Plateforme Plateforme de Biostatistique - Sys2Diag

IBiSA LABEL
Plateforme de Biostatistique
& Bioinformatique
Making
E.DUPAS-MATHIEU, K.KAMINSKI, F.MOLINA, V.MOREAU, N.SALVETAT
data
more meaningful
BIOSTATISTIQUES et mathématiques appliquées
Missions
Support & Expertise
aux équipes R&D
Protocole d’étude
Design expérimental – Nombre de sujets nécessaires – Puissance statistique
Statistiques descriptives & inférentielles
Description graphique – Tests d’hypothèse – Détection de données anormales
Aide à la décision
Data Mining
Corrélations - Analyse en composantes principales et factorielles - Analyse discriminante linéaire
Pathologycal
Développement
d’outils clé en main
Analyses statistiques multivariées
Analyses de variance – Modèles de régression – Méthodologie ROC
Healthy
Apprentissage statistique & classification
Arbres de décision – KNN – Support vector machine - Random Forest – Réseaux de neurones
Equipements
Logiciels spécialisés
Services consolidés
Modélisation mathématique
Processus déterministes et stochastiques
Data Management
Formations
Création de bases de données interfacées et sécurisées
Contrôle qualité des données
Identification de biais
Statistiques descriptives
Tests d’hypothèse et puissance statistique
Linéarité & Reproductibilité
Régression & facteurs de risque
Evaluation diagnostique
Standardisation
Contacts
Very noisy
Un programme
adapté aux besoins
Denoised
DUP Web Site:
www.sysdiag.cnrs.fr/DUP/
BIOINFORMATIQUES Analyses structurales & épitopiques
Prédiction de structure 3D par homologie
Recherche de motifs séquentiels ou structuraux
Alignements de séquences et de structures
Site Web
anticorps
http://sysdiag.cnrs.fr
Prédiction de peptides
antigéniques ou immunogéniques
Prédiction et localisation d'épitopes
Responsable
Eve DUPAS-MATHIEU
interaction
epitope
[email protected]
mimotope
peptides
input
MIMOP
Tool
Tel: +33(4) 67 16 66 23
Fax: +33(4) 67 16 66 01
Région
épitopique
potentielle
(PER)
GAD, DNF, Amm8
Peptides
antigéniques
Coordinateur
input
Nicolas SALVETAT
PEPOP
Tool
[email protected]
Tel: +33(4) 67 16 66 24
Fax: +33(4) 67 16 66 01
GAD, IA2, scorpion α-toxins
Prédiction
Design
structure 3D des protéines de peptides
SysDiag UMR3145 - CNRS / Bio-Rad CAP DELTA, 1682 rue de la Valsière, CS 61003 ● 34184 Montpellier Cedex 4 ● France
Tel : +33 (0)467 166 600 ● Fax : +33 (0)467 166 601 ● http://www.sysdiag.cnrs.fr ● mel : [email protected]
Peptides
immunogéniques
cytokines, IA2
IBiSA LABEL
Bioinformatics & Biostatistics
Platform
Making
E.DUPAS-MATHIEU, K.KAMINSKI, F.MOLINA, V.MOREAU, N.SALVETAT
data
more meaningful
BIOSTATISTICS and applied mathematics
Goals
Support & Expertise
to R&D teams
Decision-making
help
Clinical study protocol
Experimental design - Necessary number of subjects – Study power
Descriptive & inferential statistics
Graphical data description - Hypothesis testing - Abnormal data detection
Data Mining
Correlations - Principal or Factorial Component Analysis - Linear Discriminant Analysis
Pathologycal
Home-made
Dedicated tools
Healthy
Statitistical Multivariate analyses
Analyses of variance - Multiple regression – ROC methodology
Statistical Learning
Decision Trees – K-nearest-neighbors - Neural Network-Machine Vector Support. Random Forest
Equipment
Specialized software
Consolidated services
Mathematical Modeling
Deterministic and stochastic processes
Data Management
Biostat Training
Secure, easy-to-use & evolutive DATABASES development
Data quality control
Bias identification
Descriptive statistics
Hypothesis tests & Statistical power
Linearity & Reproducibility
Regression & risk factors
Diagnostic evaluation
Standardisation
Contacts
Very noisy
Program appropriate to needs
Denoised
DUP Web Site:
www.sysdiag.cnrs.fr/DUP/
BIOINFORMATICS Structural and Epitopic Analyses
Structure 3D prediction by homology
Sequential or structural pattern research
Sequence or structure alignments
Website
anticorps
http://sysdiag.cnrs.fr
Antigenic or immunogenic peptides
prediction
Epitope prediction & localisation
Platform Leader
Eve DUPAS-MATHIEU
interaction
epitope
[email protected]
mimotope
peptides
input
MIMOP
Tool
Tel: +33(4) 67 16 66 23
Fax: +33(4) 67 16 66 01
Coordinator
input
Nicolas SALVETAT
Potential
Epitopic
Region
(PER)
GAD, DNF, Amm8
antigenic
peptides
PEPOP
Tool
[email protected]
Tel: +33(4) 67 16 66 24
Fax: +33(4) 67 16 66 01
GAD, IA2, scorpion α-toxins
Protein 3D structure
prediction
Design
of peptides
SysDiag UMR3145 - CNRS / Bio-Rad CAP DELTA, 1682 rue de la Valsière, CS 61003 ● 34184 Montpellier Cedex 4 ● France
Tel : +33 (0)467 166 600 ● Fax : +33 (0)467 166 601 ● http://www.sysdiag.cnrs.fr ● mel : [email protected]
immunogenic
peptides
cytokines, IA2