CRB E Seillès2010

Les Centres de Ressources
Biologiques
Estelle SEILLES, DIU Immunologie et Biothérapies
19 novembre 2010, Paris
Gilbert Montgaillard (EFS, Dijon) CRB Ferdinand Cabanne de Dijon
Isabelle Desbois (EFS, Tours) CRB de Touraine
HISTORIQUE des CRB
Détenir des ressources biologiques validées, avec des
garanties d’assurance qualité et de traçabilité est
INDISPENSABLE pour la recherche scientifique et le
développement des biotechnologies.
Les Centres de Ressources Biologiques sont un des
éléments essentiels de l’infrastructure sur laquelle
s’appuient les sciences de la vie
La France a été mandatée par l’OCDE pour la mise en
place du réseau international des CRB (Tokyo 1999) .
Définition des critères de constitution de telles entités
(humain, animal, végétal, microorganismes) = CADRE
TECHNIQUE
HISTORIQUE des CRB
Mise en place février 2001 du Comité Consultatif, par
le Ministère de la Recherche : reconnaissance par la
France de l’importance stratégique des CRB.
Démarche d ’accréditation et de référentiel qualité des
CRB en cours (AFNOR)
Objectifs : structurer un réseau national
Appels d’offre Inserm
Excellence scientifique
Qualité de la cryoconservation
Qualité du système d’information
Déclaration de l’UNESCO du 8 Octobre 2003 sur les
données génétiques humaine :
Définition de collections, confidentialité, finalités,
consentement, partage des bienfaits ….
Définition - CRB
Regroupement de collections biologiques,
notamment d ’origine humaine (mais concerne
également l ’animal et le végétal)
collections :
diversité des populations étudiées
diversité des pathologies
diversité des finalités (recherche, diagnostic,
patrimonial, ..)
encadrement réglementaire limité
Définition – Collection d’échantillons biologiques
« Désigne au sens du code SP la réunion, à des
fins scientifiques, de prélèvements biologiques
effectués sur un groupe de personnes,
sélectionnées en fonction des caractéristiques
cliniques ou biologiques d’un ou plusieurs
membres du groupe, ainsi que des dérivés de ces
prélèvements ».
Une autorisation doit être délivrée par le
Ministre de la Recherche après avis du Comité
Consultatif sur le Traitement de l’Information
en matière de recherche dans le domaine de la
santé.
Missions :
Collecte, conserve, stocke et gère
Expertise et évalue les échantillons, assure
la préservation info clinique et bio
Cède à titre gracieux ou onéreux
Constitution et sauvegarde des collections d’échantillons
(patrimoine)
assurer la qualité, traçabilité et la sécurité des collections
et des données biomédicales associées
garantir la transparence et l’accès aux collections
encourager les collaborations scientifiques
promotion de la recherche.
Réseaux et échanges de produits biologiques
démarche assurance qualité
outils incontournables en recherche biomédicale
Certification et référentiel
INSERM / ANR
Appel à projet « Collections d’échantillons
biologiques pour la santé » en 2006
29 centres retenus
Référentiel dérivé de l’ISO 9001 construit en
partenariat avec AFAQ / AFNOR
Financement 2007 / 2008
Audits fin 2008 / 2009
Objectifs de la Certification
Améliorer le niveau de qualité
Homogénéiser les pratiques
Permettre des études à l’échelle européenne
La valorisation industrielle des échantillons
Certification 3 niveaux d’audit
Le Référentiel NF S 96-900 procédures
organisationnelles
Audit de qualité des échantillons
Experts mandatés par l’INSERM
IBISA (Infrastructure en Biologie, Santé,
Agronomie)
Plateformes technologiques
Audits possibles à tout moment
Harmonisation Européenne
Harmoniser à l’échelle européenne le
fonctionnement des CRB
Assurance qualité (promouvoir la norme
Française)
Aspects réglementaires et éthiques
Modèles de financement
Interopérabilité des bases de données
Harmonisation Européenne
Objectifs
Le soutien de la recherche académique et
industrielle
Études biomédicales groupant des cohortes
de patients importantes
Assurer la compétitivité de la recherche et
de l’industrie pharmaceutique et
biotechnologique européenne
Améliorer le niveau global de santé en Europe
BBMRI
Biobanking and Biomolecular
Resources Research Infrastructure
L’objectif de BBMRI
