Infections par les Rotavirus - Pôle de Biologie Pathologie Génétique

CBP
Infections par les
Rotavirus
1.0
FACULTÉ
ANNE GOFFARD
UNIVERSITÉ LILLE 2 DROIT ET SANTÉ
DES SCIENCES PHARMACEUTIQUES ET BIOLOGIQUES
DE LILLE
[email protected]
2012
Table des
matières
Objectifs
5
I - Infections par les rotavirus
7
A. Taxonomie et structure.................................................................................. 7
1. Taxonomie....................................................................................................................... 7
2. Structure de la particule virale............................................................................................ 7
3. Variabilité des Rotavirus.....................................................................................................8
B. Épidémiologie des infections à rotavirus........................................................... 8
1. Epidémiologie mondiale..................................................................................................... 8
2. Épidémiologie en France.................................................................................................... 8
3. Modes de transmission des rotavirus....................................................................................8
C. Tableaux cliniques des infections à rotavirus..................................................... 9
1. Gastro-entérites à rotavirus chez l'enfant............................................................................. 9
D. Diagnostic des infections par les rotavirus........................................................ 9
1. Échantillons biologiques................................................................................................... 10
2. Diagnostic direct............................................................................................................. 10
3. Diagnostic indirect........................................................................................................... 10
E. Traitement et prévention des infections à rotavirus.......................................... 10
1. Prise en charge de l'épisode aigu chez l'enfant.................................................................... 10
2. Prévention des gastro-entérites à Rotavirus........................................................................ 11
3
Objectifs
Ce cours est tiré de l'enseignement de virologie de la faculté de
pharmacie de Lille, destiné aux étudiants de 5ème année qui
préparent le concours de l'Internat en pharmacie.
5
Infections par les
rotavirus
I
I-
Taxonomie et structure
7
Épidémiologie des infections à rotavirus
8
Tableaux cliniques des infections à rotavirus
9
Diagnostic des infections par les rotavirus
9
Traitement et prévention des infections à rotavirus
10
A. Taxonomie et structure
1. Taxonomie
Les rotavirus appartiennent à la famille des
groupes ont été identifiés.
, au genre Rotavirus. 7
2. Structure de la particule virale
Ce sont des virus nus de structure icosaédrique et à ARN double brin
segmenté (11 segments). En microscopie électronique, les virions de 60 à 80 nm
de diamètre ont l'aspect d'une roue, d'où leur nom.
Leur génome est constitué de onze segments (numérotés de 1 à 11) codant douze
protéines.
Leur capside est formée de trois couches de protéines :
 la couche interne est formée par VP2,
 la protéine VP6 forme la couche intermédiaire de la capside détermine les
sérogroupes, A à G. Trois d'entre eux (A, B et C) infectent les humains,
majoritairement le groupe A,
 les protéines de la couche externe sont constituées de VP4 et VP7 qui
induisent la production d'anticorps. Les déterminants antigéniques de VP4
permettent de définir les sérotypes P, ceux portés par VP7 déterminenet
les sérotypes G.
Enfin, les protéines VP1 et VP3 sont associées au génome
3. Variabilité des Rotavirus

Les arrangements génétiques sont fréquents mais ont peu d'impacts sur
7
Infections par les rotavirus


