Etude de caractéristiques physiques de jeunes fruits en lien avec

PROPOSITION DE STAGE DE MASTER 2
Etude de caractéristiques physiques de jeunes fruits en lien avec leur susceptibilité à
Monilinia laxa, au sein d’une population inter-spécifique de pêcher
Laboratoires d’accueil:
INRA, Unité de Génétique et d’Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Domaine St Maurice, BP
94, 84143 Montfavet Cedex
Directrice : Véronique Lefèbvre _ Site web: http://w3.avignon.inra.fr/gafl/
Responsable de stage:
Bénédicte QUILOT-TURION ([email protected]), Chargée de recherches, Tel : 04 32 72 27 63
Période : 6-8 mois _ début entre Janvier et début mars
Mots clés : pêche ; Monilinia ; conductance cuticulaire ; nombre de stomates ; cartographie QTLs
Contexte
L’avenir de la production fruitière réside dans la production de fruits de qualité dans des systèmes bas
intrants. Le pêcher est sensible à de nombreuses maladies et notamment aux monilioses pouvant
engendrer des pertes directes jusqu’à 30 à 40% de la récolte. Les mesures prophylactiques habituelles
(élimination des foyers infectieux, ainsi que des fruits pourris…) sont insuffisantes. Aussi, la lutte
chimique est généralisée. Ces pratiques courantes sont problématiques d’un point de vue environnemental
et sanitaire. Actuellement, les fruits des variétés cultivées de pêchers sont tous plus ou moins sensibles
aux monilioses. Le seul génotype mentionné dans la littérature ayant un niveau de résistance élevé est le
cultivar ‘Bolinha’. La résistance pourrait être liée à l’existence d’une barrière physique à la pénétration du
champignon (cuticule). Les stomates, les micro-fissures, l’épaisseur de la cuticule pourraient être autant
de facteurs modulant la susceptibilité des fruits. La sensibilité des fruits aux monilioses varie au cours de
leur développement : les jeunes fruits verts (stade I) sont susceptibles ainsi que les fruits approchant de la
maturité (stade III). Par contre au stade intermédiaire correspondant au durcissement du noyau (stade II),
les fruits sont généralement résistants.
Objectifs du stage
Dans ce contexte, le stage sera focalisé sur les phases précoces de croissance des fruits. L’objectif est
d’étudier les relations entre la susceptibilité des fruits et certaines caractéristiques de l’épiderme, ceci au
sein d’une population de cartographie, afin d’examiner leur variabilité génétique et de rechercher des loci
associés. Il s’agira de caractériser les jeunes fruits d’une centaine d’individus de la population pour i) le
nombre de stomates ii) leur conductance cuticulaire iii) leur sensibilité à Monilinia laxa. Le stage
débutera par une période d’analyse des données recueillies en 2014 pour adapter les protocoles
expérimentaux à l’étude d’une population entière.
Matériel végétal disponible
On dispose à l’INRA de vergers expérimentaux comprenant différentes variétés dont le cultivar résistant
‘Bolinha’ et d’autres sources de résistance potentielles. On dispose également d’une population interspécifique de pêcher et une population d’autofécondation issue de Bolinha, génotypées avec une puce 9k
SNP.
Activités dominantes
Expérimentations sur des cultivars et les individus des populations
• élaboration du protocole de comptage de stomates sur la base de données préliminaires : analyse des
données, choix des zones du fruit à échantillonner, nombre de fruits, de photographies…
• estimation de la conductance cuticulaire : suivi de transpiration des fruits en enceinte ventilée
• comptage de stomates : récoltes et préparation des échantillons ; observations au microscope et prises
de photographies ; analyse des photos
• culture du champignon et production des spores ; préparation de suspensions pour infection
• tests d’infection : récoltes, infection des fruits en laboratoire, suivi et notation des symptômes
• saisie des données sur ordinateur
• analyses statistiques des résultats
• analyses QTLs