Stage de Master Analyse d`images en “Digital Pathology”

Stage de Master
Analyse d’images en “Digital Pathology”
Full time intern position
A propos de la société HalioDx.
L’ambition d’HalioDx est de devenir une société leader de la prise en charge des cancers en
fournissant des informations uniques sur le statut immunitaire des tumeurs.
Vous trouverez de plus amples informations sur le site internet de la société www.haliodx.com
HalioDx recrute en stage un spécialiste Analyse d’images en “Digital Pathology”
Durée : 6 mois
Problématique : en oncologie, de nouveaux traitements utilisant des anticorps monoclonaux
permettent de lutter contre certains types de cancer avec des résultats jamais obtenus
auparavant. Cependant, l’efficacité de ces immunothérapies est variable selon le patient et le
contexte immunitaire de la tumeur. Afin de permettre l’anticipation de l’effet du traitement, des
tests diagnostiques basés sur des méthodes d’immunohistochimie (ou « IHC ») sont
nécessaires, et une standardisation de ceux-ci est la condition pour une utilisation en routine.
Dans le but de récolter les informations nécessaires à ces tests, on a besoin d’une
identification précise et robuste des tissus autour de la tumeur ainsi que des cellules
immunitaires. Pour ce faire, une discipline est en cours de maturation : la « digital pathology
», c’est-à-dire l’analyse de ces échantillons préalablement numérisés à l’aide de l’ordinateur.
Objectif : accompagner un projet de test IHC en cours de « faisabilité » (étape précédent le
développement d’un produit) dans l’entreprise en développement des outils d’analyse d’image
permettant de recouper les informations issues de plusieurs marquages successifs d’une
même lame scannée et marquée à plusieurs reprises. Un interfaçage web de cet outil pour en
faciliter d’utilisation par l’équipe de biologistes est aussi envisagé.
Compétences attendues : connaissances de base en traitement du signal et des images,
programmation sous différents environnements (e.g. python, R, C/C++, ainsi que PHP,
javascript pour le web), un minimum de connaissances en immunologie ou biologie
moléculaire et une familiarité avec le logiciel ImageJ sera un plus.
Compétences développées : Gain d’une expertise en « digital pathology », développement
de tests diagnostiques, aptitude à la rédaction de documents en anglais sous environnement
qualité, culture d’entreprise biotech.
Environnement de travail : Le stage se déroulera dans le département de Recherche &
Développement au sein de la société HalioDx implantée à Marseille.
Encadrement : L’équipe encadrante est constituée d’experts dans le domaine du
développement de tests en diagnostics in vitro bioinformaticiens et immunologistes.
Merci d’envoyer vos candidatures à l’adresse email : [email protected]
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