Détail des Unités d`Enseignements

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Master SET 1ère année
Spécialité : Biodiversité, Ecologie et Evolution
(BEE)
Détail des Unités d’Enseignements
Responsables pédagogiques du M1 SET-BEE: R. Gros et N. Kaldonski
Version 2015-2016
(Aix*Marseille Université
Master SET-Biodiversité, Ecologie et Evolution 2015-2016
détails des UE
Unités d’Enseignements du premier semestre (S1)
Code
Intitulé
page
UE obligatoires
TC1
Traitement des données
NC
TC2
Les grands enjeux environnementaux
NC
SB1
Ecole de terrain
SB2
UE optionnelles, 2 parmi 6
SB2a
Le sol vivant
5
SB2b
Approches évolutives de la biodiversité
6
SB2c
Biologie de la conservation
7
SB2d
Aspects législatifs, (…) de la gestion des espèces et des espaces
8
SB2e
Bases génétiques des fonctions microbiennes
9
SB2f
Aspects juridiques (…) de la valorisation industrielle des bio-ressources
10
SB3
SB3a
Paléoécologie et paléoenvironnement
11
SB3b
Fonctionnement, intégrité et restauration des écosystèmes
12
SB3c
Biologie du développement végétal et interactions plantes-microorganismes
13
4
Unités d’Enseignements du second semestre (S2)
Code Intitulé
UE obligatoires
TC3
Projet tutoré de première année
TC4
Langues/Communication
SB4
SB4a Ecologie adaptative et écophysiologie animale
SB4b Ecologie adaptative et écophysiologie végétale
SIG
Géomatique/SIG/Télédétection
SB4d Interactions microbiennes : aspects environnementaux et biotechnologiques
SB4e Ecologie chimique, le langage de la nature
SB5
SB5a Méthodes en écologie animale
SB5b Méthodes en écologie végétale
SB5c Méthodes d’analyses physico-chimiques et biologiques des sols
SB6
SB6a Ecologie du paysage
SB6b Ecologie des milieux de montagne
SB6c Ecologie des milieux méditerranéens
SB6d Ecologie des arthropodes terrestres
SB6e Ecologie forestière et dendroécologie
SB6f Ecologie des eaux continentales
SB6g Biotechnologies microbiennes
-3-
page
NC
NC
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
SB1-ECOLEDETERRAIN
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-6crédits
Connaissancesdebasesenbiologieetécologie
Connaissanceapprofondiesurlastructure,lesfacteursd’organisationetle
fonctionnementdesécosystèmesterrestresetaquatiques,ensefocalisant
surlesécosystèmesméditerranéens.
Apprentissagedutravaildeterrain.Observationàdifférenteséchelles.Prise
dedonnées.
Manipulationdesconceptsdel’analysededonnéesenécologie:
structurationdel’information,miseenévidencedegradientsécologiques,
hiérarchisationdesfacteursabiotiquespotentiellementexplicatifsdu
compartimentanimalouvégétal.
L’écoledeterrainsedérouleraendeuxphases:
Phase1:endébutdesemestre(40h)
Ens’appuyantsurunedémarchepluridisciplinaire,lesétudiantsseront
amenés,pendant5joursconsécutifs,àconjuguercoursthéoriqueset
illustrationsconcrètessurleterrain,dansdeuxdomainesprincipaux:
Phase2:enfindesemestre(20h)
Cettephaseapourbutderendrel’étudiantautonomesurleplandu
traitementstatistiquedesesdonnéesdeterrainou/etdelaboratoire,en
s’appuyantsurlesdonnéesrécoltéeslorsdelapremièrephase.
Lemodulepermetdeformerlesétudiantsauxméthodesd’analyses
multivariéesutilesàl’écologie.ACP,AFC,relationsespèces-environnement,
ANOVA,CAH,régressionetclassificationpararbre.Laformationthéorique
estcomplétéeparunemiseenœuvresurordinateur(logicielR)etune
réflexionsuruncasd’étudepratiquesuscitéparl’Ecoledeterrain.
1x3hCM(écoledeterrain)+3x3hCM/5x2hTP(partiemultivariée).
A.Millon
NF=0,5CC+0,5ET
6CM
14TD
-4-
40TPdont40hTPsorties
SB2A-LESOLVIVANT
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-3crédits
Notionsd’écologiegénéraleetdepédologie
Basesfondamentalesàlacompréhensiondufonctionnementbiologique
dessols,del’écologiedusoletdurôledecemilieuvivantdansla
dynamiquedesécosystèmes.
