Globc: outils, liens utiles

Working Note
Globc: outils, liens utiles
Table of Contents
1 Globc: outils et liens utiles .
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1.0.1 Machines: .
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1.0.1.1 connections internes .
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1.0.1.2 connections externes: .
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1.0.2 Outils de développement: .
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1.0.2.1 configuration standard .
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1.0.2.1.1 ouverture de compte stagiaires: .
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1.0.2.2 éditeurs .
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1.0.2.3 logiciel de gestion de versions CVS:
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1.0.2.4 Tcl Tk .
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1.0.2.5 Langages de programmation .
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1.0.3 Simulations: .
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1.0.3.1 logiciel PALM (http://www.cerfacs.fr/globc/PALM_WEB/) .
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1.0.3.2 logiciel OASIS, PRISM (http://www.cerfacs.fr/~valcke/PRISM/prism.html)
1.0.3.3 modèles ORCAVAR, Arpège,ORCA(OPA): .
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1.0.4 Manipulation de sorties de modèle (fichiers Netcdf): .
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1.0.4.1 logiciel OASIS (interpolateur)
(http://www.cerfacs.fr/globc/software/oasis/index.html) .
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1.0.4.2 outils nco (/usr/local/bin) .
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1.0.4.3 utilitaires de manipulation de fichiers Netcdf .
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1.0.4.4 outils Statpack(imhotep) .
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1.0.5 Visualisation:
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1.0.5.1 Netcdf .
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1.0.5.2 Ferret
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1.0.5.3 logiciel IDL, librairies xxx, vxx, interpolations .
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1.0.5.4 logiciel NCL .
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1.0.5.5 Wavelet analysis (http://paos.colorado.edu/research/wavelets/) .
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1.0.5.6 outils divers: .
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1.0.6 Biblio, rapports: .
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1.0.6.1 connection PC Windows (meta) pour Word, Powerpoint .
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1.0.6.2 logiciel Latex
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1.0.6.3 outil Webify (conversion Powerpoint->html) .
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1.0.6.4 divers .
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1.0.7 Communications: .
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1.0.7.1 browser .
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1.0.7.2 mailer pine .
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1.0.7.3 demande de congés: gnews
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1.0.8 Moteur de recherche .
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1.0.9 Liens labos .
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1.0.9.1 CERFACS .
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1.0.9.2 Projets européens .
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1.0.9.3 ECMWF .
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1.0.9.4 IPSL-LODYC
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1.0.10 Publications .
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1.0.11 Toulouse pratique
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1 Globc: outils et liens utiles
Mise à jour: janvier 2003
Note: dans tous les fichiers liés, remplacer "stagiaire" par votre nom de login ($USER ou
$LOGNAME)
1.0.1 Machines:
1.0.1.1 connections internes
.rhosts (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/.rhosts)
1.0.1.2 connections externes:
Météo-France (log_kami)
Ecmwf (ecaccess (http://www.ecmwf.int/services/ecaccess/)) :
ajouter set path = ( $path /usr/ecaccess/client/tools ) dans votre .cshrc, voir Patrick
Laporte pour permissions d’accès
Idris (log_rhodes)
1.0.2 Outils de développement:
1.0.2.1 configuration standard
1.0.2.1.1 ouverture de compte stagiaires:
1. Demande formulaire (http://shou.cerfacs.fr/csg/services/CFX_Registration_Form.pdf) a
CSG
Vérifier que le terminal peut se connecter à elnino ou vortex
Faire ajouter le nom de login du stagiaire à la liste GLO (et non GLOSEUL) (Gérard
Déjean)
2. Détarer dans le HOME le fichier Env_Std.tar
(http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/Env_Std.tar) (est egalement disponible en local:
/home/maisonna/Intendance/Ouverture_Compte). Commande: tar xvf Env_Std.tar
3. Lancer sh_install
4. Se deloguer et se reloguer. Le nouvel environnement doit etre active.
5. Mailer : modifier éventuellement le .pinerc
Envoyer un premier mail au nouveau titulaire du compte pour que sa boite à lettre
se crée
-1-
6. Pour la personnalisation de l’environnement, voir Sophie Valcke (elle a le même)
7. (optionnel) Le fichier Env_Std_Imhotep.tar (compris dans Env_Std.tar) peut etre copie et
decompresse sur la machine de calcul. Le script sh_install peut etre execute pour que l’environnement standard sur imhotep soit installe.
