Guide des UE - Spiral - Université Claude Bernard Lyon 1

Guide des UE
M1
Recherche
Biomédicale
ème
3 édition - 2015
Edito
Sommaire
Le système des masters pour
les étudiants en santé peut
paraître assez obscur. Son
fonctionnement général est
méconnu et surtout, nous
devons bien souvent choisir
dans quelle UE s’inscrire en
ayant pour seule information
sur son contenu, son intitulé.
C’est pourquoi nous avons
jugé
plus
qu’opportun
d’ajouter un nouveau guide à
la collection des publications
annuelles de l’ACLE.
Mention Biochimie
UE RB3 Biochimie et biologie moléculaire des
mécanismes physiopathologiques...............................5
UE RB5 Biologie et pathologie moléculaires..................6
UE RB6 Biologie moléculaire de la cellule.....................7
UE RB9 Conception et structure des molécules
d’intérêt thérapeutique................................................8
UE RB12 Génétique humaine et comparée...................9
UE RB13 Immunologie et mécanismes
immunopathologiques...............................................10
UE RB15 Embryologie, cellules souches et thérapie
cellulaire.....................................................................11
UE RB18 Méthodologie de la recherche clinique et
épidémiologique.........................................................12
UE RB19 Vie et mort de la cellule cancéreuse.......................13
UE RB20 Pharmacologie générale, clinique et toxicologie...14
UE RB27 Vie et mort de la cellule cancéreuse................15
UE RB31 Psychopharmacologie..............................................16
UE RB32 Pharmacologie cardiovasculaire..............................17
Toutes
les
descriptions
d’UE sont écrites par des
étudiants les ayant suivies.
Nous nous sommes efforcés
de rester le plus objectif
possible mais tout le monde
ne se fait pas la même
opinion des enseignements,
l’appréciation des UE peut
donc varier d’un étudiant à
l’autre. Ce guide aspire à être
mis à jour annuellement.
Si vous estimez que la
description d’une UE que
vous avez prise peut être
améliorée, merci de contacter :
[email protected]
Martin Lannelongue
Responsable des
publications de l’ACLE
Mention Ingénerie pour la santé et le médicament
UE RB1 Anatomie, imagerie et morphogénèse....................18
UE RB4 Biologie et médecine de la reproduction...........19
UE RB7 Biostatistique et modélisation........................20
UE RB8 Biotechnologies et ingénierie biomédicale......21
UE RB10 Environnement et santé.................................22
UE RB11 Ethique, déontologie et responsabilités
médicales....................................................................23
UE RB14 Informatique médicale et techniques de
communication...........................................................24
UE RB16 Méthodes d’études en cytopathologie et
histopathologie...........................................................25
UE RB21 Physiologie et biologie des systèmes intégrés....26
UE RB22 Physiopathologie des maladies transmissibles....27
UE RB23 Psychobiologie des comportements..............28
UE RB24 Traceurs, explorations fonctionnelles et
métaboliques..............................................................29
UE RB28 Science sociale et santé................................30
UE RB29 Epistémologie, éthique et philosophie du
corps et de l’activité médicale.....................................31
Mention Santé publique
UE RB17 Méthodologie d’évaluation médico
économique dans les systèmes de santé....................32
2 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Le système des Masters
Comment s’organise le M1 ? Procédure générale
Le M1 de Recherche Biomédicale (RB) d’inscription
proposé par le département de biologie
humaine de l’université Lyon 1 s’obtient
en validant deux UE théoriques,
accompagnées chacune d’un stage
d’initiation à la recherche et/ou d’un
mémoire, que vous pouvez suivre en
même temps que vos études de santé.
Notez qu’en médecine, de la 2e à la 6e
année, il est obligatoire de valider au moins
un certificat optionnel ou UE de M1 par
an. Les 60 ECTS nécessaires à l’obtention
d’un M1 de Recherche Biomédicale sont
apportés par :
- Les deux UE théoriques : 2 x 9 ECTS
- Les stages et mémoires : 2 x 6 ECTS
- Le cycle de master (ou équivalent) du
tronc commun : 30 ECTS
Il est recommandé d’effectuer un stage
d’initiation à la recherche (UE RB25) et un
mémoire bibliographique (UE RB26) mais
il est tout de même possible de valider
deux stages ou deux mémoires pour
obtenir le M1.
Le M1 de Recherche Biomédicale ne peut
être obtenu avant la validation de la 4e
année de tronc commun, même si les UE
de M1 sont validées en 2e ou 3e année.
Qui peut faire un M1 ?
Les UE de M1 de Recherche Biomédicale
sont accessibles à tous les étudiants (sauf
PACES) et diplômés en santé comprenant
un cycle de master (ou équivalent) dans
leurs études : médecine, pharmacie,
maïeutique, odontologie et médecine
vétérinaire. Les étudiants et diplômés de
kinésithérapie et ergothérapie n’ont pas
accès à ces UE. Les étudiants en science
peuvent aussi s’inscrire mais sont avant
tout visées les filières de santé.
Les modalités d’inscription diffèrent
légèrement d’une UE à l’autre (abordées
ensuite) mais la procédure générale est
toujours la même. Il s’agit d’obtenir la
signature du responsable de l’UE sur le
formulaire d’inscription à télécharger sur
le site de la biologie humaine. Cela passe
généralement par la préparation d’un CV
et une lettre de motivation suivis ou non
d’un entretien avec le responsable de l’UE.
Ces étapes ne sont pas à négliger mais
gardez à l’esprit que l’ordre de réception
des demandes est très souvent un critère
majeur de sélection. Pour maximiser vos
chances d’être accepté dans l’UE qui vous
intéresse, prenez-vous y tôt !
Frais d’inscription
Les droits d’inscription sont revotés chaque
année. En 2014-2015 ils étaient de :
- Déjà inscrit à Lyon 1 jusqu’à la 3e année
incluse : 60 €
- Déjà inscrit à Lyon 1 à partir de la 4e
année : 150 €
- Hors Lyon 1 jusqu’à la 3e année incluse :
90,50 €
- Hors Lyon 1 à partir de la 4e année :
125 €
S’inscrire à deux UE la même année
n’augmente pas les frais d’inscription.
Mention de master
Les UE de M1 sont réparties entre trois
mentions de master : « Biochimie »,
« Ingénierie pour la santé et le médicament »
et « Santé Publique ». Cela correspond à
trois M2 avec lesquels le département de
Biologie Humaine a des partenariats. Il est
recommandé de suivre deux UE de même
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 3
mention pour maximiser ses chances
d’acceptation dans le M2 correspondant,
mais ce n’est pas obligatoire. Dans tous
les cas, le M1 délivré au final est un M1 de
Recherche Biomédicale.
Pourquoi faire un M1 ?
A quelques exceptions près, les UE de M1
demandent de fournir un travail nettement
plus important que les certificats
optionnels, mais ce n’est pas pour rien. Le
master (M1 + M2) est la première étape
du cursus de recherche qui ouvre plusieurs
portes :
- La réorientation professionnelle vers,
par exemple, une carrière d’ingénieur de
recherche.
- Sans être une condition sine qua non,
posséder un master est un énorme plus
pour postuler aux fonctions de Chef de
Clinique Assistant (CCA). Effectuer au moins
deux ans de « clinicat » est un passage
obligatoire pour poursuivre une carrière
hospitalière ou hospitalo-universitaire et
pour s’installer en secteur II.
- Pour les plus ambitieux, le cursus de
recherche peut se poursuivre lors d’un
cycle doctoral par une thèse de recherche,
réputée bien plus exigeante que la thèse
de médecine, afin d’acquérir l’habilitation
à diriger les recherches (HDR). L’HDR
est un titre indispensable pour postuler
aux fonctions de directeur de recherche,
professeur des universités, PU-PH et chef
de service.
L’année de recherche
par centre hospitalier régional. Le rang de
classement de l’interne est pris en compte
ainsi que son projet de recherche. Dans le
cas d’une année recherche, l’interne perçoit
une rémunération égale à la moyenne des
émoluments d’un interne de 2e et 3e année,
c’est-à-dire 23 847,37 € par an.
