Projet : « Vers un thésaurus de la Biodiversité

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Projet : « Vers un thésaurus de la Biodiversité
Projet : « Vers un thésaurus de la Biodiversité »
Introduction
Atelier conjoint du Réseau « Bases de données »
(Mission pour l’Interdisciplinarité du CNRS) - CESAB
« Vers un thesaurus de la biodiversité »
L’une des caractéristiques des données de la biodiversité est leur grande hétérogénéité, qui constitue
un obstacle majeur à leur intégration et à leur réutilisation concertées. Cette hétérogénéité résulte
notamment de la façon dont est conduite la recherche dans ce champ disciplinaire : s’il y a bien
quelques études très coordonnées menées à grande échelle, une grande majorité des données provient
de chercheurs qui travaillent de façon indépendante, ce qui conduit à la constitution de nombreux jeux
de données de petite taille dont la forme et le contenu peuvent être spécifiques à chaque thématique,
voire à chaque équipe ou chercheur. La mise au point d’un thesaurus de la biodiversité constitue une
première étape vers la résolution de l’hétérogénéité sémantique ce ces données. Cette dernière
correspond à la nature diverse des données, à la multiplicité des termes, et plus largement des
concepts, utilisés dans les sciences de la biodiversité, et qui rend difficile l’interopérabilité des
données existantes.
Cet atelier a lieu dans le cadre du volet « Interopérabilité » du Réseau « Bases de données » de
la Mission pour l’Interdisciplinarité du CNRS (« action 2P ») auquel contribue le CESAB.
Objectifs
Les principaux objectifs de cet atelier sont :
(1) de mettre en commun les approches de différents acteurs concernés par le développement et
l’utilisation d’un thesaurus de la biodiversité : écologues, documentalistes, informaticiens
(2) d’identifier les convergences et divergences dans les démarches suivies par ces différents
acteurs
(3) de mettre en place un programme de travail devant mener à une première version du thesaurus
Lieu
CEntre de Synthèse et d’Analyse sur la Biodiversité (CESAB)
Domaine du Petit Arbois
Aix-en-Provence, France
Date: 18 juin 2014
Personnes à contacter
Eric Garnier : [email protected]
Magali Grana: [email protected]
Projet : « Vers un thésaurus de la Biodiversité »
Contribution Inist-Cnrs (septembre 2014)
Dossier : Etude comparative des principaux thésaurus sur l’Environnement
et de leurs alignements. Propositions pour un thésaurus de la Biodiversité.
Présentation et méthodologie
Cette étude est réalisée dans un but de constitution d’un thésaurus de la Biodiversité,
thématique pour laquelle il n’existe pas actuellement de thésaurus dédié, et contribuera à
enrichir et homogénéiser les métadonnées de la recherche.
Le choix s’est porté plus particulièrement sur 6 thésaurus relatifs à l’Environnement en
insistant sur les initiatives de programmes européens.
Ces thésaurus ont été sélectionnés pour leur pertinence, leur taille ou leur audience
internationale, parmi une liste inventoriant les Ressources terminologiques en sciences de
l’environnement (précédemment établie pour l’Atelier du 18/06/2014 au CESAB).
Les thésaurus sont ensuite étudiés pour les relations qu’ils ont établies entre eux, par des
alignements entre les concepts au sein du web de données, en privilégiant les liens réalisés
dans le nuage des données liées ouvertes (Linked Open Data Cloud).
Les objectifs étant de :
-
pouvoir récupérer certains concepts génériques, dans 1 ou 2 thésaurus sous licence
libre qui serviraient de vocabulaire pivot pour une approche top-down
les enrichir sémantiquement par des synonymies, associations, définitions et
traductions, issues entre autres de nos référentiels terminologiques
compléter les hiérarchies par des termes plus spécifiques à trouver dans la
terminologie de la recherche et dans une approche bottom-up
rendre notre travail visible et interopérable dans le web sémantique en nous alignant à
notre tour avec des thésaurus déjà reconnus internationalement.
Document 1 :
Présentation et méthodologie (présent document)
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
1
Document 2 :
Thésaurus sur l’Environnement : exemples de comparaisons de la richesse des relations
sémantiques
1) Choix du concept : « Biodiversité »
Affichage complet des relations sémantiques pour ce concept dans 10 thésaurus (USGS
Biocomplexity Thesaurus, AGROVOC, EnvThes, GEMET, EARTh, NALT, EuroVoc,
UNESCO, UNBIS, THESAGRI)
2) Choix d’un terme en rapport avec la biodiversité : « *species* »
Liste des descripteurs et des non-descripteurs contenant ce terme pour 7 thésaurus
(EARTh, NALT, AGROVOC, Biocomplexity Thesaurus, GEMET, EnvThes, EuroVoc)
Document 3 :
Sélection de thésaurus du domaine Environnement : comparatif de leur richesse
sémantique
Les 6 thésaurus retenus sont comparés selon une liste de critères faisant ressortir leurs points
forts et leurs points faibles (AGROVOC, GEMET, EARTh, EnvThes, USGS, NALT)
Document 4 :
Tableau comparatif des thésaurus sur l’Environnement pour 2 concepts : Biodiversité et
Ecologie
Nombre termes spécifiques ; Nb termes génériques ; Nb niveaux hiérarchiques ; Nb
synonymes ; Nb termes adjacents (même TG) ; Nb termes associés ; Multilinguisme ;
Définitions ; Concept URI (Linked Open Data) ; Alignements et liens externes ; Liens
réciproques (SKOS/RDF) ; Web services ; Téléchargements ; Licences d’utilisation ; Origine
Document 5 :
Conclusions et recommandations
+ Annexes :
-
Schéma 1 : Les thésaurus sur l’Environnement dans le web sémantique
Schéma 2 : Constitution d’un thésaurus de la Biodiversité
Ressources terminologiques Inist : exemple du descripteur « Diversité biologique »
Indicateurs et variables de la biodiversité : sources de référence
Tableaux de mots-clés extraits des Variables essentielles de la biodiversité et des
Indicateurs de la biodiversité
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2
THESAURUS SUR L’ENVIRONNEMENT
Comparaisons de la richesse des relations sémantiques
1) Concept = Biodiversité
USGS Biocomplexity Thesaurus
(U.S. Geological Survey)
http://nbii-thesaurus.ornl.gov/thesaurus/skosThesaurusSearch2.jsp?termGroup=all&usrTerm=Biodiversity
Results for: Biodiversity
NT Genetic diversity
NT Species diversity
