Jonathan BISSON – Docteur en Science, Technologie et

Jonathan BISSON
Docteur en Science, Technologie et Santé
Interface Chimie et Biologie
Développement de méthodes, logiciels et bases de données pour la
recherche en substances naturelles
Parcours académique
2009–2012 Doctorat, Université de Bordeaux, Très Honorable, Félicitations orales.
Jury : Dr. Françoise Guéritte, Pr. Alain Berthod, Pr. Marcel Hibert, Pr. Philippe Jeandet, Patrice
André
Directeur de thèse : Dr. Pierre Waffo-Téguo
2004–2009 Master, Université de Bordeaux, Bien, 1er.
Interface Chimie-Biologie-Physique
2003–2004 Brevet de Technicien Supérieur, Lycée Gustave Eiffel, Bordeaux, Bien.
Électrotechnique : automatismes, électronique, électricité
Expérience en recherche
Post-doctorat
Octobre 2013 -
Développement d’outils pour la RMN, la chromatographie et les bases de données en substances naturelles., Pr. Guido F. Pauli team.
Department of Medicinal Chemistry and Pharmacognosy - University of Illinois at Chicago (USA)
RMN Spin complet Simulation, Prédiction,
CPC/CCC Méthodes et développements, étude
Calcul
de systèmes de solvants
Développement analyse de résultats CD et RMN,
logiciel bases de données
Janvier 2013 - Développement de stratégies de purification et d’analyse appliquées à l’œnoloSeptembre 2013 gie, Équipe du Pr. Philippe Darriet.
USC Œnologie - Institut des Sciences de la Vigne et du Vin, Villenave d’Ornon, France
Couplage CPC avec Spectrométrie de Masse HR
Élucidation RMN, Spectrométrie de Masse
structurale
Systèmes de Développement, sélection
solvants
Œnologie Recherche de composés responsables
de différents goûts (sucré,amer-. . . )
Doctorat
2009–2012 Développements méthodologiques en Chromatographie de Partage Centrifuge :
Application aux stilbénoïdes., Équipe du Pr. Jean-Michel Mérillon.
Groupe d’Étude des Substances Végétales à Activité Biologique - Institut des Sciences de la Vigne et
du Vin, Villenave d’Ornon, France
Couplage CPC avec Spectrométrie de Masse et RMN
Élucidation RMN, Spectrométrie de Masse
structurale
Systèmes de
solvants
Essais
biologiques
Développement, sélection, et modélisation
Antioxydant, neuroprotection, chélation du fer
Développement Rétro-ingénierie,
automatisation
d’analyse,
bases
de
données
logiciel
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Stages
2009 Master 2, Phytochimie, Institut de Chimie des Substances Naturelles (CNRS), Gif-surYvette, France, Équipe du Dr. Françoise Guéritte, Pôle Substances Naturelles Plantes Maître
de stage : Vincent Dumontet Isolation d’actifs anti-tumoraux et inhibiteurs d’AChE à partir
d’un arbre Vietnamien.
Fractionnement, Purification, Élucidation structurale, Essais biologiques robotisés..
2008 Master 1 Research Training, Spectrométrie de Masse, Institut Européen de Chimie
et de Biologie, Bordeaux, France, Maître de stage : Jean-Marie Schmitter.
Détermination du taux et de la position de greffons synthétiques sur une protéine par MALDI-TOF,
clivage enzymatique et développement logiciel.
2007 Licence 3, Chimie des polymères à visée thérapeutique et esthétique, ProCyTech,
Martillac, France
Développement de gels de polyacrylamide résorbables au travers de nouveaux agents réticulants. Gestion de Projet, étude de faisabilité, participation au dépôt d’un brevet..
Expérience en entreprise
2008 Technicien de laboratoire et gestion de parc informatique
BlackStone Marketing Services, Martillac, France
Maintenance et réparation d’équipements de laboratoire, gestion du réseau (VPN)
2007 Technicien de laboratoire
ProCyTech, Martillac, France
Étude technique sur un gel de polyacrylamide résorbable et formulation de dispositifs
médicaux injectables
Expérience d’enseignement
Encadrement de stagiaires
2009–2012 Phytochimie, de la plante à la molécule
Master 2 Phytochimie (Corse), 6 mois
Master 1 2 stagiaires Nutrition Humaine et
Santé, 1 mois
2 stagiaires Biotechnologie
Plantes, 1 mois
des
Moniteur Travaux Pratiques
2012 Pharmacognosie
« Extraction de principes actifs à partir de plantes », Travaux Pratiques, 64 heures.
