Claire CHRISTOPHE – 26/12/1986 à Gourdon (Lot), 28 ans

Laboratoire de mathématique Jean Leray
2, rue de la Houssinière
BP 92208 F-44322 Nantes Cedex 3
B [email protected]
http://www.math.sciences.univ-nantes.fr/∼christophe/
Claire CHRISTOPHE
26/12/1986 à Gourdon (Lot), 28 ans
Post-Doctorante
Expériences
2016-2017 Post-doctorat, avec Anne Philipe à Nantes et Guillaume Guérin à Bordeaux, avec le
labexLaScArBx, Construction, Validation and Dissemination of Models for Bayesian
Analysis of OSL data.
Collaboration avec : l’équipe de luminescence IRAMAT-CRP2A de Bordeaux
2015-2016 Post-doctorat, avec Anne Philipe à Nantes et Philippe Lanos à Bordeaux, avec le
labexLaScArBx, Approche Bayésienne de la datation OSL, dans le cas d’échantillons
mal blanchis.
Collaboration avec : l’équipe de luminescence IRAMAT-CRP2A de Bordeaux
2014-2015 ATER (mi-temps), l’INSA de Toulouse.
Formation
2011-2014 Thèse de doctorat, spécialité Mathématiques Appliquées, Univ. Paul Sabatier
Toulouse (UPS), soutenue le 02/12/2015.
Titre :Modélisation aléatoire de l’activité des Lymphocytes T cytotoxyques.
Encadrée par Patrick Cattiaux et Sébatien Gadat à l’Institut de Mathématique de
Toulouse (IMT)
Collaboration avec : l’équipe de Salvatore Valitutti à INSERM Toulouse
2007-2011 Master 2 Recherche Mathématiques Appliquées, probabailités et statistique,
UPS.
•Mémoire : statistiques non paramétriques et modèles de déformation dans un groupe
de Lie, encadré par Jérémie Bigot et Sébastien Gadat.
•Agrégation de mathématique
•Programme Erasmus (Espagne Cadiz)
2006-2007 Licence Mathématiques Fondamentales, UPS.
Activité de Recherche
Projet COVADIM:
Le but de ce projet de recherche est de developper une librairie R qui permettra
d’appliquer les modèles bayésiens (dévelopś par l’équipe de luminescence de IRAMATCRP2A à Bordeaux) pour l’analyse des données OSL. Ces modèles permettrons de
calculer la paléodose d’échantillon bien ou mal blanchis ainsi que l’âge d’échantillons
en contraintes stratigraphiques.
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Projet MD2 :
Nous nous intéressons à la datation des sédiments par OSL pour d’échantillons mal
blanchis. Pour cela, nous souhaitons obtenir la paléodose de l’échantillon. Or dans
le cas d’échantillon mal blanchi, la dose équivalente de certains grains n?est pas
représentative de la paléodose de l’échantillon.
Nous proposons de modéliser les doses équivalentes des grains par un mélange de
lois, soit gaussiennes soit log-normales. Afin d’integrer ce models dans les modèls
développées précédemments par l’équipe, nous nous plançons dans un cadre bayésien.
Un programme R utilisant JAGS est en cours de développement
Résumé de Thèse :
Ce travail de thèse étudie des propriétés probabilistes et statistiques de la dynamique
entre des cellules immunitaires (Lymphocytes T Cytotoxiques, CTL) et un nodule
tumo- ral. Etant difficile pour les biologistes de reproduire in vitro l?interaction
CTL/nodule, nous proposons un modèle agent centré pour modéliser cette interaction.
Par des simulations numériques, deux paramètres se sont révélés importants dans
la réponse immunitaire, le déplacement des CTL, les diriger vers le nodule améliore
l?efficacité des CTL, le nombre de cellules tumorales éliminées par un seul CTL, plus
ce nombre est grand plus la réponse est efficace.
Nous proposons un système d?EDO pour en déduire le comportement d?un nodule tumoral soumis, ou non, à une immunothérapie qui consiste à attirer les CTL vers le
nodule.
Puis, nous suggérons un modèle de mélange de lois de Poisson pour décrire le nombre
de cellules cibles éliminées par un CTL.
Mots clefs
Statistiques Bayésiennes, modèles de mélange, Algorithme EM, sélection de modèle,
modèles de déformation, estimateurs minimax
Distributions quasi-stationnaires, temps d?atteintes
Modélisation mathématiques, pour la biologie et l’immunologie, pour l’archéologie et
la datation OSL
Publications/Preprints
Prépublication
2016 Christophe C., Philippe A., Guérin G., Mercier N. et Guibert P. , Bayesian
approach to OSL dating of poorly bleached sediment samples: Mixture Distribution
Models for Dose (MD2 ).
2016 Guibert P., Christophe C., Urbanova P. et Blain S., Modeling incomplete and
heterogeneous bleaching of mobile grains partially exposed to the light: towards a new
tool for single grain OSL dating of poorly bleached mortars.
2016 Guérin G., Christophe C., Philippe A., Lahaye C., Thomsen K.J., Tribolo
C., Urbanova P., Murray A.S., Jain M., Guibert P., Mercier N. et Kreutzer
S., Received dose, equivalent dose, measured dose rates, and implications for OSL age
estimates: introducing the Mean Dose Model.
2016 Cattiaux P., Christophe C. et Gadat S., A stochastic model for cytotoxic T.
Lymphocyte interaction with tumor nodules.
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Publications
2016 Mercier N., Kreutzer S., Christophe C., Guérin G., Guibert P., Lahaye C.,
Lanos P., Philippe A. et Tribolo C., Bayesian statistics in luminescence dating:
The ’baSAR’-model and its implementation in the R package ’Luminescence’, Ancient
TL.
