FORMATION INGENIEUR AGRONOME PROGRAMME DE
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FORMATION INGENIEUR AGRONOME PROGRAMME DE
FORMATION INGENIEUR AGRONOME PROGRAMME DE DEUXIEME ANNEE SEMESTRE S8 ANNEE UNIVERSITAIRE 2015 - 2016 Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 1 SEMESTRE S8 Le contenu pédagogique du semestre est composé de deux types d’unités d’enseignement (UE) : - les UE du tronc commun, obligatoires pour tous les élèves-ingénieurs, et donnant des outils indispensables pour un futur ingénieur agronome; - les UE de pré-spécialisation permettant à chacun d'élaborer un parcours personnalisé en fonction de son projet professionnel et en prenant en compte les modules pré-requis nécessaires pour entrer dans une spécialisation. Volume horaire Cours TP-TD Management 3 : échanges internationaux, droit des affaires, qualité dans l’agro-alimentaire 52h 40h 12h 3 Langues et sports 66h 0h 60h 2 UE de pré-spécialisation série 1 60h 5 UE de pré-spécialisation série 2 60h 5 UE de pré-spécialisation série 3 60h 5 UE de pré-spécialisation série 4 60h 5 UE de pré-spécialisation série 5 60h 5 Intitulés des Unités d’enseignement Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 ECTS 2 UNITES D’ENSEIGNEMENT DU TRONC COMMUN (UE obligatoires pour tous les étudiants – 120h) UE MANAGEMENT 3 : ECHANGES INTERNATIONAUX, DROIT DES AFFAIRES, QUALITE DANS L’AGRO-ALIMENTAIRE – 52h – 3 ECTS Responsable : G. Nguyen [email protected] Objectifs Cette UE complète les apports en sciences sociales (économie, gestion, droit) proposés au cours de semestres précédents (S5 à S7). Elle vise à proposer aux élèves des nouvelles connaissances, et des compétences de base de l'ingénieur agronome dans les domaines de l'économie internationale, du droit des affaires et du management de la qualité. Ces éléments cimentent la culture économique, juridique et en qualité, que doit posséder un ingénieur agronome, quelque soit le métier exercé. Elle est composée des 3 modules présentés ci-dessous. Contrôle des connaissances La note finale de l’UE Management 3 est la moyenne des notes obtenues aux 3 modules, affectées du même coefficient. Module 1 – Economie internationale – cours : 13h – TD: 4h Intervenant : G. Nguyen Objectifs Ce module vise à introduire les étudiants aux concepts et grilles d’analyse économique nécessaires à la lecture critique de l’actualité et à la compréhension des enjeux concernant les problèmes contemporains : (1) de croissance et de développement économique dans un cadre européen et international. Il s’agira ici d’approfondir les définitions de la croissance et du développement vues dans le cadre de l’UE « Introduction au développement durable » en S7, en posant les questions suivantes : Quels sont les modèles de croissance ? Dans une perspective de transition (démographique, énergétique, écologique et alimentaire), quels sont aujourd’hui les enjeux de croissance économique ? Qu’est-ce qui est nouveau avec les pays émergents ? (2) de commerce international et globalisation économique : Quel intérêt à échanger avec d’autres pays, pour les entreprises, les consommateurs, les Etats ? Comment se structurent aujourd’hui les échanges internationaux et quels en sont les déterminants ? Qu’est-ce que la globalisation des échanges ? Pourquoi et comment réguler ces échanges ? Comment peut-on analyser les nombreux conflits sur le plan des échanges internationaux ? (3) de finance internationale : Comment fonctionne le système monétaire international ? Qu’entend-on par « financiarisation » de l’économie ? Qu’est-ce qu’une crise économique ? Pourquoi les crises reviennent-elles toujours ? Quel rôle pour les Etats ? Programme 1- Croissance et développement économique : modèles de croissance et durabilité, économies émergentes, croissance verte 2- Echanges internationaux et globalisation économique : éléments théoriques et d’analyse historique, stratégies d’internationalisation des firmes, structuration et régulation des échanges (négociations internationales à l’OMC et bilatérales comme le Traité Transatlantique) 3- Finance internationale : de la création de la monnaie au système monétaire internationale, crises financières 4- Selon l’actualité du moment, d’autres thèmes sont abordés comme : la crise alimentaire de 2008 et ses conséquences, la géopolitique des stratégies de sécurité alimentaire et de développement agricole, etc. Méthodes pédagogiques Cours magistraux, conférences, projets individuels ou par groupe (revue de presse, etc.), jeux de simulation (négociations sur réechelonnement des dettes d’un pays, négociations autour de traités commerciaux multilatéraux ou bilatéraux) Contrôle de connaissances 2 TD notés - 30% Examen écrit (QCM et questions ouvertes) – 70% Bibliographie : Ouvrages en économie contemporaine et macroéconomie (Stiglitz ; Blanchard et Cohen ; Burda et Wyplosz ; Mankin) Ouvrages en économie du développement et économie internationale (Abdelmalki ; Gillis ; Giraud ; Krugman ; North ; Treillet ; Sen) Lecture de la presse nationale et internationale fortement recommandée Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 3 Module 2 – Droit de l'entreprise et éthique – cours: 13h – TD: 4h Responsable : G. NGUYEN [email protected] Intervenante : C. DAVASSE Objectifs L'objectif de ce module vise à donner une culture juridique de base dans quelques champs importants pour un agronome. Plusieurs thèmes seront abordés: généralités sur le droit, l'organisation des tribunaux en France, éléments du droit du travail, de droit commercial. Dans ce module seront abordées les notions d'éthique de l'entreprise. Programme Généralités sur le droit : sources du droit, le système de la preuve Organisation des tribunaux en France Droit du travail : la formation, l'exécution et la rupture du contrat de travail Droit commercial, droit des brevets Ethique de l'entreprise Méthodes pédagogiques Cours magistraux, conférences, Travaux dirigés sur des cas pratiques, et travaux personnels. Contrôle des connaissances Examen écrit Bibliographie : J. PELISSIER, A. SUPIOT, A. JEAMMAUD, Droit du travail, précis Dalloz, 28e éd. 2014. E. DOCKES, Droit du travail, Relations individuelles, Hypercours, Dalloz, 2005. J.-P. CLAVIER, F.-X. LUCAS, Droit commercial, Champ U, Flammarion, 2003. R. ENCINAS DE MUNAGORRI, G. LHUILIER, Introduction au droit, Champ U, Flammarion, 2011. Module 3 – Management de la qualité – cours: 13h – TD: 4h Intervenants : O. Delahaye, V.Olivier Salvagnac [email protected] [email protected] Objectifs Acquérir les connaissances de base sur l’économie et le management de la qualité dans les secteurs agroalimentaires. S’initier à la réglementation et aux normes servant à réguler et à gérer les systèmes de qualité alimentaire dans un cadre mondialisé. Programme Partie I : Economie et management de la qualité dans les systèmes agro-alimentaires (3CM+ 1 TD) V.Olivier Salvagnac 1. Introduction à l’économie de la qualité des systèmes agro-alimentaires 2. Modes de valorisation de la qualité des produits (SIQO et marques) 3. Management de la qualité, l’exemple de l’ISO (TD ISO 9001) Partie II : Réglementation et Systèmes de management de la qualité sanitaire des aliments (4CM + 1 TD) O. Delahaye 1. La réglementation européenne et nationale en matière d'hygiène alimentaire. 2. Le système HACCP : principe, mise en œuvre et limites. (TD) 3. La traçabilité: obligations et limites 4. Entre réglementation et marché : des référentiels de distributeurs Méthodes pédagogiques Cours, TD, étude de cas et travaux de groupe Contrôle des connaissances (1ere session et rattrapage) Examen de connaissances sur table Bibliographie (plus de références données en cours) - Chemineau (dir) 2012, Comportements alimentaires, Choix des consommateurs et politiques nutritionnelles, Editions QUAE, 87 p. - Economie agro-alimentaire : une économie de la qualité, Nicolas F. Valceschini E. eds. INRA Economica 1995 - La grande transformation de l’agriculture : lectures conventionnalistes et régulationnistes G. Allaire, R.Boyereds, 1995 - Le système alimentaire mondialisé, J L Rastoin, G Ghersi, 2010, éditions Quae, coll. Synthèse. - Agroalimentaire et Risques sanitaires, Retour sur un demi-siècle de défis et de progrè, s, L. Rosso, 2012, L’Harmattan - sites Internet d’information sur la réglementation et les normes, exemples : Codex Alimentarius, Europa Eur-lex, Legifrance…ISO/Afnor, FAO, OMPI, INAO …+ via biblio INPT accès au bouquet de normes « sagaweb » rassemblant plusieurs milliers de référentiels. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 4 UE LANGUES ET SPORTS Module 1- Anglais – 22h de TD Responsable : A Alibert [email protected] Objectifs Permettre l’activation et le développement des acquis par la sélection de domaines d’acquisitions spécifiques liés à l’analyse des besoins professionnels de l’ingénieur agronome d’aujourd’hui. On recherchera (1A) l’élargissement et perfectionnement des champs linguistiques à couvrir (langue technique, scientifique et de communication), (1B) la meilleure utilisation interactive possible de l’outil linguistique scientifique dans le cadre de présentations orales, (2) une ouverture et un enrichissement culturels des pays anglophones . Programme Approfondissement de la langue anglaise et des outils scientifiques. La compréhension écrite, l’esprit de synthèse et l’expression orale. Pour couvrir ce programme, 2 modules sont proposés : (1A) Applied scientific communication, (1B) Scientific Presentation, (2) Project work. Méthodes pédagogiques Les groupes sont formés pour respecter le rythme de progression le mieux adapté aux étudiants. Le cours est destiné à l’approfondissement et à l’élucidation du matériel linguistique et/ou culturel (enregistrements audio, vidéo, films, documents écrits) ainsi qu’à la validation du travail de préparation personnel ou de groupe. Afin de favoriser la prise en charge par l’élève de sa propre progression (enrichissement lexical, approfondissement de compétences acquises), des documents de référence, des romans contemporains et des enregistrements sonores sont à la disposition des étudiants à la bibliothèque. Contrôle des connaissances En deuxième année il n’y a pas d’examen final. Trois notes sont attribuées : une dans le cadre de la présentation orale scientifique et pour la présentation, une concernant la synthèse et débat liés à la lecture de livres en anglais et une troisième est donnée concernant la participation en cours. Chaque note a le même coefficient (1) et la moyenne est calculée sur ces trois notes. Module 2- Langue vivante 2: espagnol/allemand – 20h TD Responsable : Carmen Lorente Objectifs Permettre à chacun de développer ses acquis et de communiquer socialement dans les situations de la vie courante plus ou moins complexes, selon son niveau. Programme Remise à niveau grammatical et approfondissement lexical (écrit et orale). Communication dans les actes sociaux de la vie quotidienne. Sensibilisation à la langue scientifique générale. Méthodes pédagogiques Exercices sur les structures essentielles de la langue espagnole. Lecture et exploitation d’articles de presse actuelle. Ecoute intensive (vidéo, films, Radio Nacional de Espana). Débats. Contrôle des connaissances Contrôle continu oral et écrit. Module 3 - Education Physique et Sportive – 20h Responsable : Jean-Louis Dessacs [email protected] Objectifs Les activités physiques et sportives proposées à l'E.N.S.A.T. sont : L'EDUCATION PHYSIQUE Deux heures de cours obligatoires, donnant lieu à la délivrance d'une note prise en compte dans la moyenne générale. Ces deux heures se décomposent en cours d'Education Physique généralisée, et en initiation ou perfectionnement aux différents sports collectifs et individuels (escrime, athlétisme, judo, tennis, golf, etc.). LES ACTIVITES PHYSIQUES Proprement dites, elles se pratiquent au sein de l'Association Sportive. • La compétition FNSU : Elle concerne les élèves-ingénieurs qui désirent pratiquer le sport en compétition. Les équipes "E.N.S.A.T." (J. Gens et J. Filles) représentent l'école dans les rencontres inter-universitaires ; de même pour les différents sports individuels : athlétisme, aviron, escrime, judo, golf, tennis, natation, etc. Les compétitions ont lieu le jeudi après-midi ou en nocturne les différents soirs de la semaine. • Les activités "E.N.S.A.T." : Elles permettent de participer à des entraînements hebdomadaires aux différents sports collectifs ou individuels : natation, danse, équitation, golf, tennis, randonnée en montagne, à un stage de ski d'une semaine dans les Alpes, aux rencontres traditionnelles en sports collectifs contre l'E.N.S.A. Montpellier, l'E.N.I.T.A. Bordeaux et l'E.N.S.A. Rennes, et bien sûr aux "Inter-Agros" (manifestation nationale). • Les activités "I.N.P.T." : Participation des étudiants aux animations proposées par le D-APS de l'I.N.P.T., "I N P I A D E S", tournois inter-école, sorties de ski hebdomadaires, nuit du volley, etc. