La PCR-Multiplex pour l`investigation rapide et fiable des diarrhées

MCL Freiburgstrasse 634 3172 Niederwangen www.mcl.ch
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avril 2015
de Medisupport, le Réseau Suisse de Laboratoires Régionaux n 8 www.medisupport.ch
La PCR-Multiplex pour l’investigation rapide et fiable des diarrhées
bactériennes
Les principaux agents pathogènes de la diarrhée, Salmonella spp., Shigella spp./E. coli entéroinvasifs (EIEC), Campylobacter jejuni/
coli et E. coli entérohémorragiques (EHEC) peuvent être identifiés et les résultats communiqués le jour même voir le jour ouvrable
suivant l’arrivée du prélèvement au laboratoire. Les résultats positifs sont confimés par culture, à l’exception des EHEC. Cette nouvelle
prestation nous permet de soutenir efficacement nos médecins dans l’établissement du diagnostic.
Culture
L’investigation de diarrhées bactériennes comporte, sauf indications particulières du prescripteur, la recherche de salmonelles,
shigelles et campylobacter. L’examen dure entre 2 et 4 jours.
Une identification plus rapide des germes entraîne des avantages conséquents aussi bien pour le patient donné que du point
de vue épidémiologique. De plus, diverses sources (Centers of
Disease Control1 (CDC) et autres2) recommandent une recherche de E. coli entérohémorragiques (EHEC, E. coli produisant
des shiga-toxines) sur les selles de diarrhées non acquises en
milieu hospitalier. La culture ne permet pas de différencier ces
derniers des E. coli apathogènes.
Avantages PCR multiplex
Nous nous efforçons d’améliorer en permanence nos méthodes. Nous analyserons donc dès maintenant tous les
échantillons de selles par PCR multiplex pour la recherche des
germes précités. Les résultats positifs seront suivis d’une mise
en culture, principalement pour des raisons épidémiologiques
(typisation, evt. antibiogramme).
L’étude de notre partenaire réseau Bioanalytica, sous la direction du Prof. Dr Martin Altwegg3 (cf. tableau) et des publications récentes4 ont montré que la PCR est plus sensible que
la culture. On doit donc s’attendre à des résultats positifs par
PCR et négatifs par culture qui seront à considérer comme vrais
positifs.
Culture a)
Salmonella spp.
Sensibilité
Spécificité
Sensibilité
Spécificité
100% b)
100%
100%
100%
67.2%
100%
91.4%
99.8%
Shigella spp.
72.7%
100%
100%
99.9% d)
Campylobacter jejuni/coli
86.2%
100%
100%
98.3%
67.2%
100%
98.5%
99.0%
nd
nd
nd
98.3%
89.5%
99.7%
E. coli enterohémorragique (EHEC)
52.6%
a)
d)
Prélèvement
PCR
c)
a)
100%
a)
Méthode imuno-enzymatique pour EHEC sur selles sans culture référence, référence [3], référence [4],
PCR englobe aussi E. Coli entéroinvasifs (EIEC), nd:
b)
c)
Selles natives
Attention : conserver les selles à température ambiante et non
au réfrigérateur.
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avril 2015
de Medisupport, le Réseau Suisse de Laboratoires Régionaux n 8 www.medisupport.ch
Disponibilité
Les échantillons arrivés dans la matinée par poste ou coursier
dans notre laboratoire sont en général traités le jour-même.
Après accord téléphonique, les prélèvements urgents peuvent
aussi être traités le week-end.
Méthode
Auparavant
Méthode
Recherche par culture :
- Salmonella spp.
- Shigella spp.
- Campylobacter spp.
Nouveau
Recherche moléculaire :
- Salmonella spp.
- Shigella spp. / EIEC
- Campylobacter spp.
- EHEC
Confirmation par culture si
positif (sauf EHEC)
Coûts
Renseignements
Résultat négatif
Résultat positif
Fr. 78.00
Fr.155.00
Fr. 100.00
Fr.177.00
Dr méd. Dobrila Dimitrijevic
Dr rer. nat. Angelika Ströhle
Littérature
[1]Gould LH et al. Recommendation for diagnosis of Shiga toxin-producing Escherichia coli infections by clinical laboratories. Morbidity and Mortality
Weekly Report 2009, 58 (RR-12): 1-14
[2]Should all stools be screened for Shiga toxin-producing Escherichia coli?
Point: MJ Marcon. Counterpoint: DL Kiska and SW Riddell. Journal of Clinical Microbiology 2011, 49: 2390-2397
[3]Altwegg M et al. Validation des Enteric Bacterial Panels für den Nachweis von Salmonellen, Shigellen, Campylobacter und EHEC auf dem BD MAXTM
(nicht publizierte Resultate einer laufenden Studie)
[4]Harrington S et al. Multicenter evaluation of the Becton Dickinson BD MAXTM Enteric Bacterial Panel (EBP) for the detection of Salmonella spp.,
Shigella spp., Campylobacter spp., and Shiga toxin-producing Escherichia coli. ASM Meeting 2014, Poster #1581
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