8. Imprimer les recommandations (README.txt
(http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/README.txt))
1.0.2.2 éditeurs
vi (http://www.cerfacs.fr/~daget/vi.htm)
ou gvim (/usr/local/bin/gvim) version multimedia, securisee de vi (parc sgi et imhotep) (site
officiel (http://www.vim.org/))
emacs (.emacs (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/.emacs))
1.0.2.3 logiciel de gestion de versions CVS:
ajouter CVSROOT dans votre .cshrc, ou alias du type: alias cvsorca ’cvs -d
:local:/home/evian/ROOTCVS’
tkcvs: utilisation interactive de CVS (/usr/local/bin/tkcvs)
CVS--Concurrent Versions System - Table of Contents
(http://www.ensta.fr/~doc/in204/doc/cvs-doc-cederqvist/cvs-html/cvs_toc.html)
CVS BUBBLES (http://www.loria.fr/~molli/cvs-index.html)
Introduction à CVS
(http://www.ensta.fr/~doc/in204/doc/cvs-doc-bouyer/cvs-html/index.html)
CVShome.org (http://www.cvshome.org/docs/manual/cvs.html)
Concurrent Version System
(http://www-igm.univ-mlv.fr/~dr/XPOSE/CVS_DESPRE/CVS1.html)
1.0.2.4 Tcl Tk
Environnement de developpement:vtcl (http://sourceforge.net/projects/vtcl)
Le Portail de Tcl Tk Francophone (http://www.larochelle-innovation.com/tcltk/)
Tcl Developer Site (http://www.scriptics.com/)
1.0.2.5 Langages de programmation
Unix
shells Unix (http://www.shellunix.com/index.html)
Cours Unix debutants IDRIS (http://www.idris.fr/data/cours/cours-IDRIS.html#Unix-u)
Commandes de base Unix (http://www.infres.enst.fr/~danzart/fiches/unix_abrege.html)
-2-
Fortran
Manuel Fortran 77 (http://hpcf.nersc.gov/vendor_docs/ibm/xlf/html/lr02.HTM)
Initiation Fortran 77 (http://www.enstimac.fr/~gaborit/lang/CoursDeFortran/Fortran.html)
Le cours de Fortran d’Anne en PDF
(http://www.idris.fr/data/cours/lang/fortran/fortran_base/Fortran_base.pdf)
Numerical Recipes in Fortran 77 (http://www.library.cornell.edu/nr/bookfpdf.html)
Autres
Eléments d’HTML (http://www.imaginet.fr/ime/html32.htm)
Javascripts (http://www.kazaap.com/kazaap.htm)
Programmation Perl (http://www2.learningtree.com/fr/schedule.asp?c=431&o=loc)
1.0.3 Simulations:
1.0.3.1 logiciel PALM (http://www.cerfacs.fr/globc/PALM_WEB/)
1.0.3.2 logiciel OASIS
(http://www.cerfacs.fr/globc/software/oasis/index.html), PRISM
(http://www.cerfacs.fr/~valcke/PRISM/prism.html)
1.0.3.3 modèles ORCAVAR, Arpège,ORCA(OPA):
OPA System Team - WORK PLAN (http://www.lodyc.jussieu.fr/~opatlod/WORKPLAN/)
IOIPSL 1999 (http://www.ipsl.jussieu.fr/~ioipsl/)
IOIPSL: documentation pdf
OPA modelling system (http://www.lodyc.jussieu.fr/opa/)
CVS - OPA (http://www.ipsl.jussieu.fr/cgi-bin-opalod/cvsweb.cgi/)
FAQ ORCA (http://www.lodyc.jussieu.fr/opa/QUESTIONS/#2-0)
1.0.4 Manipulation de sorties de modèle (fichiers Netcdf):
1.0.4.1 logiciel OASIS
