PRIOLEAU Marie

ED BIO SORBONNE PARIS CITE
Proposition de sujet de thèse à l’appui d’une demande de contrat doctoral 2016-2017
Renseignements relatifs à l’Unité de Recherche :
Label et intitulé : UMR7592
Nom et prénom du Directeur : Giuseppe Baldacci
Téléphone :
01 57 27 81 39
Télécopie :
Courriel: [email protected]
Renseignements relatifs à l’Equipe :
Nom de l’Equipe d’Accueil : Domaines chromatiniens et réplication
Nom et prénom du responsable : Marie-Noëlle Prioleau
Qualité du responsable : DR Inserm
Téléphone :
01 57 27 81 02
Télécopie :
Courriel : [email protected]
Renseignements relatifs au sujet de thèse :
Nom et prénom du Directeur de thèse (HDR) : Marie-Noëlle Prioleau
Qualité : Chef d’équipe
Téléphone :
Télécopie :
Courriel :
Titre du sujet proposé :
(En français) Identification des facteurs clés de l’initiation de la réplication
(En anglais) Identification of key factors involved in replication initiation
Département (cocher le département correspondant au sujet de thèse qui n’est pas obligatoirement le
vôtre) :




Biologie Cellulaire et moléculaire, Physiologie et Physiopathologie
Immunologie
Développement Génétique Neurobiologie et Vieillissement
Infectiologie, Microbiologie
Summary (5 lines maximum) :
At each cell division, eukaryotic genomes have to be duplicated once and only once through a tightly
regulated process named DNA replication. In large vertebrate genomes about 50 000 starting points
(replication origins) are activated during S phase. A spatiotemporal program controls both origin
positions and their timing of firing but their regulation remains largely unknown. The PhD project relies on
both genetic and genome-wide studies to understand molecular events involved in this regulation crucial
for genomic integrity.
Proposition de sujet de thèse à l’appui d’une demande de contrat doctoral 2016-2017
Nom, prénom du directeur de l'unité de recherche : Giuseppe Baldacci
Numéro de l'unité de recherche (et établissement de rattachement) : UMR7592
Nom, prénom du responsable de l'équipe d'accueil (EAD) : Prioleau Marie-Noëlle
Nom, prénom du directeur de thèse : Prioleau Marie-Noëlle
Titre du sujet de thèse proposé : Identification of key factors involved in replication initiation
(en anglais)
Citer 5 mots clés : Replication origin, G-quadruplex, Chromatin, Genomic, Proteomic
(key words)
Candidat pressenti :

OUI

NON
Contenu scientifique du programme de la thèse (en anglais)
We and others have shown enrichment of G-rich motifs inside strong replication initiation sites
genome-wide. These motifs have the capacity to be structured into G-quadruplex (G4). Deletions of the
G-rich motif in two model origins showed their important function in origin activation in the DT40 avian
cell line. Point mutations inside the G-rich motif of one model origin have demonstrated the importance
of forming this structured G4 for replication initiation. We also showed that a G-rich motif is not sufficient
to induce an origin of replication and identified a 200 bp cooperating cis-module on one model origin.
The aim of this PhD project is to refine our vision of molecular mechanisms involved in origin function.
Firstly, we plan to delineate more precisely on our two model origins the minimal size and sequence
motif of the cooperating cis-module. We will define how these cis-elements might influence locally
chromatin organization during the cell cycle. Based on this new information, we will search for
enrichment of the new identified signal(s) inside replication origins genome-wide. We will also develop a
new origin mapping method that will delineate very early firing origins in the avian DT40 cells and in
human cells. We will determine common genetic features of these specific origins in order to decipher
new potential regulatory pathways involved in the control of early firing. Proteomic analyses will be
performed to identify specific and new trans-factors associated with these early replicated origins.
Altogether this work will provide new key information on the regulation of the spatiotemporal program of
DNA replication.
Indiquez les cinq meilleures publications récentes de l’équipe :
- Schiavone D, Guilbaud G, Murat P, Papadopoulou C, Sarkies P, Prioleau MN, Balasubramanian S,
Sale JE. Determinants of G quadruplex-induced epigenetic instability in REV1-deficient cells. EMBO J.
2014 Nov 3;33(21):2507-20.
- Picard F, Cadoret JC, Audit B, Arneodo A, Alberti A, Battail C, Duret L, Prioleau MN. The
spatiotemporal program of DNA replication is associated with specific combinations of chromatin marks
in human cells. PLoS Genet. 2014 May 1;10(5):e1004282.
- Valton AL, Hassan-Zadeh V, Lema I, Boggetto N, Alberti P, Saintomé C, Riou JF, Prioleau MN. G4
motifs affect origin positioning and efficiency in two vertebrate replicators. EMBO J. 2014 Apr
1;33(7):732-46.
- Hassan-Zadeh V, Chilaka S, Cadoret JC, Ma MK, Boggetto N, West AG, Prioleau MN.USF binding
sequences from the HS4 insulator element impose early replication timing on a vertebrate
replicator.PLoS Biol. 2012 Mar;10(3):e1001277.
- Meisch F, Prioleau MN. Genomic approaches to the initiation of DNA replication and chromatin
structure reveal a complex relationship. Brief Funct Genomics. 2011 Jan;10(1):30-6