Cursus spéciaux
L’INSERM et l’ENS proposent chacune
un cursus de recherche spécial pour les
étudiants en médecine et pharmacie. Il faut
postuler en début de deuxième année et il
s’agit dans les deux cas d’une procédure
nationale en plusieurs étapes très
sélective. En plus d’apporter une formation
supplémentaire en recherche, ces écoles
permettent aux étudiants de mettre en
pause leurs études de santé après la 3e
année pour entamer un M2 Recherche,
voire même poursuivre directement
après le M2 un doctorat de sciences,
tout en touchant une bourse. Pour plus
d’informations :
www.inserm.fr/etudiants/l-ecole-de-linserm-liliane-bettencourt
www.ens.fr/spip.php?article1628
Le département de Biologie
Humaine
Le département BH est une composante
de l’université Claude Bernard Lyon 1. Ses
locaux se situent sur le site Rockefeller,
8 avenue Rockefeller, Lyon 8e, hall du
bâtiment principal, 1er étage.
Site internet (sur lequel vous trouverez
entre autres la fameuse fiche d’inscription) :
L’interne en médecine peut bénéficier
biologie-humaine.univ-lyon1.fr
d’une année recherche, qui est souvent
l’occasion de préparer un Master 2 de
recherche. Un arrêté ministériel fixe les Contacts :
conditions de déroulement de l’année 04.78.77.70.38
recherche, en particulier le nombre [email protected]
d’étudiants susceptibles d’en avoir une [email protected]
4 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Mention Biochimie
UE RB3 : Biochimie et biologie moléculaire des mécanismes
physiopathologiques
Responsable : Docteur Virginie VLAEMINCK – [email protected]
Enseignements: 4h de cours hebdomadaire
Validation: Partiels semestrialisés en décembre et mai.
Rédaction d’un mémoire
Description : Le thème fédérateur de l’enseignement est la compréhension des bases
biochimiques et moléculaires de mécanismes physiopathologiques. La description des
grandes voies métaboliques et de signalisation est mise en lien avec la pathologie, en
particulier endocrinienne et métabolique.
L’enseignement inclut : Les méthodes d’exploration des molécules porteuses de
l’information génétique : analyse de l’expression du génome et des protéines;
régulation de l’expression des gènes et chromatines; régulation de la fonction des
protéines : modifications post-traductionnelles, protéolyse, pathologie du repliement;
biologie des systèmes: notion de réseaux; les bases moléculaires des grandes voies
de signalisation et pathologies associées : récepteurs nucléaires et membranaires; les
lipides et leurs fonctionnalités : physiologie de l’adipocyte, cholestérol et stéroïdes,
éicosanoïdes et lipoprotéines; stress oxydant : peroxydation des lipides, rôle dans la
physiopathologie de l’insulinorésistance, signalisation et vieillissement, rôle du stress
oxydant; signalisation par les exosomes et implications dans le diabète; la régulation
endocrinienne des glucides et ses anomalies dans le diabète; interrelation du vivant
et de l’environnement : perturbateurs endocriniens, nutrigénomique, génomique des
interactions hôte/bactéries.
Modalités d’inscription : Accessible à tous niveaux avec CV et lettre de motivation.
Formation très solide en
biochimie et biomoléculaire.
La diversité du programme ainsi que
la difficulté inhérente à la matière
nécessite un travail personnel suivi
pour bien assimiler les notions et
en tirer le meilleur profit.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 5
Mention Biochimie
UE RB5 : Biologie et Pathologie Moléculaire
Responsable : Pr. Yves Morel – [email protected]
Enseignements: 60H de cours, d’octobre à fin mars, samedi matin à Rockfeller sous
forme de créneaux de 2, 3 ou 4 heures.
Validation: Stage dans un laboratoire de biologie moléculaire ou mémoire avec
soutenance orale.
Partiels semestrialisés, en janvier et mai, sous forme de QROC et étude d’une séquence
ADN.
Description : Le programme est divisé en deux parties.
Le semestre 1 est consacré aux méthodes de biologie moléculaire et aux bases
théoriques (structure du gène, empreinte parentale, génome viral et bactérien,
chromatine, régulation des gènes). Il peut s’inscrire dans un prolongement de la
biomoléculaire de PACES et est donc assez accessible pour un étudiant en FGSM2.
Le semestre 2 est consacré à l’étude de pathologies génétiques dans lesquelles la
biomoléculaire joue un rôle clef en matière de prise en charge (exemple: cancers,
maladies à triplets, hémophilie, etc). Ce semestre pourra paraître moins accessible à
un étudiant de premier cycle, mais restera néanmoins passionnant.
Les cours sont dispensés par des spécialistes de la matière, cliniciens ou chercheurs,
sous forme de conférence.
Les intervenants sont spécialisés
du sujet mais restent abordables
et didactiques. La formation est
intéressante tant sur l’aspect
recherche fondamentale que sur
l’aspect clinique.
6 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Les cours sont assez indépendants
les uns des autres, les notions
autonomes ce qui nécessite un
réel travail personnel.
Mention Biochimie
UE RB6 : Biologie Moléculaire de la Cellule
Responsable : Pr. Serge Lebecque – [email protected] – 04.69.16.66.26
Enseignements : 4h hebdomadaires jeudi de 14h à 18h, lieu très changeant.
Validation : Examen final écrit fin avril sous forme d’analyse d’articles scientifiques en anglais
(réponse de type QROC). Articles fournis plusieurs semaines avant l’examen.
Attention : Il faut être classé dans les 18 premiers à l’examen pour avoir accès au stage
d’initiation à la recherche réalisé au début de l’été, en binome, et trouvé par le Pr. LEBECQUE.
Si ce n’est pas votre cas, il vous faudra valider un stage ou un mémoire sans l’aide du Professeur.
L’obtention du stage s’accompagne également de la rédaction d’un mémoire ainsi que d’une
présentation orale.
Pour ceux qui n’obtiendraient pas le stage : au dessus de la moyenne, l’UE est validée mais
pas la partie master (puis qu’aucun stage n’aura été mené). En dessous de la moyenne, une
session de rattrapage existe pour permettre de valider l’UE.
Description : Cette formation aborde plusieurs grands aspects de la biologie cellulaire :
méthodes d’étude de la cellule, devenirs de la cellule, polarisation et différenciation cellulaire,
différenciation des muscles, biologie de la cellule dendritique, réponses de la cellule au stress
et biologie de l’inflammation.
Tous les intervenants sont des chercheurs de haut niveau et présentent une thématique en
rapport avec leur sujet de recherche, ainsi qu’avec leurs résultats.
Le but de cette UE estl’initiation aux méthodes de biologie cellulaire, à l’analyse, la mise en
perspective, la critique des résultats expérimentaux et la compréhension des grands concepts
de bio cell.
Il s’agit d’une UE de réflexion
et de découverte du monde
de la recherche. Elle est
particulièrement adaptée aux
candidats à l’Ecole de l’INSERM.
La non obtention du stage peut
s’avérer frustrant, il faut donc
rester bien assidu et motivé
pour arriver dans les premiers à
l’examen final.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 7
Mention Biochimie
UE RB9 : Conception et Structure des Molécules d’Intérêt
Thérapeutique
Responsable : Pr. Roland Barret – [email protected]
Enseignements: Cours le jeudi de 14H à 18H, de début novembre à fin mars sur le site
Rockfeller.
Validation: Exposé à présenter sur une publication écrite en anglais (compte pour ½ de la
note finale).
Examen écrit en QROC sur des textes en anglais (possibilité d’utiliser un dictionnaire, compte
pour ½ de la note finale).
Mémoire
Description : La démarche de ce Master est d’intégrer tous les éléments nécessaires
pour concevoir une molécule optimale sur le plan thérapeutique et industriel. A ce
titre, il s’adresse naturellement aux étudiants en pharmacie mais est également source
d’intérêt pour les étudiants des autres filières.
Le programme repose sur certaines notions de PACES notamment le «docking»,
les «molécules leads», mais également l’étude de la liaison ligand-récepteur, le
fonctionnement d’un récepteur, ou encore les études in vivo, ce qui le rend accessible
dès la FGSM2.
Le professeur BARRET est une
enseignant attentif et soucieux
de la qualité de la transmission
des connaissances. La place de
l’anglais présente un intérêt en
vue de la Lecture Critique d’Article à l’ECN.
