Télécharger le projet - BIO-SigNE - Université Paris-Sud

Ecole Doctorale ED 419 / Doctoral School ED 419
"Signalisations et Réseaux Intégratifs en Biologie"
"Signaling and Integrated Networks in Biology"
PROJET DE THESE
POUR CANDIDATURES AUX ALLOCATIONS DOCTORALES 2015
THESIS PROJECTS FOR PhD SCHOLARSHIPS
A renvoyer à l’Ecole Doctorale par voie électronique au plus tard le 03 avril 2015
[email protected]
Cet appel constitue la 1ère phase obligatoire avant toute candidature éventuelle au concours de
l’ED (2ème phase juin 2015) – Concours ED : 02 et 03 juillet 2015
This call is the first mandatory step before applying to participate in the competitive
scholarship examination of our Doctoral School on July 2 and July 3, 2015
Les étudiants intéressés sont priés de prendre contact avec le directeur de thèse potentiel
Students who are interested are invited to contact their potential thesis director
Unité de Recherche et Equipe d’Accueil proposant le projet
Research unit and team proposing the thesis project
Nom, Intitulé et N° du Laboratoire / Title and number of the laboratory
Institut des Neurosciences Paris-Saclay (UMR 9197)
Nom, Intitulé de l’Equipe d’accueil / Hosting team
Développement & Evolution de la Neurotransmission
Nom et prénom du directeur du Laboratoire / Name and first name of the laboratory director
VERNIER Philippe
Etablissement(s) de rattachement / Institution of affiliation
CNRS et Université Paris-Sud
Adresse postale (complète) du laboratoire / Full address of the laboratory
Institut des Neurosciences Paris-Saclay, Avenue de la Terrasse, CNRS
91190 Gif-sur-Yvette
Tél. / phone :
E-mail :
01 69 82 34 30
Fax :
[email protected]
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01 69 82 34 37
Responsable de l’équipe dans laquelle le doctorant fera sa thèse : Philippe VERNIER
Responsible of the hosting team of the PhD candidate
Intitulé de l'équipe / Title of the team
Développement & Evolution de la Neurotransmission
Nom et Prénom du chef d'équipe / Name and first name of the team leader
VERNIER Philippe
Titre et appartenance / Title and affiliation
DR1, CNRS
Nom et Prénom du directeur de thèse (si différent) /
Name and first name of the thesis director (if different)
YAMAMOTO Kei
Titre et appartenance / Title and affiliation :
CDI chercheur, CNRS
Adresse postale (complète) du laboratoire / Full address of the laboratory
Bâtiment 5, Avenue de la Terrasse, CNRS
91190 Gif-sur-Yvette
Tél. / phone :
01 69 82 42 95
E-mail :
[email protected]
Fax :
Nom du co-directeur éventuel (HDR) / Name of the co-director (if applicable)
VERNIER Philippe
Nom du co-encadrant éventuel (sans HDR) / Name a the co-superviser (if applicable)
Noms et Prénoms des doctorants encadrés par le directeur de thèse l’année 2015-2016 /
Name and first name of PhD students supervised by the thesis director in 2015-2016
(hors candidat pressenti)
Noms et Prénoms des allocataires (MESR, Région, Paris-Sud…) de l’équipe durant les deux
dernières années / PhD students of the team with a scholarship during the past two years
FONTAINE Romain (Région Ile de France)
Un candidat est-il déjà pressenti : OUI
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Projet de thèse en français et en anglais / Thesis project in French and English
Titre du projet : Etude des caractéristiques conservées de l’organisation cérébrale à l’origine de
la cognition chez les vertébrés
Résumé du projet (15 lignes maximum) :
Certaines espèces d’oiseaux ou de poissons présentent des capacités de raisonnement logique et
une adaptabilité des comportements en fonction du but à atteindre (fonctions exécutives) qui
ressemblent à celles que l’on trouve chez les primates, alors même que leur pallium ne forme pas
de couches comme le cortex des mammifères. La question générale est donc de comprendre
comment le pallium des oiseaux et des poissons peut, par son organisation et ses connexions,
rendre compte de propriétés cognitives semblables à celles des mammifères, malgré les
différences anatomiques apparentes entre ces groupes d’espèces.