Structurer le réseau européen des CRB
Apporter la preuve de la faisabilité du concept
Des groupes de travail sont en cours
Création d’un réseau européen des bio banques
Mission du comité de pilotage du CCRB
Coordination de la politique nationale d’accréditation
Réflexion prospective sur les objectifs (besoins à
2020)
Évaluation des besoins et coûts liés au fonctionnement
des CRB
Mise en œuvre de la politique de soutien aux CRB en
lien avec le GIS IBiSA
Coordination des actions visant à augmenter la visibilité
du dispositif national - participation de la France dans
les réseaux internationaux
Coordination des comités sectoriels
Pilotage national
du dispositif
Comité de Pilotage
du CCRB
Comité
Santé
Comité
agronomie
Ens. sup. recherche (DGRI)
Santé (DGS, DHOS)
Écologie, développement
Affaires Étrangères/Europe
Économie Finances Emploi
Défense
Agriculture pêche
Bureau res. génétiques
Inst. français biodiversité
FHF
GIS IBiSA (directeur)
Comité
Microbiologie
Pilotage opérationnel
Réseau des CRB français dans
le domaine de la santé
Réseau Français au 10 mars 2009
(J. H. Di Donato)
Reconnaissance pour 4 ans
2
Permettra la participation à
BBMRI
1
1
3
29
2
1
2
Permet d’accéder au soutien :
D’organismes de recherche
GIS IBiSA (gère
financements des
plateformes
Pôles de compétitivité
Projet de société savante
1
1
1
1
1
3
2
11
4
2
Règles de constitution de collections
Le processus : de la collecte à l’exploitation
Evaluation
Evaluation
collecte
conservation
utilisation
Règles de constitution de collections
= le processus : de la collecte à l’exploitation
1 – ÉVALUATION : définir le projet et le protocole
pour les collections à visée de recherche :
évaluer la pertinence scientifique d ’actes
invasifs
définir la population concernée
type, quantité et qualité des échantillons
biologiques et leurs transformations éventuelles
les données cliniques associées
2 – COLLECTE
Acte de prélèvement :
type d ’échantillons et obligations réglementaires :
– résidu opératoire ou de soins = INFORMATION et NON
OPPOSITION de la personne prélevée
– prélèvement dans le cadre d ’un protocole de recherche =
CPP et consentement écrit de la personne
– prélèvement à visée de recherche seule : INFORMATION
(quid si changement de recherche?)
qualité du recueil : pour permettre toute étude ultérieure
Consentement doit être obtenu en cas de changement
de finalité de la recherche (loi bioéthique août 2004)
Recueil des données patient:
données médicales, biologiques, personnelles
confidentialité (loi 1978 : CNIL)
Les différentes ressources biologiques
humaines / utilisation dans la recherche
Nature des échantillons
Types de collections
Techniques utilisées
Thématiques en recherche
Collection Repères de l’Inserm
« Les collections des ressources biologiques humaines »
février 2005
Nature des échantillons et types de
collections
Banque ADN : ADN extrait de cellules, sang
séché, lignées …
Liquides biologiques : plasma, sérums, LCR,
urine …
Lignées cellulaires établies : cellules
cancéreuses, cultures primaires
Organes : foie, poumons, ovaires …, tissus fixés
et lames
Nature des ressources biologiques
(J.H. Di Donato, 2009)
Virus Protozoaires
1%
0%
Bactéries
1%
Protéines
2% ARN
11%
parasite
1%
Champignon
0%
ADN
19%
Lignées
7%
Tissus
20%
Fluides
19%
Cellules
19%
Techniques utilisées
Exemples pour tissus et organes :
Microscopie optique ou électronique
Histologie
Microdissection
Extraction de molécules
Techniques de génétique moléculaire …
Thématiques en recherche
(J.H. Di Donato, 2009)
Santé Publique
11%
Neur/Psy
7%
Gent/Dvpmt
8%
CœurPoumon/Immu
32%
Nutrition/ Méta
10%
Cancer
20%
Mal Infectieuses
12%
3 – CONSERVATION ET STOCKAGE :
les étapes doivent se succéder pour aboutir au
stockage définitif, dans les conditions permettant
de garantir la qualité de l ’échantillon :
conditions de prélèvement (température, anticoagulant,..)
transport à une température adaptée
réception :
– enregistrement de l ’échantillon et des données associées
– anonymisation
transformation :
– centrifugation,
– extraction ADN,
– Ficoll, ….
Aliquotage et étiquetage sécurisé
congélation
– +/- cryoprotecteurs
– entretien de cultures, ….
