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Institut Pasteur d’Algérie
RAPPORT D’ACTIVITE
2008
Route du Petit Staouèli, Dely Ibrahim - Alger
Tel : 213 (0) 21 37 26 74 – Fax : 213 (0) 21 36 17 48
Site web : http://www.pasteur.dz
2
Sommaire
Rapport d’Activité 2008
Sommaire
PRESENTATION DU PERSONNEL
7
ACTIVITE DES LABORATOIRES DE RECHERCHE / DIAGNOSTIC
♦
Bactériologie médicale, antibiothérapie et hygiène hospitalière
19
♦
Immunologie
31
♦
Tuberculose et mycobactéries
55
♦
Anaérobies
65
♦
Biologie parasitaire
73
♦
Bio-Pathologie
83
♦
Eco-épidémiologie et génétique des populations
91
♦
Entérobactéries-vibrions
105
♦
Entérovirus
113
♦
Génétique
117
♦
Helicobacter Pylori
119
♦
Listeria
123
♦
Microbiologie vétérinaire et Epizootiologie
125
♦
Mycologie
135
♦
Recherche et développement sur les venins
141
♦
VIH et rétrovirus
149
♦
Virologie humaine
♦

Grippe
153

Hépatites
157
Virus et cancers
163
ACTIVITE DES LABORATOIRES DE CONTROLE DE QUALITE
♦
Contrôle de la qualité bactériologique des aliments
177
♦
Contrôle de la qualité bactériologique des eaux
181
♦
Contrôle de la qualité des vaccins et sérums
185
Sommaire
3
ACTIVITE DES LABORATOIRES DE PRODUCTION
♦
Animaux de laboratoire et de production
209
♦
Milieux de culture
211
♦
Mise en forme pharmaceutique
219
♦
Sérums thérapeutiques
225
♦
Vaccins bactériens
229
♦
Vaccins et sérums antirabiques
239
♦
Vaccins viraux vétérinaires
243
ACTIVITE DE L’UNITE D’EPIDEMIOLOGIE ET DES CENTRES
MEDICAUX
♦
Unité d’épidémiologie, d’intervention et vaccinovigilance
247
♦
Centre des prélèvements
251
♦
Centre des vaccinations
257
ACTIVITE DES ANTENNES REGIONALES
♦
Antenne de Constantine
265
♦
Antenne de M’sila
269
♦
Antenne d’Oran
275
ACTIVITE DU SERVICE DE LA FORMATION
4
281
ACTIVITE DE LA BIBLIOTHEQUE
297
ABREVIATIONS
301
Sommaire
Présentation du Personnel
6
DIRECTIONS ET SERVICES TECHNICO-ADMINISTRATIFS
DIRECTION GENERALE
Directeur général:
El Hadj Ahmed LEBRES (Doctorat en Microbiologie)
Directeur Général Adjoint :
Abdeslem KHAN
Conseiller du Directeur Général : Djamel GHETARNI
Secrétaires de direction
: H. GUERBICHE
: B. TAHRAOUI
Chargé de missions
: M. BARKAT
(Ingénieur d’état en Electrotechnique)
(Professeur en Biologie)
DIRECTION DES FINANCES ET DE LA COMPTABILITE
Directeur
Encadrement
Personnel de soutien
: D. MAZOUNI
: 15
: 18
DIRECTION COMMERCIALE
Directeur
Encadrement
: N. GHERAIEB
: 08
: 14
DIRECTION TECHNIQUE
Directeur
Encadrement
: B. MAKHLOUF
: 01
DIRECTION DES RESSOURCES HUMAINES
Directeur
Encadrement
: M.S. BOUAÏCHI
: 09
: 07
DIRECTION DES APPROVISIONNEMENTS
Directeur
Encadrement
: S.K. LALIOUI
: 04
: 20
DIRECTION DE LA MAINTENANCE TECHNIQUE ET DE L’ENTRETIEN
Directeur
Encadrement
Personnel de maîtrise
Personnel d’exécution
: H. BENDALI-BRAHAM
: 11
: 39
: 62
7
SERVICE INFORMATIQUE
Responsable
: Y. KEMARI
: 03
SERVICE DES MARCHES
Responsable
: L. BENSAADA
: 01
SERVICE DE SECURITE PREVENTIVE
Responsable
Encadrement
Personnel de maîtrise
Personnel de sécurité
8
: A. GUIR
: 05
: 14
: 65
SERVICES ET LABORATOIRES DE DIAGNOSTIC ET DE RECHERCHE
1. Service de Bactériologie médicale, antibiothérapie et hygiène hospitalière
Chef de service
: K. RAHAL
(D.M. / Prof. INESSM)
Assistants
: N. TAHRAT
: B. GUETTOU
: O. LAFER
: S. LAZIZI
: N. ZOURDANI
: R. OURAGHI
: N. REZAOUI
: R. LALIAM
: D. GUESSOUM
(Ing. d’Etat en Génie Biologie)
(Ing. d’Etat en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Technicien sup. de labo.
Technicien en informatique
Technicien de labo
Secrétaire médicale
: 04
: 01
: 01
: 03
: 02
2. Service d’Immunologie
Chef de service
: M.C. ABBADI
(Ph. / Prof. INESSM)
Assistants
: N. ATTAL
: K. DJENOUHAT
: H. AÏT-BELKACEM
: K. BELANTEUR
: N. KECHOUT
: N. HADJ BEKKOUCHE
: S.S. SALAH
: R. RAACHE
: N. KACI
: A. HANNICHE
: K.D. BERRIMI
: S. AIT-SAID
: S. KEBBAB
: F. BOUSSA
: N. BOUDABA
: S. MARIR
(Ph. / M.A. INESSM)
(D.M. / M.A. INESSM)
(D.M. spécialiste)
(D.M. / spécialiste)
(D.M. / spécialiste)
(Ph. spécialiste)
(Biologiste spécialiste)
(Ing. En Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Sup. de labo
Tech. de labo.
Administrateur
: 03
: 01
: 01
: 01
: 04
3. Service de la Tuberculose et des Mycobactéries
Chef de laboratoire
Assistants
: F. BOULAHBAL
: D. YALA
: A. DJOUAHRA
: M. IFTICENE
Tech. Sup. de labo
Administrateur
: 09
: 01
: 01
: 05
(D.M. / Prof./ INESSM)
(D.M / Docent/ INESSM)
(D.M / M.A INESSM)
(D.M. spécialiste)
9
4. Laboratoire des Anaérobies et Botulisme
Chef de laboratoire
: A.S. MERAD
(Ph. / M.A. INESSM)
Assistantes
: N. FERRAD
: I. BETATECHE
: H. ROBAINE
: L. HAREB
(D.M. microbiologiste)
(D.V.)
(D.V.)
Tech. Sup. de labo
: 04
: 01
: 02
5. Laboratoire de Biologie Parasitaire
Chef du laboratoire
: F. BACHI
(D.M. Docent INESSM)
Assistantes
: N. ZENAÏDI
: E. GOURBDJI
: L. LAZIZI
: A. BENZITOUNI
: L. TAOURIRT
(D.M spécialiste)
(Ph. spécialiste)
(Ing. En Biologie)
(Ing. En Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Sup. de labo.