2015 Christophe C., Rodrigues M., Muller S., Dupre L., Cattiaux P, Gadat
S. et Valitutti S., A biased competition model of dynamical cytotoxic T lymphocytes/tumor nodule interaction, Plos One, to appear.
2015 Vasconcelos Z., Müller S., Wong Y., Christophe C., Gadat S., Valitutti
S. et Dupré L., Individual human cytotoxic T Lymphocytes exhibit intraclonal
heterogeneity in cumulative killing.
2012 Bigot J. , Christophe C. , Gadat S., Random action of compact Lie groups and
minimax estimation of a mean pattern., IEEE, Transactions on Information Theory,
Vol 58, Nr 6 (2012) p.3509-3520..
Activités de communications
Conférence internationales
11/07/2016 UK luminescence and ESR dating meeting, Bayesian approach to OSL dating
of poorly bleached sediment samples.
26/05/2016 CHL Meeting: Bayesian statistics applied to archaeology, Bayesian approach
to OSL dating of poorly bleached sediment samples.
12/06/2013 Annual meeting of The Society for Mathematical Biology, A biased competition model of dynamical CTL/Tumor nodule interaction, poster, Arizona (USA).
Conférrances nationales
10/04/2014 11 ème Colloques Jeunes Probabilistes et Statisticiens, Mathematical modeling
of CTL efficacy during cancer immunoediting (20 min), Forges-les-eaux.
07/10/2013 4 ème rencontre RITC, Modélisation mathématique de l’efficacité des CTL pendant
la progression des cancers (10 min), Toulouse.
Séminaires
25/03/2016 Seminar in Bordeaux, Statistiques Bayésiennes pour la datation des sédiments par
OSL, cas des échantillons mal blanchis.
02/04/2015 Seminar in Nantes, Modélisation aléatoire de l’activité des Lymphocytes T
Cytotoxiques.
16/03/2015 Seminar in Montpellier, Modélisation aléatoire de l’activité des Lymphocytes T
Cytotoxiques.
21/01/2014 Séminaire étudiant commun Math-Info (IRIT), Mathematical modeling of CTL
efficacy during cancer immunoediting (20 min), Toulouse.
11/12/2013 Joint LabMeeting à l’INSERM, Mathematical modeling of CTL efficacy during
cancer immunoediting (30 min), Toulouse.
5/07/2013 Séminaire à l’ITAV, Modéle de compétition entre CTL et cellules tumorales (1h),
Toulouse.
10/10/2012 Journée des doctorants de l’équipe de probabailité et statistique de l’IMT,
Modéle de compétition entre CTLs et cellules tumorales (20 min), Toulouse.
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Diffusion de la culture scientifique
2015-2016 Atelier Art et Science, avec la classe de CM2 de l’école primaire de la Jonelière et
les artistes "N+1", thématiques: statistiques "faire une enquête statistiques" et notion
d’aléatoire, avec Marie-Anne Vibet et Chritèle Raberin.
12/04/2013 Exposé aux Cafés de l’IMT, Cellules immunitaires VS cellules tumorales.
2013-2014 Atelier Math En Jeans, Les chercheurs visites des collèges ou lycées pour proposer
des sujets de recherche mathèmatiques et suivre l’avancement et congrès.
2012 & 2013 2 stages Hippocampe, initiation de lycéens (3 jours) à la recherche, présentation
orale des résultats obtenus, formalisation sur poster et présentation aux chercheurs,
(Thèmes de recherche abordés : modéles de croissances, autour des graphes).
Activités d’enseignement
2014 1ère année STPI (INSA), Mathématiques (42,5h), TD, Nombres complexes,
polynômes, suites numériques réelles, limites, continuité, dérivabilité, fonctions réciproques, EDO d’ordre 1, intégration..
2014 3ème IC (INSA), probabilités et statistiques (2*12,5h), TD, TP R , Dénombrement,
conditionnement, indp?endance, variables aléatoires discrètes, variables aléatoires
continues, théorèmes limites, estimation.
2014 3ème année ICBE (INSA), description et inférence statistiques (2*10h), TP R,
Statisique descriptive, introduction aux ACP, modèles probabilistes, variables aléatoirs,
estimation, test statistiques, régression linéaire.
2014 1ère année IUT informatique, arithmétiques, graphes, langages (53h), TD, TP
Maple, Diviséion euclidienne dans Z, PGCD, PPCM, primalité, identité de Bezout,
nombre prèe- miers, congruences. Generality on graphs, trees, transitive closure on a
digraph, shortest paths. Language et automates.
2013 2ère année IUT informatique, graphes et arithmétiques (11h), TD et TP Maple.
2012 et 2013 L1 Préparation aux Concours Agronomiques et Vétérinaires (UPS) , cours
et TD d’analyse (60h), fonctions numériques de la variable réelle, intégrales généralisées,
équations différentielles linéaires, suites et séries, probabilités discrètes .
2012 Cours de soutien aux Master 1 Mathématique pour l’inégérie et
l’enseignement (UPS), aléatoire (3h).
Responsabilités collectives
2012-2013 Co-organisatrice du Séminaire Etudiant, séminaire par et pour les doctorants,
bimen- suel couvrant toutes les thématiques du l?IMT, séminaire communs avec les
doctorants en informatiques 2 fois par an..
2011& 2012 Salon info-sup, Toulouse.
Compétences
Informatiques
Outils
LATEX, Matlab, R, html,...
Langues
Anglais scientifique opérationnel
Espagnol courant
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