PLAQUETTE FORMATION LANGAGE R

FORMATION D’INITIATION AU LANGAGE R
RESPONSABLE DE LA FORMATION :
Professeur Jean-Yves BOIRE
 Faculté de Médecine
Laboratoire de Biostatistique, Informatique médicale
et Technologies de la communication - UMR 6284 UdA – CNRS
28, place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
PARTENARIATS : C.H.U. de Clermont-Ferrand et le CNRS.
PUBLICS CONCERNES :
Statisticiens, biostatisticiens et toute personne souhaitant s’initier au langage R.
PRE-REQUIS NECESSAIRES :
Les notions de statistiques mentionnées dans le programme sont considérées comme acquises.
OBJECTIFS DE LA FORMATION :
1) Comprendre le langage R et savoir utiliser le logiciel.
2) Mettre en œuvre un plan d’analyse simple et réaliser les graphiques les plus courants.
3) Appréhender les notions de programmation avancée (R et logiciels tiers, R et autres langages de
programmation).
PROGRAMME : 40 h sur 5 jours
Lundi 13 mai 2013 : INITIATION AU LANGAGE R
 Installation classique : RGUI
 Les variables
 Les instructions
 Les itérations et boucles
 Les fonctions
 Les objets « dataframe », « list », « vector » et « matrix »
Mardi 14 mai 2013 : STATISTIQUES INFÉRENTIELLES SIMPLES ET GRAPHIQUES
 Organiser un projet, une session de travail
 Importer un fichier de données .txt ou .csv
 Analyse descriptive (paramètres de position et de dispersion) et graphiques associés (histogramme,
densité)
 Analyse bivariée et graphiques associés (nuage de points, boite à moustache)
 Exporter les résultats
Mercredi 15 mai 2013 : MODELES LINEAIRES GÉNÉRALISÉS ET GRAPHIQUES AVANCÉS
 Format des variables
 Écriture du modèle
 Procédures de sélection
 Graphiques et adéquation du modèle
 Graphiques « multivariés »
Jeudi 16 mai 2013 : UTILISATION AVANCÉES DU LOGICIEL
 Création d’une installation portable sur support USB
 Les environnements de développement Tinn-r et RStudio
 Importer/exporter depuis Microsoft Access / Excel : le package RODBC
 Présenter ses résultats : le package R2HTML
Vendredi 17 mai 2013 : ÉTUDE DE CAS – CONCLUSION : POUR ALLER PLUS LOIN
 Étude de cas complète à partir d’un fichier de données source
 Utiliser des ressources externes : exemple de l’utilisation du moteur de calcul de SatScan pour la
détection d’agrégats
 Optimiser les temps de calcul : le multithreading ou comment optimiser les performances sur les
machines équipées de processeurs multicoeurs
Unité Mixte de Formation Continue en Santé
Faculté de Médecine - Université d’Auvergne - 28, place Henri Dunant 63001 Clermont -Ferrand
Organisme de formation enregistré sous le numéro 83.63.P.0013.63 auprès du préfet de la région Auvergne
FORMATION D’INITIATION AU LANGAGE R
NOMBRE DE CANDIDATS : 20 candidats maximum.
MODALITES PRATIQUES :
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Remise de support de cours
Formation sanctionnée par une attestation de formation
Poste informatique individuel mis à disposition de chaque stagiaire
Repas et pauses-café
RENSEIGNEMENTS ET INSCRIPTION :
Renseignements pédagogiques : Secrétariat de Biostatistique.
 04 73 17 81 95 E-mail : [email protected].
Date limite des inscriptions : 31 mars 2013.
CALENDRIER ET LIEU DE LA FORMATION :
Du 13 au 17 mai 2013.
Faculté de Médecine, Clermont-Ferrand, 28, Place Henri Dunant 63001 CLERMONT-FERRAND.
INTERVENANTS :
Lemlih OUCHCHANE (MCU-PH), Aline GUTTMANN (AHU), Cyril PERRET (PhD), Xinran LI (doctorant).
TARIFS :
900 € TTC.
Unité Mixte de Formation Continue en Santé
Faculté de Médecine - Université d’Auvergne - 28, place Henri Dunant 63001 Clermont -Ferrand
Organisme de formation enregistré sous le numéro 83.63.P.0013.63 auprès du préfet de la région Auvergne
FORMATION D’INITIATION AU LANGAGE R
FICHE D’INSCRIPTION
Date limite des inscriptions : le 31 mars 2013.
 Faculté de Médecine
Laboratoire de Biostatistique, Informatique médicale
et Technologies de la communication
UMR 6284 UdA – CNRS
28, place Henri Dunant 63001 CLERMONT-FERRAND
NOM :
PRENOM :
ADRESSE :
TEL :
E-MAIL :
PROFESSION :
MODALITE DE FINANCEMENT :
 Financement individuel (personnel)
 Prise en charge (OPCA, employeur, autre)
 En cas de prise en charge de la formation, joindre impérativement une attestation écrite de prise en charge.
A noter : Merci de ne joindre aucun règlement, celui-ci se fera qu’après signature de la convention ou du contrat
de formation envoyé(e) par nos soins.
Unité Mixte de Formation Continue en Santé
Faculté de Médecine - Université d’Auvergne - 28, place Henri Dunant 63001 Clermont -Ferrand
Organisme de formation enregistré sous le numéro 83.63.P.0013.63 auprès du préfet de la région Auvergne