UMR 1300 BIOEPAR Biologie Epidémiologie et Analyse de Risque

Unité mixte de recherche
Biologie Epidémiologie et Analyse de Risque
en santé animale
UMR 1300
BIOEPAR
INRA Angers-Nantes Pays de la Loire
Oniris
Atlanpole-Chantrerie / CS 40706
F - 44307 Nantes Cedex 3
Présentation de l’unité
Les recherches, à perspective finalisée, visent à produire :
• des connaissances et méthodes pour la gestion de la santé
animale
• des connaissances fondamentales pour comprendre les
mécanismes d’apparition de maladies transmissibles
Plus précisément, les objectifs de l’unité sont les suivants :
• Mesurer la santé des populations animales, en comprendre
les déterminants et évaluer les moyens de la maîtriser
• Comprendre le fonctionnement des populations de vecteurs
et d’agents pathogènes, et les interactions entre agents
pathogènes et hôte
Les disciplines mobilisées sont l’épidémiologie, la modélisation,
l’économie de la santé animale, la biologie des bioagresseurs et des
interactions agresseur-hôte, et la biologie des populations.
Les objets d’application sont les maladies animales endémiques
et le portage d’agents zoonotiques dans plusieurs systèmes de
production animale de type européen. L’unité s’intéresse par
ailleurs à la biologie des protozoaires transmis par les tiques.
Contact
Tél. : +33 (0)2 40 68 76 52
Fax : +33 (0)2 40 68 77 68
[email protected]
www.angers-nantes.inra.fr/bioepar
Direction
Christine Fourichon, directrice
Olivier Plantard, directeur adjoint
Quelques chiffres
22 chercheurs et enseignants-chercheurs
10 ingénieurs
23 techniciens et administratifs
19 doctorants et post-doctorants
1 élevage de tiques
1 halle expérimentale d’aquaculture
1 serveur de calcul à architecture virtualisée
Institut National de la Recherche Agronomique
Membre fondateur d’Agreenium
L’unité est organisée autour de 4 équipes scientifiques
Epidémiologie observationnelle (EPID) - Nathalie Bareille.
• Description des statuts de santé individuels et de troupeau
et identification de facteurs-clés de l’occurrence des
maladies ou du portage de pathogènes
• Evaluation de l’impact des maladies et de l’efficacité de
mesures de maîtrise pour la formulation de stratégies de
maîtrise à l’échelle de troupeaux ou de régions.
Modélisation et décision (MODEC) - Catherine Belloc
• Etude par modélisation de l’influence de l’hétérogénéité
des populations d’hôtes et de vecteurs sur la propagation
des agents pathogènes
• Modélisation prédictive pour évaluer l’efficacité
épidémiologique de stratégies de maîtrise
• Evaluation économique de stratégies de maîtrise de
maladies endémiques et épidémiques.
Variabilité, Infection et Pathogénicité (VIP) - Laurence Malandrin
• Caractérisation des agents pathogènes et de leur variabilité,
pour deux modèles biologiques : Babesia et les bactéries
pathogènes des poissons.
• Mécanismes des interactions pathogène-vecteur-hôte,
pour le modèle Babesia-tique-ruminants.
Population de Vecteurs et de Pathogènes (PVP) - François Beaudeau
Analyse spatiale et moléculaire du fonctionnement des
populations de vecteurs et d’agents pathogènes :
• rôle de la structure du paysage dans la distribution, la
dynamique et la génétique des populations de tiques
• rôle des voies de transmission dans la distribution et la
diffusion des agents pathogènes.
Thèses en cours
• Valeur informative du budget-temps de la vache laitière pour la détection précoce des troubles de santé et des événements de reproduction - Pierre Clément.
• Troubles de santé affectant le bien-être des vaches laitières : évaluation de leur
fréquence et hiérarchisation de leurs facteurs de risque - Maud Coignard.
• Evaluation du croisement entre races bovines laitières - Charlotte Dezetter.
• Emission et persistance des agents biologiques pathogènes en centres de réhabilitation pour oiseaux sauvages en France métropolitaine - Philippe Gourlay.
• Modèles dynamiques à espace d’états pour la détection d’émergence
en épidémiologie - Anne Lehébel.
• Protocoles de traitement des bronchopneumonies infectieuses bovines
à l’aide d’antibiotique à courte action et préservation de l’efficacité thérapeutique en santé animale et santé humaine - Guillaume Lhermie.
• Développement et évaluation de stratégies de maîtrise des strongyloses gastro-intestinales des ruminants limitant le recours aux anthelminthiques - Nadine Ravinet.
• Modélisation de la propagation de Mycobacteirum avium subsp.
paratuberculosis dans une région d’élevage bovin pour évaluer des
stratégies de maîtrise - Gaël Baunée.
• Modélisation de la réponse immunitaire appliquée au virus du Syndrome Dysgénésique respiratoire porcin - Natacha Go.
• Modélisation de la propagation spatio-temporelle d’un agent pathogène dans une métapopulation bovine : application au virus de la
diarrhée virale bovine (BVDV) - Bhagat Lal Dutta.
• Interactions moléculaires entre le système immunitaire de la tique
Ixodes ricinus et le Protozoaire parasite Babesia spp. - Marie Jalovecka.