Pharmacie 2ème et 3ème année.
Cours
2012 Création et réalisation
« Métabolites d’intérêt industriel : des Substances Naturelles à l’homme ». Activités collectives
et participatives. 6 heures.
Autres
2005– Formateur logiciels libres (Zotero, GNU/Linux, Inkscape. . . )
Expériences d’organisation d’évènements
Organisation de congrès et conférences
2011 SEP 2001 (International), Organisateur, Association Francophone des techniques Séparatives
2010–2012 Journée annuelle des doctorants EDSVS Bordeaux Segalen (Local), Organisateur
2011 Université d’été CJC (National), Organisateur
2010 Forum AquiDoc (Régional), Organisateur
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Compétences
Chromatographie
Solide CCM, CLHP analytique et préparative, colonnes ouvertes, flash
Liquide CPC (systèmes Kromaton/Rousselet Robatel et Armen instruments)
développement de méthodes, systèmes de solvants
Générale Réalisation de couplages, CPC-Masse, CPC-RMN, SPE automatisée (Spark Prospekt)
Spectroscopie et méthodes analytiques
RMN Brüker, acquisition, optimisation de séquences (Ultra-Fast NMR), analyse spin complet
(PERCH), élucidation structurale, LC-RMN, LC-SPE-RMN, développement et optimisation
de couplages
Masse Brüker (ESI-IT, MALDI), Thermo (Exactive OrbiTrap), acquisition, développement de
méthodes, maintenance et dépannage, couplages
Optique Polarimétrie, UV-Visible, Infrarouge et Dichroïsme Circulaire
Essais biologiques
Biological Assays
Cibles Inhibition AChE, chélation du fer, aggrégation beta-amyloïde, anti-oxydant
Automatisation Robot BioMek
Général Développement et validation
Informatique
Programmation Python, C, C++, Scilab, R, Ruby
Web HTML 5, CSS, PHP, JavaScript,
Ruby on Rails, Wt
Publication LATEX, Inkscape, Scribus, OpenOffice/LibreOffice, Microsoft Office
Bibliographie Zotero, SciFinder, BibTex, divers outils en ligne
Systèmes GNU/Linux (15 ans d’expérience),
d’exploitation BSD, Microsoft, Apple
Gestion de SQL, OrgMode, XML
données
Maintenance et réparation
Logiciel, Matériel, Réseaux, Équipements de laboratoire
Électronique
Microcontrolleur Atmel AVR, TI MSP430
Conception et Analogique et numérique, analyse des
Adaptation signaux, automatisme
Rétro-ingénierie
Logiciel Décompilation, debug binaires
Matériel Protocoles de communication, mécanique
Audio-visuel
Audio et Création, Adaptation, Montage
Musique
Graphisme et 2D vectoriel et matriciel
Vidéo 3D Statique et Animé
Montage vidéo
Langues
Français Natif
Anglais Bon niveau, Oral et écrit
Distinctions
2012 Bourse Lapervenchelif pour ICNPR 2012 - 1000 e
2009 Financement Ministère pour 3 ans de doctorat - classé 10/150
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Publications dans des journaux internationaux à comité de
lecture
RMN : Analyse spin complète
• Guido F. Pauli, Shao-Nong Chen, David C. Lankin, Jonathan Bisson, Ryan J. Case, Lucas R. Chadwick,
Tanja Gödecke, Taichi Inui, Aleksej Krunic, Birgit U. Jaki, James B. McAlpine, Shunyan Mo, José G. Napolitano,
Jimmy Orjala, Juuso Lehtivarjo, Samuli-Petrus Korhonen, and Matthias Niemitz
Essential Parameters for Structural Analysis and Dereplication by 1H NMR Spectroscopy.
