DU Séquençage haut débit et maladies génétiques

DU Séquençage haut débit et maladies génétiques
RESPONSABLES
Pr. F. HUET
Dr. J.-B. RIVIERE
COÛT
Droits administratifs*
Droits pédagogiques : 1050 €
CALENDRIER
http://fcpharma.u-bourgogne.fr
INSCRIPTION
Dossier d’inscription : sur le site
http://fcpharma.u-bourgogne.fr
Onglet : « Pour vous préinscrire »
CONTACT
UMDPC Santé
Perrine DIDI
[email protected]
Tél : 03 80 39 34 96
Objectifs
Contenus
Acquérir une formation en séquençage haut débit
appliqué aux maladies génétiques mendéliennes, des
technologies
de
séquençage
et
approches
expérimentales possibles aux outils bioinformatiques
utilisés pour le traitement des données brutes,
l'identification
de
variations
génétiques
et
l'interprétation des résultats.
Se familiariser avec le système Unix/Linux, la ligne de
commande et la gestion et l'analyse de données sur un
serveur à distance.
Connaitre et savoir utiliser les principaux logiciels dédiés
à l'analyse de données de séquençage haut débit, de
l'alignement des séquences brutes à l'annotation de
variations génétiques.
Maîtriser les principaux navigateurs, bases de données et
outils de prédiction couramment utilisés en génétique
humaine et médicale.
Connaître les différentes applications possibles du
séquençage haut débit pour le diagnostic de maladies
génétiques, les principales règles à suivre et paramètres
à considérer pour assurer la qualité des données
produites dans un contexte de laboratoire médical, et les
considérations éthiques que soulève le séquençage haut
débit pour l'interprétation et le rendu des résultats.
Module 1 : Séquençage nouvelle génération –
Technologies & applications (théorique)
Module 2 : Introduction à Linux et à la programmation
(pratique)
Module 3 : Analyse de données de séquençage haut débit
(pratique)
Module 4 : Bases de données, outils de prédiction in silico
et analyses approfondies (pratique & théorique)
Module 5 : Séquençage haut débit et diagnostic –
Exemples d'applications, Qualité, rendu des résultats et
considérations éthiques (théorique)
Organisation pédagogique
Généticiens, médecins biologistes en génétique
moléculaire, ingénieurs en génétique humaine/médicale,
étudiants et stagiaires post-doctoraux de ces disciplines.
Ce diplôme est ouvert à la formation initiale et à la
formation continue.
Lieu : Université de Bourgogne, Dijon
Durée : 105 heures réparties sur 5 modules de 21 heures
réparties sur 3 jours
Les inscriptions sont limitées à 24 candidats.
Programme détaillé : http://fcpharma.u-bourgogne.fr
Contrôle de connaissances
La formation est sanctionnée par un Diplôme d'Université
habilité par l'Université de Bourgogne.
Le contrôle des connaissances est sanctionné à la fin de la
formation par une épreuve écrite (QCM, épreuve de 2
heures).
Publics et pré-requis
* selon tarif voté par l’Université de Bourgogne, sera transmis avec le
dossier d’inscription