Lesolhébergeleplusgrandréservoirdebiodiversitédelaplanète.
Collemboles,micro-arthropodes,bactériesetchampignonsparticipentàla
dégradationdelamatièreorganiqueenmatièreminéraleessentiellepour
nourrirlesplantes.Lesmenacesquipèsentsurcettebiodiversitéetles
nombreuxusagesdusoljustifientsaconservationetlacréationd’une
directivecadreSol.CetteUEproposedeformerlesétudiantsàl’écologiedu
soletpourceladispenseunenseignementstructuréencinqgrandthèmes:
1)lesbasesdepédologietraitantlesprocessusdeformation,l’évolutionet
laclassificationdessols;lesconstituantsdusol;lespropriétésglobalesdu
sol(structure,texture,lesoletl’eau,lecomplexeabsorbant),
2)lesrelationssols/végétationsàdifférenteséchellesspatiale(desbiomes
àlaracined’uneplante),
3)labiodiversitédessols:lesfacteursstructurantsetsesvaleurs
écologiquesetéconomiques,
4)lesréseauxtrophiques,
5)lesrôlesdescomposéssecondairesvégétauxetdesorganismesdusol
dansladécompositiondelamatièreorganiqueetlaformationdeshumus.
R.Gros
NF=0CC+1ET
22CM
8TD
-5-
0TP
SB2B-APPROCHESEVOLUTIVESDELABIODIVERSITE
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-3crédits
BiologieetGénétiquedespopulationsniveaulicence,BasesenBiologie
moléculaire.
Cemoduleviseàexplorerlesproblématiquesdelabiodiversitédupointde
vueévolutifetàfournirunespritcritiquesurladiversitéetlaconservation
delabiodiversité.C’estunenseignementfondésurlapluralitédes
méthodespourappréhenderlavariablitéspatialeettemporelledela
biodiversité.Lamanipulationdeconceptsetl’abstractionthéorique
représenteuneinitiationàlamodélisationenécologie.Lemodulefournit
lesbasesincontournablespourtoutétudiantsedestinantàunM2Rou
PROenécologieetsciencesdelabiodiversité.
«Approchesévolutivesdelabiodiversité»apourobjectifuneformationen
biologieetenécologieévolutive.Lecourscommenceparlagénétiquedes
populationsetl’évolutiondupolymorphismemoléculaireetphénotypique
puissepoursuitparuneintroductionauxmodèlesd’écologieévolutive
portantsurl’évolutiondestraitsdevie,lesstratégiesévolutivement
stables,l’évolutionetledéterminismedusexe,lasélectionsexuelleetles
régimesd’appariement.Lecontenus’appuiesurlesthéoriesclassiqueset
lesdéveloppementsrécentsdelarecherche;ilestillustrédecasd’études
etdemodélisationsconceptuellesetanalytiques,théoriquesetappliquées.
Motsclés:évolutioncontemporaine,sélection,héritabilité,dérive,
structuresdediversitégénétique,modélisation,théoriedesjeux,bet
hedging.
A.Baumel
NF=0,25CC+0,75ET
24CM
3TD
-6-
3TP
SB2C/MED2-BIOLOGIEDELACONSERVATION
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-3crédits
Aucun
Cf.Contenu
Définition,historique,principesetconceptsgénérauxenmatièrede
BiologiedelaConservation.Géographieetdynamiquetemporelledela
diversitéetdelarareté.Elémentsdebaseendynamiquedespopulations
menacées.Impactsanthropiques.Protectionetgestiondelabiodiversité.
Conservationetrestauration.2sortiesdeterrain.
F.Médail
NF=0CC+1ET
18CM
0TD
-7-
SB2D/MED3-ASPECTSLEGISLATIFS,REGLEMENTAIRESET
ADMINISTRATIFSDELAGESTIONDESESPECESETDESESPACES
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-3crédits
Aucun
Cf.Contenu
-Instancesetréseauxdel’environnementenFrance,enEuropeetdansle
monde.
-Principalesloisetdirectivesrelativesàl’environnement:loisurl’air,loi
surl’eau,loi‘littoral’,loi‘montagne’.
-Lesdifférentsstatutsd’espacesprotégés.
C.Claret
NF=0CC+1ET
28CM
2TD
-8-
0TP
SB2E-BASESGENETIQUESDESFONCTIONSMICROBIENNES
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-3crédits
Aucun
Cf.Contenu
Basesdel’expressiongénétique,régulation,phénomèned’induction/
répression,quorumsensing.
