La sélection génétique en aquaculture continentale

Transcription

La sélection génétique en aquaculture continentale
La sélection génétique en
aquaculture continentale
Pratiques et perspectives
pour les professionnels
JOURNEE–RENCONTRES DU MARDI 22 JANVIER 2002
Organisée par l'ADAPRA à l'Ecole Normale Supérieure de Lyon
SOMMAIRE
Introduction et programme de la journée -------------------------------- p.2
Communication 1 ---------------------------------------------------------------------- p.3
La sélection de la Truite – Programme PROSPER
(M. Vandeputte)
Communication 2 ---------------------------------------------------------------------- p.7
Organisation des professionnels dans l'amélioration génétique en France
(P. Haffray)
Communication 3 -------------------------------------------------------------------- p.25
Bases pour l'amélioration génétique de la carpe commune en France
(D.Vallod)
Communication 4 -------------------------------------------------------------------- p.39
Amélioration des méthodes d'élevage de l'omble chevalier
et mise au point d'un hybride truite fario et omble chevalier
(C. Gillet)
Liste des sigles ----------------------------------------------------------------------- p.51
Liste des participants ------------------------------------------------------------- p.53
Journée Sélection Génétique
1
INTRODUCTION
Le principe de la journée-rencontres est de permettre aux professionnels de la
pisciculture et aux techniciens aquacoles de traiter avec les spécialistes de la recherche
d'un thème bien précis qui est au cœur des préoccupations de la profession.
Financée dans le cadre du Pôle d'Expérimentation et de Progrès Aquaculture (PEP),
cette journée doit permettre la réflexion et l'émergence des besoins de la profession
pouvant permettre ensuite la réalisation de programmes d'expérimentation.
Cette journée abordera la question de la génétique en aquaculture continentale. La
pratique de la génétique devient de plus en plus incontournable pour assurer les
conditions optimales d'élevage, en terme de croissance, de reproduction, de contrôle
sanitaire, de traçabilité des populations, etc. De plus en plus intégrée en
salmoniculture, avec notamment l'application du programme PROSPER appliqué à la
truite arc-en-ciel, les connaissances et les travaux réalisés sur la carpe, le silure sont
encore très limités. C'est un véritable défi qui est aujourd'hui posé aux professionnels de
l'aquaculture d'eau douce, d'autant plus que les travaux abordant la sélection génétique
coûtent très cher et demandent de mutualiser les moyens.
PROGRAMME DE LA JOURNEE
Matinée
La sélection de la truite – Programme PROSPER –
M. VANDEPUTTE – INRA
Organisation des professionnels dans l'amélioration génétique en France
P. HAFFRAY – SYSAAF
Après-midi
Bases techniques et scientifiques pour l’amélioration génétique de la Carpe
Commune en France
D. VALLOD – ISARA, M. VANDEPUTTE – INRA
Travaux sur l'omble chevalier
C. GILLET – INRA
Perspectives d'application en Rhône-Alpes : discussion avec les professionnels
Journée Sélection Génétique
2
La sélection de la truite
Programme prosper
M. VANDEPUTTE – INRA
Journée Sélection Génétique
3
COMMUNICATION 1 : La sélection de la Truite – Programme PROSPER
RESUME
La croissance est le premier critère sur lequel les pisciculteurs souhaitent une sélection
génétique de leur cheptel. Après une mise au point méthodologique sur la sélection,
nous examinerons les raisons de l’échec de nombreux programmes de sélection massale
(choix des individus ayant les meilleures performances). Suite à cette analyse, seront
introduits les principes du programme PROSPER, développé à l’INRA depuis 1986 par
Bernard Chevassus sur la truite commune. Les 4 grands principes sont les suivants :
1. Disposer d’une variabilité génétique initiale suffisante
2. Maîtriser la consanguinité dans la population sélectionnée
3. Sélectionner à l’intérieur de groupes constitués de façon à maximiser la part de la
variabilité génétique dans la variabilité des performances observées
4. Sélectionner par éliminations progressives en compétition avec des animaux de
même poids moyen
Après 5 générations de sélection, le gain de poids observé est en moyenne de 13% par
génération, variant de 10 à 20 % selon les mesures. On observe peu de variations sur la
qualité du produit, et la variabilité génétique est en grande partie préservée. Ce
programme est donc un succès, et son application à d’autres espèces est en cours. Il
faut maintenant étudier plus en détail les différentes hypothèses sous-jacentes afin de
pouvoir proposer des simplifications et/ou des améliorations du processus.
Journée Sélection Génétique
4
COMMUNICATION 1 : La sélection de la Truite – Programme PROSPER
► La sélection de la truite : programme prosper
Journée ADAPRA « Génétique en aquaculture continentale », Lyon, 22/01/02
Marc Vandeputte, INRA Génétique des Poissons, 78352 Jouy en Josas
Tél : 01.34.65.23.64. Fax : 01.34.65.23.90. - E-mail: [email protected]
La croissance est le premier critère sur lequel les pisciculteurs souhaitent une sélection
génétique de leur cheptel. La méthode la plus simple et la moins coûteuse en théorie
pour permettre cette amélioration par voie génétique est la sélection massale
(sélection des animaux présentant les meilleures performances de croissance).
Cependant, de nombreuses expériences réalisées chez diverses espèces de poissons
(salmonidés, tilapia, carpe) montrent une efficacité
faible à nulle de cette méthode. A contrario, la
sélection familiale ou combinée (qui réclame des
quantités de bassins très importantes) a montré son
efficacité chez les salmonidés. La méthode PROSPER
(PROcédure de Sélection individuelle optimisée par
Epreuves Répétées) a été développée pour tenter de
proposer une alternative moins coûteuse à la sélection
familiale, en prenant en considération les facteurs qui
pouvaient limiter l’efficacité de la sélection massale.
Ces facteurs possibles sont a priori de quatre types :
● Une variabilité génétique insuffisante de la
population de base, ne permettant pas d’avoir accès
dans cette population à des poissons de bonne valeur
génétique
1. Population de base synthétique
pour plus de variabilité génétique
● Un risque d’augmentation de la consanguinité avec
une forte pression de sélection dans une
population de structure mal contrôlée
● Une modification de la performance par la
présence d’effets maternels initiaux susceptibles
de masquer la valeur génétique des individus
● La présence d’interactions sociales (agressivité)
pouvant là aussi masquer ou augmenter
artificiellement le potentiel de croissance de
certains individus.
