Bioinformaticien ou biostatisticien à valence informatique

Offre du : 11 juillet 2014
Envoyez CV & lettre de motivation à [email protected]
Tel : 01 44 73 84 39
Bioinformaticien ou biostatisticien à valence informatique
Le réseau Sentinelles est une plateforme de recherche en médecine générale coordonnée par L’Institut Pierre-Louis
d’épidémiologie et de santé publique (UMR S 1136, Inserm / UPMC). Le réseau, composé de médecins généralistes,
participe, en collaboration avec l’Institut de Veille Sanitaire, à la surveillance des maladies communautaires comme la
grippe, les gastro-entérites ou la varicelle. Il développe également l’étude GrippeNet.fr dédiée à la surveillance des
épidémies de grippe en population générale.
L’équipe développe des outils pour le recueil de données, le traitement et l’analyse et la publication des données
épidémiologiques : http://www.sentiweb.fr, https://www.grippenet.fr, http://periodic.sentiweb.fr.
LE POSTE :
Poste : Bioinformaticien ou biostatisticien à valence informatique (H/F)
Localisation : UMR S 1136, Faculté de Médecine St Antoine, 27 rue Chaligny, 75012 PARIS
Equipe : Equipe 1 / Réseau Sentinelles (~ 16 personnes)
Type de poste : Temps plein, CDD de 3 mois, renouvelable pour une durée de 3 ans
Rémunération : 1650-2200€ net/mois selon diplôme et expérience (grille UPMC)
Date de prise de fonction : 1er octobre 2014
Le bioinformaticien/biostatisticien fera partie du pôle Système d’Information et Biostatistiques de l’équipe
pluridisciplinaire du réseau Sentinelles. Ses missions principales seront de participer au développement des applications
web et des outils d’analyse et de visualisation des données collectées par les systèmes de surveillance de l’équipe
(Sentiweb, GrippeNet.fr). Il participera également aux projets de recherche en bioinformatique et biostatistique de
l’équipe.
ACTIVITES PRINCIPALES :
o Développement des applications informatiques de l’équipe Sentinelles (php5/MySQL, python/pgSQL)
o Contribution à l’analyse de données de surveillance épidémiologique et à leur interprétation
o Participation à des projets de recherche en épidémiologie (analyses statistiques d’études ponctuelles,
développement de nouvelles méthodes, évaluation d’approches innovantes, …)
ACTIVITES COMPLEMENTAIRES :
 Contribuer à la gestion des serveurs web et bases de données.
 Valorisation des résultats (publication scientifique, posters,…)
PROFIL RECHERCHE
Diplôme : Bac + 5, Master en bioinformatique ou biostatistique, école d’ingénieur ou équivalent.
Compétences nécessaires
Informatiques
 Développement php5 et technologies web (html5,
CSS/JS/jQuery)
 Connaissance des bases de données (MySQL++/pgSQL)
Statistiques :
 Connaissance du logiciel R
 Connaissances en statistiques
o Descriptives
o Régression logistiques/linéaires
Générales
 Aptitude à travailler en équipe pluridisciplinaire
 Rigueur et méthode
 Intérêt pour la recherche et/ou l’épidémiologie
 Curiosité scientifique
 Esprit d’initiative
Compétences utiles / bienvenues (formations internes
possibles)
Informatiques :
 Utilisation d’un gestionnaire de version (svn, git)
 Connaissance du framework Symfony2
 Autres langages (python, java, C)
 Administration des serveurs linux
Statistiques / Analyse de données :
 Méthodes en épidémiologie (design d’étude,
sondages,…)
 Visualisation de données