Les cours, bien que n’étant pas
obligatoires, nécessitent une
présence diligente pour en retirer
le maximum. Il faut garder en tête
que la formation est davantage
axée sur le monde de la pharmacie que sur
celui de la clinique.
8 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Mention Biochimie
UE RB12 : Génétique Humaine et Comparée
Responsable : Pr. Alain Calender – [email protected]
Enseignements: 100h de cours environ, réparties d’octobre à mai, le jeudi de 14h à 18h
à Grange-Blanche et Laennec(localisation variable suivant l’année).
Cours en ligne sur un site dédié (adresse et mot de passe fourni en début d’enseignement).
Validation:Partiel en janvier sous forme de QCM en 3h.
Examen terminal en mai sur l’ensemble du programme (un exercice, des QROC, et
l’analyse d’un article de recherche inconnu en anglais). Documents autorisés pour
l’examen de mai.
- Validation de l’enseignement théorique uniquement (9 ECTS)
En optionnel :
- Validation d’un mémoire d’initiation à la recherche (étude théorique sur articles) (6
ECTS) : mémoire écrit et soutenance en septembre – octobre.
- Validation d’un stage d’un mois temps plein dans un laboratoire et/ou une structure
de génétique (nombre de places limitées < 5) (6 ECTS) : le rapport de stage fait office
de mémoire de recherche.
Description : Cette UE aborde dans un premier temps, les bases fondamentales de la
génomique, les techniques d’analyse du génome, les mécanismes physiopathogéniques
des maladies humaines, avec une forte base théorique en génétique des populations
et les outils mathématiques et statistiques utiles pour la compréhension des maladies
multifactorielles.
Le second semestre est davantage consacré aux maladies génétiques et aux processus
pathologiques (maladies liées au vieillissement, maladies musculaires, mucoviscidose,
maladies liées à l’hemostase, etc) en établissant un lien entre génétique, biologie
fondamentale, biochimie, physiologie et clinique.
Modalités d’inscription : Lettre de motivation à adresser directement au professeur
Calender.
Thématiques
intéressantes.
Beaucoup d’étudiants, une
ronéisation est facile à mettre en
place.
L’assiduité est de rigueur pour ce
master assez prenant et dense,
s’étalant sur l’ensemble de l’année
scolaire.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 9
Mention Biochimie
UE RB13 : Immunologie et Mécanismes
Immunopathologiques
Responsable : Pr. Fréderic Bérard – [email protected] – 04.78.86.15.16
Enseignements : Cours le jeudi (14H-18H) entre fin septembre et avril sous forme de
conférences (entre 2 et 3 par session), à Lyon Sud.
Validation : Mémoire bibliographique d’une vingtaine de pages par groupe de trois
étudiants à rédiger lors du second semestre : sujets donnés fin janvier, rendu mi mars,
soutenance fin avril devant un jury de 3 enseignants au minimum (40% de la note
finale);
Partiels semestrialisés (30% de la note finale chacun).
Description : Lors du premier semestre, les notions théoriques d’immunologie sont
abordées notamment les différents effecteurs, leurs mécanismes d’action et les
différents types d’immunités (innée et acquise).
Le second semestre est consacré à la clinique, c’est-à-dire les maladies inflammatoires
chroniques, les maladies auto-immunes (Lupus,…), les allergies mais aussi l’immunité
contre les virus, le cancer, etc.
Les intervenants ont une grosse plus-value en ce qu’ils n’hésitent pas à parler de leurs
travaux ou à enrichir leurs cours de leurs expériences personnelles.
Modalités d’inscription : Cv et lettre de motivation à envoyer à frederic.berard@
chu-lyon.fr. Entretien téléphonique au maximum 15 jours après réception du mail.
Ne sont acceptés que les étudiants qui choisissent en 1er choix (>150 demandes par
an, 48 places maximum et minimum – 16 groupes de 3 étudiants pour le mémoire).
L’engagement moral des étudiants sélectionnés à ne pas renoncer à s’inscrire est donc
fondamental pour l’organisation du travail de toutes la promotion.
L’enseignement est transversal
et recoupe de nombreuses
spécialités (médecin interne,
dermatologie,
rhumatologie,
infectiologie,
parasitologie,
allergologie, cancérologie) en lien tant avec la
recherche que la clinique. Les enseignements
sont d’une réelle qualité et les enseignants
très pédagogues. On retrouve aussi bien des
cliniciens que des chercheurs ce qui permet
d’avoir une approche complète d’une même
thématique.
10 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
C’est à Lyon Sud.
Mention Biochimie
UE RB15 : Embryologie, Cellules Souches
et Thérapie Cellulaire
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Pr. Jacqueline Trouillas – [email protected] –
04.78.77.86.54
Enseignements : Environ 60h de cours d’octobre à mai, par tranche de 3h le jeudi
après-midi à Laennec.
Ronéo disponible, validée par l’enseignant.
Validation : Examen annualisé fin avril, d’une durée de 2H, comportant 3 questions
rédactionnelles assez larges portant sur des sujets abordés dans l’année (ex : décrire
l’embryogenèse des gonades chez l’homme).
Possibilité de faire stage et /ou mémoire, les deux étant proposés par le professeur
Trouillas (vous n’avez donc pas à choisir de stage vous même, mais il y a un nombre de
place limité pour le stage).
Validation selon le responsable de stage (modalités à définir au cas par cas).
Mémoire par groupe et soutenance devant la classe.
Description : L’année est divisée en deux grandes parties : embryologie d’une part, cellules
souches et thérapie cellulaire d’une autre part.
Dans un premier temps seront donc étudiés les mécanismes de l’embryologie normale de
nombreux organes (pancréas, coeur, système nerveux, gonades..), ce qui permet d’approfondir
les connaissances d’embryologie de PACES tout en étudiant des exemples d’embryologie
anormale ou foetopathologie. Cette partie constitue la majeure partie du programme.
Egalement au programme : des cours théoriques sur les cellules souches, le cancer et autres
mécanismes importants pour comprendre la thérapie cellulaire, au coeur de la dernière partie
du master (greffes de peau, pancréas,etc).
Modalités d’inscription : A partir de la FGSM2 (correspond bien aux enseignements de
FGSM2). Lettre de motivation.
La bonne complémentarité des
enseignements avec la formation
de FGSM3 et la diversité des
thématiques.
Attention il y a un nombre de
place limité pour le stage, ce qui
doit pousser à l’assiduité.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 11
Mentions Biochimie, Santé publique
& Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB18 : Méthodologie de la Recherche Clinique et
Epidémiologique
Accessible à partir de la 3e année.
Responsables : Pr. Yves Matillion et Pr. François Chapuis - [email protected]
[email protected]
Secrétariat : 04.72.11.51.68 – [email protected]
Enseignements : Jeudi (14H-17H) d’octobre à fin mars.
Evaluations : Mémoire à rédiger avec ou sans soutenance.
Stage à trouver soi-même : le cadre du stage est très variable, tant par sa durée (de
deux semaines à deux mois) que par ses objectifs (rédaction d’un protocole d’essai
clinique pour une unité de recherche, suivie d’une étude dans un service, etc).
Partiels semestrialisés en janvier et avril avec open-data.
Description : Le programme aborde notamment la rédaction des protocoles, les
différents types d’études cliniques et épidémiologiques, l’organisation d’une étude en
pratique, la sélection des patients, l’analyse des données, etc.
Le format des cours est assez varié avec des mises en situation, des lectures critiques
d’articles, des études et des cours plus magistraux. L’objectif essentiel de cette
formation est d’acquérir les bons reflexes en matière de recherche et d’avoir une bonne
compréhension méthodologique. De petits travaux peuvent être demandés d’une
séance sur l’autre dans le but de préparer la séance.
Le stage et le mémoire valident à eux deux seulement l’UE RB25. Examens écrits en
janvier et en avril (documents de cours autorisés). Quelques petits travaux peuvent
être à rendre en cours d’année (très rapides).
Modalités d’inscription : Envoyez par courrier votre fiche d’inscription, lettre de
motivation et CV au secrétariat du Pr. Chapuis. A partir de la FGSM3.
