La mitochondrie
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La mitochondrie
PLAN DU COURS La mitochondrie • • • • • • • MOTS CLES • Organite intracellulaire à double membrane • Intervient dans la production énergétique de la cellule • Possède son propre génome Aspect morphologique Crêtes Membrane externe Membrane interne Espace intermembranaire Matrice • Deux membranes séparées par un espace intermembranaire • Membrane externe uniforme et continue • Membrane interne forme des crêtes Aspects morphologiques Caractéristiques de la double membrane Production énergétique par chimiosmose – L’ATP – Transformation du glucose et des acides gras en AcétylCoA – La production de FADH2 et NADH – La chaîne respiratoire – La phosphorylation oxydative Autres fonctions des mitochondries L’ADN mitochondrial Les protéines mitochondriales – Outils pharmacologiques – Adressage des protéines cytoplasmiques vers la mitochondrie Origine des mitochondries (théorie endosymbiotique) Aspect morphologique en microscopie optique • Dans le cytoplasme • Globulaires: 0,5 à 1µm de diamètre • Filamenteux: jusqu’à 10µm de long • Nombre variable selon type cellulaire (et besoins énergétiques) Aspect morphologique en microscopie électronique Matrice finement granuleuse: - mitoribosomes - ADN - granules de grande taille - cristaux protéiques - cristaux de substances minérales - Nombreux systèmes enzymatiques 1 Variation morphologique d’une mitochondrie dans le temps L’immunofluorescence Marquage de l’échantillon Anticorps primaires dirigés contre A Localisation des mitochondries Localisation dans le cytosol Anticorps secondaires, couplés à des fluorochromes et dirigés contre les primaires actine Antigène A fixé mitochondries noyau Observation au microscope à fluorescence excitation émission Lien avec les microtubules mitochondries Composition chimique de la membrane externe microtubules • Contient plus de protéines que la membrane plasmique • Riche en porine • Perméable aux ions et molécules de masse moléculaire inférieure à 10kDa 2 Passage passif des petites molécules par la porine de la membrane externe ATP ADP Acides gras Pyruvate • Contient plus de protéines que la membrane externe Phosphate Cytoplasme Membrane externe ATP ADP Espace intermembranaire Acides gras Pyruvate Composition chimique de la membrane interne • Dépourvue de cholestérol mais riche en cardiolipine (diphosphatidyl-glycerol) • Riche en transporteurs et complexes protéiques enzymatiques Phosphate • Faible fluidité (passage actif) Passage actif des petites molécules à travers la membrane interne ATP Acides gras Pyruvate Composition de l’espace intermembranaire Phosphate Cytoplasme Membrane externe ADP ATP Acides gras Pyruvate H+ Espace inter-membranaire Phosphate H+ H+ ADP Pyruvate H+ Acides gras • Contient les protons qui proviennent du fonctionnement de la chaîne respiratoire mitochondriale H+ Membrane interne ATP • Composition en ions et petites molécules identique à celle du hyaloplasme H+ Phosphate • Contient le cytochrome C qui circule entre les deux membranes Matrice Fractionnement des mitochondries Milieu de faible osmolarité MOTS CLES Milieu de forte osmolarité Matrice Membrane externe Membrane interne Espace intermembranaire • Organite intracellulaire à double membrane Gradient de densité • Intervient dans la production énergétique de la cellule Lyse et centrifugation • Possède son propre génome Centrifugation Espace intermembranaire Membrane interne Matrice Membrane externe 3 L’hydrolyse de l’ATP fournit de l’énergie à la cellule Lumière Aliments Electrons hautement énergétiques La chimiosmose Gradient électrochimique +31 kJ/mol Transport membranaire actif Glucose Pyruvate Acide gras Pyruvate Acide gras Lors des réactions biochimique: Quand un e- est enlevé à une molécule (elle est oxydée), il est immédiatement transféré à une