Différence de ∆Ct entre 2 échantillons

Ce paragraphe résume les formules les plus utilisées en PCRq en temps réel.
Différence de ∆Ct entre 2 échantillons :
- PCR avec une efficacité de 100% (2) :
Un écart d’un facteur 4 entre 2 échantillons correspondra à :
xlog2 = log4 donc x = 2
2 cycles d’écart entre les Cp de 2 échantillons différents d’un facteur 4
1 cycles d’écart entre les Cp de 2 échantillons différents d’un facteur 2
1,58 cycles d’écart entre les Cp de 2 échantillons différents d’un facteur 3
2,32 cycles d’écart entre les Cp de 2 échantillons différents d’un facteur 5
3,32 cycles d’écart entre les Cp de 2 échantillons différents d’un facteur 10
- PCR avec une efficacité de 96% (1,96 ) :
Un écart d’un facteur 4 entre 2 échantillons correspondra à :
xlog1,96 = log4 donc x = 2,06
2,06 cycles d’écart entre les Cp de 2 échantillons différents d’un facteur 4
Vous avez la pente, vous voulez l’efficacité :
E = 10-1/pente
Une pente de –3.7 correspond donc à une efficacité PCR de :
10 -1/-3.7
= 1.86, c’est a dire 86% d’efficacité PCR.
Vous avez l’efficacité, vous voulez la pente :
Pente = - 1 / logE
Une efficacité de 100% (donc E = 2) correspond a une pente de
-1 / log 2 = 3,32
Vous voulez créer vous-même une courbe standard sous Excel
Vous pouvez suivre la procédure à l’adresse WEB suivante ;
ABI