat aHI 1304 Origine Biossource Int'l, INC./USA Fournisseur : Clini Sciences 4. Tween 20 : Polyoxyéthylènesorbitan monolaurate Tween Ref : P 1379 500ml Px=127F 5. OPD Tablets 50 sets (sigma) Ref: P 9187 Px=636F 6. PBS poudre 4*1L Ref : 75511 Biomérieux 7. Sodium Chloride, 5M Solution Molecular / Ref S5150-1L - Sigma 7/7