La méthode PROSPER répond point par point à
ces problèmes potentiels, en s’assurant :
1. De disposer d’une variabilité génétique
initiale suffisante (fig. 1)
2. Contrôle de la consanguinité : le produit
commercial est un croisement entre deux lignées
ayant de forts effectifs génétiques efficaces
2. De maîtriser la consanguinité dans la population sélectionnée (fig. 2)
3. De sélectionner à l’intérieur de groupes constitués de façon à maximiser la part de
la variabilité génétique dans la variabilité des performances observées (fig. 3)
Journée Sélection Génétique
5
COMMUNICATION 1 : La sélection de la Truite – Programme PROSPER
4. De sélectionner par éliminations progressives en compétition avec des animaux de
même poids moyen (fig. 4)
Ce programme a été mis en œuvre à partir de 1986 dans les structures de l’INRA et à la
SEMII (Inra-Ifremer) sur deux lignées de truite commune (Salmo trutta) par B. Chevassus
et des collaborateurs. La sélection est effectuée sur la longueur totale du poisson, qui
est très corrélée au poids et plus facile à mesurer précisément sur un grand nombre
d’individus en conditions de terrain.
Après 5 générations de sélection, le gain de poids
observé est en moyenne de 13% par génération, variant
de 10 à 25 % selon les mesures.
On observe peu de variations sur la qualité du produit, si
ce n’est une légère modification du format
(augmentation de la taille de la tête et de l’axe
vertébral). Il est remarquable de constater qu’il n’y a
aucune augmentation de la composition corporelle (pas
d’augmentation des lipides)
3. Groupes optimaux : nombreux
mâles (variance génétique
maximum, femelles triées par taille
d’œufs (effets maternels minimaux)
Par ailleurs, un test en compétition sur l’une des lignées
semble montrer que les poissons sélectionnés ne
montrent pas de surcroît d’agressivité par rapport aux
témoins.
La variabilité génétique est en grande partie
préservée (à plus de 95% en mesurant avec
des marqueurs génomiques), ce qui montre
que les mesures prises pour éviter la
consanguinité ont été efficaces.
Pour ce qui est de l’efficacité alimentaire,
aucune modification n’est détectable entre
témoins et sélectionnés, ce qui signifie que
l’indice de consommation est le même entre
les deux lignées, et sous un autre angle que
le surcroît de croissance observé chez les
sélectionnés est dû uniquement à une
capacité d’ingestion supérieure.
PETITS
éliminés
GROS
MOYENS
période de
croissance
GROS
4
cycles
MOYENS
PETITS
(éliminés)
4. Contrôle des interactions sociales : épreuves
répétées sur groupes triés
Ce programme est donc un succès, et son
application à d’autres espèces (truite arcen-ciel, bar, daurade, turbot, carpe) est en cours. Par ailleurs, il faut maintenant
étudier plus en détail les différentes hypothèses sous-jacentes et l’effet de chacune des
mesures prises afin de pouvoir proposer des simplifications et/ou des améliorations du
processus, car si l’ensemble est efficace, il est possible que certaines parties du
protocole soient inutiles, et au contraire que d’autres soient insuffisamment
contraignantes.
Journée Sélection Génétique
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Organisation des
professionnels dans
l'amélioration génétique
en France
P. HAFFRAY – SYSAAF
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
RESUME
Depuis 1991, 16 entreprises piscicoles et conchylicoles françaises innovantes se sont
organisées dans le cadre du SYSAAF pour disposer d’un appui technique spécialisé en
matière d’amélioration génétique et sanitaire des cheptels de truite arc-en-ciel, de
truite fario, d’omble de fontaine, de bar, de turbot, de daurade et d’huître creuse. Ce
travail de transfert est réalisé en étroite concertation avec le Ministère de l’Agriculture,
l’INRA et l’IFREMER.
Après la présentation du contexte international et national, la présentation se
focalisera sur les modalités techniques et financières de la mise en œuvre des schémas
de sélection, sur le fonctionnement du syndicat ainsi que sur les autres services
développés par le SYSAAF pour répondre aux attentes des sélectionneurs d’espèces
aquacoles :
● Amélioration de la reproduction (induction de la ponte, conservation et congélation
de sperme),
● Optimisation de la triploïdisation et contrôle de ploïdie,
● Développement de méthodes de mesures sur la qualité,
● Introduction d’une gestion généalogique en sélection assistée par empreintes
génétiques.
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Organisation
Organisation des
des professionnels
professionnels français
français
pour
pour l’amélioration
l’amélioration génétique
génétique
des
des espèces
espèces aquacoles
aquacoles
Pierrick
Pierrick HAFFRAY
HAFFRAY
SYSAAF,
SYSAAF,Section
SectionAquacole,
Aquacole,Station
StationSCRIBE,
SCRIBE,Campus
Campusde
deBeaulieu,
Beaulieu,35
35042
042RENNES
RENNES
Tel
Tel::02
0223
2348
4853
5378
78;;Fax
Fax::02
0223
2348
4856
5660
60;; Mel
Mel::[email protected]
[email protected]
Syndicat
Syndicat des
des Sélectionneurs
Sélectionneurs Avicoles
Avicoles et
et Aquacoles
Aquacoles Français
Français
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Pourquoi le SYSAAF ?
• Gros animaux
• Bovins, ovins, équins, porcins (3,5 Mt viande + 34 Mt lait)
• Fécondité femelle faible
• Evaluation du progrès et transfert par la voie mâle
• Programmes de sélection lourds ⇒ Programmes publics
• Loi sur les animaux d’élevage (1966), soutien annuel (100 MF)
• Petits animaux
• Volailles, poissons de chair (2,3 Mt viande + 1 Mt oeufs)
• Fécondité femelle importante
• Programmes de sélection légers ⇒ Programmes privés
• Soutien du Ministère de l’Agriculture au SYSAAF (2,3 MF)
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Un syndicat professionnel depuis 1952
• 1952 : SNAA - Syndicat National des Aviculteurs Agréés
• 50-60 entreprises
• 1955 : Collaboration INRA
• Sélection généalogique au Magneraud (M. Cochez)
• Spécialisation (croissance rapide ou lente, coquille colorée)
• Atelier mécanographique de calcul informatique
• 1968 : Implantation à Nouzilly
• 1976 : SYSAF - Syndicat des Sélectionneurs Avicoles Français
• 6 entreprises
• Cession des lignées INRA chair à l’ISA et femelle Label à la SASSO
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Section aquacole, quelques dates …
• 1990-1991 : Audit SYSAAF (ministère de l’agriculture)
• 21 juin 1991 : Création de la section aquacole
Mollusques
Poissons marins
Nombre d'entrepr ises
16
Salmonidés
14
12
10
M ollusques
8
Poissons marins
6
Etangs
4
Salmonidés
2
2 00 1
2000
19 9 9
1 9 98
1997
1 99 6
1995
19 9 4
1 9 93
1992
1 99 1
1 9 90
0
• 5 mai 1993 : Extension aux poissons marins
• 5 juin 2001 : Extension aux mollusques
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
16 PME innovantes….
• Ecloseurs : Poissons du Soleil (34), Elsamer (29), Grainocéan (17), Satmar (50),
SODABO (44), Vendée naissain (44)
• Sélectionneurs : Ecloserie Marine de Gravelines (59), Ferme Marine du Douhet
(17), France Turbot (85), Furic Piscicultures (29), Font Rome Pisciculture (07), Les
Aquaculteurs Bretons (29), Les Aquaculteurs Landais (40), Pisciculture de Ménaouen
(29), Pisciculture des Fontaines (38), Viviers de France (40)
% juvé nile s franç ais
100
70 à 100 % des
juvéniles français
d’écloserie
80
60
40
20
0
Truite aec
Bar
Daurade
Turbot
Fario de
mer
O. de
fontaine
Huître
creuse
⇔ 600 MF de C.A.