RT Biocomplexity
RT Biological control
RT Biomass
RT Convention on Biological Diversity
RT Natural resources
SC 6FH FIREHouse
Biodiversity
SC ASF Aquatic Sciences and Fisheries
SC CERES CERES thesaurus terms
SC EcoT EcoTourism
SC LSC Life Sciences
SC POL Pollution
UF Biological diversity
UF Ecosystem diversity
UF Habitat diversity
AGROVOC (FAO)
Ancienne présentation
33949 - Biodiversity (EN)
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_33949
BT resources (9001017)
BT Natural resources (5091)
BT Biological resources (92341)
Biodiversity (33949)
NT Agrobiodiversity (37977)
NT Genetic diversity as resource (33952)
NT Natural heritage (37967)
UF Ecosystem diversity
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1
UF
UF
RT
RT
RT
RT
RT
RT
RT
Biological diversity
Species diversity
Biosafety
biodiversity conservation
bioprospecting
Germplasm
Gene pools
ecosystems
Species
Nouvelle présentation (depuis le 25/09/2014)
Biodiversity
CONCEPT TYPE
BROADER CONCEPT
Concept
Biological resources
NARROWER
CONCEPTS
Agrobiodiversity
Genetic diversity as resource
Natural heritage
ALTERNATIVE
LABEL
Biological diversity
Ecosystem diversity
Species diversity
SCOPE NOTE
The variety of life on earth at the genetic, species and
ecosystems levels
HAS COMPONENT
INFLUENCES
IN OTHER
LANGUAGES
Species
ecosystems
BIODIVERSITAET (de)
Biodiversità (it)
Biodiversité (fr)
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2
ecology
CONCEPT TYPE
BROADER CONCEPT
NARROWER CONCEPTS
RELATED CONCEPTS
ALTERNATIVE LABEL
HAS THEME
EXACT MATCH
Concept
biology
agroecology
animal ecology
autecology
chemical ecology
fire ecology
forest ecology
freshwater ecology
human ecology
marine ecology
microbial ecology
Phenology
plant ecology
population ecology
radiation ecology
radioecology
synecology
balance of nature
Biogeography
colonizing ability
Ecological factors
Ecotoxicology
Environmental degradation
environmental factors
Sustainability
bionomics
ecological sciences
environmental biology
ecological succession
ecosystems
environment
ecology EARTh
Ecology STW Thesaurus for
Economics
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3
EnvThes
Environmental Thesaurus (EnvEurope / LTER)
biodiversity (en)
Concept URI
http://vocabs.lter-europe.net/EnvThes3/USLterCV_64
RDF/XML
Definitions
[Henderson's] biological diversity q.v. As defined by the United Nations Convention
on Biological Diversity: “the variability among living organisms from all sources,
including, inter alia, terrestrial, marine, and other aquatic ecosystems and the
ecological complexes of which they are part. This includes diversity within species,
between species and of ecosystems.” The number of different living species is
estimated at between 40 and 80 million, most of them still undiscovered and
uncharacterized, each species containing yet further genetic diversity. (en)
http://en.wikipedia.org/wiki/Species_diversity (en)
Broader Concept
disciplines (en)
biology (en)
Narrower Concept
ecosystem diversity (en)
genetic diversity (en)
species diversity (en)
Exact Matching Concepts - (External Links)
http://www.eionet.europa.eu/gemet/concept/827
http://linkeddata.ge.imati.cnr.it:2020/resource/EARTh/27980
Biodiversity (en)
http://en.wikipedia.org/wiki/biodiversity
http://eurovoc.europa.eu/5463
Scope Notes US LTER controlled vocabulary (en)
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4
GEMET General Multilingual Environmental Thesaurus (EIONET)
biodiversity
http://www.eionet.europa.eu/gemet/concept/827
1) Genetic diversity: the variation between individuals and between populations within a
species; species diversity: the different types of plants, animals and other life forms within a
region; community or ecosystem diversity: the variety of habitats found within an area
(grassland, marsh, and woodland for instance. 2) An umbrella term to describe collectively
the variety and variability of nature. It encompasses three basic levels of organisation in living
systems: the genetic, species, and ecosystem levels. Plant and animal species are the most
commonly recognized units of biological diversity, thus public concern has been mainly
devoted to conserving species diversity. (Source: WRES / GILP96)
Themes
biology
Groups
BIOSPHERE (organisms, ecosystems)
Related terms
Broader
ecological parameter
Related
genetic diversity
Other relations
Has close match
UMTHES: Artenvielfalt
Has exact match
AGROVOC: Biodiversity
EuroVoc: biodiversity
Wikipedia article
Biodiversity
Adjacent (= « ecological parameter » Narrower)
abiotic factor
aerobic condition
anaerobic condition
balance of matter
bio-availability
biodiversity
biogeochemical cycle
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5
biological attribute
biological production
biomass
biotic factor
climax
ecological abundance
ecological balance
ecological carrying capacity
ecological factor
ecological niche
genetic diversity
genetic variation
land cover
nutrient
species
vegetation cover
EARTh Environmental Applications Reference Thesaurus
(eENVplus)
http://linkeddata.ge.imati.cnr.it/resource/EARTh/27980
BT [properties related to environmental systems]
[ecological properties]
NT4 biodiversity [~]
o NT5 agrobiodiversity
o NT5 potential biodiversity
NT4 biotype
NT4 ecological carrying capacity
NT4 ecological diversity
NT4 ecological load capacity
NT4 ecological valency
NT4 ecotype
NT4 genetic diversity
NT4 survival capacity
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6
NALT (National Agricultural Library Thesaurus – USDA)
biodiversity
Persistent URI:
http://lod.nal.usda.gov/nalt/5559
RDF/XML Format:
http://lod.nal.usda.gov/nalt/5559.rdf
Used For
agrobiodiversity
biological diversity
Broader Term
biological resources
community ecology
Narrower Term
species differences
species diversity
Related Term
biological assessment
biological corridors
ecological restoration
genetic variation
germplasm conservation
indicator species
Spanish
biodiversidad
Term Number
5559
Subject Category
P Natural Resources, Earth and Environmental Sciences
EUROVOC (Thésaurus multilingue de l'Union européenne)
biodiversity
http://eurovoc.europa.eu/5463
SN
Biological diversity within and across species, and within terrestrial or aquatic ecosystems.