l'épidémiologie.
Les mutations peuvent entraîner une dérive génétique avec pour conséqunce
l'apparition de mutants d'échappement voire de souches épidémiques.
Les réassortiments entre génomes humains et entre génomes de différentes
espèces sont à l'origine de l'émergence de nouveaux génotypes humains
comme par exemple les rotavirus G9.
B. Épidémiologie des infections à rotavirus
1. Epidémiologie mondiale
Les rotavirus sont la première cause de diarrhée aiguë sévère du jeune
enfant dans le monde.
Presque tous les enfants sont infectés par un rotavirus au cours des cinq premières
années de leur vie.
> 500 000 enfants de moins de 5 ans meurent de diarrhée à rotavirus
chaque année, à plus de 85% dans les pays à faible revenu d'Afrique et d'Asie.
Dans les pays industrialisés, les infections à rotavirus représentent 15 à 50%
des cas de gastro-entérites ; la mortalité associée à celles-ci reste faible.
Principale cause de mortalité infantile, la gastro-entérite à rotavirus est
responsable d'un demi-million de décès par an, chez les enfants de moins
de cinq ans.
On rencontre des gastro-entérites à Rotavirus lors d'épidémies hivernales, mais il
existe également des cas sporadiques tout au long de l'année.
2. Épidémiologie en France
En France, près de 300 000 épisodes annuels seraient décomptés chez les
enfants de moins de cinq ans avec une dizaine de décès
Les infections à Rotavirus sont observées en France pendant l'hiver, de Novembre
à Mars avec un pic en décembre et janvier.
Cependant des cas sporadiques peuvent survenir en dehors de cette période.
3. Modes de transmission des rotavirus
Virus nus très résistants dans l'environnement.
Transmission fécale-orale directe : par les mains souillées, lors du nettoyage des
sanitaires.
transmission indirecte : par les aliments (coquillages...), par les eaux souillées.
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Infections par les rotavirus
Personne saine
Personne infectée
Eaux de boisson
Aliments souillés
Eaux Usées
Coquillages
Arrosages, Ependages
Stations d'épuration
Ruisseaux, Rivières, Fleuves,
Lacs,
Océans, Mers
Graphique 1 Cycle de contamination fécal-oral
C. Tableaux cliniques des infections à rotavirus
En France, les gastro-entérites à Rotavirus sont le plus souvent bénignes, elles
évoluent en quelques jours vers une guérison sans séquelles. le principal risque de
cette pathologie est la déshydratation chez le petit enfant.
De nombreuses réinfections auront lieu dans l'enfance. Chez l'adulte, les gastroentérites sont rarement liées aux Rotavirus.
1. Gastro-entérites à rotavirus chez l'enfant
La primo-infection à Rotavirus survient surtout entre 3 et 9 mois.
Nombreuses réinfections dans l'enfance et à l'âge adulte.
Après une Incubation de 3 jours, apparaît brutalement une gastro-entérite aiguë
fébrile :
 Diarrhée aqueuse : par définition > 3 selles liquides/j,
 Vomissements ,
 Douleurs abdominales : à type de spasmes, de coliques,
 Fièvre rarement élévée, plutôt 38,5°C-39°C.
Evolution du tableau clinique est rapide : guérison en 4 à 7 jours. Il n'y a en
général aucune séquelle.
 Complication : Déshydratation
[Fièvre, vomissements, diarrhée]
Rapide chez le petit enfant (< 1 an)
Nécessite une hospitalisation
Après 3 ans : formes pauci voire a-symptomatiques
D. Diagnostic des infections par les rotavirus
En général, les gastro-entérites virales ne nécessitent pas de diagnostic biologique.
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Infections par les rotavirus
Une confirmation biologique est nécessaire dans les cas suivants :
 gastro-entérite sévère du nourrisson,
 diagnostic et prévention des gastro-entérites nosocomiales dans les services
de pédiatrie.
Le but du diagnostic biologique sera de confirmer la présence de virus dans les
selles dans un temps le plus court possible afin que le diagnostic soit bénéfique
pour le patient.
1. Échantillons biologiques
Selles pour la recherche d'antigènes viraux ou plus rarement, la recherche d'ARN.
2. Diagnostic direct
Recherche d'antigènes viraux : par agglutination de particules de latex, ELISA ou
immunochromatographie.
Recherche du génome viral par RT-PCR (en pratique, cet examen est très rarement
utilisé).
3. Diagnostic indirect
Sans intérêt.
E. Traitement et prévention des infections à
rotavirus
Le traitement des gastro-entérites virales est surtout basé sur un régime
alimentaire adapté. Chez l'enfant en bas âge, la réhydratation doit être le principal
objectif du traitement.
Les vaccins anti-rotavirus commencent à être proposés aux parents... mais restent
controversés dans le milieu médical.
1. Prise en charge de l'épisode aigu chez l'enfant
Un traitements médicamenteux doit être mis en place surtout centré sur la
réhydratation :
 Réhydratation orale +++
Anti-émétiques
Antipyrétiques
Un régime alimentaire est indispensable pour résoudre l'épisode de diarrhée.
Réhydratation orale : soluté de réhydratation orale
 Adiaril, GES 45, Alhydrate, Hydrigoz ...
 Diluer 1 sachet dans 200 ml d'eau
 Proposer un biberon de 25 à 50 ml toutes les 15 minutes
 puis augmenter les quantités progressivement puis à volonté
 A l'exclusion de toute autre boisson (arrêt du lait)
 Antiémétisant
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Infections par les rotavirus
Dompéridone, Motilium solution : 1 ml/kg/j en 3 prises
Antipyrétique
Paracétamol : 60 mg/kg/j en 4 à 6 prises
 Les ralentisseurs du transit sont contre-indiqués
Régime alimentaire avant diversification (6 mois):
 Continuer allaitement au sein en plus du SRO
 Allaitement artificiel :
12 à 24h de SRO,
suivi de lait sans lactose (Diarigoz...), formule d'hydrolysat de protéines
(Alafaré)
Reprise progressive du lait habituel après 1 sem. de selles normales
Régime alimentaire après diversification (> 6 mois):
 12 à 24h de SRO,
 Suivi de lait sans lactose (Diarigoz...) pendant 24-48h,
 Réintroduire une alimentation variée en évitant les aliments riches en
graisse et en fibres, les crudités et fruits crus, les laitages, les jus de fruits,
 Favoriser aliments constipants : riz, carottes, compotes de pommes,
bananes et coings,
 Les laitages et le lait seront réintroduits au bout d'une semaine environ.
-