dont 80 à l’export
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Le SYSAAF en 2002
• Syndicat professionnel ; 30 PME
• Sélection de 135 lignées avicoles et de 18 lignées piscicoles
• Poule, dinde, pintade, canard de barbarie, oie, canard commun, faisan, pigeon,
caille, perdrix rouge, perdrix grise.
• Truites arc-en-ciel et fario, turbot, bar, daurade, omble de fontaine, huître creuse.
• Traitement statistique des données sous BLUP modèle animal avec 3
stations de travail sous UNIX (VCE, PEST, SAS), caractères continus et discrets
• 9 salariés : 7 ingénieurs, 1 vétérinaire, 1 attachée de direction
• Budget section aquacole: 1,5 millions de Francs
Expérimentations
Ministère Agriculture
Contrats R&D
35%
39%
7%
8%
Fonctionnement
85%
26%
Ressources
Cotisations
Dépenses
Salaires
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Le SYSAAF, un Centre Technique
• Accord cadre INRA-SYSAAF
• 2 implantations administratives et techniques
• INRA Nouzilly (SRA)
• INRA Rennes (SCRIBE)
• Directeur INRA
• Appui technique spécialisé :
• Reproduction et congélation de laitance
• Monosexage et polyploïdisation
• Gestion de la variabilité génétique et sélection
• Sanitaire
• Innovation
• Organisme de formation professionnelle (n°24 75 01150 37)
• Certification des lignées reconnue par la CNLC
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Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Amélioration de la reproduction
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Service « Reproduction»
• Développement de dilueurs Maturfish®, Storfish®, Ovafish®, Actifish® et
Cryofish® (Licence INRA-IMV-SYSAAF)
100
% motilité
80
Effet du Storfish® sur la motilité de la laitance
de néomâles (n = 44)
60
40
20
0
Avant incubation
Après incubation
• Induction de la ponte par GnRH (Coll. Breton)
• Injection, implants ou microbilles (Ovaprim®, Reproboost®, Décapeptyl®)
• Etude clinique / Dossier d’AMM Reprozan® pour Intervet
100
% ovulation
80
Essai 1 (n = 45)
60
Essai 2 (n = 10)
40
Ovulation de 3 lots de truites fario
traités par Reproboost® (Coll. SEMII)
Essai 3 (n = 39)
20
0
0
5
6
7
9
10
11
18
19
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Congélation de laitances
• SYSAAF membre fondateur de la Cryobanque Nationale
• Développement du dilueur de congélation Cryofish® (licence INRAIMV-SYSAAF ; www.imv-technologies.com )
fécondance (%)
100
Mounib (1978)
Dilueurs Cryofish IMV
80
60
40
*
*
*
20
0
essai 1
essai 2
essai 3
essai 4
Fécondance de spermes congelés de truite (n = 7 à 30)
(Maisse et al, 1998)
• Formation du personnel et congélation sur site
• Impression de paillettes (Domino, 3600 paillettes / h)
• Remplissage et soudure automatisés (MRS1, 4000 paillettes / j)
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Transfert de la triploïdisation
et du monosexage
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Triploïdiser = Féconder en conservant 100 %
du matériel génétique de la mère
Triploïdisation… ⇒ n + n + n = 3 n
Fécondation classique…. ⇒ n + n = 2 n
n
n
n
Expulsion normale du
2ème globule polaire
(50 % des
chromosomes
maternels)
Spermatozoïde
(50 % des
chromosomes
paternels)
Inhibition de
l’expulsion du 2ème
globule polaire
(température, pression)
Ovocyte II (50 % des
chromosomes
maternels)
X
n
nn
Expulsion du
2ème globule
polaire
Expulsion du 2ème globule polaire chez la carpe
(Hollebecq et Haffray, 1994)
Expulsion du 2ème globule polaire chez la carpe
(Hollebecq et Haffray, 1994)
Huître (2n = 20) ; turbot (2n = 44) ; Bar (2n = 48) ; Daurade (2n = 48) ; Truite arc-en-ciel (2n = 60) ;
Omble de fontaine (2n = 84) ; Carpe (2n = 100)
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
90 % des végétaux cultivés sont issus
de polyploïdisation !