UF species diversity
52 ENVIRONMENT
MT 5211 natural environment
BT1 biosphere
BT2 physical environment
RT animal resources [ 5211 ] plant resources [ 5211 ]
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7
UNESCO Thesaurus
Biological diversity
http://skos.um.es/unescothes/C00396
Terme français: Diversité biologique (fr)
Término español: Diversidad biológica (es)
Русский термин: Биологическое разнообразие (ru)
Microtesauri Natural resources
Used for (non-descriptors)
UF Biodiversity
UF Genetic diversity
Términos genéricos
BT Ecological balance
Términos relacionados
RT Biology
RT Biosphere reserves
RT Endangered species
RT Genetics
RT Global commons
RT Nature conservation
RT Species
UNBIS Thesaurus (United Nations Bibliographic Information
System)
BIOLOGICAL DIVERSITY
03.02.00 - RESOURCES (GENERAL)
Used For: BIODIVERSITY
Scope note: Variety of, and variation among living organisms and the ecologic complexes in
which they occur; consists of species diversity, genetic diversity and ecosystem diversity
Related terms: BIOSAFETY; ECOSYSTEMS; GENETIC RESOURCES; PLANT
VARIETIES
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8
Thésaurus THESAGRI (MOTBIS 2012)
Terme générique : écologie [MT 1530]
Employé pour :
diversification biologique
diversité biologique
biodiversité
[MT 1530]
Terme(s) associé(s) : Aucun terme associé
Terme(s) spécifique(s) :
diversité des espèces
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9
2) Descripteurs contenant “species”
Environmental Applications Reference Thesaurus (EARTh)
http://thesaurusonline.iia.cnr.it/tematres/earth/index.php?xsearch=1
57 terms (descriptors) for search expression "species" (0 non-descriptor)
adaptable species
adapted species
alien species
animal species
animal species reintroduction
autochthonous species
bird species
cornfield species
cosmopolitan species
critically endangered species
data deficient species
endangered species
endangered species habitat
endemic species
established alien species
exotic species
extinct species
extinct-in-the-wild species
extinction of animal species
extinction of plant species
feral species
flagship species
fruit species
harmful species
introduced species
introduction of animal species
introduction of plant species
invasive alien species
invasive species
keystone species
least concern species
migratory species
near threatened species
nesting species
new species
not evaluated species
plant species
plant species reintroduction
protected species
protection of species
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01.10.2014
10
rare species
relict species
ringing of migratory species
species
species conservation
species conservation programme
species habitat
species impoverishment
species reintroduction
synanthropic species
threatened species
tracking of species
umbrella species
vanished species
vulnerable species
[species by chorology]
[species by conditions]
NAL Agricultural Thesaurus (NALT)
26 descriptors + 29 non-descriptors
alien species
allopatric species
biological species
C3 species
C4 species
calcicolous species
CITES (Convention on International Trade in Endangered Species)
Convention on International Trade in Endangered Species
crop mixtures (species)
edible species
endangered species
endemic species
euryhaline species
eurytopic species
exotic species
farmed animal species
farmed species
indicator species
indigenous species
interspecies dose conversion
introduced species
invasive species
keystone species
limnophilic species
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01.10.2014
11
limnophilous species
native species
new species
new subspecies
non-native species
nonindigenous species
nonnative species
nontarget species
philopatric species
pioneer plant species
pioneer species
pioneer tree species
pollinating species
protected species
rheophilic species
rheophilous species
sibling species
species composition
species differences
species dispersal
species displacement
species distribution
species diversity
species identification
species novum
species reintroduction
species richness
stenohaline species
stenotopic species
sympatric species
threatened species
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01.10.2014
12
AGROVOC Thesaurus
Ancienne présentation
14 descriptors + 16 non-descriptors
Code
Term
10354
determination of species (EN)
1333440888271 introduced species (EN)
1333440925693 alien species (EN)
1333440954906 exotic species (EN)
1333440995752 non-native species (EN)
1333441044241 nonindigenous species (EN)
15733
new species (EN)
16047
subspecies (EN)
17723
Species threatened with extinction (EN)
17744
species extinction (EN)
2362
Dominant species (EN)
2557
endangered species (EN)
26882
Endemic species (EN)
331243
species (taxa) (EN)
33266
Species differences (EN)
33953
Genetic diversity within species (EN)
33954
Species diversity (EN)
33964
Choice of species (EN)
33965
Species selection (EN)
34272
Indigenous species (EN)
34367
Native species (EN)
34368
Autochthonous species (EN)
35790
Indicator species (EN)
35864
recognition of species (EN)
36956
Beneficial species (EN)
4024
ISSCAAP groups of species (EN)
49865
Invasive species (EN)
4987
Multispecies fisheries (EN)
6244
Protected species (EN)
7280
Species (EN)
Status
Descriptor
Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Descriptor
Descriptor
Non-Descriptor
Descriptor
Descriptor
Descriptor
Non-Descriptor
Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Non-Descriptor
Descriptor
Descriptor
Descriptor
Descriptor
Descriptor
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01.10.2014
13
Nouvelle présentation
15 descriptors + 18 non-descriptors
alien species >> introduced species
Autochthonous species >> Indigenous organisms
Beneficial species >> Beneficial organisms
Choice of species
Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora >> CITES
Convention on Migratory Species of Wild Animals >> CMS
determination of species
Dominant species
endangered species
Endemic species >> Indigenous organisms
exotic species >> introduced species
forest types (by species composition)
Genetic diversity within species >> genetic variation
Indicator species >> Indicator organisms
Indigenous species >> Indigenous organisms
introduced species
Invasive species
ISSCAAP groups of species
Multispecies fisheries
Native species >> Indigenous organisms
new species
non-native species >> introduced species
nonindigenous species >> introduced species
Protected species
recognition of species >> determination of species
Species
species (taxa)
Species differences >> biological differences
Species diversity >> Biodiversity
species extinction
Species selection >> Choice of species
Species threatened with extinction >> endangered species
subspecies
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01.10.2014
14
USGS Biocomplexity Thesaurus
51 descriptors + 25 non-descriptors
Alien species
Amphibiotic species
Amphihaline species
Anadromous species
Animal species introduction
Animal species reintroduction
Associated species
Candidate species
Catadromous species
Cavernicolous species
CITES (Convention on International Trade in Endangered
Species)
Commercial species
Composition (species)
Convention on International Trade in Endangered Species
Cosmopolitan species
Dependent species
Domestic species
Domesticated species
Dominant species
Economic species
Endangered species
Endemic species
Endogenous species
Epipsammic species
Exotic species
Extinct species
Fire dependent species
Form species
Indicator species
Indigenous species
Interdependent species
Introduced species
Invasive species
Katadromous species
Keystone species
Migrant species
Migratory species
Native species
Native species (animals)
Native species (plants)
Naturalized species
New species
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01.10.2014
15
New subspecies
Non-native species
Pathogenic species
Pioneer species
Plant species introduction
Plant species reintroduction
Poisonous species
Protected species
Rare species
Relict species
Sedentary species
Sensitive species
Sessile species
Short-life species
Sibling species
Special status species
Species
Species composition
Species diversity
Species diversity (animals)
Species diversity (plants)
Species extinction
Species impoverishment
Species nova
Species of special concern
Species packing
Species rarity
Species richness
Species-area relationship
Threatened species
Translocation (threatened and endangered species)
Transplantation (species introduction)
Vagile species
Vulnerable species
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01.10.2014
