Jean-Baptiste ROMAGNAN - Observatoire Océanologique de

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Jean-Baptiste ROMAGNAN - Observatoire Océanologique de
Jean-Baptiste ROMAGNAN---------------------------------------2008 / 2009------Integrative Oceanography Division
Scripps Institution of Oceanography, UCSD
9500 Gilman Drive, Mailbox 0218
La Jolla, CA 92093-0218, USA
tel: (001) 858-534-1547
mobile: (001) 858-207-8195
courriel :
[email protected]
[email protected]
ANALYSTE de ZOOPLANCTON
-------Situation actuelle------Depuis le mois d’Avril 2008, pour une durée d’un an, je suis « Zooplankton
Analyst » au laboratoire de Mark Ohman, au sein du Departement d’Oceanographie
Integrative (IOD) de la Scripps Institution of Oceangraphy, à San Diego, CA.
Î Mes fonctions incluent la conduite d’un projet autonome au sein du laboratoire
ainsi que la supervision de toutes les activités relatives au Zooscan :
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Préparation et scan d’échantillons préservés et frais de zooplancton
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Mise en œuvre des techniques d’apprentissage automatique relatives a
l’élaboration des données issues du processus d’analyse du Zooscan
-
Identification taxonomique de zooplancton
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Encadrement et formation d’étudiants et de stagiaires à l’utilisation du
Zooscan
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Maintenance de l’appareil, mises à jour logicielles et des techniques d’analyse
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Analyse et présentation de données
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Rédaction de communications scientifiques (posters, protocole expérimental,
etc..)
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Campagnes a la mer, gestion de l’échantillonnage de zooplancton (filets
MOCNESS et BONGO)
Î Toutes ces taches sont réalisées en anglais
-------Formation Académique------•
2005/2007 :
Master Océanographie & Environnement Marin
specialité Oceanographie Pelagique & Modellisation de l’Environnement Marin (Université Paris 6)
•
2004/2005 :
Licence de Biologie Marine (Université de La Rochelle.)
•
2003/2004 :
Bachelor of Marine & Freshwater Biology
•
(Napier University, Edimbourg, Ecosse)
2001/2003 :
DUT Génie de l’Environnement (Université Toulon-Var)
-------Stages et projets------•
2007
Changement verticaux d’habitat du mesozooplancton dans le courant
californien, Scripps Institution of Oceanography, San Diego, 5 mois. Superviseur: Dr. Mark Ohman.
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utilisation du Zooscan et des techniques associées
taxonomie du mesozooplancton
analyse de spectres de taille
programmation et analyse de données sous Matlab et Systat
campagne a la mer (21 jours), échantillonnage de zooplancton et CTD
pratique intensive de l’anglais (parlé, lu et écrit)
Stages d’enseignement au LOV
Analyse Exploratoire Multidimensionnelle des Écosystèmes : Analyse de données univariées
(EVF, analyse de séries temporelles) et multivariées (ordination : ACP, AFC, AFCM,
classification, analyse discriminante). Utilisation des logiciels Spad, Systat et MatLab.
Modélisation de l’Environnement Marin : comparaison de 2 modèles de réseau trophique NPZD
pour étudier l’influence des ciliés sur la dynamique du réseau.
Réponse du Plancton aux changements Climatiques et Environnementaux : Présentation des
réponses en termes de physiologie, de composition, de répartition du plancton en relation avec
le réchauffement climatique et l’anthropisation.
Océanographie Spatiale : utilisation des satellites en océanographie. Couleur de l’eau,
température de surface, hauteur de l’eau, vitesse et direction des vents de surface.
Océanographie Instrumentale et Méthodologie : campagne de 2 jours en mer Ligure sur la
radiale Nice-Calvi, prélèvement du plancton au filet WP2, au filet-pompe, à la bouteille Niskin,
mesures hydrologiques avec la sonde CTD, acquisition et analyse de profils vidéos verticaux avec
le PVM, comptage et identification du zooplancton sous loupe binoculaire et à l’aide du Zooscan,
cartographie et analyses de données multivariées sous MatLab.
Biodiversité du Plancton Marin et Fonctionnement de l’Ecosystème pélagique (2006) : 2
stages différents mais intimement liés. Taxonomie et découverte de la biodiversité du plancton
marin et mise en perspective de cette diversité à travers l’étude mécanistique et fonctionnelle
d’un réseau trophique pélagique méditerranéen.