2n gyno ou androgenètique
maïs, chou fleur, colza riz, asperge,
piment, melon, courgette
4n : blé dur (semoules et pâtes), pomme des
terre, orge, poireaux, griottes, arachides, café
arabica, tabac, coton, ray-grass, dactyles,
fétuques, luzerne, trèfle violet
6n : blé tendre
(panification, aliment du
bétail), ail à grosse tête,
kiwi, prune
3n : betterave à sucre,
pomme, banane,
pamplemousse, orange,
clémentine, citron vert
8n : fraise (Bel Rubby,
Gariguette, Favette,
Elsanta, Pajaro)
Aneuploïdes
canne à sucre
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Triploïdiser pour une aquaculture durable
FAO
Guide Technique pour une
Aquaculture Responsable
NASCO
ICES
ftp://ftp.fao.org/fi/document/tech
Organisation pour la
(Conseil
International
pour
guid/fishaqu5.pdf
Conservation du Saumon de
l’Exploitation
de
la
Mer)
Article 9.3. : p 21 et 22
l’Atlantique Nord, Résolution
Code de Bonne Pratique de
d’Oslo de Juin 1994
l’Introduction et du Transfert
www.nasco.uk, § 16
des Organismes Marins 1994
( UE, USA, Canada, Norvège,
www.ices.dk/pubs/itmo.pdf
Islande, Russie)
Conseil Supérieur de la Pêche
www.peche.org/csp/csp.htm
Journées d’Information
Scientifiques et Techniques des
23 et 24 novembre 1994
Greenpeace
Stérilisation des OGM en
association avec des mesures
de confinement stricts
www.greenpeace.org/geneng/re
ports/bio/bioO16.htm
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Contrôle de ploïdie par cytofluorimétrie
(Lecommandeur et al., 1995)
• Cytomètres Partec CA II et PA II
N b de poissons a nalysé s
• 40 000 poissons contrôlés depuis 1993 (embryon ou nageoire)
14000
12000
10000
S e rvi ce E a u Dou c e
8000
S e rvi ce E a u de M er
6000
R& D E a u Douc e
R& D E a u de M er
4000
2000
0
1992
19 93
199 4
1995
1 996
199 7
1998
1 999
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Développement de la stérilisation
• Développement de prototypes de traitement hyperbare (5 l ;
www.quiri.com ) et validation sur 7 sites trutticoles
100
100
80
Tr aitem e nt
th erm iqu e
60
Tr aitem e nt
hy p erb a re
40
% triploïdie
120
75
50
25
20
0
0
% s urvie
1
% 3n
14
27
40
53
66
79
92
Efficacité relative des traitements hyperbares (96 lots) sur les traitements thermiques
(20 lots) en 1999 (n = 50 à 100 alevins / lots)
• Segmentation du marché de la truite (SCEES, 1998)
⇔ 12 000 T de 3n en 2001
1991
17 %
Por tion ( 17 0-3 00 g)
3%
1997
12%
50%
File t ( 30 0 - 25 00 g)
38%
8 0%
Fuma ge ( > 25 00 g)
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Transfert de la méthodologie de sélection
Prosper pour améliorer la croissance
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Transfert de Prosper
• 18 lignées sélectionnées en 2000 dont 13 selon « Prosper » truite
20
18
16
14
12
10
8
6
4
2
0
Lignées « Prosper »
2000
1999
1998
1997
1996
1995
1994
1 9 93
1 9 92
Autres lignées
1 9 91
Nom b re de ligné e s
arc-en-ciel et fario, bar, turbot et daurade
• Adaptation de « Prosper » à la biologie de la reproduction et à la
zootechnie du turbot, du bar et daurade
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Développement de méthodes de mesure de la
qualité indirectes
• Prédiction du rendement à l’éviscération (Haffray et al., 1999)
peau
Estimation indirecte par
ultrasons 7, 5 MHz
e8
muscle
paroi
abdominale
cavité
abdominale
r2 multiple = 0,5
• Prédiction % lipides musculaires (Collewet et al., 2001)
Estimation indirecte
par micro-ondes
avec le Torry Fish
Fat Meter
r2 = 0,71
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Quelques chiffres sur le travail du
sélectionneur…
• Nombre moyen de parents / lignée (truite) : 85 pères et 75 mères
• Nombre de candidats / lignée (truite) : 54 000 filles et 17 000 fils
• Effectifs retenu en fin de sélection : 600 filles et 350 fils
• Nombre de troncatures pilotée / an / SYSAAF : 60
• Nombre de mesures / génération / lignée : 150 000 à 200 000
• Création d’une nouvelle génération : 10 équivalents hommes jours
• Tri qualité : 18 hommes jours
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Coût de le sélection
• Coût à l’échelle de l’entreprise
• Investissement : 1 à 2 MF (40-50 bassins pour 2 souches)
• Fonctionnement : 200 kF à 1 MF
• Coût à l’échelle de la filière française
0,37
0,40
0,35
F / kg
0,30
0,25
0,20
0,15
0,10
0,05
Coût F / kg
0,08
0,05
0,00
Salm onidés
Poissons
m arins
Total
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Introduction d’une gestion généalogique de la
ressource génétique
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
22
COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Transfert du génotypage aux sélectionneurs
Tu1-125
Tu1-174
• Identification des échantillons
• Extraction et conservation de l’ADN
• PCR et séquençage en multiplex
• Caractérisation allélique
• Reconstitution informatisée des
généalogies
Tu3-8
Tu4-14
Tu - 152
standard de taille
GIE Labogéna
Tu5-111
2
1
Sélectionneur
SYSAAF
3
• Application d’un schéma de sélection
• Identification par transpondeur
• Prélèvement d’ADN
• Constitution du fichier de généalogies
• Choix informatisé des reproducteurs
• Proposition de plans d’accouplements
• Plans d’accouplements optimisés / apparentement et EF
• 5400 poissons génotypés depuis 1999
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Génotypage d’un noyau sélectionné de truite
arc-en-ciel (SYSAAF, Labogéna, INRA, CIPA, OFIMER)
Novembre 1999 : Reproduction
200 parents + prélèvement ADN
Avril 2001 : Prélèvement d’ADN de 400
filles (+ 100) et 300 fils sélectionnés
Sélection Prosper ; p = 3% / longueur
Génotypage (été 2001)
200 parents
400 filles et 300 fils
• Mesures de qualité : P, L, k, gras musculaire, épaisseur musculaire
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
23
COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France
Composition du noyau sélectionné
• Représentation des parents dans la descendance :
• 89 pères sur 100 et 76 mères sur 82
• Perte de variabilité génétique
• Effectif efficace Ne = (4 * Nm * Nf) / (Nm + Nf)
• Ne initial = 181,8
• Ne sélectionné = 122,9
• Coefficient de consanguinité F = - 1 / 2Ne = - 0,04 %
• Conservation de 99,6 % de la variabilité génétique à la
génération suivante
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
10 ans de transfert
• Transfert de Prosper et sélection sur la qualité (5 espèces, 12
souches) à 70% à 100% de la production française
• + 10 % de poids attendu / génération
• Gestion de la ressource génétique nationale
• Réseau de 16 PME et 20 techniciens et ingénieurs
• Interface « recherche-professionnels » active et démultiplication
d’un soutien public
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
24
Bases pour l'amélioration
génétique de la CARPE
COMMUNE en France
D. VALLOD – ISARA
Journée Sélection Génétique
25
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
RESUME
Dans l’optique d’une sélection des carpes sur leur aptitude à la transformation nous
avons envisagé le développement de critères indirects de rendements en filetage liés à
la conformation des poissons et mis en place un protocole de testage de souche dans le
cadre d’un programme «Agriculture Demain» (1996-2000).
En première approche, nous avons réalisé une caractérisation préalable de la diversité
génétique et de la variabilité des rendements des carpes élevées en France et d’autre
part des comparaisons avec des carpes issues de quelques pays producteurs des pays de
l’Est.
Les premiers résultats obtenus ont montré que :
● Les ressources génétiques des carpes françaises sont peu différenciées entre les
populations observées mais les populations françaises sont différentes des populations
tchèques, et aussi variables à l’intérieur de chaque population que ces dernières.
● Il est très difficile d’identifier des morphotypes (souche) plus ou moins performants.