Tech. de labo.
: 07
: 01
: 01
: 05
6. Laboratoire de Bio-Pathologie
Chef de laboratoire
: A. BOUHADEF
Tech. Sup. de labo.
: 02
: 01
(Professeur, CA)
7. Laboratoire d’Eco-épidémiologie parasitaire et génétique des populations
Chef de laboratoire
: Z. HARRAT
(D.M. Maître de recherche)
Assistants
: I. KHARACHI
: S. BENIKHLEF
: S.C. BOUBIDI
: I. BITAM
: N. EDDAIKRA
: R. BENCHERIFA
: R. GARNI
: S. BENBETKA
(Ing. en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. sup. de labo
: 02
: 01
8. Laboratoire des Entérobactéries-Vibrions
Chef de laboratoire
: F. MOUFFOK
(Ph. / M.A. INESSM)
Assistants
: C. BELKADER
(DES en Biologie)
Tech. sup. de labo
: 03
: 01
: 02
10 Présentation du Personnel
9. Laboratoire des Entérovirus
Chef de laboratoire
: M. SEGHIER
(D.M. /M.A. INESSM)
Assistante
: D.L. BOULAHBAL
(D.V.)
Tech. Sup. de labo.
: 03
: 02
10. Laboratoire de Génétique (voir le laboratoire de biologie parasitaire)
Chef de laboratoire
: N. SERIDI
Assistants
: A. AIT AISSA
: K. BENALLAL
: L. BOUIBA
: N. KARA
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
11. Laboratoire de Génétique constitutionnelle et d’onco-génétique
Chef de laboratoire
: H. KESRI
(D.M./M.A.)
Assistantes
: N. BENFARES
: N. SOUAI
(Ing. en Biologie)
(DES en Biologie)
12. Laboratoire Helicobacter pylori
Chef de laboratoire
: F. MOUFFOK
(Ph. / M.A. INESSM)
Assistant
Tech. Sup. de labo.
: F. KIAS
: 01
(Ing. en Bactériologie)
Chef de laboratoire
: E.H. LEBRES
(Directeur de recherche)
Tech.Sup.de labo.
: 01
13. Laboratoire des Listéria
14. Laboratoire de Microbiologie vétérinaire et épizootiologie
: N. TOUARIGT
(D.V.spécialiste) jusqu’au 1er août
2008
(D.V.) à partir du 1er août 2008
Assistants
: E. ABDELATIF
: A. ABOUN
: M. MADANI
: R.N. BENELMOUFFOK
: A. AMARA-KORBA
(D.V)
(D.V)
(D.V)
(D.V)
Tech. sup. de labo.
: 05
: 03
Chef de laboratoire
: A. TARIL
15. Laboratoire de Mycologie
Chef de laboratoire
: D. KELLOU
(Ph. M.A. INESSM)
Assistants
: Z. HAMROUNE
: A.B. BENELMOUFFOK
Secrétaire
: 01
: 01
11
16. Laboratoire de Recherche sur les Venins
Chef de laboratoire
: F. LARABA-DJEBARI
(Prof./ USTHB/ CA)
Assistante
: D. HAMOUDI-TRIKI
: O. SADEDDINE
(Biologiste spécialiste/CA)
(Ing. en Biologie)
: 01
17. Laboratoire VIH et rétrovirus
Chef de laboratoire
Tech. Sup. de labo.
: S. BOUZEGHOUB
: 02
: 01
(D.M./ M.A./INESM)
18. Laboratoire de Virologie humaine
Chef de laboratoire
: F. DERRAR
(D.M. spécialiste)
Assistantes
: A. BENSALEM
: F. IGUER
: S. BOUDJADJA
: K.L. IZRI
: N. TERFANI
(D.M./ M.A./ INESSM)
(Ing. En Biologie)
(Ing. En Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Sup. de labo.
Tech. de labo.
: 09
: 03
: 01
: 01
19. Laboratoire des virus et cancers
Chef de laboratoire
: A. BOUGUERMOUH
(D.M. /Prof.)
Assistants
: H. MELOULI
: N. SADOUKI
: S. DAHMANI
: F. TAIBI
Tech. Sup. de labo.
: 02
LABORATOIRES DE CONTROLE DE LA QUALITE
1. Laboratoire de contrôle de la qualité bactériologique des aliments
Chefs de service
: F. MOUFFOK
(Ph. / M.A. INESSM)
Assistants
: E.H.A. LEBRES
: H. AL AMIR
: A.A. BENABBOU
(Maitre de recherche)
(Magister en agronomie)
(Ing. d’état chimie industrielle)
Tech. Sup. de labo
Tech. de labo.
: 07
: 02
: 01
: 03
2. Laboratoire de contrôle de la qualité bactériologique des eaux
Chefs de service
: F. MOUFFOK
(Ph. / M.A. INESSM)
Assistants
: A. BENABOU
: Y. HAFFERSSAS
(Ing. en chimie)
(Ing. en microbiologie)
Tech. sup. de labo.
: 02
3. Laboratoire de Contrôle de qualité des vaccins et sérums
Chef de laboratoire
: N. TOUABTI
(Ph. D. en chimie)
Assistants
: S. KEZZAL
: M. ALOUACHE
: L.N. DAÏD
: A. DJOUABRI
: A. MOKRANI
: L. AÏT-SAÏD
: K. TAHAR-DJEBBAR
: M. HAMLAT
: S. BOUMENDIL
: N. SEGHOUANI
: A. ZAIDI
(Pharmacien)
(D.V)
(Ing. d’état en biologie)
(Ing. en chimie)
(Ing. d’état en génie - chimique)
(Ing. d’état en génie - biologique)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Sup. de labo.
: 05
: 02
: 03
LABORATOIRES DE PRODUCTION
1. Laboratoire des Animaux de laboratoire et de production
Chef de laboratoire
: N. TOUARIGHT
: M. ISSAD
: 06
(D.V.) jusqu’au 31 juillet 2008
2. Laboratoire des milieux de culture
Chef de laboratoire
: M. BENABDELKADER
Assistants
: F.Z. HAMADOUCHE
: N. MADANI
: S. BELLACHE
: S. KEBILENE
: K. MESBAH
: L. TSABIT
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. sup de labo
Tech. de labo.
: 04
: 01
: 05
: 32
13
3. Laboratoire de mise en forme pharmaceutique
Chef de laboratoire
: F.Z. BEGHDADI-GHANASSI (Ph. / Docent INESSM)
Assistants
: K. GUERBICHE
: S. BELHAMISSI
; M. BOUCHENE
Tech. Sup. de labo
Tech. de labo.
: 01
: 05
: 13
(Ph.)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
4. Laboratoire des Sérums thérapeutiques
Chef de laboratoire
: A.C. BENGUEDDA
(D.V spécialiste)
Assistants
: M.M. ABDELLI
: M.L. SAÏDANI
: N. ICHALAMENE
(D.V.)
(D.V)
(Ing. d’Etat en Biotechnologies)
Tech. Sup. de labo
Tech. de labo.
: 01
: 01
: 15
5. Laboratoire des Vaccins bactériens
Chef de laboratoire
: F. GACEM
Assistantes
: N. KHECHA
: B. MECHTI
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Sup. de labo
Tech. de labo.