16
GEMET (General Multilingual Environmental Thesaurus)
23 descriptors (0 non-descriptor)
species
Narrower
adaptable species
animal species
bird species
migratory species
endemic species
exotic species
plant species
category of endangered species
Narrower
endangered species (IUCN)
endangered animal species
endangered plant species
extinct species (IUCN)
lower risk species (IUCN)
protected species
rare species
vanished species
vulnerable species (IUCN)
species conservation programme
species impoverishment
species reintroduction
animal species reintroduction
plant species reintroduction
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
17
EnvThes (Environmental Thesaurus for long term ecological
research, monitoring, experiments)
11 descriptors (0 no-descriptor)
species (en)
Narrower Concept
species lists (en)
endangered species (en)
Invasive species (en)
plant species (en)
vascular plant species (en)
plant species composition
species composition
species diversity
species interactions
species richness
EuroVoc
2 descriptors + 11 non-descriptors
MT 3606 natural and applied sciences
life sciences
animal taxonomy
UF classification of animal species
plant taxonomy
UF classification of plant species
MT 5211 natural environment
physical environment
biodiversity
UF species diversity
wildlife
protected species
UF endangered species
MT 5626 means of agricultural production
livestock
cattle
UF bovine species
equidae
UF equine species
goat
UF caprine species
sheep
UF ovine species
swine
UF porcine species
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
18
MT 5641 fisheries
fisheries policy
catch by species
fishery resources
fish
fish
UF piscicultural species
UF species of fish
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
19
SELECTION DE 6 THESAURUS SUR L’ENVIRONNEMENT
Comparatif de leur richesse sémantique
Critères de comparaison (points forts et points faibles) :
-
-
Relations sémantiques : nombre de termes spécifiques ; nombre de termes génériques ;
nombre de niveaux hiérarchiques ; nombre de termes associés ; nombre de termes
adjacents (pour un même générique)
Hiérarchies : types (sorte de / partie de / instance), cohérence et compatibilité
Richesse terminologique : synonymes, variantes orthographiques, langage naturel
Equivalences linguistiques - Multilinguisme
Présence de définitions
Européen (ou utilisé dans des programmes européens), international ou américain
Identifiant pérenne (URI) pour chaque concept
Liens vers le web sémantique (LOD Linked open data cloud)
Alignements déjà réalisés avec d’autres thésaurus
Liens entrants et/ou sortants (réciprocité)
Affichage de la nature des liens (skos:exactMatch ou closeMatch ou mappingRelation)
Ressources libres, téléchargeables et interopérables (SKOS/RDF)
AGROVOC : Thésaurus de la FAO
Multidisciplinaire et multilingue : 32 000 concepts (dont 20 000 concernent la taxonomie) et
25 top-concepts
Schéma conceptuel modélisé à la fois comme un thésaurus et une ontologie
Interface d’interrogation classique (navigation alphabétique ou hiérarchique) :
http://aims.fao.org/standards/agrovoc/functionalities/search
interface entièrement remaniée (25/09/2014) avec de nouveaux types de relations, propriétés
et sous-propriétés entre les concepts énumérés dans une « agrontologie »
http://aims.fao.org/aos/agrontology
Ex. a pour composant/ est composé de / fait partie de / est membre de/ est influencé par /
dépend de…
http://oek1.fao.org/skosmos/agrovoc/en/page/c_33949
information comparable à celle fournie par les URIs :
Concept URI (LOD)
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_33949
Richesse sémantique (TS, TG, EP, TA) : jusqu’à 8 ou 9 niveaux hiérarchiques; pas de
définitions, mais des scope-notes (skos:scopeNote)
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
1
Librement téléchargeable (licence CC BY NC SA)
Alignements réalisés et affichés : 7 liens externes dont EARTh, EuroVoc, GEMET , NALT
et DBpedia. Liens entrants réciproques avec : EARTh et GEMET
GEMET : Thésaurus de l’Agence européenne de l’environnement
Multilingue : 5300 concepts et 109 top-concepts
Recommandé par la Directive INSPIRE
Interface d’interrogation :
http://www.eionet.europa.eu/gemet/en/themes/
information identique à celle trouvée par les URIs
Concept URI (LOD)
http://www.eionet.europa.eu/gemet/en/concept/4637/
Richesse sémantique :
Niveaux hiérarchiques limités à 4 ou 5 ; absence totale de synonymes
Des incohérences hiérarchiques (ex. « biosphère » est TG de « anatomie » et
« écologie »)
Plusieurs définitions (en anglais)
Librement téléchargeable (CC BY)
Alignements réalisés et affichés : liens sortants vers 3 thésaurus dont Agrovoc et EuroVoc
Liens entrants: Agrovoc (réciproques en exactMatch); EARTh (exactMatch); EnvThes;
USGS
EARTh : Environmental Applications Reference Thesaurus
Bilingue (anglais/italien) : 12000 concepts et 5 top-concepts
Thésaurus du programme européen eENVplus / NatureSDIPlus / CNR-IIA-EKOLab
Extension de GEMET compatible avec INSPIRE : “One of the main actions is making
EARTh compliant with the INSPIRE directive and to become with GEMET, thanks to their
synergy, effectively the hub for the bridging to other environmental related vocabularies for
the Environment “
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
2
EARTh fait partie avec GEMET et AGROVOC d’une compilation de différents vocabulaires
et thésaurus relatifs à l’environnement, dont les concepts sont reliés entre eux au sein du
LOD cloud et permettent d’opérer des alignements :
LusTRE (Linked Thesaurus fRamework for Environment)
http://linkeddata.ge.imati.cnr.it/terminologies.jsp
Interrogation simultanée possible : http://linkeddata.ge.imati.cnr.it/search.jsp
Absence de français
Interface d’interrogation en ligne (anglais)
http://thesaurusonline.iia.cnr.it/
Navigation classique ou graphique, mais purement hiérarchique
Information beaucoup plus riche en passant par les URIs (LOD)
http://linkeddata.ge.imati.cnr.it/directory/EARTh
http://linkeddata.ge.imati.cnr.it/resource/EARTh/27980
Richesse sémantique :
skos :altLabel / definition / related / closeMatch / exactMatch
Quelques incohérences sémantiques : ex. « biological diversity » est à la fois un
prefLabel du concept 13280 et un altLabel du concept 27980 (« biodiversity »)
http://linkeddata.ge.imati.cnr.it/resource/page/EARTh/13280
Non téléchargeable en intégralité (CC BY NC ND)
Alignements réalisés et affichés : liens sortants vers 4 thésaurus (dont Agrovoc, EuroVoc,
GEMET) et DBpedia
Liens entrants réciproques (en exactMatch et closeMatch) avec Agrovoc
EnvThes : Environmental Thesaurus
Thésaurus développé par le programme européen EnvEurope-Life+ / ExpeER
Utilisé par le réseau LTER-Europe / ILTER (International Long Term Ecological Research)
et reprenant notamment le LTER Controlled Vocabulary américain
Monolingue (anglais pour les préférentiels, mais multilingue pour les définitions) : 1600
concepts (projet en construction)
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
3
Absence de descripteurs français
Interface d’interrogation
http://vocabs.lter-europe.net/EnvThes3.html
Concept URI (LOD)
http://vocabs.lter-europe.net/EnvThes/USLterCV_64
Richesse sémantique : absence de synonymes et de termes associés
Présence de définitions dans plusieurs langues
Navigation classique ou graphique
Non téléchargeable
Alignements réalisés et affichés : liens sortants vers 5 thésaurus (dont Agrovoc, EARTh,
EuroVoc, GEMET) et DBpedia
Aucun lien entrant vers EnvThes à partir de ces thésaurus
USGS Biocomplexity Thesaurus
Thésaurus de l’U.S. Geological Survey Core Science Analytics & Synthesis program
Monolingue : 9500 termes
Absence de français
Deux interfaces d’interrogation : classique et SKOS
http://www.usgs.gov/core_science_systems/csas/biocomplexity_thesaurus/search_thesaurus.html
http://nbii-thesaurus.ornl.gov/thesaurus/skosThesaurusSearch2.jsp
Pas de concept URI déréférençable  n’apparaît pas dans le LOD cloud
Niveaux hiérarchiques limités à 3 ou 4
Pas de définition
L’USGS collabore avec l’EEA/EIONET pour rendre ce thésaurus interopérable et
interrogeable simultanément avec GEMET
Alignement réalisé (non affiché) : un seul lien sortant vers GEMET (pas de lien entrant)
Vocabulaire conseillé pour les métadonnées par DataONE : “Tips for Writing Quality
Metadata : Example: USGS Biocomplexity Thesaurus (over 9,500 terms)” ou par le GBIF
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
4
NALT (National Agricultural Library Thesaurus – USDA)
Thésaurus multidisciplinaire comparable à Agrovoc par sa taille (53000 concepts avec une
grande part de taxonomie).
