planning previsionnel_BOMC2

Planning BOMC (sous réserve de modification)
Lundi 5 Décembre 2016
Matin cours théorique 9h-12h –ED7
Objectifs généraux (Cindy Degerny)
Outils Biologie Moleculaire
Notion de biologie Haut Débit
Mardi 6 Décembre 2016
Après-midi cours théorique 14h-17h- Salle Pôle Biologie 2ème étage BROCA
NGS (Jerome Bouligand) : technologie et applications
Bioinformatique : présentation des besoins d’analyse, outils dispo (Christophe Habib)
Présentation Galaxy (JB, Christophe Habib)
Mercredi 7 Décembre 2016
en salle TP4 8h-13h / 14h-17h salle TP2 (salle info)
Analyse par FACS (journée théorique/pratique Géraldine Louf)
1. Cours théorique FACS
2. Partie pratique
a. Marquage des cellules
b. Passage au FACs
3. Analyse de données (logiciel gratuit cf TP Orsay)
Jeudi 8 décembre 2016
Matin 8h-11h –salle TP4
Consultation fictive
Extraction ADN et PCR
Après midi 14h-17h –salle informatique TP 2
Présentation de la plateforme Galaxy Rosetta
Exemple d’application simple
Vendredi 9 décembre 2016–
matin TP 8h-11h –salle TP4
Vérification de PCR et coupure
Conseil génétique
Visite des plateformes 14h-17h Salle ED 12
plateforme NGS 1h ? (JB)
Plateforme GCMS (CD)
Plateforme microscopie (FL)
Lundi 12 décembre 2016 :
9h - 12h cours théorique salle TP4
Rappel sur le génome et les gènes ; l’expression des gènes (CD, JB)
Transmission mendelienne et mutations
Après midi 14h – 17h salle informatique Joliot
Premier pas avec Galaxy pour analyser les données NGS
Mardi 13 décembre 2016 : salle informatique TP2
9h - 12h :
Analyse d’un patient de A à Z pas à pas par un workflow
14h – 17h : Analyse et d’interprétation des résultats
Mercredi 14 décembre 2016 - OFF
Jeudi 15 décembre 2016 – salle informatique TP2
9h -12h : Cours de conclusion + évaluation de la formation
Vendredi 16 décembre 2016 – ED9 + ED16
10h – 11h30 Examen BOMC 1h30
MCC : 50% note en CC par CR + 50% note exam théorique
CR :
1CR sur le TP HFE
1CR sur le FACS
1CR sur l’analyse NGS par Galaxy