b4b-connection : mercredi 30 mars

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B4B-CONNECTION : MERCREDI 30 MARS
EN PARTENARIAT AVEC BUZZ4BIO SUR INSCRIPTION
INÉDIT ! Le mercredi 30 mars, dans le site insolite de la Collégiale Saint-Martin, des
rendez-vous d’affaires et des présentations d’entreprises compléteront idéalement le
programme de Gen2Bio. La combinaison de ces deux journées permet aux
participants d’optimiser leur visite à Angers et de maximiser les bénéfices de ces
rencontres. La journée B4B-Connection est organisée avec le soutien du Conseil
général de Maine-et-Loire.
Tarifs : consulter Buzz4bio. Tarifs préférentiels
pour les entreprises de Bretagne et Pays de la Loire !
Plus d'infos sur www.buzz4bio.com
GEN2BIO 2011 EST ORGANISÉ AVEC LE SOUTIEN DE
8H30 : CAFÉ D’ACCUEIL
CONFÉRENCES (AMPHITHÉÂTRE)
Journée animée par Brian MONKS, animateur de Capbiotek, le cluster des
biotechnologies en Bretagne, et Charles PINEAU pour la matinale « Biologie intégrative »
MATINALE AUTOUR DE LA BIOLOGIE INTÉGRATIVE
9h00 Allocution d’accueil : Représentant de la Région Pays de la Loire et
Daniel BOUJARD, président de Biogenouest
9h10 « Apports de la génomique et de la métagénomique à l'étude des
Mamiellales, les plus petits eucaryotes du phytoplancton »
Gwenaël PIGANEAU, CR CNRS, Observatoire Océanologique de Banyuls-sur-Mer
9h50 « Modèles dynamiques prédictifs pour l’identification de cibles
thérapeutiques et de biomarqueurs » Jean-Baptiste DUMAS, Gérant et
directeur technique, Helios Biosciences
10h30 PAUSE-CAFÉ
11h00 « Des réseaux d'interactions à la modélisation : intérêt pour l'étude du
mécanisme d'action de l'endostatine » Sylvie RICARD-BLUM, Institut de
biologie et chimie des protéines, UMR 5086 CNRS - Université Lyon 1
11h40 « Vers le contrôle de la qualité sensorielle et nutritionnelle du fruit :
approches de génomique fonctionnelle chez la tomate »
Christophe ROTHAN, INRA UMR Biologie du fruit Bordeaux
ATELIERS TECHNOLOGIQUES
SUR INSCRIPTION VOIR PROGRAMME EN ANNEXE
Les ateliers ont lieu en parallèle des conférences. Destinés à la fois aux chercheurs et
aux entreprises, ils abordent de façon concrète des sujets variés : technologies,
applications, valorisation, transfert de technologie… Les participants sont invités à
interagir avec l’animateur pour apporter un témoignage, poser une question...
ATTENTION : pré-inscription obligatoire sur www.gen2bio.org.
ORGANISATION ET INSCRIPTIONS
Gen2Bio est le rendez-vous annuel des chercheurs de l'Ouest et des entreprises
biotech. Il est organisé par Biogenouest, le réseau des plates-formes du Grand Ouest
en sciences du vivant et de l’environnement : plus de 50 laboratoires de recherche en
Bretagne et Pays de la Loire, 20 plates-formes technologiques, soit 2000 personnes
dont 800 chercheurs et enseignants-chercheurs.
Gen2Bio permet d'établir un contact direct avec les plates-formes et de mesurer
l'avancée des travaux de recherche en sciences du vivant en France.
Chercheurs et industriels, ingénieurs et doctorants, acteurs de la valorisation…
cette journée vous est dédiée !
12H20 À 13H30 : COCKTAIL DÉJEUNATOIRE ET VISITE DE L’EXPOSITION
INSCRIPTION gratuite mais obligatoire : en ligne sur www.gen2bio.org.