17 Subject Categories et plus spécialement la thématique « Natural Resources, Earth and
Environmental Sciences »
Bilingue (anglais/espagnol)
Absence de français
Interface classique d’interrogation
http://agclass.nal.usda.gov/
Persistent URI:
http://lod.nal.usda.gov/nalt/5559
Richesse sémantique : nombreux niveaux hiérarchiques ; quelques définitions
Disponible et téléchargeable
Alignements réalisés avec Agrovoc et LCSH en exactMatch, mais aucun lien sortant
affiché
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
5
4-Tableau comparatif des thésaurus sur l’Environnement : Biodiversité
Nb termes Nb termes
Nb
Nb termes
Nb termes
CONCEPT
Niveau
Multilin
spécifiques génériques
synonymes adjacents associés RT
Définition(s)
BIODIVERSITE
hiérarchique
guisme
NT1
BT1
UF
(même BT) (skos:related)
USGS
Biocomplexity
AGROVOC
EARTh
EnvThes
2
3
2
3
INIST-CNRS (PSVCIST)
0
1
1
1
1/3
4/5
5/6
3/4
3
3
1
0
0
4
8
5
5
NON
7
OUI
6
english/i
talian
0
Isabelle GOMEZ; Dominique VACHEZ
NON
Groupes
thématiques
Concept URI
(Linked
Open Data)
0
1
http://aims.fa
o.org/aos/agr
ovoc/c_33949
1
http://linkedda
ta.ge.imati.cnr
.it/resource/E
ARTh/27980
1
http://vocabs.l
tereurope.net/En
vThes3/USLt
erCV_64
01.10,2014
1
4-Tableau comparatif des thésaurus sur l’Environnement : Biodiversité
Nb termes Nb termes
Nb
Nb termes
Nb termes
CONCEPT
Niveau
Multilin
spécifiques génériques
synonymes adjacents associés RT
Définition(s)
BIODIVERSITE
hiérarchique
guisme
NT1
BT1
UF
(même BT) (skos:related)
Groupes
thématiques
Concept URI
(Linked
Open Data)
http://www.eio
net.europa.eu
/gemet/en/co
ncept/4637/
GEMET
0
1
4/4
0
22
1
OUI
2
Thèmes et
Groupes
NALT
2
2
4/6
2
19
6
english/
spanish
0
Subject
Categories
http://lod.nal.u
sda.gov/nalt/5
559
EUROVOC
0
1
3/3
1
4
2
OUI
1
Domaines
http://eurovoc
.europa.eu/54
63
UNESCO
0
1
3/3
2
2
7
OUI
0
LCSH
13
1
3/5
3
80
3
NON
1
RAMEAU
5
1
4/5
3
40
2
NON
0
INIST-CNRS (PSVCIST)
Isabelle GOMEZ; Dominique VACHEZ
http://skos.um
Microthésaurus .es/unescothe
s/C00396
http://id.loc.go
v/authorities/s
h87005569#c
oncept
Diversité
biologique
01.10,2014
2
4-Tableau comparatif des thésaurus sur l’Environnement : Biodiversité
Matching
(skos:exact
CONCEPT
/closeMatch)
BIODIVERSITE
external links
(accessibility)
Liens
inverses
Linked Open
Data
(SKOS/RDF)
NON
http://nbiithesaurus.ornl.
gov/thesaurus/s
kosThesaurusS
earch2.jsp?ter
mGroup=all&us
rTerm=Biodiver
sity
USGS
Biocomplexity
1 (gemet)
AGROVOC
7 (earth;
eurovoc;
gemet; nalt) +
(lcsh; rameau)
EARTh
5 (agrovoc;
eurovoc;
gemet)
agrovoc
EnvThes
5 (agrovoc,
earth; eurovoc;
gemet)
NON
INIST-CNRS (PSVCIST)
earth;
gemet
Web
services
Téléchargeable
Licence
Origine
NonDescripteurs
descripteurs
contenant
contenant
"species"
"species"
http://www.u
sgs.gov/cor
e_science_s
http://nbiiystems/csas thesaurus.ornl.go
/biocomplexi v/thesaurus/client
ty_thesauru sourcefiles.zip
s/web_servi
ce.html
américain
51
25
https://code.googl
http://aims.fao. http://aims.f
e.com/p/agrovocCreative
org/standards/a ao.org/down
csCommons CC
grovoc/linkedloadworkbench/downl
BY NC SA
open-data
agrovoc
oads/list
international
15
18
européen
57
0
européen
11
0
http://thesaurus.ii
Creative
a.cnr.it/images/th Commons CC
esaurus/earth.rdf
BY NC ND
Isabelle GOMEZ; Dominique VACHEZ
01.10,2014
3
4-Tableau comparatif des thésaurus sur l’Environnement : Biodiversité
Matching
(skos:exact
CONCEPT
/closeMatch)
BIODIVERSITE
external links
(accessibility)
GEMET
3 (agrovoc;
eurovoc)
Liens
inverses
Linked Open
Data
(SKOS/RDF)
NON
agrovoc
EUROVOC
NON
agrovoc;
earth;
envthes;
gemet
http://opendata.europa.eu/
en/data/dataset
/eurovoc
UNESCO
NON
NON
LCSH
3 (nalt;
rameau)
rameau
RAMEAU
1 (lcsh)
lcsh
INIST-CNRS (PSVCIST)
Téléchargeable
Licence
http://www.e
ionet.europa http://www.eionet.
Creative
.eu/gemet/e europa.eu/gemet/ Commons CC
n/webservic exports/en/rdf/
BY
es/
agrovoc;
earth;
envthes;
usgs
http://www.nal.u
sda.gov/news/
NALT_LOD.sht
ml
NALT
Web
services
Origine
NonDescripteurs
descripteurs
contenant
contenant
"species"
"species"
européen
23
0
http://agclass.nal.
usda.gov/downlo
ad.shtml
américain
26
29
http://eurovoc.eur
opa.eu/drupal/?q
=fr/download/subj
ect_oriented&cl=
en
européen
2
11
international
3
http://skos.um.es/
Creative
unescothes/down Commons CC
loads.php
BY NC SA
http://id.loc.gov/
américain
français
Isabelle GOMEZ; Dominique VACHEZ
01.10,2014
4
4-Tableau comparatif des thésaurus sur l’Environnement : Ecologie
CONCEPT
ECOLOGIE
Nb termes Nb termes
spécifiques génériques
NT1
BT1
Nb
Niveau
synonymes
hiérarchique
UF
Nb termes
associés RT
(skos:related)
Multilin
Définition(s)
guisme
Concept URI
(Linked Open
Data)
Matching
(skos:exact
/closeMatch)
external links
USGS
Biocomplexity
29
0
1/2
2
21
NON
0
AGROVOC
16
1
6/7
3
8
OUI
0
http://aims.fao.org/a
os/agrovoc/c_2467
10
EARTh
22
1
6/8
0
7
NON
1
http://linkeddata.ge.i
mati.cnr.it/resource/
EARTh/89210
5
EnvThes
11
1
2/4
0
0
NON
1
http://vocabs.ltereurope.net/EnvThes
3/USLterCV_172
5
GEMET
4
2
4/8
0
0
OUI
1
http://www.eionet.eu
ropa.eu/gemet/en/c
oncept/1711/
4
NALT
17
1
2/9
1
4
NON
0
http://lod.nal.usda.g
ov/nalt/352
0
EUROVOC
0
1
2/2
1
5
OUI
1
http://eurovoc.europ
a.eu/632
0
UNESCO
1
1
2/3
1
13
OUI
1
http://skos.um.es/un
escothes/C01143
0
INIST-CNRS (PSVCIST)
Isabelle GOMEZ; Dominique VACHEZ
0
01,10,2014
4-Tableau comparatif des thésaurus sur l’Environnement : Ecologie
CONCEPT
ECOLOGIE
Nb termes Nb termes
spécifiques génériques
NT1
BT1
Nb
Niveau
synonymes
hiérarchique
UF
Nb termes
associés RT
(skos:related)
Multilin
Définition(s)
guisme
LCSH
89
2
3/8
9
1
NON
1
RAMEAU
23
1
2/6
3
12
NON
1
Concept URI
(Linked Open
Data)
http://id.loc.gov/auth
orities/subjects/sh85
040752
Matching
(skos:exact
/closeMatch)
external links
7
1
Écologie
INIST-CNRS (PSVCIST)
Isabelle GOMEZ; Dominique VACHEZ
01,10,2014
Projet : « Vers un thésaurus de la Biodiversité »
Contribution Inist-Cnrs (septembre 2014)
Conclusions et recommandations
A) Sélection de thésaurus susceptibles de servir prioritairement pour des alignements
Schéma 1 (en Annexe 1) : Les thésaurus sur l’Environnement dans le web sémantique
Présentation des liens déjà effectués entre les différents thésaurus sur l’Environnement, parmi
lesquels situer notre thésaurus sur la Biodiversité.
