FINANCEMENT Demandé Acquis Fiche Résumé du sujet de thèse
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FINANCEMENT Demandé Acquis Fiche Résumé du sujet de thèse
Profil N° (à remplir par VAS) FINANCEMENT Demandé Fiche Résumé du sujet de thèse 2013 Acquis Non Champs disciplinaire Santé et biologie fondamentale Titre de la thèse : (1-2 lignes) Analyse fonctionnelle de gènes impliqués dans le développement de la lignée germinale de souris mâle. 3 mots-clés : (1 ligne) Signalisation / Spermatogenèse / Fertilité Unité/équipe encadrante : (1-2 lignes) Inserm U1085 IRSET, Réseaux transcriptionnels en gamétogenèse et cancer Nom du responsable scientifique et codirecteur : (1 ligne) Soazik Jamin, CR1 Inserm Contact : (1 ligne) Soazik Jamin, IRSET, Campus de Beaulieu, [email protected], tél: 02 23 23 33 82 Contexte socioéconomique et scientifique : (10 lignes) L’infertilité est devenue un problème majeur de santé publique. Certains cas d’infertilité mâle non expliqués peuvent être liés à des mutations dans des gènes essentiels à la spermatogenèse. Plusieurs centaines de gènes sont connus pour leur importance dans la méiose mâle et la gamétogenèse dans des organismes modèles mais peu ont été associés à l’infertilité mâle chez l’Homme. La spermatogenèse est un processus complexe qui implique des mécanismes de signalisation, de mort cellulaire programmée et de modifications chromatiniennes. L’ensemble des étapes doit être parfaitement contrôlé pour permettre une différenciation de la spermatogonie souche en spermatozoïde fonctionnel. Ce processus qui comprend de nombreuses étapes n’est pas encore totalement caractérisé au niveau génique. Sujet Les hypothèses et questions posées (8 lignes) Nous avons précédemment réalisé l’analyse globale du programme codant d’expression testiculaire des rongeurs et de l’homme en utilisant des puces à ADN. Par ailleurs, les données sur la levure et les modèles murins permettent d’émettre l’hypothèse que les gènes spécifiques du testicule doivent coder pour des fonctions importantes contribuant à la méiose mâle, la gamétogenèse et la fécondation. Pour tester cette idée nous cherchons à identifier des gènes conservés chez la souris et l’homme et dont le transcrit et la protéine sont exclusivement localisés dans la lignée germinale. Nous proposons d’étudier leur fonction au cours de la spermatogenèse et de la fécondation chez la souris. Ces gènes essentiels à des processus majeurs de la spermatogenèse sont de bons candidats pour expliquer certains cas idiopathique d’infertilité mâle. Les grandes étapes de la thèse et démarche (10-12 lignes) Le projet de thèse comprend trois étapes. 1) Validation et confirmation de données d’expression géniques obtenues chez l’homme et la souris. Ces validations au niveau protéique se feront sur coupes testiculaires de souris et conforteront les données disponibles chez l’homme sur Human Protein Atlas. 2) Caractérisation fonctionnelle par diminution de l’expression in vivo et surexpression dans des lignées cellulaires (ex :Hela). Les gènes candidats démontrant un profil spécifique de la lignée germinale seront invalidés localement par injection de petits ARN interférents dans le rete testis. En parallèle, ces candidats seront surexprimés dans des lignées cellulaires afin d’analyser si ces gènes spécifiques de la méiose sont incompatibles avec la croissance cellulaire mitotique normale ainsi que la division. L’ensemble de ces étapes devrait être réalisable au cours de la première année. 3) Génération de modèles murins d’invalidation génique (totale et/ou conditionnelle) et analyse du phénotype des souris. L’étape de génération des modèles de souris sera réalisée en collaboration avec le consortium KOMP (UC Davis, CA, USA) et l’ICS (Institut Clinique de la Souris, Strasbourg, France). Cette troisième phase se fera au cours des deuxième et troisième années. Les gènes candidats sélectionnés sont Pnma5 (apoptose), Hmgb4 (formation de la chromatine), Fam71b (épissage des ARN) et Stk31 (signalisation). Approches méthodologiques et techniques envisagées (4-6 lignes) L’immunohistochimie permettra de confirmer l’expression protéique chez la souris. L’injection de petits ARN interférents (dirigés contre les gènes candidats) dans le rete testis sera suivie d’analyses morphologiques et immunohistochimiques sur des sections testiculaires. Des expériences de surexpression seront également réalisées par transfection des ADNc codant pour les gènes d’intérêt dans des lignées cellulaires. Elles seront suivies par des analyses de la croissance et de la réplication d’ADN permettant d’évaluer l’effet sur la mitose. Enfin, des modèles murins d’invalidation génique (totale et/ou conditionnelle) seront générés et analysés. Différents tests de fertilité seront réalisés pour la caratérisation complète du phénotype. Compétences scientifiques et techniques requises par le candidat (2 lignes) Ce projet requiert des connaissances théoriques et pratiques en biologie moléculaire et cellulaire et en physiologie ainsi qu’un intérêt particulier pour la spermatogenèse et l’infertilité mâle.