13h30 « Breakthrough Technologies and Open Innovation »
Valérie ANDRÉ, Senior Manager Scouting & Strategy, BASF Future Business
GmbH, Ludwigshafen, Allemagne
14h10 « Services pour l’étude des interactions protéiques : de la fonction des
protéines à l’identification de nouvelles voies de signalisation »
Etienne FORMSTECHER, Directeur scientifique et commercial, Hybrigenics Services
14h50 « Marchés d’application des biotechs : état des lieux et prospective pour la
Bretagne et les Pays de la Loire » Xavier PINARDON, Alcimed
15h30 PAUSE-CAFÉ
16h00 « Sécurisation d’un process de production d’un anticorps thérapeutique en
CHO : quels contrôles, quelles réglementations, quel coût ? »
Olivier BOISTEAU, co-fondateur et Président de Clean Cells
16h40 « Further evidences for the occurrence of more than one important starch
biosynthetic pathway in plants » Javier POZUETA ROMERO, PhD Biological
sciences, Institute of agrobiotechnology, Pampelune, Espagne
RENSEIGNEMENTS :
Christelle HAYS
Tél. 02 23 23 45 85 - [email protected]
Eric MATHIEU
Tél. 02 41 72 86 17 - [email protected]
17H45 : FIN DE GEN2BIO 2011
LIEU DU CONGRÈS
Centre des congrès de Terra Botanica
Route de Cantenay Epinard
49000 ANGERS
Tél. 02 41 25 00 00
www.terrabotanica.fr / Accès
(Coordonnées GPS : lat. 47°29'54" N - long. 0°33'56" O)
Programme des Ateliers technologiques
Gen2Bio 2011 – Angers, jeudi 31 mars 2011
Les ateliers durent 35 minutes et ont lieu en parallèle des conférences en amphi. Vous pouvez participer à 1 ou plusieurs ateliers (7 maximum).
Attention : Pour nous permettre d'organiser au mieux la journée, l'inscription aux ateliers est obligatoire.
9h50
Salle 1
Salle 2
Salle 3
Salle 4
1. « L’axe Génomique de Biogenouest :
périmètres actuel et futur »
L'atelier vise à présenter l'organisation de
l'axe génomique de Biogenouest, son
périmètre et ses acteurs. L'activité actuelle
de l'axe ainsi que les jalons importantw pour
l'année 2011 en matière de nouvelles offres
de servicew seront également abordés.
8. « Biogenouest, le réseau des platesformes du Grand Ouest en sciences du vivant
et de l’environnement »
Cet atelier présente l’organisation du réseau
Biogenouest, ainsi que les modalités de
fonctionnement des 20 plates-formes au sein
des 5 axes technologiques.
15. « Développement d’un pacemaker
biologique cardiaque par transfert non-viral de
gènes » - Actuellement, la seule thérapie des
troubles de la conduction cardiaque est
l’implantation d’un stimulateur électronique
cardiaque (pacemaker). Bien que ceux-ci
représentent un moyen thérapeutique efficace, ils
s'accompagnent de nombreux inconvénients
(infections, embolies, dysfonctions mécaniques,
complications propres aux jeunes enfants...).
L’idée de mettre au point un pacemaker
biologique répondant au mieux aux besoins
physiologiques a émergé : notre stratégie a été le
transfert de gènes dans le myocarde."
22. « Développement de cultures bactériennes
protectrices antifongiques pour améliorer la
conservation des produits laitiers fermentés »
L’atelier présente les travaux menés par l’unité
Inra BIA de Nantes dans le cadre du projet ANR
Funginib labellisé par le Pôle Valorial. Ce projet
met en lumière la possibilité d’utiliser des
cultures bioprotectrices actives en lieu et place
des additifs chimiques pour la conservation des
produits laitiers fermentés, sensibles aux
altérations fongiques. Les travaux de recherche
menés par l’Inra BIA au sein de ce projet portent
sur l’étude de bactériocines, avec une recherche
d’optimisation de leur potentiel antifongique par
la modification de leur séquence peptidique.