Au niveau de la richesse terminologique, le thésaurus EARTh est le plus ambitieux en nombre
de concepts (12000), mais à l’instar de EnvThes (1600 descripteurs), bien qu'européens, ils ne
sont pas multilingues, et ne proposent pas de versions françaises.
D'autre part, EnvThes renvoie sur EARTh et sur Agrovoc (qui renvoie sur NALT), mais le
chemin inverse n’est pas possible. EnvThes et EARTh renvoient aussi sur GEMET et
EuroVoc (pour récupérer le multilinguisme), mais l’inverse n’est pas vrai.
Les liens GEMET-Agrovoc, ainsi que plus récemment EARTh-Agrovoc, sont quant à eux
réciproques et renvoient tous trois sur EuroVoc (thésaurus européen de 6800 descripteurs à
vocation généraliste).
Au final, le thésaurus AGROVOC apparaît comme incontournable, de par sa richesse
sémantique (onto-terminologie), ses synonymies, son multilinguisme et ses liens avec la
quasi-totalité des autres thésaurus, y compris l’américain NALT (USDA)
EnvThes est utilisé en même temps que d’autres vocabulaires européens et américains dans le
réseau ILTER, mais il est assez peu riche (ni synonymes, ni termes associés) et toujours en
cours d’élaboration.
Par ailleurs, tant que le thésaurus européen EARTh (monolingue mais 2 fois plus riche en
concepts que GEMET) ne s’est pas imposé par rapport à GEMET (multilingue) dans le cadre
de la directive INSPIRE, ce dernier continuera à servir de vocabulaire pivot, tout en offrant
une passerelle avec un autre vocabulaire américain (USGS Biocomplexity Thesaurus).
EARTh est d’autre part sous licence publique CC BY NC ND (pas d’utilisation dérivée),
tandis que GEMET et AGROVOC sont disponibles sous licence CC BY ou BY NC SA.
Nous proposons donc que le thésaurus Biodiversité s’aligne prioritairement sur GEMET et
sur AGROVOC, ce dernier permettant à son tour l’alignement avec EARTh.
Ils présentent tous trois des définitions et des scope-notes.
En cas de doute sur le bien-fondé d’une hiérarchie ou d’une association (ex. GEMET), on
pourra aussi s’inspirer des relations sémantiques de NALT et Biocomplexity Thesaurus.
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
1
B) Constitution d’un thésaurus sur la biodiversité
Schéma 2 (en Annexe 2): Constitution d’un Thésaurus de la Biodiversité
1) Atouts de nos ressources terminologiques (référentiels et bases de données) pour leur
complémentarité avec les thésaurus existants :
- accès synonymes et multilingues facilitant les alignements
- formes variantes, expressions du langage naturel utiles pour la fouille de données (text and
data mining) Ex. Référentiel terminologique Inist : règle « Diversité biologique »(ci-après)
- bi/trilinguisme pour la visibilité française et internationale
- traduction ou adaptation en français de concepts et de définitions issus de thésaurus
anglophones.
2) Choix des top-concepts et des concepts spécifiques
Top-concepts = concepts/termes génériques issus des thésaurus existants (GEMET,
AGROVOC, EARTh) et des référentiels terminologiques Inist, en se limitant aux 3 ou 4
premiers niveaux hiérarchiques.
Concepts plus spécifiques à choisir parmi :
- Variables de la biodiversité : GEO BON Essential Biodiversity Variables
(Group on Earth Observations - Biodiversity Observation Network)
https://www.earthobservations.org/documents/cop/bi_geobon/ebvs/201303_ebv_table.pdf
(contributeurs de GEO BON : GBIF, ILTER, IUCN, USGS…)
-
Indicateurs de la biodiversité :
Objectifs d’Aichi pour la biodiversité (Aichi Target passport) qui détaille les cibles
du Plan stratégique pour la biodiversité 2011-2020, élaboré dans le cadre de la
Convention sur la diversité biologique (CBD 2020)
http://www.bipindicators.net/LinkClick.aspx?fileticket=CMxb7ElMHUo%3d&tabid=38
European biodiversity indicators 2020 (European Environment Agency)
http://www.eea.europa.eu/publications/streamlining-european-biodiversity-indicators-2020
Indicateurs de l'Observatoire National de la Biodiversité (ONB)
http://indicateurs-biodiversite.naturefrance.fr/indicateurs/tableau0
-
Mots-clés des bases de données de l’INEE, inventoriées par l’UMS BBEES « Bases
de données sur la Biodiversité, Ecologie, Environnements et Sociétés »
-
Vocabulaire des projets recensés dans l’Annuaire de la recherche sur la biodiversité de
la FRB
Thésaurus AnaEE-France, thésaurus FRB…
-
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
2
-
Terminologies des SOERE/AllEnvi (Systèmes d’observation et d’expérimentation au
long terme pour la recherche en environnement), de ILTER-Europe.