: 02
: 01
: 02
6. Laboratoire des Vaccins et sérums antirabiques
Chef de laboratoire
: M. BRAHIMI
(D.V. spécialiste)
Assistants
: F. SEGHOUANI
: A. BOUKHANFRA
: S. OUARED
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Sup. de labo.
Tech. de labo.
: 03
: 01
: 14
7. Laboratoire des Vaccins viraux vétérinaires
Chef de laboratoire
: A. TARIL
: N. TOUARIGT
Tech. Sup. de labo.
: 03
: 03
(D.V spécialiste) jusqu’au 1er août
2008
LABORATOIRE D’EPIDEMIOLOGIE ET CENTRES MEDICAUX
1. Unité d’Epidémiologie
Chef d’unité
: A. SOUFI
: 01
(D.M.)
2. Centre des Prélèvements
Chef de centre
Tech. Sup. en soins infirmier
Tech. infirmier
: A. BRIKA
: 01
: 01
: 01
: 07
(D.M.)
Chef de centre
: A.S. HARCHI
(D.M.)
Tech. Sup.en soins infirmier
Assistant administratif
: 02
: 01
: 01
: 02
3. Centre des Vaccinations
ANTENNES REGIONALES DE L’IPA
Responsable
: F. KHELIFA
(D.M. spécialiste)
Assistants
Tech Sup en soins infirmiers
: L. DIF
: 01
: 04
(DES en Biologie)
Responsable
: A. BOUDRISSA
(Ing. d’Etat en biologie)
Assistants
: K. LADGHAME-CHICOUCHE
: M. BELHOUT
: N. BENHALIMA
: O. DAHMANI
: W.K. DJELLID
: F. ZEROUAK
: A. SEGHIOUR
: M. M’HATEF
: D. FAYALA
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Sup. de labo.
Tech. sup. en informatique
: 01
: 01
: 06
Antenne de M’Sila
15
Antenne d’Oran
Responsable
: L. BELHABRI
(D.M.)
Assistants
: D. AMARA
: A. TOUAA
: H. BELARIBI
: K. ALLA
: C. MEZAACHE
: N.I. OSTMANE
: R. TERBACHE
(D.M.)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
(DES en Biologie)
Tech. Infirmier
: 01
: 04
SERVICE DE LA FORMATION
Responsable
: S. NEDIR
BIBLIOTHEQUE
Responsable
: F.Z AÏT-OUAMAR
Secrétaire
: 01
: 03
Activités des services et laboratoires de
diagnostic et de recherche
18
Services et laboratoires de Diagnostic et Recherche
Service
de
Bactériologie
et d’Hygiène Hospitalière
Médicale,
d’Antibiothérapie
Chef de Service : Kheira RAHAL (DM. Professeur INESSM)
Comme nous l’avons déjà mentionné, le service est divisé en deux parties :
1ère partie :
- Recherche et biologie moléculaire
- Informatique
- Souchothèque
- Germes dangereux
2ème partie : - Diagnostic et sérologie
- Hygiène hospitalière
- Assurance qualité
Les deux assistantes Dr H. TALI-MAAMAR et le Dr N. BENAMROUCHE en assurent les
responsabilités sous la direction du chef de service à tour de rôle (permutation tous les
6 mois).
I. ACTIVITE DE DIAGNOSTIC
1- Diagnostic et sérologie
Cette unité traite les prélèvements adressés par les CHU, secteurs sanitaires et EHS et
cabinets privés.
19
1.1- Diagnostic bactériologique courant :
N. REZAOUI, N. TAHRAT, M. BOUHERAOUA
Tableau 1 : Prélèvements reçus par mois et par poste.
Janvier
Février
Mars
Avril
Mai
Juin
Juillet
Août
Septembre
Octobre
Novembre
Décembre
Total
ECBU
Divers
Spermoculture
P.Vaginal
P.Uréthral
Hémoculture
72
70
72
94
61
48
40
20
47
70
37
66
21
25
25
36
47
27
47
11
17
28
10
43
09
04
12
12
21
05
15
00
02
04
10
00
25
28
37
33
27
46
53
00
18
35
35
34
03
02
05
03
03
07
02
00
03
08
00
00
02
03
01
06
06
02
05
02
05
01
00
00
697
337
94
371
36
33
Total des prélèvements reçus durant l’année 2008 pour les postes de diagnostic = 1568
Nous avons perdu 70% de nos activités de diagnostic ; nous aimerions récupérer un
local au niveau du polyfonctionnel du Hamma pour y installer un autre centre de
prélèvements qui seront acheminés vers le laboratoire de bactériologie médicale de Dely
Ibrahim.
Tableau 2 : Souches reçues pour identification durant l’année 2008
Souche
Enterococcus faecium
Flavimonas oryzihabitans
Staphylococcus epidermidis
Pseudomonas aeruginosa
Acinetobacter baumanii
Escherichia coli
Klebsiella oxytoca
Chryseomonas lutéola
Enterobacter cloacae
Klebsiella pneumoniae
Rahnella aquatilis
Enterococcus faecalis
Proteus mirabilis
Acinetobacter lwoffii
Bacillus sp
Staphylococcus capitis
Citrobacter youngae
Staphylococcus hominis
Staphylococcus warnneri
Staphylococcus haemolyticus
Staphylococcus aureus
Klebsiella ozaenae
Total
20
Nombre
01
02
17
01
02
02
02
02
02
03
01
02
02
01
01
02
01
02
01
01
01
01
53
Tableau 3 : Nombre total d’antibiogrammes réalisés selon les normes CLSI
Types de prélèvements
Nombre d’antibiogrammes réalisés
Urines
189
Hémocultures
65
P urétral + Spermoculture+P vaginal
129
Divers
87
DPCA
03
Souche à identifier
53
Total
526
1.2- Diagnostic bactériologique des souches pouvant être à l’origine d’épidémies :
a) Corynebacterium diphteriae (diphtérie) : (B. GUETTOU, M. LAZRI)
Nombre de
prélèvements
reçus
Corynebacteriu
m diphteriae
mitis
Corynebacteriu
m diphtheriae
belfanti
Recherche de la
toxine par PCR
Bouira
01
00
00
00
B.Messous
02
00
02
Négative
Blida
06
00
03
Négative
Externe
01
00
01
Négative
10
00
06
Négative
Origine
Total
b) Brucella (brucellose) : (B. GUETTOU, M. LAZRI)
Origine
Type de prélèvement
Nombre de
prélèvements
reçus
Germe isolé
BLIDA
LCR
01
Brucella melitensis
biovar 3
CNMS
2- hémoc
1- valve
03
Brucelle melitensis
Biovar3
Total
04
21
c) Bordetella pertussis (coqueluche) : (B. GUETTOU, M. LAZRI) COIFFEUR
Aspirations
nasopharyngées
Frottis
nasopharyngés
Sérums
Souches
isolées
Akbou
00
00
20
00
Annaba
00
00
01
00
Bab el oued
00
00
01
00
HCA
01
00
00
00
El kettar
00
01
01
00
Tougourt
00
00
01
00
B messous
03
00
02
00
Tlemcen
00
00
01
00
Externe
09
00
18
00
13
01
45
00
Origine
Total
1.3- Sérologie bactérienne : (H. SENOUCI, S. CHEMLI)
Les analyses effectuées au sein de l’unité « sérologie bactérienne » sont :
• Diagnostic indirect de la brucellose humaine.