Axe Génomique
Richard REDON et
Philippe VANDENKOORNHUYSE
Biogenouest
Jocelyne LE SEYEC, animation scientifique et
des plates-formes Biogenouest
PAUSECAFÉ À
10H30
11h00
Exploration fonctionnelle « Cardiex »
Maud CHÉTIVEAUX (Cardiex) et
Cynthia ORÉ-CERPA (UMR 915)
2. « Affymetrix GeneTitan : un nouvel outil
d'analyse génomique à très haut débit »
La plate-forme de génomique de Nantes
disposera en 2011 de la nouvelle technologie
de génotypage et d’analyse transcriptomique
à très haut débit sur station Affymetrix
GeneTitan. Le principe et les applications de
la technologie sont présentés ici.
9. « Les métadonnées et leur gestion dans
les domaines –omiques »
La production des informations en biologie a
subi des modifications radicales sous
l'impulsion des nouvelles technologies et
l'évolution de cette discipline se fera grâce à
l'adoption de modalités permettant
l'intégration des données.
Axe Génomique
Richard REDON
Axe Bio-informatique
Olivier COLLIN
16. « Utilisation de la microscopie confocale à
fluorescence pour l’étude de MELK au cours du
développement embryonnaire précoce chez le
xénope »
Exploration fonctionnelle « MRic »
Marc TRAMIER, Stéphanie DUTERTRE et
Jean-Pierre TASSAN
Atelier proposé par le pôle Valorial
Yvan CHOISET et Jean Marc CHOBERT
(Inra UR1268 BIA)
23. « Valorisation des bioressources marines :
les algues, source d’énergie » - La filière
Atlanpole Blue Cluster compte une centaine
d’acteurs dont l’objectif est de préserver,
produire et valoriser les éco-ressources marines.
Parmi ces acteurs, le laboratoire GEPEA, acteur
incontournable, porte un projet de
démonstrateur préindustriel dédié à la mise en
place de l’exploitation de microalgues pour la
production d’énergie à grande échelle.
Atelier proposé par Atlanpole Blue Cluster
Florence HALLOUIN, Atlanpole Blue Cluster et
Jack LEGRAND, GEPEA
11h40
3. « Séquençage de masse 454 : applications offertes et développements
envisagés »
Depuis une année le séquençage en masse
par pyroséquençage 454 version titanium est
offert aux laboratoires du réseau
Biogenouest. Des développements innovants
ont été réalisés pour proposer différentes
applications en recherche et analyses, ces
approches sont exposées lors de cet atelier.
Axe Génomique
Philippe VANDENKOORNHUYSE
10. « Comment accroître les performances
des programmes bio-informatiques grâce aux
cartes graphiques » - L'offre de cartes
graphiques, dopée par le marché des jeux
vidéo et de la visualisation 3D, a connu
récemment un essor considérable : le matériel
proposé est devenu plus généraliste, et d'une
puissance telle que de nombreuses
applications bio-informatiques ont pu être
accélérées d'un facteur 10 à 100 par rapport à
leur exécution traditionnelle sur CPU.
Axe Bio-informatique
Charles DELTEL, Inria
17. « Imagerie in vivo par luminescence et
24. « Genomic and phenotypic analysis of wine
fluorescence : applications au développement de yeast strains » - Wild Saccharomyces cerevisae
vecteurs pour le transfert de gènes »
exhibits high genotypic and phenotypic diversity,
Utilisation des outils de bioluminescence et de
which we have explored, using high-throughput
fluorescence : applications au domaine du
screening methodologies to identify strains with
transfert de gènes.
interesting biotechnological traits.
Exploration fonctionnelle « Vecteurs de
synthèse SynNanoVect »
Tristan MONTIER (SynNanoVect) et
Frédérique GAUTIER (Berthold)
Atelier proposé dans le cadre du projet
européen ShareBiotech (en anglais)
Ana Catarina GOMES, PhD, Coordinator
researcher at the Genomics unit, Biocant,
Cantenhede, Portugal
Programme des Ateliers technologiques
Salle 1
13h30
4. « Découverte et analyse fonctionnelle de
protéines : les offres de l'axe Protéomique
de Biogenouest »
Cet atelier présente la structuration de l’axe
Protéomique et l’offre de ses plates-formes
technologiques.