En 1998, un protocole de testage de performances de 3 souches (Dombes, Forez,
Brenne) a été mis en place sur des structures situées en Dombes et en Région Centre
(SEPIB). Ce testage a été réalisé à partir de carpes de même âge, produites dans un
environnement contrôlé par témoin interne (carpe recouverte d’écailles)
De nombreuses mesures ont été réalisées sur les carpes de 2 étés issues de ce testage :
pesées, taux de survie, longueur du corps et de la tête, hauteur du corps, rendement de
filetage, poids des viscères et des gonades, prélèvement d’écailles pour des analyses
d’ADN, prise de vues pour des analyses morphologiques, …et nous pouvons présenter les
principaux résultats.
Les perspectives envisagées pour les prochaines années, après concertation entre
chercheurs et producteurs pourraient engager un travail de sélection au travers de :
● La mise en place d'une gestion rationnelle de la ressource génétique carpe
● La reprise éventuelle d'une comparaison de souches avec des poissons plus
différenciés
● L’estimation des paramètres génétiques : peut-on améliorer un caractère
(croissance, rendement, morphologie) par sélection ?.
● La mise en place d'une sélection sur le rapport H/L pour améliorer le rendement en
filet.
Journée Sélection Génétique
26
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
BASES TECHNIQUES et
SCIENTIFIQUES pour
l’AMELIORATION GENETIQUE
de la CARPE COMMUNE
en FRANCE
Programme
Agriculture Demain
1996-2000
Dominique VALLOD
ISARA – 31, place Bellecour 69288 LYON cedex 02
Tel : 04.78.92.69.83. – Fax : 04.78.92.69.75. – e-mail : [email protected]
Journée Sélection Génétique
27
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
Objectif
¬la recherche des meilleures souches de
carpe par rapport à leur aptitude au filetage...
pour proposer aux éleveurs
:
• une ou deux populations adaptées aux
attentes du marché,
• des méthodologies de gestion et
d’amélioration des ressources génétiques
Programme Agriculture Demain
Partenaires
• ADAPRA (Association pour le Développement de
l’Aquaculture et de la Pêche en RhôneRhône-Alpes)
• INRA (Laboratoire de Physiologie des Poissons de Rennes,
Laboratoire de Génétique des Poissons de Jouy)
• SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles
Français)
• ITAVI (Cellule Technique Aquacole Nationale)
• UNIVERSITE LYON I (Ecologie des Eaux Douces et des
Grands Fleuves)
Programme Agriculture Demain
Coût: 1 300 KF HT
• Ministère Recherche : 650 KF
• Ministère Agriculture : 120 KF
• Région Rhône-Alpes : 240 KF
• Autofinancement : 560 KF
Journée Sélection Génétique
28
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
Étapes réalisées
• Inventaire des populations de carpe en France
et à l'étranger,
• Caractérisation génétique,
• Analyse de leur morphométrie,
morphométrie,
• Étude des rendements
(éviscération et filetage),
de
transformation
• Testage de performances de 3 souches à 2 étés.
Protocole du testage
¾ Trois souches de carpe commune élevées dans des conditions
contrôlées : réplicat bassin, réplicat site d’élevage, témoin interne intrabassin demi-frère à écaille, alimentation, ...
¾Testage des performances de croissance après 1 an et 2 ans
d’élevage sur l’ensemble des poissons
¾Étude des rendements de transformation sur un échantillon
¾Étude des morphologies sur un échantillon par mesures de
longueur, poids, … et calcul de données à partir d’images
numériques des carpes à l’abattage
Les souches testées
Γ Brenne
Γ Forez
24 Γ /souche
Γ Dombes
Ε Dombes
Journée Sélection Génétique
29
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
► Présentation des étapes des travaux réalisés
Pêche des géniteurs
Mai 1998
Reproduction artificielle
Fécondation
Écloserie P. DANNANCIER
Mise en bouteilles de Zoug
Vésicules Résorbées
Écloserie P. DANNANCIER
Journée Sélection Génétique
30
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
Carpes de 1 été
Pêche des carpes de 1été
•Brenne
•Forez
•Dombes
Octobre
1998
Témoin interne
Station IRRA
3 cm
Pêche à 2 étés
Octobre
1999
COOPEPOISSON
Stockage avant transformation
des carpes
COOPEPOISSON
Journée Sélection Génétique
31
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
► Mesures des poissons
Longueur / Hauteur / Pesée/ ADN
Analyse morphologique
Échographie et prédiction du
rendement
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
► Présentation des résultats
Résultats
• validation de l’intérêt du témoin interne pour
améliorer l’interprétation de la procédure de testage
par standardisation des effets environnementaux
•pas de différences de croissance à 5 semaines,
1 été et 2 étés entre les trois souches françaises
testées.
Croissance à 2 étés
Po id s so u ch e te stée (g )
2 500
2 000
Bre n n e
1 500
Dombes
F o re z
1 000
y=x
500
-
500
1 000
1 500
2 000
2 500
P o id s t é m o in ( g )
Exemple de comparaison sur le facteur croissance
Journée Sélection Génétique
33
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
Résultats
• survie entre souches globalement identique
• peu de différence entre les trois souches françaises testées
pour la plupart des caractéristiques morphologiques :
longueur, coefficient de condition, épaisseur moyenne du
filet, ...
• pas de différence entre les trois souches françaises testées
pour les caractéristiques de transformation :
rendement carcasse, rendement filet, rapport gonadosomatique, poids de la tête, …)
• caractères montrant une différence :
• hauteurs : Forez>Dombes>Brenne
• angles caractérisant la « bosse » du poisson : Forez
>Dombes> Brenne
• pas de relation nette entre morphologie de la
souche et rendements
Journée Sélection Génétique
34
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
Différences morphologiques
• différences observées pour les hauteurs maximales
correspondant à un développement des viscères et/ou à un
développement de la partie dorsale
Ddéveloppement dorsal du à un accroissement de tissu
musculaire ou de tissu adipeux (cas des carpes tchèques)
Dsouche la plus haute : Forez (Dombes intermédiaire)
Dpas de corrélation avec le rendement de filetage
Deffet environnemental dominant
• différences observées pour certaines longueurs du corps :
Ddéveloppement du tronc, allongement du pédoncule
caudal
Dsouche à longueur de tronc la plus faible : Forez
Dsouche à pédoncule caudal le plus long :Dombes
Dcorrélation positive avec le rendement de filetage
Deffet d’origine génétique, en faveur de l’origine Dombes
• différences observées pour l’angle du profil dorsal entre la
tête et la nageoire dorsale
Dtraduisent des différences de hauteur
Dsouche à angle le plus fort : Forez (Dombes
intermédiaire)
Dcorrélation positive avec le rendement de filetage
Dpas d’effet d’origine génétique
Journée Sélection Génétique
35
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
La souche «idéale»
hcarpe miroir
hallongée
hà petite tête
•la rechercher parmi les souches européennes voire asiatiques
•la «créer» par sélection puisque le rapport L/H est héritable chez la
carpe
Mais effet sur le rendement filetage hypothétique :
- il y a bien un effet souche
- mais pas de relation avec des caractères mesurables
sur le poisson vivant
Perspectives
• Mettre en place une gestion rationnelle de
la ressource génétique
•Reprendre une comparaison de souches avec
des poissons plus différenciés
•Engager une sélection sur le rapport H/L pour
améliorer le rendement en filet.