• Diagnostic indirect de la syphilis.
• Diagnostic indirect de Mycoplasma pneumoniae.
• Diagnostic indirect de Chlamydia pneumoniae.
• Diagnostic indirect de Légionella pneumophila urinaire et sanguin.
• Diagnostic indirect de la diphtérie par ELISA.
• Diagnostic des bartonelloses par IFI.
Brucellose :
Le nombre de sérums reçus cette année 2008 est de 412 sérums avec 61 positifs
répartis géographiquement comme suit :
Tableau n°1 :
Hôpitaux et secteurs sanitaires
Externe
15
Boufarik
Tizi Ouzou
Médéa
Douéra
Blida
9
1
4
6
1
CHU El Kettar
Parnet
Ain Defla
Adrar
Beni Messous
Ain Bessam
CNMS
Z’mirli
3
1
1
9
2
5
3
1
Total
22
Nombre de positifs
61
Syphilis :
Le nombre de prélèvements reçus est de 23 avec aucun positif.
Bartonella quuntana et henselae :
La recherche des anticorps anti-bartonella quuntana et henselae s’est effectuée sur
8 sérums avec aucun positif.
Diphtérie :
Nous avons reçu pour la recherche des antitoxines diphtériques 71 sérums.
Diagnostic indirect des affections respiratoires atypiques :
Le nombre de prélèvements (sérums et urines) reçus pour la recherche des atypiques
bactériennes durant l’année 2008 a été de 114 sérums et de 45 urines répartis comme
suit :
Tableau n°2 :
Nombre de positifs
Nombres de sérums
reçus
Mycoplasma pneumoniae
29
114
Chlamydiae pneumoniae
22
114
Légionella pneumophila sanguin
10
114
Légionella pneumophila urinaire
5
45
66
159
Anticorps et antigènes recherchés
Total des germes atypiques
Conclusion :
Le nombre d’analyses effectuées pour tous les paramètres : Brucellose, syphilis,
bartonellose, diphteries, chlamydiae, Mycoplasma pneumoniae et Légionella
pneumophila sanguin et urinaire s’élève à 673 prélèvements.
Recherche :
- Mise au point de la technique ELISA F1 peste (Yersinia pestis)
- Mise au point de la PCR appliquée aux pneumopathies atypiques bactériennes :
Légionella pneumophila type 1
23
2- Assurance qualité : R. OURAGHI, S. LAZIZI et Dj. GUESSOUM
G Activités Assurance Qualité
Mise en place de la base documentaire
• Rédaction de modes opératoires :
9 Les modalités des prélèvements
9 Prélèvement urétral, de pus, de gorges, nasales et oculaires
• Les techniques bactériologiques des prélèvements :
9 Prélèvement cervico-vaginal
9 ECBU
G Activités de Contrôle de Qualité
• Contrôle des milieux de culture
A chaque nouveau lot, contrôle de fertilité et de stérilité.
• Contrôle de l’antibiogramme
A chaque nouveau lot, étude du PH, de la concentration en cations, de la
concentration en thymine et thymidine et des diamètres des disques
d’antibiotiques.
• Contrôle des températures (étuves et chambre froide)
Activités d’expertise
Expertise de cinq lots de milieu Mueller Hinton
Contrôle de qualité de 5 lots de gélose Mueller Hinton de fournisseurs différents.
Etude du PH, de la concentration en cations, de la concentration en thymine
et thymidine et des diamètres des disques d’antibiotiques.
Expertise de cinq poudres d’amoxicilline pour le compte du LNCPP
Etude comparative de l’activité de 5 lots de poudre d’amoxicilline de fournisseurs
différents.
Etude de la bactériostase par la détermination de la CMI et de la bactéricidie par la
détermination de la CMB.
24
3- Hygiène hospitalière : N. ZOURDANI
Enquêtes :
Lieu
Intervention
Date
SOMEDIAL Oued Semar El Harrach
Enquête
Janvier 2008
CHU Beni Messous Sce de
Cardiologie
Enquête
Avril 2008
EPH Meftah – Bloc opératoire
Pré-enquête
Juillet 2008
EHS Aït Idir Sce de réanimation
Enquête
Septembre 2008
Contrôle d’environnement :
Lieu
Date
Centre d’imagerie médicale Youghourta
Mai 2008
Centre d’imagerie médicale Youghourta
Décembre 2008
Hygiène intra service :
Contrôle de l’eau, des paillasses, et de l’air.
Contrôle des mains et des surfaces (ordinateurs, téléphones portables).
Mise en place du système de pré-collecte des déchets conformément à la circulaire
ministérielle.
Contrôle de Stérilité :
Contrôle de sang et sérum de cheval, sang de mouton, verrerie.
Contrôle des hottes et des étuves.
II. RECHERCHE
1- Développement de la Biologie Moléculaire :
Mise au point de techniques :
- Recherche du gène Mec A à l’origine de la résistance des Staphylocoques aureus
à la méthicilline par PCR.
- Recherche du gène Mec A et de la leucocidine de Panton Valentine chez
S. aureus.
- Identification des entérocoques et mise en évidence de la résistance à la
vancomycine par les techniques de PCR et d'hybridation.
25
2- Projets de recherche :
- Projet PTR qnr : H. TALI-MAAMAR, F. ASSAOUS, O. LAFER, R. LALIAM
Il s’agit d’un projet du programme transversal de recherche du réseau international
des Instituts Pasteur.
L’objectif est de déterminer chez les entérobactéries résistantes aux
céphalosporines de 3ème génération, la proportion des résistances plasmidiques aux
quinolones en Alfrique et en Asie.
• Suite et fin de la collecte des souches.
• Recherche des gènes qnr A, B et S, et aac(6’)-Ib par PCR.
• Caractérisation des enzymes de résistance aux céphalosporines de
3ème génération.
• Début de l’étude épidémiologique.
- Projet N. meningitidis : H. TALI-MAAMAR, R. LALIAM
• Contrôle de la conservation des souches.
• Etude de la sensibilité aux antibiotiques par technique de CMI E test.
• Collecte d’échantillons de LCR et commande de réactifs pour la mise en route du
diagnostic des méningites par technique de PCR.
- Projet : ß-lactamines à spectre élargi synthétisées par les Salmonella isolées
en milieu hospitalier : M.N. OUAR-KORICHI, F. ASSAOUS
Durant l’année 2008, nous avons complété l’étude moléculaire des différentes
souches de Salmonella non typhoïdique par la technique de PCR en recherchant la
présence d’intégrons de classe 1, de classe 2, de classe 3 et l’élément SXT.
• L’étude a permis de révéler la présence d’intégrons classe 1 dans les souches
isolées de 3 épidémies (El Oued, Sétif, Constantine).
• Extractions plasmidiques par lyse alcaline : non concluantes (doivent être
relancées).