Axe Protéomique
Charles PINEAU, Hugues GASCAN,
Yannick JACQUES et Pierre WEIGEL
Salle 2
Salle 3
11. « Le ″High-content screening″ ou la
18. « Présentation d’un projet "inter"
vision intégrée de la robotique appliquée à la plates-formes : le projet Gliome du
biologie, de la culture à l'imagerie
Cancéropôle Grand Ouest » - Le projet
cellulaire »
Gliome, financé par l’INCa, fait appel aux
plates-formes de génomique et de protéomique de Biogenouest. Au cours de l’atelier
Axe Exploration fonctionnelle « ImPACcell »
seront présentés le montage et le déroulement
Rémy LE GUÉVEL, ImPACcell, Hamilton
du projet, ainsi que des résultats. Des responRobotics et Cellomics ThermoFisher
sables de plates-formes Biogenouest témoigneront de leur implication dans le projet.
Philippe MENEI, chef du département de
neurochirurgie, CHU d’Angers
14h10
5. « Technologie Luminex : exemples
d'utilisation par Padam »
Présentation de la technologie Luminex par la
société Bio-Rad et de ses applications dans le
cadre des activités de la plate-forme de
production d’anticorps monoclonaux.
Axe Protéomique « Padam »
Josy FROGER, Yannick DANGER (Padam) et
Laurence TALBOT (Bio-Rad)
12. « Rôle du microenvironnement dans le
cancer du foie : caractérisation moléculaire
par une approche de génomique
intégrative » - Par une approche combinée de
microdissection par capture laser in vivo, de
co-cultures de cellules stromales et tumorales
in vitro, et de génomique fonctionnelle, nous
avons caractérisé les altérations du
microenvironnement tumoral dans le cancer du
foie, modélisé les interactions tumeur-stroma
et évalué leur impact fonctionnel sur la
survenue et la progression tumorale.
Axe Exploration fonctionnelle « H2P2 »
Alain FAUTREL, Cédric COULOUARN, Inserm U991
14h50
PAUSECAFÉ À
15H30
16h00
6. « La technologie de transfert d'énergie de
fluorescence (BRET, HTRF) et la ligation de
proximité dans l'étude des interactions
moléculaires et le criblage haut débit :
applications » - L'atelier présente l'approche
de transfert d'énergie de fluorescence pour
l'étude des interactions sur cellules vivantes et
son utilisation plus appliquée à la recherche
haut débit et la validation de molécules à
potentiel thérapeutique.
Axe Protéomique « Impact »
Mike MAILLASSON
7. « Imagerie par spectrométrie de masse:
développements récents et applications pour
la compréhension des phénomènes
biologiques »
Cet atelier expose les tout derniers
développements de l'imagerie par
spectrométrie de masse et les applications
possibles de cette technologie pour aider à la
compréhension des phénomènes biologiques.
13. « Biologie et physiologie de l'adaptation
au milieu : que dit la métabolomique ! »
Savoir-faire, compétences et moyens de la
plate-forme Corsaire pour appréhender
l'analyse de métabolites d'intérêt à partir de
différents objets biologiques et en relation
avec leur environnement abiotique, dans le
cadre d'études de l'adaptation ou de la
réaction des organismes vivants à leur milieu.
Axe Analyse structurale et métabolomique
« Corsaire » Philippe POTIN (MetaboMer) et
Alain BOUCHEREAU (P2M2)
14. « Avancées récentes concernant
l'utilisation de l'IRM pour l'amélioration
génétique des espèces piscicoles »
L'utilisation d'un scanner IRM pour l'analyse
d'un grand nombre d'échantillons de poissons
(1000) a permis d'estimer l'héritabilité du taux
de lipide de la chair dans le cadre d'un projet
d'évaluation généalogique assistée par
empreintes génétiques pour les programmes de
Axe Protéomique « Protéomique haut débit » sélection de la filière truiticole.
