Annuaire de la recherche 2013-2014 - Faculté de Pharmacie
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Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 UMR_S 1076 INSERM Vascular Research Center of Marseille (VRCM) Pr. Françoise Dignat-George Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE au 1er Janvier 2013 Intitulé de l’Unité : Vascular Research Center of Marseille (VRCM) - UMR_S 1076 Localisation : UFR Pharmacie Responsable : Françoise Dignat-George Intitulé de l’Equipe 1 : « Physiopathologie de l’Endothélium » Localisation : UFR Pharmacie Responsable : Françoise Dignat-George Téléphone : 04 91 83 55 55 Adresse électronique : [email protected] Intitulé de l’Equipe 2 : « Dysfonction endothéliale dans l’insuffisance rénale chronique » Localisation : UFR Pharmacie Responsable : Stéphane BURTEY Téléphone : 04 91 83 55 31 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : 26 Chercheurs : 3 Praticiens hospitaliers : 1 Assistants Hospitaliers Universitaires 2 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 2 Inserm, 3 Universitaires Personnel Administratif et Technique Universitaire : 7 Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : 1 Post-doc : 3 Etudiants en Thèse : 15 Etudiants en Master : 9 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom AGAPE BACHELIER BALDUCCI BARDIN BENNIS BLIN BLOT-CHABAUD Prénom Marie-Lucie Richard Estelle Nathalie Youssef Muriel Marcel BONELLO BONELLO BOUVIER BRUNET BURTEY CERINI CHARPIOT CHATEAU COINTE DARBOUSSET DE SAINT LEGER DIGNAT-GEORGE DOU DUBOIS DUMOULIN DUSSOL ESSAADI FALLAGUE FRERE GARRIGUES GONDOUIN GRANDVUILLEMIN GSELL GUILLET HACHE JOURDE-CHICHE KAPLANSKI Laurent Nathalie Sylvie Philippe Stéphane Claire Philippe Anne-line Sylvie Roxane Edith Françoise Laetitia Christophe Chloé Bertrand Amel Karim Corinne Philippe Bertrand Isabelle Thibault Benjamin Guillaume Noémie Gilles KNIPPING LACROIX LE QUANG LEROYER LOY LOYENS MEGE MESEGUER MEZOUAR MOYON NOLLET PAGANELLI PANICOT-DUBOIS Clémence Romaric Agathe Aurélie Catherine Maxime Diane Virginie Soraya Anais Marie Franck Laurence PAUL Pascale PERRIN PISANO Justine Pascale Fonction ATRF IE Inserm Doctorant MCU-PH Doctorant Doctorant DR2 Inserm MCU-PH Doctorant Doctorant PU-PH PU-PH MCF PU Doctorant AHU Doctorant AI Inserm PU-PH IE MCF IE PU-PH Doctorant TRF MCU-PH Doctorant Doctorant Doctorant Master 2 MCU-PH AHU MCU-PH PU-PH Master 2 MCU-PH ASI MCF ASI Master 2 Doctorant Master 2 Doctorant Master 2 Doctorant PU-PH CR1 Inserm CR1 Inserm Master 2 PU-PH HDR Téléphone 04 91 83 56 00 04 91 83 56 87 04 91 83 56 62 Oui 04 91 83 56 85 04 91 38 81 88 04 91 83 56 87 Oui 04 91 83 56 85 e-mail [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] Non Oui Oui Non Oui Non Oui Oui Oui Non Non Non Oui Oui [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] Non Non Oui Non 04 91 32 43 00 04 91 38 77 87 04 91 83 56 85 04 91 38 30 43/42 04 91 38 30 42 04 91 83 56 83 04 86 13 68 39 04 91 83 56 86 04 91 83 56 00 04 91 83 55 39 04 91 83 56 00 04 91 83 56 00 04 91 83 56 83 04 91 83 55 61 04 91 83 56 00 04 91 38 23 07 04 91 83 56 85 04 91 83 56 87 04 91 83 55 61 04 91 83 56 00 04 91 38 41 26 04 91 38 40 40 04 86 13 68 37 04 91 83 53 41 04 91 83 55 72 04 91 38 30 42 04 91 38 33 54 04 91 83 56 13 04 91 83 55 61 04 91 83 56 01 04.91.83.55.00 04 91 83 56 87 04 91 83 55 82 04 91 83 56 01 04 91 83 55 39 04 91 83 55 61 04 91 83 55 39 04 91 83 53 41 04 91 83 56 85 04 91 96 86 83 04 91 83 55 61 [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] Oui 04 91 83 56 55 pascale.paul@ univ-amu.fr Oui 04 91 38 30 42 04 91 83 56 24 [email protected] [email protected] Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 POGGI POITEVIN RAMDANI ROBERT ROSSI MCF Non MCF Non Master 2 IE Inserm PU-PH Oui 04 91 8 355 52 04 91 83 56 83 04 91 83 53 41 04 91 83 56 63 04 91 96 87 11 [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] SABATIER Marjorie Stéphane Alaa Stéphane PascalMaurice Florence PU-PH Oui 04 91 83 56 86 SALLEE SANTANA SARAND SCAGLIARINI SIELEZNEFF SIMEONI SIMONCINI STALIN TELLIER THOMAS Marion Tacy Célia Christine Igor Umberto Stéphanie Jimmy Edwige Grace Non Oui Oui Non - 04 91 38 30 42 04 91 38 30 42 04 91 83 56 00 04 91 83 55 54 04 91 38 58 52 04 91 38 40 30 04 91 83 56 86 04 91 83 56 85 04 86 13 68 37 04 91 83 55 39 VACHER-COPONAT VIGIER VIVANCOS WIDEMANN Henri Samy Lucie Agnès Oui - 04 91 38 30 72 04 91 83 56 48 04 91 83 56 85 04 91 83 56 62 [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] YZYDORCZYK Catherine PH Master 2 ATRF ATRF PU-PH PU-PH IE Doctorant MCF PostDoctorant PU-PH TRF Master 2 PostDoctorant PostDoctorant [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] - 04 91 83 56 00 [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE L'unité de recherche « Endothélium, pathologies vasculaires et cibles thérapeutiques » a pour objectifs principaux d’étudier les mécanismes physiopathologiques qui contrôlent l’intégrité de l’endothélium et leur dérégulation au cours des pathologies vasculaires, avec un intérêt particulier sur l’insuffisance rénale chronique. Partant de travaux d’amont sur la biologie de l’endothélium, au carrefour des réponses hémostatiques, inflammatoires et angiogéniques, la finalité de cette recherche est de contribuer à une meilleure compréhension des processus d’activation, de lésion et de régénération endothéliale, afin de développer des biomarqueurs originaux et de proposer des solutions thérapeutiques pour optimiser la prise en charge et la prévention des maladies vasculaires. Notre projet repose sur des chercheurs et enseignants-chercheurs fédérés thématiquement par les objectifs mentionnés cidessus et ayant, pour la plupart, une forte implication dans l'activité des laboratoires hospitaliers et des services cliniques du CHU. Cette politique permet d’assurer une continuité du versant fondamental vers le versant clinique de façon à dégager un aspect translationnel sur les différents thèmes. Dans ce contexte, nous avons restructuré notre projet autour de deux équipes reposant sur des thématiques fortement interfacées entre elles. Une 3ème équipe est venue se rattacher à l’UMRS1076 début 2012. Cette équipe est administrativement rattachée à l’équipe 1 mais fonctionne d’un point de vue scientifique comme une 3ème équipe autonome focalisée sur l’étude de la relation Endothélium, Thrombose et Cancer. - L’équipe 1 est dans la continuité des thèmes fondateurs de l’UMR S 608, sur la « Physiopathologie de l’endothélium » qui repose sur l’expertise acquise en biologie vasculaire, hémostase, et en médecine régénérative. Un premier thème a comme objectifs de comprendre le rôle de CD146 dans l’inflammation et l’angiogenèse, grâce à un modèle de souris KO, d’étudier les mécanismes de génération de CD146 soluble et ses fonctions biologiques et de développer des stratégies diagnostiques et thérapeutiques innovantes ciblant CD146, notamment dans l’angiogenèse tumorale. Le deuxième thème est focalisé sur les mécanismes de lésion et de régénération endothéliale. Nous étudions 1/ les mécanismes qui contrôlent la vésiculation endothéliale en fonction du territoire vasculaire et le rôle des microparticules dans le transfert d’information protéolytiques et immuno-régulatrices, 2/ les mécanismes qui contrôlent la survie et la fonction réparatrice des progéniteurs endothéliaux circulants en situation d’ischémie, et le rôle potentialisateur de facteurs de croissance ou de cellules souches à activité synergique 3/ l’intérêt des microparticules et des progéniteurs endothéliaux circulants comme biomarqueurs dans des situations à risque vasculaire, notamment la pathologie vasculaire gravidique, les thalassémies et le purpura thrombotique thrombocytopénique. Un troisième thème sur le risque vasculaire associé à la sénescence de l’endothélium est initié: nous étudierons les altérations de Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 l’endothélium au cours du vieillissement physiologique, du vieillissement pathologique induit par les anomalies de synthèse de la lamine (modèles animaux et cohortes de patients atteints de Progéria) et dans le risque vasculaire associé au faible poids de naissance. Un dernier thème concerne l’étude de l’interaction de l’endothélial avec les cellules circulantes et les conséquences en pathologie tumorale et thrombotique. - L’équipe 2, focalise ses recherches sur «le rôle de la dysfonction endothéliale dans l’insuffisance rénale chronique». L’objectif de cette équipe émergente au sein de notre unité est de rendre plus visible la recherche sur les maladies rénales chroniques à Marseille, à travers un regroupement d’expertises autour de la néphrologie, la biologie vasculaire, l’immunologie et la génomique. En effet, cet axe met en synergie les cliniciens et les chercheurs de l’UMRS1076 étudiant depuis plusieurs années l’impact de l’urémie et de la réponse allo-immune sur l’endothélium, avec une expertise en génomique et dans la création de modèles animaux appliqués à l'étude des maladies rénales. L’objectif général est de comprendre le rôle des toxines urémiques dans les complications cardiovasculaires de l’Insuffisance rénale chronique (IRC). Trois thèmes sont développés. Le premier étudie la régulation de l’expression du facteur tissulaire et de la fractalkine par les indoles, à l’aide de cellules endothéliales en culture et de modèles animaux d’IRC, en présence ou non d’inhibiteurs permettant de disséquer les voies de signalisation associées .Le deuxième thème étudie l’existence d’un nouveau mode de régulation de l’expression des gènes associés à l’IRC par épissage alternatif. Le troisième thème, focalisé sur la transplantation rénale, étudie le rôle potentiel de l’urémie et de l’allo-immunité, notamment des cellules NK, dans la dysfonction endothéliale en se focalisant sur le système fractalkine/CX3CR1. - L’équipe 3, « Endothélium, Thrombose et Cancer », centre ses recherches sur la compréhension des mécanismes cellulaires impliqués dans l’interaction des cellules circulantes avec l’endothélium dans les différentes conditions pathologiques que sont la thrombose, l’inflammation et le cancer. Un premier thème de recherche a pour but d’identifier les différents partenaires cellulaires impliqués dans la formation d’un thrombus plaquettaire in vivo. Nous nous focalisons tout particulièrement sur les interactions entre endothélium, polynucléaire neutrophile et plaquettes sanguines par microscopie intravitale en temps réel. Le second thème abordé se propose de déterminer le rôle des plaquettes sanguines dans la transmigration des leucocytes à travers la barrière endothéliale dans des modèles murins d’inflammation que nous avons développé. Enfin, le troisième thème de recherche étudie le rôle de microparticules d’origine cancéreuse dans la formation d’un état procoagulant et prothrombotique. 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS NATIONALES 2013 Lacroix R, Desplat V, Dignat-George F et Sampol J. Les syndromes mononucléosiques. Biochimie Hématologie. Le moniteur d'internat 2013 Lacroix R, Desplat V, Dignat-George F et Sampol J. La leucémie lymphoïde chronique. Biochimie Hématologie. Le moniteur d'internat 2013 Lacroix R, Desplat V, Dignat-George F et Sampol J. Les lymphomes. Biochimie Hématologie. Le moniteur d'internat 2013 Lacroix R, Sabatier F, Dignat-George F et Sampol J. La leucémie myéloïde chronique. Biochimie Hématologie. Le moniteur d'internat 2013 Frere C, Mercier-Bataille D, Suchon P, Aillaud MF. Le TCA, what else ? Spectra Biologie. 2013 Mar; 199 : 41-48 Ayach L, Curti C, Montana M, Pisano P, Vanelle P. Actualités dans le traitement étiologique de la sclérose latérale amyotrophique. Amyotrophic lateral sclerosis: Update on etiological treatment Thérapie. Vol. 68, No. 2 (Mars-Avril 2013) : 93 Pellegrini L, Bennis Y, Guillet B, Velly L, Bruder N, Pisano P. Cell therapy for stroke: from myth to reality. Rev Neurol (Paris). 2013 Apr ; 169(4):291-306 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Daumas A, Eraud J, Hautier A, Sabatier F, Magalon G, Granel B.Interests and potentials of adipose tissue in scleroderma] Rev Med Interne. 2013 Dec;34(12):763-9 G. Hache. La fibromyalgie. Pharmacie clinique – Le Moniteur Hospitalier 2013 ; 259 Hourmant M, de Cornelissen F, Brunet P, Pavaday K, Assogba F, Couchoud C, Jacquelinet C; registre du REIN. Access to the waiting list and renal transplantation. Nephrol Ther. 2013 Sep;9 Suppl 1:S139-66. Melenotte C, Rossi P, Reynaud Gaubert M, Harlé JR, Aissi K, Frances Y, et al. Une dyspnée et des phalanges raccourcies. Rev Med Interne 2013;34:785-6. Daumas A, Mélenotte C, Jimenez S, Rossi P, Jean E, Figarella-Branger D, et al. Des douleurs des membres supérieurs après un effort intense. Rev Med Interne 2013. Daumas A, Grob A, Faucher B, Melenotte C, Rossi P, Jean E, et al. Une cause rare de cervicalgie au cours d'une sclérodermie systémique. Rev Med Interne 2013;34:719-20. Dussol B. Dyslipidémie et maladie rénale chronique. Actualités Néphrologiques Jean Hamburger. Editeur Lavoisier SAS, Paris 2013, pages 85-97 2014 Daumas A, Rossi P, Bernard-Guervilly F, Francès Y, Berbis J, Durand JM, Kaplanski G, Ebbo M, Harlé JR, Weiller PJ, Serratrice J, Disdier P, Gayet S, Villani P, Granel B. Clinical, laboratory, radiological features, and outcome in 26 patients with aortic involvement amongst a case series of 63 patients with giant cell arteritis. Rev Med Interne. 2014 Jan;35(1):4-15 G. Hache. La médecine palliative. Dossier – Le Moniteur Hospitalier 2014 ; 264 Souberbielle JC, Benhamou CL, Cortet B, Rousière M, Roux C, Abitbol V, Audran M, Bachetta J, Beauchet O, Blain H, Breuil V, Briot K, Brunet P, Chanson P, Cormier C, Courbebaisse M, Fardellone P, Fouque D, Friedlander G, Gauvain JB, Groussin L(20), Houillier P, Jacot W, Jean G, Kamenicky P, Lafage-Proust MH, Legrand E, Levy-Weil F, Linglart A, Mallet E, Marcelli C, Maruani G, Montagnon F, Personne V, Prié D, RaynaudSimon A, Rolland Y, Salle B, Sault C, Schott AM, Thervet E, Urena-Torres P, Viard JP, Weryha G, Pierrot-Deseilligny C, Young J, Thomas T. HAS report on vitamin D measurement: don't go from an extreme situation to another as extreme situation. Presse Med. 2014 Jan;43(1):5-8. Quatre A, Roland G, Benabdelmoumene N, Hovsepian M, Melenotte C, Rossi P, et al. Une cause rare d'accident vasculaire cérébral. Rev Med Interne 2014;35:212-3. Melenotte C, Hovsepian M, Rodriguez F, Rossi P, Quatre A, Frances Y, et al. Douleur thoracique brutale après vomissements. Rev Med Interne 2014;35:139-40. Jourde-Chiche N, Chiche L, Mancini J, Daniel L, Bardin N, Burtey S, Gondouin B, Dussol B, Harlé JR, Hamidou M, Meulders Q, Daugas E. Prise en charge des glomérulonéphrites lupiques prolifératives : enquête de pratiques du Groupe Coopératif sur le Lupus Rénal auprès des néphrologues et internistes français. Néphrologie & Thérapeutique 2014 (sous presse). Chabannon C, Sabatier F, Rial-Sebbag E, Calmels B, Veran J, Magalon G Lemarie C, Mahalatchimy A. les unites de therapie cellulaire a l’épreuve de la réglementation sur les médicaments de thérapie innovante. Medecine Science 2014 (sous presse). Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES 2013 1. Jouve N, Despoix N, Espeli M, Gauthier L, Cypowyj S, Fallague K, Schiff C, Dignat-George F, Vély F and Leroyer AS. The Involvement of CD146 and Its Novel Ligand Galectin-1 in Apoptotic Regulation of Endothelial cells. J. Biol. Chem. 2013 Jan 25;288(4):2571-9. 2. Sallée M, Ismail K, Fakhouri F, Vacher-Coponat H, Moussi-Francés J, Frémaux-Bacchi V, Burtey S. Thrombocytopenia is not mandatory to diagnose haemolytic and uremic syndrome. BMC Nephrol. 2013 Jan 8;14:3. 3. Fernandez C, Bardin N, De Paula AM, Salort-Campana E, Benyamine A, Franques J, Schleinitz N, Weiller PJ, Pouget J, Pellissier JF, Figarella-Branger D. Correlation of clinicoserologic and pathologic classifications of inflammatory myopathies: study of 178 cases and guidelines for diagnosis. Medicine (Baltimore). 2013 Jan;92(1):15-24 4. Granel B, Daumas A, Rossi P. Dr. Granel, et al reply. J Rheumatol. 2013 Jan;40(1):96 5. Peyrol M, Sbragia P, Quatre A, Orabona M, Casalta AC, Boccara G, Zerrouk Z, Guenoun M, Lévy S, Paganelli F. Reduction of procedure duration and radiation exposure with a dedicated inner lumen mapping catheter during pulmonary vein cryoablation. Pacing Clin Electrophysiol. 2013 Jan;36(1):24-30. 6. Streitner F, Hamm K, Wittstein IS, Baranchuk A, Akashi YJ, Nef HM, Bonello L, Wolpert C, Borggrefe M, Haghi D. Is abnormal myocardial repolarization associated with the occurrence of malignant tachyarrhythmias in Takotsubo cardiomyopathy? Cardiol J. 2013;20(6):633-8. 7. Narasimhan L, Kuchta B, Schaef O, Brunet P, Boulet P. Mechanism of adsorption of p-cresol uremic toxin into faujasite zeolites in presence of water and sodium cations - A Monte Carlo study. Microporous and Mesoporous Materials. 2013;173:70–77 8. Lacroix R, Dignat-George F. Microparticles : new protagonists in pericellular and intravascular proteolysis. Seminars Thromb Haemost 2013 Feb; 39(1):33-9. 9. 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Diagnostic Performance of Computed Tomography Coronary Angiography (from the Prospective National Multicenter Multivendor EVASCAN Study). Am J Cardiol. 2013 Feb 15;111(4):471-8. 13. Stalin J, Harhouri K, Hubert L, Subrini C, Lafitte D, Lissitzky JC, Elganfoud N, Robert S, Foucault-Bertaud A, Kaspi E, Sabatier F, Aurrand-Lions M, Bardin N, Holmgren L, Dignat-George F, Blot-Chabaud M. Soluble Melanoma Cell Adhesion Molecule (sMCAM/sCD146) promotes angiogenic effects on endothelial progenitor cells through Angiomotin. J Biol Chem. 2013 Mar 29;288(13):8991-9000. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 14. 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Sallée M, Dou L, Cérini C, Poitevin S, Brunet P, Burtey Stéphane. The Aryl Hydrocarbon Receptor-Activating Effect of Uremic Toxins from Tryptophan Metabolism: A New Concept to Understand Cardiovascular Complications of Chronic Kidney Disease. Toxins. 2014;6(3):934-49 24. Gondouin B, Brunet P, Dignat-George F, Burtey Stéphane. The uraemic paradox : thrombotic and bleeding events. A pivotal role for endothelium, uraemic toxins and AHR pathway. Seminars in Dialysis. 2014 (in press) 25. Romeu M, Couchoud C, Delarozière JC, Burtey S, Chiche L, Harlé JR, Gondouin B, Brunet P, Berland Y, Jourde-Chiche N. Survival of patients with ANCA-Associated Vasculitides in Chronic Dialysis in France from 2002 to 2011: Data From The National Rein Registry. Quarterly Journal of Medicine. 2014 Feb 24 (in press). 26. Gaubert M, Laine M, Richard T, Fournier N, Gramond C, Bessereau J, Mokrani Z, Bultez B, Chelini V, Barnay P, Maillard L, Paganelli F, Bonello L. Effect of ticagrelor-related dyspnea on compliance with therapy in acute coronary syndrome patients. Int J Cardiol. 2014 Feb 22. pii: S0167-5273(14)00381-7. doi: 10.1016/j.ijcard.2014.02.028. [Epub ahead of print] 27. Giaime P, Daniel L, Burtey S. Remission of C3 glomerulopathy with rituximab as only immunosuppressive therapy. Clin Nephrol. 2014 (in press) 28. Dou L, Sallee M, Cerini C, et al. The uremic solute indole-3 acetic acid predicts cardiovascular events and mortality in chronic kidney disease patients: evidence for a vascular inflammatory and prooxidant effect. Journal of American Society of Nephrology. 2014 (Under review) 29. Hache G., Guiard BP., Nguyen TH, Quesseveur G., Gardier AM., Peters D., Munro G., Coudoré F. Antinociceptive activity of a new triple reuptake inhibitor NS 18283, in a mice model of chemotherapy-induced neuropathic pain. European Journal of Pain, 2014 (accepté sous réserve de modifications). 