-Transmissiondel’informationgénétiquechezlesmicroorganismes.
-Signification,intérêtdelabiodiversitéfonctionnelleintraet
interspécifiques.
A.-M.Farnet
NF=0CC+1ET
9CM
6TD
-9-
15TPdont3hTPsorties
SB2F-ASPECTSJURIDIQUESETADMINISTRATIFSDELA
VALORISATIONINDUSTRIELLEDESBIO-RESSOURCES
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-3crédits
Aucun
Cf.Contenu
-Protectionindustrielle,propriétéintellectuelle,innovationsstratégiques.
-Présentationdesdifférentesnormesdequalitédusecteuragro-industriel.
-Rôledesdifférentsservicesdel’entreprise:administration,recherche&
développement,production,servicecommercial,parketingetpublicité.
-Développementinternational.
C.Périssol
NF=0CC+1ET
20CM
10TD
- 10 -
0TP
SB3A-PALEOECOLOGIEETPALEOENVIRONNEMENT1
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
M1-S1-6crédits
Connaissancesdebaseenécologie
Changementsenvironnementauxetécologiquessousl'effetduclimatetde
l'actionhumainedurantleCénozoïque.Bilandel’histoiredesécosystèmes
aucoursduquaternaireetdestechniquesd’étudedes
paléoenvironnements.
Histoireetbilandel’actionduclimatetdel’Hommesurlesfaunes,les
floresetlesécosystèmes.Initiationauxtechniquesd’étudesdes
paléoenvironnements.
-Paléoenvironnement,paléoécologie,paléopaysages,Environnementde
dépôt,Analysemorphopollinique.
-Reconstitutionspaléoenvironnementalesàhauterésolutionspatiale:
Bioindicateurs,macrorestesvégétauxetanimaux.
-Reconstructionsquantitativesenpaléoécologie.
Importancedel’histoirepaléogéographiquedanslamiseenplaceet
l’évolutiondesfaunesetdesflores.
Rôledeszonesrefugesdansl’organisationdelabiodiversitéactuelle.
Responsable
V.Andrieu-Ponel
MCC
NF=1CC+0ET
Heures
détails des UE
40CM
20TD
- 11 -
0TP
SB3B/MED4-FONCTIONNEMENT,INTEGRITEETRESTAURATION
DESECOSYSTEMES
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S1-6crédits
Aucun
Cf.Contenu
-Ecologiedesperturbations,intégritédessystèmes,systèmesderéférence.
-Outilsdediagnosticécologique:descripteurdefonctionnement,
bioindicateurs.
-Ecologiedelarestaurationetrestaurationd’écosystèmesterrestreset
aquatiques.
-Etudes.
R.Gros
NF=0,25CC+0,75ET
30CM
6TD
- 12 -
SB3C-BIOLOGIEDUDEVELOPPEMENTVEGETALETINTERACTIONS
PLANTES-MICROORGANISMES
Acquis
conseillés
M1-S1-6crédits
Basesenbiologie,physiologie,écologievégétaleetmicrobienne
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Objectifs:disposerdesconnaissancessolidessurledéveloppementdes
végétaux,leurévolutionetleursadaptationsainsiquesurlesinteractions
existantentrevégétauxetmicroorganismesprésentsdansleur
environnementqu’ellessoientbénéfiques(valorisables)oudommageables.
Contenu
Depuisl’originedeleurdéveloppement,lesplantespartagentlemême
environnementquelesmicroorganismes.Acetitre,leurévolutionestsouvent
étroitementliéedanslesécosystèmes.Lacompréhensionexhaustivedu
fonctionnementdesécosystèmesterrestressedoitainsidetenircomptedes
processusinteractifsexistantsentreplantesetmicroorganismes.Cette
compréhensionnepeutsefairequ’autraversdel’étudede:(i)l’écologie
fonctionnelledesplantes;(ii)l’écologiefonctionnellemicrobienne;(iii)leurs
interactions.
UnepremièrepartiedecetteUEtraitedesprincipesfondamentauxrégissantla
forme,lastructuredesplantesdupointdevuedeleurfonctionnement
écologique,deleurorigineévolutiveetdeleurdynamiquededéveloppement.Ces
basespermettrontàchacund’interpréterlesrelationsexistantsentresles
différentesformesdecroissanceetleursfonctionsàtraversl’étudedel’origineet
del’évolutiondudéveloppementdesappareilsaérienetracinairedesplantes.