Des listes de mots-clés avec leurs équivalents (anglais ou français) ont été extraites de
documents officiels d’organismes français, européens et internationaux (ex. Aichi targets)
et présentées sous forme de tableaux Excel :
-
Indicateurs et variables de la biodiversité : sources de référence (ci-après)
Tableaux de mots-clés extraits des Variables essentielles de la biodiversité et des
Indicateurs de la biodiversité (en Annexe 3)
Référentiel terminologique Inist : concept Biodiversité (français/anglais/espagnol)
Diversité biologique
agro-biodiversity
bacterial diversity
Biodiversity
biodiversity preservation
coenotic diversity
diversity of the
ANG ectomycorrhiza community
ecosystem diversity
functional biodiversity
insect diversity
plant diversity
Shannon index
weed diversity
ESP
biodiversidad
agro-biodiversité
biodiversité animale
Convention sur la
diversité biologique
diversité écosystémique
FRA
diversité biologique
agriculture
diversité des êtres vivants
diversité du vivant
Indice de Shannon
protection biodiversité
SL
Natura 2000
agrobiodiversity
bio-diversity
biodiversity conservation
biological diversity
Convention on Biological
Diversity
ecodiversity
ecosystemic diversity
fungal diversity
microbial diversity
rhizobial diversity
songbird diversity
wild diversity
Diversidad biológica
agrobiodiversité
biodiversité aquatique
avifaunal diversity
biodiversities
Biodiversity Convention
botanical diversity
diversity of rhizobia
ecological diversity
fauna diversity
fungi diversity
Nagoya Protocol
Shannon diversity
structural diversity of
fungal community
wildlife diversity
Biodiversité
conservation biodiversité
diversification biologique
diversité écologique
diversité animale
Diversité biologique
diversité biosphérique
diversité botanique
diversité des animaux
diversité sauvage
préservant biodiversité
richesse biologique
diversité des plantes
diversité végétale
préservation biodiversité
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
3
INDICATEURS ET VARIABLES DE LA BIODIVERSITE
Sources de référence
Indicators - Convention on Biological Diversity
http://www.cbd.int/2010-target/framework/indicators.shtml
Adequacy of the Biodiversity Observation System to support CBD 2020 Targets_GEO
BON 2011
http://www.earthobservations.org/documents/cop/bi_geobon/2011_cbd_adequacy_report.pdf
Essential Biodiversity Variables (EBV) - Group on Earth Observations Biodiversity
Observation Network (GEO BON / GEOSS)
https://www.earthobservations.org/documents/cop/bi_geobon/ebvs/201303_ebv_table.pdf
Biodiversity Indicators - JNCC (UK Joint Nature Conservation Committee) :
http://jncc.defra.gov.uk/page-4233
Biodiversity Indicators Partnership - UNEP
http://www.bipindicators.net/globalindicators
Aichi Target Passport
http://www.bipindicators.net/LinkClick.aspx?fileticket=CMxb7ElMHUo%3d&tabid=38
Séminaire ECOSCOPE (mai 2013)
http://www.fondationbiodiversite.fr/observatoires-de-recherche/programme-du-seminaireecoscope-paris-23-24-mai-2013
Les indicateurs de l'Observatoire National de la Biodiversité (ONB)
http://indicateurs-biodiversite.naturefrance.fr/indicateurs/tableau0
European 2010 Biodiversity Indicators
http://www.eea.europa.eu/publications/technical_report_2007_11
European biodiversity indicators 2020
http://www.eea.europa.eu/publications/streamlining-european-biodiversity-indicators-2020
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
4
BASES DE DONNEES EN BIODIVERSITE
Bases recensées par l’UMS BBEES (Bases de données Biodiversité, Ecologie,
Environnements Sociétés – MNHN/CNRS INEE)
http://www.bdd-inee.cnrs.fr/
Fiches projets - Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité – FRB
http://www.fondationbiodiversite.fr/annuaire-des-publications/fiches-projets
FRB : Annuaire des projets
http://www.portailfrb.fr/portailFRB/faces/recherche_avancee_projet.jsp
Systèmes d’observation et d’expérimentation au long terme pour la recherche en
environnement (SOERE) - Infrastructures de recherche - AllEnvi
http://www.allenvi.fr/groupes-transversaux/infrastructures-de-recherche/lessoere2/labellisation
Programmes de l’INSU en environnement
http://www.insu.cnrs.fr/environnement
Observatoires des sciences de l'univers (OSU)
http://www.insu.cnrs.fr/node/1128
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
5
Les thésaurus sur l’Environnement dans le web sémantique
DBpedia
LOD LOV
owl: sameAs
skos: exactMatch
skos: closeMatch
skos: relatedMatch
SKOS/RDF
LOD
CC BY NC ND
EnvThes *
EARTh *
(EnvEurope-Life+)
(eENVplus)
LOD
ILTER
LTER-EUROPE
exactMatch
INSPIRE
exactMatch
INSPIRE
E
Thésaurus de
la Biodiversité
LOD
GEMET *
(EIONET/EEA)
exactMatch
CC BY
LOD
closeMatch
exactMatch
exactMatch
EUROVOC
(UE)
LOD
AGROVOC
(FAO)
exactMatch
LOD
CC BY NC SA
exactMatch
NALT
(USDA)
e
Biocomplexity
Thesaurus *
LOD
(USGS)
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
1
Légende du schéma
Flèches épaisses : alignements réciproques
Flèches fines : alignements unidirectionnels
Flèches en pointillés : alignements en projet
LOD : Linked Open Data
LOV : Linked Open Vocabularies
CC BY : Licences Creative Commons
Rectangles : thésaurus
Ellipses : infrastructures utilisatrices
Taille des rectangles : proportionnelle au nombre total de concepts
Taille des caractères : proportionnelle au nombre de concepts en Environnement
Astérisque : thésaurus spécialisé en Environnement
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
2
Constitution d’un thésaurus de la Biodiversité
Ressources terminologiques
INIST-CNRS
Vocabulaires de
ANAEE France,
SOERE, LTER
GEMET
Thésaurus de la
Biodiversité
AGROVOC
Vocabulaires des
bases de données
INEE-BBEES,…
Essential Biodiversity
Variables (EBV)
GEO BON
EARTh
Indicateurs de la biodiversité
-CBD 2020
-European biodiversity indicators
(European Environment Agency)
-Indicateurs de l’ONB
(Observatoire National de la
Biodiversité)
Rectangles : thésaurus sélectionnés
Ellipses : différentes terminologies choisies pour extraire les concepts
Flèches en pointillés : alignements réalisables avec d’autres thésaurus et indication du sens de
l’alignement
Flèches épaisses : apports des terminologies
INIST-CNRS (PSVCIST) Isabelle Gomez ; Dominique Vachez
01.10.2014
1
Library of Congress Subject Headings (LCSH)
http://id.loc.gov/authorities/subjects.html
Biodiversity
Here are entered works on the totality of the variety of living organisms, the genetic
differences among them, and the communities and ecosystems in which they occur.
URI(s)
o
o
http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh87005569
http://id.loc.gov/authorities/sh87005569#concept
Variants
o
o
o
o
o
Biological diversification
Biological diversity
Biotic diversity
Diversification, Biological
Diversity, Biological
Broader Terms
o
Biology
Narrower Terms
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
Agrobiodiversity
Animal diversity
Aquatic biodiversity
Arid regions biodiversity
Coastal biodiversity
Forest biodiversity
Microbial diversity
Mountain biodiversity
Plant diversity
Soil biodiversity
Species diversity
Sustainable biodiversity
Wetland biodiversity
Related Terms
o
o
o
Biocomplexity
Ecological heterogeneity
Numbers of species
Exact Matching Concepts from Other Schemes
o
biodiversity
Closely Matching Concepts from Other Schemes
o
o
o
Biodiversità
biodiversity
Diversité biologique
INIST-CNRS (PSVCIST)
Dominique Vachez
04.11.2014
Page 1
Ecology
Here are entered works on the interrelationships of organisms and their environment,
including other organisms. Works on the composite of physical, biological, and social
sciences concerned with the conditions of the environment and their effects are
entered under [Environmental sciences.] Works on the relationship of humans to the
natural environment are entered under [Human ecology.] Works on the relationship of
humans to their sociocultural environment are entered under [Social ecology.]