• Rédaction de la thèse en cours.
- Projet : Caractérisation phénotypique et génotypique des souches de
V.cholerae résistantes aux antibiotiques en Algérie : H. AMMARI, F. ASSAOUS
Dans le cadre de la thèse, un stage de biologie moléculaire a été effectué au niveau
de l’Institut Pasteur de Paris dans l’unité Plasticité du génome bactérien (Didier
MAZEL) du au 15 au 30 juillet 2008. Ce stage a permis l’apprentissage de la
technique de séquençage des produits d’amplification par PCR.
Rédaction en cours d’un article scientifique intitulé :
« Place des intégrons de classe 1 et de l’élément SXT dans la résistance aux
antibiotiques chez Vibrio cholerae »
Article à paraître dans les archives de l’Institut Pasteur d’Algérie.
26
- Projet : Coqueluche diagnostic et prévention : Dj. TOUATI, M. LAZRI
La coqueluche est une infection respiratoire contagieuse transmise par voie
aérienne par l’intermédiaire de gouttelettes de salive à partir du réservoir humain.
C’est une infection connue déjà au moyen âge.
1900 : Bordet et Gengou médecins bactériologistes belges découvrent l’agent de
la coqueluche.
1906 : La culture fut possible sur un milieu enrichi en extrait de pomme de terre.
La bactérie nommée au départ Bacillus pertussis puis Haemophilus
pertussis.
En 1952 la bactérie est nommée Bordetella pertussis en hommage
à Bordet. C’est un coccobacille à Gram négatif appartenant à la famille
des alcaligenaceae et fait partie des germes fastidieux, car nécessite de la
nicotinamide de la cystéine. Il ne pousse qu’après 03 jours à 07 jours en
aérobie. Bordetella pertussis produit une toxine pertussique (PTX).
1903 à 1960 : La coqueluche présentait des cycles tous les 03 à 04 ans, la plupart
des enfants étaient infectés par Bordetella pertussis avant l’âge de 15 ans
avec un pic à 05 ans, et les adultes étaient régulièrement exposés à la
maladie et développaient une immunité naturelle et continue.
La vaccination a été introduite en 1959 et généralisée en 1966.
1989 : On observe une résurgence de la coqueluche en France et aux Etats-Unis,
avec un changement de l’épidémiologie.
La coqueluche, est une maladie d’actualité selon toutes les études
européennes, américaines, et asiatiques.
Avec des tableaux cliniques variables voir atypiques.
Le diagnostic clinique est difficile, il faut retenir :
Les toux quinteuses.
Les toux prolongées plus de 08 jours, mais inférieures à 02 mois.
Toux émétisantes, avec des accès nocturnes.
Il faut chercher toujours le(s) contaminant(s).
Le diagnostic bactériologique est divisé en trois parties :
Culture : Peut être réalisé pendant les trois premières semaines sur une aspiration
naso-pharyngée. La culture reste difficile vu la fragilité de la bactérie qui est à
l’origine de nombreux faux négatifs.
La culture peut être négative en cas de prise d’antibiotiques ou suite à un
prélèvement mal fait.
Des milieux spéciaux sont à disposition : Bordet-Gengou ou Regan-Lowe.
Biologie moléculaire : Est plus sensible que la culture et reste positif pendant
04 semaines peut être réalisée en rétrospective.
Sérologie : ose le diagnostic après l’infection ; d’interprétation difficile chez le
nouveau-né et les personnes récemment vaccinées car la réaction ne fait pas la
différence entre les anticorps naturels ou vaccinaux.
La lecture nécessite deux sérums à un mois d’intervalle (phase aigue et phase de
convalescence) afin de mettre en évidence une ascension des anticorps.
La sérologie est un diagnostic de choix pour l’adulte qui consulte tard.
27
La sérologie reste un diagnostic de certitude quand on ne peut réaliser les autres
tests, une augmentation des titres de plus de deux voire quatre fois entre les deux
échantillons signe, en général, une séroconversion, par l’immuno-enpreinte ou par
technique immunoenzymatique.
- Projet : Prévalence des Salmonelloses aviaires et étude de la résistance aux
antibiotiques des souches isolées : S. KECHIH, F. ASSAOUS
Les salmonelloses humaines non typique constituent l’un des problèmes important
du monde contemporain et entraînent des pertes économiques considérables.
L’étude épidémiologique des toxi-infections alimentaires dont l’agent causal est
représentée par Salmonella sp. démontre dans de nombreux cas l’origine animale
et surtout aviaire (viandes, œufs et ovo produits).
Afin de maîtriser cette pathologie, les antibiotiques représentent la première classe
thérapeutique utilisée aussi bien chez l’homme que chez la volaille.
Notons que les volailles ainsi que tous les animaux de rente reçoivent les
antibiotiques aussi bien comme médicaments anti-infectieux, qu’additifs alimentaires
à effet promoteur de croissance, ce qui a favorisé l’émergence des résistances
bactériennes à certains antibiotiques qui se développent et se transmettent à travers
différentes modalités de pression de sélection.
Toutes ces raisons ont motivé notre travail qui se résume à la caractérisation des
souches de salmonelles aviaires isolées au niveau de cinq wilayas du centre du
pays par :
- Le sérotypage de ces souches.
- La répartition des différents sérotypes par type de production.
- La répartition des différents sérotypes par wilaya.
- L’étude de leurs réponses vis-à-vis des antibiotiques par la méthode de diffusion
sur gélose et la concentration minimale inhibitrice.
- L’étude des supports de résistance.
- Le groupage des plasmides par la technique de compatibilité.
- L’utilisation de l’électrophorèse en gel d’agarose afin de visualiser ces plasmides.
- Projet : Réseau
antibiotiques :
de
surveillance
de
la
résistance
bactérienne
aux
Durant l’année 2008 un stage de formation a été organisé pour les 32 participants
du réseau (médicaux et vétérinaires). En novembre 2008, une formation a été
organisée pour les formateurs afin de préparer les participants à la biologie
moléculaire. Les formations des participants auront lieu durant l’année 2009.
28
III. FORMATION
A l’Institut Pasteur
Résidents en sciences médicales
Nom et Prénom
Période
Abaziz Hassiba
Décembre – Janvier 2008
Drouaz nadjoua
Décembre – Janvier 2008
Hamidi Moufida
Février – Mars 2008
Tlemçani Adel
Mokhtari kamelia
Souici Mériem
Avril – mai 2008
Arib samia
Avril – mai 2008
Belloufa Mohammed Amine
Avril – mai 2008
Hamaili Linda
Avril – Mai 2008
Ali Amel
Mai – juin 2008
Nessab Abdelkader
Octobre – Novembre 2008
Benmansour Hanaa
Mechhoud Abdel hamid
Ousser Ahmed Fateh
Novembre – Décembre 2008
- Journée d’information sur la gestion des déchets à l’IPA
- Amphithéâtre IPA Dely Ibrahim. 09 Mars 2008.
- Atelier de formation des formateurs
- Initiation à la technique de PCR. Service de bactériologie médicale. Novembre
2008.
VI. SEMINAIRE
Participation du Dr H. TALI-MAAMAR à l’atelier de révision du consensus des
méningites purulentes. Mostaghanem, Mars 2008.