L’objectifestd’acquérirunemeilleurecompréhensiondel’évolutiondes
organismesvégétauxetdesmécanismesquipermettentauxplantesd’adapter
leurdéveloppementàleurenvironnement.
Lacompréhensionapprofondiedufonctionnementetdudéveloppementdes
végétaux,deleursadaptationsetdeleurévolutionseferaàtraversl’étude
d’exemplesdebiodiversitédéveloppementaleauniveau:
-reproducteur(développementinflorescentiel,floral,sporo-gamétogénèse,
fécondation…),
-racinaire(développementarchitectural,adaptationfonctionnelle,...).
UnedeuxièmepartiedecetteUEtraitedesprocessusinteractifsexistantentreles
plantesetlesmicroorganismes.Lespointssuivantsserontainsiabordés:
-écologiemicrobienneetrelationplantes-microorganismes,
-liensfonctionnelsentreplantesetmicroorganismes(racines,surfacedesfeuilles,
fleurs,fruits),
-interactionssymbiotiquesetpathogènesplantes-microorganismes,
-métabolitessecondaires,valorisationdelabiomasseetdelabiodiversitétantdu
pointdevuedelabiomassevégétalequedesmicroorganismes.
Sortieetéchantillonnagedeplantessurleterrain(étang,garrigue).Travaux
pratiquesetanalysesdelaboratoire.Interactionsplantes–microorganismeset
impactsurledéveloppementvégétal.Biodiversitéetvalorisationdebiomasses
végétales.
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
S.Criquet
NF=0CC+1ET
42CM
0TD
- 13 -
18TPdont6hTPsorties
détails des UE
SB4A-ECOLOGIEADAPTATIVEETECOPHYSIOLOGIEANIMALE
Acquis
conseillés
Basesdelaphysiologieanimale(milieuintérieur,fonctionscardiovasculaire,respiratoire,digestiveetexcrétionrénale),basesdegénétiques
despopulations(sélectionnaturel,fitness),basesdel’écologie,basesde
biologieanimale.
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Compréhensionapprofondiedesmécanismesadaptatifsauxcontraintesde
l’environnementdepuislecomportementjusqu’auxadaptations
physiologiqueschezlesanimaux.
Contenu
Traitsd’histoiredevieetadaptationdesanimauxauxconditions
environnementales.
Résistanceàl’assèchementetàlasalinitéenmilieuaquatiquestemporaires
(Stresshydrique,salin,hypoxiqueetanoxique).Rythmesbiologiquesdans
l’écosystème,stratégiesadaptativesetdereproduction.
Approchephysiologiquedesrythmesbiologiquesdeshorlogescircadiennes,
etdelathermorégulation.
Responsable
MCC
Heures
M1-S2-6crédits
E.Franquet
NF=0,25CC+0,75ET
33CM
27TD
- 14 -
0TP
SB4B-ECOLOGIEADAPTATIVEETECOPHYSIOLOGIEVEGETALE
Acquis
conseillés
M1-S2-6crédits
Basesenbiologie,écologieetphysiologievégétale.
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Compréhensionapprofondiedesmécanismesadaptatifsauxcontraintesde
l’environnement,stratégiesadaptatives,trade-off,notiondetrait
biologique,gestiondel’équilibrehydrominéral,stratégies
photosynthétiques.
Contenu
Lesplantessontdesorganismesfixésquimodulentleurcroissanceetreproduction
enfonctiondesfacteursphysico-chimiquesdel’environnementdémontrantleur
extraordinaireplasticité.L’intégrationdedifférentssignauxetleurtraductionen
réponsesbiologiquesleurpermettentd’avoirundéveloppementharmonieuxen
relationavecleurenvironnement.
SerontabordésdanslecadredecetteUE,lesmécanismesd’adaptationsdes
végétauxauxvariationsenvironnementalesàtraversl’étudedelatransition
florale,del’influencedesfacteursclimatiques,édaphiquesetdespolluantssur
leurdéveloppementetleurfonctionnementetl’étudedetraitsfonctionnelsen
interactionavecl’environnement.
Unepremièrepartietraiteradesdifférentsmécanismesd’adaptationetde
toléranceauxvariationsclimatiquesetleseffetsdespolluantssurle
développementdesplantes.Quellessontlesrelationsexistantesentreles
processusphysiologiquesdelaplanteetsonenvironnementetquellesstratégies
adaptativesdéveloppent-ellesafind’assurerleurdéveloppement,notammenten
situationdestress.