La formation est une bonne
introduction à la Lecture Critique
d’Article et constitue une base
méthodologique solide pour la
recherche.
12 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Le stage et le mémoire valident
uniquement l’UE RB25. Certains
stages peuvent être difficiles à
trouver.
Mention Biochimie
UE RB19 : Vie et mort de la cellule cancéreuse
Responsables : Semestre 1 : Professeur DUMONTET ([email protected])
pour les inscriptions notamment et Professeur JORDHEIM ([email protected]) pour tout autre renseignement
Semestre 2 : Professeur FERVERS ([email protected])
Enseignements : Jeudi (14h-18h) de fin septembre à mi-décembre, site Rockfeller.
Jeudi (14h-18h) de mi février à mi avril, au centre Léon Bérard.
Validation:
Au choix : Mémoire, thèmes proposés par l’enseignant, à rendre en décembre; Stage
d’initiation à la recherche de 15 jours, rapport de stage de 10 pages à rendre avant septembre.
Pas de soutenance.
Examens écrits semestrialisés en janvier (2 sujets à choisir parmi 3) et en avril (4 QROC).
Description : L’organisation de l’UE suit une organisation semestrielle.
Premier semestre : Bases thérapeutiques du cancer. Les cours sont très axés sur la
pathologie. Ce sont pour la plupart des médecins-chercheurs qui viennent parler d’un
type de traitement, d’un type de chirurgie, etc. Il y a souvent plusieurs intervenants
dans l’après-midi.
Deuxième semestre: Facteurs environnementaux et cancérogenèse. Certains cours sont
très généraux, d’autres plus spécifiques à un facteur environnemental en particulier.
Modalités d’inscription : Envoyez par courrier votre fiche d’inscription, lettre de
motivation et CV au secrétariat du Pr. Chapuis. A partir de la FGSM3.
Donne un très bon aperçu des
progrès et des innovations anticancer.
Ronéisation possible.
Requiert une certaine flexibilité
d’esprit. Savoir se tenir informé
des changements de planning et
de salles.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 13
Mentions Biochime & Santé publique
UE RB20 : Pharmacologie Générale, Clinique et
Toxicologique
Responsable : Dr. Quadiri Timour-Chah – [email protected] –
04.78.77.71.88
Enseignements : Jeudi (14H-18H), d’octobre à mars, site Rockfeller.
Validation : Choix entre :
- un mémoire d’une dizaine de page avec soutenance,
- stage appuyé d’un rapport d’une dizaine de pages à rédiger pour le mois de mars.
Partiels annualisés (60% QCM, 20% QROC, 20% stage ou mémoire) en avril (deuxième
session en mai sous forme de QROC).
Description : Le programme de l’UE est divisé en quatre parties :
- pharmacologie générale et bases du fonctionnement des médicaments (physiologie,
pharmacocinétique, récepteurs, métabolisme, addiction;)
- pharmacologie clinique (développement et évaluation de l’efficacité);
- pharmacologie toxicologique (bases de la toxicologie et prise en charge des
intoxications);
- pharmacologie cardio-vasculaire (applications en cardiologie).
Les enseignements vous permettront de mieux comprendre les mécanismes de la
pharmacologie à travers une approche pratique de la matière comme le montre
d’ailleurs l’examen final pour lequel le docteur Timour n’hésitera pas à vous interroger
sur des cas cliniques. Les cours sont dispensés à la fois par les enseignants de la faculté
et par des intervenants extérieurs.
La présence est vérifiée par la liste d’émargement. Cours tous les jeudis de 14h à 18h,
d’octobre à mars, sur le domaine de Rockefeller. Choix entre un mémoire d’une dizaine
de pages avec soutenance orale, ou un stage et un rapport d’une dizaine de pages, à
rédiger pour le mois de mars. La première session a lieu en avril (60% QCM, 20% QROC,
20% stage ou mémoire), la deuxième session a lieu en mai (QROC uniquement).
Modalités d’inscription : CV, lettre de motivation, toutes filières à partir de la FGSM2.
Les
interactions
médicamenteuses n’auront plus
de secret pour vous ! Par ailleurs
cette formation prépare à la
Lecture Critique d’Article.
Un abord général de la
pharmacologie nécessite de
la rigueur et de l’assiduité (la
présence est obligatoire) mais le
jeu en vaut la chandelle car une
bonne connaissance de la thérapeutique est
un réel atout pour le praticien.
14 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Mention Biochimie
UE RB27 : Bases Thérapeutiques du Cancer
Attention, cet enseignement est en cours de réorganisation. La description suivante
se base sur l’UE telle qu’elle était jusqu’en 2012-2013. Le Pr. Dumontet vous invite à le
contacter directement pour plus d’informations.
Responsables : Pr. Jordheim – [email protected] - 04 78 77 71 28
Enseignements : Jeudi (14h-18h, parfois à partir de 13 h) de septembre à mi-décembre, site
Rockefeller ou Laennec.
Validation : Examen écrits en janvier ou février comptant pour 3 ECTS
Au choix pour compléter avec 6 ECTS :
- Mémoire, thèmes proposés par l’enseignant, à rendre en janvier;
- Stage d’initiation à la recherche de 40 heures, rapport de stage de 10 pages à rendre avant
septembre.
Description : L’UE se déroule uniquement sur le premier semestre.
Les cours sont très axés sur la pathologie. Ce sont pour la plupart des médecins-chercheurs
qui viennent parler d’un type de traitement, d’un type de chirurgie, etc. Il y a souvent plusieurs
intervenants dans l’après-midi et un total d’environ 25 intervenants au total.
Modalités d’inscription : Ouvert aux étudiants de pharmacie, médecine, odonto et
véto à partir de la 3ème année. Inscription via la BH avec CV. Max 25 étudiants.
Donne un très bon aperçu des
progrès et des innovations anticancer.
Ronéisation possible.
Requiert une certaine flexibilité
d’esprit. Savoir se tenir informé
des changements de planning et
de salles.
Les informations sont données via
SPIRAL et les mails étudiants de l’université.
Il faut absolument vérifier les adresses etu.
univ-lyon1.fr
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 15
Mention Biochimie
UE RB31 : Psychopharmacologie
Responsable : Dr. Quadiri Timour-Chah – [email protected] –
04.78.77.71.88
Enseignements : Jeudi (4H) de septembre à fin janvier, site Rockfeller.
Validation : Partiel annualisé fin janvier;
Mémoire à rendre, seul ou à deux.
Notation prenant en compte la présence en cours.
Description : La formation est très axée clinique, à travers l’évocation des différentes maladies
psychiatriques et leur traitement pharmacologique. Par conséquent cette UE présente un réel
intérêt pour l’ECN. Au delà du traitement, il permet d’évoquer les problématiques de gestion
du médicament dans le cadre psychiatrique, en institut et en cabinet.
Certains cours sont ronéisés et recoupent le programme de certaines années de premier cycle
en offrant un abord différent à la matière ce qui est assez éclairant.
Modalités d’inscription : Sur lettre de motivation. Toutes filères à partir de la deuxième
année.
La formation prépare à l’ECN en
ce qu’il déflore le programme
de
psychiatrie
et
qu’il
familiarise avec le traitement
pharmacologique. Intervenants
variés et très soucieux d’etre pédagogues
malgré des cours parfois très pointus qui
sauront, le cas échéant, être écartés du
programme des partiels par les directeurs.
16 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
aucun actuellement
Mention Biochimie
UE RB32 : Pharmacologie cardiovasculaire
Responsable : Dr. Quadiri Timour-Chah – [email protected] –
04.78.77.71.88
Enseignements : Jeudi (14h-18h), de janvier à mi avril, site Rockefeller. Cours magistraux
en grande majorité.
Validation : Au choix :
Stage
Mémoire
Soutenance obligatoire pour les mémoires. Possibilité de cumuler stage ET mémoire.
Attention toutefois, cette UE ne permet que de valider STAGE OU MEMOIRE
Description : Cardiologie
Pharmacie
Exemple: substratum de la mort anatomique, pharmaco cardio en pédiatrie, la sémiologie
cardiaque
Modalités d’inscription : Accessible à tous. Regroupe des étudiants de Lyon Est et Lyon Sud,
pharmacie, médecine et dentaire.