29
V. COMMUNICATIONS
- « La diphtérie en Algérie »
N. BENAMROUCHE, S. BELHOCINE, H. TALI-MAAMAR, M.
R. OURAGHI, H. SENOUCI, K. RAHAL
1ère journée nationale de Microbiologie Clinique, SAMIC, 29 mai 2008.
LAZRI,
- « Etude de la consommation des antibiotiques en milieu hospitalier en Algérie »
H. TALI-MAAMAR, K. RAHAL, L. ABED, O. LADJADJ, NOUAR, TOUAMI,
CHAMEKH, CHELLALI, BENACEUR
1ère journée Nationale d’hygiène Hospitalière de l’EHS Bologhine.
VI. PUBLICATIONS
- Standardisation de la technique de l’antibiogramme à l’échelon national à l’intention
de la médecine humaine.
ANDS – 2008 – 114 pages.
- Standardisation de la technique de l’antibiogramme à l’échelon national à l’intention
de la médecine vétérinaire.
ANDS – 2008 – 100 pages.
- 9ème rapport d’évaluation du réseau national de surveillance de la résistance aux
antibiotiques.
ANDS – 2008 – 170 pages.
- M. LAZRI, V. CARO, D. BRUN, E. NJAMKEPO, R. OURAGHI, Dj. GUESSOUM,
K. RAHAL and N. GUIZO
La coqueluche en Algérie : diagnostic direct et indirect de l’infection, sensibilité aux
antibiotiques des souches identifiées.
Arch. De l’IPA. 2007/2008, 66, 29 – 37.
- M.N. OUAR-KORICHI, F. ASSAOUS, F. MOUFFOK, K. RAHAL
Molecular characterization of antibiotic resistant Salmonella enterica serovar
typhi and paratyphi A and B causing enteric fever in Algeria.
The J. of infection in develop countries.
(En cours de publication).
30
Service d’Immunologie
Chef de Service: Mohamed-Cherif ABBADI (Pharmacien/ Professeur INESSM)
I. INTRODUCTION
Durant l’année 2008, s’est poursuivie la mise en place du laboratoire « Biochimie des
antigènes et production d’anticorps monoclonaux » sous la responsabilité des
Drs N. KACI et R. RAACHE), qui, nous l’espérons, sera totalement opérationnelle
durant l’année 2009 :
a) Unité anticorps monoclonaux :
• Mise en culture, des cellules de myélomes Sp2/O En vue de leur utilisation pour la
production d’hybridomes murins.
• Préparation de splénocytes de souris Balb/c immunisées avec des globules rouges
de phénotypes A et B par voie intra-péritonéale.
• Fusion entre les splénocytes des souris immunisées et les cellules myélomateuses
murines Sp2/O par agitation au Polyéthylène- glycol (PEG).
• Préparation des macrophages péritonéaux de souris utilisés comme cellules
nourricières pour la culture des hybridomes.
• Détection des anticorps anti-A et anti-B pour le screening par réaction
d’hémagglutination.
b) Unité Biochimie :
Il a été procédé à la mise en place des différentes techniques de Chromatographie
(gel filtration, échangeuse d’ions, affinité) et d’électrophorèse (SDS PAGE,….), ce qui
a permis de faire la purification d’IgG, IgM et IgA humaines.
Par ailleurs, le Service s’est impliqué dans l’organisation des 3èmes Journées
Nationales d’Immunologie couplées aux 1ères Journées Algéro-françaises
d’Immunologie organisées par la Société Algérienne d’immunologie les 10 et 11 mai
2008 à Alger, Palais de la Culture Moufdi Zakaria avec pour thème « Des
mécanismes de l’inflammation en auto-immunité : à l’exemple de la polyarthrite
rhumatoïde ».
31
II. ACTIVITES DE DIAGNOSTIC :
1- LABORATOIRE DU COMPLEXE HLA (H. AMROUN)
a) Typage HLA par microlymphocytotoxicité :
♦ Recherche d’antigèneHLAB51
1450
♦ Recherche d’antigène HLA B27
1402
♦ Typage HLA classe I (HLA-A,HLA-B)
170
b) Typage HLA par PCR-SSP :
♦ Typage HLA classe I (HLA-A,HLA-B,HLA-C)
151
♦ Typage HLA classe II (HLA-DR,DQ)
94
♦ Typage HLA DQ2-DQ8
43
2- LABORATOIRE D’IMMUNOCHIMIE ET D’IMMUNOLOGIE CELLULAIRE (N. ATTAL et N. KECHOUT)
a) Exploration de l’immunité cellulaire PAR IFI :
♦ Détermination du nombre de lymphocytes T CD3
107
107
107
♦ Détermination du nombre de lymphocytes B CD19
107
♦ Détermination du taux d’expression du HLA DR
♦ Test de réduction, au NitroBleu Tetrazolium
20
137
b) Exploration des protéiques sériques :
♦ Protidémies (Bleu de Coomassie)
1480
♦ Electrophorèses sur gel d’agarose
1480
♦ Tests d’immunofixation
234
♦ Recherche de cryoglobulines par cryoprécipitation
226
♦ Recherche de chaînes H α libres dans le sérum par immunosélection
63
♦ Dosage des protéines sériques et recherche d’anticorps par laser- néphélémétrie :
• Albumine
• Alpha 1 anti-trypsine
• Haptoglobine
• Céruléoplasmine
139
2079
14
• C3
2979
• C4
864
• Transferrine
32
2073
11
• IgG
2513
• IgA
3401
• IgM
2513
• Chaines Légères κ
408
• Chaines Légères λ
408
• C Reactive Protein (CRP)
497
c) Exploration des protéiques urinaires :
♦ Protiduries (Bleu de Coomassie)
215
♦ Electrophorèses sur gel d’agarose
215
♦ Recherche de protéine de Bence Jones par immunofixation
53
d) Profils rachidiens :
d.1- L.C.R. :
• Protidorachies (Bleu de Coomassie)
880
• Isoélectrofocalisations
360
• Dosage des protéines rachidiennes par laser-néphélométrie :
- Albumine
880
- IgG
880
d.2- Sérums accompagnant les L.C.R. :
• Protidémies (Bleu de Coomassie)
880
• Electrophorèses sur acétate de cellulose
880
• Isoélectrofocalisations
360
• Dosage des protéines sériques par laser-néphélométrie :
- Albumine
880
- IgG
880
d.3- Divers :
• Recherche d’anti-gangliosides GM1 IgG/IgM (Elisa)
32
• Recherche d’anti-gangliosides GD1b IgG/IgM (Elisa)
32
• Recherche d’anti-gangliosides asialo-GM1IgG/IgM (Elisa)
32
• Recherche d’anti-gangliosides GD1a IgG/IgM (Elisa)
32
• Recherche d’anti-gangliosides GM2 IgG/IgM (Elisa)
32
• Recherche d’anticorps anti-neuronaux
12
• Recherche d’anticorps anti-TNFβ (Elisa)
20
• Dosage du Phospho TAU (181p) (Elisa)
43
• Dosage du Phospho TAU (Elisa)
43
• Dosage du β amyloide (Elisa)
43
• Dosage du Neuron Specific Enolase (Elisa)
92
3- LABORATOIRE DU COMPLEMENT ET ALLERGIE, D’ONCOBIOLOGIE ET D’HORMONOCHIMIE (K.