Journée Sélection Génétique
36
COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France
Quelques compléments…
• Génétique des populations de carpe
– Populations françaises très peu différenciées
– Populations françaises différentes des Tchèques
– Ensemble européen assez homogène (certaines
souches de pisciculture très consanguines)
– Europe ≠ extrême Orient (Koï, Chine, fleuve
Amour)
• Sélection pour rapport H/L (Ankorion et al., 1992)
– Bonne héritabilité (0.47 vers haut, 0.33 vers bas)
– Association positive possible entre poisson allongé
et bonne croissance pondérale
• « PROSPER Carpe » en Rép. Tchèque
– Débuté en 2001
– Objectif : sélection divergente L et H/L + lignée
témoin non sélectionnée
– Estimation d’héritabilité à 8 semaines
– G1 disponible en 2003 ou 2004 – à tester
Journée Sélection Génétique
37
Journée Sélection Génétique
38
Amélioration des méthodes
d'élevage de l'OMBLE
CHEVALIER
et mise au point d'un
HYBRIDE truite fario et
omble chevalier
C. GILLET – INRA
Journée Sélection Génétique
39
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
RESUME
L’omble chevalier (Salvelinus alpinus) est une espèce adaptée aux eaux très froides qui
vit actuellement dans la plupart des cours d’eau et des lacs dans les pays qui bordent
l’océan arctique. En France, cette espèce relique de l’aire glacière n’existait à l’origine
que dans quelques lacs subalpins de la région Rhône Alpes. Ce poisson peut s’élever en
salmoniculture à condition de disposer d’eau très froide. En région de montagne,
l’élevage de l’omble chevalier présente un intérêt certain pour les salmoniculteurs
désirant diversifier leur production.
Depuis plusieurs années, la station d’hydrobiologie lacustre de l’INRA à Thonon
entreprend des recherches sur cette espèce, initialement dans le but de développer le
pacage lacustre puis pour évaluer l’aptitude de l’omble à l’élevage en salmoniculture.
Le bilan des travaux réalisés dans ce domaine fait apparaître que l’omble chevalier
présente une bonne aptitude à l’élevage en eau froide (température inférieure à 10 °C)
au cours de la première année de grossissement. Par la suite, il se produit fréquemment
une baisse sensible des performances zootechniques des poissons (en terme de taux de
croissance, d’indice de transformation de l’aliment et de survie) survenant
généralement au début du deuxième été lorsque les poissons les plus précoces
commencent à développer leurs gonades. Ce phénomène est lié, au moins
partiellement, à l’établissement d’une hiérarchie dans les bassins, entraînant une baisse
des performances chez les individus dominés. Au-delà du stade poisson portion, l’omble
chevalier s’élève difficilement en pisciculture car la mortalité pendant et après la
reproduction est très élevée.
Nous avons réussi à produire des individus stériles en soumettant l’œuf à un choc
hyperbare à 650 atmosphères, 40 minutes après la fécondation ce qui induit la triploïdie
par rétention du second globule polaire. Cependant, cette pratique n’améliore pas les
performances zootechniques (croissance et survie) des ombles chevaliers triploïdes au
cours de la troisième année d’élevage par rapport à celles des témoins diploïdes. Nous
avons réalisé avec succès l’hybridation entre la truite fario femelle (Salmo trutta) et
l’omble chevalier mâle (Salvelinus alpinus). L’hybride est viable à l’état diploïde aussi
bien qu’à l’état triploïde. La survie au stade oeillé est de 88% chez la fario, 77% chez
l’hybride diploïde et 58% chez l’hybride triploïde. Entre le stade alevin et le stade
poisson portion, l’hybride grossit plus vite que les deux espèces parentales dans les
piscicultures où la température de l’eau dépasse 8°C, tandis qu’il grossit moins vite que
l’omble chevalier dans un élevage où la température de l’eau reste inférieure à 7°C
toute l’année. L’hybride est stérile, ce qui lui permet d’atteindre une taille important
sans subir les mortalités qui affectent les espèces parentales pendant la période de
reproduction.
Dans l’avenir, des recherches devront être entreprises pour identifier parmi les
nombreuses populations naturelles d’omble chevalier, les souches les plus aptes à
l’élevage.
Journée Sélection Génétique
40
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
► Amélioration des méthodes d’élevage de l’omble chevalier
► Etude de l’intérêt aquacole de l’hybride entre la truite
fario femelle et l’omble chevalier mâle
Christian Gillet, INRA Station de Thonon, Avenue de Corzent 74200 Thonon-les-Bains
Tél : 04.50.26.78.28. – Fax : 04.50.26.07.60. - E-mail : [email protected]
Contexte et historique des travaux de recherche sur l’omble chevalier
L’omble chevalier (Salvelinus alpinus) est une espèce adaptée aux eaux très froides qui
vit actuellement dans la plupart des cours d’eau et des lacs dans les pays qui bordent
l’océan arctique.
En France, cette espèce relique de l’aire glacière n’existait à l’origine que dans
quelques lacs subalpins de la région Rhône Alpes. Ce poisson peut s’élever en
salmoniculture à condition de disposer d’eau très froide. En région de montagne,
l’élevage de l’omble chevalier présente un intérêt certain pour les salmoniculteurs
désirant diversifier leur production.
Photo d’un mâle de quatre ans en période de reproduction à la pisciculture de l’INRA
Depuis plusieurs années, la station d’hydrobiologie lacustre de l’INRA à Thonon
entreprend des recherches sur cette espèce, initialement dans le but de développer le
pacage lacustre puis pour évaluer l’aptitude de l’omble à l’élevage en salmoniculture.
Dans tous les lacs subalpins affectés par l’eutrophisation, les captures d’ombles
chevaliers ont fortement décliné au cours du vingtième siècle. C’est le cas en
particulier pour le Léman et le Bourget.
La dégradation du sédiment des zones profondes ne permet plus à l’omble de se
reproduire d’une manière satisfaisante car la plupart des œufs avortent avant
l’éclosion. Dans ce contexte, le repeuplement réalisé avec des estivaux d’omble
chevalier s’est traduit par une nette amélioration des captures. C’est le cas dans le
Léman où un programme de pacage lacustre à été initié au cours des années 80. Les
recherches ont d’abord porté sur l’amélioration des méthodes de production d’estivaux
en condition d’élevage intensif. Puis la capacité de production de la pisciculture de la
DDAF à Rives a été améliorée pour permettre d’y produire plus de 1.000.000 d’estivaux.