Journal of Natural Products 77(6), (2014) : 1473-1487.
doi :10.1021/np5002384
Phytochimie
• Christina M. P. Vidal, Ariene A. Leme, Thaiane R. Aguiar, Rasika Phansalkar, Joo-Won Nam, Jonathan
Bisson, James B. McAlpine, Shao-Nong Chen, Guido F. Pauli, and Ana Bedran-Russo
Mimicking the Hierarchical Functions of Dentin Collagen Cross-Links with Plant Derived Phenols and Phenolic
Acids
Langmuir ASAP, (2014)
doi : 10.1021/la5034383
• Thierry Buffeteau, Dominique Cavagnat, Jonathan Bisson, Axel Marchal, Gilbert D. Kapche, Ilaria Battistini,
Gregory Da Costa, Alain Badoc, Jean-Pierre Monti, Jean-Michel Mérillon, and Pierre Waffo-Téguo
Unambiguous Determination of the Absolute Configuration of Dimeric Stilbene Glucosides from the Rhizomes of
Gnetum africanum
Journal of Natural Products 77(8), (2014) : 1981-1985.
doi : 10.1021/np500427v
• Carole Lambert, Jonathan Bisson, Pierre Waffo-Téguo, Yorgos Papastamoulis, Tristan Richard, Marie-France
Corio-Costet, Jean-Michel Mérillon, and Stéphanie Cluzet.
Phenolics and their antifungal role in grapevine wood decay : focus on the botryosphaeriaceae family.
Journal of Agricultural and Food Chemistry 60(48) (2012) : 11859–11868.
doi :10.1021/jf303290g.
• Carole Lambert, Tristan Richard, Elodie Renouf, Jonathan Bisson, Pierre Waffo-Téguo, Louis Bordenave,
Nathalie Ollat, Jean-Michel Mérillon, and Stéphanie Cluzet
Comparative Analyses of Stilbenoids in Canes of Major Vitis vinifera L. Cultivars
Journal of Agricultural and Food Chemistry 61(47) (2013) : 11392-11399
• Merian Nassra, Stéphanie Krisa, Yorgos Papastamoulis, Gilbert Deccaux Kapche, Jonathan Bisson, Caroline
André, Jan-Pieter Konsman, Jean-Marie Schmitter, Jean-Michel Mérillon, and Pierre Waffo-Téguo
Inhibitory Activity of Plant Stilbenoids against Nitric Oxide Production by Lipopolysaccharide-Activated Microglia
Planta Medica : 79(11), (2013) : 966-970
doi : 10.1055/s-0032-1328651
• Yorgos Papastamoulis, Jonathan Bisson, Hamza Temsamani, Tristan Richard, Axel Marchal, Jean-Michel
Mérillon, and Pierre Waffo-Téguo
New E-miyabenol isomer isolated from grapevine cane using centrifugal partition chromatography guided by mass
spectrometry
Tetrahedron : In press, (2014)
doi : 10.1016/j.tet.2014.08.029
Spectrometrie de masse
• Kamel Arraki, Tristan Richard, Alain Badoc, Eric Pédrot, Jonathan Bisson, Pierre Waffo-Téguo, Ahmed
Mahjoub, Jean-Michel Mérillon, and Alain Decendit
Isolation, Characterization and Quantification of Stilbenes from Some Carex Species
Records of Natural Products 7(4) Acgpubs (http ://www.acgpubs.org/RNP/2013/Volume7/Issue%201/43RNP-1212-216.pdf)
• Alison D Pawlus, Emma Cantos-Villar, Tristan Richard, Jonathan Bisson, Pascal Poupard, Yorgos Papastamoulis, Jean-Pierre Monti, Pierre-Louis Teissedre, Pierre Waffo-Téguo, and Jean-Michel Mérillon.
Chemical dereplication of wine stilbenoids using high performance liquid chromatography-nuclear magnetic
resonance spectroscopy.
Journal of Chromatography A 1289, (2013) : 19-26.
doi :10.1016/j.chroma.2013.03.010
12 Impasse du Général de Gaulle – 33740 Arès - France
H +33 (0) 681 390 292 • B [email protected]
• Alison D Pawlus, Ramla Sahli, Jonathan Bisson, Céline Rivière, Jean-Claude Delaunay, Tristan Richard, Eric
Gomès, Louis Bordenave, Pierre Waffo-Téguo, and Jean-Michel Mérillon. Stilbenoid profiles of canes from Vitis
and Muscadinia species.
Journal of Agricultural and Food Chemistry Biology (2012).
doi :10.1021/jf303843z.