Exploration fonctionnelle « Prism »
Mélanie LAGARRIGUE, Régis LAVIGNE
Pierrick HAFFRAY (Sysaaf) et Guylaine
COLLEWET (Cemagref, plate-forme Prism)
19. « Le Centre d'études et de recherches
sur les radiopharmaceutiques : un outil de
choix pour la recherche biomédicale »
L'équipe mixte implantée au CHRU de Tours
développe et utilise des traceurs radioactifs
pour l'exploration cérébrale et le cancer. Le
laboratoire Cyclopharma est spécialisé dans la
production et la commercialisation de ce type
de « médicaments ». Associer les
connaissances scientifiques de l'un aux savoirfaire industriels de l'autre semblait évident.
Atelier proposé par la région Centre
Denis GUILLOTEAU, directeur du CERRP et
Jean-Bernard DELOYE (Lab. Cyclopharma)
20. « Transgenèse par l’utilisation de vecteurs viraux (lentivirus et adeno-associated
virus) » - Exemple de collaboration entre la PF
de Transgenèse Rat (Inserm U643) et les PF de
production de vecteurs lentiviraux (Inserm
U948) et de vecteurs AAV (Inserm U649). Nous
présenterons les potentialités de ces 2 types
de vecteurs pour générer des modifications
géniques chez le rat.
Axe Exploration fonctionnelle, atelier
commun aux plates-formes « Vecteurs viraux » et
« Transgenèse Rat » : Séverine RÉMY, Tuan
NGUYEN et Véronique BLOUIN-TAVEL
21. « Altérations du métabolome plasmatique
et du protéome cérébral des ratons présentant un retard de croissance intra-utérin » Illustrer la complémentarité des approches de
protéomique et de métabolomique menées sur
les plates-formes Bibs et Laberca pour étudier
l'impact d'un retard de croissance intra-utérin
sur la mise en place des réseaux métaboliques
dans l'hypothalamus.
Axe Analyse structurale et métabolomique
« Bibs » Jean-Philippe ANTIGNAC (Laberca),
Hélène ROGNIAUX (Bibs), Marie-Cécile
ALEXANDRE-GOUABAU (UMR PHAN Nantes)
Salle 4
25. « TERM : un réseau de 7 pays pour favoriser le développement et la valorisation de la
médecine régénératrice en région » - Coordonné par Atlanpole Biotherapies, le projet européen TERM vise à valoriser les ressources et les
compétences régionales dans le domaine des
thérapies innovantes. Cet atelier présente les
moyens mis en œuvre pour favoriser les
collaborations entre acteurs de la R&D des
différents clusters impliqués, ainsi que les
principales retombées attendues.
Atelier proposé par le pôle Atlanpole
Biotherapies Agnès KAMMOUN
26. « La norme ISO 9001 comme outil de
progrès : témoignages et retours d’expérience
de plates-formes Biogenouest certifiées »
Des Responsables Qualité de plates-formes
Biogenouest expliquent en quoi la certification
ISO 9001 est un outil de progrès, notamment pour
l'amélioration de l'organisation du travail.
Atelier animé par Véronique BLIN, Ingénieur
Qualité Biogenouest
27. « Des fertilisants à base d'algues pour aider
les cultures à mieux absorber l'azote » L’atelier met en lumière le procédé innovant
développé au sein du projet Azostimer, labellisé
par le Pôle Mer Bretagne, qui propose une
réponse innovante aux problèmes posés par la
fertilisation azotée en ciblant les effets stimulants des algues sur le métabolisme des plantes
et leur capacité d’absorption des apports.
Atelier proposé par le Pôle Mer Bretagne
Jean-Claude YVIN, directeur R&D Timac Agro
International (groupe Roullier)
28. « Tavelure du pommier : travaux de l’Inra
sur le génome de Venturia » - Les travaux de
génotypage sur des populations mondiales de
Venturia inaequalis, l'agent de la tavelure du
pommier, ont permis de retracer l'histoire
évolutive de cette maladie. Nous présenterons
les projets en cours sur l'exploitation de la
séquence du génome de V. inaequalis récemment acquise au laboratoire dans la recherche
de gènes ou de régions génomiques impliquées
dans l'adaptation du pathogène à son hôte.
Atelier proposé par le pôle Vegepolys
Bruno LE CAM, Inra, UMR 077 PaVé