Il existe des points communs entre l’organisation cérébrale des mammifères et des oiseaux et
l’objectif est de savoir si ces points communs existent aussi chez un poisson-modèle, le danio
(zebrafish). L’étude sera centrée sur deux systèmes 1) l’innervation du pallium par les noyaux
sensoriels. 2) l’innervation du pallium par les neurones dopaminergique du mésencéphale. Nous
allons étudier chez les oiseaux (principalement le poulet) et chez le danio, les caractéristiques de
l’innervation du pallium d’un point vue anatomique et moléculaire. Nous allons aussi mettre au
point chez le danio des tests comportementaux fondés sur le conditionnement opérant, qui
permet de comparer les fonctions cognitives chez des animaux différents.
Title of the project: Study of the conserved anatomo-functional organization of the pallium
underlying cognition in vertebrates
Summary of the project (15 lines maximum):
Some species of birds and teleost fishes possess higher order cognitive capacities, exhibiting
logical reasoning and goal-directed behaviors (executive functions). Although such behaviors are
similar to those found in primates, the pallium of birds and fish are not layered, unlike
mammalian cerebral cortex. Our general question is to understand how avian and fish pallium
are organized anatomically and functionally to generate cognitive capacity similar to mammals,
despite the large morphological differences.
The pallium organization shares important similarities between mammals and birds, which may
be critical for generating cognitive functions. We will focus on the following two systems. 1)
Modal-specific sensory inputs to the pallium via specific thalamic relay nuclei. 2) Innervation to
the pallium from mesencephalic dopamine neurons.
We will study the connectivity and molecular properties of these systems in birds (mainly
chicken) and zebrafish. We will also establish behavioral tests in zebrafish using operant
conditioning, which allows comparing cognitive functions in different animal groups.
Connaissances et compétences requises pour la thèse /
Knowledge and skills required for the thesis
Training in neuroscience and general biology, and, as much as possible in comparative
neuroscience and behavioral neuroscience.
Histological techniques in different animals (immunostaining, in situ hybridization, retrograde
tracing…)
Embryological methods (dissections, microinjections, mutant manipulation…etc)
Basic molecular biology techniques (PCR, DNA cloning,
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Sélection des cinq meilleures publications de l'équipe depuis 2010 (en soulignant les noms
des membres de l'équipe)
Attention : il s'agit des publications de l'équipe, pas du laboratoire.
Selection of the five best publications since 2010 (underline the names of team members)
Attention: these are the publications of the team, not of the laboratory
Affaticati P, Yamamoto K, Rizzi B, Bureau C, Peyriéras N, Pasqualini C, Demarque M, Vernier
P. 2015. Identification of the optic recess region as a morphogenetic entity in the zebrafish
forebrain. Scientific Reports 5:8738.
Yamamoto K, Mirabeau O, Bureau C, Blin M, Michon-Coudouel S, Demarque M, Vernier P.
2013. Evolution of dopamine receptor genes of the D1 class in vertebrates. Mol Biol Evol 30:
833-843.
Yamamoto, K. and Vernier, P. (2011) The evolution of dopamine systems in chordates.
Frontiers Neuroanat., 5: 21
Yamamoto K, Ruuskanen JO, Wullimann MF, Vernier P. 2011. Differential expression of
dopaminergic cell markers in the adult zebrafish forebrain. J Comp Neurol 519: 576-98.
Yamamoto K, Ruuskanen JO, Wullimann MF, Vernier P. 2010. Two tyrosine hydroxylase genes
in vertebrates -New dopaminergic territories revealed in the zebrafish brain-. Mol Cell Neurosci.
43: 394-402.
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