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 5 LA PRE-SPECIALISATION Objectifs Les enseignements de pré-spécialisation ont pour but de permettre aux élèves ingénieurs d’approfondir un champ disciplinaire et de personnaliser leur parcours de formation en fonction de leur projet professionnel. Ce parcours, débouchant sur une spécialisation, doit être établi en fonction des UE exigées (pré-requis) pour entrer dans une spécialisation (cf guide des modalités d’orientation). Certaines de ces UE sont proposées en langue anglaise, partiellement ou en totalité. L’objectif est double : être plus attractif pour l’accueil d’étudiants internationaux et permettre aux étudiants français d’intégrer progressivement l’anglais comme langue de travail. Procédure de choix et d’inscription pour les élèves-ingénieurs : cf guide des modalités d’orientation Une organisation par UE, par série et par filières de pré-spécialisation Chaque UE de pré-spécialisation a une durée totale de 60h (cours, TD, TP, Travail Personnel). Chaque enseignant responsable fixe les modalités du contrôle de connaissances. En cas de contrôle final, l’examen a lieu à la fin de l’UE de pré-spécialisation dans le cadre des horaires impartis à chaque UE. Les UE sont réparties en 5 séries consécutives, approximativement de 3 semaines chacune. Enfin les UE sont réparties, dans la mesure du possible, par filières de pré-spécialisation. C’est ainsi que, pour chaque série, 6 UE sont proposées correspondant en général aux 6 grandes filières de préspécialisation, conduisant aux spécialisations proposées à l’ENSAT. Bien évidemment, cette structuration n’est pas systématique et certaines UE peuvent intéresser plusieurs filières de pré-spécialisation. Les UE transversales, susceptibles d’intéresser les étudiants quelque soit leur projet de spécialisation, apparaissent dans la dernière ligne. Organisation générale des UE Série 1 Février 1.2 Food science (C. Chervin) 36 Série 2 Mars Série 3 Mars - Avril Série 4 Avril - Mai Série 5 Mai 2.1 Marketing et techniques de vente (F. Pichon) 30 3.1 Gestion des flux et maîtrise des coûts (B. Legagneux) 30 4.1 Sociologie des mondes agricoles (F. Purseigle) 36 5.1 Economie sociale et solidaire et développement durable des territoires (G. Nguyen) 36 4.2 Procédés enzymatiques et fermentaires 5.2 Processing of animal products (C. Bayourthe) 36 2.2 Qualité et sécurité 3.2 Bilans, Rhéologie et réacteurs sanitaire des aliments 36 (A. Leszkowicz) 36 (G. De Billerbeck) (T. Liboz) 1.3 Biogéochimie de l’environnement (C. Dumat) 36 2.3 Télédétection et SIG (D. Sheeren) 30 1.4 Sciences animales : 2.4 Systèmes fourragers fonctions de production : approches agronomique et de reproduction et zootechnique (C. Bayourthe) 20 (H. Remignon) 36 1.5 Biotechnology and sustainable agriculture (J. Kallerhoff) 36 1.6 Systèmes de culture (P. Maury) 36 2.5 Génomique (F. Regad) 24 2.6 Agriculture biologique et composts (M. Barret) 24 36 3.3 Eau et Environnement (S. Jean) 36 4.3 Sol et environnement (M. Guiresse) 24 5.3 Biodiversité et gestion de l’espace rural 3.4. L’animal dans son environnement (Z. Vitezica) 24 4.4 Des matières premières végétales aux systèmes d’alimentation (C. Bonnefont) 36 3.5 Semences et Amélioration des plantes (C. Ben) 30 4.5 Bio-informatique (M. Zouine) 24 5.5 Protection des cultures (F. Vailleau) 36 3.6 Télédétection et SIG (D. Sheeren) 30 4.6 Gestion de l’eau en agriculture (G. Bertoni) 36 5.6 Agriculture de conservation et agroécologie (J.P. Sarthou) 36 3.7 Modélisation en agronomie et environnement (C. Laplanche) 24 4.7 Agricultures Urbaines (C. Dumat) 36 5.7 Analyse et cartographie des controverses sociotechniques (F. Purseigle) 24 (A. Ouin) 36 Les étudiants en double-cursus DNO-Ingénieur suivent 2 UE de pré-spé au choix et les enseignements du DNO dans le temps des autres pré-spé : Nombre d'étudiants maximum pouvant être accueillis dans le module Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 6 Les UE du S8 sont organisées en 6 filières(lignes du tableau) autour des thématiques de la formation d’ingénieur et pour préparer aux spécialisations de l’Ensat. La dernière ligne du tableau est constituée d’unités dites transversales et qui intègrent plusieurs de ces thématiques de formation. I- AGROMANAGEMENT Objectifs -Préparer les étudiants à accéder à des métiers nécessitant une double compétence, technique et managériale : - métiers transversaux nécessitant des compétences en gestion, économie et sociologie : management de projet, conduite du changement, chargé de mission - métiers opérationnels : marketing, commercial, comptabilité-finance Les métiers visés sont essentiellement situés au sein des entreprises du secteur agroalimentaire ou encore cosmétique, d'organisations professionnelles agricoles, de banques, de bureaux d'études, de cabinets de consultants… -Préparer l’accès à la spécialisation Agromanagement Il s’agit d’apporter des bases conceptuelles et méthodologiques en sciences de gestion, économiques et sociales, que les étudiants sont susceptibles de mobiliser dans leur projet professionnel. Les enseignements retenus sont ceux qui présentent un intérêt pour les deux types de métiers visés. Marketing et techniques de vente Gestion des flux et maîtrise des coûts Sociologie des mondes agricoles Economie sociale et solidaire et développement territorial II- SCIENCES ET INDUSTRIES ALIMENTAIRES Objectifs Proposer aux étudiants qui souhaitent s'orienter vers des spécialisations dans le domaine agro-alimentaire une formation dans divers domaines allant des sciences alimentaires, de la toxicologie alimentaire, de la qualité des aliments, de la microbiologie alimentaire, du génie des procédés alimentaires. Cette pré-spécialisation conduit à la spécialisation Industries Agro-alimentaires: Elle pourra également déboucher sur le Master "Elaboration de la qualité et sécurité alimentaire" de l’école doctorale SEVAB. Elle est aussi prévue pour les étudiants qui souhaitent faire la troisième année dans des domaines de l'agroalimentaire plus spécialisé à l'ENSAIA ou dans des universités étrangères. Cette filière peut aussi intéresser les étudiants qui s’orientent vers la valorisation non alimentaire des agroressources car les fondements scientifiques et certaines technologies peuvent y trouver des applications. Organisation Cinq UE sont proposées dans le domaine agro-alimentaire Food Science (obligatoire) Qualité et Sécurité alimentaire des aliments Génie des procédés : bilans, rhéologie et réacteurs Procédés enzymatiques et fermentaires Technologie des produits d’origine animale (lait et viande) III- ENVIRONNEMENT Objectifs Offrir aux étudiants une formation dans le domaine de l'environnement nécessaire à l’accès aux spécialisations : - Qualité de l’environnement et gestion des ressources - Génie de l’environnement (en lien avec l’ENSEEIHT et l’ENSIACET) - Agrogéomatique - à un Master en lien avec la spécialisation QeGr: Ecosystèmes et Anthropisation (EA) - à un Master en lien avec la spécialisation Agrogéomatique : SIGMA Organisation Biogéochimie de l’environnement Télédétection et SIG Eau et Environnement Sol et Environnement Biodiversité et gestion de l’espace rural Modélisation en agronomie et environnement Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 7 IV- SCIENCES ET PRODUCTIONS ANIMALES Objectifs Les quatre UE proposées par le département de Sciences et Productions Animales ont comme finalité : 1- de faire acquérir aux étudiants désirant suivre la spécialisation « Systèmes et Produits de l'Elevage », les bases physiologiques et technologiques des productions, ce qui doit leur permettre d’aborder les différents aspects de la maîtrise des productions et des produits au sein des diverses filières animales. Cette acquisition se fera essentiellement au travers des UE : « Sciences Animales: fonctions de production et de reproduction » et "Des matières premières végétales aux systèmes d'alimentation". 2- de développer, au travers des deux autres modules que sont « Systèmes Fourragers : approche agronomique et zootechnique » et « L'animal dans son environnement», une approche plus intégrative des productions, pouvant aussi intéresser des étudiants se destinant à d’autres spécialisations orientées vers le végétal et/ou l’environnement. 3- Enfin, d’aborder le secteur de la transformation des produits animaux dans l'UE « Technologie des produits d’origine animale », assurée par les enseignants du Département de Sciences Animales mais proposée dans le cadre de la pré-spécialisation "Sciences et Industries Alimentaires". Organisation : 4 UE de 60 heures chacune Sciences Animales : fonctions de production et de reproduction Des matières premières végétales aux systèmes d'alimentation L'animal dans son environnement Systèmes fourragers : approche agronomique et zootechnique V- BIOSCIENCES VEGETALES Objectifs La concentration par de grands groupes internationaux, des activités phytosanitaires et semencières, ainsi que le développement de la génomique végétale, créent une demande d’ingénieurs agronomes capables d’animer et de coordonner des activités de recherche, d’expérimentation et de développement dans les domaines conjoints de la bioanalyse, de l’amélioration et de la protection des espèces cultivées. La filière "Biosciences végétales" permet aux étudiants de s’orienter vers les métiers de la recherche, de l’expérimentation, des études ou du conseil, au sein de groupes industriels ou d’organismes publics ou professionnels. La formation pourra être finalisée par l’accession aux spécialisations suivantes : - Agrobiosciences végétales - Biologie Computationnelle pour les Biotechnologies - Master Adaptations, Développement, Amélioration des Plantes, en association avec des Microorganismes (ADAM) Organisation La formation est organisée pour permettre aux étudiants d'appréhender les avancées conceptuelles et technologiques les plus récentes des sciences du végétal. Biotechnologies et applications Génomique Semences et amélioration des plantes Bioinformatique Protection des cultures VI- AGRONOMIE Objectifs Offrir aux étudiants la possibilité d’approfondir leurs connaissances agronomiques tant dans une perspective d’approche système que pour certaines productions ou techniques. Cette filière conduit aux spécialisations - Agro écologie : du système de production au territoire - AGREST - Agrogéomatique - Et à un Master en lien avec la spécialisation Agrogéomatique : SIGMA Organisation Un certain nombre d’UE proposées dans les flilières Environnement et biosciences végétales intéressent aussi cette filière. Voici les UE plus spécifiques aux objectifs poursuivis. Systèmes de culture Agriculture biologique et compost Télédétection et SIG Gestion de l’eau en agriculture Agriculture de conservation et agro-écologie Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 8 VII- UNITES D’ENSEIGNEMENT TRANSVERSALES En complément des unités d’enseignement proposées par « filières » de formation, ces UE sont susceptibles d’intéresser les étudiants quel que soit leur projet de spécialisation. Ce sont : Modélisation en agronomie et environnement Agricultures Urbaines Analyse et cartographie des controverses socio-techniques CAS PARTICULIERS DES SPECIALISATIONS DES ECOLES PARTENAIRES Ces spécialisations ne s’inscrivent pas au sens strict dans une filière de pré-spécialisation. Elles sont en partie transversales à ces filières. A ce titre, les pré-requis sont réduits et le choix est très ouvert, selon le projet professionnel de l’étudiant. Voici cependant quelques conseils. Spécialisation Chimie verte Le choix des UE doit se faire en fonction des domaines d’application envisagés :. - les aspects transformation : nous conseillons alors les étudiants de choisir des UE se rapprochant de celles de la filière IAA ; - les aspects production de plantes à des fins de valorisation non alimentaire : nous conseillons alors les étudiants de choisir des UE de la filière biosciences végétales : - les aspects gestion des flux et organisation : nous conseillons alors de choisisr des UE de la filière agromanagement. Spécialisation Procédés pour la Chimie Fine et les Bioindustries Une seule UE spécifique est proposée et est obligatoire, celle de « génie des procédés : Bilans, rhéologie et réacteurs » Le choix des autres UE peut se faire dans le domaine de l’agromanagement avec l’UE « Gestion des flux et maîtrise des coûts », des IAA avec « Sciences des aliments » et également dans les biosciences avec l’UE « biotechnologies ». Spécialisation Eco-énergies Pas d’UE obligatoire mais un certain nombre d’UE conseillées relatifs à certaines méthodologies : « SIG et télédetection », « Modélisation » et « génie des procédés : Bilans, rhéologie et réacteurs » Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 9 UNITES DE PRE-SPECIALISATION SERIE 1 1.2 – Food science - lectures : 24h – practicals : 20h - personal work : 16h Prof in charge : C. Chervin [email protected] Objectives Knowledge of the composition of food, biochemical and nutritional aspects, in relation to consumer demands. The module aims to provide students with a personal work with a refund in the form of written and oral report. It will, through a case study (1) to make an inventory of ingredients and additives, (2) identify the functions of different classes of components, and (3 ) provide for each of the elements regulatory and toxicological risks . This work requires an investigation into the composition of food, a brief study of the manufacturing process and consultation of books and websites. Program * Knowledge of food products (C Chervin , JP Roustan ) : 14h - Introduction to molecular cuisine (Practical works ) and sensory analysis (Tutorials) - Example of some products: wine , beer, bread products (lectures , visits) * Composition of foods : - Functional aspects (14h , B. van der Rest) : case study of certain foods (TD), study of food spoilage (practical work) . - Nutritional aspects (14h , A Leszkowicz ) : relationships food – health, food - cancer (dietary factors and carcinogenesis, food as cancer prevention) relationships food - obesity , food - cardiovascular diseases, diabetic diets , sport diets , food for pregnant women, chrononutrition . * Flavourings and food dyes (2h, G. de Billerbeck, 2h T. Talou, ENSIACET) Teaching methods Lectures, practicals and personal work, handouts, slideshows, visits Knowledge assessment Written report and oral presentations. Students can choose the language of assessment, French or English. Literature http://www.codexalimentarius.org/codex-home/en/ « Sensory evaluation techniques », Meilgaard et al., CRC Press « Sécurité alimentaire du consommateur » de Moll & Moll, Tech & Doc, Lavoisier. « Additifs et auxiliaires de fabrication des les IAA », de J.L. Multon, Ed. Tech et Doc, Lavoisier « Evaluation sensorielle », de Depledt, Tech & Doc, Lavoisier Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 10 1.3 – Biogéochimie de l’Environnement - 60h Responsable : C Dumat [email protected] Objectif Dans un contexte de développement durable, l’étude et la gestion de l’environnement doivent être abordés de façon globale. Il y a en effet des transferts d’eau, de matières et d’énergie et des transformations qui se font de l’échelle de la molécule à l’échelle du globe. Le module « Biogéochimie de l’Environnement » a pour objectif d’aborder au travers de quelques exemples les mécanismes et les bilans qui contrôlent à différentes échelles (molécules, sols, bassin versant, globe terrestre) ces transferts. Ce module de 60 heures est organisé en 2 sous-modules. Les intervenants et volumes horaires sont les suivants : Programme 1- Physico-chimie aux interfaces : transferts vers les écosystèmes terrestres Une particule riche en plomb émise par une activité anthropique dans l’atmosphère, peut retomber sur un sol cultivé. Le devenir du plomb de cette particule va alors dépendre en particulier des caractéristiques de la particule (taille, forme, nature et concentrations des constituants, etc.), des caractéristiques du sol (texture, pH, CEC, etc..), du climat, de l’activité rhizosphérique, de la bioturbation des vers de terre…Pour imaginer à priori quel sera l’impact du plomb de cette particule sur l’environnement, il faudra se baser sur l’ensemble des connaissances disponibles et des données mesurables par les techniques actuelles. Pour cet exemple comme pour beaucoup d’autres, la compréhension des mécanismes d’adsorption/désorption, complexation, précipitation-dissolution, réactions redox et acido-basiques et fonctionnement des organismes vivants qui peuvent modifier leur milieu est donc nécessaire dans une optique de gestion et modélisation. Cet enseignement a pour objectif de décrire de façon générale les phénomènes biogéochimiques qui se déroulent aux interfaces et dans les milieux naturels durant le cycle de vie d’une substance nutritive ou polluante afin de mieux gérer et prévoir l’impact de cette substance sur les écosystèmes et l’homme. 