DJENOUHAT et K. BELANTEUR)
a) Allergie :
♦ Dosage des IgE totales (par Elisa)
500
♦ Dosage des IgE spécifiques :
- Mélange d’aliments (FP5)
250
100
80
117
- Mélange graminées
214
33
- Mélange d’animaux
34
75
- Mélange de poussières
272
- Mélange de moisissures
117
- Dpt
270
- Dpf
250
- Blatte
100
- Œuf (blanc)
150
- Œuf (jaune)
145
- Lait de vache
460
- α-lactalbumine
40
- β-lactoglobine
40
- Caséine
40
- Arachide
75
- Tomate
45
- Fraise
30
- Gluten
25
- Blé
72
- Sésame
50
- Soja
40
- Pomme
40
- Amande
18
- Noix
17
- Cacao
26
- Levure de bière
20
- Latex
25
- Noyer
25
- Mimosa
25
- Olivier
50
- Pin
30
- Eucalyptus
30
- Chat (épithélium)
26
- Chien (épithélium)
10
- Chien (squames)
15
- Alternaria
50
- Candida albicans
10
- Cladosporium herbarum
15
- Penicillium notatum
10
- Pityrosporium obiculare
10
- Anti-CDD
20
b) Pathologie du complément :
♦ Exploration du complément total sérique :
- Dosage de CH50 par macrométhode
300
- Dosage du VAH50 par macrométhode
15
♦ Exploration des différentes fractions du complément :
- C3
185
- C4
180
- C1 Inh antigénique
120
- C1 Inh fonctionnel
20
- C1q
90
- Facteur B
95
- Auto-anticorps anti-C1q
125
c) Recherche et dosage de marqueurs tumoraux (par chimiluminescence) :
♦ Antigène carcino-embryonnaire
1307
♦ Antigène de cancer CA 15-3
1218
♦ Antigène spécifique de prostate PSA Total
2407
♦ Antigène spécifique de prostate PSA Libre
1288
♦ Alpha 1 Foetoprotéine
1441
♦ Antigène de cancer CA 19-9
1097
♦ Antigène de cancer CA 125
1100
♦ Parathormone (PTH)
502
d) Bilans thyroïdiens (par chimiluminescence) :
♦ Thyrotropine (TSH 3G)
3494
♦ Tri-iodothyronine Libre (FT3)
3261
♦ Tyroxine Libre (FT4)
3292
♦ Tyroglobuline (Tg)
318
♦ Anti-thyroglobuline (anti-Tg)
1048
♦ Anti-thyroperoxydase (anti-TPO)
1048
e) Bilan de fertilité (par chimiluminescence) :
♦ Hormone lutéotrope (LH)
1349
♦ Hormone folliculostimulante (FSH)
1522
♦ Testostérone (TTE)
1514
♦ Prolactine (PRL)
1703
♦ Estradiol (E2)
1001
♦ Progestérone (PGN)
666
f) Autres hormones (par chimiluminescence) :
♦ Cortisol
501
♦ Hormone choriogonadique (HCG)
479
♦ βHCG
330
♦ Hormone adénocorticotrope (ACTH)
223
35
♦ Déhydroépiandrostérone (DHEA)
506
♦ Somatotropine (HGH)
307
♦ Insuline
287
♦ C peptide
303
♦ Δ4 andronestenedione
401
♦ Calcitonine
241
4- LABORATOIRE D’AUTOIMMUNITE (S.S. SALAH)
a) Recherche et titrage d’auto-anticorps sériques :
♦ Par IFI :
- Anticorps anti-nucléaires (sur HEp2000)
- ANCA
- Anticorps anti-muscle lisse, mitochondries, cellules pariétales, LKM
- Autres spécificités anti-tissus
4478
206
1332
330
♦ Par Elisa :
- Anticorps anti-cardiolipines (IgG, IgM )
3177
- Anticorps anti-β2GP1 (IgG, IgM)
2762
- Anticorps anti-tTG/gliadine (IgA/IgG)
500
- Anticorps anti-CCP2
523
♦ Par lasernéphélémétrie :
- Facteurs rhumatoïdes
2214
♦ Par Multiplex :
- Anticorps anti-tTG/gliadine (IgA)
- Anticorps IgG anti-MPO/PR3
2741
595
♦ Par Immuno-DOT :
- Anticorps anti-PR3/MPO/MBG
15
- Anticorps anti-M2/Ribo/Jo1/LKM
38
- Anticorps anti-tTG/gliadine-IgG
06
b) Détermination de la spécificité des facteurs anti-nucléaires :
♦ Anti-DNA natif (par ELISA)
- par Multiplex
2574
- par IFI sur Crithidia luciliae
251
- par ELISA
180
♦ Anti-Antigènes solubles nucléaires :
- par Multiplex
- par ELISA
36
2574
280
III. ACTIVITES DE RECHERCHE
1- PROJETS EN COURS :
1.1- Profil du polymorphisme génétique de cytokines pro- et anti-inflammatoires
chez des patients Algériens atteints de sclérose en plaques (N. ATTAL) :
La sclérose en plaques (SEP) est une maladie dysimmune dont la
physiopathologie implique une profonde dysrégulation de la synthèse des
cytokines pro et anti-inflammatoires.Le but de ce travail est de rechercher une
éventuelle association entre le polymorphisme des gènes de cytokines pro et antiinflammatoires, et la susceptibilité à la SEP chez des patients algériens.
En 2008, cette étude a porté sur 63 patients algériens atteints de SEP définie dont
l’âge moyen était de 34 ans et 120 sujets sains dont l’âge moyen était de 29 ans.
L’ADN a été extrait des leucocytes du sang périphérique par la méthode classique
au phénol-chloroforme et la détermination du profil du polymorphisme des gènes
des cytokines (TNF-α, TGF-β1, IFN-γ, IL-6 et IL-10) a été effectuée par la méthode
PCR-SSP grâce à un kit commercial (cytokine genotyping tray de la firme One
Lambda,Inc.).
Des résultats significatifs ont été obtenus uniquement pour le TGF-β1. En effet,
le génotype GG (codon25) était plus fréquent chez les témoins que chez les
malades SEP (Pc = 0,005, OR = 0,3), le génotype GC était plus fréquent chez les
malades SEP que chez les témoins (Pc = 0,011, OR = 3,06) et le phénotype High
était plus fréquent chez les témoins, comparé aux malades (Pc = 0,017 ; OR =
0,41).
Le TGFβ joue un rôle essentiel dans la différentiation des LT régulateurs (LTreg),
mais dans un contexte inflammatoire, il oriente la différentiation des LT vers la voie
Th17. De ce fait, la faible production de TGFβ chez nos malades favoriserait sans
doute l’orientation de la réponse immunitaire vers les voies Th1 et Th17.
A la lumière des résultats obtenus, nous pouvons suggérer que le polymorphisme
du gène de cette cytokine est impliqué dans la susceptibilité à la SEP dans la
population algérienne.
