2V423 - Licence SdV

SDV
Sciences de la Vie
Fiche d’U.E – 2V423
GENIE GENETIQUE ET MOLECULAIRE : UTILISATION D’UN ORGANISME MODELE
EUCARYOTE LA LEVURE SACCHAROMYCES CEREVISIAE
Responsables de l’U.E. :
Laure BIDOU, [email protected]
Mathilde GARCIA, [email protected]
Hélène PELCZAR, [email protected]
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Nature de l’U.E
Complémentaire
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Nombre d’ECTS :
6 ECTS
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Semestre où l’enseignement est proposé :
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Nombre d’heures de cours :
S4
4 heures de cours
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Nombre d’heures de TD :
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Nombre d’heures de TP :
56 heures (dont 10 séances de 3 ou 4h à la paillasse et des séances de 2h en petits groupes de travail de
bibliographie, d’histoire et philosophie des sciences, ou encore d’analyse de séquences)
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Evaluation :
60% de la note sera liée aux TP et 40% à un examen final
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Capacité d’accueil :
64 étudiants
Cette UE bidisciplinaire de génétique et de biologie moléculaire composée d'une partie théorique
et d'une partie pratique se situe dans la continuité directe des UE de tronc commun de biologie
moléculaire, de génétique et de biochimie de L1 et L2.
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement :
Illustrer et approfondir au moyen de la mise en œuvre de diverses approches expérimentales les
connaissances de base de la génétique et de la biologie moléculaire pour favoriser l’intégration des
notions fondamentales de la biologie. L’atelier pratique utilisera comme modèle la levure Saccharomyces
cerevisiae (S.c.). Il est essentiellement constitué de séances de TP, comportant non seulement des séances
« à la paillasse » mais aussi différents types de travaux personnalisés encadrés.
b) Thèmes abordés :
Mise en oeuvre d’une expérience : notions de modèle d’étude, de protocole, de bonne pratique
expérimentale, de résultat.
Caractérisation phénotypique et génotypique de souches de levure S.c. : notions d’auxotrophie et de
prototrophie, de voie de biosynthèse, de gène et de mutation. Mise en œuvre de tests de dominance et
récessivité, d’expériences de mutagenèse et de sauvetage fonctionnel.
Notion de vecteur (cas d’un plasmide navette). Mise en oeuvre de l’amplification de plasmides en
bactérie, de la purification et de l’analyse qualitative et quantitative d’une solution de plasmide, de
l’utilisation d’un plasmide navette recombinant.
Initiation à l’utilisation des bases de données (banque SGD) ainsi qu’aux logiciels d’analyse de séquence
(Ape et strider).
Techniques de laboratoire : cultures liquides et sur milieux gélosés de levure S.cerevisiae et de bactérie
E.coli, électrophorèse d’ADN en gel d’agarose, utilisation d’enzymes de restriction, mutagenèse aux UV,
utilisation du spectrophotomètre.
c) Connaissances et compétences attendues :
Acquis des UE de tronc commun de biochimie, biologie moléculaire et de génétique de L1 et L2.
d) Evaluation:
60% de la note sera liée aux TP et 40% à un examen final
e)
Particularités pédagogiques :
A l'issue de cet enseignement, les étudiants auront acquis une vision intégrée des concepts fondamentaux
en génétique et en biologie moléculaire illustrés par les expériences menées en TP. De plus, ils auront
appris à suivre une démarche expérimentale : de la mise en œuvre du protocole jusqu'à l'obtention d’un
résultat, sa présentation et son interprétation. Ils auront également appris à se servir de l’outil
informatique afin de conceptualiser leurs expériences et d’analyser leurs résultats. Ils apprendront
également à exposer devant un auditoire une problématique biologique issue d’une analyse de
publications scientifiques.