Journées ARENA – Lille – 26, 27 et 28 mars 2007

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Journées ARENA – Lille – 26, 27 et 28 mars 2007
Journées ARENA – Lille – 26, 27 et 28 mars 2007
Les journées sont accueillies par le restaurant Le Meunier (15 rue de Tournai, Lille), qui dispose d’une
salle de séminaires. C’est à 50 mètres de la Gare Lille Flandres et à 300 mètres de la Gare Lille Europe. Les
déjeuners de midi sont pris sur place.
Pour le logement, les chambres sont réservées à l’hôtel Mister Bed (57 rue de Béthune, 03 20 12 96 96) à
10 minutes à pied. S’il pleut ou si vous etes chargé, vous pouvez prendre le métro: de la Gare Lille Flandres,
prendre la ligne 1 direction CHR Calmette et descendre à la station République Beaux-Arts, de la Gare Lille
Europe, prendre la ligne 2 pour rejoindre la ligne 1. Le logement est pris en charge par l’ACI. Vous n’avez
donc rien à payer.
Il y a une sortie culturelle, le lundi en fin d’après-midi, avec la visite du Palais des Beaux-Arts. Le diner
de mardi soir a lieu au restaurant La Baignoire, à côté de l’hôtel. Le diner du lundi soir est libre. Enfin,
si vous etes sur Lille dimanche apres-midi, il y a un concert gratuit de Philippe Katerine à 17h, place de la
République.
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Restaurant Le Meunier (journées de travail), 15 rue de Tournai
Hôtel Mister Bed, 57 rue de Béthune, en face des cinémas, 03 20 12 96 96
Restaurant La Baignoire (mardi soir), 8 place de Béthune
Palais des Beaux-Arts, place de la République (lundi après-midi)
Lundi 26 mars
9h30-10h00
10h00-11h30
11h30-12h00
12h00-12h30
12h30-13h45
13h45-15h15
15h15-16h15
16h45-17h45
Accueil
Régulation par les petits ARN eucaryotes et procaryotes
Daniel Gautheret - Institut de Génétique et Microbiologie, Orsay
Génération aléatoire de structures d’ARN
Yann Ponty - CMB, Boston college
Comparaisons de séquences à base de graines espacées pour la recherche d’ARN non-codants
Mathieu Giraud - SEQUOIA, LIFL Lille
Déjeuner
Tutorial sur l’apprentissage en biologie
Christine Froidevaux - LRI, Orsay
Approches pour la recherche de gènes d’ARN non codant: le cas spécifique des ARN H/ACA,
le cas général des ARN structurés
Fabrice Leclerc - Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, Nancy
Visite du Palais des Beaux-Arts
Mardi 27 mars
9h-10h
10h00-10h35
10h35-10h55
10h55-11h55
12h-12h35
12h35-14h00
14h-15h00
15h00-15h35
15h35-16h10
16h10-16h30
16h30-17h30
17h30-18h30
20h
Recherche de motifs ARN dans un genome, vite et bien
Hélène Touzet - SEQUOIA, LIFL Lille
Prediction of RNA Secondary Structure with Pseudoknots
Mohammad Ganjtabesh - LIX, Ecole Polytechnique, Palaiseau
Pause
Gene regulation with RNA switches and knots
Hervé Isambert - RNA dynamics and Biomolecular Systems, Institut Curie
Classification topologique et prediction Monte Carlo des structures d’ARN
Michael Bon - Service de Physique Théorique, CEA, Saclay
Déjeuner
RNA parametric algorithms
Peter Clote - CMB, Boston college
Décomposition arborescente, algorithmes et ARN
Stéphane Vialette - LRI, Orsay
Interactions ADN/ARN et ARN/ARN dans les biopuces Affymetrix
Enrico Carlon - Institut de Recherche Interdisciplinaire et Polytech-Lille
Pause
PARADISE: plateforme d’annotation des données de l’ARN reposant sur une architecture
distribuée
Fabrice Jossinet - Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg
Discussion générale
Dı̂ner au restaurant La Baignoire
Mercredi 28 mars
9h00-10h00
10h00-10h35
10h35-10h55
10h55-11h55
12h30
Biais de composition des séquences d’ARN chez les eucaryotes: utilisation pour l’étude
de l’organisation du génome humain
Claude Thermes - Génétique Moléculaire, Gif/Yvette
Finding the building blocks of RNA 3-D structure using graph analysis
Romain Rivière - Université de Montréal
Pause
Prédiction de structures tridimensionnelles (de séquences) d’ARN
Francois Major - Université de Montréal
Déjeuner et fin des journées