2- Biogéochimie des bassins versants : Échange atmosphère, biosphère, hydrosphère : cycle des éléments et perturbations anthropiques. L’étude à l’échelle des bassins versants permet une analyse intégrée des différents cycles biogéochimiques. Cette séquence d’enseignement a pour objectif d’apporter des connaissances sur les cycles de l’eau, du carbone, de l’azote et des contaminants (métaux, pesticides) dans les écosystèmes terrestres (incluant le couplage atmosphère-sol-eau). Une sortie terrain permettra d’aborder plus concrètement les stratégies d’observation des écosystèmes forestiers et plus particulièrement la mesure des dépôts atmosphériques actuels au niveau des écosystèmes forestiers (placette forestière) et la reconstitution des dépôts passés au niveau d’une tourbière. Elle permettra également d’aborder les questions de production et de transfert de la matière organique terrestre. Quelques exemples des différentes approches isotopiques (stables et radiogéniques) que l’on peut utiliser dans le domaine de l’environnement, notamment sur les sols, les eaux à Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 11 l’échelle des bassins versants, pour tracer les sources des différents éléments concernés, les vitesses de transferts et l’intensité des différents processus. Contrôle des connaissances: Examen écrit sur chaque partie du cours, compte rendu sur l’un des deux TD (visites de terrain), exercices d’analyse bibliographique. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 12 1.4 – Sciences animales : fonction de production et de reproduction – cours : 30h TD/TP : 30h Responsable : H. Rémignon [email protected] Objectifs Acquérir les bases scientifiques nécessaires pour aborder la maîtrise des productions et la logique des systèmes de production. Programme Volet 1 : La lactation (20h) - Particularités anatomiques de la mamelle - Mécanismes cellulaires de l’élaboration du lait - Biosynthèse des constituants du lait - Contrôle hormonal de la lactation Volet 2 : Croissance et développement (20h) - Physiologie de la croissance et du développement Courbes de croissance et allométrie de la croissance Croissance embryonnaire et post embryonnaire Facteurs de croissance Croissances musculaires, osseuse, du tissu adipeux - Nutrition et croissance Besoins nutritionnels et efficacité alimentaire Croissance compensatrice restriction alimentaire - Influence des facteurs environnementaux (température, programme lumineux, qualité de l’air) - Génétique de la croissance et du développement Volet 3 : La reproduction des mammifères d’élevage (20h) - Anatomie des appareils reproducteurs. - Hormones et corrélations hormonales intervenant dans la régulation de la sexualité et de la reproduction. - Principales étapes de la reproduction chez les mammifères (Fonction germinales mâle et femelle, Fécondation, Gestation - Comportement reproducteur. - Relations entre l'environnement et la reproduction. - Induction et synchronisation de l’œstrus, Insémination artificielle, Fécondation in vitro et transfert embryonnaire, Induction ou blocage de la parturition. Méthodes pédagogiques Cours – TP- Conférences – Travail Personnel : recherche bibliographique et exposé oral. Contrôle des connaissances Rapport bibliographique écrit (coefficient 2) et exposé oral (coefficient 1) individuels Bibliographie: - Revue « Elevage et Insémination » (UNCEIA) - Reproduction des Mammifères d’élevage (INRAP, 1988) - Reproduction des Mammifères et de l’homme (2001, INRA Ellipse) - Croissance et développement des animaux (Ed. Lavoisier) - Control and manipulation of animal growth (Ed. Lavoisier) - Biologie de la lactation (Ed. INRA/INSERM) Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 13 1.5 – Biotechnology for Sustainable Agriculture (60H: in English) - Lectures : 20 h ; Tutorials : 14 h ; Practical work : 8H ; Group project : 16 h - Seminars : 6H ; Written assessment :2H Faculty in charge : J. Kallerhoff [email protected] Other Faculty : M. Rickauer [email protected]> C. Bayourthe [email protected] C. Verheecke [email protected] P. Bogdanowicz (Institut Pierre Fabre) [email protected] M. Zouine [email protected] Objectives The objective of this module is to cover different fields of crop improvement and protection, biodiversity conservation, food, environment, health and animal sciences, metagenomics, where biotechnology has emerged to be a complementary tool in matter of sustainable agriculture. Program A- Plant biotechnology : Germplasm conservation, crop improvement and protection (M.Rickauer and J. Kallerhoff) Applications of in vitro culture towards the improvement and conservation of plant species will be declined. Conventional and novel technologies involving recombinant DNA technology aiming at reducing the use of agricultural intrants will be studied. Model plants used to decipher gene isolation and functional analysis will be studied. Altogether taken, these will be explored within the international legal framework of the International Biodiversity Convention and Biosafety Carthagena Protocol. Finally, the European and French legal framework dedicated to Crop Improvement, Crop Protection, Food and Feed safety will be summarised. B- Introduction to Metagenomics (M. Zouine) Metagenomics is the study of the genetic material recovered directly from environmental samples. This new field of research enables studies of microbial communities that are not easily cultured in laboratory conditions under conditions of clonal cultures. This has led to the discovery of new genes that code for novel enzymes capable of producing molecules of industrial potential. C- Microbial Biotechnology : The role of microbes in sustainable agriculture, human and environmental health (C. Verheecke and J. Kallerhoff) Lectures will focus on the use of lab-cultured microorganisms to produce new biofertilisers, biopesticides, novel agents for biocontrol of plant diseases. The presence of diverse microorganisms in food will be illustrated within the legal context of the European Food Safety Authority. D- Animal biotechnology Methodologies and case studies in animal biotechnology will be declined with respect to the resulting diverse applications. E- Biotechnology and dermo-cosmetics Dr Patrick Bogdanowicz, from Pierre Fabre Cosmétiques will explain how a flourishing local industry makes use of Biotechnology, cellular imagery during the process of developing new products in the dermocosmetics industry. Educational methods Lectures, Practical works and tutorials will all be dealt in English. Hand-outs as well as power-point presentations will be available on the “Moodle” platform of the ENSAT. A tutored group project will involve students into the art of scientific communication. Assessment (Students can choose the language of assessment, French or English): Table examination: 60% of the grading Practicals: 10% of the grading Group project: 30% of the grading Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 14 1.6 – Systèmes de cultures : concepts agronomiques, outils et méthodes pour l'analyse et la conduite de systèmes de cultures - 60h - Cours 32h – TD/TP : 14h – Travail personnel encadré : 14h Responsable : P. Maury [email protected] Intervenants : Georges Bertoni, Philippe Grieu, Julie Ryschawy, Pierre Maury, Jean-Pierre Sarthou, Jérôme Silvestre Objectifs - Connaissances de systèmes de culture et de production - Analyse de la différenciation des systèmes de culture (intensif/extensif) - Méthodes et outils de conception/conduite des systèmes de culture Programme Système de grande culture (20h) Définitions, concepts, système de culture et changement d’échelle (parcelle-territoire) Evolution des systèmes de culture au cours du temps Diversification des systèmes de culture (productif, extensif, rustique, systèmes à cahier des charges ; clés de raisonnement du système de culture ; techniques culturales simplifiées) Outils de conception/d’évaluation des systèmes de cultures (intérêt et limites des modèles de culture, présentation du modèle de culture « STICS ») Visite exploitation Système intensif : cultures en serre, sous abri (18h) Présentation des systèmes de cultures en serre et sous abri (grandes productions – intérêts – limites) L'outil serre - fonctionnement Les cultures hors sol (principaux systèmes de culture hors sol, formulation des solutions nutritives, substrats, fabrication et contrôle de solutions nutritives, recyclage des solutions nutritives - logiciel « Végénut») Visite exploitation Systèmes polyculture-élevage, herbagers et Agroforestiers (8h) Les systèmes polyculture-élevage et herbagers dans les territoires (état des lieux, évolution et prospective, cas d’études) Agroforesterie : association cultures pérennes/annuelles (présentation générale - Intérêt et limites - cas d’étude : dispositif expérimental de Grasac : noyer/trêfle) Projets thématiques (14h) Projet « système » Ce projet thématique consiste à réaliser un approfondissement bibliographique sur une innovation technique ou sur un système de culture d’intérêt (1 sujet par binôme ou trinôme). Le travail bibliographique, basé sur des références scientifiques et techniques, mais également sur des articles à destination des professionnels de l’agriculture, donne lieu à la réalisation d’une présentation sous forme d’exposé oral. Projet « fiche » Une fiche de synthèse biotechnique sur une culture sera également réalisée dans le cadre du projet (1 fiche par étudiant). Ce travail personnel encadré (TPE) comprend des séances avec l’enseignant et du travail personnel programmé à l’emploi du temps. Les projets les plus récents sont consultables sur la plateforme pédagogique de l’ENSAT (http://moodleensat.inp-toulouse.fr/). Méthodes pédagogiques Cours, travaux dirigés, travail personnel encadré (recherche bibliographique) et visite Contrôle des connaissances Projet « système » : document écrit accompagné d’un exposé oral noté (30% de la note de l’UE) Projet « fiche » : document écrit accompagné d’un exposé oral noté – individuel - (20% de la note de l’UE) Examen écrit individuel (50% de la note de l’UE). Pour des raisons d’économie, il est recommandé de remettre les documents en noir et blanc et de n’y inclure des pages couleur que si cela s’avère nécessaire pour permettre la lecture des informations, notamment pour certains graphiques, cartes, exceptionnellement des photos. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 15 UNITES DE PRE-SPECIALISATION SERIE 2 2.1 – Marketing et techniques de vente – 60h Responsables : F. Pichon [email protected] Objectifs Développer les connaissances et les compétences des étudiants dans les domaines du marketing stratégique, du marketing opérationnel et des techniques de vente. Initier les étudiants au métier de chef produit Programme Simuler les décisons de marketing dans la conduite d’une entreprise (définir le positionnement, établir le mix-produit, expérimenter et étudier la concurrence, évaluer les résultats) Expérimenter le métier de chef produit à travers le lancement d’un nouveau produit Vendre et gérer une force de vente Méthodes pédagogiques Simulation de gestion par groupes d’étudiants, simulation de vente, travaux dirigés (étude de cas, exercices de communciation), exposés. Contrôle des connaissances Evaluation des travaux réalisés collectivement (simulation de gestion, étude de cas) et évaluation individuelle (simulation de gestion et techniques de vente) Bibliographie Philip Kotler et Bernard Dubois, Marketing-Management, Publi-Union. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 16 2.2 – Qualité et Sécurité sanitaire des aliments - 60h Responsables : A. Leszkowicz Autres intervenants : F. Mathieu, C. Verheecke [email protected] Objectifs Connaître les paramètres de la qualité microbiologique, les risques toxicologiques ainsi que des moyens de gestions de ces risques dans les aliments. Programme 1 - Ecologie microbienne dans les produits alimentaires : rôle des micro-organismes d’intérêt et d’altérations : (cours:15 h / TP : 8h / TD : 2 h) Diversité microbienne des principaux produits alimentaires Micro-organismes intervenants dans les fermentations alimentaires Action des micro-organismes d’altération dans les aliments 2 - Réglementation (contexte national, EU et International), méthodes d ’analyses (HACCP, Critères de la qualité); 15 h : 3- Toxicologie Alimentaire (20h): Les crises alimentaires liées aux matières premières (ESB, listeria, dioxine, algues marines…) Incident et accidents liés aux végétaux (mycotoxine, métaux lourds, nitrate, nitrites, substances antinutritives) Risques liés aux produits transformés (impact de la cuisson, des modes de conservation… sur la qualité nutritionnelle et sur la sécurité) Alcoolisme Allergies alimentaires Evaluation du risque (rôle des experts), comment établit-on des limites maximales de résidus (LMR), des doses journalières admissibles (DJA). Gestion du risque (en temps normal, en période de crise), contrôles indispensables, bonnes pratiques agricoles (BPA), bonnes pratiques de laboratoire (BPL). Méthodes pédagogiques Cours Contrôle des connaissances Examen écrit, exposé et rapport Bibliographie Elément de toxicologie, de A.Viala, Tec & Doc Lavoisier, 1998. La sécurité en laboratoire de chimie et de biochimie, Picot & Grenouillet, eds, Tec & doc Lavoisier, 1992. Sécurité alimentaire du consommateur", de Moll & Moll, Eds. Tech et Doc, Lavoisier, 2002. Mycotoxines dans l’alimentation :évaluation et gestion du risque, Pfohl-Leszkowicz, ed, Tec & Doc, Lavoisier, 1999. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 17 2.3 – Télédétection et SIG - 60h Responsable : D. Sheeren Autres intervenants : C. Monteil, F. Catalayud, M. Fauvel [email protected] Objectifs Former le futur ingénieur aux systèmes d’information géographique (SIG) et au traitement d’images satellitaires (télédétection). Les outils mobilisés (ArcGIS, QGIS, OrfeoToolBox, Fragstat, Idrisi) seront mis en œuvre sur des cas d’applications touchant aux domaines de l’agriculture, de l’environnement, de l’aménagement. Programme Module 1 : Télédétection – Traitement des données numériques (30h) gestion des fichiers images visualisation des données prétraitements des données : stretching, calcul de néocanaux, ACP, génération de masques, filtrage des données, corrections géométriques des images, mosaïquage d’images, orthorectification de photographies aériennes classification multispectrale : méthodes dirigées et non dirigées, analyse des résultats, cartographie des résultats, mesure de la qualité Module 2 : Systèmes d’Information Géographique (30h) - géoréférencement de documents cartographiques (systèmes de projection, rééchantillonage, formules de transformation polynomiales) - acquisition de données avec un GPS - analyse spatiale en mode vecteur (import/export, requêtes attributaires et spatiales, jointure, géotraitements, opérateurs spatiaux élémentaires) - analyse multicritères (élaboration de plans croisés d’informations, opérateurs spatiaux ensemblistes et de proximité) - analyse spatiale en mode raster (création de modèle numérique de terrain, analyse 3D, calcul de paramètres morphométriques, algèbre de cartes, calcul du plus court chemin) - analyse paysagère (indicateurs de composition et configuration spatiale) Méthodes pédagogiques Les enseignements sont réalisés sous forme de cours et travaux dirigés. Des études de cas concrets sont présentées au cours de travaux dirigés Les étudiants sont formés aux versions les plus récentes de logiciels largement utilisés dans le monde professionnel scientifique et technique (OTB, ArcGIS, Idrisi …). Contrôle des connaissances Une évaluation individuelle en télédétection + une évaluation individuelle enSIG. La note finale est la moyenne des deux notes. Bibliographie F. BONN, G. ROCHON, 1992 - Précis de Télédétection, Vol 1 : Principes et méthodes. Editions Presses de l’Université du Québec – AUPELF, 485 pages. CALOZ R., COLLET C. 2011. Analyse spatiale de l’information géographique. Presses polytechniques et universitaires romandes (PPUR), Collection « Science et ingénierie de l'environnement », 383 p. C. COLLET, 1992 - Systèmes d'information géographique en mode image. Presses polytechniques et universitaires romandes, Lausanne. J. DENEGRE et F. SALGE, 1996 - Les systèmes d'information géographique. Presses Universitaires de France, collection Que sais-je, n° 3122. M.C. GIRARD, C.M. GIRARD, 1999 – Traitement des données de télédétection. Editions Dunod, Paris, 529 pages. R. LAURINI, 1993 - Les bases de données en géomatique. Editions Hermès. M. ROBIN, 2002 – Télédétection : des satellites aux SIG. Edition Nathan Université, Paris, 318 pages. L. SANDERS, 2001 - Modèles en analyse spatiale. Editions Hermès, Traité IGAT, série Aspects fondamentaux de l'analyse spatiale, 328p. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 18 2.4 – Systèmes fourragers : approches agronomique et zootechnique - 60h [email protected] Responsable : C. Bayourthe Objectifs A partir de cas concrets (visite d’exploitations), comprendre la notion de système fourrager, système qui assure la correspondance entre système de culture et système d’élevage. Analyser les relations entre ces deux sous-systèmes dans un contexte physique et socio-économique donné. Programme COURS Les productions fourragères: présentation, définitions, statistiques Le système fourrager : définition et principaux systèmes La gestion des productions fourragères : Biologie des espèces, Ecophysiologie-écologie, Itinéraires techniques, Interaction herbe-animal, Système de pâture Valeur alimentaire des fourrages sur pied : systèmes de récolte et méthodes de conservation des fourrages TP/TD Visite d’exploitation – objectif : mise en situation, sensibilisation et analyse du système fourrager Relevé floristique Analyse fourragère et prédiction de la valeur alimentaire Méthodes pédagogiques Cours – TP/TD – Visite d’exploitation – Utilisation du Rami fourrager (jeu de plateau) Contrôle des connaissances Etude de cas en groupe: Rapport (25% de la note finale) ; Oral (25% de la note finale). Examen ecrit individuel et sans document (50% de la note finale) Bibliographie Prévision de la valeur nutritive des aliments pour ruminants (INRA Ed., 1979) Forage evaluation in ruminant nutrition (Ed. Givens, Owen, Axford &Omed, CABI Publishing) Les fourrages et l’éleveur (Ed. TEC & DOC) Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 19 2.5 – Génomique - cours : 20h - TD : 16h – TP et visites :16h - Projet : 8h [email protected] Responsables : F.Regad Autres intervenants : L Gentzbittel, M Zouine, B Van der Rest La génomique est une discipline de la biologie moderne qui a pour objet l'étude du fonctionnement d'un organisme à l'échelle de son génome, et non plus limitée à un seul gène. La génomique se divise en deux branches : la génomique structurale, qui se charge du séquençage du génome entier, et la génomique fonctionnelle, qui vise à déterminer la fonction et l'expression des gènes séquencés en caractérisant le transcriptome, le protéome et le métabolome. Objectifs Former les ingénieurs à la démarche intellectuelle et aux techniques expérimentales liées à la génomique et à la post génomique. Programme Unité 1 : Structure du génome Les grands projets séquençage génomique Les technologies de séquençages de nouvelle génération Le séquençage environnemental Les nouvelles méthodes de génotypage à haut débit Conservations de synténie Unité 2 : Transcriptome Les analyses différentielles de l’expression génique : rappels Microarrays, puces à ADN, RNA-seq et PCR quantitative à haut débit Visite de platefomes du génopole Toulousain : - Get transcriptome (Plateforme biopuce- INSA Toulouse) - Get Plage (Plateforme de génomique – Campus INRA d’Auzeville) Unité 3 : Protéome et Métabolome Les méthodologies d’analyses en masse des protéines : l’approche protéomique. Les méthodologies d’analyses en masse des métabolites : l’approche métabolomique. TP protéomique IPBS Visite de platefomes du génopole Toulousain : - Plateforme Protéomique (IPBS Toulouse) - Plateforme Métabolomique (CNRS-UPS Auzeville) Unité 4 : Exploration fonctionnelle La génomique fonctionnelle. La génétique inverse : Mutagenèse aléatoire (Tilling), Mutagenèse dirigée, Interférence ARN Epigénétique. Méthodes pédagogiques Cours et travaux dirigés, travaux pratiques et visites de plateformes, intervenants extérieurs Contrôle des connaissances La note totale du module se décompose en deux évaluations : 75% de la note est établie par une synthèse d’article et présentation orale 25% de la note vient des CR du TP protéomique. Bibliographie - Génomes. Terence A. Brown. Flammarion médecine-sciences, 2004. - Génétique, gènes et génomes : Cours et questions de révision, ouvrage collectif par Jean-Luc - Rossignol, Roland Berger, Jean Deutsch, Marc Fellous. Dunod, 2004. - Des gènes aux génomes. Stuart J. Edelstein. Odile Jacob, 2002. - Introduction à l'analyse génétique. Anthony J. F. Griffiths, Jeffrey H. Miller, David T. Suzuki, Chrystelle Sanlaville, Richard C. Lewontin, William M. Gelbart (trad. Chrystelle Sanlaville, Denise Aragnol). De Boeck Université, 2002. - * La génomique en biologie végétale. Jean-François Morot-Gaudry, Jean-François Briat. Editions Quae, 2004. - *La révolution génomique animale : Repenser la sélection. Ouvrage collectif. Editions France Agricole, 2011. *ebook scholarvox Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 20 2.6 – Agriculture biologique et compost – 60h (cours : 18h, TD/TP : 20h, visites : 16h, travail personnel : 6h) Responsables : M. Barret [email protected] Autres intervenants : Véronique Sarthou, Valérie Martignolle (organisme certificateur), Eric Rossignol (Chambre d’agriculture Ariège), Thomas Breuzet (DG DANIVAL) Objectifs Cet enseignement développe un exemple d’un système de production qui s’inscrit dans un objectif de durabilité de l’agriculture. Dans ce module, c’est toute la filière de l’agriculture biologique qui sera abordée : de la qualité des intrants jusqu’aux débouchés des produits, tant au niveau théorique (cours) que pratique (visite, travaux pratiques). Programme Après une introduction qui replace l’agriculture biologique dans le contexte de l’agriculture durable, ce premier volet du module présente la diversité de l’agriculture biologique par son histoire et les mouvements qui la composent, puis s’attache à montrer les différentes techniques de production en lien avec la réglementation qui la régit (labels, certification, certificateurs, logos). Il présente ensuite un aperçu de la commercialisation et des diverses perspectives d’évolution de ce mode de production (12h cours, 4h travaux dirigés et 8h visites) Un des points clé de l’agriculture biologique est ensuite abordé : le maintien de la fertilité des sols par des engrais et des amendements organiques. Au cours de cet enseignement sera exposée la technologie d’élaboration des fertilisants organiques, de la qualité des matières premières aux procédés de compostage et de méthanisation (cours et visites en entreprises) Le dernier point abordé par cet enseignement est l’homologation des composts (réglementation, normalisation, tests de phytotoxicité, tests de maturité des composts) Méthodes pédagogiques Ces enseignements sont réalisés sous la forme de cours théoriques, travaux dirigés et pratiques directement en application avec ce qui est observé au cours des différentes visites. Contrôle des connaissances Contrôle écrit (sans documents, coef. 0,25), remise d’un compte rendu de TP par binôme/trinôme (coef. 0,25) et présentation orale de travaux de recherche/synthèse en groupes (coef 0,5). Bibliographie C. de Carné-Carnavalet, 2012. Agriculture biologique, une approche scientifique. France Agricole Eds, 472 pp G. Guet, A. Chotard, K. Riman, 2011. Mémento d’Agriculture Biologique. France Agricole Eds, 392 pp P. Behra, 2013. Chimie et Environnement. Ed. Dunod, 432p. R.T. Haug, 1993. The practical handbook of compost engineering. Lewis Publishers, 717p Union Européenne, 2007. Règlement (CE) N° 834/2007 du Conseil du 28 juin 2007 relatif à la production biologique et à l'étiquetage des produits biologiques et abrogeant le règlement (CEE) n° 2092/91. 36 pp Union Européenne, 2008. Règlement (CE) N° 889/2008 DE LA COMMISSION du 5 septembre 2008 portant modalités d'application du règlement (CE) n° 834/2007 du Conseil relatif à la production biologique et à l'étiquetage des produits biologiques en ce qui concerne la production biologique, l'étiquetage et les contrôles. 135 pp Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 21 UNITES DE PRE-SPECIALISATION SERIE 3 3.1 – Gestion des flux et maîtrise des coûts - cours: 20h – TD: 30h – Travail personnel : 10h Responsable : B. Legagneux [email protected] Autres intervenants : O Delahaye [email protected] Objectifs Approfondir les méthodes visant à évaluer, diagnostiquer et améliorer les performances d’une entreprise par une meilleure maîtrise des flux et des coûts. Ceci passe par * - l’organisation de la production - la gestion des flux de matières en interne et en externe, et donc des stocks - la mesure ainsi que le suivi des coûts et de la rentabilité de l’activité Programme 1–Gestion analytique et contrôle de gestion - introduction à la démarche analytique - détermination des coûts : coût partiel, coût complet - les différentes notions de coût dans la prise de décision : coûts variables, coûts marginaux, standards, coût d’opportunité. 2–Gestion de production et logistique - méthodes de pilotage des flux de production - simulation de pilotage des flux de production(MRP) - logistique des produits agroalimentaires coûts Méthodes pédagogiques Courts exposés magistraux appuyés par des documents à travailler personnellement ; exercices ; étude d’un cas et visite d’entreprises visant à l’acquisition d’un savoir-faire ; jeu de simulation en pilotage des flux ; conférence d’un praticien pour parler des métiers dans ces fonctions. Contrôle des connaissances Examen écrit sous la forme de questions nécessitant de courtes réponses sans documents (coef 60% répartis de manière égale entre les 2 parties du programme) Etude de cas réalisée par groupe d’étudiants et donnant lieu à un rapport (coef 40%) Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 22 3.2 – Génie des procédés Alimentaires : bilans, rhéologie et réacteurs – cours : 30h – TD : 14h – Travail personnel : 16h Responsable : G. de Billerbeck [email protected] Autres intervenants : Carine Julcour, Brigitte Caussat, Hugues Vergnes Objectifs Comprendre les fondements scientifiques de : Les bilans matière et énergie dans les procédés, Les propriétés rhéologiques des produits alimentaires, La mise en œuvre des réactions chimiques ou biochimiques dans les réacteurs. Programme Bilans Matière et Energie - 20h (8h cours, 2h TD, 10h Travail Personnel) Définitions - Equations de bilan - Variance d'un système Systèmes non réactifs en régime permanent Systèmes réactifs en régime permanent Applications de calcul sur procédés agro-alimentaires Rhéologie de produits alimentaires – 20h (8h cours, 6h TD, 6h Travail personnel) Concepts fondamentaux en transferts de quantité de mouvement Transferts diffusifs de quantité de mouvement – Loi de Newton – Fluides non newtoniens Les équations de conservation locales en mécanique des fluides Les principales conditions aux limites utilisées en mécanique des fluides Applications aux produits alimentaires Génie des réacteurs - 20h (14h cours, 6h TD) La réaction chimique ou biochimique Les réacteurs idéaux: fermé/ouvert, RAC, piston Analyse des réactions dans les réacteurs idéaux isothermes Une technique de diagnostic des réacteurs: la DTS Technologie des bio-réacteurs (exemples) Réactions en phase hétérogène: gaz-liquide et liquide-solide, compétition transferts / réaction (notions) Applications, exemple de dimensionnement d'un réacteur enzymatique Méthodes pédagogiques Cours théoriques et analyse de cas d’application agro-alimentaires Contrôle des connaissances Epreuve écrite de 1h30 avec documents. Rapports notés à l’issue des travaux personnels. Bibliographie J-Villermaux, Génie de la réaction chimique, 2e édition, Ed. Lavoisier, 2000. AC-Roudot, Rhéologie et analyse de texture des aliments, Ed. Lavoisier, 2001. RB-Bird, WE-Stewart et EN-Lightfoot, Transport Phenomena, 2nd Edition, Ed. Wiley, 2001. Techniques de l’Ingénieur, Articles scientifiques divers. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 23 3.3 - Eau et Environnement - 60h (cours, TP, Visites) Responsable : S Jean [email protected] Objectifs La sensibilisation aux problèmes de l’eau (crue, pénuries, pollution..) et aux enjeux socio-économiques et géopolitiques nécessite de commencer la pré-spécialisation par une mise en ordre et un assemblage des connaissances sur : - le fonctionnement et la qualité hydrobiologique, - l’anthropisation des hydrosystèmes, - le diagnostic environnemental des hydrosystèmes. Les ressources en eau et leur renouvellement dans l’unité fonctionnelle à l’échelle des bassins versants tels que l’Adour et la Garonne pourraient servir de cadre de référence. Ce module de 60 heures est structuré en 3 sous modules et s’appuie sur de nombreuses visites de terrain afin d’illustrer les études de cas traitées en cours. Il repose ainsi sur la complémentarité pédagogique entre les enseigants de l’ENSAT, de l’UPS et les professionnels en environnement aquatique. Programme ➧ Fonctionnement et qualité des milieux aquatiques Organisation spatiales des communautés de poissons Ecologie et systématiques des poissons (jeux de carte en TD !) Directive Carde sur l’Eau, de la réglementation à des études de cas sur la qualité des masses d’eau (lac, zone humide, rivière, littoral) Diagnostic (sortie terrain et TP sur les indices biotiques macrophyte, invertébrés et poisson) ➧ Anthropisation des hydrosystèmes Cycle d’utilisation de l’eau Utilisation de l’eau par les industries (example et visite du complexe EDF de Golfech) Pollution des eaux Eau potable et assainissement (visite des stations de Pech David et de Ginestou) ➧ Focus sur hydroélectricité et environnement aquatique (chaire pédagogique EDF) Ces enseignements sont effectués par des ingénieurs d’EDF Introduction à l’hydroélectricité et aux aménagements hydrauliques Principaux impacts de l’hydroélectricité et études d’impacts Viste de chantier Méthodes pédagogiques Cours – TD/TP – et nombreuses Visites Contrôle des connaissances Examen écrit individuel et restitution oral en groupe Bibliographie Chimie des milieux aquatiques (L. Sigg, W. Stumm, P. Behra. Masson, Paris 1992) Limnologie générale (R. Pourriot, M. Meybecck. Masson, Paris 1995) Rehabilitation of rivers for fish (I.G. Cowx, R.L. Welcomme. FAO edition 1998) Gestion des milieux aquatiques (Wasson et al. Cemagref edition 1998) Les poissons d’eau douce de France (Keith et al. Biotope edition 2011) Production d'électricité par aménagements hydrauliques (Lavy P. Techniques de l'ingénieur 2004) Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 24 3.4 – L’animal dans son environnement - 60h Responsable : Z. Vitezica Autres intervenants : S. Chriki et intervenants extérieurs [email protected] Objectifs Ce module propose d’aborder sous un large angle de vue la place de l’animal dans son environnement à différentes échelles socio-spatiales. Pour chaque niveau d’approche, un thème spécifique sera abordé au travers d’exemples pris dans différentes filières animales : ANIMAL TROUPEAU SYSTEME D’ELEVAGE ABATTOIR TERRITOIRE APPROCHE GLOBALE Bases physiologiques de l’adaptation des animaux Evaluation du bien être animal en élevage Logement des animaux : évolution en matière de réglementation bien-être et conséquences en élevage – exemple des poules pondeuses Facteurs de stress ante-mortem : bases réglementaires et applications Les systèmes d’élevage ovins à composante pastorale Multifonctionnalité des systèmes d’élevage de montagne Evaluation de la durabilité des sytèmes d’élevage : environnement, société et économie Programme - Bases physiologiques de l’adapation de l’animal à son milieu : mesures et interprétations. - Comportement des animaux dans un troupeau (relation de l’animal avec ses congénères) et évaluation multicritère du bien-être animal (Welfare Quality®). - Evolution des sytèmes d’élevage pour une amélioration du bien-être des animaux : retour d’expérience en élevage de poules pondeuses (L. Bignon). - Les facteurs de stress ante-mortem influençant la qualité des produits animaux. - Les systèmes d’élevage ovins à composante pastorale : la valorisation d’un territoire. - Les systèmes d’élevage de montagne et leur multifonctionnalité : l’exemple des Pyrénées. - Demandes sociétales et systèmes d’élevage. - Approche systémique : exemple de la filière cunicole. - Systémique et productions avicoles : une approche de la durabilité ? - Evaluation de la durabilité des systèmes d’élevage : méthodologie et exemples d’applications. - L’analyse de cycle de vie : exemples en aquaculture. Méthodes pédagogiques Cours, dont une partie importante sera assurée par des personnalités extérieures. Visites en exploitations : deux systèmes d’élevage différents dans un même territoire pour une même production principale. Sortie en montagne : occupation du territoire par les systèmes d’élevage. Contrôle des connaissances Examen écrit sous forme de questions nécessitant de courtes réponses sans documents (60% de la note). Étude en groupe suite aux visites d’exploitations donnant lieu à un exposé oral (40% de la note). Bibliographie Dedieu B., P. Faverdin, J.Y. Dourmad, A. Gibon. 2008. Système d'élevage, un concept pour raisonner les transformations de l'élevage. INRA Prod. Anim., 21(1), 45-58. Griffon M. Nourrir la planète. Pour une révolution doublement verte. Ed. Odile Jacob, 2006, 456 p. Veissier I., R. Botreau, P. Perny. 2010. Evaluation multicritère appliquée au bien-être des animaux en ferme ou à l’abattoir : des difficultés et solutions du projets Welfare Quality®. INRA Prod. Anim., 23(3), 269-284. Welfare quality Network, http://www.welfarequality.net/network/44186/5/0/40, 02/10/2013 Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 25 3.5 – Semences et Amélioration des Plantes – Cours : 25h - TP/TD : 35h Responsable : C. BEN [email protected] Intervenants: C. BEN, L. GENTZBITTEL Objectifs Au cours de ce module, seront abordés tous les aspects concernant la semence: de la biologie et du développement de l'embryon aux aspects règlementaires de la filière avec un accent mis sur la qualité des semences et l'amélioration des espèces. Cet enseignement vise à la mise en application des principes essentiels dégagés dans les cours théoriques de génétique, de statistique et d'amélioration des plantes. Il établit également les bases théoriques nécessaires au suivi du module de 'Seléction variétale: vers une agriculture durable' de la spécialisation ABSV en 3ème année. Programme 1- Amélioration des Plantes – (Cours /TD~17h) Systèmes reproductifs des plantes et méthodes de sélection végétale (notions d'auto-incompatibilité et de stérilité mâle) Bases génétique de l'hétérosis des caractères agronomiques et physiologiques L'utilisation de la mutation dans l'amélioration des plantes Polyploïdes, aneuploïdes et leur utilisation en génétique végétale Epistasie 2. TP/Projet (24h): Interaction Génotype X Environnement Exploitation de la biodiversité naturelle pour les programmes de sélection végétale 3- Semences – (Atelier bibliographique basé sur des articles scientifiques en anglais~12h, Visite d'une entreprise semencière) Fécondation, développement de l'embryon, mise en place des réserves Technologies de production de semences Qualité des semences 4-Conférences Protection des obtentions végétales Organisation de la filière semencière et réglementation européenne Brevetabilité du vivant Méthodes pédagogiques Cours théoriques, TP/Projet, Travaux dirigés (Analyse statistique des données par informatique (logiciel R) si nécessaire). Visites d'entreprises semencières, Conférences par des professionnels des filières semencières Contrôle des connaissances Examen (60%) Atelier Bibliographique : exposé en binôme (15%) Compte-rendu de TP (25%) Pré-requis Connaissance des méthodes de statistiques d’analyses multi-variables et de planification d’expériences développées dans l’UE ‘Maths et génétiques appliquées à l’agronomie’ (Seconde année d’ENSAT Semestre 7). Notions de base concernant l’utilisation du logiciel R. 3.6 – Télédétection et SIG - 60h Identique à l’UE 2.3 – voir le programme de cette UE Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 26 3.7 – Modélisation en agronomie et sciences de l'environnement – Cours : 20h – TD/TP : 20h – Travail personnel: 20h Responsable : Christophe Laplanche [email protected] Autres Intervenants : Claude Monteil, David Sheeren Objectifs Les modèles numériques sont des modèles mathématiques de systèmes complexes mis en forme à l'aide de moyens informatiques. Ils sont et seront de plus en plus utilisés en agronomie et en sciences de l'environnement à des fins d'exploration (par les chercheurs), d'évaluation et de communication (par les ingénieurs) et de décision (par les gestionnaires). Un agronome, qu'il soit chercheur, ingénieur ou gestionnaire, doit être en mesure de pouvoir interpréter et évaluer les résultats d'un modèle numérique. Un ingénieur agronome chercheur pourra au cours de sa carrière proposer un nouveau modèle d'un système agronomique ou environnemental. Un ingénieur agronome scientifique devra être en mesure de pouvoir appliquer un modèle existant. Enfin, un ingénieur agronome gestionnaire devra être capable d'interpréter et de critiquer les résultats d'un modèle fournis par un tiers. Cette UE est une introduction à la modélisation et donne un aperçu des vastes possibilités qu'offre la modélisation en agronomie et en sciences de l'environnement. En vue des connaissances acquises au cours des trois premiers semestres du cursus ENSAT, cette UE se focalise principalement sur des modèles statistiques de systèmes complexes. Cette UE n'a cependant pas pour but de développer des aspects théoriques mathématiques ou statistiques. L'étude des modèles statistiques permettra aux étudiants de découvrir de nouveaux concepts offrant une nouvelle vision des systèmes agronomiques et environnementaux et de structurer et assimiler les connaissances abordées en statistiques au cours du cursus ENSAT (MI1, MI2, MI3). Ces nouveaux concepts seront illustrés à l'aide d'exemples en agronomie et sciences de l'environnement. Les concepts introduits au cours de cette UE au travers des modèles statistiques s'appliquent néanmoins aux autres types de modèles numériques. Ceci permettra aux étudiants ayant suivi l'UE de pouvoir développer, interpréter et évaluer les résultats d'autres types de modèles numériques utilisés en agronomie et sciences de l'environnement. Organisation et méthodes pédagogiques Cette UE de 60 h se décompose en deux parties, une partie Théorie et exemples (40 h) et une partie Ateliers (20 h). Les concepts et outils de modélisation sont présentés dans la partie Théorie et exemples et seront illustrés par des exemples en agronomie et sciences de l'environnement. Dans la partie Atelier, les étudiants en binôme appliqueront un modèle numérique existant à l'aide des outils présentés en cours dans la partie Théorie et exemples. Les enseignants de l'UE mettront à disposition des étudiants des documents scientifiques présentant différents modèles. Les étudiants présenteront le modèle qu'ils auront étudié ainsi que leurs résultats sous la forme d'une soutenance orale. Les modèles statistiques abordés au cours des trois premiers semestres du cursus ENSAT (ANOVA, régression linéaire) limitent l'ingénieur agronome à un champ restreint d'expérimentations et de questions scientifiques qu'il souhaitent aborder. Les modèles statistiques abordés au cours de cette UE permettront d'élargir les possibilités d'action de l'ingénieur agronome qui ne sera plus limité dans son questionnement par les limites de l'approche statistique mais par ses connaissances du système étudié, les variables qu'il peut mesurer et sa créativité. L'UE débutera par une présentation sous un nouvel angle – celui de la modélisation – des modèles statistiques déjà abordés (ANOVA, régression linéaire). Ces modèles sont un cas particuliers de modèles statistiques plus complexes qui seront alors présentés. Un autre type de modèles numériques, les modèles multi-agents, seront présentés en fin d'UE. Contrôle des connaissances Un examen écrit (10 points) : durée de 2 h, documents et calculatrices autorisés. Atelier (10 points) : Les binômes présenteront leurs travaux sous forme d'une soutenance orale. La qualité de la présentation (oral, supports) et la qualité des simulations seront évaluées. Bibliographie (les ouvrages [2, 3, 4] sont disponibles à la bibliothèque de l'ENSAT) [1] Hierarchical modelling for the environmental sciences, Oxford University Press, Eds: Clark, J.S., and Gelfand, A.E., 2006 [2] Faraway, J.J.: Linear Models With R, Chapman & Hall/CRC, 2004 [3] Faraway, J.J.: Extending the Linear Model With R: Generalized Linear, Mixed Effects and Nonparametric Regression Models, Chapman & Hall/CRC, 2005 [4] Treuil J.-P., Drogoul A., Zucker J.-D. : Modélisation et simulation à base d'agents. Exemples commentés, outils informatiques et questions théoriques, Dunod, pp. 352, 2008. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 27 UNITES DE PRE-SPECIALISATION SERIE 4 4.1 - Sociologie des mondes agricoles Cours : 20h – TD : 20h – Travaux personnels: 20h Responsable : François PURSEIGLE [email protected] Autres intervenants: Bertrand HERVIEU, Chercheur associé au Cevipof-Sciences po-Paris, chercheurs du CIRAD et du CIHEAM Intervenants professionnels-visite entreprises: Fédérationrégionale des coopérativesagricoles, ARVALIS, Association Générale des Producteurs de Maïs, Chambred’agriculture, Jeunesagriculteurs, Association Générale des producteurs de blé, Interprofessionbovine (CIV), FRCUMA. Objectifs Cet enseignement interrogera dans une perspective sociologique, ce qu’il convient aujourd’hui d’appeler les mondes agricoles. Tout d’abord, il reviendra sur la manière avec laquelle la question paysanne s’est posée à travers l’histoire et les débats auxquels elle a donné lieu autour de l’opposition ville-campagnes, du village comme société paysanne et de la « renaissance rurale ». Il portera également sur l’émergence de la figure de l’agriculteur dans les sociétés contemporaines. Les questions de la modernisation de l’agriculture (changement technique, innovations), du maintien de la famille agricole comme structure de production (place des femmes et du patrimoine) de l’exode rural seront ici abordées. Le thème des agricultures et des paysanneries dans la globalisation sera ici central. Nous nous interrogerons sur la place des producteurs agricoles dans un monde urbanisé et sur la coexistence des différentes formes d’agriculture présentent à l’échelle du globe : agriculture de subsistance, agriculture familiale, agriculture de firme.Comment se recomposent les formes d’organisation du travail en agriculture ? Du Nord au Sud, quelles sont les dynamiques démographiques ? Quelles sont les formes de résistance ou d’adaptation à la globalisation ? Cet enseignement portera sur les modes d’actions et de représentations des agriculteurs. Il proposera notamment des clefs de lecture du fonctionnement des organisations professionnelles. Il offrira des concepts et outils nécessaires pour comprendre les différentes dimensions de l’action collective en agriculture, le développement agricole, les stratégies des groupes d’intérêt agricoles et la place des agriculteurs dans les débats publiques. Enfin, cet enseignement fournira l’ensemble des outils nécessaires aux jeunes ingénieurs désirant évoluer dans les mondes agricoles et les organisations professionnelles. Il est ouvert aux étudiants qui se destinent aux spécialités Agromag, Spet ou qui envisagent une spécialisation dans le développement agricole (Paris, Montpellier) Programme 1. Introduction à la sociologie des mondes ruraux et agricoles 2. Le « village » comme société paysanne 2.1. L’opposition ville-campagne ; 2.2. Les théories des sociétés paysannes 3. De l’invention du paysan à l’entrée en agriculture 3.1. Les changements techniques et la modernisation de l’agriculture 3.2. Le maintien de la famille comme structure de production 4. Les mondes agricoles dans la globalisation 4.1. Un monde urbanisé 4.2. Une population agricole croissante et pourtant minoritaire 4.3. Les agricultures familiales 4.4. Les agricultures de firme 4.5. Les agricultures de subsistance 5. Les mondes agricoles en France et en Europe 5.1. L’effacement démographique 5.2. Les formes d’exercice du métier 5.3.La place des agriculteurs dans la gouvernance des territoires 5.4.Les agriculteurs en politique 6. L’organisation de la profession agricole 6.1. Les O.P.A., genèse d’un système complexe 6.2. L’organisation du développement agricole 6.3. La coopération agricole 6.4. Les instituts techniques agricoles 6.4. Le lobbying et les groupes d’intérêt agricoles Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 28 Méthodes pédagogiques Les enseignements seront réalisés sous la forme de cours (20h), de travaux dirigés (20h) et de travaux pratiques (20h) réalisés en partenariats avec des responsables professionnels et des chercheurs du CIRAD et du CIHEAM. Adossés à des enquêtes de terrain, les TP reposeront sur la réalisation de monographie d’ organisations professionnelles ou de petites régions agricoles. Contrôle des connaissances Réalisation de monographies (note collective). Rédaction d’une fiche de lecture (note individuelle) Bibliographie HERVIEU B, PURSEIGLE F. (2013), Sociologie des mondes agricoles, Armand Colin, Collection U. HERVIEU B, MAYER M., MULLER P., PURSEIGLE F., REMY R. (2010), Les mondes agricoles en politique, Presses de Sciences po. MENDRAS H. (1976), Les sociétés paysannes, Paris, Gallimard. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 29 4.2 – Procédés enzymatiques et fermentaires - 20h cours - 8h TD – 32h TP Responsables : T. Liboz [email protected] Autres intervenants : A. Lebrihi, E. Pinelli Objectifs Les microorganismes et les enzymes sont très utilisés comme catalyseurs biologiques dans le domaine des agro-industries (industries alimentaires et non alimentaires). L’objectif de cet enseignement est de permettre aux étudiants de connaitre les voies métaboliques impliquées dans la production de molécules à haute valeur ajoutée (arômes, antibiotiques …), de savoir appréhender la conduite de cultures industrielles de microorganismes (fermentations), et de comprendre le rôle joué par les enzymes ainsi que de savoir moduler leurs actions. L’originalité de cet enseignement est qu’il repose sur une trame de travaux pratiques qui constituent plus de la moitié du volume horaire du module ; Tous les aspects technologiques développés en cours (depuis le paramétrage de cultures jusqu’à l’exploitation d’enzymes pour reproduire une transformation industrielle) sont mis en application lors de ce TP géant (1 semaine en discontinu). Programme 1 - Physiologie microbienne et sélection d’organismes d’intérêt industriel (6h cours, 2h TD, 6h TP) - Grandes voies métaboliques fermentaires - Régulation du métabolisme des hydrates de carbones - Régulation de la biosynthèse des métabolites primaires et secondaires - Amélioration des souches d’intérêt industriel 2 - Conduites de fermentations industrielles et alimentaires (4h cours, 2h TD, 6h TP) - Conduite de cultures microbiennes : cultures batch, semi continue et continue - Fermentations alimentaires (produits d’origines animales et végétales) - Exemples de production de molécules à haute valeur ajoutée (non alimentaire) 3 - Génie enzymatique (10h cours, 24h TP/TD) - Production des enzymes à l’échelle industrielle - Immobilisation des enzymes et utilisation en bioréacteurs - Applications dans le domaine agro-industriel Contrôle des connaissances - 1 compte rendu de TP global (microbiologie & enzymologie) : 50% note finale (par groupe) - 1 examen terminal partie microbiologie : 25% note finale (individuel) - 1 examen terminal partie enzymologie : 25% note finale (individuel) Bibliographie Génie Enzymatique (Coutouly) - Ed Masson Biochemical Engineering Fundamentals (Bailey and Ollis) - Ed McGraw-Hill Book Company Biotechnologie des antibiotiques (Larpent et Sanglier) - Ed Masson Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 30 4.3 – Sol et Environnement - (22h cours, 8h TP, 10h TD, 10h sortie, 10h travail personnel) Responsables : M. Guiresse (ATER) [email protected] Autres intervenants : M. Barret, B. Pey, C. Gers, S.Beaufort, professeurs invités anglophones (cours en anglais) : Anna Seniszak Objectifs Interface entre la biosphère, la lithosphère, l’atmosphère et l’hydrosphère, le sol assure de nombreux services écosystémiques. Les pouvoirs publics sont en train d’en prendre conscience et cherchent à protéger ce patrimoine commun. Une directive cadre européenne est en cours d’élaboration sur les sols. Le texte en préparation a pour objectif de mettre en place un cadre d’action commun au niveau de l’Union Européenne, destiné à préserver, à protéger et à restaurer les sols. Ce texte souligne les cinq menaces prioritaires qui pèsent sur nos sols européens : érosion, perte de matière organique, contamination, imperméabilisation et diminution de la diversité biologique. Dans ce module, notre objectif est de donner des méthodologies d’approches pour que les étudiants soient capables de hiérarchiser, parmi toutes les caractéristiques des sols, celles qui, d’une part, vont favoriser la potentialité des sols à produire, et d’autre part, celles qui peuvent être à l’origine d’une baisse d’une fertilité voire d’un dysfonctionnement dans l’environnement, de manière à pourvoir répondre aux questions sociétales pour lesquelles de gros enjeux pèsent sur les sols. Un accent est mis sur l’utilisation de la micro et macro faune du sol pour la bioindication de la qualité des sols, dans un contexte environnemental et agronomique. Programme 1- Diversité des sols et de leurs fonctions (L. Gandois 4h cours, et M. Guiresse/L. Gandois 6h sortie terrain) Les principaux processus de pédogénèse sont expliqués de manière à comprendre les propriétés des sols qui en découlent. Les fonctions environnementales des sols, ainsi que la pression anthropique sur celles- ci sont exposées à l’échelle globale et régionale. 2. Evaluation de la qualité des sols (L. Gandois, 8h TD) En TD, une évalutation de la qualité des sols sera effectuée sur la base d’une méthodologie presentée en cours. Chaque groupe doit évaluer la qualité des sols d’un département et identifier les sols à preserver en priorités pour leurs qualités agronomiques. 3- Pression anthropique sur les sols : erosion des sols, sols urbains Les grands processus de l’érosion sont décrits avec une iconographie très fournie. La compréhension des différents agents de l’érosion, permet d’aller jusqu’à la mise en équation de l’érosion hydrique (Equation de Wishmeier). Enfin, les principaux moyens de lutte sont également expliqués. Les problématiques spécifiques aux sols urbains (compaction, contamination) seront abordées. 4- Bioindication de la qualité des sols, contexte environnemental et agronomique. Laure Gandois (2h et sortie terrain 4h), Maialen Barret (2h cours, 2h TD + 8 h de TP) Sandra Beaufort (8 h de TP), Anna Seniszak (6 h de cours et TD), Charles Gers (2h de cours). La biodiversité des sols est abordée pour son rôle dans la régulation des fonctions du sol mais également pour son rôle d’indicateur de qualité des sols. Il sera abordé le rôle de la mésofaune (vers de terre), de la microfaune (acariens, collemboles) et des microorganismes (champignons et bactéries) en tant qu'acteurs actifs des grandes fonctions biologiques et agronomiques des sols et dans la dynamique des contaminants. Leur utilisation en tant que bioindicateurs, développée en cours sera mise en application lors d’une sortie de terrain et de TP de microbiologie et d’extraction de la microfaune, dans le contexte de l’impact du travail du sol sur la biodiversité. 5- Analyse et interprétation des résultats : (10h : travail personnel et exposés) Le module comprend un rendu oral (TD) et deux rapports (TD et TP). Une synthèse personnelle sur le cours est également demandée. Du temps de préparation est ainsi nécessaire pour mener à bien l’interprétation des résultats et la rédaction des comptes rendus. Contrôle des connaissances La note totale du module se décompose en deux évaluations : 50% de la note est établie par une synthèse individuelle de l’ensemble des cours sur les sols 25% de la note vient des CR par trinôme des TP microbiologie et 25 % du TD sur la qualité des sols (Rapport et présentation orale). Bibliographie Bigham J.M. 1994. Methods of soil analysis. Part 2 Microbiological and biochemical properties. Soil Science Society of America Book serie : 5. 1121 p. Gavalda D., 2001. Devenir des éléments traces métalliques dans les boulbènes (Luvirédoxisols) après épandage de boues granulées. Thèse de doctorat INP Toulouse. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 31 Gobat J.M., Aragno M., W. Matthey, 1998. Le sol vivant. Base de pédologie. Biologie des sols Presses polytechniques et universitaires romandes, collection gérer l’environnement, Lausanne. 519p R.T. Haug, 1993. The practical handbook of compost engineering. Lewis Publishers, 717p. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 32 4.4 – Des matières premières végétales aux systèmes d’alimentation - 60h – cours : 27h – TD : 3h – TP : 4h – visite : 6h - travail de groupe (APP) : 10 h Responsable: C. BONNEFONT [email protected] Autres intervenants : C. BAYOURTHE et intervenants extérieurs Objectifs Connaitre les caractéristiques nutritionnelles des principales matières premières entrant dans la composition des aliments composés pour les animaux d’élevage. Connaitre et comprendre l'impact de traitements technologiques et chimiques sur la qualité de ces matières premières en fonction de leur utilisation chezl'espèce cible. Connaître les principales enzymes utilisées en alimentation animale et connaître leurs effets sur les matières premières Connaitre le secteur règlementé de l'alimentation animale et lesprocess de fabrication des aliments composés. Concevoir et analyser une formule alimentaire en fonction des contraintes nutritionnelles, technologiques et économiques. Connaître les grands principes de la fabrication d’aliment à la ferme Comprendre et analyser les systèmes d'alimentation en élevage de monogastriques. Programme 1- Typologie des principales matières premières (céréales, oléo-protéagineux, quelques co-produits) : aspects taxonomique, agronomique, physico-chimique et nutritionnel. 2- Traitements technologiques, chimiqueset enzymatiques des matières premières végétales 3- De la programmation linéaire à la formulation d'un aliment composé Rappels sur la programmation linéaire. Les différentes contraintes en formulation. La formulation au moindre coût et l'analyse aux marges: un exemple à l'aide du logiciel PORFAL. La multi formulation en usine. 4- Fabrication d’aliments. Fabrication d’aliments à la ferme (FAF) Fabrication industrielle des aliments composés. Le secteur des industries de l’alimentation animale et sa règlementation. 5- Les aliments composés au cœur des systèmes d'alimentation. Systèmes d’alimentation volaille: l'exemple des palmipèdes. Systèmes d’alimentation des porcs. Le logiciel INRAporc, une application à l'analyse des systèmes d'alimentation. Méthodes pédagogiques: Cours, TD, TP, visite, travail de groupe Contrôle des connaissances Présentation orale du travail de groupe (40%). Examen écrit (60%). Bibliographie La revue de l’alimentation animale. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 33 4.5 – Bio-informatique - 60h Responsables : Mohamed Zouine Autres intervenants : L Gentzbittel, F Regad [email protected] Objectifs Former les ingénieurs à la démarche intellectuelle et aux techniques informatiques liées aux traitements et à l’intégration des données issues des approches globales à haut débit comme la génomique et la post génomique. La mise en pratique des démarches sera réalisée par l’analyse concrète de problématiques biologiques. • • • • Programme Initiation à l’environnement UNIX/LINUX Programmation en Bioinformatique • Apprentissage de la programmation structurée • Mise en œuvre en utilisant le langage Perl • Utilisation de bibliothèques de programmation dédiée à la bioinformatique. • Apprentissage de la programmation Web (code HTML, site web). Bioinformatique des séquences • Banque de données généralistes et spécialisées. • Analyse et comparaison de séquences. • Caractérisation de familles de protéines. Bioinformatique pour la génomique et la post-génomique • Méthodes d’annotation de génomes • Traitement les données issues des approches expérimentales à haut débit. Méthodes pédagogiques Cours et travaux dirigés, visite de la plateforme bioinformatique de l’INRA de Toulouse. Contrôle des connaissances Un projet noté par binôme (50%) et une évaluation individuelle (50%). La consultation de documents est autorisée lors de l’évaluation individuelle. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 34 4.6 – Gestion de l'Eau en Agriculture - 60h Responsable : M. Bertoni [email protected] Autres intervenants : J.E. Bergez INRA, D. Burger – Leenhardt INRA, JM. Deumier, Arvalis, J. Georges, Chambre d’Agriculture Haute Garonne, M. Guiresse ENSAT, P. Maury ENSAT , E Justes INRA, J.F. Royer Météo France, B. Verdier (Conseil général Haute Garonne). Objectifs Acquérir l'essentiel des connaissances et des méthodes modernes impliquées dans la gestion de l'eau, à l'échelle de la culture, de l'exploitation et du territoire. Programme 1 - Contexte (6h) 1.1 Scenarii d'évolution du climat – conséquences pour l'Agriculture 1.2 Contexte économique et législatif 2 - Gestion de l'eau en Agriculture (10h) 2.1 Ressource en eau et irrigation (aspects économiques et tarification) 2.2 Stratégies agronomiques et pratiques agricoles 2.3 Les systèmes de cultures secs et irrigués et sous contraintes 3 - Outils et méthodes pour la conduite de l'irrigation (10h) 3.1 Basées sur le suivi des cultures 3.2 Basées sur la modélisation 4- L'irrigation (10h) 4.1 Techniques d'irrigation 4.2 Efficience de l'eau 4.3 Impact sur l'environnement 5- Gestion de la ressource en eau à l'échelle d'un territoire (10h) 5.1 La gestion de la ressource, les usages de l'eau et les acteurs 5.2 La gestion des systèmes non irrigués 5.3 Outils et modèles de l'agronomie: exemple du système irrigué réalimenté par le canal de la Neste 5.4 Point de vue d’une collectivité territoriale 6- Conclusion (1h) Méthodes pédagogiques Cours, conférences, TD en salle, visites et travail personnel (10h) Contrôle des connaissances Travail personnel donnant lieu à une présentation orale (50%) plus examen écrit individuel de 1 heure (50%) Bibliographie Traité d’irrigation (2006). Tiercelin, Vidal Coord. Tec et Doc Lavoisier Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 35 4.7 – Agricultures Urbaines - innovations agricoles durables et transition écologique. 60h [email protected] Responsable : C. Dumat Objectifs Selon la FAO (Food and Agriculture Organization), 60 % de l’Humanité vit en zones urbaines en 2014 et les prévisions pour 2050 sont de 80 % (avec + 3 milliards d’habitants sur la terre). Cette organisation considère ainsi le développement de l’agriculture urbaine comme l’une des clés de la survie alimentaire de l’Humanité. Le terme d’agriculture urbaine recouvre différents aspects (Duchemin, 2013) notamment: le maraîchage traditionnel en zone périurbaine, la production hors-sol sur des surfaces non constructibles et non susceptibles de remédiation, les jardins collectifs (Chenot et al., 2013) à but productif ou thérapeutique (une priorité du Plan National Santé-Environnement, 2015), les cultures sur toits, et les fermes intensives (fermes verticales ou autres…). Développer des solutions d’agriculture urbaine écologiquement innovantes implique de maitriser en particulier les bases de la nutrition des plantes, de considérer de façon globale les facteurs influant la qualité des productions (transferts sol-plante-atmosphère des éléments nutritifs et polluants ; qualité des intrants et des supports de culture), (Dumat et al., 2013; Mombo et al., 2015 ; Pierart et al., 2015 ; Uzu et al., 2014 ; Xiong et al., 2014) de prendre en compte des aspects techniques tels que le poids pour les cultures sur les toits (Aubry, 2013) ou raisonner l’aménagement urbain (Borries, 2013 ; Blanc et Hamman, 2012). Dans ce contexte, l’objectif du projet pédagogique S8 « Agricultures Urbaines » est d’offrir aux étudiants des enseignements scientifiques relatifs aux multiples facettes des agricultures urbaines : agronomie, aménagements urbains, Environnement-Risques-Communication-Transition écologique, Biodiversité – Biologie. Programme Les bases des agricultures urbaines seront abordées : vocabulaire, grandes questions d’actualité, innovations technologiques. Des enseignements croisés en écologie, nutrition minérale des plantes, qualité des milieux et des intrants, urbanisme raisonné et réflexion sur la gestion des inégalités écologiques permettront aux étudiants d’appréhender à la pluridisciplinarité des projets d’agricultures urbaines. Ils pourront ensuite réaliser de petits projets en collaboration avec l’équipe pédagogique et les exposer sous la forme d’un film pédagogique lors de la dernière séance du module. Les intervenants et volumes horaires proposés pour ce module sont les suivants : Intervenant Dumat C. Thème Gestion durable des écosystèmes urbains. t (h) 10 Evaluation et gestion socio-scientifique des risques sanitaires. Bertoni G. BE, ingénieurs Toulouse Métropole, agence de l’eau… Borries O. Innovations culturales urbaines (de toit et verticales) : atouts et contraintes du hors sol. Quels projets (agriculture sur les toits) sont développés ? 6 6 Quels acteurs (élus, professionnels…) sont impliqués ? Aménagements urbains. 6 Outils d’aide au développement durable de l’agriculture urbaine Vialatte A., Sejalon N. Sorties terrains : Biodiversité et agriculture urbaine: une alliance efficace 8 Possibles sorties : La Ferme des 50, jardins collectifs, Borde Bio aux 8 Izards, Quint-Fonsegrives… Conférences : Possibles conférences (éventuellement en visio) avec des chercheurs du projet national ANR ville durable Jassur (http://www6.inra.fr/jassur) et du projet Potex (Mairie de Paris). Travail individuel Temps utilisé pour travailler aux projets, exposés, films 12 Evaluation Exposés, projets 4 Méthodes pédagogiques Cours, TD, sortie, mini projet, utilisation de la plateforme pédagogique « Agriville », réalisation de films pédagogiques. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 36 Contrôle des connaissances Examen écrit individuel sur chaque partie du cours et exposé-film présenté en groupe. Bibliographie Aubry C. 2013. Sur les toits d’AgroParisTech (http://www.agroparistech.fr/+Le-Monde-sur-les-toits-d+.html). -Blanc M. et Hamman P. (dir.) 2012. La Ville aux défis de l’environnement. Revue des sciences sociales, n° 47. -Bories O. 2013. « Les actions innovantes de pratiques agricoles en milieu urbain », Exposition internationale Carrot City, Muséum d’histoire naturelle de Toulouse. -Chenot E., Dumat C., Douay F. C. Schwartz. 2013. EDP Sciences. ISBN : 978-2-7598-0723-9. 176 pages. Jardins potagers : terres inconnues ? -Duchemin E. (Ed.) 2013. Agriculture urbaine : aménager et nourrir la ville. collectif, Vertigo. -Dumat C. et al. 2013. International Conf. Environmental Geochemistry and Health. Environmental and sanitary risk assessment and management in associative gardens: vegetable quality in relation with practices and context. -Mombo S., Foucault Y., Deola F., Gaillard I., Goix S. & Dumat C. 2015. Journal of Soils and Sediments in press. Management of human health risk in the context of kitchen gardens…near a lead recycling company. -Pierart A., Shahid M., Séjalon-Delmas N. & Dumat C. 2015. Hazardous Materials in press. Antimony bioavailability: knowledge and research perspectives for sustainable agricultures. -Sobocinski A. 2015. Le boom de l’agriculture urbaine. Le journal du CNRS. https://lejournal.cnrs.fr/articles/le-boom-de-lagriculture-urbaine. -Uzu G., Schreck E., Xiong T., Macouin M., Fayomi B., Dumat C. 2014. Water, Air, & Soil Pollution, 225:2185. Urban market gardening in Africa: metal(oid)s foliar uptake and their bioaccessibility in vegetables, implications in terms of health risks. -Xiong T., Leveque T., Shahid M., Foucault Y., Dumat C. 2014. J. Environmental Quality, 43, 1593-1600. Lead and cadmium phytoavailability and human bioaccessibility for vegetables exposed to soil or atmosphere pollution by process ultrafine particles. -http://www.voixdumidi.fr/notre-dossier-toulouse-veut-sauver-son-agriculture-urbaine-98028.html Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 37 UNITES DE PRE-SPECIALISATION SERIE 5 5.1 – Economie sociale et solidaire (ESS) et développement durable des territoires : concepts, outils et études de cas - Cours/TD/Conférences : 32h - Projet de terrain : 30h Responsable : Geneviève Nguyen [email protected] Autres intervenants : Professionnels, entreprises et associations de l’ESS et du développement territorial Objectifs Cette unité d’enseignement (UE) optionnelle approfondit les questions liées à la mise en œuvre du développement durable (UE Introduction au DD en S7) dans un contexte français et international. Elle s’intéresse plus précisément à mise en œuvre pratique du DD au niveau local en prenant comme exemples d’étude les expériences innovantes dans le domaine de l’économie sociale et solidaire. Plusieurs questions sont posées : comment caractériser ces expériences ? Peut-on les considérer comme des modèles économiques « alternatifs » ? Dans quelle mesure ces expériences peuvent-elles contribuer au développement durable des territoires ? Et réciproquement, comment les territoires peuvent-ils participer à l’émergence et à la structuration de telles initiatives d’économie sociale et solidaire ? A l’issue de cette UE, les étudiants doivent être capable de maîtriser un certain nombre de concepts et d’outils méthodologiques leur permettant d’analyser, d’un point de vue essentiellement socio-économique, les problèmes complexes de mise en œuvre d’une démarche de DD au niveau d’un territoire. Les exemples d’application et les études de cas sont pris dans les pays aussi bien du Nord que du Sud. Pour les étudiants qui souhaitent s’orienter vers les métiers du management d’entreprises, cette UE leur permet d’enrichir leur approche de l’entreprise en les confrontant à des logiques d’entrepreneuriat et des structures d’entreprise qui ont su innover dans une perspective de DD. Elle prépare aussi les étudiants qui souhaitent poursuivre leurs études dans le domaine du développement des pays du Sud ou du développement territorial en Europe. Programme Partie théorique I. L’économie sociale et solidaire dans les pays du Nord : fondamentaux, historique, acteurs, démarches et outils d’action II. Le mouvement de l’ESS dans les pays du Sud III. Zoom sur la finance solidaire dans les Nords et la microfinance dans les Suds IV. L’ESS et développement local a. Eléments introductifs du développement local (définitions, historique, exemples) b. Les entreprises de l’ESS et le développement des territoires Partie projet de terrain L’objectif est de caractériser et de comprendre les formes d’organisations de l’ESS, leurs logiques et modalités de fonctionnement, leur insertion dans le système économique actuel et les impacts sur le développement local. Ce travail de terrain consiste donc à étudier diverses expériences d’économie sociale et solidaire (ESS) sur un territoire donné. La question posée est celle de leur articulation au développement de ce territoire. Une liste d’expériences d’ESS sera proposée aux étudiants, qui organisés en sous-groupes, auront à étudier chacun une expérience selon une grille qui leur sera fournie. Pour chacune des études de cas, les étudiants sont incités à prendre contact avec des personnes ressources (acteurs institutionnels, porteurs de projets, etc.). Une mise en commun des études de cas sera faite collectivement, pour essayer de répondre à la question posée. Evaluation L’évaluation combine une note santionnant un travail de groupe (travail demandé en lien avec le projet de terrain - 50%) et une note pour un travail personnel (réflexion inviduelle sur une question de synthèse en lien avec le projet de terrain et la partie théorique – 50%). L’équipe se réserve de pondérer la note finale en fonction de la présence et de la participation de l’étudiant aux séances en présentiel. Bibliographie : Boutiller S. et Allemand S. (2010) Economie sociale et solidaire. Nouvelles trajectoires d’innovations. L’Harmattan Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 38 Chopart J.N., Neyret G., Rault D. (2006) Les dynamiques de l’économie sociale et solidaire., Coll. Recherche, Ed. La Découverte. Granovetter M. (2000) Le marché autrement. Desclée de Brouwer. Laville E. (2009) L’entreprise verte. 3ème éd., Pearson Education. Lévesque B., Bourque G.L., Forgues E. (2001) La nouvelle sociologie économique. Desclée de Brouwer. North D. (2005) Le processus de développement économique. Editions d’Organisation. Pecqueur B. (2000) Le développement local. Pour une économie des territoires. 2ème éd., Syros. Smouts M.C. (2005) Le développement durable. Les termes du débat. Armand Colin. Treillet S. (2005) L’économie du développement. De Bandoeng à la mondialisation. 2ème éd., Armand Colin. 5.2 Processing of animal products-( 60h in English). Lectures (30h) - Practical and tutorial classes (8h) Faculty in charge : C. Bayourthe [email protected] Other Faculty. : C. Molette: [email protected] H. Remignon: [email protected] Objectives To know the physico-chemical and biochemical determinants of the transformation processes of animal products (milk and meat-based products). To optimize the choice of a given technology process, according to the quality of the raw material and the type of desired product. Program A - Milk and milk-based products technology (30h) Milk industry. Milk physico-chemical properties. Milk, butter and cream technology. Cold storage, heat treatments, dehydration and acidification. Technology cheese maker and main cheeses families. Specific microbiology. B - Meat-based products technology (30h) Physico-chemical characteristics of the meat processing and/or its preservation in meat-based product. Raw materials, refrigeration and freezing, dehydration, mincing and restructuring, curing, fermentation, elaboration of meat sausages, industial use of animal-derived proteins. Educational methods Courses, Practical classes on the processing of meat-based products and on cheeses sensory analysis, Bibliographical analysis. Assessment (Students can choose the language of assessment, French or English) Oral presentation (coeff. 1) and written examination (coeff. 2) Literature - « Milk and Dairy Product Technology » E. SPREER and A. MIXA, 1995, 483 p., Marcel Dekker Pub.. - « Lawrie’s Meat Science », R. A. LAWRIE, 1998, 336 p., Woodhead Pub.. - « Meat Science », P. D. WARRISS, 2000, Cabi Pub.. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 39 5.3 – Biodiversité et gestion de l’espace rural - 60h Responsables : A. Ouin [email protected] Programme 1- La biodiversité dans l’espace rural (30h) « L’Ennui naquit un jour de l’Uniformité ». Ce célèbre alexandrin dit vrai pour les salons, les salles de cours et la biodiversité. La biodiversité est l’un des garants de la durabilité des systèmes écologiques dont l’agrosystème. Les espaces ruraux européens sont le support d’une biodiversité remarquable et menacée. Apres une introduction sur la biodiversité et les différents enjeux qu’elle recouvre, des exemples de gestion conservatoire dans l’espace rural seront apportés par des professionnels. 1/ Biodiversité : définition, origine, concepts associés (habitats…) (A. Ouin, 3h) 2/ Les enjeux du maintien de la biodiversité et les outils législatifs, incitatifs associés (A. Ouin, 3h) 3/ Les causes de l’érosion de la biodiversité et l’action des activités humaines (A. Ouin, 3h) 4/ Un service écologique majeur : la biodiversité utile a l’agriculture (J. P. Sarthou, 4h ) 5/ Exemples de programmes de conservation d’espèces et de milieux d’intérêt patrimonial dans l’espace rural (C. Lemouzy, ADASEA 32 ; M. Tessier, ANA, autres 9h) Une sortie sur le terrain d’une journée sera programmée pour rencontrer des acteurs de l’espace rural mettant en œuvre des programmes de maintien ou de renouveau de la biodiversité (8h). 2- Méthode d’étude de la biodiversité (20h) Apporter les méthodes et les techniques essentielles pour l’étude, l’analyse et la description des biocénoses des agroécosystèmes. 1/ Etude de la végétation en milieu prairial et cultivé (A. Ouin, 6h ) - techniques de relevés de végétation et détermination des espèces dominantes - méthodes d’analyse et de description de la flore 2/ Etude des communautés animales (J.P. Sarthou, 2h) Etude des zoocénoses : entomofaune (utilisation de morpho-espèces), en milieu naturel ou semi naturel et en milieu cultivé. Un TP a la ferme des cinquante permettra la mise en œuvre de différentes techniques, les identifications se feront au laboratoire, puis l’analyse des données se fera en salle info (3*4h=12h). 3- Biodiversité et paysages boisés (10h) Présenter les principaux éléments de la biodiversité dans les paysages boisés (du bocage à la forêt). Décrire les principaux fonctionnements écologiques de ces paysages et l’importance des modes gestion par l’Homme dans la préservation des espèces et des processus écologiques. 1/ Paysages boisés : définition, typologie et biodiversité patrimoniale dans les bocages (A. Ouin, 2h) 2/ Agroforesterie (A . Gavaland, INRA, 2h) 3/ Gestion forestière, habitats, microhabitats (L. Larrieu, CRPF, 2h) 4/ Des indicateurs de biodiversité en forêt (J. P. Sarthou, 2h) 5/ Gestion forestière et biodiversité des plantes, oiseaux et carabes - Ecocertification (G. du Bus, 2h) Méthodes pédagogiques Cours en salle, et travail de groupe en TP. Contrôle des connaissances Rapport bibliographique et présentation orale (0.5), compte rendu du TP sur les méthodes d’étude de la biodiversité (0.5). Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 40 5.5 – Protection des cultures - 60h Responsable : F. VAILLEAU [email protected] Objectifs Cet enseignement de protection des cultures a pour but de donner un aperçu de la diversité des ennemis des cultures : parasites, ravageurs et mauvaises herbes. Les concepts de lutte raisonnée, protection intégrée et lutte biologique seront introduits. Programme ENTOMOLOGIE APPLIQUEE : (7 séances de 2 heures) Au cours de ces séances, des identifications d’insectes seront réalisées, à l’aide de clés de détermination adaptées, au niveau des ordres et des principales familles d’intérêt agronomique : reconnaissance des principaux ravageurs des cultures ainsi que de quelques insectes auxiliaires. En début de séance, des notions importantes d’entomologie fondamentale ou appliquée sont développées. PHYTOPATHOLOGIE : (7 séances de 2 heures) Au cours de ces séances, les thèmes suivants seront abordés : - Diagnostic : détection et identification des agents pathogènes (champignons, bactéries, virus, …), techniques de diagnostic de laboratoire (méthodes biologiques, sérologiques et moléculaires). - Parasitisme du système racinaire ; parasitisme du système aérien. - Des exemples de maladies d’intérêt agronomique seront étudiés : symptômes de maladie, biologie de l’agent pathogène, épidémiologie et méthodes de lutte. MALHERBOLOGIE : (3 séances de 2 heures) Identification des principales mauvaises herbes des cultures, du stade plantule au stade adulte : - Séance dicotylédones ; Séance graminées ; Sortie terrain. Utilisation de la clé de détermination. Méthodes pédagogiques Travaux dirigés (observation, identification). Contrôle des connaissances Evaluation par examen écrit individuel : Identification d’insectes, d’agents pathogènes fongiques, et de mauvaises herbes. Questions de synthèse. Examen oral par groupes : exposés. Bibliographie Guide pratique de défense des cultures (ACTA) Mauvaises herbes des cultures (J. Mamarot, ACTA) Phytoma, La défense des végétaux (Revue mensuelle) Les auxiliaires entomophages (J.-N. Reboulet, ACTA) Plant Pathology (G. Agrios, Academic Press) Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 41 5.6 - Agriculture de Conservation et agro-écologie ou comment l'agroécologie vient élargir les champs de l'agronomie. Durée totale (dont examen) : 60h dont cours/conférences : 26h dont TP/TD/visites : 31h Responsable : Jean-Pierre Sarthou [email protected] Intervenants : Pierre Maury, Valérie Olivier, Jean-Pierre Sarthou. Objectifs Une des réponses techniques apportées à la recherche d'une réduction des coûts de production en grandes cultures, est la simplification du travail du sol, allant jusqu'à la suppression du labour et au semis direct. En France comme ailleurs dans le monde, cette innovation se développe parfois sans autres considérations agronomiques et mène à des impasses. L’agriculture de conservation vise au contraire à l’accompagner de ses deux autres piliers : l’allongement des rotations et la couverture permanente des sols. Ces trois principes agronomiques ensemble aboutissent à des processus à l’origine desquels se trouvent des espèces d’intérêt fonctionnel pour la production agricole. Tout l’enjeu réside alors dans leur pilotage, y compris de ceux dépendants d’autres compartiments et niveaux d’organisation des agroécosystèmes, afin qu’ils débouchent sur des services écosystémiques permettant à l’agriculteur d’engager son système vers la transition agroécologique, caractérisée par la « double performance » économique et écologique. Ainsi, de nouvelles façons de produire, de nouveaux agroécosystèmes, se mettent progressivement en place. Leur analyse comme leur accompagnement ne peuvent évidemment se faire sans la connaissance des processus agroécologiques mais également sans une bonne connaissance des acteurs et donc des leviers et verrous socio-économiques qui accompagnent les agriculteurs. Finalités Elles sont d’une part d'approcher ces techniques et processus agroécologiques mais aussi de mesurer les implications en matière de gestion des itinéraires techniques et systèmes de production, de la parcelle au territoire. Elles sont d’autre part de prendre en considération le rôle des acteurs économiques individuels ou organisés en réseaux (agriculteurs, organismes professionnels, conseillers, etc.) dans le développement de ces nouvelles pratiques. Une étude de terrain permettra d’aborder les questions opérationnelles, relevant des champs de recherche en agroécologie, en économie et en sociologie. Mots clés: semis direct, itinéraire technique, système de production, processus agro-écologiques, externalités, acceptabilité socio-économique, adhésion/apprentissage (individuel/collectif), gouvernance. Programme Présentation du module et du projet – Enseignements agronomiques (+ visite) (20 h : Agriculture de Conservation : définitions et contexte ; Enjeux agroécologiques mondiaux ; Analyse historique et systémique de l'agriculture ; Les services écologiques en agriculture ; Importance des rotations avec couverts végétaux ; Introduction à la qualité biologique et structurale des sols ; Liens entre pratiques culturales-vie du sol-qualité du sol ; Non labour et semis direct dans le Sud-Ouest, l'expérience et le conseil ; Visite chez un agriculteur) – Enseignements socio-économiques (+ visite) (8 h : Nouvelles techniques agronomiques et mouvement social ; Changement social et innovation technique ; Les organisations de vulgarisation agricoles et l'agriculture de conservation ; AOC Sols) – Projet : nombreuses séances de TD et de travail en autonomie (36 h : bibliographie, entretiens, analyses, en intra- et en inter-groupes). Méthodes pédagogiques Cours, TD, conférences, un TD-conférence de 4h en anglais, visite, enquêtes, travail de groupe. Contrôle des connaissances Examen écrit sur parties théoriques – Restitution du projet en groupes. Bibliographie Crovetto Lamarca C., 1999. Les fondements d'une agriculture durable. PANAM Ed. /// Gliessman S.R., 2000. Agroecology, ecological processes in sustainable agriculture. Lewis Pub. Ed. /// JP Darré et al. Coord, (2004) Le sens des pratiques, conceptions d’agriculteurs et modèles d’agronomes, INRA Editions, 323 p. (version électronique imprimée, disponible en SHS) /// Revue TCS (Centre de Documentation ENSAT) /// Site internet : http://www.agriculture-de-conservation.com/. Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 42 5.7 – Analyse et cartographie des controverses sociotechniques Durée totale (dont examen) : 60h dont cours/conférences : 24h dont TP/ : 40h Responsable : F. Purseigle [email protected] Intervenants : Antoine Doré (CR INRA UMR AGIR), Geneviève Nguyen, François Purseigle, Julien Weisbein (MCF Sciences-Po Toulouse, Directeur du LaSSP) Objectifs L’objectif pédagogique général est de fournir aux étudiants les bases théoriques, méthodologiques et techniques nécessaires à l’analyse de questions sociales et politiques qui sont l’objet d’une expertise technique et scientifique forte et qui traversent l’espace public sous la forme d’affaires complexes où se croisent des questions juridiques, économiques, morales, symboliques et sociales. Il s’agit d’un cours orienté essentiellement vers l’étude sociale des sciences et des techniques et qui vise à initier les étudiants à un panel d’approches (sociologiques, anthropologiques, historiques et politiques) et d’outils (notamment d’analyse de réseaux sociaux, de scientométrie et de lexicométrie) permettant de décrire et d’analyser la dynamique des technosciences et des projets d’aménagement, des laboratoires jusqu’à l’espace public en passant par les bureaux d’études, les organisations non gouvernementales, etc. Un tel cours permet de familiariser les étudiants à des approches aussi variées que la sociologie des connaissances, des professions, des organisations, de l’environnement, des questions sanitaires ou encore des institutions scientifiques et techniques. L’enjeu pédagogique principal de ce cours est d’apprendre aux étudiants à réagir dans les situations d’incertitude et de controverses qu’ils seront amenés à rencontrer dans la vie professionnelle. L’un des principaux défis consiste à établir des ponts entre les sciences sociales et sciences exactes. En focalisant sur les controverses, ce cours se présente comme une initiation à l’histoire des sciences modernes, à la sociologie, à l’anthropologie et à la science politique. Le but est d’apprendre aux étudiants à s’orienter et à naviguer dans des situations complexes et troubles face auxquelles l’état des connaissances scientifiques et techniques ne fournit pas toujours les appuis suffisants pour la décision et l’action en situation professionnelle. Ainsi, ce cours développe des aptitudes à l'enquête qualitative et apporte aux étudiants ingénieurs ou en IEP un complément indispensable à leurs capacités d’expertise technique ou à leur formation de cadre de l’action publique. Mots clés: Programme Cet enseignement comprend trois types de séances : Des séances consacrées à un enseignement magistral sur les thèmes suivants (24h) : 1) Les fondamentaux de l’analyse des controverses (A. Doré, J. Weisbein, V. Simoulin) – 10h 2) Controverses, mondes agricoles et environnement (F. Purseigle, G. Nguyen) – 7h 3) Controverses sanitaires (F. Sicot) – 7h Des séances consacrées aux ateliers techniques (soient 20h au total) : 1) Atelier Lexicométrie (Pascal Marchand) – 4h 2) Atelier Analyse de réseaux (Béatrice Millard) – 4h 3) Atelier Enquête (Thomas Debril) – 4h 4) Atelier Web Design (YohannChaulet) – 4h 5) Atelier Écriture (intervenant du parcours Journalisme de l’IEP) – 4h Des séances consacrées au suivi des travaux des étudiants à travers 20h de TD, animées par un enseignant. Le cours sera organisé en trois temps : • Semaine 1, acquisition des fondamentaux de l’analyse de controverses et choix de la controverse : Enseignements des fondamentaux de l’analyse des controverses + Une séance d’introduction aux modules « agriculture/environnement » et « santé » + Choix des controverses (tout au long de la semaine, les étudiants travaillent sur le choix d’une controverse et justifier de ce choix dans un court rapport rendu en fin de semaine). • Semaine 2, acquisition des compétences thématiques et techniques, et travail d’enquête : Ateliers techniques (lexicométrie, réseaux, enquête) + Enseignement magistral Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 43 • « agriculture/environnement » et « santé » + TD de suivi des projets collectifs d’analyse des controverses. Semaine 3, analyse et restitution : Ateliers techniques (Web Design, Ecriture) + TD de suivi des projets collectifs d’analyse des controverse Méthodes pédagogiques Cours, TD, ateliers méthodologiques. Contrôle des connaissances L’évaluation de la première partie du cours se fait en deux temps : • un dossier dans lequel les étudiant exposent et justifient le choix de la controverse qu’ils envisagent d’analyser au second semestre ; • l’exposé et la discussion des textes de l’anthologie du cours ; L’évaluation de la deuxièmepartie du cours se fait également en deux temps : • exercice d’atelier ; • présentation de l’avancement intermédiaire du projet cartographique par l’esquisse du site (partie projet) ; L’évaluation de la troisième partie du cours se fait en deux temps : • une présentation finale du site de controverse ; • l’examen écrit sur les notions apprises dans le cours magistral. Bibliographie Document édité par la direction des études le 21/01/2016 2ème année / Semestre 8 44