Unedeuxièmepartieporterasurlatransitionfloralequiestunévénementmajeur
ducycledevieetdontletimingesthautementréguléparlesfacteurs
environnementauxetconditionnantlarépartitiondesvégétaux.Lesmodesde
perceptions,auxréponsesetauxinteractionsentredifférentsfacteurs
(photopériode,thermopériode,températuresélevées,facteursnutritionnels&
hormonaux)orchestrantcettetransitionserontabordés.
Unetroisièmeparties’intéresseraàcommentcescaractéristiques
écophysiologiquesadaptativesvariententreespèces;lestraitsfonctionnels
commecaractéristiquespertinentesexpliquantl’interactionplante-environnement
àéchelledel’organismeentier;lesstratégiesadaptativesdelaplanteentièresont
abordéesaveclasélectionr/KetlemodèleCSRetLHS;puislaquestionde
commentlesvégétauxoptimisentleurfitnessenfaisantvariertraitsfoliaires,de
grainesetdetaillephénologie,lescompromisévolutifsetphysiologiques(tradeoff);enfinestabordélacorrélationentretraitsetphylogénie.Commemodèle
alternatifàl’approcheadaptativeestprésentélathéorieneutredebiodiversitéet
biogéographie.
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
H.Folzer
NF=0CC+1ET
45CM
15TD
- 15 -
0TP
SIG-GEOMATIQUE/SIG/TELEDETECTION
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
M1-S2-6crédits
Pratiquecourantedel'informatiqueniveaubureautique
Moduled’initiationàlagéomatiquepermettantauxétudiantsd’acquérirlesbases
nécessairesetindispensablesàuneinsertiondanslemilieuprofessionneldansledomaine
del'environnement.
Lesenseignementsthéoriquesserontcouplésenpermanenceàdesapplicationspratiques
portantsurdesexemplesconcrets;Ilsutiliserontdesbasesdedonnéesréellesetactuelles
;Ilsbénéficierontd'interventiondechercheursetprofessionnelsspécialisésdans
l'utilisationd'outilsdelagéomatiquedansdesdomainesvariés(gestionenvironnementale,
cartographiedesrisques,…).
L'acquisitiondedonnéessurleterrainetsonintégrationdansleSIGpermettrademieux
appréhenderlachaînedetraitementdel'informationgéographique.
Lesoutilsutilisésserontlespluscourantsdanslemondeprofessionnel(ArcGis,Spatial
Analyst…),chaqueétudiantdisposantdel’équipementinformatiquenécessaire.
Unité1,8h:
Uneprésentationthéoriquedes:
–principesdelagéodésieetthéoriedel’instrumentationdédiéeàlagéomatique.
–principedesSIG
Unité2,26h
Cetteunitéestdédiéeàl’acquisitiondedonnées.Celle-cipeutcomprendrecertainsdes
élémentssuivantsenfonctionduparcours:
–logistiqueterraininstrumentation(topométrique,géophysique...);
–stratégied’échantillonnage,formatd’échangesetimport/export.
–utilisationGPS
–MesuresGravimétriques
–Tomographiederésistivitéélectrique
–Cartographiemagnétique.
–Échantillonnageetanalysegranulométrique–Photogrammétrie
-Numérisation
-Télédétection
Unité3,26h
Cetteunitéestdédiéeàl’analyseetlarestitutiondesdonnéessousSIG.Lesobjectifssont:
–Traiterlesdonnéesrécoltéesdansl’unité2.
–ApplicationdeslogicielsArcGiset/ouQgis.
–Assimilerlaterminologiepropreaux2logiciels.
–Comprendreetdifférencierlesdifférentesdonnées(Vecteur,Raster,DonnéesWMS...)
–Consulterdesdonnées
–Gérerladonnéetabulaire
–Procéderàdessélections(graphiquesetattributaires)etàdesrequêtes(logiqueset
topologiques)
–Réaliseruneanalysespatiale
–Réaliserunemiseenpage
–ConstruireetgérerdesMNT
–Créerdesgéodatabasesetdesclassesd’entités
–Savoirgéoréférencerunraster
–Utiliserlavisualisation3D
Responsable
S.MEULE/A.LERICHE
MCC
NF=0,25ET+0,75CC
Heures
détails des UE
12CM
32TD
- 16 -
16TP
SB4D/M15-INTERACTIONSMICROBIENNES:ASPECTS
ENVIRONNEMENTAUXETBIOTECHNOLOGIQUES
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-6crédits
Connaissancesdebasesenchimieetbiologie
Cemodulethématiquepermettraauxétudiantsd’avoirunevision
synthétiquedesinteractionsentrelesorganismesvivantsetlesmatériaux
ausenslarge.L’accentseratoutparticulièrementmissurlesrelations
microorganismes-solsetmicroorganismes-eauxauniveaudesdéséquilibres
dusàdespollutions,ainsiqu’auniveaudurôledeceux-cidansles
mécanismesderémédiation.
