Intérêt du diagnostic moléculaire dans le syndrome de Gilbert
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Intérêt du diagnostic moléculaire dans le syndrome de Gilbert
Intérêt du diagnostic moléculaire dans le syndrome de Gilbert Dr François PETIT Laboratoire de génétique moléculaire Centre de référence des maladies héréditaires du métabolisme hépatique Hôpital Antoine Béclère Le syndrome de Gilbert Affection bénigne du métabolisme de la bilirubine Touche entre 3 et 10 % de la population Autosomique récessif Diagnostic moléculaire et pharmacogénétique - population Caucasienne et Africaine : variant TA7, - population Asiatique : mutation c.211G>A - mutation du PBREM : c.-3279T>G Pénétrance incomplète : ~20% de 7/7 et ~40% de 6/7 Autres gènes potentiellement impliqués : hèmeoxygénase 1, canal OATP2 => pas de preuves réelles Buts de l’étude Mise au point d’une méthode d’analyse simultanée des trois variants TAx, c.211G>A et c.-3279T>G Etude des liens génétiques entre ces anomalies de séquence Etude de la prévalence de ces anomalies en population générale et en population sélectionnée Analyse moléculaire : 2 PCR, 1 lecture Plusieurs types d’anomalies = plusieurs techniques Variant de longueur du promoteur : PCR avec amorces fluorescentes et mesure de longueur sur séquenceur Permet de mettre en évidence tous les variants décrits : TA5, TA6, TA7 et TA8 Mutations ponctuelles : Tétra-ARMS PCR fluorescente Outer F Inner F C Inner F Outer R G Allèle 2 pathologique Allèle 1 normal Allèle contrôle interne Analyse faisable en une journée Conclusion 1 Technique efficace, robuste et sensible pour déterminer les trois variants en simultané Contrôles internes inclus Coût réduit Résultats disponibles en 24h, extraction incluse Technique et analyse accréditées Cofrac en 2013 Liens génétiques entre ces anomalies 226 patients (plus de 10 ans) et 65 témoins inclus Pas de différence entre valeurs observées et valeurs attendues Très fort déséquilibre de liaison entre TAX et PBREM : variants TA5, TA7 et TA8 systématiquement associés à l’allèle G du PBREM Variant TA6/TA6 : pas de différence de répartition des groupes T/T, T/G et G/G entre patients et témoins Variant TA6/TA7 : pas de surreprésentation de G/G chez les patients par rapport aux témoins Conclusion 2 Surreprésentation des TA7/TA7 chez les patients par rapport aux témoins Démonstration in vitro de la réduction de l’expression d’UGT1A1 en présence de G/G (Li et al., 2009) mais : - pas d’association TA7/T, - pas de surreprésentation de G/G chez les patients TA6/TA6 et TA6/TA7 par rapport aux témoins Déséquilibre de liaison : variant ancestral TA6/T, apparition du variant TA6/G, modification du nombre de TA plus récente intervenue chez TA6/G ? Instabilité des configurations TA5/T, TA7/T et TA8/T ? Prévalence génétique 103 nouveau-nés caucasiens, à terme et ayant présenté une hyperbilirubinémie non-conjuguée avec des concentrations entre 85 et 727 µmol/L Étude du promoteur et du PBREM, séquençage des exons 1 à 5 du gène UGT1A1 Réduction significative des TA7/TA7 chez les nouveaunés par rapport à la population générale Témoins Patients TA6/TA6 36,9 % 65,0 % TA6/TA7 41,6 % 25,3 % TA7/TA7 21,5 % 9,7 % Conclusion 3 Cause génétique de l’hyperbilirubinémie retrouvée uniquement chez 12 patients sur 103 : 9 patients TA7/TA7, 2 patients avec deux mutations dans les séquences codantes et 1 TA7/mutation exon 2 L’étude moléculaire étendue d’UGT1A1 n’apporte pas de réponse étiologique suffisante aux hyperbilirubinémies en période néonatale Elément commun retrouvé : allaitement maternel Remerciements Laboratoire de génétique moléculaire Hôpital Antoine Béclère Dr Emilie BRISELET Liliane CAPEL Dr Aurélie HUBERT Frédéric PARISOT Centre de référence des maladies héréditaires du métabolisme hépatique Hôpital Antoine Béclère Dr Aurélie HUBERT Dr Karen MILCENT Pr Philippe LABRUNE Et le comité scientifique de la SFEIM