30. Le Dantec Y., Hache G., Guilloux JP., Guiard BP., David DJ., Adrien J., Escourrou P.. Chronic corticosterone administration enhances non-rapid eye movement sleep, induces sleep fragmentation and leads to poor sleep quality in a neuroendocrine mouse model of anxiety/depression. Neuroscience, 2014 (accepté sous réserve de modifications) 31. Rossi P, Gargne O, Ayme K, Gavarry O, Boussuges A. Between-limb changes in arterial function after intense cycling exercise. Int J Sports Med 2014 (in press) 32. Hubert L., Darbousset R., Panicot-Dubois L., Robert S., F. Sabatier F., Fallague K., DignatGeorge F. and Dubois C. Neutrophils recruit and activate Human Endothelial Colony Forming Cells at the site of vessel injury via PSGL-1 and L-Selectin. Thromb Haemost 2014 (in press) Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 BREVETS Titre du Brevet Développement d’un système de lecture automatisé Inventeurs : Bertin D, Bongrand P, Bardin N. N° de dépôt : European patent n° 1000191432 Année de dépôt : 2013 Année de publication : 2013 Déposant (Université de Méditerranée…) APHM Co-déposant (Inserm, AP..) : Licence éventuelle : Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 (En cours, soutenues) Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant Date Titre de la thèse Inscription Soutenance Devenir du Doctorant Thèses soutenues BENNIS Youssef BONELLO Nathalie "L'érythropoïétine, agent d'optimisation de la thérapie cellulaire par progéniteurs endothéliaux dans l'AVC ischémique et l'ischémie aigüe des membres inférieurs" « Conséquences des laminopathies dans l’endothélium vasculaire » (en cours) « Rôle des polynucléaires DARBOUSSET neutrophiles dans la formation d'un Roxane thrombus in vivo dans un modèle murin après blessure au rayon laser» GONDOUIN Bertrand PELLEGRINI Lionel SALLEE Marion "Les toxines urémiques provoquent un phénotype procoagulant de l’endothélium par la voie du facteur de transcription AHR" « Stratégie de neuroprotection au cours de l’AVC » "Mécanismes cellulaires, moléculaires et épigénétiques impliqués dans les complications de l’insuffisance rénale chronique 2008/2009 Mars 2013 MCU-PH 2008/2009 Septembre 2013 PH 2010/2011 Décembre 2013 POST DOCTORANT en Australie Melbourne Pr. Shaun Jackson 2010/2011 Novembre 2013 Chef de Clinique Assistant 2009/2010 Prévue Dec 2013 Abandon 2010/2011 Janvier 2014 PH 2011/2012 Prévue en Nov 2015 - Thèses en cours BALDUCCI Estelle « Rôle des microparticules dans le transfert d’information au cours de l’infection VIH » BLIN Muriel « Rôle de CD146 dans les pathologies inflammatoires et vasculaires » 2013 Prévue en Septembre 2016 - BOUVIER Sylvie « Nouveaux acteurs moléculaires impliqués dans la dysfonction vasculo placentaire » 2011/2012 Prévue en 2014 - COINTE Sylvie « Impact des microparticules dans la fibrinolyse" 2011/2012 Prévue en Octobre 2015 - CHATEAU Anne-Line « Microparticules dérivéses de progéniteurs endothéliaux issus Novembre 2013 Prévue en Décembre - Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 ESSAADI Amel GARRIGUES Philippe GRANDVUIL LEMIN Isabelle MEGE Diane MEZOUAR Soraya NOLLET Marie du sang de cordon : Outils d'angiogénèse thérapeutique et marqueurs de la dysfonction endothéliale » « Rôle de CD146s dans la différenciation des cellules vasculaires: application en thérapie cellulaire » « Imagerie de l’angiogenèse » « Implication des progéniteurs endothéliaux dans l’anoxo ischémie cérébrale néonatale expérimentale » « Rôle des microparticules circulantes dans le cancer colorectal » « Inflammation cancer et thrombose » « Caractérisation de CD146 dans les cellules cancéreuses: intérêt d'un anticorps anti-CD146 spécifique des cellules tumorales » « Rôle de CD146 soluble dans la croissance et l’angiogenèse tumorale » STALIN Jimmy 2016 01/12/2013 Prévue en Dec 2018 - 2010/2011 Prévue en Oct 2014 - 2010/2011 Prévue en Décembre 2014 - 2013/2014 Prévue en Octobre 2016 - 2011/2012 Prévue en Oct 2014 - 2013/2014 Prévue en Octobre 2016 - 2010/2011 Prévue en Novembre 2014 - 6 / LISTE DES CONTRATS 2013-2014 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique DIGNATGEORGE Françoise DUBOIS Christophe DIGNATGEORGE Françoise Intitulé Organisme de financement (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) ANR “Control of inter-endothelial junctions integrity by CD146 and JAMs : from molecular basis to renal inflammatory disease” READ « Rôles des microparticules dans ANR l’initiation et la régulation des processus de thromboses et de métastases » MiniRev : « Télomères courts chez les ANR 2013 patients à risque Programme de cardiovasculaire, marqueurs ou Recherche déterminants du vieillissement Translationnelle en Santé artériel accéléré » Date de début Date de fin 2011 2015 2009 2013 2014 2017 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 « Microparticules, vecteurs d’information génétique au cours de l’infection par le VIH » ANRS 2011 2014 « Rôle des plaquettes sanguines dans le développement d’une tumeur et la formation de métastases dans un modèle murin du cancer du pancréas » « Biomarqeurs de la Thrombose DUBOIS chez des patientes atteints d’un Christophe cancer du pancréas » « Encéphalopathie anoxoSIMEONI ischémique néonatale : étude de Umberto/ la tolérance et de la faisabilité SABATIER d’un traitement curatif par les Florence cellules souches du sang du cordon ombilical » « Immunité innée et KAPLANSKI lymphohistiocytose Gilles hémophagocytaire secondaire de l’adulte » « Etude de la vasculo KAPLANSKI compétence dans les SHU » Gilles VERSCHUUR A. Etude de phase II de chimiothérapie métronomique Pr. DIGNATassociant celecoxibGEORGE F. methotrexate-vinblastinecyclophosphamide chez les enfants porteurs d’une tumeur solide en rechute ou en progression SPARTE LAURENT S. ARC 2012 2013 INCa 2014 2016 PHRC 2010 2013 PHRC - 2013 PHRC - 2013 PHRC National 2010 2011 2014 PHRC 2014 2018 PHRC Interrégional 2012 2016 PHRC Interrégional 2012 2016 PROMOTION APHM 2011 2014 AORC - 2013 AORC Sénior - 2013 ROLL Patrice/ DIGNATGEORGE Francoise DUBOIS Christophe Intérêt pronostique des Pr. F. marqueurs associés à la SABATIER Pr. PAGANELLI modification des progéniteurs endothéliaux au cours de syndromes coronaires aigüs Pr J. ALBANESE Intérêt pronostique de la balance des activités pro-coagulantes et Pr F. DIGNATfibrinolytiques des GEORGE microparticules dans le choc septique « Effet du traitement par anti ROSSI Pascal TNF sur la rigidité artérielle et la fonction endothéliale au cours de la polyarthrite rhumatoïde » « Etude des anticorps antiKAPLANSKI endothéliaux au cours des microGilles angiopathies » « Sclérodermie et marqueurs GRANEL B. vasculaires » BARDIN Nathalie Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 HARLE Jean Robert DIGNATGEORGE Françoise BERNARD F. BARDIN Nathalie PAUL Pascale BARDIN Nathalie DIGNATGEORGE Françoise/ DECOUSUS Hervé DIGNATGEORGE Françoise DUBOIS Christophe BURTEY Stéphane DIGNATGEORGE Françoise DUBOIS Christophe DUBOIS Christophe DUBOIS Christophe « Etude de la lésion endothéliale dans la Drépanocytose » AORC Sénior « Etude in vivo et in vitro de la AORC Junior fonction endothéliale au cours de la sclérodermie systémique « « Marqueurs endothéliaux AORC Junior 2010 circulants et solubles dans la sclérodermie systémique » « Evaluation de la réaction AAP 2010 Recherche humorale et cellulaire antiClinique Translationnelle endothéliale dans la survenue du rejet de greffe cardiaque » « Apport du dosage du CD146 Contrat agence de soluble dans les milieux de biomédecine culture embryonnaire en fécondation in vitro » “Investigation Network On French Clinical Venous Thrombosis Embolism” Infrastructure Network (INNOVTE) F-CRIN 2013 2011 2013 2011 2014 2011 2014 2010 2013 2013 2016 2013 2017 « CD 146 nouvelle cible dans les pathologies vasculaires » FONDATION DE FRANCE 2012 2014 « Identification des mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans la formation et la stabilité d’un thrombus plaquettaire in vivo » « Rôle de l’activation d’aryl hydrocarbon receptor dans les anomalies de l’hémostase au cours de l’insuffisance rénale chronique » « Endothélial progenitor cells dysfunction in low birth weight : from mechanistic pathways to prevention strategies” « Etude du pouvoir antitumoral du Clopidrogrel dans un modèle murin du cancer du pancréas » FRM 2012 2015 FRM 2013 2015 Fondation Santé, Sport et Développement Durable (FSSDD) 2013 2014 FORMATION RECHERCHE TRANSLATIONNELLE EN CANCEROLOGIE GFTC 2009 2013 2012 2013 GFTC 2013 2015 « Study of the antitumoral effect of Clopidogrel in a mouse model of pancreatic cancer » « Analyse des microparticules de patients atteints de cancer pancréatiques : un indicateur d’efficacité des traitements chimiothérapeutiques » Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 BLOTCHABAUD Marcel DIGNATGEORGE Françoise DIGNATGEORGE Françoise « Evaluation de l’intérêt SATT Paca Corse thérapeutique d’anticorps anti CD146 soluble en cancérologie » Exploratory assessment of Laboratoire SERVIER biomarkers in female patients suffering from chronic venous leg ulcer versus control subjects free of leg ulcer “Standardization of ISTH microparticles analysis by flow cytometry.” 2013 2014 2013 - 2013 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 UMR 911 INSERM Centre de recherche en oncobiologie et oncopharmacologie Dr. Dominique Lombardo Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE 2013/2014 Intitulé de l’Unité : Centre de Recherche en Oncologie Biologique et Oncopharmacologie (CRO2) – Inserm UMR 911 Localisation : Campus santé Timone Responsable : D. LOMBARDO Intitulé de l’Equipe 1 : Communications microtubules-mitochondries implication en oncopharmacologie. Localisation : Faculté de Pharmacie Responsable : D. BRAGUER Téléphone : 04 91 83 56 35 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : 6 Chercheurs 0 Praticiens hospitaliers : 5 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 0 Personnel Administratif et Technique Universitaire : 3 Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : 1 Post-doc : 4 Etudiants en Thèse : 3 Etudiants en Master : 4 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom Prénom Fonction HDR Téléphone e-mail Braguer Diane PU-PH Oui 0491835635 [email protected] André Nicolas MCU-PH Oui 0491835507 [email protected] BourgarelRey Véronique MCU-PH Oui 0491835603 [email protected] Carlier Anne-Sophie ADT AMU Non CDD 0491835506 [email protected] Carre Manon MCU Non 0491835626 [email protected] Esteve Marie-Anne MCU Non 0491835626 Honore Stéphane MCU-PH Oui 0491835507 [email protected] [email protected] Berges Raphael Post-doc Non 0491835625 [email protected] Montero Marie-Pierre ADTAMU Non 0491835506 [email protected] Chacon Christine TCH AMU Non 0491835534 [email protected] Taya Sarah AGT INSERM Non 0491835502 [email protected] Mc Kay Nathalie CDD TCH AMU Non 0491835617 [email protected] Correard Florian Doctorant Non 0491835626 [email protected] Le Grand Marion Doctorant Non 0491835626 [email protected] Baati Tarek PostDoctorant Non Barlukova Ayuna Doctorante Non Oddoux Sarah Non Pasquier Eddy Postdoctorante Postdoctorant Non Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 3 / THEMES DE RECHERCHE Objectif général : caractériser in vitro et in vivo les mécanismes moléculaires de la réponse aux chimiothérapies anticancéreuses, en particulier aux agents ciblant les microtubules (MTAs) selon 4 axes : 1/ Dynamique des microtubules, protéines EB et pharmacologie des MTAs 1-1/ modélisation mathématique de la dynamique des microtubules 1-2/ rôle de EB1 dans l’invasivité du glioblastome, rôle prédictif dans la réponse aux MTAs 2/ Mitochondrie, stress oxydatif et réponse des cellules tumorales aux MTAs 2-1/ ROS mitochondriaux et dynamique des microtubules via la phosphorylation de EB1 2-2/ mécanisme moléculaire impliqué dans les assocations MTAs et anti Akt 2-3/ partenaires de Bim au niveau microtubulaire et mitochondrial 3/ Développement de nanoparticules pour améliorer la délivrance intratumorale de MTAs 3-1/ Identité biologique et caractérisation de l’innocuité et de l’internalisation des nanoparticules in vitro 3-2 / Innocuité et distribution tissulaire des nanoparticules sur petit animal sain et porteur de tumeur 3-3/ Efficacité de complexes nanoparticules-drogue 4/ Mécanismes de résistance aux chimiothérapies conventionnelles et ciblées, stratégie de repositionnement de drogue 4-1/ Hétérogénéité tumorale : interactions cellules sensibles et résistantes et schémas de traitement 4-2/ repositionnement de drogue par screening haut débit de drogues et de siRNA de tumeurs Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 Evidence for new targets and synergistic effect of metronomic celecoxib/fluvastatin combination in pilocytic astrocytoma Mercurio S, Padovani L, Colin C, Carré M, Tchoghandjian A, Scavarda D, Lambert S, Baeza-Kallee N, Fernandez C, Chappé C, André N, Figarella-Branger D Acta Neuropathologica Communications. 2013.1:7 - (2013) Has the time come for metronomics in low-income and middle-income countries? André N, Banavali S, Snihur Y, Pasquier E. Lancet Oncol. 2013 May;14(6):e239-48 - (2013) β-blockers increase response to chemotherapy via direct antitumour and anti-angiogenic mechanisms in neuroblastoma. Pasquier E, Street J, Pouchy C, Carre M, Gifford AJ, Murray J, Norris MD, Trahair T, Andre N, Kavallaris M. Br J Cancer. 2013 May 21. doi: 10.1038/bjc.2013.205. - (2013) Concentration- and schedule-dependent effects of chemotherapy on the angiogenic potential and drug sensitivity of vascular endothelial cells. Pasquier E, Tuset MP, Street J, Sinnappan S, MacKenzie KL, Braguer D, Andre N, Kavallaris M. Angiogenesis. 2013 Apr;16(2):373-86. (2013) Anti-Migratory Effect of Vinflunine in Endothelial and Glioblastoma Cells Is Associated with Changes in EB1 C-Terminal Detyrosinated/Tyrosinated Status. Rovini A, Gauthier G, Bergès R, Kruczynski A, Braguer D, Honoré S PLoS One. 2013 Jun 4;8(6) - (2013) Primary gliomatosis cerebri involving gray matter in pediatrics: a distinct entity? A multicenter study of 14 cases. Chappé C, Riffaud L, Tréguier C, Carsin-Nicol B, Veillard D, Chiforeanu DC, Grill J, Frappaz D, André N, Millot F, Vinchon M, Sirvent N, Edan C. Childs Nerv Syst. 2013 Jan 10. - (2013) A mathematical model for the administration of temozolomide: comparative analysis of conventional and metronomic chemotherapy regimens. Faivre C, Barbolosi D, Pasquier E, André N. Cancer Chemother Pharmacol. 2013 Feb 7. - (2013) Bcl-2-enhanced efficacy of microtubule-targeting chemotherapy through Bim overexpression: implications for cancer treatment. Savry A, Carre M, Berges R, Rovini A, Pobel I, Chacon C, Braguer D, Bourgarel-Rey V. Neoplasia. 2013 Jan;15(1):49-60. - (2013) ATIP3, a novel prognostic marker of breast cancer patient survival, limits cancer cell migration and slows metastatic progression by regulating microtubule dynamics. Molina A, Velot L, Ghouinem L, Abdelkarim M, Bouchet BP, Luissint AC, Bouhlel I, Morel M, Sapharikas E, di Tommaso A, Honore S, Braguer D, Gruel N, Vincent-Salomon A, Delattre O, Sigal-Zafrani B, Andre F, Terris B, Akhmanova A, Di Benedetto M, Nahmias C, Cancer Res. 2013 Feb 8. - (2013) Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Date Nom – Prénom du Doctorant Titre de la thèse Inscription Soutenance Devenir du Doctorant « Communication microtubulesmitochondries : une nouvelle clef dans la réponse à la 01/10/12 chimiothérapie » LE GRAND Marion CORREARD Florian « Evaluation pharmacologique de nanoformulations du paclitaxel » « Modélisation mathématique BARLUKOVA de la dynamique des Ayuna microtubules » 01/10/12 01/10/2013 6 / Liste des contrats 2013-2014 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique BASILEA BAL27862 Organisme Date de de financement début (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) Privé 2009 2014 Lasernanothéranostique Amidex 2014 2016 LASERNANOBIO ANR 2010 2014 Marie Curie people FP7 2014 2016 SIRIC Paca Ouest INCa 2013 2017 S. Honoré Pharmathotubule Amidex 2014 2016 N. André SFCE METRO PHRC 2011 2015 SFCE 2012 caritatif 2012 2014 Fluvabrex 1208 PHRC 2013 2016 D. Braguer Intitulé Date de fin Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Intitulé de l’Equipe 2 : Microenvironnement redox, cytosquelette et progression tumorale Localisation : UFR de Pharmacie Responsable : Pr. Hervé Kovacic Co-responsable : Pr. Vincent Peyrot Téléphone : 04.91.83.56.27 Secrétariat: 04.91.83.55.06 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : 11 (dont 1PH) Chercheurs : 0 Praticiens hospitaliers : 1 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 1 (à 60%) Personnel Administratif et Technique Universitaire : 3 Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : 1 en disponibilité Post-doc : 1 en cours Etudiants en Thèse : 2 Etudiants en Master : 2 M2 3 M1 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE Nom KOVACIC PEYROT LUIS GARROUSTE THUAULT BARBIER DEVRED BREUZARD MONJANEL POMMIER PAGANO LELOUP Prénom Hervé Vincent José Françoise Sylvie Pascale François Gilles Suzanne Gilbert Alessandra Ludovic Fonction PU PU PU MCU MCU MCU MCU MCU MCU MCU-PH MCU MCU HDR OUI OUI OUI NON NON NON NON NON NON OUI NON NON Téléphone 0491835627 0491835505 0491835652 0491835523 0491835659 0491835616 0491835596 0491835526 e-mail [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] 0491835584 [email protected] 0491835577 [email protected] 0491835584 [email protected] Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 PARAT ALLEGRO DOUILLARD NOUAR MOUSSLIM Fabrice Diane Soazig Roqiya Mohamed TCH AI IE PhD PhD NON NON NON NON NON 0491835599 0491835617 0491835617 0491835550 0491835502 [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE L’homéostasie redox extracellulaire joue un rôle régulateur important dans les interactions cellule/microenvironnement. Elle se trouve altérée lors du développement tumoral. Il en résulte une modification de la fonctionnalité de protéases, facteurs solubles et protéines de la matrice extracellulaire qui favorise l’agressivité du développement tumoral. Nos travaux visent à comprendre l’impact de l’homéostasie redox sur l’évolution métastatique des tumeurs, ainsi que sur la réponse aux traitements anticancéreux. Thème 1 : Homéostasie redox, progression métastatique colorectale et migration tumorale. La conversion d’une tumeur primaire en une métastase invasive implique une modification du phénotype migratoire des cellules tumorales. Nous avons identifié les NADPH oxydases comme des régulateurs majeurs de la directionalité de migration par leur impact sur l’activation de RhoA et sur la biodisponibilité membranaire des intégrines. Ces résultats, récemment confirmés in vivo, montrent que les deux principales molécules capables d’affecter la directionalité de migration sont les inhibiteurs de NADPH oxydase et les déstabilisants du réseau microtubulaire. Les objectifs de ce thème de recherche sont de (a) comprendre les interrelations des voies des NADPH oxidases/RhoA/intégrines avec la stathmine (une protéine déstabilisatrice de microtubules) (b) d’évaluer le lien entre la perte de directionalité induite par l’inhibition de Nox1 ou de stathmine et l’établissement de la transition mésenchymale/amiboïde (c) d’évaluer l’impact d’un knock-out ou d’une modulation de l’activité NADPH oxydase sur l’occurrence de métastases in vivo. Cette étude est développée en utilisant des techniques de biologie moléculaire et cellulaire, d’imagerie et de dynamique cellulaire ainsi, qu’une approche in vivo sur le petit animal. Thème 2 : Potentialité thérapeutique et pronostique de la modulation redox en cancérologie. Les espèces réactives de l’oxygène (ROS) sont augmentées dans les cellules tumorales par activation oncogéniques des NADPH oxydases (en particulier Nox1) et par l’impact de l’hypoxie sur les mitochondries. Il est maintenant démontré que de nombreux agents de chimiothérapie induisent une production de ROS qui participent à leur effet cytotoxique. Les agents anti-microtubules (AMT) tels que le paclitaxel (taxol), la vincristine (oncovin) et le docétaxel (taxotère) représentent une classe majeure d’agents anticancéreux régulant la polymérisation du cytosquelette microtubulaire. Des travaux récents ont montré que le paclitaxel induit une production de ROS par une NADPH oxydase (Nox1) dans le milieu extracellulaire, aboutissant à la mort de cellules voisines non exposées aux drogues. Le mécanisme oxydant des AMT reste mal connu et son impact peut affecter le système microtubulaire en affectant directement les microtubules ou indirectement les protéines régulatrices associées telles que tau et la stathmine. Nos objectifs sont de : 1-Caractériser l’effet de l’oxydation des protéines associées aux microtubules, telles que tau (protéine stabilisatrice) et la stathmine (protéine déstabilisatrice des microtubules), sur l’interaction de ces protéines avec les microtubules en solution et leur sensibilité aux AMT. 2-Etudier l’impact de la modulation de la production des ROS sur l’état d’oxydation du cytosquelette microtubulaire (microtubules, tau et stathmine) et sur sa fonctionnalité. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES 1. Deciphering the molecular mechanisms of anti-tubulin plant derived drugs P. Barbier, P. O. Tsvetkov, G. Breuzard, F. Devred. Phytochemistry Reviews March 2014, Volume 13, Issue 1, pp 157-169 . 2. Biochemical and structural studies of the oligomerization domain of the Nipah virus phosphoprotein: Evidence for an elongated coiled-coil homotrimer. David Blocquel, Matilde Beltrandi, Jenny Erales,Pascale Barbier,Sonia Longhi. Virology, Volume 446, Issues 1-2, November 2013, Pages 162-172. - (2013) 3. Microtubule-associated proteins and tubulin interaction by isothermal titration calorimetry. Tsvetkov PO, Barbier P, Breuzard G, Peyrot V, Devred F.Methods Cell Biol. 2013;115:283-302 - (2013) 4. Molecular Mechanisms of Tau Binding to Microtubule and its Role in Microtubule Dynamics in Live Cells. Breuzard G, Hubert P, Nouar R, De Bessa T, Devred F, Barbier P, Sturgis JN, Peyrot V. J Cell Sci. 2013 May 9. 5. FRET and FRAP imaging: approaches to characterize tau and stathmin interactions with microtubules in cells. Nouar R, Devred F, Breuzard G, Peyrot V. Biol Cell. 2013 Jan 14. - (2013) 6. Geriatric Factors Predict Chemotherapy Feasibility: Ancillary Results of FFCD 200102 Phase III Study in First-Line Chemotherapy for Metastatic Colorectal Cancer in Elderly Patients. Aparicio T, Jouve JL, Teillet L, Gargot D, Subtil F, Le Brun-Ly V, Cretin J, Locher C, Bouché O, Breysacher G, Charneau J, Seitz JF, Gasmi M, Stefani L, Ramdani M, Lecomte T, Mitry E. J Clin Oncol. 2013 Mar 4. 7. Body mass index at diagnosis and survival among colon cancer patients enrolled in clinical trials of adjuvant chemotherapy. Sinicrope FA, Foster NR, Yothers G, Benson A, Seitz JF, Labianca R, Goldberg RM, Degramont A, O'Connell MJ, Sargent DJ; for the Adjuvant Colon Cancer Endpoints (ACCENT) Group. Cancer. 2013 Jan 10. 8. PIVL, a new serine protease inhibitor from Macrovipera lebetina transmediterranea venom, impairs motility of human glioblastoma cells. Morjen M., Kallech-ziri O., Bazaa A., Othman H., Mabrouk K., Zouari-Kessentini R., Sanz L., Calvete J.J, SrairiAbid N., El Ayeb M., Luis J. & Marrakchi N. (2013) Matrix Biol. 32, 52-62. 9. Antitumoral Potential of Tunisian Snake Venoms Secreted Phospholipases A2. Zouari-Kessentini R., Srairi-Abid N., Bazaa A., El Ayeb M., Luis J. & Marrakchi N. BioMed Research International 2013. 10. Snake venom peptides: promising molecules with anti-tumor effects. Sarray S., Luis J., El Ayeb M. and Marrakchi N. In Bioactive food peptides in health and disease (ISBN 980-953-307-472-1). pp219-228. (2013). Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Date Nom – Prénom du Doctorant Devenir du Doctorant Titre de la thèse Inscription DeBessa Tiffany Co-tutelle Université Sao Paulo, Brésil Soutenance 2013 2016 Nouar Roqiya Microtubule & Stathmine 2009 2013 Mousslim Mohamed 2010 2014 2009 2013 2013 2016 Identification de nouveaux inhibiteurs de NADPH oxydase Codirection avec D Lafitte SM & carbonylation des protéines Co-tutelle Université Sao Paulo, Brésil Sellami Lina DeBessa Tiffany Post-doc Post-doc Liste des HDR Nom – Prénom Barbier Pascale Date de soutenance Titre de l’HDR Oncopharmacologie des ligands de la tubuline 2014 6 / Liste des contrats 2013-2014 Responsable Scientifique Intitulé H. Kovacic ARCUS Brésil J. Luis ARCUS Magreb V. Peyrot Marie Curie International Incoming fellowship Organisme Date de de financement début (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) Ministère affaires 2010 étrangères Ministère affaires 2011 étrangères 7eme PCRD 2014 Date de fin 2013 2014 2016 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Plate-forme Pharmacocinétique : SMARTc (« Simulation & Modelling : Adaptive Response for Therapeutics in Cancer »). Localisation : UFR Pharmacie + CHU Timone Responsable : Pr. Bruno Lacarelle Téléphone Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : 8 Chercheurs : 0 Praticiens hospitaliers : 1 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 0 Personnel Administratif et Technique Universitaire : 1.5 Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : 0 Post-doc : 1 Etudiants en Thèse : 5 Etudiants en Master : 3 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom Prénom Fonction HDR Téléphone BARBOLOSI Dominique PU Oui 0491835645 BENAY Stéphan DOCTORANT Non CICCOLINI Joseph MCF PA Oui 0491835509 FAIVRE Christian MCF Oui 0413551434 FANCIULLINO Raphaëlle MCU PH Non GIACOMETTI Sarah TCH AMU Non 0491835509 e-mail Dominique.barbolos [email protected] Stephan.benay@uni v-amu.fr Joseph.ciccolini@u niv-amu.fr Christian.faivre@un iv-amu.fr Raphael.fanciulino @univ-amu.fr Sarah.giacometti@u niv-amu.fr Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 ILIADIS Athanassios PU Oui 0491835645 LACARELLE Bruno PU PH Oui 0491835608 MERCIER Cédric PH Non MOLLARD Séverine POST DOCORANT Non SERDJEBI Cindy DOCTORANT Non 0491835509 SOLAS Caroline MCU PH Non 0491835640 BANEYX Guillaume DOCTORANT Non 0491835509 LAUNAY Manon DOCTORANT Non 0491835509 KHELOUFI Farid DOCTORANT Non Athanassios.iliadis @univ-amu.fr Bruno.lacarelle@un iv-amu.fr Cedric.mercier@uni v-amu.fr Severine.mollard@ univ-amu.fr Cindy.serdjebi@uni v-amu.fr Caroline.solas@uni v-amu.fr guillaume.baynex@ roche.com [email protected] [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE Notre activité de Recherche est axée autour du contrôle de la variabilité pharmacocinétique, et de l’optimisation des protocoles thérapeutiques reposant sur l’association de plusieurs médicaments, avec une forte spécialisation dans le domaine des médicaments anticancéreux : cytotoxiques ou thérapies ciblées. Il s’agit d’une recherche de transfert, qui par essence nécessite de fortes collaborations avec les équipes cliniques hospitalières et les partenaires de l’industrie pharmaceutique. Cette activité repose sur le développement et l’intégration d’outils issus des sciences mathématiques appliqués au domaine du médicament, ou pharmacométrie. Le développement de modèles biomathématiques décrivant les processus pharmacocinétiques et leur impact pharmacodynamique (toxicité, efficacité) permet en retour de proposer une modalité optimale d’utilisation des thérapeutiques afin de contrôler et d’améliorer la balance efficacité/toxicité chez le patient atteint de cancer. Cette activité repose sur 3 sous-groupes de recherche au sein de la plate-forme SMARTc : le groupe « Modelling & Simulation », le groupe « PK Expérimentale », et enfin le groupe « PK Translationnelle ». Plus précisément, les principales thématiques de recherche de l’unité SMARTc sont : - - Le développement de modèles PK/PD pour déterminer la séquence optimale d’association entre les antiangiogéniques et la chimiothérapie dans les cancers du sein et en oncologie thoracique. Le développement de modèles mathématiques décrivant l’essaimage métastatique et l’impact des traitements sur celui-ci. Le développement d’outils mathématiques pilotant l’administration de polychimiothérapies par des modèles de contrainte. Le développement de modèles mathématiques optimisant la mise en place des chimiothérapies dites métronomiques. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 - - Le développement de stratégies de suivi thérapeutique pharmacologique permettant de cibler les schémas posologiques de cytotoxiques majeurs (5-FU), de thérapies ciblées (TKIs) et de biothérapies (bévacizumab, cetuximab). Le développement de formes vectorielles permettant de réduire la variabilité pharmacocinétique d’anticancéreux via le recours au ciblage actif et passif des molécules. 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS NATIONALES: Ciccolini J. Déterminants moléculaires et génétiques d’efficacité et de toxicité du 5-fluorouracile. Oncologie (2014) 16:91-95. PUBLICATIONS INTERNATIONALES: Peters GJ, Honeywell R, Maulandi M, Giovanetti E, Etienne-Grimaldi MC, Milano G, Serdjebi C, Ciccolini J. Cross-validation of cytidine deaminase using different blood compartments and two assays in three EORTC-Pharmacology and Molecular Mechanism (PAMM) group laboratories. Nucleosides, Nucleotides Nucleic Acids. 2014 in press. Fanciullino R, Mollard S, Correard F , Giacometti S, Serdjebi C, Iliadis A, Ciccolini J. Biodistribution, Tumor Uptake And Efficacy Of 5FU -Loaded Liposomes: Why Size Matters. Pharm Res. 2014 in press. D. Barbolosi, A. Benabdallah, S. Benzekry, J. Ciccolini, C. Faivre, F. Hubert, F. Verga, B. You. A Mathematical Model for Growing Metastases on Oncologists’s Service. Computational Surgery and Dual Training 2014 (Springer) : 331-338. Ciccolini J; Fanciullino, R; Milano, G. Predicting survival of gastric cancer patients treated with 5-fluorouracil-based regimen: falling again on TP53. Pharmacogenomics 14(10): 11371138. Faivre C, Barbolosi D, Pasquier E, André N. A mathematical model for the administration of temozolomide: comparative analysis of conventional and metronomic chemotherapy regimens. Cancer Chemother Pharmacol. 2013 71(4):1013-9. Milano, G; Fanciullino, R; Ciccolini, J. MTHFR gene polymorphisms: how to face Janus in oncology, with risk on one side and treatment effect on the other. Pharmacogenomics 14(9): 1007-1008. R. Fanciullino, J. Ciccolini, G. Milano. Challenges, expectations and limits for nanoparticlesbased therapeutics in cancer: a focus on nano-albumin-bound drugs. Crit Rev Oncol Hematol. 2013 88(3):504-13. C. Serdjebi, JF. Seitz, J. Ciccolini, M. Duluc, E. Norguet, F. Fina, B. Lacarelle, L. Ouafik, L. Dahan. Rapid deaminator status is associated with poor clinical outcome in pancreatic cancer patients treated with a gemcitabine-based regimen. Pharmacogenomics. 2013 Jul;14(9):104751. F. André, J. Ciccolini, JP Spano, F. Penault-Llorca, N. Mounier, G. Freyer, JY. Blay, G. Milano. Personalized medicine in oncology: where have we come from and where are we going? Pharmacogenomics. 2013 Jun;14(8):931-9. J. Ciccolini, GJ. Peters, E. Giovannetti. Gender, cytidine deaminase, and 5-aza/decitabine. Clin Cancer Res. 2013 Jun 1;19(11):3105. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Evrard A, Lacarelle B, Ciccolini J. Severe or lethal toxicities with nucleosidic analogs: time for action. Pharmacogenomics. 2013 Feb;14(3):227-30 R. Fanciullino, S. Mollard, S. Giacometti, Y. Berda-Haddad, M. Chefrour, C. Aubert, A. Iliadis, J. Ciccolini. In vitro and in vivo evaluation of lipofufol, a new triple stealth liposomal formulation of modulated 5-fu: impact on efficacy and toxicity. Pharm Res. 2013 May;30(5):1281-90 MJ. Amiot, B. Romier, TM. Dao, R. Fanciullino, J. Ciccolini, R. Burcelin, L. Pechere, C. Emond, JF. Savouret, E. Seree. Optimization of trans-Resveratrol bioavailability for human therapy. Biochimie. 2013 Jun;95(6):1233-8 G. Baneyx G, N. Parrott, C. Meille, A. Iliadis, T. Lavé. Physiologically based pharmacokinetic modeling of CYP3A4 induction by rifampicin in human: Influence of time between substrate and inducer administration. Eur J Pharm Sci. 2014 Feb 12;56C:1-15 Hajji H, Gérolami R, Solas C, Moreau J, Colson P. Chronic hepatitis E resolution in a human immunodeficiency virus (HIV)-infected patient treated with ribavirin. Int J Antimicrob Agents. 2013 Mar 15 Colson P, Bregigeon S, Tourres C, Solas C, Poizot-Martin I, Tamalet C. Relapse of hepatitis C virus after 14 months of sustained virological response following pegylated-interferon alpha plus ribavirin therapy in a human immunodeficiency virus type 1 infected patient. J Clin Virol. 2013 Sep;58(1):309-14. Poizot-Martin I, Solas C, Allemand J, Obry-Roguet V, Pradel V, Bregigeon S, Faucher O, Lacarelle B. Renal impairment in patients receiving a tenofovir-cART regimen: Impact of tenofovir trough concentration. J Acquir Immune Defic Syndr. 2013 Apr 1;62(4):375-80. BREVETS Titre du Brevet Inventeurs : N° de dépôt : Année de dépôt : Année de publication : Method for assessing the ability of a patient to respond to or be safely treated by a nucleoside analog based-chemotherapy Ciccolini, Mercier, Dahan, Iliadis, Seitz, Ouafik US 20130011392 A1 2009 10 janvier 2013 Déposant (Université de Méditerranée…) AMU Co-déposant (Inserm, AP..) : APHM Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Nom – Prénom du Doctorant WOLOCH Christian BANEYX Guillaume BENAY Stéphan SERDJEBI Cindy LAUNAY Manon Kheloufi Farid Date Titre de la thèse Inscription Soutenance Modélisation formelle des phénomènes de résistance rencontrés en Prévue parasitologie, infectiologie et en 2013-2014 2014 chimiothérapie. Utilisation optimale d'une association médicamenteuse Physiologically modeling of drug-drug interactions and PK/PD modeling of Prévue 2013-2014 the tumor diffusion for drugs involved 2014 in oncology Les anticorps monoclonaux utilisés en oncologie : Modélisation Prévue pharmacocinétique2013-2014 2014 pharmacodynamique et intérêt du suivi thérapeutique pharmacologique Prévue Pharmacogénétique de la gemcitabine 2013-2014 2015 Prévue STP et ciblage posologique du 5-FU 2013-2014 2016 Etude des relations pharmacogénétiquepharmacodynamique de la ribavirine Prévue 2012 dans le cadre du traitement de 2015 l’hépatite C chez le patient co-infecté VIH-VHC Devenir du Doctorant En cours En cours En cours En cours En cours En cours Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 6 / Liste des contrats 2013-2014 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique J. Ciccolini (co-porteur) J. Ciccolini Intitulé MEMOREX Organisme Date de de financement début (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) ANR 2009 2013 Pro-CAN 2012 2013 GEFLUC 2013 2014 Roche Oncologie 2014 2014 CANCEROPOLE PACA Fédération Française de Cancérologie digestive (FFCD) Galderma R&D 2013 2013 2011 2014 2012 2013 Anavex NY, USA 2013 2015 2013 2014 2014 2014 2014 2016 2011 2014 A. Iliadis Modélisation des processus métastatiques Développement de modèles sphéroïdes 3D Optimisation de la séquence bévacizumab-cytotoxique. PK du bévacizumab en oncologie thoracique Pharmacogénétique de la gemcitabine : essai clinique FFCD 1004. PK and PD profiles of a NCE Population PKs of Anavex 273 in healthy volunteers Cell Index – Impedance J. Ciccolini Développement des ANC Hoffmann – La Roche, Basel Roche - Genentech D. Barbolosi Vinorelbine métronomique Pierre Fabre C SolasChesneau Essai clinique ANRS HC-27 ANRS BOCEPREVIH : Sous-étude pharmacogénétique des antirétroviraux et de la ribavirine Fluvabrex : Etude de phase I PHRC de l’association Fluvastatine®-Celebrex® pour les gliomes de bas grade hypothalamochiasmatique en rechute ou réfractaire. PK de la fluvastatine et celecoxib J Ciccolini J. Ciccolini J. Ciccolini J. Ciccolini (resp. étude biologique) A. Iliadis A. Iliadis C SolasChesneau Date de fin 2013 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Plateforme Protéomique et Innovation Technologique (PIT2, Labellisation IBISA/Référent Shimadzu) Localisation : Faculté de Pharmacie Responsable : LAFITTE Daniel Téléphone : 04 91835680 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2012-2013 Enseignants - Chercheurs : 0 Chercheurs : 0 Praticiens hospitaliers : 0 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 2.5 Personnel Administratif et Technique Universitaire : 0 Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : 1 Post-doc : 1 Etudiants en Thèse : 2 Etudiants en Master : 4 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom Prénom Fonction HDR Téléphone AIT BELKACEM Rima DOCTORANT Non 0491835680 RAUJOL Julie Doctorante Non 0491835680 LAFITTE Daniel IGR AMU Oui 0491835680 SElAMI Lyna POST DOCTOTANT Non 0491835680 SCHEMBRI Thérèse IGE AMU Non 0491835532 VILLARD Claude IR CNRS Non 0491835680 e-mail [email protected] [email protected] [email protected] Therese.schembri@ univ-amu.fr Claude.villard@uni v-amu.fr Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 3 / THEMES DE RECHERCHE Activité recherche : -Pharmacoprotéomique et thérapies ciblées Imagerie par spectrométrie de masse des tumeurs solides Mécanisme de fragmentation des biomolécules application a la caractérisation des biomarqueurs et des médicaments in situ. (Absorption distribution élimination pharmacocinétique) design d’un nouvel imageur MALDI (en collaboration avec Shimadzu) Activité plateforme : - Analyse protéomique campus Timone (neurosciences, cardiovasculaire, maladies rares, inflammation, cancer) - Imagerie MALDI (cancer, cardiovasculaire, inflammation) - Analyse petites molécules 4 / PUBLICATIONS 2012-2013 1: Ait-Belkacem R, Berenguer C, Villard C, Ouafik L, Figarella-Branger D, Chinot O, Lafitte D. MALDI imaging and in-source decay for top-down characterization of glioblastoma. Proteomics. 2013 Dec 23. 2: Salmi M, Bruneau N, Cillario J, Lozovaya N, Massacrier A, Buhler E, Cloarec R, Tsintsadze T, Watrin F, Tsintsadze V, Zimmer C, Villard C, Lafitte D, Cardoso C, Bao L, Lesca G, Rudolf G, Muscatelli F, Pauly V, Khalilov I, Durbec P, Ben-Ari Y, Burnashev N, Represa A, Szepetowski P. Tubacin prevents neuronal migration defects and epileptic activity caused by rat Srpx2 silencing in utero. Brain. 2013 Aug;136(Pt 8):2457-73. 3 Stalin J, Harhouri K, Hubert L, Subrini C, Lafitte D, Lissitzky JC, Elganfoud N, Robert S, Foucault-Bertaud A, Kaspi E, Sabatier F, Aurrand-Lions M, Bardin N, Holmgren L, Dignat-George F, Blot-Chabaud M. Soluble Melanoma Cell Adhesion Molecule (sMCAM/sCD146) Promotes Angiogenic Effects on Endothelial Progenitor Cells through Angiomotin. J Biol Chem. 2013 Mar 29;288(13):8991-9000. 2: Ait-Belkacem R, Calligaris D, Sellami L, Villard C, Granjeaud S, Schembri T, Berenguer C, Ouafik L, Figarella-Branger D, Chinot O, Lafitte D. Tubulin isoforms identified in the brain by MALDI in-source decay. J Proteomics. 2013 Feb 21;79:172-9. 3: Ait-Belkacem R, Sellami L, Villard C, DePauw E, Calligaris D, Lafitte D. Mass spectrometry imaging is moving toward drug protein co-localization. Trends Biotechnol. 2012 Sep;30(9):466-74. 4: Sellami L, Belgacem O, Villard C, Openshaw ME, Barbier P, Lafitte D. In-source decay and pseudo tandem mass spectrometry fragmentation processes of entire high mass proteins on a hybrid vacuum matrix-assisted laser desorption ionization-quadrupole ion-trap time-of-flight mass spectrometer. Anal Chem. 2012 Jun 19;84(12):5180-5. 5: Calligaris D, Manatschal C, Marcellin M, Villard C, Monsarrat B, Burlet-Schiltz O, Steinmetz MO, Braguer D, Lafitte D, Verdier-Pinard P. Tyrosine-dependent capture of CAP-Gly domain-containing proteins in complex mixture by EB1 C-terminal peptidic probes. J Proteomics. 2012 Jun 27;75(12):3605-16. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2012-2013 Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant Date Devenir du Doctorant Titre de la thèse Inscription Soutenance AIT BELKACEM Rima Imagerie MALDI des gliomes 2011 2014 SELLANI Lyna Carbonylation des protéines 2009 2013 Raujol Julie Imagerie MALDI petites molécules d’intérêt pharmacologique 2014 Post doc PIT2 6 / Liste des contrats 2012-2013 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique Intitulé D LAFITTE IAPP euroMALDI Organisme Date de de financement début (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) FP7 2012 D LAFITTE Nanomaldi mnt era net FP7 2011 Date de fin 2016 2015 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 INSERM U1068 CNRS UMR 7258 Institut Paoli-Calmettes Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille Pr. Jean-Paul Borg Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE au 1er Janvier 2013 Intitulé de l’Unité : Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille Université Aix-Marseille, INSERM U1068, CNRS U7258, Institut Paoli-Calmettes Localisation : Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (sites Institut Paoli-Calmettes, Faculté de Pharmacie et Luminy) http://crcm.marseille.inserm.fr/ Responsable : Jean-Paul Borg Intitulé de l’Equipe : Polarité cellulaire, signalisation et Cancer ……… Localisation : Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (site Institut Paoli-Calmettes et Faculté de Pharmacie) Responsable : Jean-Paul Borg Téléphone : 04 86 97 72 01 Adresse électronique : [email protected] [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : Chercheurs : 1 PU-PH pharm, 1 AHU pharm, 1 PUPH med 2 CR1 Inserm, 1 CR1 CNRS Praticiens hospitaliers : 1 PH med Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 1 IR Inserm, Personnel Administratif et Technique Universitaire : Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : Post-doc : 1 tech IPC Etudiants en Thèse : 3 Etudiants en Master : 3 2 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom Prénom Fonction HDR Téléphone e-mail 04 86 97 72 51 [email protected] 04 86 97 72 54 [email protected] 04 91 22 33 11 [email protected] PH (Med) 04 91 22 36 95 [email protected] Eric CR1 INSERM 04 86 97 72 57 [email protected] SANTONI Marie-Josée CR1 CNRS 04 86 97 72 57 [email protected] SEBBAGH Michael CR1 INSERM 04 86 97 72 57 [email protected] MARCHETTO Sylvie IR2 INSERM 04 86 97 72 53 [email protected] DARBON Floriane M2R, Interne PH 04 91 22 33 07 [email protected] PUVIRAJESINGHE Tania 04 86 97 72 55 DAULAT Avais 04 86 97 72 55 [email protected] [email protected] MARTINEZ Sébastien 04 86 97 72 55 [email protected] TRAORE Wilfried 04 86 97 72 55 [email protected] LOPEZ ALMEIDA MAURIN TOIRON Leonor Pauline Yves Post-doc Ligue Contre le Cancer Fondation de France Thèse RégionInserm Thèse MRT/LNCC Master 2R Thèse MRT Tech IPC 04 86 97 72 54 04 86 97 72 54 04 86 97 72 53 [email protected] [email protected] [email protected] BORG Jean-Paul PU-PH LHOUMEAU Anne-Catherine AHU (Pharm) GONCALVES Anthony PU-PH (Med) PREBET Thomas BAILLY oui oui oui 3 / THEMES DE RECHERCHE Le phénotype tumoral s’accompagne fréquemment d’altérations de l’architecture des tissus épithéliaux touchés, et donc de leur polarité cellulaire, d’une augmentation de la migration et de résistance à l’apoptose des cellules tumorales à l’origine de la formation de métastases. Nous étudions des acteurs de la polarité cellulaire qui ont été identifiés dans l’équipe sur le plan moléculaire et fonctionnel afin d’élucider leur rôle dans la tumorigenèse. La connaissance des réseaux signalétiques associés à ces protéines devrait nous permettre d’offrir un nouvel éclairage sur les processus de transformation cellulaire et leur mode de régulation. La polarité cellulaire est un processus fondamental, initié pendant le développement embryonnaire et maintenu tout le long de la vie adulte. La cellule épithéliale est assujettie à deux types de polarité : polarité apico-basale (ABP), nécessaire à la formation des jonctions adhérentes et serrées, et polarité planaire (PCP), nécessaire à l’organisation de structures apicales, pour former un tissu fonctionnel. Plusieurs études, dont les nôtres, ont démontré que les réseaux moléculaires impliqués dans ABP et PCP sont conservés pendant l’évolution, et participent également à la migration et la division des cellules. Bien que les altérations de l’ABP furent historiquement les premières révélées dans le processus cancéreux, celles de la PCP sont maintenant reconnues comme également importantes. Les acteurs de l'ABP, tels que les suppresseurs de tumeur E-cadhérine et LKB1, contribuent sans conteste à la croissance tumorale et à la dissémination métastatique. Plus récemment, la responsabilité d’acteurs de la PCP (Scribble, Vangl2, PTK7) a été également documentée, en particulier dans des cancers d’origine épithéliale mais également hématopoïétique. Notre connaissance sur les mécanismes d’action de ces protéines de la polarité reste cependant encore à définir ainsi que le retentissement que leur dérégulation provoque sur les voies de signalisation oncogéniques. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Le laboratoire fut lancé il y a une dizaine d’années par la découverte d’Erbin, une protéine basolatérale contenant un domaine PDZ nécessaire à son association avec le récepteur à activité tyrosine kinase ErbB2. Depuis, nous avons étendu notre intérêt à d’autres membres de cette famille, - Scribble and Lano -, et contribué à leur caractérisation dans les cellules épithéliales normales et cancéreuses. Par exemple, nous avons été les premiers à purifier le complexe PIX-GIT composé de protéines GAP et GEF associé à Scribble et à démontrer sa fonction dans la migration cellulaire. Nous poursuivons actuellement nos recherches sur Erbin et Scribble sur le plan physiologique et physiopathologique à l’aide de modèles d’étude in vitro, en particulier des techniques de protéomique et des essais fonctionnels, et des modèles animaux. Nous nous sommes récemment intéressés au suppresseur de tumeur LKB1 et aux récepteurs de la polarité PTK7 et Vangl2, tous deux génétiquement liés à Scribble. Ces récepteurs sont connus pour participer à la PCP et sont surexprimés dans certains cancers. Leur mécanisme d’action étant encore inconnu, nos travaux explorent leur rôle dans la signalisation cellulaire et la tumorigenicité. Depuis ses débuts, l’équipe a eu un grand intérêt pour la découverte de réseaux moléculaires associés aux protéines à domaines PDZ, spécialement lorsque ceux-ci sont impliqués dans le développement tumoral et la dissémination métastatique. En collaboration avec Jérôme Reboul, nous avons récemment cloné l’ensemble des séquences humaines et de C. elegans codants pour des domaines PDZ. Ces ressources sont maintenant facilement utilisables pour des programmes de recherche d’interaction PDZ par double hybride chez la levure ou autre procédé, et aident nos collaborateurs à entrer de plein pied dans le monde des ‘PDZomes’! Pour finir, nos recherches ne pourraient se faire sans notre étroite collaboration avec les départements cliniques et biologiques de l’Institut Paoli-Calmettes, ainsi que l’aide inestimable de notre réseau riche et stimulant de collaborateurs nationaux et internationaux. 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 - Lhoumeau A.-C., Prébet T., S. Martinez, and Borg J.-P. PTK7 tyrosine kinase receptor family. Invited review in "The Receptor Tyrosine Kinase Handbook", Springer Scientific Ed. (Editors: D. Wheeler and J. Yarden), in press. - Even-Desrumeaux K., Nevoltris D., Lavaut MN, Alim K., Borg J.-P., Audebert S., Kerfelec B., Baty D. and Chames P. Masked selection: a straightforward and flexible approach for the selection of binders against specific epitopes and differentially expressed proteins by phage display. (2014) Mol Cell Proteomics, 13:653-65. - Bontems F., Fish R.J., Borlat I., Lembo F., Chocu S., Chalmel F., Borg J.-P., Pineau C., Neerman-Arbez M., Bairoch A., and Lydie Lane. C2orf62 and TTC17 are involved in actin organization and ciliogenesis in zebrafish and human. (2014) PLoS One, 9:e86476. - Rachmin I., Tshori S., Smith Y., Gilon D., Marchetto S., Kay G., Borg J.-P., and Razin E. Erbin is regulated by MITF in the normal heart and in cardiac hypertrophy in mice. PNAS, in press. - Bonacci T., Audebert S., Camoin L., Baudelet E., Bidaut G., Garcia M., Borg J.-P., Iovanna J.L., and Soubeyran P. Chemotherapy induced changes of ubiquitin and ubiquitin-likes post-translational modifications in pancreatic cancer cells, Journal of Proteome Research , in press. - Mojallal M., Zheng Y., Hultin S., Audebert S., Johnson P., Lenander C., Fritz N., Mieth C., Corcoran M., Hallström M., Hartman J., Mazure N., Weide T., Grander D., Borg J.-P., Uhlén P., and L. Holmgren. Identification of a hypoxic stress pathway that disrupts apical-basal polarity and promotes tumor invasion. Nature Communication, in revision. - Luchino J., Hocine M., Amoureux M.-C., Bernet A., Treilleux I., Lécine P., Borg J.-P., Mehlen P., Chauvet S., and Mann F. PlexinD1 dependence receptor induces apoptosis of cancer cells through the NR4A1-mediated mitochondrial pathway. (2013) Cancer Cell, 24: 673-85. - Tao Y., Shen Y.J., Shen C., Marchetto M., Bates R., Lee D., Xiong W.-C., Borg J.-P., and Mei L. Erbin interacts with TARP -2 for surface expression of AMPA receptors in cortical interneurons. (2013) Nature Neuroscience, 16(3):290-9. - Michaelis U.R, Chavakis E., Kruse C., Jungblut B., Kaluza D., Wandzioch K., Heide H., Santoni M.-J., Potente M., Eble J., Borg J.-P., and Brandes R.P. The polarity protein Scrib is essential for directed endothelial cell migration. (2013) Circulation Research, 112(6):924-34. - Belotti E., Polanowska J., Daulat A.M., Lembo F., Audebert S., Thomé V., Lissitzky J.-C., Lembo F., Blibek K., Omi S., Lenfant N., Gangar A., Montcouquiol M., Santoni M.-J., Sebbagh M., Aurrand-Lions M., Angers S., Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Kodjabachian L., Reboul J., and Borg J.-P. The human PDZome: a gateway to PDZ mediated functions. (2013) Mol Cell Proteomics, 12: 2587-603. - Ezan J., Lasvaux L., Novakovic A., May-Simera H. , Belotti E., Lhoumeau A.-C., Beer-Hammer S., Borg J.-P., Le Bivic A., Nurnberg B., Sans N. and Montcouquiol M. A G protein signaling pathway modulates tubulin dynamics and controls autonomous translational planar cell polarity in mammalian epithelial cells. (2013) Nature Cell Biology, 15: 1107-15. BREVETS Titre du Brevet METHODS AND PHARMACEUTICALS COMPOSITIONS FOR TREATING BREAST CANCERS Inventeurs : N° de dépôt : François Bertucci, Jean-Paul Borg, Tania Puvirajesinghe brevet EP13305409.8 Année de dépôt : 2013 Année de publication : Déposant (Université de Méditerranée…) Inserm Transfert Co-déposant (Inserm, AP..) : Aix-Marseille Université, Institut Paoli-Calmettes 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant Date Titre de la thèse LHOUMEAU Rôle du récepteur PTK7 dans Annel’hématopoïèse murine Catherine Implication de Erbin dans le TRAORE développement de la glande Wilfried mammaire murine MARTINEZ Rôle du récepteur PTK7 dans la Sébastien tumorigenèse MAURIN Pauline Complexe LKB1 : composition et fonction Inscription Soutenance 01/08/2008 11/01/2013 01/09/2010 Prévue en juin 2014 01/09/2011 01/09/2013 Devenir du Doctorant AHU AMU-IPC Prévue en 2014-2015 Prévue en 2016 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 6 / LISTE DES CONTRATS 2013-2014 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique J-P Borg P. Viens Intitulé Etude du mode d’action du récepteur tyrosine kinase PTK7 Site de Recherche Intégrée sur le Cancer PACA-Ouest Organisme de financement (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) Date de début Date de fin ARC (décliné) 2013 2014 INCA 2012 2016 E. Vivier MiMabs ANR (Investissements d’Avenir) 2012 2020 JP Borg Label Ligue « Polarité cellulaire et Cancer » Ligue National Contre le Cancer 2013 2015 M. Sebbagh LKB1 et ciliogenèse ARC Fondation de France 2012 2013 2012 2012 2013 2016 2013 2014 2013 2014 Funding InsermTransfert 2013 2015 ITMO Cancer AO Biologie des Systèmes 2012 2015 A. Gonçalvès Proteo-Targ JP Borg JP Borg T. Prébet INCA – projet Libre Study of PTK7, a tyrosine kinase receptor, in acute myeloid leukemia Generation of a conditional Canceropôle PACA PTK7 deficient mouse model Association Laurette Role of PTK7 in leukemia Fugain Proof-of-Concept of Project “Therapeutic potential of targeting the tyrosine kinase receptor PTK7” Anaïs Baudot « HSP27 functions in castration-resistant prostate cancer : a system biology approach ». JP Borg Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE au 1er Janvier 2013 Intitulé de l’Unité : Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille Université Aix-Marseille, INSERM U1068, CNRS U7258, Institut Paoli-Calmettes Localisation : Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (sites Institut Paoli-Calmettes, Faculté de Pharmacie et Luminy) http://crcm.marseille.inserm.fr/ Responsable : Jean-Paul Borg Intitulé de l’Equipe : Biologie Structurale et Chimie-Biologie Intégrée Localisation : Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (site Institut Paoli-Calmettes et Faculté de Pharmacie) Responsable : Yves Collette/Xavier Morelli Téléphone : 04 86 97 73 31 Adresse électronique : [email protected] [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : 1 Chercheurs : 6 Praticiens hospitaliers : - Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 2 Personnel Administratif et Technique Universitaire : - Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : Post-doc : 1 Etudiants en Thèse : 3 1 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom COLLETTE MORELLI Prénom YVES XAVIER Fonction Chef de Groupe Chef de Groupe HDR Oui Oui Téléphone 0486977331 0486977331 e-mail [email protected] [email protected] BETZI BRUNEL BRECHOT COMBES ROCHE STEPHANE JEAN-MICHEL VERONIQUE SEBASTIEN PHILIPPE Chercheur Chercheur Chercheur MCU Chercheur Non Oui Oui Non Oui 0486977333 0689271645 0486977335 0486977335 [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] BASSE DERVIAUX FAURIAT LUGARI MARIE-JEANNE CARINE CYRIL ADRIEN ITA CNRS CDD IE CDD IE Postdoc Non Non Non Non 0486977335 0486977334 [email protected] [email protected] 0486977334 [email protected] MILHAS ZHANG DRIVET SABINE XU ELSA PhD Student PhD Student PhD Student Non Non Non 0486977333 0486977333 0486977333 [email protected] [email protected] [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE The drug discovery process is inherently inefficient, especially in oncology. The challenge of matching the vastness and complexity of the chemical world to a physiological effect in daily clinical study is unfortunately illustrated by limitations such as harmful side effects and drug resistance that challenge the most powerful available chemotherapeutics. It is therefore an urgent need to identify new therapeutic targets and develop approaches to propose and characterize a new generation of anticancer drugs. Most drug discovery efforts by pharmaceutical companies concerning the development and / or expanding of their pre-clinical and clinical pipeline primarily target G proteincoupled receptors, nuclear receptors, ion channels and active sites of enzymes (i.e kinases). Although this strategy is perfectly understandable for historical reasons and risk management, inhibitors of protein-protein interactions represent an alternative and powerful reservoir, almost unfilled in cancerology, in which we can tap new sources to meet this challenge in the 21st century. We propose to develop at iSCB a fundamental research to identify, validate, understand and target the protein interfaces involved in signaling and epigenetics processes, especially in oncology. The range of applicability of this fundamental research will cover the identification, optimization and validation of novel targets and compounds with high therapeutic potentials. Developments in bioinformatics, chemoinformatics and molecular modeling will provide dedicated virtual libraries for protein-protein interactions and predict parameters of "druggability" for identification (in silico) of original new targets in oncology. Developments in structural biochemistry and Drug Design will aim to characterize the structural interfaces and develop innovative methodologies to accelerate the discovery of bioactive compounds targeting protein-protein interfaces involved in signaling in cancer. Developments in organic chemistry targeting asymmetric synthesis and/or heterocyclic will first characterize the chemical space of class-specific protein-protein complexes and provide new libraries dedicated to these interfaces, but also to optimize for structure-activity relationship (SAR) compounds with high therapeutic potential. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Developments in chemistry and biology have as main objectives the in vitro study and manipulation of biological systems, the identification of therapeutic targets (chemical proteomics), and the elucidation of the mechanisms of action of drugs, with the prospect of optimizing therapeutic strategies. Applicability Domain / Keywords @ iSCB: Signaling & Cancer, epigenetics Methodologies : Chemoinformatics & Bioinformatics Molecular Modeling & Drug Design Organic Chemistry & Chemical Biology Structural Biology & Biophysics Prioritary Targets: Kinases & Interacting Partners, Histone Deacetylase (HDac) & Histone Methyl Transferase 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES 2014 1- Loosveld, M., Castellano, R., Gon, S., Goubard, A., Crouzet, T., Pouyet, L., Prebet, T., Vey, N., Nadel, B.*, Collette, Y.*, and Payet-Bornet, D.* Therapeutic targeting of c-Myc in T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia (T-ALL) Oncotarget. - In press 2- De Bellis F, Carafa V, Conte M, Rotili D, Petraglia F, Matarese F, Francoijs KJ, Ablain J, Valente S, Castellano R, Goubard A, Collette Y, Mandoli A, Martens JH, de The H, Nebbioso A, Mai A, Stunnenberg HG, Altucci L. Context-selective death of acute myeloid leukemia cells triggered by the novel hybrid retinoid-HDAC inhibitor MC2392. Cancer Research – In press 3- Khelifi, N., Ali, O.A., Gross, V., Roche, P., Valette, O., Ollivier, B., Dolla, A. and Hirschler-Réa, A. (2013) First evidence of anaerobic oxidation of long-chain n-alkanes by the sulfate-reducing archaeon, Archaeoglobus fulgidus: Involvement of an alkylsuccinate synthase. ISMEJ, in press. 4- Contesto-Richefeu C, Tarbouriech N, Brazzolotto X, Betzi S, Morelli X, Burmeister WP, Iseni F. Crystal structure of the vaccinia virus DNA polymerase holoenzyme subunit d4 in complex with the a20 Nterminal domain. PLoS Pathog. 2014 Mar 6;10(3):e1003978. doi: 10.1371/journal.ppat.1003978. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 2013 1- Hamon, V., Brunel, JM., Combes, S., Basse, MJ., Roche, P., and Morelli, X. 2P2ICHEM: Focused Chemical Libraries Dedicated to Orthosteric Modulation of Protein-Protein Interactions MedChemComm. 2013, 4, 797-809 DOI: 10.1039/c3md00018d. 2- Ivarsson, Y.*, Wawrzyniak, AM.*, Kashyap, R., Polanowska, J., Betzi, S., Lembo, F., Vermeiren, E., Chiheb, D., Morelli, X., Borg, JP., Reboul, J., and Zimmermann, P., Prevalence, Specificity and Determinants of Phosphoinositides-interacting PDZ Domains from a Cellbased screen and in Vitro Binding experiments PLoS ONE, 2013;8(2):e54581. doi: 10.1371/journal.pone.0054581. 3- Basse, MJ., Betzi, S., Bourgeas, R., Bouzidi, S., Chetrit, B., Hamon, V., Morelli, X., Roche, P. 2P2IDB: A Structural Database Dedicated to Orthosteric Modulation of Protein-Protein Interactions Nucleic Acid Research. 2013 Jan;41(Database issue):D824-7. doi: 10.1093/nar/gks1002. 4- Brunel, J. M.; Lieutaud, A.; Lome, V.; Pagès, J. M.; Bolla, J. M. Polyamino geranic derivatives as new chemosensitizers to combat antibiotic resistant Gram-negative bacteria Bioorg. Med. Chem. 2013, 21, 1174-1179. 5- Poggi, M.; Kara, I.; Brunel, J. M.; Landrier, J. F.; Govers, R.; Bonardo, B.; Fluhrer, R.; Haass, C.; Alessi, M. C.; Peiretti, F. Palmitoylation of TNF alpha is involved in the regulation of TNF receptor 1 signalling Biochim. Biophys. Acta 2013, 1833, 602-612. 6- Coulibaly, O.; Alhanout, K.; L'ollivier, C.; Brunel, J. M.; Thera, M. A.; Djimdé, A. A.; Doumbo, O. K.; Piarroux, R.; Ranque, S. In vitro activity of aminosterols against dermatophytes Med Mycol. 2013, 51, 309-312. 7- Hamon V., Bourgeas, R., Theret, I., Brunel, JM., Combes, S., Basse MJ., Ducrot, P., Morelli, X., & Roche, P. 2P2IHUNTER: A Tool for Filtering Orthosteric Protein-Protein Interaction Modulators via a Dedicated Support Vector Machine 8- J R Soc Interface. 2013 Nov 6;11(90):20130860. doi: 10.1098/rsif.2013.0860. Print 2014. Salvador MA, Wicinski J, Cabaud O, Toiron Y, Finetti P, Josselin E, Lelièvre H, Kraus-Berthier L, Depil S, Bertucci F, Collette Y, Birnbaum D, Charafe-Jauffret E, Ginestier C. The histone deacetylase inhibitor abexinostat induces cancer stem cells differentiation in breast cancer with low Xist expression Clin Cancer Res. 2013 Dec 1;19(23):6520-31. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-13-0877. 9- Malleter M, Tauzin S, Bessede A, Castellano R, Goubard A, Godey F, Levêque J, Jézéquel P, Campion L, Campone M, Ducret T, MacGrogan G, Debure L, Collette Y, Vacher P, Legembre P. CD95L cell surface cleavage triggers a prometastatic signaling pathway in triple-negative breast cancer Cancer Res. 2013 Nov 15;73(22):6711-21. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-13-1794 10- Chaubet G, Coursindel T, Morelli X, Betzi S, Roche P, Guari Y, Lebrun A, Toupet L, Collette Y, Parrot I, Martinez J Stereoselective synthesis of original spirolactams displaying promising folded structures Org Biomol Chem. 2013 Jul 28;11(28):4719-26. doi: 10.1039/c3ob40643a Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 11- Breuer, S., Espinola, S., Morelli X., Torbett, B.E, Arold, ST., Engels, IH. A biochemical/biophysical assay dyad for the HTS-compatible triaging of inhibitors of the HIV Nef/Hck SH3 Interaction Current Chemical Genomics and Translational Medicine, 2013, 7, 16-20 12- Hamon, V., Morelli, X. Druggability of protein–protein interactions In: Understanding and Exploiting Protein–Protein Interactions as Drug Targets. Unitec House, 2 Albert Place, London N3 1QB, UK (Future Science Ltd) 2013. Pages 18-31. eBook ISBN: 978-1909453-46-3 13- Wang, Y., Chu, X., Longhi, S., Roche, P., Han, W., Wang, E. and Wang, J. (2013) Multiscaled exploration of coupled folding and binding of an intrinsically disordered molecular recognition element in measles virus nucleoprotein. Proc Natl Acad Sci U S A, 110, E3743-3752. 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Date Nom – Prénom du Doctorant Titre de la thèse Inscription Soutenance MANEVILLE En cours STEPHANIE 09/2009 Soutenue ZHANG - XU En cours 09/2012 En cours MILHAS SABINE En cours 09/2012 En cours RIVET - ELSA En cours 09/2013 En cours Devenir du Doctorant Recherche Travail Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 6 / LISTE DES CONTRATS 2013-2014 Responsable Scientifique COLLETTE / MORELLI COLLETTE/ MORELLI COLLETTE MORELLI MORELLI MORELLI ROCHE BRUNEL BRUNEL COLLETTE / MORELLI Intitulé Organisme de financement (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) Profilage chémoprotéomique et ciblage INCa – PLBio Date de début Date de fin 09/2012 09/2016 VALIRX (Privé) 09/2012 03/2014 Profilage de cibles d'épidrogues par chimie protéomique comme paradigme d'optimisation de thérapie ciblée Analyse des Mécanismes d’Actions d’Hsp27 ARC 01/2012 12/2013 INCa – PAIR Prostate 09/2010 09/2013 Activités de synthèse et de modification des ARNs du SARS-coronavirus Recherche d’Antiviraux contre des Virus Emergents en PACA ANR Blanche 09/2012 09/2015 REGION PACA 09/2012 09/2014 Inhibition des Pompes d’Efflux Bactériennes ANR Blanc 09/2011 09/2014 SATT PACA 02/2013 02/2016 VIRBAC 02/2013 02/2015 INCa – PLBio 09/2012 09/2016 des interactions poly-prolines oncogènes Biophysical &. Chemoproteomic Evaluation ofVa1201 'Nouveaux dérivés polyaminogéraniques comme agent de restauration de l’efficacité des antibiotiques sur les bactéries Gram négative multirésistantes" Nouveaux dérivés aminostéroidiens à usage vétérinaire Profilage chémoprotéomique et ciblage des interactions poly-prolines oncogènes Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 UMR 7273 CNRS Institut de Chimie Radicalaire ICR Dr. Didier Gigmes Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE 2013 Intitulé de l’Unité : Institut de Chimie Radicalaire ICR UMR7273 Localisation : Faculté des Sciences Saint-Jérôme/Faculté de Pharmacie Responsable : Dr Didier GIGMES Intitulé de l’Equipe : Equipe Pharmaco-Chimie Radicalaire (PCR) Localisation : Faculté de Pharmacie Responsable : Pr Patrice VANELLE Téléphone : 04 91 83 55 80 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2012-2013 Enseignants - Chercheurs : 11 + 1 ATER +1 AHU Chercheurs : 4 IGR Praticiens hospitaliers : 0 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 0 Personnel Administratif et Technique Universitaire : 4 Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : Post-doc : 0 Etudiants en Thèse : 4 Etudiants en Master : 2 0 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom Vanelle Prénom Patrice Fonction PU-PH Rathelot Pascal Crozet HDR X Téléphone 04-91-83-55-80 [email protected] PU-PH X 04-91-83-56-14 [email protected] Maxime D. PU X 04-91-13-68-27 [email protected] Terme Thierry PU X 04-91-83-55-28 [email protected] Broggi Julie MCF 04-91-83-56-96 [email protected] Castera-Ducros Caroline MCF 04-91-83-55-95 [email protected] Curti Christophe MCU-PH 04-86-13-68-26 [email protected] Gellis Armand MCF 04-91-83-55-83 [email protected] Montana Marc MCU-PH 04-91-83-56-05 [email protected] Primas Nicolas MCF 04-91-83-56-57 [email protected] Spitz Cédric MCF 04-91-83-56-34 [email protected] Roche Manon AHU 04-91-83-55-25 [email protected] Giuglio-Tonolo Alain Gamal IGR 04-91-73-68.25 [email protected] Khoumeri Omar IGR 04-91-83-55-27 [email protected] Kabri Youssef IGR 04-91-83-55-27 [email protected] Remusat Vincent IGR 04-91-83-56-34 [email protected] Redon Sébastien ATER 04-91-83-56-34 sé[email protected] Arecchi Françoise ADT 04-91-83-55-27 [email protected] Lanzada Gilles ADT 04-91-83-55-27 [email protected] Maillard Martine ASI 04-91-83-55-38 [email protected] Piednoel Mélanie ADT 04-91-83-55-18 [email protected] X e-mail 3 / THEMES DE RECHERCHE La problématique fondamentale des recherches développées par l’équipe de PharmacoChimie Radicalaire de l’Institut de Chimie Radicalaire (ICR) UMR CNRS 7273, de la Faculté de Pharmacie de Marseille est centrée sur l’obtention de nouvelles molécules à potentialités pharmacologiques via le développement de nouveaux outils synthétiques utilisant les réactions par transfert monoélectronique. Le développement de ces nouveaux outils pharmacochimiques radicalaires est articulé autour de trois méthodologies principales : les réactions SRN1 et apparentées, la stratégie TDAE, les réactions avec l’acétate de manganèse. Celles-ci sont associées à différentes réactions (cyclisation, couplage métallo-catalysé…) assistées ou non par la technologie micro-ondes et en privilégiant des protocoles respectueux de l’environnement. A l’heure actuelle, ces 3 méthodologies définissant de nouveaux outils synthétiques pour l’obtention de nouvelles molécules à potentialités anti-infectieuses sont déclinées selon 5 grands axes. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 I. Projet « Quinazopôle » (quinazolines à visée antiplasmodiale) II. Projet « imidazole et thiazole» (antiparasitaire : Trichomonas…) III. Projet « Quinone » (anti-Alzheimer et maladies à prions) IV. Projet « Benzodioxole et apparentés » (antiviral) V. Projet « Furane» (antiparasitaire : Leishmania…) Ces travaux de recherche s’appuient d’une part sur l’utilisation d’un plateau technique « micro-ondes » original et performant dédié à la « Chimie Verte » (plateforme comprenant 4 réacteurs micro-ondes dont 1 avec passeur et permettant de réaliser des réactions, en parallèle, avec contrôle de la température et de la pression, dans des réacteurs de 0,5-2 mL jusqu’à 1 L) et d’autre part sur l’adhésion de la chimiothèque locale de l’équipe PCR (plus de 1500 composés) à la chimiothèque nationale permettant de favoriser de nouvelles collaborations avec des biologistes universitaires et industriels et mettre en évidence de nouvelles propriétés biologiques par l’intermédiaire de criblages. 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES Synthesis and promising in vitro antiproliferative activity of sulfones of a 5-nitrothiazole series. Cohen A., Crozet M. D., Rathelot P., Azas N., Vanelle P. Molecules 18 (2013) 97-113 Influence of Plasmonic Silver Nanoparticles on Fluorescence Quenching of 1,4-dihydroxy-3methylanthracene-9,10-dione Umadevi M., Kavitha S. R., Vanelle P., Terme T. Plasmonics 8 (2013) 859-867. Manganese(III) acetate-mediated oxidative cyclization of α-methylstyrene and trans-stilbene with β-ketosulfones. Bouhlel A., Curti C., Tabele C., Vanelle P. Molecules 18 (2013) 42934307. Efficacy and toxicity of factor Xa inhibitors Bondarenko M., Curti C., Montana M., Rathelot P., Vanelle P. Journal of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences 16 (2013) 74-88. Sonogashira cross-coupling reaction in 4-chloro-2-trichloromethylquinazoline series is possible despite a side dimerization reaction Kieffer C., Verhaeghe P., Primas N., Castera-Ducros C., Gellis A., Rosas R., Rault S., Rathelot P., Vanelle P. Tetrahedron 69 (2013) 2987-2995. SERS investigations of 2,3-dibromo-1,4-naphthoquinone on silver nanoparticles Anuratha M., Jawahar A., Umadevi M., Sathe V. G., Vanelle P., Terme T., Meenakumari V., Milton Franklin Benial A. Spectrochimica Acta, Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy 105 (2013) 218-222. Original TDAE strategy using propargylic chloride: rapid access to 1,4-diarylbut-3-ynol derivatives. Roche M., Terme T., Vanelle P. Molecules 18 (2013) 1540-1548. Synthesis of 4-alkynyl-1,2-dimethyl-5-nitro-1H-imidazole via microwave-assisted Sonogashira cross-coupling reactions Neildé K., Crozet M. D., Terme T., Vanelle P. Synthesis (2013) 1349-1356. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 TDAE strategy for the synthesis of 2,3-diaryl N-tosylaziridines Khoumeri O., Spitz C., Terme T., Vanelle, P. Molecules 18 (2013) 7364-7375. Ground and excited state behavior of 1,4-dimethoxy-3-methyl-anthracene-9,10-dione in silver nanoparticles. Spectral and computational investigations Umadevi M., Kavitha S. R., Vanelle P., Terme T., Khoumeri O. J. Lumin., 142 (2013) 1-7. Amyotrophic lateral sclerosis: update on etiological treatment Ayach L., Curti C., Montana M., Pisano P., Vanelle P. Therapie 68 (2013), 93-106 Diastereoselective synthesis of N-tert-butanesulfinylamines through addition of p-nitrobenzyl chloride to N-tert-butanesulfinimines using TDAE strategy Spitz C., Khoumeri O., Terme T., Vanelle, P. Synlett (2013) 1725-1727. Targeting the human parasite Leishmania donovani: Discovery of a new promising antiinfectious pharmacophore in 3-nitroimidazo[1,2-a]pyridine series Castera-Ducros C., Paloque L., Verhaeghe P., Casanova M., Cantelli C., Hutter S., Tanguy F., Laget M., Remusat, V., Cohen A., Crozet M.D., Rathelot P., Azas N., Vanelle P. Bioorg. Med. Chem. 21 (2013) 7155-7164 New orally effective 3-(2-nitro)phenylpropanamide analgesic derivatives: Synthesis and antinociceptive evaluation Since M., Freret T., Nee G., Terme T., Vanelle P., Boulouard M. Eur. J. Med. Chem. 69 (2013) 728-734 Synthesis and antiplasmodial receptor independent 4D-QSAR study in 4-aryl-2trichloromethylquinazoline series Reboul J.-P., Verhaeghe P., Siri D., Gaudel-Siri A., Castera-Ducros C., Dumetre A., Hutter S., Azas N., Rathelot P., Vanelle P., Iliadis A. Current Chem. Biol. 7 (2013) 139-150. Organic Electron Donors as Powerful Single Electron Transfer Reducing Agents in Organic Synthesis Broggi J., Terme T., Vanelle P. Angew. Chem. Int. Ed. 53 (2014) 384-413. Synthesis, biological activity and structure-activity relationship of 4,5-dimethoxybenzene derivatives inhibitor of rhinovirus 14 infection. Roche M., Lacroix C., Khoumeri O., Franco D., Neyts J., Terme T., Leyssen P., Vanelle P. Eur. J. Med. Chem. 76 (2014) 445-459. Orientation of 1,4-dimethoxy-3-bromomethylanthracence-9,10-dione on silver nanoparticles: SERS studies. Geetha K., Umadevi M., Sathe G. V., Vanelle P., Terme T., Khoumeri O. J. Mol. Struct. 1059 (2014) 87-93. Synthesis of Novel Highly Functionalized 4-Thiazolidinone Derivatives from 4-Phenyl-3thiosemicarbazones. Benmohammed A., Djafri A., Khoumeri O., Terme T., Vanelle P. Molecules 19 (2014) 30683083. Primas N., Neildé K., Kabri Y., Crozet M.D., Terme T., Vanelle, P. Exploring the synthesis and the reactivity of 4-[4-(chloromethyl)styryl]-1,2-dimethyl-5-nitro-1H-imidazole in TDAE strategy. Synthesis 46 (2014) 348-356. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant Roche Manon Neildé Kévin Date Inscription Pharmacomodulation antivirale par 10/2009 la méthodologie TDAE Nouvelles approches Pharmacochimiques (SRN1, TDAE et 10/2011 couplages métallo-catalysés) dans le domaine des anti-infectieux Pharmacochimie anti-infectieuse série 2trichlorométhylquinazoline Kieffer Charline Tabelé Clémence Meye Biyogo Alex Devenir du Doctorant Titre de la thèse Synthèse d'hétérocycles à visée antiparasitaire par réactions radicalaires médiées par l'acétate de manganèse(III). Synthèse et réactivité radicalaire de dérivés quinoniques à visée antiparasitaire Soutenance 12/2013 AHU AMU 10/2011 10/2012 05/2013 6 / LISTE DES CONTRATS 2013-2014 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique P. Vanelle P. Vanelle P. Vanelle Intitulé Date de début Date de fin Programme « open innovation drug discovery » MTA Eli Lilly (criblage pharmacologique en diabétologie et oncologie) Oct 2012 Sept 2015 Criblage pharmacologique sur la dihydrorotate deshydrogénase plasmodiale PfDHOD Déc 2012 Nov 2014 Déc 2012 Nov 2015 criblage pharmacologique sur kinases plasmodiales Organisme de financement (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) MTA University of Texas Southwestern Medical Center of Dallas (Dr Margaret Philipps) MTA USR CNRS 3151, Station Biologique de Roscoff (Dr Luc Reininger, Dr Stéphane Bach) Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 UM63 CNRS 7278 - IRD 198 INSERM U1095 Virus émergents et pathologies humaines Pr. Didier Raoult Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE A partir du 1er Janvier 2013 Intitulé de l’Unité : URMITE CNRS UMR 7278 – IRD 198 – INSERM U1095 IHU Méditerranée Infection http://www.mediterranee-infection.com/article.php?laref=1 Localisation : Marseille – UFR Médecine et de Pharmacie Responsable : Pr D. Raoult Intitulé de l’Equipe : Responsable d’équipe « Mucoviscidose, microbiote et prise en charge thérapeutique » Localisation : UFR PHARMACIE – URMITE – IHU Méditerranée Infection (10ème étage Aile A & C) Responsable : Pr J-M. Rolain Téléphone : 04 86 13 68 28 Adresse électronique : [email protected] Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 2 / EFFECTIFS A partir du 1er Janvier 2013 Enseignants - Chercheurs : 5 Chercheurs : Praticiens hospitaliers : 4 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : Personnel Administratif et Technique Universitaire : 1 Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : Post-doc : 2 Etudiants en Thèse : 9 Etudiants en Master : 5 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE A partir du 1er Janvier 2013 Nom Rolain Dubus Reynaud Andrieu Roux Prénom Jean-Marc JC Martine Véronique Véronique Fonction PU-PH PU-PH PU-PH MCF MCU-PH HDR oui oui oui Oui oui Téléphone 04 86 13 68 28 04 91 32 43 00 04 91 38 43 06 04 91 83 56 39 04 91 83 55 60 e-mail 3 / THEMES DE RECHERCHE A partir du 1er Janvier 2013 (Résumé de votre projet de recherche AERES) Projet 1 : Evaluation de la sensibilité et de la résistance aux agents anti-infectieux – Mécanismes moléculaires de la résistance aux antibiotiques - Veille épidémiologique •Identification génétique et étude des mécanismes moléculaires de résistance aux antiinfectieux des pathogènes émergents et multirésistants au cours de la mucoviscidose •Etude des transferts latéraux de gènes et de la résistance aux antibiotiques au cours de la mucoviscidose. •Analyse génomique de souches bactériennes épidémiques et/ou multirésistantes par pyroséquençage à haut débit. •Identification et biotypage des souches bactériennes par MALDI-TOF – Typage moléculaire •Surveillance épidémiologique des bactéries multirésistantes – Mise au point de technique moléculaire de détection des gènes de résistance aux antibiotiques Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Projet 2 : Détection et Identification de nouveaux agents responsables d’infections pulmonaires – Caractérisation du microbiote respiratoire des patients atteints de mucoviscidose •Identification moléculaire et taxonomie bactérienne de nouveaux agents pathogènes •Réalisation d’études de métagénomique virale et bactérienne sur les prélèvements pulmonaires de patients atteints de mucoviscidose – Caractérisation du microbiote au cours de la mucoviscidose. •Recherche exhaustive, par prélèvements systématiques essentiellement des expectorations, d’agents infectieux émergents et/ou multirésistants responsables de colonisations et d’infections des voies respiratoires chez les patients atteints de mucoviscidose. •Utilisation de techniques originales d’isolement et de culture, de détection et d’identification moléculaire des agents infectieux au cours des infections pulmonaires. Projet 3 : Nouvelles approches thérapeutiques et développement de nouvelles formes galéniques d’administration des antibiotiques •Développement de nouvelles formes galéniques vectrices de médicaments pour la voie pulmonaire et optimisation des formes existantes (agents anti-infectieux et antiinflammatoires) 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 Précisez les articles avec comité de lecture répertoriés par l’AERES ou dans les bases de données internationales (ISI Web of Knowledge, Pub Med…) en séparant les publications nationales, internationales et les brevets 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. S. Biswas, JM. Rolain. Use of MALDI-TOF mass spectrometry for identification of bacteria that are difficult to culture. J. Microbiol. Methods. 2013, 92(1)14-24. E. Angelakis, M. Million, F. D’Amato, L. Rouli, H. Richet, A. Stein, JM. Rolain, D. Raoult. Q fever and pregnancy: disease, prevention, and strain specificity. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect Dis. 2013. 32(3):361-8. SM. Diene, B. Fall, M. Kempt, F. Fenollar, K. Sow, B. Niang, B. Wade, D. Raoult, JM Rolain. Emergence of OXA-23 carbapenemase encoding gene in multidrug resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates from principal hospital of Dakar, Senegal. Int. J. Infect. Dis. 2013, 17(3):e209-10. M. Kempf, JM Rolain, S. Azza, S. Diene, ML. Joly-Guillou, G. Dubourg, P. Colson, L. Papazian, H. Richet , PE. Fournier, A. Ribeiro, D. Raoult. Investigation of Acinetobacter baumannii:resistance to carbapenems in Marseille hospitals, south of France : a transition from an epidemic to an endemic situation. Acta Pathol. Microbiol. Immunol. Scand. 2013, 121(1):64-71. JM. Rolain, S. M. Diene, M. Kempf, G. Gimenez, C. Robert, D. Raoult. Real time sequencing to decipher the molecular mechanism of resistance of a clinical pan-drug resistant Acinetobacter baumannii, Marseille, France. Antimicrob. Agents Chemother. 2013, 57(1):592-6. SM. Diene, V. Merhej, M. Henry, A. El Filali, V. Roux, C. Robert, S. Azza, F. Gavory, V. Barbe, B. La Scola, D. Raoult, and JM Rolain; The rhizome of the multidrug-resistant Enterobacter aerogenes genome reveals how new “killer bugs” are created because of a sympatric lifestyle. Mol. Biol. Evol.. 2013, 30(2):369-83. JC. Galán, F. González-Candelas, JM. Rolain and R. Cantón. Antibiotics as selectors and accelerators of diversity in the mechanisms of resistance: From the resistome to genetic plasticity in the b-lactamases world. Front. Microbiol. 2013. 4:9. SM. Diene and JM. Rolain. Investigation of antibiotic resistance in the genomic era of multidrugresistant Gram-negative bacilli, especially Enterobacteriaceae, Pseudomonas and Acinetobacter. Expert Review of Anti-infective. 2013. 11(3):277-96. R. Drali, A. Boutellis, D. Raoult Didier, JM. Rolain and P. Brouqui. Distinguishing Body Lice from Head Lice by Multiplex Real-time PCR Analysis of the Phum_PHUM540560 Gene. PLOS One. 2013, 8(2):e58088. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27. 28. M. Touati, S. M Diene, M. Dekhil, A. Djahoudi, A. Racherache, JM. Rolain. Dissemination of class I integron carrying VIM-2 carbapenemase gene in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from intensive care unit of University Hospital of Annaba, Algeria.. Antimicrob. Agents Chemother. 2013, 575(5):2426-7. A.O. Olaitan, M. Berrazeg, O.E. Fagade, O.O. Adelowo, J.A. Alli, JM. Rolain. Emergence of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii producing OXA-23 carbapenemase, Nigeria. Int. J. Infect. Dis. 2013, 4:9. F. Fenollar, J.C. Lagier, JM. Rolain, M. Célard, O. Bouchot, J.C. Eicher, H. Lepidi, D. Raoult. Tropheryma whipplei endocarditis relapses after treatment with trimethoprim/sulfamethoxazole. Int. J. Antimicrob Agents. 2013, 41(6):592-4. JM. Rolain, M. Vayssier-Taussat, W. Saisongkorh, V. Merhej, G. Gimenez, C. Robert, D. Le Rhun, C. Dehio, D. Raoult. Partial disruption of translational and post-translational machinery reshapes growth rates of Bartonella birtlesii. mBIO. 2013, 23;(4):e00115-13. M. Berrazeg, S. M. Diene, M. Drissi, M. Kempf, H. Richet, L. Landraud, JM Rolain. Biotyping of multidrug-resistant Klebsiella pneuponiae clinical isolates from France and Algeria using MALDI-TOF MS. PLOS One. 2013, 8(4):e61428. S. Biswas, J.C. Dubus, M. Reynaud-Gaubert, N. Stremler, J.M. Rolain. Evaluation of colistin susceptibility in multi-drug resitant clinical isolates from cystic fibrosis, France.Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2013, 32(11):1461-4. T. Jiyipong, S. Morand, S. Jittapalapong, D. Raoult, JM. Rolain. Bordetella hinzii in rodents. Southeast Asia. Emerg. Infect. Dis. 2013, 19(3) :502-3. M. Berrazeg, M. Drissi, L. Medjahed, JM Rolain. Hierarchical clustering as a rapid tool for surveillance of emerging antibiotic resistance phenotypes in Klebsiella pneumoniae strains. J. Med. Microbiol. 2013, 62(6):864-74. E. Mesli, M. Berrazeg, M. Drissi, SN. Bekhoucha, JM Rolain. Prevalence of carbapenemase encoding genes including New Delhi Metallo-β-lactamase in Acinetobacter species, Algeria. Int. J. Infect. Dis. 2013, 17(9):e739-43. T. Atieh, G. Audoly, S. Hraiech, H. Lepidi, A. Roch, JM. Rolain, D. Raoult, L. Papazian, F. Bregeon. Evaluation of the diagnostic value of fluorescent in situ hybridization in a rat model of bacterial pneumonia. Microb. Infect. Dis. 2013, 76(4):425-31. P. Sharma, SM. Diene, S. Thibeaut, F. Bittar, V. Roux, C. Gomez, M. Reynaud-Gaubert and JM. Rolain. Phenotypic and genotypic properties of Microbacterium yannicii, a recently described multidrug resistant bacterium isolated from a lung transplanted patient with cystic fibrosis in France. BMC Microbiology Feb. 2013, 13(1):97. S. M. Diene, T. L’homme, S. Bellulo, N. Stremler, JC. Dubus, L. Mely, N. Degand, S. Leroy, JM. Rolain. ISPa46, a novel insertion sequence in OprD porin gene of an imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolate from a Cystic Fibrosis patient in Marseille, France. Int. J. Antimicrob. Agents. 2013, 42(3):268-71. S. Bakour, A. Touati, F. Sahli, AA. Ameur, D. Haouchine, JM. Rolain. Antibiotic resistance determinants of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates in Algeria.Diag. Microbiol. Infect. Dis. 2013, 76(4):529-31. S. Hraiech, A. Roch, H. Lepidi, T. Atieh, G. Audoly, JM Rolain, D. Raoult, JM. Brunel, L. Papazian, F. Brégeon. Impaired virulence and fitness of a colistin-resistant clinical isolated of Acinetobacter baumannii in the rat model of pneumonia. PLOS One, 2013, 57(10):5120-21. S. Edouard, M. Million, H. lepidi, JM. Rolain, PE. Fournier, B. La Scola, D. Grisoli, D. Raoult. Persistence of DNA in cured patient and positive culture in cases with low antibody levels bring into question diagnosis of Q fever endocarditis. 2013, J. Clin. Microbiol. 2013, 51(9):3012-17. AS. Le Floch, N. Cassir, S. Hraiech, C. Guervilly, L. Papazian, JM Rolain. Haemophilus parahaemolyticus Septic Shock after Aspiration Pneumonia, France. Emerg Infect Dis. 2013 Oct;19(10):1694-5. PE. Fournier , M. Drancourt, P. Colson P, JM Rolain, B. La Scola, D. Raoult. Modern clinical microbiology: new challenges and solutions. Nat Rev Microbiol. 2013 Aug;11(8):574-85. JM Rolain. Food and human gut as reservoirs of transferable antibiotic resistance encoding genes. Front Microbiol. 2013, 4:173. P. Seng, C.Abat, JM Rolain, P. Colson, JC. Lagier, F. Gouriet, PE. Fournier , M. Drancourt, B. La Scola, D. Raoult. Identification of rare pathogenic bacteria in a clinical microbiology laboratory: impact Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 29. 30. 31. 32. 33. 34. 35. 36. 37. 38. 39. 40. 41. 42. 43. 44. 45. 46. 47. of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J Clin Microbiol. 2013 Jul;51(7):2182-94. JL. Burns, JM Rolain. Culture-based diagnostic microbiology in cystic fibrosis: Can we simplify the complexity? J Cyst Fibros. 2013, 13(1):1-9. L. Djouhri-Bouktab, JM Rolain, J.M. Brunel. Polyamines metabolism, toxicity and potent therapeutical use. Anti-infective Agents Med. Chem. 2014, 12:95-103. SK. Gupta, BR. Padmanabhan, SM. Diene, R. Lopez-Rojas, M. Kempf, L. Landraud, JM Rolain. ARG-ANNOT (Antibiotic Resistance Gene-ANNOTation), a new bioinformatic tool to discover antibiotic resistance genes in bacterial genomes. Antimicrob Agents Chemother. 2014, 58(1):212-20. T. Kernif, H. Leulmi, C. Socolovschi, JM. Berenger, H. Lepidi, I. Bitam, JM. Rolain, D. Raoult, P. Parola. Acquisition and Excretion of Bartonella quintana by the Cat Flea, Ctenocephalides felis felis. Mol. Ecol. 2014, 23(5):1204-12. Z. Ouchenane, A. Agabou, F. Smati, JM. Rolain , D. Raoult. Staphylococcal cassette chromosome mec characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated at the military hospital of Constantine/Algeria. Pathol Biol (Paris). 2014, 61(6):280-1. P. Sharma, SP. Gupta, JM. Rolain. Whole genome sequencing of bacteria in cystic fibrosis as a model for bacterial genome adaptation and evolution. Expert Rev. Anti. Infect. Ther. 2014. 12(3):34355. S. Muhammed Ameen, JM. Rolain, MN. Le Poullain, V. Roux, D. Raoult, M. Drancourt. Serum concentration of co-trimoxazole during a high-dosage regimen. J Antimicrob Chemother. 2014, 69(3):757-760 M. Berrazeg, S. M. Diene, L. Medjahed, P. Parola, M. drissi, D. Raoult and JM Rolain. New Delhi metallo-ß-lactamase the world : An eReview using Google Maps. 2002. Eurosurveillance, 2014, in press I. Sefraoui, M. Berrazeg, M. Drissi, JM. Rolain. Molecular epidemiology of carbapenenem-resistant pseudomonas aeruginosa clinical strains isolated from western Algeria between 2009 and 2012. Microbial Drug Resistance. 2014, in press R. Rafei, M. Eveillard, M. Hamze, F. Dabboussii, F. Mokadem, H. Mallat, JM. Rolain, ML. JolyGuillou, M. Kempf. First report of blaNDM-1 producing Acinetobacter baumannii isolated in Lebanon civilians wounded during the Syrian war. 2014. Int. J. Infec. Dis. 2014, in press Z. Belbel, H. Chettibi, M. Dekhil, A. Ladjama, S. Nedjai, JM Rolain. Outbreak of an armA Methyltransferase-Producing ST39 Klebsiella pneumoniae Clone in a Pediatric Algerian Hospital. Microb. Drug Resist. 2014, in press A. Labid, D. Gacemi-Kirane, M. Timinouni, K. Amoura and JM Rolain. High prevalence of extended spectrum beta-lactamase (ESBL) producers in fatal cases of pediatric septicemia among the Enterobacteriaceae in the pediatric hospital of Annaba, Algeria. Af. J. Microb. Res. 2014, in press S. Kokcha, F. Bittar, M. Reynaud-Gaubert, L. Mely, C. Gomez, JY. Gaubert, P. Thomas and JM. Rolain. Pandoraea pulmonicola chronic colonization in a cystic fibrosis patient, France New Microb New Infect. 2014, in press S. M. Diene, F. Fenollar, B. Fall, K. Sow, B. Niang, P. Samba Ba, B. Wade, D. Raoult and JM. Rolain. CTX-M-15-producing Morganella morganii from Hôpital Principal de Dakar, Senegal. New Microb New Infect. 2014, in press T. Jiyipong, S. Jittapalapong, S. Morand, JM Rolain. Bartonella species in small mammals and their potential vectors in Asia. Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine 2014, in press R. López-Rojas, SM Diene, M. Enrique Jiménez-Mejías, J. Pachón, and JM Rolain. Acquired resistance to colistin alters the antibiotic resistance profile of Acinetobacter baumannii: a genomic perspective. J. Antimicrob. Chemother. En revue L. Loucif, E. Bendjama, D. Gacemi-Kirane and JM Rolain. Rapid identification of Streptomyces isolates by MALDI-TOF MS. Microb. Research En revue P. Sharma, S. Kumar Gupta, SM Diene, and JM Rolain. Whole-genome sequence of Chryseobacterium oranimense, a new multidrug-resistant bacterium from a cystic fibrosis patient in France. J. Antimicrob. Chemother. En revue F. Brégeon, G. Brioude, F. De Dominicis, T. Atieh, X. Benoit D'journo, C. Flaudrops, JM Rolain, D. Raoult, PA Thomas. MALDI-ToF mass spectrometry for the rapid diagnostic of cancerous lung nodules. PLOS One revision Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 48. S. Bakour, A. Touati, T. Bachiri, F. Sahli, D. Tiouit, M. Naim, M. Azouaou, JM Rolain. Emergence of NDM-1 and 16S rRNA methylase armA producing Acinetobacter baumannii in Algeria. Eur. J. Clin. Microb. Infect. Dis. En revue S. Bakour, SA Alsharapy, A. Touati, JM Rolain. Characterization of Acinetobacter baumannii clinical isolates 1 carrying OXA-23 carbapenemase and 16S rRNA methylase armA in Yemen. Microb. Drug Resist. Révision A. Sassi, L. Loucif, SK Gupta, M. Dekhil, H. Chettibi, JM Rolain. NDM-5 carbapenemase-encoding gene in multidrug-resistant clinical isolates of Escherichia coli, Algeria. Antimicrob. Agents Chemother. En revue C. Al Bayssari, SM Diene, L. Loucif, SK. Gupta, F. Dabboussi, H. Mallat, M. Hamze, and JM Rolain. Emergence of VIM-2 and IMP-15 carbapenemases and inactivation of oprD gene in carbapenemresistant Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from Lebanon. Antimicrob. Agents Chemother. Révision AO Olaitan, SM Diene, M. Kempf, M. Berrazeg, S. Bakour, SKumar Gupta, B. Thongmalayvong, K. Akkhavong, S. Somphavong, P. Paboriboune, K. Chaisiri, C. Komalamisra, OO Adelowo, OE Fagade, OA Banjo, AJ Oke, A. Adler, MV Assous, S. Morand, D. Raoult, and JM Rolain. Worldwide emergence of colistin resistance in Klebsiella pneumoniae from healthy humans and patients in Lao PDR, Thailand, Israel, Nigeria, and France due to inactivation of the PhoP/PhoQ mgrB regulator : an epidemiological and molecular study. J. Antimicrob. Chemother. En revue E. Bendjama, L. Loucif, SM Diene, C. Michelle, D. Gacemi-Kirane, JM Rolain. Non-contiguous finished genome sequence and description of Paucisalibacillus massilioalgeriensis sp. nov. Stand. Genomic Sci. En revue E. Bendjama, L. Loucif, SM Diene, C. Michelle, D. Gacemi-Kirane, JM Rolain. Non-contiguous finished genome sequence and description of Bacillus massilioalgeriensis sp. nov. Stand. Genomic Sci. En revue S. Hraiech, J. Hiblot, J. Lafleur, L. Papazian, JM Rolain, D. Raoult, M. Silby, F. Bregeon, E. Chabriere, M. Elias. Quorum quenching lactonase inhibits Pseudomonas aeruginosa virulence and reduces lethality. PLOS Pathogens En revue C. Abat, G. Desboves, AO Olaitan, H. Chaudet, N. Roattino, PE Fournier, P. Colson, D. Raoult, JM Rolain. Increasing burden of infections due to intrinsic colistin-resistant bacteria linked to increased colistin consumption in hospitals in Marseille, France. J. Antimicrob. Chemother. En revue 49. 50. 51. 52. 53. 54. 55. 56. Brevets 1. D. Raoult, M. Maurin and JM Rolain. Méthode de détermination de l’activité bactériostatique ou bactéricide des agents antibiotiques par PCR quantitative. 12.03.02 – n° Brevet 01.13573 2. J.M. Brunel, JM Rolain, D. Raoult. Composés aminostéroïdiens pour une application topique locale pour la décolonisation cutanéo-muqueuse de Staphylococcus aureus. 2/12/2009 – n° Brevet 09.58575. Brevet licencié par la société Virbac avec un contrat de collaboration de 250 k€ sur 3 ans. 3. J.M. Brunel, J.M. Rolain, D. Raoult. Utilisation de squalamine ou analogue comme agent desinfectant. 12/01/2012. n° Brevet 12.50312. 4. F. Bregeon, D. Raoult, J.M. Rolain, X.B. D’journo, C. Flaudrops. : Méthode de détermination de la nature tumorale ou non tumorale ou du type de tumeur d’un fragment d'organe solide humain ou animal. Brevet déposé le 03/04/2012. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant Tawisa Jiyipong Meryem Berrazeg Poonam Sharma Sami Hraiech Rezak Drali Date Titre de la thèse Inscription Infections à Bartonella en Asie Epidémiologie et mécanisme moléculaires de la résistance aux antibiotiques de Klebsiella pneumoniae, Algérie et France Pathogènes émergents et mucoviscidose Evaluation de stratégies thérapeutiques dans des modèles de pneumopathies infectieuses chez l'animal Etude phénotypique des poux Mise en place d’outils informatiques pour la surveillance en temps réel Cedric Abat des évènements basés sur des données de laboratoires Etude phénotypique et moléculaire Abiola Olaitan des bactéries multirésistantes en Asie Etude des mécanismes moléculaires Charbel Al de la résistance aux antibiotiques Bayssari dans le bassin méditerranéen Caractérisation des souches d’Escherichia coli résistantes aux Asma Sassi antibiotiques isolées au CHU d’Annaba - Algérie Epidémiologie et mécanisme Meriem moléculaires de la résistance aux antibiotiques de Pseudomonas Touati aeruginosa, Algérie Prevalence of ESBL-producers in fatal cases of pediatric septicemia among the Enterobacteriaceae in the Asma Labib pediatric hospital of Annaba, Algeria ETUDE PHENOTYPIQUE ET GENOMIQUE DU PORTAGE Thomgpan DIGESTIF DE BACTERIES Leangapichart MULTI-RESISTANTES CHEZ LES VOYAGEURS Soutenance Devenir du Doctorant 2011 En cours Collaboration avec S. Morand 2011 2013 Cotutelle AVERROES 2010 2013 2010 En cours 2011 En cours 2012 En cours 2012 En cours 2012 En cours 2013 En cours Cotutelle 2011 2013 Cotutelle 2011 En cours Cotutelle 2014 En cours Collaboration avec S. Morand Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 6 / Liste des contrats 2010-2014 JM Rolain Intitulé Organisme de financement (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, associations caritatives, privé…) Date de début Date de fin JM Rolain Responsable de la plateforme robotisation des isolements et cultures bactériennes : 1.5 M€ 2010 Infectiologie (investigateur associé) CPER / FEDER 2013 JM Rolain Fondation de Coopération scientifique “Infectiopole Sud » – 2011-2012. (Coinvestigateur avec le Dr Landraud, Nice) Obtention d’une bourse postdoctorale de deux ans : 36 K€ 2012 Fondation de Coopération scientifique “Infectiopole Sud » (Coinvestigateur avec le Dr Landraud, Nice) 2014 Porteur de projet : Pr Martine ReynaudGaubert Porteur de projet : Dr Xavier Benoît D’JOURNO « Evolution clinique et modifications du microbiote respiratoire en fonction du traitement antibiotique chez les patients atteints de mucoviscidose » : 150 K€ « Intérêt de la décontamination oropharyngée et du naso-pharynx par Chlorhexidine Glu-conate contre placebo dans la prévention des infections nosocomia-les en chirurgie d’exé-rèse pulmonaire: étude multicentrique, prospec-tive et randomisée » 280 K€ PHRC Inter Régional 2012 – 2011 (Investigateur associé) 2014 PHRC National – (Investigateur associé) 2012 2014 IHU – Méditerranée Infection, 72.300.000 € Investigateur associé Pr JM Rolain 2011 2021 2012 2015 2012 2014 2013 2014 En collaboration avec 2014 A. Sotto - Nimes 2016 Porteur de projet : Didier Raoult Fondation Méditerranée Infection 36 K€ Bourse doctorale – Collaboration avec S. Morand – Montpellier Contrat de collaboration - 250 K€ Licence Brevet 09.58575 – Société Virbac Projet PathoDivSEA Bio Asie – 40 K€ Porteur du Projet : Dr Serge Morand (Montpellier Fondation de Coopé-ration scientifique « Infectiopole Sud » 36 K€ Bourse doctorale – 3 ans Investigateur Associé : JM Rolain Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Fondation de Coopé-ration scientifique « Infectiopole Sud » 36 K€ Bourse Post-doctorale - 2 ans IHU Méditerranée Infection 27 K€ IHU Méditerranée Infection 12 K€ IHU Méditerranée Infection – 2014 - 36 K€ En collaboration avec 2014 E. Delaporte Montpellier Financement ingénieur 6 mois sur projet d’excellence Financement technicien 4 mois sur projet d’excellence Bourse doctorale 36 mois sur projet d’excellence 2015 2014 2014 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE au 1er Janvier 2013 Intitulé de l’Unité : URMITE CNRS-IRD-INSERM UMR 7278 Localisation : Facultés de Médecine et de Pharmacie Responsable : Professeur Didier RAOULT Intitulé de l’Equipe : Equipe 4 : Virus émergents de l’environnement et de l’immunodéprimé Localisation : Facultés de Médecine et de Pharmacie Responsable : Professeur Bernard LA SCOLA Téléphone : +33491 32 43 75 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : 3 Etudiants en Thèse : 13 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom COLSON Prénom Philippe Fonction PU-PH HDR oui Téléphone 0491835560 PAGNIER Isabelle MCH non 0491835560 BITTAR Fadi MCU Chair IRD non 0491835560 e-mail [email protected] [email protected] [email protected] Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 3 / THEMES DE RECHERCHE Philippe COLSON : - Génomique des virus géants associés aux amibes - Rôle en pathologie humaine des virus des plantes - Epidémiologie, diversité, variabilité, et résistance aux antiviraux des virus des hépatites et virus émergents Isabelle PAGNIER : Le travail de cette équipe se concentre sur l’analyse de nouveaux virus géants dans l’environnement, et les produits alimentaires, de leur écologie à leur étude génétique et leur implication potentielle en pathologie humaine. En marge de ce travail, l’équipe travaille également sur la recherche et l’analyse de nouveaux agents viraux chez des personnes immunodéprimées. Les analyses sont faites selon 4 axes de recherche principaux: rechercher des virus géants et des bactéries intracellulaires, analyser leurs génomes, leur implication potentielle en pathologie humaine, et enfin rechercher des virus émergents en pathologie humaine chez des patients immunodéprimés. Fadi BITTAR : Pathogènes émergents dans les pays du Sud 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES In press: Aherfi S, Boughalmi M, Pagnier I, Fournous G, La Scola B, Raoult D, Colson P. Complete genome sequence of Tunis virus, a new member of the proposed family Marseilleviridae. Accepted in Archiv Virol. Yoosuf N, Pagnier I, Fournous G, Robert C, Raoult D, La Scola B, Colson P. Draft genome sequences of Terra1 and Terra2 viruses, new members of the family Mimiviridae isolated from soil. Accepted in Virology. Dans PubMed: 1: Moal V, Ferretti A, Devichi P, Colson P. Genome sequence of a hepatitis e virus of genotype 3e from a chronically infected kidney transplant recipient. Genome Announc. 2014 Jan 30;2(1). pii: e01156-13. doi: 10.1128/genomeA.01156-13. PubMed PMID: 24482510; PubMed Central PMCID: PMC3907725. 2: Doudier B, Vencatassin H, Aherfi S, Colson P. Fatal fulminant hepatitis E associated with autoimmune hepatitis and excessive paracetamol intake, southeastern France. J Clin Microbiol. 2014 Jan 29. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 24478416. 3: Aherfi S, Borentain P, Raissouni F, Le Goffic A, Guisset M, Renou C, Grimaud Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 JC, Hardwigsen J, Garcia S, Botta-Fridlund D, Nafati C, Motte A, Le Treut YP, Colson P, Gerolami R. Liver transplantation for acute liver failure related to autochthonous genotype 3 hepatitis E virus infection. Clin Res Hepatol Gastroenterol. 2014 Feb;38(1):24-31. doi: 10.1016/j.clinre.2013.05.013. Epub 2014 Jan 23. PubMed PMID: 24462173. 4: Yoosuf N, Pagnier I, Fournous G, Robert C, La Scola B, Raoult D, Colson P. Complete genome sequence of Courdo11 virus, a member of the family Mimiviridae. Virus Genes. 2013 Dec 1. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 24293219. 5: Boughalmi M, Pagnier I, Aherfi S, Colson P, Raoult D, La Scola B. First isolation of a giant virus from wild Hirudo medicinalis leech: Mimiviridae isolation in Hirudo medicinalis. Viruses. 2013 Nov 27;5(12):2920-30. doi: 10.3390/v5122920. PubMed PMID: 24287596. 6: Abat C, Chaudet H, Raoult D, Colson P. Increasing trend of invasive group B streptococcal infections, marseille, france. Clin Infect Dis. 2014 Mar;58(5):750-1. doi: 10.1093/cid/cit777. Epub 2013 Nov 26. 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Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 15: Colson P, Fournous G, Diene SM, Raoult D. Codon usage, amino acid usage, transfer RNA and amino-acyl-tRNA synthetases in Mimiviruses. Intervirology. 2013;56(6):364-75. doi: 10.1159/000354557. Epub 2013 Oct 17. PubMed PMID: 24157883. 16: Pagnier I, Reteno DG, Saadi H, Boughalmi M, Gaia M, Slimani M, Ngounga T, Bekliz M, Colson P, Raoult D, La Scola B. A decade of improvements in Mimiviridae and Marseilleviridae isolation from amoeba. Intervirology. 2013;56(6):354-63. doi: 10.1159/000354556. Epub 2013 Oct 17. PubMed PMID: 24157882. 17: Bouamra Y, Gérolami R, Arzouni JP, Grimaud JC, Lafforgue P, Nelli M, Tivoli N, Ferretti A, Motte A, Colson P. Emergence of autochthonous infections with hepatitis E virus of genotype 4 in Europe. 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Kokcha, NMNI. 2013. 45: Pagnier, I; Croce, O; Robert, C ; Raoult, D ; La Scola, B Non-contiguous finished genome sequence and description of Anaerococcus pacaensis sp nov., a new species of anaerobic bacterium. Standards In Genomic Sciences. 8(3) 548-560. IF: 2.01046 : Slimani M, Pagnier I, Boughalmi M, Raoult D, La Scola B. Alcohol disinfection procedure for isolating giant viruses from contaminated samples. Intervirology. 