Lettre de motivation, CV, classement.
Assurer un bon diagnostic et
maîtriser la pharmacologie
cardiovasculaire pour limiter les
effets indésirables (nombreux en
cardio et souvent mortels).
Un approfondissement des connaissances en
cardiologie.
Une grande technicité des cours.
La possibilité d’effectuer un stage (13 places
ont été proposées par le pr Timour en
initiation a la recherche cardio dans le service
du Pr Chevalier).
La pharmacologie passe par
l’apprentissage
de
petits
catalogues de médicaments.
Avis aux motivés : ronéiser ce
master est une idée pertinente
étant donné que les cours ne sont pas
toujours mis en temps et en heure sur spiral.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 17
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB1 : Anatomie, Imagerie et Morphogénèse
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Pr. François Cotton – franç[email protected]
Secrétariat : Patricia El Abba – patricia.el-abba @univ-lyon1.fr – 04.78.77.71.43
Enseignements : 46h d’enseignement d’octobre à avril. Cours le mardi soir de 18h à 20h sur
le site Rockefeller. Majorité des supports de cours à disposition des étudiants sur spiral.
Validation : Rédaction d’un article scientifique, en anglais de préférence, sous la direction
d’un maître de mémoire. Présentation orale du mémoire de 10 minutes environ. Examen
écrit fin mai (3 questions rédactionnelles portant sur des thèmes abordés en cours).
Description : L’enseignement est axé sur la pratique clinique, l’interprétation des
examens d’imagerie et les techniques chirurgicales.
Le programme est centré sur l’anatomie appliquée, l’imagerie, la chirurgie, la biométrie
et la paléontologie. Il s’intéresse à l’implication de l’anatomie et de l’embryologie dans
divers domaines tels que la chirurgie ou la médecine légale.
Durant l’année chaque étudiant devra rédiger un article en choisissant un thème ainsi
qu’un maître de mémoire. C’est l’occasion de s’impliquer dans un projet de recherche
et de se familiariser avec la littérature scientifique. L’article doit porter sur un travail de
recherche en rapport avec l’anatomie, ou un rapport de cas.
Modalités d’inscription : Accessible à partir de la 3ème année, concerne principalement
les étudiants en médecine, dentaire et kiné (pas de pharmaciens, UE trop éloignée de
leur enseignement).
Sélection portée essentiellement sur l’analyse d’une lettre de motivation.
L’enseignement
aborde
non seulement des notions
théoriques, mais nous donne
aussi les clés pour la mise en
pratique.
L’accent est mis sur la réflexion et sur l’analyse
18 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Les intervenants considèrent
comme acquises les notions
d’anatomie et d’embryologie
enseignées en tronc commun.
L’assiduité est contrôlée.
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB4 : Biologie et Médecine de la Reproduction
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Pr. Jean-Francois Guerin – Laboratoire de biologie de la reproduction,
Domaine Rockefeller
[email protected] – 04.78.77.70.64
secretariat.laboratoire-biologie-de-la-reproduction@univ-lyon1.fr
Enseignements : 60h de cours les jeudis de 14h à 18h, de mi-octobre à mi-mars, sur le site
Rockfeller. Diaporamas accessibles sur Spiral après les cours.
Validation : Examen écrit en avril sous forme de trois questions rédactionnelles en 2h.
Mémoire bibliographique sur un sujet au choix dans domaine de la reproduction (possibilité
de se mettre par groupe de deux ou trois), soutenance en juin. Pas de stage possible.
Description : Les cours sont divisés en deux parties : une partie plus théorique sur
l’embryologie et la génétique et l’autre sur les aspects pratiques et techniques de la
Procréation Médicalement Assistée (PMA).
En parallèle de la dimension technique de la PMA, des enseignements relatifs à l’aspect
éthique et légal de cette discipline sont dispensés.
Modalités d’inscription : Envoyez votre fiche d’inscription, CV et lettre de motivation
au secrétariat du Pr GUERIN. Accessible à partir de la 3ème année. (Attention, master
très convoité donc s’y prendre tôt !)
L’accessibilité des enseignants et
leur soutien lors de l’écriture du
mémoire.
C’est un master passionnant mais
demandant du travail. Il y a deux
gros cours par après midi, très
denses mais très intéressants
et nécessitant une bonne
concentration.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 19
Mention Ingénierie
Mentions
Santé publique
pour la&santé
Ingénierie
et le médicament
pour la santé et le médicament
UE RB7 : Biostatistique et Modélisation
Responsable : Dr. Maucort-Boulch – Service de Biostatistique, 162 avenue Lacassagne
69424 Lyon Cedex 03 – [email protected]
Secrétariat : [email protected]
Enseignements : Cours jeudi après midi (14H-18H) de janvier à fin mai sur le site Rockfeller.
Validation : Master annualisé : examen en juin et session de rattrapage en juin;
Mémoire à rédiger seul ou en groupe, à rendre en juin sans soutenance. Thème du mémoire
soumis à l’approbation du responsable de l’enseignement.
Description : Le programme se veut le prolongement des notions de biostatistiques de
bases abordées en PACES (statistiques descriptives, évalutation d’un test diagnostic, tests
d’hypothèse, comparaison de moyennes, corrélation et régression linéaire, analyse de la
survie, etc). Le rythme de la formation permet un réel approfondissement des différentes
notions. Par ailleurs, le Master aborde des thèmes d’épidémiologie et de biomédecine
quantitative (lien avec la Lecture Critique d’Article). Il s’agit d’une formation variée aux thèmes
transversaux, couvrant le programme de plusieurs années et proposant une approche en lien
avec la pratique médicale, odontologique et pharmaceutique.
Tous les cours sont normalement mis en ligne sur Spiral chaque semaine. Il s’agit soit de cours
sonorisés soit de cours avec diaporama accompagnés de commentaires. Par ailleurs, les
annales des partiels sont disponibles en ligne.
De nombreux exercices sont également mis en ligne pour mettre en application les notions
du cours.
De plus, quatre séances de Travaux Pratiques en salle informatique par semestre viennent
ancrer les connaissances. Elles permettent d’apprendre à utiliser le logiciel «R» (logiciel
d’analyse de données statistiques).
Modalités d’inscription : Envoyez votre fiche d’inscription, CV et lettre de motivation
par mail à Madame Canova.
Les cours recoupent de manière
transversale des thèmes de
différentes années et permettent
de se mettre dans la dynamique
de la Lecture Critique d’Article.
20 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Peu de nouveautés par rapport
au programme de médecine.
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB8 : Biotechnologies et Ingénierie Biomédicale
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Pr. Daniel Hartmann – [email protected] – 04.78.78.56.73
Enseignements : Environ 70h de cours de fin octobre à fin avril, le jeudi de 14h à 18h à
Grange Blanche.
Validation : Un examen final écrit mi-mai sous forme de questions de compréhension sur
l’ensemble du programme.
Possibilité fin avril de réaliser un exposé d’environ 10 minutes sur le sujet de son choix en
rapport avec l’UE (considéré comme un controle continu afin de comptabiliser quelques
points en plus, utiles à la validation de l’UE) qui peut servir de base pour son mémoire.
Choix entre :
- un stage d’initiation à la recherche, qu’il faut trouver soi-même, d’environ 2-3 semaines;
- La période du stage est au choix : morcelée au cours de l’année à ou en fin d’année. Rapport
de stage.
- Un mémoire sur le sujet de son choix peut aussi être réalisé à la place du stage.
Description : Les cours portent sur des sujets variés tels que les techniques d’analyse
(protéines, cellules, ADN), les biomatériaux et les thérapies innovantes (cellules souches,
thérapie génique).
Chaque sujet est abordé de manière globale avec souvent une focalisation sur le domaine de
recherche de l’intervenant.
Au cours de l’année certains d’entre eux, dont le Pr Hartmann, proposent une visite de leurs
laboratoires respectifs suite à leur cours.
Modalités d’inscription : Envoyez votre fiche d’inscription, CV et lettre de motivation
au Pr Hartmann par mail. Il vous répondra à son tour par mail pour vous donner la date
de présentation du master durant laquelle il vous remettra votre fiche signée.