(http://www.cerfacs.fr/globc/software/oasis/index.html) (interpolateur)
1.0.4.2 outils nco (/usr/local/bin)
NCO Homepage (http://nco.sourceforge.net/)
1.0.4.3 utilitaires de manipulation de fichiers Netcdf
Création et retouche de masques: persona
(http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Persona/readme.html)
Conversion de format: Vairmer2Netcdf
(http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Vair2cdf/readme.html)
(local:/home/evian/eric/Vair2cdf/sh_vair2cdf et
imhotep:/home/globc_home/maisonna/Vair2cdf/sh_vair2cdf)
-3-
1.0.4.4 outils Statpack(imhotep)
ajouter set path=($path /home/globc/maisonna/statpack3/bin) a votre .cshrc
1.0.5 Visualisation:
1.0.5.1 Netcdf
Netcdf pour Fortran (http://www.unidata.ucar.edu/packages/netcdf/guidef/)
1.0.5.2 Ferret
Ferret IPSL (http://www.ipsl.jussieu.fr/~brocksce/ferret/docs/ferret.html)
Ferret Doc 5.0
(http://ferret.wrc.noaa.gov/Ferret/Documentation/Users_Guide/v50_2000/fer_html.htm)
Ferret Home Page (http://ferret.wrc.noaa.gov/Ferret/)
Librairie SIBYLLE (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Ferret/scripts.html) (visualisation des
grilles ORCA et Arpège, utilitaires développés par les utilisateurs du Cerfacs)
Impression Postscript:
alias metatolps source /usr/local/ferret540/paths/ferret_paths; Fprint -o \!* -p landscape metafile.plt
alias metatopps source /usr/local/ferret540/paths/ferret_paths; Fprint -o \!* metafile.plt
1.0.5.3 logiciel IDL, librairies xxx, vxx, interpolations
1.0.5.4 logiciel NCL
NCL (http://www.cgd.ucar.edu/csm/support/NCL/ref.shtml)
The NCAR Command Language (http://ngwww.ucar.edu/ncl/)
1.0.5.5 Wavelet analysis
(http://paos.colorado.edu/research/wavelets/)
1.0.5.6 outils divers:
xv (/usr/local/bin/xv)
acroread (/usr/local/bin/Acrobat4.05/bin/acroread et sur meta (Windows))
ghostview (/usr/local/bin/ghostview)
La foire aux logiciels IPSL (http://www.ipsl.jussieu.fr/~ioipsl/foire.html)
GMT (http://gmt.soest.hawaii.edu/gmt/examples/ex14/job14.csh.txt)
GRIB2IEEE (ftp://wesley.wwb.noaa.gov/pub/wgrib/grib2ieee.txt)
DODS (http://www.unidata.ucar.edu/packages/dods/)
1.0.6 Biblio, rapports:
1.0.6.1 connection PC Windows (meta) pour Word, Powerpoint
rsh meta x11 -display $DISPLAY
et ajouter, dans votre .rhosts, la ligne
votre_login meta
-4-
1.0.6.2 logiciel Latex
(/usr/local/bin/setuplatex.csh)
Conversion Latex-> RTF : /usr/local/glob/uti/latex2rtf-1.9.13/latex2rtf
1.0.6.3 outil Webify (conversion Powerpoint->html)
set path = ( $path /usr/local/glob/uti/WEBIFY/bin ) et
alias webify ’webify /home/maisonna/Webify/webify.template \!* ’ ou copier et modifier ce
fichier
Utilisation:
1: dans Powerpoint, imprimer dans un fichier (imprimante lg ou lc).
2: Renommer le .prn en .ps.