2013;56(6):434-40. IF: 1.889 Suárez C, Welsch S, Chlanda P, Hagen W, Hoppe S, Kolovou A, Pagnier I, Raoult D, Locker JK. OPEN membrane-intermediates are the precursors for assembly of large DNA viruses. Cell Microbiol. 2013 Jun 11. IF : 4.811 47 :Barreau M, Pagnier I, La Scola B. Improving the identification of anaerobes in the clinical microbiology laboratory through MALDI-TOF mass spectrometry. Anaerobe. 2013 Apr 29. IF : 2,327 Gaia M, Pagnier I, Campocasso A, Fournous G, Raoult D, La Scola B. Broad spectrum of mimiviridae virophage allows its isolation using a mimivirus reporter. PLoS One. 2013 Apr 15;8(4):e61912. IF : 3.730 48 :Slimani M, Pagnier I, Raoult D, La Scola B. Amoebae as battlefields for bacteria, giant viruses, and virophages. J Virol. 2013 Apr;87(8):4783-5. IF : 5,076 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Date Nom – Prénom du Doctorant Niyaz YOOSUF Inscription Genomes of mimiviruses of amoeba 2010 Fanny BALIQUE Tatsiana NGOUNGA Haitham SOBHY Cédric ABAT Devenir du Doctorant Titre de la thèse Détection et impact potentiel des tobamovirus chez l’homme Detection and identification of giant viruses of amoeba in clinical specimens Bioinformatics analysis and characterization of proteins associated to fibrils among giant viruses of amoebae Development of epidemiological tools for the real-time surveillance of abnormal events based on clinical microbiology laboratory data Soutenance Dec 2013 Post-doc, Institut Gustave Roussy, Paris, France Institut Pasteur Dakar, Sénégal 2010 Juillet 2013 2011 2014 En cours 2011 2014 En cours 2012 2015 En cours Liste des HDR Nom – Prénom Valérie MOAL Date de soutenance Titre de l’HDR Mars 2014 - 6 / LISTE DES CONTRATS 2013-2014 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique Pr Bernard LA SCOLA Intitulé Etude des infections par les virus géants associés aux amibes chez les enfants présentant une gastroentérite Organisme de financement (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) PHRC Date de début 2011 Date de fin 2013 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 UMR MD1 Transporteurs Membranaires, Chimiorésistance et Drug-Design Dr. Jean-Marie Pagès Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE 2013 Intitulé de l’Unité : UMR MD1 Transporteurs Membranaires, Chimiorésistance et Drug-Design (TMCD2) Localisation : Faculté de Médecine et Faculté de Pharmacie - 27 boulevard Jean Moulin - 3ème étage Aile verte - 13005 Marseille Responsable : Directeur Jean-Marie Pagès Intitulé de l’Equipe : Transporteurs Membranaires, Chimiorésistance et Drug-Design (TMCD2) Localisation : Faculté de Médecine et Faculté de Pharmacie - 27 boulevard Jean Moulin - 3ème étage Aile verte - 13005 Marseille Responsable : Directeur Jean-Marie Pagès Téléphone : 04 91 32 45 87 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : Chercheurs : 4 (AMU) 6 (IRBA-SSA) 2 (INSERM) Praticiens hospitaliers : 1 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : Personnel Administratif et Technique Universitaire : 2 (AMU) Personnel Administratif et Technique (INSERM, CNRS, autre) : Post-doc : 4 sous CDD Etudiants en Thèse : 8 7 Etudiants en Master : Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom ALIBERT BIOT Prénom SANDRINE FABRICE BOLLA JEAN-MICHEL Fonction MCF CHERCHEUR IRBA CR INSERM BOYER CHEVALIER GERARD JACQUELINE PU MCF + + DAVIN-REGLI ANNE MCU-PH + GARNOTEL ERIC PAGES JEAN-MARIE PROFESSEUR AGREGE (SSA) DR INSERM + THEFENNE HELENE THIBAULT FRANCOIS VALADE ERIC VIDAL DOMINIQUE CHERCHEUR SSA CHERCHEUR IRBA PROFESSEUR AGREGE (SSA) PROFESSEUR AGREGE (SSA) HDR Téléphone e-mail 04 91 78 29 88 [email protected] 04 76 63 68 40 [email protected] + 04 91 32 44 40 [email protected] 04 91 28 90 14 [email protected] 04 91 83 56 95 [email protected] 04 91 83 56 95 [email protected] 04 91 61 71 13 [email protected] 04 91 32 45 87 [email protected] 04 91 61 71 13 [email protected] 04 76 63 68 40 [email protected] + 04 76 63 68 40 [email protected] + 04 76 63 69 19 [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE EQUIPE : E1 - Physiologie de la membrane bactérienne (bactéries, expression des porines, contrôle, régulation, impact) RESPONSABLE : DAVIN-REGLI Anne/VALADE Eric THEMATIQUE : Transporteurs membranaires chez les bactéries à Gram négatif. Régulation de l'expression des transporteurs et rôle des transporteurs en clinique ALIOUANE Soumeya BIOT Fabrice DAVIN-REGLI Anne DE MARCHI Laurence FADLI Mariam GARNOTEL Eric MAIGRE Laure MASI Muriel NEULAT-RIPOLL Fabienne PERIAME Marina PHILIPPE Nadège PINET Elizabeth QUENIN Solange (50 %) SPRYNSKI Nicolas THEFENNE Hélène THIBAULT François VALADE Eric VIDAL Dominique DOCTORANT Praticien de recherche MCU-PH, AMU CDI AMU DOCTORANT Professeur de biologie POST-DOC POST-DOC POST-DOC DOCTORANT POST-DOC T (CDD) ADT AMU POST-DOC Praticien de biologie Praticien de recherche Professeur de recherche Professeur de recherche Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 EQUIPE : E2 - Nouvelles molécules et nouvelles cibles (synthèse, structure-activité-Q-SAR) RESPONSABLE : BOLLA Jean-Michel THEMATIQUE : Nouvelles cibles et nouveaux antibiotiques. Nouveaux potentialisateurs d'antibiotiques ALIBERT Sandrine BOLLA Jean-Michel BORSELLI Diane BOYER Gérard CHEVALIER Jacqueline DE MARCHI Laurence DUMONT Estelle HERNANDEZ Jessica LAUTARD Christelle LIEUTAUD Aurélie LOME Vincent N’GOMPAZA DIARRA Johanna OTREBSKA Ewa QUENIN Solange (50 %) STUTZMANN Aurélien MCU, AMU CR INSERM DOCTORANT PU, AMU MCU, AMU CDI AMU POST-DOC DOCTORANT IE (CDD) IE (CDD) DOCTORANT POST-DOC DOCTORANT ADT AMU DOCTORANT 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES 2013 Lieutaud A, Guinoiseau E, Lorenzi V, Giuliani M.C, Lome V, Brunel JM, Luciani A, Casanova J, Pagès J.-M, Berti I, Bolla JM. Inhibitors of Antibiotic Efflux by AcrAB-TolC in Enterobacter aerogenes. Anti-Infective Agents, 2013, 11, 168178. Lavigne JP, Sotto A, Nicolas-Chanoine MH, Bouziges N, Pagès J.-M, Davin-Regli A. An adaptative response of Enterobacter aerogenes to imipenem: the regulation of porin balance in clinical isolates. Int. J. Antimicrob. Agents, 2013, 41:130-136 Dal T, Aksu B, Pagès J.-M, Over-Hasdemir U. Expression of adeB gene and responsiveness to 1-(1-naphthylmethyl)-piperazine and phenylalanyl-arginyl-βnaphthylamide in clinical isolates of Acinetobacter baumannii. J. Antimicrob. Chemother., 2013, 68:1200-2. Boutet-Dubois A, Pantel A, Prère MF, Bellon O, Brieu-Roche N, Lecaillon E, Le Coustumier A, Davin-Regli A, Villeneuve L, Bouziges N, Gleize E, Lamarca R, Dunyach-Remy C, Sotto A, Lavigne JP. Faecal carriage of oxyiminocephalosporin-resistant Enterobacteriaceae among paediatric units in different hospitals in the south of France. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2013, 32:1063-8. Bajaj H, Tran GT, Mahendran KR, Nasrallah C, Colletier JP, Davin-Regli A, Bolla JM, Pagès J.-M, Winterhalter M. Antibiotic uptake through membrane channels: Role of Providencia stuartii OmpPst1 in carbapenem intrinsic resistance. Biochemistry, 2012, 51:10244-9. Masi M, Pagès J.-M. Structure, function and regulation of outer membrane proteins involved in drug transport in Enterobactericeae: the OmpF/C – TolC case. The Open Microbiology Journal, Open Microbiol J. 2013, 7:22-33. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Handzlik J, Szymańska E, Alibert S, Chevalier J, Otrębska E, Pękala E, Pagès J.-M, Kieć-Kononowicz K. Search for new tools to combat Gram-negative resistant bacteria among amine derivatives of 5-arylidenehydantoin. Bioorgan. Med. Chem., 2013, 21:135-45. Martins M, McCusker MP, Viveiros M, Couto I, Fanning S, Pagès JM, Amaral L. A Simple Method for Assessment of MDR Bacteria for Over-Expressed Efflux Pumps. Open Microbiol J. 2013, 7:72-82. Brunel JM, Lieutaud A, Lome V, Pagès J.-M, Bolla JM. Polyamino geranic derivatives as new chemosensitizers to combat antibiotic resistant Gram-negative bacteria. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2013, 21: 1174-1179 Sulaeman S, Hernould M, Schaumann A, Coquet I, Bolla JM, De E, Tresse O. Enhanced adhesion of Campylobacter jejuni to abiotic surfaces is mediated by membrane proteins in oxygen-enriched conditions. PLoS One. 2012, 7:e46402.doi: 10.1371/journal.pone.0046402. Feham K, Benkadari A, Chouaih A, Miloudi A, Boyer G, Alabd D. Synthesis and Structural Study of Triphenylbismuth Bis (Salicylate). Crystal Structure Theory and Applications,2013, 2, 28-33 doi:10.4236/csta.2013.21004 Djabou N, Lorenzi V, Guinoiseau E, Andreani S, Giuliani MC, Desjobert JM, Bolla JM, Costa J, Berti I, Luciani A, Muselli A. Phytochemical composition of Corsican Teucrium essential oils and antibacterial activity against foodborne or toxi-infectious pathogens. Food Control, 2013, 30: 354-363. Kreisberg JF, Ong NT, Krishna A, Joseph TL, Wang J, Ong C, Ooi HA, Sung JC, Siew CC, Chang GC, Biot F, Cuccui J, Wren BW, Chan J, Sivalingam SP, Zhang LH, Verma C, Tan P. Growth inhibition of pathogenic bacteria by sulfonylurea herbicides. Antimicrob Agents Chemother, 2013, 57 (3): 1513-7. Valade E, Davin-Regli A, Bolla JM, Pagès J.-M. Bacterial membrane, a key for controlling drug influx and efflux. Open Microbiol J. 2013, 217-240. Pagès J.-M, Kascakova S, Maigre L, Allam A, Alimi M, Chevalier J, Galardon E, Refregiers M, Artaud I. New Peptide-Based Antimicrobials for Tackling Drug Resistance in Bacteria: Single Cell Fluorescence Imaging. Med. Chem. Letters, 2013, 4: 556-559. Biot F, Lopez M, Poyot T, Neulat-Ripoll F , Caclard A, Thibault F, Peinnequin A, Pagès,J.-M, Valade E. Interplay between three RND efflux pumps in doxycycline-selected strains of Burkholderia thailandensis. PloS One, 2013, 8:e84068. Feham K, Abdelkarim B, Chouaih A, Miloudi A, Boyer G, Alabed D. Synthesis and Structural Study of Triphenylbismuth Bis (Salicylate). Cryst. Struct. Theory and Appl., 2013, 2, 28-33. Ooi WF, Ong C, Nandi T, Kreisberg JF, Chua HH, Sun G, Chen Y, Mueller C, Conejero L, Eshaghi M, Ang RM, Liu J, Sobral BW, Korbsrisate S, Gan YH, Titball RW, Bancroft GJ, Valade E, Tan P. The condition-dependent transcriptional landscape of Burkholderia pseudomallei. PLoS Genet. 2013, 9:e1003795. 2014 Fadli M, Chevalier J, Hassani L, Mezrioui NE, Pagès JM. Natural extracts stimulate membrane-associated mechanisms of resistance in Gram-negative bacteria. Lett Appl Microbiol. 2014 Jan 22. doi: 10.1111/lam.12216. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 BREVETS Titre du Brevet Use of polyaminoisoprenyl derivatives in antibiotic or antiseptic treatment Inventeurs : Bolla JM et Brunel JM N° de dépôt : PCT/EP2012/053113 Année de dépôt : 2012 Année de publication : 2013 Déposant (Université de Méditerranée…) Université de la Méditerranée et Université de Corse 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant FADLI Mariam Date Devenir du Doctorant Titre de la thèse Effet synergique d’antibiotique et d’extraits de plantes médicinales marocaines sur des bactéries d’intérêt sanitaire Inscription Soutenance 2009 12/12/2013 Cadre marocain 6 / LISTE DES CONTRATS 2013-2014 (Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus) Responsable Scientifique (coordonnateur) Intitulé PAGES JeanIBEF Marie (coordonnateur) PAGES JeanMETABAC Marie (I. Artaud) PAGES JeanTRANSLOCATION Marie (M. Organisme Date de de financement début (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) ANR 2012 Date de fin 2015 ANR 2011 2013 IMI (Europe) 2013 2018 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Winterhalter) PAGES JeanMarie (coordonnateur) PAGES JeanMarie (coordonnateur) BOLLA JeanMichel (coordonnateur) BOLLA JeanMichel (coordonnateur) BOLLA JeanMichel (coordonnateur) BOYER Gérard (coordonnateur) Perméabilité et Résistance Privé 2012 2013 CAZ-Avibactam Privé 2013 2013 Dérivés du Géraniol SATT 2013 2015 Analyses pharmacophoriques PHC Ballaton 2012 2013 Rapid (OOPERA) DGA/DGCIS 2012 2014 Synthèse et pharmaco-chimie de nouveaux inhibiteurs de pompe d’efflux chez les bactéries à Gram-négatif BOURSE THESE DGA 2013 2016 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 UMR CNRS 7263 IRD 237 Biogénotoxicologie - Santé humaine et Environnement Pr. Thierry TATONI Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE 2013 Intitulé de l’Unité : Institut Méditerranéen de Biodiversité et d'Ecologie marine et continentale IMBE - UMR CNRS 7263, IRD 237 Localisation : Aix-Marseille Université – Site de l’Etoile Responsable : Pr Thierry TATONI Intitulé de l’Equipe : IMBE - UMR CNRS 7263, IRD 237 – FR CNRS 3098 ECCOREV Biogénotoxicologie - Santé humaine et Environnement Localisation : Campus Santé Timone Responsables : B. COURBIERE & T. ORSIERE : Composante Médecine P. GALLICE : Composante Pharmacie Téléphone : B. COURBIERE +33 492 50 22 T. ORSIERE: +33 491 32 45 48 P. GALLICE : +33 491 835 540 Adresse électronique : B. COURBIERE : [email protected] T. ORSIERE : [email protected] P. GALLICE : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : Praticiens hospitaliers : Personnel Administratif et Technique Universitaire : Etudiants en Thèse : Etudiants en Master : 9 7 4 5 2 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Composante Pharmacie Nom GALLICE BERGE-LEFRANC CHASPOUL GUICHAOUA Prénom Philippe David Florence Marie-Roberte Fonction PU MCU IGE PU-PH HDR Téléphone e-mail x 0491835540 [email protected] 0491835670 [email protected] [email protected] x 0491383749 [email protected] Composante Médecine Nom ACHARD BOTTA GRILLO COURBIERE SARI-MINODIER PERRIN ORSIERE POMPILI TASSISTRO Prénom Vincent Alain Jean-Marie Blandine Irène Jeanne Thierry Jocelyne Virginie Fonction MCU-PH PU-PH PU-PH MCU-PH MCU-PH MCU-PH IGR TCN IGE contractuel HDR Téléphone x x 0491325021 0491324468 x 0491324436 049132434 0491324548 0491324573 0491324548 e-mail [email protected] [email protected] [email protected] Blandine.Courbiè[email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE La thématique de recherche de l’équipe « composante Pharmacie » s’inscrit dans celle de l’équipe Biogénotoxicologie - Santé humaine et Environnement. Elle concerne les domaines de la cytotoxicité et de la génotoxicité des nuisances environnementales vis-à-vis des cellules somatiques et germinales humaines. Les objectifs principaux de ces études sont la compréhension des mécanismes de cytotoxicité et de génotoxicité et la recherche de biomarqueurs pertinents d’exposition et d’effets génotoxiques. Les principaux axes de recherche sont : la compréhension de l’impact des métaux lourds sur la fertilité masculine par l’étude de leur cytogénotoxicité sur des modèles cellulaires adaptés (co-cultures de cellules germinales et cellules de Sertoli). Le développement de méthodes spécifiques de détection de ces composés au niveau cellulaire et dans des milieux complexes (liquide séminal, milieux de culture). L’étude d’interaction des métaux doués de toxicité et de leur cible cellulaire, en particulier l’ADN, est également menée afin d’approcher leur mécanisme d’action. l'évaluation des risques génotoxiques et mutagènes liés à l'exposition aux facteurs environnementaux sur les spermatozoïdes par le développement et l’application de biomarqueurs tels que les adduits sur l’ADN ou la mesure des niveaux d’expression des gènes de réparation des lésions génotoxiques. Une collaboration avec le Centre d’Assistance Médicale à la Procréation de l’Hôpital de la Conception (« Germethèque ») permettra d’obtenir des échantillons issus de patients. L’accès aux données médicales permettra également d’étudier les effets de facteurs environnementaux divers (tabagisme, expositions professionnelles …) sur les paramètres de fertilité. le développement des études de nanotoxicologie par la recherche et la compréhension des effets cytogénotoxiques des nanoparticules et nanomatériaux associant une caractérisation fine de leurs propriétés physico-chimiques à une approche toxicologique utilisant les outils adaptés pour la mise en évidence de leur impact sur des cellules humaines (bioénergétique cellulaire et identification des cibles spécifiques, cytogénétique, génomique, protéomique et/ou métabolomique) afin d’approcher au plus près leur signature toxicologique. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES Assouline E, Crocchiolo R, Prebet T, Broussais F, Coso D, Gamerre M, Vey N, Blaise D, Courbiere B Impact of Reduced-Intensity Conditioning Allogeneic Stem Cell Transplantation on Women's Fertility. Clin Lymphoma, Myeloma Leuk 13(6):704-710,2013. Bergé-Lefranc D, Chaspoul F, Cérini C, Brunet P, Gallice P 2013 Thermodynamic study of indoxylsulfate interaction with human serum albumin and competitive binding with p-cresylsulfate. Journal of Thermal Analysis and Calorimetry 115 :2021-2026, 2014. Berthelot-Ricou A, Perrin J, Di Giorgio C, De Meo M, Botta A, Courbiere B Genotoxicity assessment of mouse oocytes by comet assay before vitrification and after warming with three vitrification protocols. Fertil Steril 100(3):882-888, 2013. Berthelot-Ricou A, Perrin J, Orsiere T, Aye M, Roustan A, Botta A, Courbiere B Genotoxicity risk assessment and oocytes: basis of genetic toxicology and application in reproductive science. Gynecol Obstet Fertil 41(9):544-547, 2013. Courbiere B, Auffan M, Rollais R, Tassistro V, Bonnefoy A, Botta A, Rose J, Orsière T, Perrin J Ultrastructural interactions and genotoxicity assay of cerium dioxide nanoparticles on mouse oocytes. Int J Mol Sci 14(11):21613-28, 2013. Courbiere B, Decanter C, Bringer-Deutsch S, Rives N, Mirrallie S, Pech JC, De Ziegler D, Carré-Pigeon F, MayPanloup P, Siefer C, Amice V, Schweitzer T, Porcu-Buisson G, Poirot C and the French Study Group for Ovarian and Testicular Cryopreservation (GRECOT). Emergency IVF for embryo freezing to preserve female fertility. A French cohort multicentric study. Hum Reprod 28(9):2381-2388, 2013. 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant ALI Sazan LUIGI Manon HAMA FARAJ Sara PLUMEJEAUD Sophie BELLIARDO Catherine Date Titre de la thèse Inscription Soutenance Etude de l’effet toxique des métaux lourds et des organométalliques sur le déroulement de la spermatogénèse Etude des propriétés anti-mutagènes de molécules naturelles d’origine végétale Mise au point et application du test PigA sur cellules endobuccales Génotoxicité des particules atmosphériques ultrafines Etude comparée de la cytogénotoxicité de Al, Ni et Cd 2010 - 2011 - 2012 - 2012 - Devenir du Doctorant 2013 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE au 1er Janvier 2013 Intitulé de l’Unité : Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie (IMBE) marine et continentale (UMR Université Aix-Marseille / CNRS 7263 / IRD 237 / Univ Avignon Localisation : AMU : Faculté des Science St Jérôme Responsable : Thierry Tatoni Intitulé de l’Equipe : Mutagenèse et Toxicologie Environnementale Localisation : AMU : Faculté des Sciences St Charles Responsable : Xavier Moreau Téléphone : 33+(4).13.55.11.94 Adresse électronique : [email protected] 2 / EFFECTIFS 2013-2014 de l’équipe Enseignants - Chercheurs : 7 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 1 Etudiants en Thèse : 2 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014 Nom CHAMPION DE JONG-MOREAU DI GIORGIO DE MEO MOREAU PICCERELLE VILLARD WAFO Prénom SERGE LAETITIA CAROLE MICHEL XAVIER PHILIPPE PIERRE-HENRI EMMANUEL Fonction PR MCF MCF MCF MCF PR MCF IE HDR OUI OUI OUI OUI OUI OUI NON NON Téléphone 04-91-83-56-19 04-13-55-11-93 04-91-83-56-91 04-86-13-68-33 04-13-55-11-94 04-91-83-56-93 04-91-83-56-38 04-91-83-55-19 e-mail [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE La persistance d’une espèce dans un environnement donné dépend de sa sensibilité, de sa vulnérabilité et de sa capacité à s’adapter aux changements. Cette persistance varie en Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 fonction de la tolérance physiologique et du patrimoine génétique de l’espèce. Ainsi, les mécanismes adaptatifs des organismes constituent une réponse intégrative à une combinaison de stress. D’autre part, les variations de l’état de stress physiologique des organismes peuvent affecter le potentiel adaptatif des espèces. Les mécanismes par lesquels la combinaison de stress environnementaux est traduite en une réponse physiologique capable de modifier les performances de l’organisme, ainsi que la valeur sélective et la survie des populations en milieu naturel, sont encore mal connus. Les objectifs de l’équipe sont d’améliorer la compréhension des mécanismes métaboliques et physiologiques élaborés par les organismes pour faire face aux contraintes environnementales. Les travaux s’effectuent selon une démarche multidisciplinaire qui vise à identifier des réponses biologiques face aux polluants (Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques, Amines Aromatiques, Nitroarènes, Eléments Traces Métalliques, Polychlorobiphényls …), notamment face aux mutagènes environnementaux et aux nouveaux contaminants (nanoparticules, produits pharmaceutiques). Basés sur une approche « multimarqueurs » (moléculaires, cellulaires, histologiques et physiologiques), les travaux s’appuient sur des organismes modèles allant de la bactérie jusqu’aux vertébrés en passant par des invertébrés. 