OFFRE DE THESE CIFRE Gene Extractor

OFFRE DE THESE CIFRE
Gene Extractor
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Nom de l’entreprise : PICOMETRICS TECHNOLOGIES…………………………………....…………
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● Ville et code
postal : 31 760 LABEGE……………………………………………………………………………………
● Nom
du laboratoire académique partenaire (si déjà connu) : à finaliser, en fonction du profil du candidat. L’un
des deux laboratoires partenaires du projet……………………..………………………………………………………………………………........
● Numéro
de reconnaissance du laboratoire : ………………………………………………………………………………………………………….
● Thématique
de recherche en une phrase(sans aucun caractère confidentiel) :
Gene Extractor : Méthode d’extraction d’une portion de génome à des fins de séquençage.
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●Descriptif de
la thématique de recherche (sans aucun caractère confidentiel) :
Picometrics Technologies, en partenariat avec le CNRS-LAAS développe de nouveaux outils d’analyse et de
préparation de grands fragments d’ADN grâce à la technologie µLAS, une méthode physique innovante. Cette
méthode est basée sur l’application d’une force d’électrophorèse sur l’échantillon emmené par un flux laminaire
d’une solution viscoélastique dans un capillaire ou un microcanal.
L’enjeu de ce travail de thèse est double : d’une part augmenter la taille des fragments d’ADN manipulable par
cette technique, jusqu’à 1 Mb. Et d’autre part savoir extraire les fragments, non seulement selon leur taille, mais
aussi selon une séquence d’ADN spécifique, de façon à pouvoir isoler un locus génétique particulier au sein d’un
génome. L’isolation de ce locus permettra de le séquencer, et donc d’accélérer les recherches sur les remaniements
génomiques associés aux cancers. L’isolation des fragments se fera en combinant le piégeage des fragments sur des
nanoparticules et la technologie µLAS à une échelle préparative.
Ce travail de recherche se fera en collaboration avec le CNRS-LAAS et l’INSERM-CRCT.
●Descriptif du
poste :
Dans un premier temps, le doctorant aura en charge d’augmenter la taille des fragments d’ADN analysable par la
technologie µLAS. En collaboration avec un physicien, il suivra une démarche empirique, qui permettra de mieux
comprendre les phénomènes physiques en jeu.
Dans un second temps, le doctorant aura à trouver comment séparer des fragments d’ADN décorés de
nanoparticules. La méthode biologique pour associer spécifiquement l’ADN et les nanoparticules sera apportée par
les partenaires académiques du projet.
Dans un troisième temps, le doctorant aura à transférer cette méthode sur un automate de laboratoire, en cours
de développement par ailleurs.
Le travail relève de la chimie analytique, de la physico-chimie, et de la physique en microfluidique.
● Date
de recrutement : septembre 2015
● Adresse
e-mail à laquelle le candidat doit envoyer sa candidature : [email protected]