3: Lancer la commande Unix webify fichier.ps
1.0.6.4 divers
agrep: grep avec fonctionnalités supplémentaires (/usr/local/glob/uti/AGREP/agrep-2.04/agrep)
f2html: convertisseur Fortran -> HTML
(/usr/local/glob/uti/F2HTML/fortran2html_4.4/bin/f2html)
octave: matlab gratuit sur SUN (/usr/local/glob/uti/OCTAVE/bin/octave)
wget: aspire des sites Web entiers (/usr/local/glob/uti/WGET/wget)
gifscycle: film avec des gifs (/usr/local/glob/uti/gifsicle-1.30)
html2ps: convertisseur (/usr/local/glob/uti/html2ps-globc/bin/html2ps)
html2txt: convertisseur (/usr/local/glob/uti/html2txt/html2txt)
xwpick: capture d’écran ameliorée (/usr/local/glob/uti/xwpick-2.20/xwpick)
1.0.7 Communications:
1.0.7.1 browser
netscape
opera (sur station SUN) (/usr/local/glob/uti/OPERA/bin/opera)
outils: realplay, flahplayer (voir CSG)
1.0.7.2 mailer pine
filtres: .procmailrc
1.0.7.3 demande de congés: gnews
Ne pas oublier de remplir et faire signer la feuille de demande de conges (Voir Nathalie
Brousset)
Signaler votre absence avec l’utilitaire "gnews"
-5-
1.0.8 Moteur de recherche
Google (http://www.google.com/)
1.0.9 Liens labos
1.0.9.1 CERFACS
Site externe Cerfacs (http://www.cerfacs.fr/)
Intranet Cerfacs (http://shou.cerfacs.fr/)
Phone Directory (http://shou.cerfacs.fr/services/Phone_Directory.htm)
Plans d’accès Météopole (http://www.cnrm.meteo.fr/ama2002/acces2002.html)
Enregistrement TR/WN (http://shou.cerfacs.fr/docu/Report_Number/index.html)
Bibliotheque CERFACS (http://shou.cerfacs.fr/docu/index.html)
1.0.9.2 Projets européens
DEMETER Home Page (http://wms.ecmwf.int/research/demeter/)
Predicate Reading (http://ugamp.nerc.ac.uk/predicate/)
PREDICATE Metoffice (http://www.met.reading.ac.uk/~rowan/fp5/predicate.html)
PRISM Home Page (http://www.cerfacs.fr/~valcke/PRISM/prism.html)
1.0.9.3 ECMWF
Nos sorties atmospheriques
(http://wms.ecmwf.int/services/archive/d/catalog/class=dm/date=last/expver=crfc/)
ERA-40 (http://wms.ecmwf.int/research/era/Project_status.html)
ECMWF Home Page (http://www.ecmwf.int/)
1.0.9.4 IPSL-LODYC
plan Jussieu (http://www.admp6.jussieu.fr/planCampus.htm)
IPSL --Offres d’emploi (http://www.ipsl.jussieu.fr/actualites/Secretariat/Offres.htm)
Le Modèle LMDZ (http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/)
IOIPSL 1999 (http://www.ipsl.jussieu.fr/~ioipsl/)
OPA modelling system (http://www.lodyc.jussieu.fr/opa/)
1.0.10 Publications
Coaps Journal Holdings (http://www.coaps.fsu.edu/lib/jrn/)
Tellus - Series A
(http://www.munksgaarddirect.dk/usr/munksgaard/tidsskrifter.nsf/newcomlink/046?OpenDocument)
JGR (http://www.agu.org/pubs/inpress.html)
1.0.11 Toulouse pratique
Aeroport: Aéroport de Toulouse (http://www.toulouse.aeroport.fr/)
Routes:Trafic Rocade (http://www.trafic.asf.fr/trafic/cartes.asp?niveau1_6)
Cinemas: ABC TOULOUSE, (http://www.abc-toulouse.net/)Toulouse cinemas
(http://www.toulouseweb.com/cinemas.htm)
-6-
Bus:SEMVAT (http://www.semvat.com/)
Librairie: Ombres Blanches (http://www.ombres-blanches.fr/)
Theatres: TNT, (http://www.tnt-cite.com/)Jules Julien,
(http://www.ifrance.com/julesjulien/)Théâtre du Capitole
(http://www.theatre-du-capitole.org/)
Musique: Orchestre du Capitole de Toulouse, (http://www.onct.mairie-toulouse.fr/)LE
BIKINI (http://www.lebikini.com/)
Mairie: Mairie Tlse (http://www.mairie-toulouse.fr/)
-7-