CCC/CPC
• Jonathan Bisson, Pascal Poupard, Alison D Pawlus, Alexandre Pons, Philippe Darriet, Jean-Michel Mérillon,
and Pierre Waffo-Téguo.
Development of hybrid elution systems for efficient purification of stilbenoids using centrifugal partition chromatography coupled to mass spectrometry.
Journal of Chromatography A 1218(36) (2011) : 6079–6084.
doi :10.1016/j.chroma.2011.03.020.
• Davide Slaghenaufi, Stéphanie Marchand-Marion, Tristan Richard, Pierre Waffo-Téguo, Jonathan Bisson,
Jean-Pierre Monti, Jean Michel-Mérillon, and Gilles de Revel.
Centrifugal partition chromatography applied to the isolation of oak wood aroma precursors.
Food Chemistry (2013).
doi :10.1016/j.foodchem.2013.04.069
Journaux associatifs
• Jonathan Bisson, Pierre Waffo-Téguo, and Jean-Michel Mérillon.
Les techniques analytiques dans l’étude de la vigne et du vin : le cas des stilbénoïdes. (Analytical techniques in
the study of vine and wine : the stilbenoid case)
CJ’ Mag, AFSEP, 2, 18-23, 2010
Présentations orales
• Reverse-engineering des équipements et formats de fichiers dans la recherche.
THSF 2013, Toulouse, France, 26 Mai 2013
• Hyphenating Countercurrent Chromatography with NMR and Mass Spectrometry. How to enhance the range of
the liquid phases.
ICNPR 2012, New York, USA, 31 Juillet 2012
• Couplages de la Chromatographie de Partage Centrifuge avec des techniques analytiques dans la recherche de
stilbénoïdes à activités biologiques.
Société de Pharmacie de Bordeaux, Bordeaux, France, 5 Avril 2012
• Phytochimie de la vigne et du vin : Apport des techniques couplées, CPC-MS et CLHP-RMN
Rencontre des jeunes chercheurs, AFSEP, Paris, France, 14 Octobre 2010
• Phytochimie des stilbénoïdes de la vigne et du vin : Développement de méthodes innovantes pour l’obtention de
nouveaux composés
Rencontres annuelles ISVV, Bordeaux, France, 1-2 Juillet 2010
Posters
• Jonathan Bisson, Jean-Michel Mérillon, and Pierre Waffo-Téguo.
Development of a new CPC elution mode "back-step" using hyphenation with mass-spectrometry in the purification
of stilbenoids from Vine.
SEP 2011, Toulouse, France, 23-25 Mars 2011
• Jonathan Bisson, Pascal Poupard, Alexandre Pons, Jean-Michel Mérillon, and Pierre Waffo-Téguo.
Development of a gradient elution system for efficient purification of Stilbenoids using centrifugal partition
chromatography coupled to mass spectrometry
CCC2010, Lyon, France, 28-30 Juillet 2010
Sociétés savantes
2013 Association Francophone pour l’Enseignement et la Recherche en Pharmacognosie (AFERP)
2010-2012 Association Francophone des Techniques Séparatives (AFSEP)
2008-2013 Société Française d’Ethnopharmacologie (SFE)
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Formations professionnelles
2011 Formation en Ethnopharmacologie
Société Française d’Ethnopharmacologie, 5-10 Septembre, Metz, France
Anthropologie, ethnobotanique, stratégies de travail, phytothérapie, chamanisme
2009–2012 Formations universitaires
Prendre la parole en anglais, Communiquer et écrire la science, Communication interpersonnelle et sociale, Histoire des sciences
Activités associatives
2014– Membre, Laboratoire ouvert et collaboratif (HackerSpace), Pumping Station One, Chicago
2011–2013 Membre, Laboratoire ouvert et collaboratif (HackerSpace), LaBx, Bordeaux
2005– Membre, TROLL, Théâtre et Jardin
Écriture, jeu et direction collective de pièces de théâtres et de spectacles
Jardinage et production en permaculture, recherche et distribution/vente
Montage Audio et Vidéo
2011–2012 Président, Association des doctorants et docteurs en biologie de Bordeaux, 2D2B Université
de Bordeaux
2010–2012 Membre du bureau et Webmaster, Association francophone des techniques séparatives
- Club Jeunes
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