C’est un bon moyen pour se faire
une première idée sur le monde
de la recherche.
La recherche d’un stage peut
s’avérer difficile.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 21
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB10 : Environnement et Santé
Responsable : Dr. Jean-Claude Normand, Contacter sa secrétaire, Mme HERRSCHER
pour toute question : [email protected]
Enseignements : 65H de cours, jeudi après-midi (14h-18h) d’octobre à mars, Grange-Blanche.
Validation : Pas de stage, mais un mémoire bibliographique à faire en binome. Mémoire à
rendre début juin, soutenance mi-juin.
Examen terminal de deux heures fin avril portant sur deux sujets à traiter.
Description : L’idée de cette UE est d’étudier l’effet de notre environnement (au sens large)
sur notre santé.
Les cours traitent de thèmes variés : risques industriels, bactéries environnementales, gestion
des déchets, ondes électromagnétiques, cancers et environnement, etc. La diversité des
thèmes est l’un des points qui rend ce Master si attrayant.
Les cours sont dispensés par des intervenants de formation médicale, pharmaceutique,
biologique et vétérinaire. Il s’agit plutôt de cours magistraux, relativement peu interactifs
(même si les intervenants sont tout à fait prêts à répondre aux questions).
Certains cours font appel à des connaissances de FGSM3 mais sont suffisamment détaillés
pour permettre à un FGSM2 de comprendre.
Modalités d’inscription : Envoyez votre fiche d’inscription, CV et lettre de motivation
par mail à Mme Herrscher, qui les transmettra au Pr. Normand.
Il s’agit souvent de sujets peu
abordés dans les autres cours
ce qui confère une ouverture
d’esprit.
22 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Les cours, bien que n’étant pas
obligatoires, nécessitent une
présence diligente pour être bien
profitables.
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB11 : Ethique, Déontologie et Responsabilité Médicale
Responsable : Pr. Daniel Malicier – [email protected]
Enseignements : Cours le jeudi après-midi (14H-16H) de mi-octobre à mi-avril, site Rockfeller.
Validation : Mémoire au sujet libre et soutenance mi-mai.
Partiel annualisé mi-mai, composé de trois questions de cours (droit, droit médical, éthique).
Note finale correlée à la présence en cours.
Description : Le Master traite de thèmes variés qui constituent un complément très
intéressant pour des futurs médecins en leur offrant une vision de leur profession dans
la société civile : la justice ordinale (Ordre des médecins, atteinte à la déontologie),
la médecine assurance, la réparation des préjudices, la responsabilité pénale du
médecine.
Par ailleurs, cette formation est très enrichissante sur le plan de l’éthique médicale en
offrant une reflexion approfondie sur la relation médecin-malade, les soins palliatifs, le
secret médical, l’enfance en danger, les lois de bioéthique, etc.
Les interventions sont variées et animées par des professionels de différents milieux :
médecins, juristes, avocats, ce qui lui confère un caractère très interdisciplinaire.
Modalités d’inscription : Il faut simplement envoyer un mail à l’adresse du professeur
Malicier. Sa secrétaire vous mentionnera les éléments à fournir (CV, lettre de motivation
et fiche d’inscription). Les dossiers peuvent être déposés à l’institut médico-légal
jusqu’en septembre. Il est indiqué que l’enseignement n’est pas ouvert aux deuxièmes
années mais vous pouvez tout de même y accéder sans difficulté.
Les thèmes abordés sont variés
et très enrichissants en tant que
futur praticien mais également
en tant que citoyen puisqu’ils
permettent de mieux saisir
l’environnement juridique de la médecine et
ses enjeux.
Les cours sont destinés à des
médecins ce qui peut être moins
intéressant pour des étudiants
d’autres filières. Les termes
juridiques sont parfois pointus
mais cela ne constitue pas un frein sous
réserve d’un peu de curiosité.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 23
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB14 : Informatique Médicale et
Technologies de Communication
Responsable : Jocelyne Fayn – [email protected] – EA4171-MTIC, Bât 13,
Hôpital Cardiologique, 28 Avenue du Doyen Lépine 69500 Bron
Enseignements : 72H de cours réparties en 18 séances de 4h tous les jeudis après-midi de
mi-octobre à mi-mars, en salle Info, à Rockefeller.
Compter en plus la réalisation de 4 ED à rendre durant l’année, sous la forme de projet
informatique (base de données, site internet,etc.).
Validation: L’UE RB14 est validée par une note finale ≥ 10/20 qui se compose pour 60%
de la note d’examen écrit et pour 40% de la note de contrôle continu. L’examen écrit, avec
consultation autorisée des notes de cours sur papier uniquement, a lieu en mai et est d’une
durée de 3 H. La note de contrôle continu est la moyenne de 4 compte-rendus d’enseignements
dirigés sur ordinateur, à rendre 1 mois après la séance : (1) Conception et réalisation d’un
logiciel de gestion des dossiers médicaux sous MS-Access, (2) Conception et réalisation
d’un site web d’informations médicales sous Kompozer, (3) Conception de modèles UML de
systèmes d’information médicaux, (4) Mise en œuvre de méthodes de traitement d’images
sous MATLAB. Une 2ème session de rattrapage est organisée fin juin.
L’UE RB25 est validée par un article de 8 à 10 pages du type « revue bibliographique » et une
soutenance en juin.
Les étudiants inscrits en RB14 peuvent faire en plus un RB25 « stage d’initiation à la recherche
» en informatique médicale s’ils le souhaitent la même année ou une année ultérieure. Ce
stage consiste à faire une revue bibliographique d’environ 10 articles sur un sujet de leur choix
en informatique médicale. Ces articles sont fournis par leur maître de stage, qui est l’un des
intervenants de leur choix de l’UE RB14. Le stage est validé fin juin par la rédaction d’un article
de synthèse des articles étudiés et la présentation orale de 15 mn de cette synthèse devant
un jury composé de 3 personnes (Maître de stage, Intervenant de l’UE RB14, moi-même en
tant que responsable de l’UE).
Description : Chaque cours est indépendant, et plusieurs intervenants traiteront
de sujets divers comme les bases de données, les interfaces homme-machine, le
traitement des images, les langages informatiques (HTLM, Java, XML, etc.)
Modalités d’inscription : Accessible à tous les étudiants de toutes filières et ce dès la
deuxième année. CV et lettre de motivation suffisent.
La qualité des enseignements.
Peut rassembler des personnes
L’utilité de bien maîtriser
de niveaux très hétérogènes.
les outils informatique de
Peut ainsi nécessiter un travail
nos jours (notamment les
personnel plus important.
bases de la programmation),
personnellement
comme
professionnellement.
24 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB16 : Méthodes d’Étude en Cytopathologie et
Histopathologie
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Docteur Marie BREVET - [email protected]
Enseignements : Jeudi après-midi (de 2 à 4 heures selon les semaines), sur le site Rockfeller;
Validation : Possibilité de faire un stage court d’une semaine pendant les vacances d’été ou
durant l’année dans un laboratoire d’anapathologie.
Exposé à réaliser durant le second semestre, lequel sert de base au mémoire.
Partiels annualisés en mai, sous forme d’une lecture d’article à synthétiser, et de questions de
méthodes.
Description : Ce Master porte sur la réalisation de coupes analysables par les
anatomopathologistes, les méthodes de coloration, les produits de conservation
utilisés sur les pièces opératoires envoyées par les chirurgiens, etc. En clair, pas mal de
techniques de conservation tissulaire.
Les enseignements visent à fournir aux étudiants les connaissances théoriques
nécessaires à l’appréhension des coupes d’anapathologie, pour une mise en oeuvre
pratique, un stage est conseillé.
Modalités d’inscription : Pour ce master, il y a toujours peu d’inscrits (environ 15
étudiants par année) donc pas de sélection, les premiers inscrits sont les premiers
servis. Il faut juste envoyer la fiche d’inscription, une lettre de motivation et votre
CV à sa secrétaire Nadia Mecheri. Généralement il répond rapidement par mail et sa
secrétaire est assez facilement joignable.
Le thème est assez pratique
en lui-même et constitue un
bon complément aux cours
d’anapathologie de FGSM3.