L’objectifdesTPestdemaîtrisercertainestechniquesmicrobiologiques
permettantd’évaluerlesinteractionsmicroorganismes/matériauxdansun
environnementcomplexe(lesoloulesédiment):cultureset
dénombrements,biologiemoléculaire,respirométrie,activités
enzymatiques,testsécotoxicologiques,biodiversitéfonctionnelle(Biolog).
Utilisationsdesactivitésmicrobiennesdanslesproblèmesdetraitement
despollutionsetdebioremédiation.
Implicationsdesbactériesdanslesphénomènesdecorrosiondesmétaux
etdesroches.
Biodégradationdesmatériaux.
Biotraitementdessolspolluésenmétaux.
Traitementdeseaux:stationsd'épuration,fonctionnementbiologique,
microorganismesetleursrôlesdanslesbouesactivées,traitementdes
boues,composts.
Perturbationsdel'écosystèmesol:effetsdel'épandagedebouesdestation
d'épurationoudecompostssurlefonctionnementmicrobiologiquedes
sols.
Travauxpratiquesdemicrobiologiedessolsetdessédiments.
S.Criquet
NF=0CC+1ET
28CM
2TD
- 17 -
30TPdont8hTPsorties
SB4E-ECOLOGIECHIMIQUE,LELANGAGEDELANATURE
Acquis
conseillés
M1-S2-6crédits
Connaissancesdebaseenécologie
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Donnerdesconnaissancesdebasesenécologiechimique,domained’avenir
permettantderépondreàdesquestionssociétalessurlaqualitéetla
préservationdel’environnement.
Contenu
Toutêtrevivantproduitetémetdesmoléculesquivontavoirdesactions
surleurenvironnementbiotiqueetabiotique.L’écologiechimiqueétudie
cesinteractionsentrelesêtresvivantsviacesmoléculesmaisaussiles
substancesquiensontresponsables.Danscecoursserontabordésles
thèmessuivants:
Lessubstancesimpliquées:principalesvoiesmétaboliquesetvariationsde
productionenfonctiondesconditionsenvironnementales.
Del’écologiechimiqueàlachimiotaxonomie:commentl’analysedu
métabolomepermetd’obtenirdesclassificationscomparablesàcelles
fourniesparlasystématiquemoléculaireparl’analysedugénome.
Rôlesdecesmétabolitesdanslefonctionnement,ladiversitéetde
l’évolutiondesécosystèmes(communicationchimique:microorganismes,
plantes,insectes,organismesaquatiques,mammifères).
L’écologiechimiquedansunmondeenmutation:exemplesdel’implication
desmétabolitesspécialisésdanslecadreduchangementglobal
(changementclimatique,changementd’utilisationdesterres,invasions
biologiques)etconséquencessurlefonctionnementdesécosystèmesetles
interactionsbiotiques.
Dessolutionsnaturelles:Utilisationdesconnaissancesapportéespar
l’écologiechimiquedanslarecherchedesolutionsnaturellespermettantde
répondreauxgrandproblèmesenvironnementaux:écologiechimiqueet
agriculture;chimieverte;phytoremédiation.
Travauxpratiquesettravauxdirigésillustrantlesthèmesabordés:miseen
évidencedemédiateurschimiques(testd’olfaction,électroantennographie,
testd’allélopathie)etexempledetechniquesd’analysesdesmédiateurs
chimiques(odeurs,couleurs…).
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
C.Fernandez
NF=0CC+1ET
30CM
18TD
- 18 -
12TPdont8hdeTPsorties
SB5A-METHODESENECOLOGIEANIMALE
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Basesd’écologieetdetaxinomie
Maîtrisedesdifférentesméthodesettechniquesd’échantillonnageetde
quantificationdespopulationsetcommunautésanimalesterrestreset
aquatiques
Techniquesetméthodesdedénombrement,techniquesdecapturesetde
prélèvement,étudedesdéplacements,mesuresbiométriquesetautres
investigations(régimealimentaire,étudedesdéplacements,etc.).CM
(10h),articulésavecdesmanipulationspratiques(TP)àl’extérieur
regroupéssurdesdemijournéesoudesjournées):vertébrésetinvertébrés
terrestresetaquatiques.