• Evaluation de l’intérêt vaccinal de la protéine RAP-1 pour lutter
contre les babésioses ovines - Qingli Niu.
• Influence du paysage sur les communautés de rongeurs comme
hôtes de maladies vectorisées par les tiques - Grégoire Perez.
• Influence des mouvements du chevreuil et du paysage sur la dynamique de population de tiques - Mohamed Lemine Brahim.
• Modélisation de la propagation de Coxiella burnetii entre troupeaux
bovins laitiers - Pranav Pandit.
• Polymorphisme génétique et écologie des tiques (Ixodide) - Ionut Pavel.
• Génétique des populations de tiques à l’échelle du paysage - Elsa Quillery.
Dispositifs d’expérimentation
• Elevage de tiques permettant des infections expérimentales et
études de transmission, avec des souches d’agent pathogène
issues du monde entier.
• Halle expérimentale poissons utilisée dans la réalisation d’infections expérimentales.
• Serveur de calcul à architecture virtualisée.
Faits marquants 2012
Infection par le virus de la Bluetongue sérotype 8 et
performances dans les troupeaux bovins laitiers - Simon
Nusinovici, Christine Fourichon.
Les baisses de performances de reproduction et de production
de lait associées à l’infection d’un troupeau bovin laitier par le
virus de la Bluetongue sérotype 8 (BTV-8) sont importantes
et durent plusieurs semaines. Des dégradations marquées
des performances ont également été mises en évidence dans
les troupeaux situés en zone infectée mais non notifiés par le
système de surveillance. Ceci montre que l’impact de l’épizootie
a été très supérieur aux effets décrits dans les troupeaux
notifiés. Un effet secondaire de la vaccination sur la fertilité a
été identifié mais est très limité comparativement aux effets de
l’infection.
Dynamique et contrôle des populations de vecteurs et des
maladies vectorielles – Pauline Ezanno.
Le contrôle des maladies vectorielles et de leurs vecteurs
constitue un enjeu majeur de santé animale et de santé
publique. Une approche par modélisation a permis d’intégrer
des connaissances éparses et hétérogènes entre espèces
vectrices ou maladies vectorielles pour proposer des modèles
épidémiologiques et de dynamique de populations de vecteurs,
utilisables pour évaluer des stratégies de contrôle ciblées.
Variabilité génétique de Flavobacterium psychrophilum,
pathogène de salmonidés, en France : une diversité génétique
sous-estimée – Ségolène Calvez, Laurence Malandrin.
Chez Flavobacterium psychrophilum isolé de Truite arc-enciel en France, le niveau de variabilité génétique s’est révélé
beaucoup plus faible pour des isolats cliniques que pour des
isolats issus de porteurs asymptomatiques. La recombinaison
est un déterminant majeur de cette diversité, et une structure
de population de type épidémique a été démontrée. Pour cette
étude, deux méthodes de typage de niveaux de discrimination
similaires ont été utilisées (MLST et PFGE).
La présence de la bactérie intracellulaire Wolbachia dans la
tique Ixodes ricinus est en fait due à la présence cryptique
d’un hyménoptère endoparasitoïde – Olivier Plantard
Plusieurs publications ont rapporté la présence de la bactérie
intracellulaire Wolbachia – connue pour être un symbiote
obligatoire chez certains nématodes ou une manipulatrice de
la reproduction chez certains insectes - chez certaines tiques.
La présence de Wolbachia dans la tique Ixodes ricinus est en fait
due à la présence cryptique d’un hyménoptère endoparasitoïde
qui se développe à l’intérieur de l’acarien.
Partenariats
Collaborations scientifiques
• INRA (départements MIA, EFPA, SPE, SAE2, GA, PHASE),
ANSES, CIRAD, CNRS, INRIA, Institut Pasteur, Universités
(Rennes, Bordeaux)
• Internationale : RVC et Glasgow Univ. (UK), Utrecht Univ.
et WUR (NL), SLU (SE), Kassel Univ. (G), IREC et IRTA
(SP), FEM (I), Univ. Bohême du Sud (CZ), LVRI (Chine)
Partenariats socio-économiques
• Unité Mixte Technologique « Maîtrise de la santé des
troupeaux bovins », en partenariat avec l’Institut de
l’Elevage, en lien avec les GDS et les GTV
• Institut Carnot Santé Animale
Formation
Les enseignants-chercheurs et chercheurs de l’unité interviennent dans les masters MODE, SAED (Université Rennes 1).
L’unité est rattachée à l’école doctorale Biologie-Santé (Univ. Nantes).
L’unité accueille des étudiants en thèse de doctorat vétérinaire, en
stage de fin d’études d’ingénieur et de master (Modélisation, BioInformatique, Statistiques, Ecologie, Biologie moléculaire et cellulaire, Biologie des populations, Epidémiologie, Santé publique).
BIOEPAR - Atlanpole-Chantrerie - CS 40706 - F - 44307 Nantes Cedex 3
Tél. : +33 (0)2 40 68 76 52 - Contact : [email protected] - Info : www.angers-nantes.inra.fr/bioepar
Service communication INRA - Mars 2013
Thématique de recherche