Réaliser un stage dans un service
d’anapathologie est nécessaire
pour se confronter à la réalité
pratique des thèmes abordés.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 25
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB21 : Physiologie et Biologie des Systèmes Intégrés
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Pr. Michel Ovize – [email protected]
Secrétariat : E. LEPETIT – 04.78.77.72.79 – [email protected]
Enseignements: 63h de cours, jeudi de 14h30 à 17h30 d’octobre à avril, site Rockefeller et
faculté de médecine de Saint Etienne.
Validation : Partiel annualisé, de 3H, en avril : trois questions de cours (QROC) et une
épreuve de rédaction à partir d’un article scientifique en anglais (dictionnaire autorisé). Stage
accompagné d’un mémoire de stage (10 pages sous forme d’un article scientifique). Pas de
soutenance.
Validation du stage : 8 points pour l’avis du maître de stage et 12 points pour le mémoire écrit
de fin de stage (pas de présentation orale).
Description : Cette UE poursuit et approfondit des thématiques abordées en PACES
et en FGSM2 (neurophysiologie, appareil digestif, myologie, équilibre acido-basique,
etc...). Chaque cours est donné par un enseignant différent, selon son domaine
d’exercice et/ou de recherche.
Un cours « type » dure environ 3h, avec une partie de rappels (connaissances a priori
déjà acquises, ce qui peut paraître un peu fastidieux pour certains mais est toujours
bon à prendre), et ensuite une partie où le sujet est traité de manière approfondie, en
général en essayant d’aborder l’actualité de la recherche concernant ce thème.
Modalités d’inscription : Sur lettre de motivation et CV.
Les amoureux de la physiologie
se sentiront pousser des ailes.
Beaucoup
de
notions
permettent de comprendre
certains phénomène que l’on appliquera
surement sans comprendre plus tard dans
notre exercice médical.
De plus certains cours parlent de recherche
en cours qui vont aboutir à des publications
scientifiques, et ces recherches sont souvent
très prometteuses avec résultats assez
impensables.
Attention, les cours sont en
alternance avec la faculté de Saint
Etienne, effort d’organisation à
prevoir, à la charge de l’étudiant.
Prévenir le professeur en cas
d’absence fait partie des règles de bienséance.
26 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB22 : Physiopathologie des Maladies Transmissibles
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Pr. François Vandenesch – [email protected]
Secrétariat : [email protected]
Enseignements : Jeudi (14H30-17H30), d’octobre à avril, site Laennec.
Validation : Examen annualisé en mai, 2 parties : connaissances pures et critique d’un article
scientifique.
Stage, mémoire de stage à rédiger à la façon d’un article scientifique. Liste de tuteurs potentiels
fournie.
L’étudiant est aussi rapporteur du mémoire d’un autre étudiant, ce qui implique de lire le
mémoire et de préparer une critique de fond ainsi que quelques questions à poser. Ce travail
de rapporteur participe à l’évaluation.
Description : Le but de cette UE est d’initier les étudiants à la démarche expérimentale
en infectiologie. Le programme se compose donc de bactériologie, de virologie, de
parasitologie et permet également de comprendre les interactions entre infectiologie
et immunologie, santé publique, ou encore anthropologie.
Certains cours vont reprendre des principes de base, d’autres traiteront des évolutions
actuelles dans le domaine de l’infectiologie.
Plusieurs enseignants font travailler les étudiants en interactivité sur des articles.
Quelques cours sont d’ailleurs dédiés à la recherche et à la rédaction (apprendre à
rechercher sur PubMed, apprendre à rédiger et présenter oralement un travail
scientifique...). Le doyen de la faculté se propose même d’apprendre aux étudiants à
bien s’exprimer en présentant un travail scientifique.
Cet enseignement est franchement orienté vers la démarche expérimentale, ce qui
est très intéressant pour ceux que la recherche intéresse, en revanche, cela peut aussi
constituer un défaut potentiel pour d’autres.
Modalités d’inscription : A partir de FGSM3, médecine, Pharmacie, dentaire, ouvert
aussi aux vétérinaires et aux scientifiques. Sur lettre de motivation. Affectation
dépendant aussi de la BH concernant la procédure de soumission des candidatures.
Le nombre d’étudiants est réduit
(une quinzaine) ce qui permet
une bonne ambiance en cours et
une interactivité forte.
Cours toutes les semaines, y
compris pendant les révisions ou
les partiels.
Grosse charge de travail pour
préparer les présentations et
écrire le mémoire.
Difficulté pour trouver un tuteur pour son
mémoire.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 27
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB23 : Psychobiologie des Comportements
Responsable : Pr. Thierry d’Amato – CH le Vinatier – [email protected]
Secrétariat : [email protected]
Enseignements : Jeudi (14h-17H), de mi-septembre à début avril, au Vinatier
Validation: Partiels annualisés en mars, 2 questions rédactionnelles (à choisir parmi 3
questions proposées, tirées au sort parmi tous les cours de l’année), rattrapages en septembre.
Stage durant l’année appuyé d’un mémoire de stage avec soutenance (possibilité de
rattrapages)
Description : Cet enseignement aborde les bases neurologiques et cognitives du
comportement animal et humain, normal et pathologique. Les cours sont variés, et
abordent des thèmes comme la schizophrénie, le sommeil, la dépression, le langage et ses
troubles, le traitement de l’information sensori-motrice, les comportements animaux…
Cette formation permet de mieux comprendre les mécanismes qui conduisent à certaines
pathologies neurologiques et psychiatriques. Elle s’intéresse tout autant à la recherche
d’un point de vue pratique que théorique : utilisation de modèles animaux, questions
éthiques, etc
Les supports de cours sont déposés sur Spiral.
Le stage s’effectue dans un centre de recherche en neurosciences. Il représente une
occasion de s’impliquer dans un projet scientifique concret et de suivre son déroulement.
Le mémoire a pour objectif d’expliquer l’expérience à laquelle vous aurez participé et
d’en interpréter les résultats.
On retrouve des cours en commun avec le certificat optionnel «Psychologie et
neurobiologie» qui peut donc constituer une alternative intéressante pour ceux qui ne
voudraient pas avoir la contrainte du stage et du mémoire (ne concerne pas certains
cours très intéressants comme ceux de Bret et d’Amato néanmoins).
Modalités d’inscription : Accessible à tous. Pour être sélectionné, au dela de la lettre de
motivation et du CV, il est impératif d’avoir trouvé un stage dans un service en rapport
avec le thème de la formation. Il est donc nécessaire de prendre le temps, durant les
vacances d’été, de candidater auprès des maîtres de stages des labos lyonnais (près de
200 stages possibles).
Si les absences sont tolérées,
Les sujets sont passionnantes
la présence parait vraiment
et le stage est extrêmement
indispensable pour saisir les
enrichissant dans un domaine en
notion importantes détaillées
constante expansion. Idéal pour
en cours. Attention à anticiper
ceux intéressés par la psychiatrie les contraintes administratives en matière
et les neurosciences.
de convention de stage (se renseigner au
plus vite). Stage et mémoire ne permettent
de valider que l’UE RB26 car le stage est
considéré comme un cours.
28 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Mention Ingénierie pour la santé et le médicament
UE RB24 : Traceurs, Explorations Fonctionnelles et
Métaboliques
Accessible à partir de la 3e année.
Responsable : Pr. Luc Zimmer – [email protected]
Secrétariat : Mme Bardelli – [email protected]
Enseignements : Cours le jeudi (2 ou 3 heures) de début octobre à fin février.
Validation : Stage de deux semaines minimum appuyé d’un rapport de stage ou un mémoire
portant sur un sujet à choisir dans une liste en fin d’année. Mémoire de stage à rendre en
septembre.
Examen annualisé en mai sous forme de QROC portant sur des articles récents en anglais.
Description : Le programme est divisé en deux thématiques imbriquées :
Une partie décrivant des techniques d’imagerie associées aux traceurs (IRM,TEP..)
Une partie sur les applications des techniques en préclinique ou en clinique, chez l’animal
ou chez l’homme et selon les sytèmes et pathologies (système cardio-vasculaire, SNC,
oncologie...).