A.Millon
NF=0CC+1ET
14CM
0TD
- 19 -
SB5B-METHODESENECOLOGIEVEGETALE
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Taxonomievégétaleetécologiedespopulationsetdescommunautés
végétalesniveaulicence.
Cemoduleviseàfairemaîtriserlesdifférentestechniquesactuelles
d’échantillonnagedespopulationsetdescommunautésvégétales
nécessairespourtoutesétudesdelavariabilitéspatialeettemporelledela
biodiversité;cecisurlabased’enseignementsthéoriques,dirigéset
pratiquesavec2journéesdeterraininsituetexsitu(conditions
contrôlées).
Démarchederecherchescientifique.Descriptiondelapluralitédes
approchesexpérimentalesinsituetexsitupourquantifierlabiodiversité.
Relevésdevégétation.Traitsfonctionnels.Basesdedonnées.Techniques
desplacettes,destransectsetdesméthodesponctuelles.Estimationdela
fréquenceetl’abondancedesespècesetdeleursbiovolumes.Utilisation
d’abaques.Dénombrement/Spatialisationdesindividus.Tauxde
renouvellement.Modalitésdereproduction.Interactionsbiotiques.Effets
demultiplesfacteursabiotiques.
L.Affre
NF=0,25CC+0,75ET
9CM
4TD
- 20 -
17TP
SB5C-METHODESD’ANALYSESPHYSICO-CHIMIQUESET
BIOLOGIQUESDESSOLS
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Connaissancesfondamentalesenécologiedessolsetenécophysiologie
microbienne.
Acquisitiondesméthodesettechniquesd’analysesdespropriétésphysicochimiquesetbiologiquesdessols.
Plansd’expériencesetéchantillonnageensciencesdusolenconditions
réelsavecnotamment½journéedeterrain
Traitementsdesdonnéesspécifiquesauxsciencesdusol
Descriptiondesprofilsdesolsetrelationssols/végétation(sortieterrain)
Propriétésphysico-chimiquesdessols(analysegranulométrique,stabilité
structurale,capacitéd’échangecationique,réserveutileeneau,
perméabilité,azotetotaletformesminérales,phosphoreassimilable,
carboneorganique…);
Approchesexpérimentaleetanalytiquedurôledelamicroflorebactérienne
dansladynamiquedescyclesducarboneetdel’azote(méthodes
d’évaluationdelataille,deladiversitéetdel’activitédescommunautés
microbiennes;techniquesd’étudedeladégradationdeslitières).
R.Gros
NF=0CC+1ET
16CM
0TD
- 21 -
14TPdont4hTPsorties
SB6A-ECOLOGIEDUPAYSAGE
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Basesenécologie.
Initiationàl’analysespatialeetintroductionauxconceptsdéveloppésen
écologiedupaysage.
Lanotiondepaysage,structure,fonctionnement.Rôlefonctionnelet
dynamiquedespaysages.Hétérogénéité,analysespatiale,rôledes
perturbations.Interactionentreécosystèmes.
Rôledel’hommedanslacréationetladynamiquedupaysage.
Notiondepaysagedansleshydrosystèmes,bassinsversants
Méthodesd’analysesspatiales.Lesdifférentstypesdedonnées
photographiquesetsatellitaires.Quantificationdupaysage.
InitiationauxSystèmesd’informationgéographique.
T.Tatoni
NF=0CC+1ET
16CM
6TD
- 22 -
8TPdont8hTPsorties
SB6B-ECOLOGIEDESMILIEUXDEMONTAGNE
Acquis
conseillés
M1-S2-3crédits
Basesdebiologieetd’écologie.
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Fournirlesbasesfondamentalesàlacompréhensiondesmilieuxd’altitude,
àleurspécificitéetleurdiversité.ExempledesAlpesdusud.
Contenu
Cetenseignementcomprenduneécoledeterrainde3jours.
Spécificitéetfonctionnementdesécosystèmesd’altitudes
-Etagementaltitudinaldelavégétationetdessols,dynamiquedesespèces
etdespopulations,histoiredel’anthropisationetdespaysages.Risqueset
perturbations.
-Florealpine(Particularités.Biodiversité.Origine.Migrationpostglaciaire
taxonomie,identification).Faunealpine(particularités,inventaire,
répartition).
-Lesmilieuxaquatiquesethumides(tourbières,lacs,torrents):
particularités,fonctionnement,biodiversité.
