Proposition de Stage : 2013-2014
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Proposition de Stage : 2013-2014
Proposition de Stage : 2013-2014 Intitulé du stage Couplage des signaux physiologiques et de données d’IRM fonctionnelle chez l’Homme sain: acquisition et traitement des données. Contexte du stage Le laboratoire de Neurosciences Cognitives (LNC) est une unité INSERM qui se situe à l’Ecole Normale Supérieure à Paris (5ème arr). Le LNC a pour but d’élucider les fondements biologiques des fonctions mentales humaines et leurs altérations possibles dans les maladies neurologiques et neuropsychiatriques. Ces recherches se basent sur la psychologie expérimentale, la modélisation mathématique et la neuroimagerie (acquisition des données au Centre de NeuroImagerie de Recherche, Hôpital Pitié-Salpêtrière, 13ème arr). Objectifs du stage Ce stage s’inscrit dans un projet de recherche en neuroimagerie chez l’Homme sain qui a pour but d’étudier l’influence des facteurs physiologiques sur les données d’IRM fonctionnelle. Le but de ce stage est de mettre en place une procédure d'acquisition et de traitement des données physiologiques (électrocardiographie, électromyographie, conductance cutanée, respiration, diamètre pupillaire) afin de les corréler avec des données d'IRM fonctionnelle. Les procédures mises en place au cours de ce stage seront ensuite utilisées largement dans les études de neuroimagerie cognitives effectuées dans notre laboratoire. L’enregistrement des données d’IRM fonctionnelle se fera chez des volontaires sains au repos (IRM 3T, Siemens) et les signaux physiologiques seront acquis par des logiciels propriétaires ("Recorder" de BrainProducts, "Acknowledge" de Biopac). Les données physiologiques enregistrées dans l'IRM sont bruitées par l'acquisition IRM. Le but sera donc de débruiter ces différents signaux (filtrage, analyse en composantes indépendantes, …) pour ensuite les corréler avec les données d'IRM fonctionnelles. Les différentes étapes de ce stage seront : - Mise en place des enregistrements physiologiques et synchronisation avec l’IRM avant l’acquisition. - Acquisition des données d’IRM fonctionnelle et des différents facteurs physiologiques. - Traitement des signaux physiologiques, débruitage (toolbox EEGlab, http://sccn.ucsd.edu/eeglab/). - Traitement des données d'IRM fonctionnelles de repos (toolbox SPM sous Matlab : http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm). - Corrélation des signaux physiologiques débruités avec les données d’IRM fonctionnelle de repos. Compétences demandées - Avoir de solides connaissances de programmation (Matlab souhaitable). Avoir des bases en électrophysiologie. Avoir des bases en traitement du signal. Bon niveau en anglais (tutoriels, articles scientifiques, réunions d'équipe). Faire preuve de curiosité, d’autonomie, de rigueur et être motivé(e). Compétences acquises Au terme des 6 mois de stage, l’étudiant aura acquis les compétences suivantes : - Compréhension du fonctionnement d’un laboratoire de recherche et d’une plateforme expérimentale. - Gestion des étapes d’un projet de recherche - Acquisition de données d’IRM fonctionnelle et de facteurs physiologiques - Traitement de signaux physiologiques variés - Connaissances de bases en physiologie et fonctionnement du cerveau Modalités D’une durée de 6 mois, le stage aura lieu au Laboratoire de Neurosciences Cognitives, Unité INSERM U 960 à l’Ecole Normale Supérieure, 29 rue d’Ulm 75005 Paris. La mise en place du protocole expérimental et l'acquisition des données seront réalisées au Centre de NeuroImagerie de Recherche (CENIR) Hôpital Pitié-Salpêtrière, Bâtiment ICM - 47 boulevard de l'Hôpital 75013 Paris. Rémunération Le (la) stagiaire percevra une gratification de stage d'environ 400€/mois. Nom du responsable du stage Anne-Dominique LODEHO (Ingénieur de Recherche INSERM) Email : [email protected] Téléphone : 01.44.32.26.43 Laboratoire de Neurosciences Cognitives, Unité INSERM U960 Ecole Normale Supérieure - 29, rue d'Ulm 75005 Paris