Stockage sécurisé (-196°C, - 80°C)
Réception des produits frais ou congelés
4 – UTILISATION
par le chercheur : « utilisation primaire »
utilisation par d ’autres équipes = « secondaire »
à la fin de la recherche les échantillons peuvent être
détruits ou être utilisés à d ’autres fins (loi du 4 août 2004)
retour au consentement
comité scientifique +/- CPPRB (CPP)
contrat définissant la propriété intellectuelle et les coûts
Exemple d’organisation :
Le CRB Ferdinand Cabanne (Dijon)
CRB multi-thématique de site
UF du Pôle de recherche clinique du CHU
Mutualisation des financements et centralisation
du management
Partenariat avec l’EFS Bourgogne Franche-Comté
Participation du DIM et de la DESIIR du CHU de
Dijon
Dimension inter-régionale avec le CHU de
Besançon
Schéma général d’organisation
Gouvernance organisée par une
charte
Coordonnateur et coordonnateur adjoint
Nommés par le coordonnateur du pôle de
recherche clinique
Comité technique
Stratégie scientifique et politique qualité du
CRB
Recevabilité et pérennité des collections
Cession des échantillons
Réunion toutes les 5 semaines environ
Équipe pludisciplinaire
Khalida Bentrari : responsable qualité – Pôle Recherche
Alain Bonnin : PU-PH biologie, coordonateur du CRB
Frédéric Brun : chef de projet informatique – DIM
Caroline Chapusot : ingénieur recherche – anatomopathologie
Irène François : PU-PH Médecine légale – éthique médicale
Gilbert Mongaillard : responsable de la biothèque, EFS.
Yves Mouillon : chargé de mission - Pôle Recherche
Nathalie Portier : Chef de projet – Pôle recherche
Sylvia Rastoix : analyste informatique – DIM
Céline Schaeffer : ingénieur recherche – lab. Hématologie
Lorraine Suschetet : ingénieur DSIIR
Le CRB facilitateur de la recherche
Tumeurs solides
F. Piard J. Faivre, CHU Dijon
Hémopathies malignes
M. Maynadié, CHU Dijon
Sérothèque hémopathies malignes
O. Casasnovas, CHU Dijon
Tumeurs mammaires
L. Arnould, CLCC Dijon
AGARIC
C. Bonithon-Kopp, CHU Dijon
CIRCE
P. Hillon, CHU Dijon
BMSI
B. Bonnotte, CHU Dijon
Sérothèque mycoses invasives
F. Dalle
Banque de sang placentaire
F. Pouthier, EFS BFC, Besançon
Cellules mononucléées/ allogreffes
P. Saas, EFS BFC, Besançon
Collections micro-organismes
D. Talon, L. Millon CHU Besançon
D. Caillot, CHU Dijon
Le CRB acteur de la recherche
PHRC inter-régional 2006 « projet cellules
sentinelles »
Coordination CRB FC
Plateforme protéomique CLIPP (Patrick Ducoroy)
NVH Medicinal (David Vandroux)
EFS BFC (Gilbert Mongaillard)
Plateforme de cytométrie de l’IFR santé-STIC (Anabelle
Legrand)
Brevet déposé
Exemple du CRB de Touraine
GIS
université François Rabelais de TOURS
CHU (CIC),
EFS,
INRA,
Institut interRégional pour la Santé,
INSERM
fonctionnement avec:
un conseil de groupement
un conseil scientifique et éthique
Rôle du CSE
Définition de règles de fonctionnement :
– CHARTE de FONCTIONNEMENT
– et de REGLEMENT INTERIEUR :
o conditions d ’accès
o conditions de cession, ….
Étude des dossiers proposés pour stockage (avis
technique et éthique)
Organisation centralisée (EFS) :
– plateau technique « cryo » norme ISO
– prestation : extraction ADN
Mise en place de Procédures
– réception, stockage, enregistrement informatique
Programme scientifique du CRBT
Cancérologie :
Pharmacogénétique des biomédicaments
Biothérapies, Cancérologie et Thérapie cellulaire
Tumorothèque hospitalière
Nutrition et métabolisme :
nutrition et cancer
cohorte DESIR (Données Epidémiologiques sur le Syndrome
d ’Insulino Résistance) avec l ’IRSA
Infectiologie
hépatites (IRSA, INvS, ..)
autres agents pathogènes
Pathologies Vasculaires
PHRC 2001 et 2002
Gestion de la biodiversité
semences de 3 lignées expérimentales de l ’INRA de coq Gallus
gallus
Les choix technologiques :
conditionnement, congélation, stockage
Containers
Azote liquide
Congélateurs
-80°C
« Bioarchive »
Conclusion
Véritable outil et plate forme à la disposition
des chercheurs et des cliniciens
vers une meilleure qualité des recherche , par
l ’amélioration de la qualité des échantillons
les objectifs :
l ’intégration de la tumorothèque hospitalière
la certification ISO
Annexes :
Collection Repères Inserm, février 2005
Les collections européennes
Les collections dans le monde
Textes et références
Sites WEB
http://www.crbfrance.fr
http://www.bbmri.eu
http://www.crbferdinandcabanne.fr