URI(s)
o
o
http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh85040752
http://id.loc.gov/authorities/sh85040752#concept
Variants
o
o
o
o
o
o
o
o
o
Balance of nature
Biology--Ecology
Bionomics
Ecological processes
Ecological science
Ecological sciences
Environment
Environmental biology
Oecology
Broader Terms
o
o
Biology
Environmental sciences
Narrower Terms
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
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Aerial photography in ecology
Agricultural ecology
Anaerobiosis
Animal ecology
Animal-plant relationships
Applied ecology
Aquatic ecology
Arid regions ecology
Bioclimatology
Biogeochemical cycles
Biological productivity
Biotic communities
Canal ecology
Cerrado ecology
Chaparral ecology
Chemical ecology
Cliff ecology
Closed ecological systems
Coastal ecology
Colonies (Biology)
Colonization (Ecology)
Communication in ecology
Communism and ecology
INIST-CNRS (PSVCIST)
Dominique Vachez
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Conservation biology
Corridors (Ecology)
Ecogeomorphology
Ecolinguistics
Ecological carrying capacity
Ecological disturbances
Ecological genetics
Ecological heterogeneity
Ecological integrity
Ecophysiology
Ecosystem health
Ecotheology
Ecotones
Edge effects (Ecology)
Environmental chemistry
Experimental ecology
Extreme environments
Fire ecology
Food chains (Ecology)
Forest ecology
Global environmental change
Grassland ecology
Habitat (Ecology)
Hedgerow ecology
Household ecology
Human ecology
Indicators (Biology)
Island ecology
Lagoon ecology
Landscape ecology
Lawn ecology
Life zones
Llanos ecology
Macroecology
Meadow ecology
Microbial ecology
Microclimatology
Molecular ecology
Mud flat ecology
Niche (Ecology)
Paleoecology
Paramo ecology
Pasture ecology
Pests--Ecology
Plant ecology
Radioactive tracers in ecology
Radioecology
Range ecology
Resilience (Ecology)
Resource partitioning (Ecology)
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Dominique Vachez
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Roadside ecology
Sand dune ecology
Savanna ecology
Shrubland ecology
Snow ecology
Soil ecology
Spatial ecology
Steppe ecology
Tide pool ecology, Landlocked
Tundra ecology
Underground ecology
Upland ecology
Urban ecology (Biology)
Watershed ecology
Wetland ecology
Xeric ecology
Related Terms
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Population biology
Exact Matching Concepts from Other Schemes
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ecology
Closely Matching Concepts from Other Schemes
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Bionomie
Ecologia
Écologie
ecology
environment
Ökologie
Theoretische Ökologie
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Dominique Vachez
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Notice d'autorité RAMEAU
(Répertoire d'autorité-matière encyclopédique et alphabétique unifié –BnF)
http://catalogue.bnf.fr/jsp/recherche_autorites_rameau.jsp?nouvelleRecherche=O&host=catalogue
Diversité biologique
Vedette matière nom commun . S'emploie en tête de vedette
<Employé pour :
Biodiversité
Diversification biologique
Diversité (biologie)
<<Terme(s) générique(s) :
Biologie
>><<Terme(s) associé(s) :
Hétérogénéité écologique
Ressources génétiques
Voir aussi la subdivision Ressources génétiques [+ subd. géogr.] aux êtres vivants
>>Terme(s) spécifique(s) :
Diversité animale
Agrobiodiversité
Diversité des espèces
Diversité microbienne
Diversité végétale
Equiv. LCSH :
Biodiversity
Écologie
Sous cette vedette, on trouve les documents sur les relations entre les organismes et le milieu
où ils vivent. Les documents sur les mouvements qui s'attachent à la défense de la nature et à
la protection de l'environnement se trouvent sous Écologisme
. - S'emploie également en subdivision [+ subd. géogr.] aux êtres vivants
<Employé pour :
Biologie -- Écologie
Bionomie
Influence du milieu
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Dominique Vachez
04.11.2014
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<<Terme(s) générique(s) :
Sciences de l'environnement
>><<Terme(s) associé(s) :
Aspect environnemental
Biologie des populations
Catastrophes écologiques
Écologie -- Aspect politique
Écologie -- Bases de données
Écologie animale
Écologie végétale
Écologues
Écosystèmes
Environnement
Habitat (écologie)
Services écosystémiques
Voir aussi la subdivision Aspect environnemental [+ subd. géogr.] aux forces armées, guerres,
industries, maladies, matériaux, produits chimiques, véhicules et sujets noms communs
appropriés
>>Terme(s) spécifique(s) :
Écologie fonctionnelle
Adaptation (biologie)
Autoécologie
Bioclimatologie
Biomes
Écologie agricole
Écologie appliquée
Écologie chimique
Écologie industrielle
Écologie moléculaire
Écologie spatiale
Écologie urbaine
Écophysiologie
Écothéologie
Géoécologie
Hétérogénéité écologique
Intégrité écologique
Macroécologie
Paléoécologie
Radioécologie
Restauration écologique
Savoirs écologiques traditionnels
Succession écologique
Equiv. LCSH :
Ecology
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04.11.2014
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RAMEAU (Répertoire d'Autorité-Matière Encyclopédique et Alphabétique Unifié) est le
langage d'indexation matière utilisé, en France, par la Bibliothèque nationale de France, les
bibliothèques universitaires, de nombreuses bibliothèques de lecture publique ou de recherche
ainsi que plusieurs organismes privés.
http://data.bnf.fr/liste-rameau
Il est élaboré depuis 1980, de façon autonome, en relation avec le "Répertoire de vedettesmatière" de l'Université Laval à Québec, lui-même traduit de la liste de vedettes-matière de la
Bibliothèque du Congrès (Library of Congress Subject Headings).
A la différence d'un thesaurus, le langage RAMEAU n'est pas constitué a priori mais enrichi
au fur et à mesure des besoins de l'indexation, à partir des propositions formulées par le
réseau de ses utilisateurs grâce à un Fichier national des propositions RAMEAU.
Les sujets RAMEAU sont alignés avec :
le référentiel de sujets de la Bibliothèque du Congrès (Library of Congress, LOC).
le référentiel de sujets de la Bibliothèque nationale allemande (Deutsche
Nationalbibliothek, DNB).
le référentiel des sujets des Archives de France, le Thésaurus W.
la base de données de lieux géographique Geonames;
le thesaurus Agrovoc.
Un alignement a été réalisé entre le référentiel RAMEAU et les principaux domaines de la
classification Dewey (http://dewey.info).
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------En complément de LCSH, il existe une version simplifiée : FAST, utilisée entre autres pour
indexer des jeux de données, elle permet une navigation par facettes et est disponible dans le
LOD.
FAST (Faceted Application of Subject Terminology) is derived from the Library of
Congress Subject Headings (LCSH), one of the library domain’s most widely-used subject
terminology schemas. The development of FAST has been a collaboration of OCLC Research
and the Library of Congress.
FAST is used by Databib to index descriptions of databases, and by a variety of libraries to
provide subject indexing of description of digital resources.
FAST is available as Linked Data, which is an approach to publishing data which enhances
the utility of information on the web by making references to persons, places, things, etc.
more consistent and linkable across domains.
http://id.worldcat.org/fast/
--------------------------------------------------------------------------------------------------------LCSH est aligné avec RAMEAU (réciproquement) ainsi qu’avec NALT.
Remarque : AGROVOC est aligné avec RAMEAU (réciproquement) et LCSH mais les liens
ne sont pas affichés (ni entrants, ni sortants).
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