Journée Sélection Génétique
41
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
En conséquence, les captures d’omble chevalier dans le Léman ont été multipliées par
10 entre 1980 et 1995. Il existe une corrélation très forte (r>0.9) entre la quantité
d’estivaux déversés dans le Léman et les captures réalisées 3 ans plus tard par
l’ensemble des pêcheurs (professionnels + amateurs).
Pour développer l’élevage de l’omble en pisciculture de grossissement jusqu’à des
stades destinés directement à la consommation, il s’est avéré nécessaire, dans un
premier temps de maîtriser toutes les étapes du cycle reproducteur en condition
d’élevage.
L’ovulation spontanée des femelles ne peut se produire que lorsque l’eau des bassins
est à une température inférieure à 10°C. Les ovulations sont bien groupées lorsque la
température de l’eau est inférieure à 6°C. Au-dessus de cette température, les
processus de surmaturation des ovules s’accélèrent et le rythme des ovulations ralentit
fortement.
Journée Sélection Génétique
42
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
Le bilan des travaux sur le grossissement des ombles chevaliers fait apparaître que ce
poisson présente une bonne aptitude à l’élevage en eau froide (température inférieure
à 10 °C) au cours de la première année de grossissement. Par la suite, il se produit
fréquemment une baisse sensible des performances zootechniques des poissons (en
terme de taux de croissance, d’indice de transformation de l’aliment et de survie)
survenant généralement pour un poids voisin de 100 g., lorsque les poissons les plus
précoces commencent à développer leurs gonades. Ce phénomène est lié, au moins
partiellement, à l’établissement d’une hiérarchie dans les bassins, entraînant une baisse
des performances chez les individus dominés. Le calibrage qui permet d’augmenter
l’homogénéité des lots améliore les performances zootechniques en diminuant les
phénomènes de dominance dans les bassins d’élevage.
Au-delà du stade poisson portion, l’omble chevalier s’élève difficilement en pisciculture
car la mortalité pendant et après la reproduction est très élevée. Nous avons donc
cherché à produire des ombles chevaliers stériles.
Journée Sélection Génétique
43
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
Journée Sélection Génétique
44
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
Recherches sur l’induction de la triploïdie chez l’omble chevalier.
L’œuf de l’omble chevalier ne supportant pas les températures élevées, même
brièvement, il n’a pas été possible de produire des individus triploïdes par la méthode
des chocs thermiques. Nous avons réussi à produire des individus stériles en soumettant
l’œuf à un choc hyperbare à 650 atmosphères, 40 minutes après la fécondation ce qui
induit la triploïdie par rétention du second globule polaire.
Au cours des 600 premiers jours d’élevage, la croissance des ombles triploïdes ne
diffère pas de celle des témoins diploïdes.
Journée Sélection Génétique
45
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
Cependant au cours de la troisième année d’élevage, la triploïdie n’améliore pas les
performances zootechniques (croissance et survie) des ombles chevaliers par rapport à
celles des témoins diploïdes.
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
La triploïdie améliore l’indice de carcasse des femelles car la plupart d’entre elles ne
développent pas de grappe ovarienne contrairement aux mâles qui développent des
testicules bien qu’ils ne produisent pas de laitance.
Journée Sélection Génétique
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COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
Recherches sur l’hybridation entre la truite fario et l’omble chevalier.
D’après les données disponibles dans la littérature scientifique, les poissons du genre
salvelinus peuvent s’hybrider avec ceux du genre salmo et produire ainsi des individus
stériles. Nous avons réalisé avec succès l’hybridation entre la truite fario femelle
(Salmo trutta) et l’omble chevalier mâle (Salvelinus alpinus). L’hybride est viable à
l’état diploïde aussi bien qu’à l’état triploïde, la triploïdie étant induite par un choc
thermique selon la méthode définie pour la truite fario. La survie au stade oeillé est de
88% chez la fario, 77% chez l’hybride diploïde et 58% chez l’hybride triploïde.
Hybride entre la truite fario femelle et l’omble chevalier mâle
Entre le stade alevin et le stade poisson portion, l’hybride grossit plus vite que les deux
espèces parentales dans les piscicultures où la température de l’eau dépasse 8°C,
tandis qu’il grossit moins vite que l’omble chevalier dans un élevage où la température
de l’eau reste inférieure à 7°C toute l’année.
Journée Sélection Génétique
48
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
L’hybride est stérile, ce qui lui permet d’atteindre une taille importante sans subir les
mortalités qui affectent les espèces parentales pendant la période de reproduction. Son
indice de carcasse est toujours supérieur à 90%. Comme chez les ombles triploïdes, la
quasi-totalité des femelles ne développe pas de grappe ovarienne, les rares individus
qui en développent le font tardivement et leurs ovules ne sont pas viables. La plupart
des mâles développent des testicules mais ils ne produisent pas de laitance.
Journée Sélection Génétique
49
COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER
et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier
Perspectives
Dans l’avenir, des recherches devront être entreprises pour identifier parmi les
nombreuses populations naturelles d’omble chevalier, les souches les plus aptes à
l’élevage. Il existe aussi dans les pays scandinaves et en Ecosse des souches
sélectionnées pour leur croissance en élevage qui devront être comparées aux souches
françaises. La mise au point de méthode d’élevage permettant de minimiser les effets
négatifs engendrés par les phénomènes de dominance devrait permettre d’améliorer les
performances des ombles chevaliers en élevage.
L’utilisation d’anti-stress constitue l’une des pistes explorées actuellement pour lutter
contre le stress chronique qui affecte les individus dominés.
Il serait intéressant de réaliser des néomâles pour produire des populations monosexes
femelles car seules les femelles présentent une stérilité gonadique permettant
d’améliorer l’indice de carcasse des individus triploïdes ainsi que celui des hybrides
issus de croisement avec le genre salmo. Les femelles étant généralement matures un
an plus tard que les mâles, l’utilisation de populations monosexes femelles devrait
permettre d’améliorer le bilan zootechnique jusqu’au stade portion chez les individus
diploïdes. Des essais d’hybridations entre l’omble chevalier et le saumon atlantique ont
été réalisés avec succès à l’étranger, il sera intéressant de tester les performances de
cet hybride dans les conditions d’élevage en région alpine.