Les enseignants, pour la plupart associés à des équipes de recherche hospitalo-universitaire,
représentent les diverses disciplines de l’imagerie biomédicale : radiopharmaciens, médecins
nucléaires et radiologues, pharmacologues, chercheurs expérimentaux, chirurgiens-dentistes,
ingénieurs biomédicaux.
Modalités d’inscription : Apportez votre fiche d’inscription et un CV à Mme Christianne
Bardelli.
La diversité des enseignants,
professionnels, est un atout
car il permet d’allier une vision
théorique et pratique du thème.
Répétitions des notions entre les
cours. Cours parfois très ardus
même s’ils ne tombent pas à
l’examen
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 29
Mention Ingénierie
Santé publique
pour la santé et le médicament
UE RB28 : Sciences sociales et santé
Responsable : Evelyne LASSERRE – [email protected]
Enseignements : Jeudi 14h-17h de octobre à mi-avril, site Rockfeller.
Validation : 40% de participation orale et assiduité
60% examen écrit annualisé en mai.
Mémoire à rendre en juin (35 pages minimum), sur un thème libre. Pas de soutenance.
Description : Cette UE propose d’interroger la relation de soin au travers de la mise
en perspective proposée par les sciences humaines et sociales. Elle repose sur une
dynamique d’échanges et de rencontres nécessitant la présence et l’implication de
l’étudiant. Les séances permettront de mêler éléments et interrogations de la pratique
médicale et apports conceptuels.
L’UE vise à : Apporter des éléments de sciences humaines et sociales (anthropologie,
philosophie, éthique, epistémologie, histoire, médecine) permettant de contextualiser
la situation de soin interrogée. Transmettre les bases théoriques du raisonnement
critique en le mettant à l’épreuve de l’action médicale. Elaborer les outils nécessaires
à une meilleure compréhension des enjeux et difficultés rencontrées dans la pratique.
Favoriser l’acquisition d’une posture réflexive sur les pratiques de soin. Posture
qui sera enrichie par l’apport de différents intervenants de terrain (chercheurs
comme praticiens). Développer une méthode de recherche et d’argumentation par
l’apprentissage des méthodologies qualitatives (problématisation, recensement
bibliographique, observation et recueil des données, analyse des résultats) validée par
la rédaction d’un mémoire.
Modalités d’inscription : Toutes filières, toutes promos. Lettre de motivation importante
et détaillée.
Des cours très humains,
pas scolaires du tout avec
des discussions impliquant
l’expérience de chacun. La parole
est libre.
30 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Il existe une petite sélection
pour démarquer les étudiants
vraiment motivés, avec un projet
personnel adéquat.
Mentions Santé publique
UE RB29 : Epistémologie, éthique et philosophie du corps et
de l’activité médicale
Responsable : Olivier Perru – [email protected]
Enseignements : Jeudi après-midi (3H), site Rockfeller.
Validation : 30% d’assiduité et participation orale. 40% pour l’examen final, écrit de 3h, sous
forme de 2 questions donnant lieu à une synthèse sur un problème épistémologique ou
philosophique précis traité en cours, 70% de la note.
Mémoire d’environ quarante pages, sur un sujet philosophique, éthique et.ou scientifique.
Encadrement actif par l’un des trois enseignants disponibles.
nb :Il s’agit de l’UE associée RB 25 (il y a l’UE de cours, RB 29 et l’UE mémoire, RB 25)
Description : Ce master s’axe sur des questions de philosophie du vivant et de la
médecine, d’histoire et épistémologie des sciences du vivant, et dans une moindre
mesure d’éthique, en vue de donner certaines connaissances fondamentales en
philosophie, dans une relation avec les études et la pratique médicale.
En d’autres termes, ces enseignements sont destinés à donner une ouverture et
des moyens d’analyse et d’évaluation dans des domaines de réflexion concernant
la vie humaine et proche des sciences et techniques, en particulier de la biologie et
de la médecine. L’enseignement familiarisera aussi les étudiants avec des oeuvres
qui restent essentielles pour penser la médecine et le corps vivant aujourd’hui
(Georges Canguihem, Michel Foucault, François Dagognet, Maurice Merleau-Ponty)
et pour penser les sciences (Popper, Bachelard, Kuhn..) et l’éthique (Kant, Bentham,
le principlisme..). Des questions fondamentales seront posées : le lien entre corps,
conscience et esprit, l’expérience de la maladie, l’éthique médicale, la norme en
médecine, la souffrance et la mort.. Des études de textes se feront sous forme de
travaux dirigés. Les cours magistraux et les travaux de groupe comporteront aussi une
nécessaire actualisation des problèmes relatifs à des oeuvres historiquement datées et
à des apports de l’histoire de la bilogie et de la médecine.
Dans le cadre du master biomédical, cette UE devra faciliter l’accès aux masters 2
Recherche et aux écoles doctorales de sciences humaines et sociales (master recherche
HPDS Lyon 1 - Montpellier 2; master culture et santé Lyon 3 - Lyon 1; doctorat en histoire
et philosophie des sciences).
Modalités d’inscription : Accessible dès la deuxième année, pour les étudiants de Lyon Est
et Lyon Sud, toutes sections confondues, dès la deuxième année. CV, lettre de motivation.
(Voir avec le secrétariat de BH, car il y aura des modalités précises cette année, dans
l’informatisation du dossier)
Une prise de recul minimale
Pour ceux qui sont en manque
sur le contenu est recquise
de sciences humaines dans le
pour faire des liens constructifs
cursus globalement scientifique
entre les différents courants de
qu’est la médecine, ceux qui ont
pensées, auteurs, polémiques,
soif de culture générale, à qui le etc. étudiés.
débat plait.
ACLE 2015 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - 31
Mention Santé publique
UE RB17 : Méthodologie d’Évaluation Médico-Économique
dans les Systèmes de Santé
Responsable : Pr. Cyrille Colin – [email protected] – 04.72.11.53.72
Enseignements : Jeudi 14h-17h30 de janvier à mi-avril, site Rockfeller.
Validation : Examen écrit mi-mai sous forme de QROC, rattrapages mi-juin.
Mémoire d’une trentaine de pages à faire à deux sur un système de santé étranger ou un
autre sujet (à rendre mi-avril).
Mini-mémoire de Lecture Critique d’Article, environ 5 pages, à rendre fin avril pour valider les
6 ECTS du mémoire.
Description : L’enseignement de cette UE aborde des notions d’économie relativement
inconnues, en sachant les rendre intéressantes et claires.
Dans un premier temps sont abordées des notions fondamentales en économie, puis
appliquées spécifiquement au système de santé français (financement, organisation,
etc).
Dans un deuxième temps les cours s’axent sur la méthodologie : protocoles d’évaluation,
étude de coût, qualité de vie, arbres de décision, etc.
L’enseignement donne un point de vue différent sur le monde de la santé, en abordant
son aspect économique, plutôt absent de la formation générale, mais primordial en
pratique.
Les cours sont interactifs, avec beaucoup d’exemples et d’exercices.
Modalités d’inscription : il n’y a pas de sélection à l’entrée compte tenu du faible
nombre d’inscrits. Envoyez votre fiche d’inscription remplie par e-mail au Pr. Colin.
La formation est axée sur
une appréhension générale
de l’économie de la santé ce
qui constitue une véritable
ouverture d’esprit.
Les professeurs, très accessibles et avenants,
sont généralement disponibles pour
répondre aux questions.
32 - Guide des UE de M1 Recherche Biomédicale - ACLE 2015
Un travail supplémentaire est
demandé avec la rédaction de
deux mémoires.
Association des Carabins Lyon Est
8, Avenue Rockefeller
69373 LYON CEDEX 08
www.acle.net
04 78 77 71 53
[email protected] – [email protected]
3ème édition – 2015
Rédacteur en chef : Martin Lannelongue
Remerciement à tous les étudiants ayant aidé
à remplir ce guide par leur expérience au sein
d’un master.
Remerciement tous particuliers aux responsable
en charge du contenu : Alexandre Brudon,
Pierre Thibert, Zoé André, Estelle Tuaz, Gwénael
Leport, Laëticia Gutman, Quentin Paulik, Elsa
Dieterlen, Léa Durand, Alicia Milot Elsa Riche.
Photo : ©Communication – Eric Le Roux / UCBL