2. Prévention des gastro-entérites à Rotavirus
Rappel des règles d'hygiène à respecter



Lavage régulier des mains : préciser les circonstances
Nettoyage régulier des sanitaires
Mise à l'écart éventuellement des personnes fragiles (enfant < 1 an,
immunodéprimés...)
Vaccins commercialisés en France





RotaTeq (Sanofi-Pasteur MSD) : recombinant pentavalent issu de la
recombinaison d'une souche de RTV bovine et de souches de RTV humaines
(G1 à 4 et P1A[8], 3 doses
Rotarix (GSK) : monovalent, souche virale atténuée de RTV humain G2P[4],
2 doses
Administrés par voie orale
À partir de 6 semaines de vie et avant 6 mois : intervalle de 4
semaines entre chaque dose.
Aucune administration après 6 mois en raison des risques d'Invagination
intestinale aiguë observée avec un précédent vaccin...
a) Contre-indications et effets secondaires des vaccins antiRotavirus
Contre-Indications :
 Hypersensibilité aux substances actives ou à l'un des excipients,
 Hypersensibilité suite à une précédente administration de vaccin rotavirus,
 Antécédent d'invagination intestinale,
 Nourrissons ayant une malformation congénitale de l'appareil gastrointestinal pouvant prédisposer à une invagination intestinale.
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Infections par les rotavirus
Nourrissons ayant une immunodépression connue ou suspectée. Une
infection asymptomatique par le VIH ne devrait pas affecter la tolérance ou
l'efficacité de Rotateq. Cependant, en l'absence de données suffisantes,
l'administration de Rotateq à des nourrissons ayant une infection
asymptomatique par le VIH n'est pas recommandée.
 L'administration de Rotateq doit être différée chez les nourrissons ayant une
maladie fébrile sévère aiguë grave. Une infection bénigne n'est pas une
contre-indication à la vaccination.
 L'administration de Rotateq doit être différée chez les sujets présentant une
diarrhée aiguë ou des vomissements.
Effets Secondaires :
 Diarrhée, vomissements,
 Fièvre.

Attention
Ces vaccins ne sont pas recommandés par les autorités françaises.
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