Hépatite B - Institut national de santé publique du Québec

Guide des services
Laboratoire de santé
publique du Québec
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Hépatite B
Génotypage
Révisé le 2014-05-29
Indication clinique
Patients porteurs du virus de l'hépatite B (VHB) chez lesquels un traitement à l’interféron versus
analogues de nucléotides ou de nucléosides est envisagé.
Spécimens
Sérum ou plasma (prélevé sur EDTA ou ACD-A).
Un minimum de 1 à 2 ml d’échantillon est requis pour l’analyse.
Requête d’analyse
- Requête du LSPQ (FO-LSPQ-221) dûment complétée :
 inscrire « Hépatite B » dans la section « AGENT ÉTIOLOGIQUE PRÉSUMÉ OU RECHERCHÉ »; et
cocher l’option « Génotypage » dans la section « ANALYSE(S) DEMANDÉE(S) »;
 Dans la section « Autres données pertinentes », inscrire le résultat du dernier test
quantitatif de la mesure de la charge virale du VHB. Indiquer toute autre information jugée
pertinente.
Manipulation, conservation et expédition des spécimens
(a) Réception prévue au LSPQ dans les 7 jours :
 conserver réfrigéré et expédier sur sachets de glace (ice pack) ou
 conserver congelé à ≤ -60°C, sinon à ≤ -15°C et expédier sur glace sèche.
(b) Réception prévue au LSPQ au-delà de 7 jours :
 conserver congelé à ≤ -60°C, sinon à ≤ -15°C et expédier sur glace sèche.
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Méthodes utilisées et interprétation des résultats
L’ADN viral est isolé du sérum ou plasma sur une plateforme automatisée. Une PCR est effectuée
suivi d’un séquençage populationnel. La partie du génome ciblé pour le génotypage est la même que
pour une détermination de la résistance aux antiviraux, soit un segment de 827 nucléotides situé sur
le domaine rt du gène de la polymérase. Pour assigner le génotype, la séquence consensus est
comparée aux séquences de références des différents génotypes par inférence phylogénétique. Le
génome du VHB se classent en 8 principaux génotypes, identifiés A à H (Arauz-Ruiz et al., 2002;
Guirgis BSS et al., 2010). Le génotype G se produit principalement en coinfection avec le génotype A
(Osiowy et al., 2008).
Temps réponse
15 jours ouvrables.
Commentaires :
Le résultat du dernier test quantitatif de l’ADN-VHB doit être énoncé sur le formulaire d’analyse.
Références:
Arauz-Ruiz P, Norder H, Robertson BH, Magnius LO. Genotype H: a new Amerindian genotype of
hepatitis B virus revealed in Central America. J Gen Virol. 2002; 83:2059-2073.
Guirgis BSS, Abbas RO, Azzazy HME. Hepatitis B virus genotyping: current methods and clinical
implications. Int. J Infect Dis 2010; 14:e941-953.
Osiowy C, Gordon D, Borlang J, Giles E, Villeneuve JP. Hepatitis B genotype G epidemiology and coinfection with genotype A in Canada. J Gen Virol. 2008; 89:3009-3015.
Personnes ressources :
Personnel technique du secteur Biologie moléculaire : (514) 457-2070, poste 278.
Responsable de l’analyse : Donald Murphy, poste 266.
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