Journée Sélection Génétique
50
LISTE DES SIGLES
Journée Sélection Génétique
51
LISTE DES SIGLES
ADAPRA
Association pour le Développement de l’Aquaculture et de la Pêche
en Rhône-Alpes
ADN
Acide désoxyribonucléique
CIPA
Comité Interprofessionnel des Produits de l’Aquaculture
CNLC
Commission Nationale des Labels et des Certifications
DDAF
Direction Départementale de l'Agriculture et de la Forêt
DRAF
Direction Régionale de l'Agriculture et de la Forêt
FAO
Food and Agriculture Organization
FLAC
Filière Lorraine d'Aquaculture Continentale
IFREMER
Institut Français pour la Recherche et l'Exploitation de la Mer
INRA
Institut National de la Recherche Agronomique
ISARA
Institut Supérieur d'Agriculture Rhône-Alpes
ITAVI
Institut Technique de l'Aviculture et de l'élevage des petits animaux
LDA
Laboratoire Départemental d'Analyses
OFIMER
Office national Interprofessionnel des produits de la Mer et de l’aquaculture
OGM
Organisme Génétiquement Modifié
PEP
Pôle d’Expérimentation et de Progrès
PME
Petites et Moyennes Entreprises
PROSPER
Procédure de Sélection individuelle optimisée par Epreuves Répétées
SCEES
Service Central des Enquêtes et Etudes Statistiques
SEPIB
Station Expérimentale Piscicole Interrégional du Blanc
SEMII
Station Mixte INRA-IFREMER
SPSE
Syndicat des Pisciculteurs du Sud-Est
SREA
Service Régional d'Economie Agricole
SYSAAF
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français
Journée Sélection Génétique
52
LISTE DES PARTICIPANTS
Journée Sélection Génétique
53
LISTE DES PARTICIPANTS
NOM
PRÉNOM
SOCIÉTÉ
1
AUBRY
Etienne
Pisciculture de la grande La Paquelière
source
73170
St Jean-de-Chevelu
2
BEAL
Mickaël
Pisciculture Font-Rome
BP 25
07200
St Pierre-sousAubenas
3
CADIEU
Gilles
Filière Aquacole
Comtoise -
92 rue Turenne
90300
Valdoie
4
CESAR
David
SCEA PETIT
Pisciculture
Pont Royal
73390
Chamousse
5
CORMORECHE
JeanChristophe
Syndicat des
Pisciculteurs du Sud-Est
25, rue Frédéric
Chopin
26000
Valence
6
CURTET
Marc
pisciculteur-exploitant
Le Bataillard
01240
St Paul de Varax
7
DALLOZ
Jacky
SARL Pisciculture du
Moulin de Pierre
39300
Mont-sur-Monnet
8
DANNANCIER
Pascal
Dombes étangs
Le Moulin neuf
01310
St Rémy
9
DECERIER
Bernard
Pisciculture du moulin
855, route des
étangs
38140
Reaumont
10
DELEURME
Stéphanie
Maison de l'élevage Chambre d'Agriculture
B.P. 59
76232
Bois-Guillaume
11
DESHAYES
Cyrille
CIPA
16, rue de la
Grange Batelière
75009
Paris
12
DESMARTIN
Maurice
pisciculteur-exploitant
14, allée des
Fauvettes
69740
Genas
13
FLEURET
Jean-Loup
Région Rhône-Alpes
78, route de Paris - 69751
B.P. 19
Charbonnières-lesBains
14
GADENNE
Timothée
ADAPRA
5, rue Hermann
Frenkel
69364
Lyon cedex 07
15
GILLET
Christian
INRA
Av. de Corzent
74200
Thonon les Bains
16
GOUNON
Véronique
Pisciculture Font-Rome
BP 25
07200
St Pierre-sousAubenas
17
GRAVILLON
Lionel
Fédération Pêche de
l'Allier
Le Mouil Piat
03250
Serrieres/Sichon
18
GRIOT
Pierre
Ecole d' agriculture de
Poisy-Chavanod
74650
Chavanod
19
GUERRAZ
André
TROUW
38490
Fitilieu
20
HAFFRAY
Pierrick
SYSAAF Station SCRIBE / Campus de
INRA
Beaulieu
35042
Rennes Cedex
21
JACQUEMOND
François
Ecole d' agriculture de
Poisy-Chavanod
74200
Chavanod
22
JOUAN
Yannick
FLAC
57260
Lindre Basse
Journée Sélection Génétique
ADRESSE
1010, route de
Vernay
Domaine de Lindre
54
LISTE DES PARTICIPANTS
NOM
PRÉNOM
SOCIÉTÉ
23
LANGLOIS
Ingrid
Pisciculture des sources
de l'Archiane
24
LAURENT
Emmanuel
technicien aquacole
25
LAVIROTTE
Gilles
Ass. Pisciculteurs de
Dombes
26
LIMANDAS
Gilbert
Chambre d'Agriculture
27
MARGERIT
Paul
28
MOISSONNIER
29
ADRESSE
26410
Treschenu
69140
Vancia
01320
Chalamont
4, avenue du
Champ de Foire
01000
Bourg en Bresse
Pisciculture de la
Fabrique
40, chemin de
Robinson
26000
Valence
Guy
Ass. Promotion poisson
de Dombes
Les Roussières
01240
Saint-Paul de Varax
MORAND
Marc
LDA JURA
Bd Théodore
Vernier B.P. 376
39016
Lons le Saunier
Cedex
30
MOULLET
Gérard
Pisciculture Font-Rome
26400
Beaufort/Gervanne
31
MURGAT
Laurent
S.A MURGAT
Beaufort
38270
Beaurepaire
32
NIVOT
Patrick
Chambre d'Agriculture
4 rue Carnot
01330
Villars les Dombes
33
NOUVEL
Philippe
DRAF Rhône-Alpes SREA
Cité Administrative 69401
BP 3202
34
PAYET-PIGEON
Jean Luc
Syndicat Exploitants des Fieutet
Etangs de Dombes
35
POLI
Jean-Michel SEPIB
36
QUIBLIER
Laurent
Chambre d'Agriculture
37
ROMEZIN
Fannie
Pisciculture des sources
de l'Archiane
38
ROURE
JeanFrançois
Pisciculture Font-Rome
39
TEPPE
Jérôme
GAEC Pisciculture TEPPE 731, chemin de
Jouffroy
40
TROIN
Bernard
Syndicat des
19, rue des Manoirs 62690
Salmoniculteurs du Nord
Savy-berlette
41
VALLOD
Dominique
ISARA
31, Place Bellecour 69002
Lyon
42
VANDEPUTTE
Marc
INRA Laboratoire
Génétique des Poissons
Domaine de Vilvert 78352
Jouy en Josas
Journée Sélection Génétique
22 place des
Hirondelles
Lyon cedex 3
01320
St Nizier le Désert
Les Ages
36300
Le Blanc
4, rue Carnot
01330
Villars les Dombes
26410
Treschenu
07200
St Pierre-sousAubenas
01310
Polliat
BP 25
55
ACTIPOLE AGRICULTURE – 5, rue Hermann Frenkel 69 364 Lyon Cedex 07
Téléphone : 04 72 72 49 66 – Fax : 04 72 72 49 26