LIGHT CYCLER PROBE DESIGN SOFTWARE 2.0
Transcription
LIGHT CYCLER PROBE DESIGN SOFTWARE 2.0
LIGHT CYCLER PROBE DESIGN SOFTWARE 2.0 - - rentrer la séquence dans Experiment Type : choisir primers only dans Experiment Settings : sélectionner une taille d’amplicon souhaitée travailler avec un Tm = 60°C cliquer sur Analyse l’onglet Analysis s’ouvre : possibilité de bouger la fenêtre dans laquelle on veut dessiner des amorces cliquer sur Single Set Search l’onglet Primer Probe Sets s’ouvre : les couples proposés vont du meilleur au moins bon (sachant que plus on est proche de 0, meilleur est le couple) dans Tools : show alignment of current sélection : permet de voir la position des amorces sur la séquence cible (cliquer sur la flèche pour faire défiler tous les couples) BLAST : possibilité de blaster les séquences Remarque : il est également possible d’importer des séquences d’amorces connues pour les tester dans le logiciel