•
2006
Etude de la distribution du zooplancton en mer tyrrhénienne au cours
de l’été et l’hiver 2005- Relation avec l’hydrologie, Observatoire Océanologique de
1/
Villefranche, 2 mois. Superviseurs: Dr Gabriel Gorsky & Dr Lars Stemmann
- utilisation du Zooscan et des techniques associées
-
taxonomie du mesozooplancton
analyse de spectres de taille
programmation et analyse de données sous Matlab
Analyse de zooplancton avec le Zooscan et le Profileur Video Marin
(PVM) pour la campagne BIOSOPE (2004), Observatoire Océanologique de Villefranche, 1
2/
mois. Superviseurs: Dr Gabriel Gorsky & Dr Lars Stemmann
- Utilisation du Zooscan et des techniques associées
- taxonomie du mesozooplancton et du macroplancton gélatineux
- analyse de profils vidéo issus du PVM
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2005
Le phytoplancton du Loch Creran de 2003 à 2005 : Comparaison avec une
série temporelle (1970-1981) - évaluation de l'impact d'une ferme
aquacole, Napier University, Ecosse, 2 mois. Superviseur : Prof. Paul Tett
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identification de phytoplancton en microscopie inversée
traitement de données (Excell, Minitab, Systat)
extraction à l’acétone de chlorophylle a et analyse par méthode fluorométrique
pratique intensive de l’anglais
mini campagne d’échantillonnage (3 jours) sur le loch Creran (CTD et filets)
2003
Biomonitoring de la pollution au TriButyléTain par l'étude des populations
d'Hexaplex trunculus dans la lagune de Venise, Laboratoire de Chimie de
l'Environnement, université Ca' Foscari de Venise. Superviseurs :Prof. Bruno Pavoni & Prof. Jean-Louis
Jamet
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chimie analytique
extraction des composés organostanniques(TBT et dérivés)
Chromatographie en Phase Gazeuse (CPG)
Spectrométrie de Masse
pratique intensive de l’Italien
-------Communications scientifiques------•
2008
Zooplankton digital image analysis: assessment of size-dependent variations in vertical distributions of
Copepods and Chaetognaths. Romagnan, J. B., Ohman, M. D. Poster et Abstract, Conférence CalCOFI, San
Diego, 2008.
•
2007
Zooplankton community structure and size distribution in the southern Tyrrhenian sea during the 2005
CIESM SUB1 and SUB2 cruises. L. Stemmann, J.B. Romagnan, M.G. Mazzocchi, C. Garcia Comas, E. Antajan,
M. Picheral, N.J. Daly Yahia, G. Gorsky. Rapp. Comm. int. Mer Médit., 38, 2007.
Vertical habitat shift in California Current mesozooplankton: Copepods vs Chaetognaths. Romagnan, J. B.,
Ohman, M. D. Poster et Abstract, Conférence ASLO, Orlando, 2008.
-------Langues étrangères------Anglais : Lu, écrit et parlé couramment (20 mois en pays anglophones so far)
Italien : Parlé couramment (5 mois en Italie)
Espagnol : Lu et écrit niveau bac LV2.
-------Autres informations utiles------•
Expérience professionnelle
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Centres d’intérêt
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Conducteur-Régleur (Cartonnages VJ, 2007-2008)
Animateur spécialisé dans la collecte de fonds (AIDES, 2005-2006)
Préparateur de commande dans la grande distribution (ED, 2004)
Boulanger (boulangerie artisanale, 2005)
Technicien vérificateur sécurité incendie (marine marchande, Servaux Marseille, 2003)
Manœuvre, Manutentionnaire (Danzas, Geodis, Moby, 2000-2002)
Voyages en France et à l’étranger
Milieu marin (plaisance, surf, océanographie)
Randonnée, montagne
Cinéma, lecture, musique (guitare)
Environnement : membre de l’association Trimarrant: tri et réduction des déchets sur les lieux de
manifestations culturelles, sensibilisation du public à ces problématiques.
« Fourre-tout »
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Permis B et voiture personnelle
AFPS (2001)
Certificat d’Aptitude a Conduire En Sécurité (CACES), niveau 2 (permis chariots a fourche)
Autostoppeur chevronné (plusieurs milliers de km a mon actif a travers l’Europe)
Je totalise 58 jours de campagne océanographique à ce jour.