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
B.Talon
NF=0CC+1ET
6CM
0TD
- 23 -
SB6C-ECOLOGIEDESMILIEUXMEDITERRANEENS
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Basesenécologie,engénétiquedespopulations,etenhydrobiologie.
Compréhensiondesprincipalescaractéristiquesécologiqueset
anthropiquesquifontdeszonesàbioclimatméditerranéendelaPlanète,
dessecteursremarquablesentermesdediversitébiologiqueet
écosystémique,defonctionnementécologiqueetd’adaptations
physiologiquesdesespèces.
Biodiversitédel’aireMéditerranéenne,évolutionetdynamiquedes
écosystèmesméditerranéens,aspectsbioclimatiques,végétationetagroécologieméditerranéennes,particularitésdesmilieuxaquatiques
Méditerranéens.
S.Fayolle
NF=0CC+1ET
20CM
2TD
- 24 -
8TPdont8hTPsorties
SB6D-ECOLOGIEDESARTHROPODESTERRESTRES
Acquis
conseillés
M1-S2-3crédits
Connaissancesdebaseenbiologieetécologie.
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Acquisitiondesconnaissancessystématiquesetécologiquespourl'analyse
descommunautésd'arthropodesterrestresetaquatiques.Moduledestiné
auxétudiantsayanteuuneformationplutôtbotaniqueauparavantetqui
désirentcompléterleursconnaissancessurlafauneinvertébrée.
Contenu
Basessystématiques.
Placeetrôledesarthropodesdanslesécosystèmes.GestionetConservation
desespèces
Placeetrôledesarthropodesdanslesmilieuxaquatiques.Spécificitédela
conservationdesarthropodesenmilieuaquatique.
Responsable
J.Orgeas
MCC
NF=1ET
Heures
détails des UE
18CM
6TD
- 25 -
6TP
SB6E-ECOLOGIEFORESTIEREETDENDROECOLOGIE
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Connaissancesdebaseenécologie.
Basesfondamentalesetméthodologiquesdel’écologieforestièreet
l’analysedespeuplementsarborés.
Structuredesécosystèmesforestiers:architecture,communautés
végétales,organisationspatialeetévolution.Analysespatiale.
Naturalitéetbiodiversitédesécosystèmesforestiers.
Biologiedel’arbre.Formationducerne.Enregistrementdesperturbations
localesetdynamiqueforestière.Rôleduclimatetimpactdeschangements
climatiques.
LeBois:critèresdereconnaissancesmacroscopiquesetmicroscopiquesdes
principalesessencesforestièresdelarégionPACA.
B.Talon
NF=0CC+1ET
12CM
8TD
- 26 -
10TP
SB6F-ECOLOGIEDESEAUXCONTINENTALES
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Fonctionnementnatureldesrivières,connaissancesdebasesurlafloreet
lafaunedesmilieuxaquatiques.
Connaissancesfondamentalesetappliquéessurlefonctionnementdes
hydrosystèmesanthropisés.
Panoramasdesperturbationsanthropiquesenmilieuxaquatiques.Etudede
casetpriseencomptedesimpactsdesactivitéshumainessurla
biodiversité(algues,macrophytes,invertébrésetpoissons)etle
fonctionnementdesécosystèmesaquatiques.Exemplesd’impactsétudiés
(enfonctiondesannées):lacsdebarrage,régulationdesdébitsdesgrands
fleuves,endiguement,exploitationdegravières.Stagedeterrainde2jours.
C.Bertrand
NF=0,5CC+0,5ET
15CM
7TD
- 27 -
8TPdont8hTPsorties
SB6G-BIOTECHNOLOGIESMICROBIENNES
Acquis
conseillés
Compétences
auxquellesest
reliéel’UEou
objectifs
Contenu
Responsable
MCC
Heures
détails des UE
M1-S2-3crédits
Basesdemicrobiologie.
Acquérirlesconnaissancessurlerôledesmicroorganismesdansle
traitementdeseauxetdanslabioremédiation.
Stationsd’épurationettraitementdeseauxusées:installationsd’épuration
deseaux,processusmicrobiologiquesimpliqués,traitementaérobieet
anaérobiedeseauxuséesurbainesetindustrielles,variationdedominance
desmicroflores,traitementetgestiondesboues.
Compostsdebouesd’épuration:principesducompostageetintérêt
agronomique.
Phytoremédiationettechniquesindustriellesdedépollutiondessolspar
voiesbiologiques,étudesdecas.
C.Périssol
NF=0CC+1ET
22CM
0TD
- 28 -
8TPdont8hTPsorties

Détail des Unités d`Enseignements

Transcription

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