4 / PUBLICATIONS 2013-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES 3. Aye, M., C. Di Giorgio, I. Berque-Bestel, A. Aime, B.P. Pichon, Y. Jammes, P. Barthélemy and M. De Méo. 2012. Genotoxic and mutageneic effects of lipid-coated CdSe/ZnS quantum dots. Mutation Res., 750: 129-138. 3. Aye, M., C. Di Giorgio, M. Mekaouche, J.G. Steinberg, C. Brerro-Saby, P. barthelemy, M. De Meo and Y. Jammes. 2013. Genotoxicity of intraperitoneal injection of lipoamphiphile CdSe/ZnS quantum dots in rats. Mutation Res., 58: 48-55. 3. Berthelot-Ricou, A., J. Perrin, C. Di Giorgio, M. De Méo, A. Botta. 2013. Genotoxicity assessment of mouse oocytes by comet nassay before vitrification and after warming with three vitrification protocols. Fertil. Steril., 100: 882-888. 4. Saez, G., M. Aye, M. De Méo, A. Ahissan, I. Bestel, P. Barthélémy, C. Di Giorgio. 2014. Genotoxic and oxidative responses in coelomocytes of Eisenia fetida and Nereis diversicolor exposed to lipid-coated CdSe/ZnS quantum dots and CdCl2. Ecotox. Environ. Safety, (in press). 5. El Hosr, C. Di Giorgio,Bire, Habib,Tueni, Bun, Herbette, M.De Meo, E. Ollivier and R.Elias. 2014. In vitro cytotoxic and anticlastogenic activities of Saxifragifolin B and Cyclamin isolated from Cyclamen persicum and Cyclamen libanoticum. Pharmaceutical Biol., (in press). 6. Roustand, A., M. Aye, C. Di Giorgio and M. De Méo. 2014. Comparative study of the in vitro clastogenic effects of glyphosphate, atrazine, aminomethyl phosphoric acid, desethylatrazine and a mixture of the four pesticides. Chemopsphere. (accepted). Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 BREVETS Titre du Brevet INTERNAL DNA STANDARDS FOR ASSAYS USING MICRO-ELECTROPHORESIS Inventeurs : Viallat A, De Meo M, Combet-Blanc Y N° de dépôt : BIO 12042 - Viallat / AF - N.Réf ABU-GL BET 13P0468 - Année de dépôt : 2014 Année de publication : 2014 Déposant (Université de Méditerranée…) INSERM 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Liste des thèses Nom – Prénom du Doctorant Aye Mélanie Date Titre de la thèse Inscription La génotoxicité des Quantum dots et le rôle du stress oxydant : 01/10/2009 Implications sur l’environnement et la santé humaine Soutenance 15/11/2013 Devenir du Doctorant postdoc Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 UMR MD3 Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutique Pr. Daniel PARZY Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE Au 1er janvier 2014 Intitulé de l’Unité : UMR-MD3 - Infections Parasitaires : Transmission, et Thérapeutique Localisation : UFR de Pharmacie Responsable : Directeur Pr. Renaud Piarroux Co-directeurs : Nicolas Taudon, Nadine Azas, Francisco Veas 2 / EFFECTIFS 2013-2014 Enseignants - Chercheurs : 13 Chercheurs : 5 Praticiens hospitaliers : 1 Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) : 1 Personnel Administratif et Technique Universitaire : 4 Post-doc : 1 Doctorants : 21 Etudiants en Master : 2 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 IDENTIFICATION DES PERSONNES IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2012-2014 Nom Ollivier Azas Elias Mahiou-Leddet Bun Dumetre Cohen Casanova Laget Baghdikian Mabrouki Hutter Boudon Manguin Veas Piarroux Ranque Mary L’Ollivier Sinou Prénom Evelyne Nadine Riad Valérie Sok-Siya Aurélien Anita Magali Fonction Professeur PU-PH Maître de Conférences HDR HDR HDR HDR Maître de conférences MCU-PH MCU Téléphone 04 91 83 55 43 04-91-83-55-64 04 91 83 55 42 04 91 83 56 50 04 91 83 55 93 04.91.83.55.44 MCU-PH MCU 04.91.83.55.44 Michèle Béatrice MCU Maître de Conférences 04.91.83.55.60 04 91 83 55 93 Fathi Sébastien Michèle Sylvie Technicien 04 91 83 56 50 Francisco HDR e-mail [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] Technicien ADT Directrice de HDR Recherche Directeur de Recherche HDR PU-PH Renaud Stéphane Charles Coralie PH Véronique Chercheur MCU-PH MCU-PH HDR HDR HDR 04 91 83 55 24 04 11 75 94 84 [email protected] 04 11 75 94 83 04 91 38 60 90 04 91 38 60 90 04 91 38 60 90 04 91 38 60 90 04 91 83 56 37 [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] 3 / THEMES DE RECHERCHE L'UMR-MD3 est une unité de recherche spécialisée en maladies infectieuses associant des chercheurs et des cliniciens du Service de Santé des Armées (SSA), de l'Université d'Aix-Marseille (AMU), de l'Assistance Publique des Hôpitaux de Marseille (AP-HM) et de l'Institut de Recherche pour le Développement (IRD). Un des points forts de cette UMR est le regroupement d'équipes ayant des compétences complémentaires autour d’un paradigme commun qui est l’infection parasitologique dans tous ses aspects, de la transmission à la thérapeutique, en prenant en compte les interactions entre le pathogène et les micro (organes des hôtes) et macro (sites de transmission, vecteurs)-environnements. • Equipe 1 : Transmission Dirigée par Sylvie Manguin (coordinatrice) (IRD Montpellier), Stéphane Ranque (APHM) et Renaud Piarroux (APHM), cette équipe se consacre à l’étude de la transmission des maladies parasitaires centrée plutôt sur le paludisme. Sur le plan de la transmission, une approche globale est développée en prenant en compte le rôle déterminant des vecteurs dans la dissémination des agents infectieux. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Thématiques Caractérisation et capacité vectorielle des moustiques vecteurs du paludisme. Recherche de répulsifs et d’insecticides pour le contrôle des vecteurs du paludisme et de la dengue. Surveillance spatiale du paludisme. - Dynamique des épidémies et endémisation, appliquée à : leishmaniose, toxoplasmose, paludisme et choléra • Equipe 2 : Thérapeutique Dirigée par Evelyne Ollivier (Coordinatrice) (UFR Pharmacie Marseille), Nadine Azas (UFR Pharmacie Marseille) et Francisco Veas (IRD, Montpellier), cette équipe se consacre au développement de nouvelles approches pharmacologiques avec l’identification et la caractérisation de nouvelles cibles parasitaires, la recherche de nouveaux antiparasitaires naturels et de synthèse et la mise au point d’alternatives chimioprophylactiques et thérapeutiques. Thématiques : o Evaluation et Caractérisation mécanistique de composés antiparasitaires. o Mort cellulaire programmée chez les leishmanies. o Interaction du toxoplasme et de son environnement. o Ethnopharmacologie et Phytochimie. o Métabolomique 4 / PUBLICATIONS 2012-2014 PUBLICATIONS INTERNATIONALES 1 Desgrouas C, Desbordes M, Dormoi J, Ollivier E, Parzy D, Taudon N. Quantitative analysis of cepharanthine in plasma based on semi-automatic micro-extraction by packed sorbent (MEPS) combined with liquid chromatography Journal of Analytical Methods in Chemistry (in press). 2. Cassagne C, Pratlong F, Jeddi F, Benikhlef R, Aoun K, Normand AC, Faraut F, Bastien P, Piarroux R. Identification of Leishmania at the species level with matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Clin Microbiol Infect. 2013 Sep 5. doi: 10.1111/1469-0691.12387 3 El Hosry L, Di Giorgio C, Birer C, Habib, Tueni M, Bun SS, Herbette G, De Meo M, Ollivier E, Elias R. In vitro cytotoxic and anticlastogenic activities of Saxifragifolin B and Cyclamin isolated from Cyclamen persicum and Cyclamen libanoticum. Pharmaceutical Biology (in press). 4 Secondary Metabolites from Jacaranda mimosifolia and Kigelia africana (Bignoniaceae) and their Anticandidal activity. Sidjui Sidjui L, Menkem Zeuko’o E, Kouipou Toghueo RM, Placide Noté O, Mahiou-Leddet V, Herbette G, Boyom Fekam F, Ollivier E, Ngosong Folefoc G. Records of Natural Products (in press). 5 In vitro and in vivo combination of cepharanthine with anti-malarial drug. Desgrouas C, Dormoi J, Chapus C, Ollivier E, Parzy D, Taudon N. Malaria Journal (2014) 13:90. 6. In vitro antiplasmodial activity of some medicinal plants of Burkina Faso. Ouattara LP, Sanon S, Mahiou-Leddet V, Gansané A, Baghdikian B, Traoré A, Nébié I, Traoré AS, Azas N, Ollivier E, Sirima SB. Parasitol Res (2014) 113:405–416. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 7. Rapid and green extraction, assisted by microwave and ultrasound of cepharanthine from Stephania rotunda Lour. Desgrouas C, Baghdikian B, Mabrouki F, Bory S, Taudon N, Parzy D, Ollivier E. Separation and Purification Technology, 2014; 123: 9-14. 8. Ngo CT, Harbach RE, Garros C, Parzy D, Le HQ, Manguin S. Taxonomic assessment of Anopheles crawfordi and An. dangi of the Hyrcanus Group of subgenus Anopheles in Vietnam. Acta Trop. 2013 Sep 17 9. Faucher B, Bichaud L, Charrel R, Mary C, Izri A, de Lamballerie X, Piarroux R. Presence of sandflies infected with Leishmania infantum and Massilia virus in Marseille urban area. Clin Microbiol Infect. 2013 Sep 21. doi: 10.1111/1469-0691.12404. 10. Lachaud L, Dedet JP, Marty P, Faraut F, Buffet P, Gangneux JP, et al. Surveillance of leishmaniases in France, 1999 to 2012. Euro Surveill 2013;18. 11. Piarroux R, Abedi AA, Shako JC, Kebela B, Karhemere S, Diatta G, et al. Plague epidemics and lice, Democratic Republic of the Congo. Emerg Infect Dis 2013;19:505-6. 12. Mary C, Chapey E, Dutoit E, Guyot K, Hasseine L, Jeddi F, et al. Multicentric evaluation of a new real-time PCR assay for quantification of Cryptosporidium spp. and identification of Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis. J Clin Microbiol 2013;51:2556-63. 13.. Piarroux M, Piarroux R, Knapp J, Bardonnet K, Dumortier J, Watelet J, et al. Populations at risk for alveolar echinococcosis, France. Emerg Infect Dis 2013;19:721-8. 14.. Fricker-Hidalgo H, Cimon B, Chemla C, Darde ML, Delhaes L, L'ollivier C, et al. Toxoplasma seroconversion with negative or transient immunoglobulin M in pregnant women: myth or reality? A French multicenter retrospective study. J Clin Microbiol 2013;51:2103-11. 15. Coulibaly D, Rebaudet S, Travassos M, Tolo Y, Laurens M, Kone AK, et al. Spatiotemporal analysis of malaria within a transmission season in Bandiagara, Mali. Malar J 2013;12:82. 16. Poisnel E, Ebbo M, Berda-Haddad Y, Faucher B, Bernit E, Carcy B, et al. Babesia microti: an unusual travel-related disease. BMC Infect Dis 2013;13:99. 17. Gangneux JP, Poinsignon Y, Donaghy L, Amiot L, Tarte K, Mary C, et al. Indoleamine 2,3-dioxygenase activity as a potential biomarker of immune suppression during visceral leishmaniasis. Innate Immun 2013. 18. Gharbi M, Flegg JA, Hubert V, Kendjo E, Metcalf JE, Bertaux L, et al. Longitudinal study assessing the return of chloroquine susceptibility of Plasmodium falciparum in isolates from travellers returning from West and Central Africa, 2000-2011. Malar J 2013;12:35. 19. Foissac M, Million M, Mary C, Dales JP, Souraud JB, Piarroux R, et al. Subcutaneous infection with Dirofilaria immitis nematode in human, France. Emerg Infect Dis 2013;19:1712. 20.. Villard O, Breit L, Cimon B, Franck J, Fricker-Hidalgo H, Godineau N, et al. Comparison of four commercially available avidity tests for Toxoplasma gondii-specific IgG antibodies. Clin Vaccine Immunol 2013;20:197-204. 21. Reboul JP., Verhaeghe P., Siri D., et al. Synthesis and antiplasmodial receptor independent 4D-QSAR study in 4-aryl-2-trichlorométhylquinazoline serie. Current Chemical Biology.2013. 7, 139-150. 22. Castera-Ducros C, Paloque L, Verhaeghe P, Casanova M, Cantelli C, Hutter S, Tanguy F, Laget M, Remusat V, Cohen A, Crozet MD, Rathelot P, Azas N, Vanelle P Targeting the human parasite Leishmania donovani: Discovery of a new promising antiinfectious pharmacophore in 3-nitroimidazo[1,2-a]pyridine series. Bioorg Med Chem. 2013 Nov 15;21(22):7155-64. 23.. Paloque L, Vidal N, Casanova M, Dumètre A, Verhaeghe P, Parzy D, Azas N.A new, rapid and sensitive bioluminescence assay for drug screening on Leishmania. J Microbiol Methods. 2013 Sep 18;95(3):320-323. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 24. Hohweyer J, Dumètre A, Aubert D, Azas N, Villena I.Tools and methods for detecting and characterizing Giardia, Cryptosporidium, and Toxoplasma parasites in marine mollusks. J Food Prot. 2013 Sep;76(9):1649-57. 25. Cohen A, Dumètre A, Azas N A decade of Plasmodium falciparum metabolic pathways of therapeutic interest to develop new selective antimalarial drugs. Mini Rev Med Chem. 2013 Jul;13(9):1340-7. 26. Dumètre A, Dubey JP, Ferguson DJ, Bongrand P, Azas N, Puech PH Mechanics of the Toxoplasma gondii oocyst wall. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Jun 24 27. Since M, Sopkova de Oliveira Santos J, Verhaeghe P, Hutter S, Legay R, Azas N, Terme T, Rathelot P, Dallemagne P, Vanelle P, Rault S. X-ray and 2D-NMR-based antiplasmodial pharmacophore design in 2-trichloromethylquinazoline series. Medicinal Chemistry. 2013. Sous presse. 28. Bory S., Bun S.S., Baghdikian B., Dumètre A., Hutter S., Mabrouki F., Bun H., Elias R., Azas N., Ollivier E. HPLC analysis of Stephania rotunda extracts and correlation with antiplasmodial activity. Phytotherapy Research 2013, sous presse. 29. Cohen, A.; Crozet, M.D.; Rathelot, P.; Azas, N.; Vanelle, P. Synthesis and Promising in Vitro Antiproliferative Activity of Sulfones of a 5-Nitrothiazole Series. Molecules 2013, 18, 97-113. 30. Baghdikian B., Mahiou-Leddet V., Bory S., Bun S.S., Dumètre A., Mabrouki F., Hutter S., Azas N., Ollivier E. New antiplasmodial alkaloids from Stephania rotunda. Journal of Ethnopharmacology 2013, 145:381-385. 31. Souza GF, Carvalho D, Pedrosa W, Franck J, Piarroux R. Analytical validation of anti-toxoplasma IgG immunoassays. Braz J Infect Dis 2012;16:574-6. 32. Murat JB, L'Ollivier C, Fricker Hidalgo H, Franck J, Pelloux H, Piarroux R. Evaluation of the new Elecsys Toxo IgG avidity assay for toxoplasmosis and new insights into the interpretation of avidity results. Clin Vaccine Immunol 2012;19:1838-43. 33. 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Paloque L., Verhaeghe P., Casanova M., Castera-Ducros C., Dumètre A., Mbatchi L., Hutter S., Kraiem-M’Rabet M., Laget M., Remusat V., Rault S., Rathelot P., Azas N., Vanelle Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 P. Discovery of a new antileishmanial hit in 8-nitroquinoline series. European Journal of Medicinal Chemistry 2012, 54:75-86. 41. Lélu M., Villena I., Dardé M.L., Aubert D., Geers R., Dupuis E., Marnef F., Poulle M.L., Gotteland C., Dumètre A., Gilot-Fromont E. Quantitative estimation of the survival of Toxoplasma gondii oocysts in soil. Applied and Environmental Microbiology 2012, 78:51275132. 42. Gellis A., Dumètre A., Lanzada G., Hutter S., Ollivier E., Vanelle P., Azas N. Preparation and antiprotozoal evaluation of promising β-carboline alkaloids. Biomedicine and Pharmacotherapy 2012, 66:339-347. 43. 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Publications Nationales Problématiques liées au développement d’une procédure analytique de dosage de constituants dans les medicaments à base de plante(s). III. Exemple de mise en œuvre de méthodes de dosage de drogues végétales dans différents laboratoires. Bellenot D, Brum M, Barrau E, Bourny E, Abbe P, Alet P, Baghdikian B, Chanel-Audigier I, Dufat H, Garinot O, Lugez M, Maciuk A, Portier G, Romérales C, Saperas O, Seigneuret JM, Soussain R, Toure H. STP Pharma Pratiques, 23(6), novembre-décembre 2013. Problématiques liées au développement d’une procédure analytique de dosage de constituants dans les médicaments à base de plante(s). II. Revue des méthodes de dosage utilisées dans la Pharmacopée, commentaires et données expérimentales. Bellenot D, Brum M, Dufat H, Romerales C, Barrau E, Abbe P, Alet P, Baghdikian B, Bourny E, Chanel-Audigier I, Garinot O, Lugez M, Maciuk A, Portier G, Saperas O, Seigneuret JM, Soussain R, Taoubi K, Toure H. STP Pharma Pratiques, 22(6), novembre-décembre 2012. Problématiques liées au développement d’une procédure analytique de dosage de constituants dans les médicaments à base de plante(s). I. Données de la littérature et commentaires. Bellenot D, Toure H, Chanel-Audigier I, Brum M, Abbe P, Alet P, Baghdikian B, Barrau E, Bourny E, Dufat H, Garinot O, Le Roux E, L’huillier-Chaigneau A, Lugez M, Maciuk A, Portier G, Romerales C, Saperas O, Seigneuret JM, Soussain R, Taoubi K, Versini F. STP Pharma Pratiques, 22(1), janvier-février 2012. Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014 Nom – Prénom du Doctorant Leina El Hosry Manon Luigi Camille Desgrouas Cédric Garcia Mom Khay Lucie paloque Date Titre de la thèse Inscription Soutenance Bioactive compounds from three Lebanese plants : Berberis libanotica Ehnreb, Cyclamen persicum Mill. and Cyclamen libanoticum Hildebr”. Etude de propriétés antimutagènes de molécules naturelles Evaluation du mécanisme d’action, des propriétés pharmacodynamiques et pharmacocinétiques des molécules à activité antipaludique de Stephania rotunda Mise au point d’un système galénique innovant à partir d’actifs végétaux Molécules bioactives issues de la biodiversité végétale cambodgienne Etude de la MCP chez leishmania Etude de l’organisation des Louise Basmaciyan microtubules au cours la MCP chez Leishmania Capacité vectorielle des anophèles dans la co-transmission de Plasmodium et Chung Thuy Ngo Wuchereria bancrofti au centre-sud Vietnam Comportement et capacité vectorielle des anophèles dans la co-transmission Krajana Tainchum de Plasmodium et Wuchereria bancrofti à l’ouest de la Thaïlande Thipwara Transmission du virus de l’Encéphalite Chuaycharoensuk Japonaise par des Culex en Thaïlande Capacité vectorielle des anophèles et Chatchai Tananchai chimio-sensibilité des Plasmodium spp. en Thaïlande 10.2009 12/2013 10.2010 En cours 10.2010 12/2013 10.2011 En cours 10.2011 En cours 10.2011 06.2013 10.2012 En cours 9. 2010 Devenir du Doctorant Post Doc Thaïlande Chercheur à l’Institut 10/01/2014 Vétérinaire de Hanoi 9. 2010 En cours 9. 1011 En cours 2.2014 En cours Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 6 / Liste des contrats 2013-2014 Respo nsable Scientifique Intitulé Nicolas Taudon Evaluation des propriétés pharmacodynamiques et pharmacocinétiques des molécules à activité antipaludique de Stephania rotunda Pascal Sonnet SEAPAL : Synthèse et Etude de nouveaux Antipaludiques énantiomériquement purs Béatrice Ethnobotanique des sites Baghdikian pollués en zone méditerranéenne : potentiel de valorisation Sylvie Recherche de substances Manguin naturelles insecticides issues de la biodiversité végétale du sud-est asiatique pour le contrôle des vecteurs du paludisme et de la dengue Sylvie Capacité vectorielle des Manguin Anopheles et chimiosensibilité de parasites humains pour l’amélioration des méthodes de contrôle du paludisme en Asie du sud-est Réhabilitation et valorisation Evelyne d’une plante oubliée de la Ollivier Pharmacopée provençale : Inula montana Véronique Sinou Véronique Sinou Projet R&D collaboratif Dat@diag Evaluation de la sensibilité des antipaludiques pour l'amélioration du suivi et de l'évaluation du programme de la lutte contre le paludisme Organisme de financement (ANR, ANRS, PHRC, Fondation, Associations caritatives, privé…) Date de début Date de fin Direction Générale de l’Armement 01.01.2011 31.12.2013 ANR 01.01.2013 31.12.2015 OHM-Littoral Méditerranéen BioAsie Ministère des Affaires Etrangères 01.01.2013 31.12.2013 01.03.2013 28.02.2015 JEAI IRD 02.2012 01.2015 REGION 01.03.2013 28.02.2015 OSEO Ministère des Affaires Etrangères « Initiative 5% Sida, Tuberculose, Paludisme » 09.2011 09.2016 11.2013 11.2015 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12 Annuaire de la Recherche 2013 / 2014 Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12