autre molécule (qui est réduite). La tendance à transférer des e- peut être mesurée expérimentalement: Acetyl-CoA GTP Cycle de Krebs H+ O2 H2 O H2 O H+ e- e- ADP + Pi H H+ + ATP H+ Couple rédox A/A+ H+ Couple rédox de référence (B/B+) H+ H+ Comment faire de l’ATP avec des e-? Chaque fois qu’un e- réduit une molécule, il lui amène une charge négative. Cette charge est alors compensée par l’apport d’un H+ La synthèse d ’ATP Principe du couplage chimiosmotique Force proton motrice Espace intermembranaire Ce proton est libéré avec l’e- lors de l’oxydation. Les complexes de la chaîne de transport « prennent » un H+ dans la matrice quand ils sont réduit et le re-larguent dans l’espace inter-membranaire lorsqu’ils sont oxydés. Ils créent ainsi un gradient électrochimique de H+ à travers la membrane interne. V Pont salin Chaîne respiratoire mitochondriale H+ voltmètre e- NADH FADH2 O2 Mouvement flagellaire Les potentiels rédox H+ H+ Synthèse Membrane interne Libération de H+ Accepteur final d’eComplexe IV Libération d ’énergie disponible pour la synthèse d ’ATP Niveau d’énergie des ed’e- Transport le long de la chaîne de transport Niveau d’énergie des e- Matrice Flux d ’e- 4 Le NADH est un donneur d’électrons hautement énergétiques qui vont alimenter la chaîne respiratoire mitochondriale NADH / FADH2: donneurs d’ee- sont maintenus dans une liaison à haute énergie. * Potentiel rédox: très négatif faible affinité pour les e-. * Potentiel rédox de O2: très positif accepteur d’e-/forte affinité pour e-. Pourquoi une chaîne de transport d’e-? La différence de potentiel rédox est très importante la réaction est très favorable et l’énergie fournie énorme. Supérieure à l’énergie nécessaire pour la synthèse d’ATP. Explosion et dissipation sous forme de chaleur. Nicotinamide Adenine Dinucleotide Nicotinamide Adenine Dinucleotide reduit Ainsi à partir du NADH, les e- passent d’un complexe à l’autre en perdant peu à peu leur énergie. Le FADH2 est un autre donneur d’électrons hautement énergétiques… Le pyruvate provient du catabolisme des acides aminés et des sucres simples 1 Glucose glycolyse 2 Pyruvates + 2 NADH + 2 ATP -2 ATP 2 Pyruvates Chaîne respiratoire mitochondriale 2 NADH CoA-SH O2 ATP 2 NADH 2 AcetylCoA Krebs Le passage des électrons sur la chaîne respiratoire mitochondriale conduit à la formation d’un gradient électrochimique 2 GTP + 6NADH + 2FADH2 O2 1 GDP + 1 NADH 2e- 2e- ADP + Pi ATP H+ Chaîne respiratoire mitochondriale H+ H+ 1 GTP + 1 ADP FADH2 H2 O H2 O H+ H+ ATP H+ H+ FMP H+ Force motrice protonique FMP =∆V-60∆pH (environ 220mV) L’énergie d’oxydation du NADH et FADH2 est transformée au niveau de la membrane interne en énergie de liaison phosphate sous forme d’ATP L’oxydation des acides gras dans la matrice est une source de NADH et FADH2 Acide gras CoA-SH O2 O2 FADH2 NADH 2e- 2e- H2 O H2 O H+ -2 ADP + Pi ATP H+ H+ ATP Lynen H+ Acyl-CoA(-2C) 1 FADH2 1 NADH Chaîne respiratoire mitochondriale H+ H+ H+ FMP Chaîne respiratoire mitochondriale ATP Acyl-CoA 1 AcetylCoA Krebs 1 GTP + 3 NADH + 1 FADH2 H+ 1 GTP + 1 ADP 1 molécule de NADH oxydée 3 molécules d’ ATP 1 molécule de FADH2 oxydée 2 molécules d’ ATP 1 GDP + 1 ATP 5 Transport d’électrons (chaîne respiratoire) Le contrôle respiratoire Flux d’e- Les cellules n’oxydent que la quantité de glucose nécessaire pour synthétiser la quantité d’ATP suffisante à leur activité métabolique. Espace intermembranaire Cytochrome c Complexe III Complexe I Complexe IV Coenzyme Q Matrice Le fonctionnement de la chaîne s’accompagne d’un transport de H+ et crée un gradient. O2 NADH+H+ • 3 complexes enzymatiques (associations de nombreuses protéines) Complexe I: NADH déshydrogénase C’est la vitesse de dissipation du gradient qui dicte la vitesse de fonctionnement de la chaîne et donc la consommation d’O2. Ce qui contribue à un retour plus rapide des H+ accélère la respiration. Complexe III: cytochrome b-c1 Complexe IV: cytochrome oxydase • 2 transporteurs d’électrons (mobiles) Coenzyme Q = Ubiquinone Cytochrome c La force proton motrice est une forme d’énergie potentielle (gradient) • Pour rétablir l’équilibre, les H+ situés dans l’espace inter-membranaire doivent traverser la membrane interne au niveau du « tunnel à H+ » de l ’ATPase • Le passage des H+ dans le tunnel de l’ATPase génère l’énergie pour former de l’ATP à partir de l ’ADP et de Pi • L’énergie libérée sert aussi au transport actif de substrat: - symport entrée de pyruvate, AG, phosphate - antiport échange ATP/ADP, Pi • La synthèse des hormones stéroïdes • La synthèse de phospholipides • La synthèse d’acides aminés Matrice ATP ADP + Pi AUTRES FONCTIONS DES MITOCHONDRIES Membrane interne Espace intermembranaire MOTS CLES • Rôle dans le contrôle de la concentration de calcium cytosolique • Rôle déterminant dans la mort cellulaire L’ADN mitochondrial • Organite intracellulaire à double membrane • Intervient dans la production énergétique de la cellule • Possède son propre génome 6 L’ADN mitochondrial Le code génétique mitochondrial diffère du code génétique universel • Dans la matrice • Circulaire • Deux brins Mito ch ond r i es Co don Cod e u niv erse l Mam m i f è res Dr o s oph i la N eu ro sp ora Le v ure P lan t e s UGA S t op Trp Trp Trp Trp S t op AGA , AGG S t op S er Ar g Ar g Ar g Ar g AUA Il e Me t Me t Il e Me t Il e AUU Il e Me t Me t Me t Me t Il e Leu Leu Leu Leu Thr Leu • Taille: • 16,5 kilobases chez l’homme • 78,5 kilobases chez la levure • Pas d’introns chez l’homme • Hérédité maternelle CUU, CU C, CUA, CUG Origine des composants protéiques de la mitochondrie Origine des composants protéiques de la mitochondrie Inhibiteurs pharmacologiques • Les protéines codées par l’ADN mitochondrial restent toujours dans la mitochondrie • alpha-amanitine Transcription nucléaire • cycloheximide Traduction cytoplasmique • acridine ou éthidium Transcription mitochondriale • chloramphénicol, érythromycine, tétracycline Traduction mitochondriale Importation des protéines mitochondriales produites dans le cytoplasme • La majorité des protéines mitochondriales sont codées par l’ADN nucléaire • Les ARN messagers correspondants sont traduits sur des ribosomes cytoplasmiques libres Rôle des protéines chaperons dans l’adressage des protéines cytoplasmiques vers la mitochondrie 7 L’adressage des protéines cytoplasmiques vers la membrane interne ou l’espace intermembranaire Origine des mitochondries La théorie endosymbiotique s’appuie sur le parallèle fait entre les bactéries et les mitochondries Evolution vers des cellules avec mitochondries et chloroplastes Les mitochondries sont seules responsables de la respiration. Sans mitochondries, les cellules animales seraient des organismes anaérobies, dépendant énergétiquement du processus relativement inefficace et antique de la glycolyse. De nombreuses bactéries actuelles peuvent respirer, comme les mitochondries. Il semble donc probable que les cellules eucaryotes sont les descendantes d'organismes primitifs anaérobies qui ont survécu dans un monde devenu riche en oxygène par intégration de bactéries aérobies les maintenant en symbiose pour leur capacité de consommer l'oxygène atmosphérique et de produire de l'énergie. Les arguments contre cette théorie • Le code génétique des mitochondries diffère du code génétique universel des procaryotes • L’ADN bactérien n’a pas d’introns alors que l’ADN mitochondrial de levure en possède Les éléments en faveur de cette théorie • La mitochondrie est un organite à double membrane • Présence d’ADN dans un organite • Mécanisme de chimiosmose comparable La division mitochondriale se fait par scissiparité Comme pour les eucaryotes, chaque mitochondrie fille est génétiquement identique à la mère. 8