1.2- Apport du diagnostic biologique dans la maladie d’Alzheimer (N. ATTAL) :
Durant l’année, nous nous sommes intéressés à l’étude de 3 marqueurs
biologiques pouvant fournir une approche diagnostique de la maladie d’Alzheimer
(ALZ) à savoir :
• La protéine TAU.
• La Tau phosphorylée (phospho Tau ; pTAU).
• Le peptide β amyloide (1-42) : Aβ1-42.
Cette recherche a été réalisée par technique ELISA (kits INNOTEST) au niveau du
liquide céphalorachidien (LCR) de 18 patients présentant une suspicion de maladie
d’ALZ (démence) et de 18 patients atteints de sclérose en plaques (SEP) et
constituant le groupe témoin car nous ne pouvons disposer de LCR de sujets
sains.
37
Les résultats ont montré que :
• La concentration moyenne de la protéine TAU est plus élevée chez les patients
ALZ que le groupe SEP (195,07 pg/ml vs 143,079 pg/ml), car, dans la maladie
d’ALZ, la TAU est libérée dans l’espace extra- cellulaire et traduit la mort
neuronale.
• La concentration moyenne de la protéine pTAU est plus élevée chez les patients
ALZ que le groupe SEP (39,94 pg/ml vs 16,94 pg/ml) ce qui concorde avec les
résultats trouvés par ailleurs car, dans la maladie d’ALZ, il y a une hyperphosphorylation de la TAU, responsable de la dégénérescence neuro-fibrillaire.
• La concentration moyenne du peptide Aβ1-42 est diminuée chez les patients ALZ
par rapport au groupe SEP 494,25pg/ml vs 666,291pg/ml ce qui rejoint la
littérature car dans la maladie d’ALZ, la concentration du peptide β amyloïde
diminue car piégé dans les agrégats.
Ces résultats préliminaires, qui rejoignent d’ailleurs les données de la littérature,
se révèlent être très intéressants dans la mesure où ils ont permis, chez certains
malades, d’asseoir le diagnostic de maladie d’ALZ et d’adapter une thérapeutique
adéquate, et au contraire, chez d’autres, de le reconsidérer. Il est ddonc prévu de
poursuivrecette étude sur un plus grand nombre de patients pour une meilleure
exploitation des résultats.
1.3- Etude des facteurs de prédisposition génétique aux spondylarthropathies
dans le grand Alger (H. AMROUN, S.S. SALAH) :
Plus de trois décennies après la découverte de HLA-B27 comme gène majeur de
susceptibilité à la spondylarthrite ankylosante (SA), la physiopathologie de cette
affection reste encore non élucidée. Celle-ci combine des facteurs génétiques,
des facteurs d’environnement et une réponse immunitaire anormale.
Si l’antigène HLA-B27 semble un composant génétique important dans la
susceptibilité à cette maladie, il n’en demeure pas moins que d’authentiques SA ainsi
que des Spondylarthropathies peuvent survenir chez des sujets HLA-B27 négatifs,
ce qui suggère bien évidemment l’intervention d’autres facteurs génétiques. Parmi
les régions chromosomiques en dehors du CMH retrouvées associées à la SA, on
retrouve la région 2q14 qui s’étend sur 430kb et qui comporte la famille des gènes de
l’IL-1 : l’IL-1A, l’IL-1B et l’IL-1RN antagoniste qui codent respectivement pour les
cytokines pro-inflammatoires IL-1α, IL-1β et l’antagoniste du récepteur de l’IL-1
(IL-1ra), cytokines qui jouent un rôle important dans l’ostéolyse et le remodelage
osseux.
Durant l’année 2008 nous avons effectué l’analyse du polymorphisme des gènes du
cluster de l’IL-1 chez 146 patients présentant une SA et 127 sujets sains non
apparentés, tous originaires du grand Alger, à l’aide de la méthode PCR-RFLP pour
deux polymorphismes de l’IL-1β , un situé au niveau du promoteur IL-1β-511 C/T(rs
16944), l’autre au niveau de l’exon 5 IL-1β +3953 (rs 1143634) et le polymorphisme
de l’IL1-ra de type VNTR (variable number repeat) IL-1ra (86pb)n.
L’analyse des trois polymorphismes, réalisée séparément chez les malades et
les témoins, ne révèle pas de différences statistiquement significatives. Par contre,
l’analyse multi-variée des patients et témoins porteurs de l’allèle IL-1β 3953T selon
les différents allèles de l’IL-1ra, montre que la fréquence des patients porteurs
simultanément l’allèle IL-1β3959T et l’allèle IL-1RN*2 : (86pb)2 est plus élevée que
38
celle des témoins porteurs du même haplotype. Cette différence est statistiquement
significative pour les fréquences alléliques (17,19% Vs 8,86%; pc=0,034 ; OR =2,13)
et pour les fréquences phénotypiques (32,29% Vs 16,46% ; pc= 0,026 ; OR =2,42).
Plus intéressant encore, l’analyse de l’association de ce même haplotype et de la
SA dans le groupe des malades et témoins HLA-B27 négatif, révèle une fréquence
élevée de l’haplotype IL-1RN*2 (86pb)2 et IL-1β+3953T chez les patients HLA-B27
négatifs par rapport aux témoins. Cette différence est statistiquement significative :
18,92% Vs 6,76% ; pc= 0,012 ; OR= 3,22.
Durant l’année 2009, nous nous proposons :
• De confirmer, dans un premier temps, l’association de ce polymorphisme sur un
nombre de sujets atteints de SA plus important,
• Et, dans un deuxième temps, de chercher une éventuelle relation de certains
marqueurs sériques de la réaction inflammatoire (C réactive protéine, vitesse
de sédimentation) avec l’activité de la maladie dans les deux groupes de
patients HLA-B27 positifs et HLA-B27 négatifs.
1.4- Détermination de la fréquence des allèles HLA dans la population Algérienne
par biologie moléculaire (H. AMROUN) :
Durant l’année 2008, notre unité a effectué des bilans de pré-greffe chez
91 donneurs potentiels, faisant augmenter notre cohorte de donneurs à 240 sujets
sains, pour lesquels le typage HLA-A, B et C a été réalisé par PCR-SSP. Ceci nous
a permis d’établir la distribution des fréquences alléliques pour chaque locus :
• Pour les allèles HLA-A :
- A*02 : 20,29 %,
- A*30 : 12,91%,
- A*03 : 9,84 %,
- A*01 : 9,63 %.
• Pour le locus HLA-B :
- B*51 : 9,13%,
- B*07 : 8,92%,
- B*44 : 8,71%,
- B*18 : 7,26 % ;
- B*50 : 6,64%.
• Parmi les allèles HLA-cw détectés, nous retrouvons une prédominance des
allèles HLA CW* 07 et HLA- CW* 06 avec des fréquences respectives de
22,42% et 15,87%.
Pour ce qui est des loci HLA de classe II, le travail se poursuivra durant l’année
2009 par l’augmentation de l’effectif actuellement disponible et qui est insuffisant
pour établir des fréquences aux allèles HLA-DR B1 et HLA-DQ B1.
Ce travail servira de référence témoin pour les études
maladies.
d’association HLA et
39
1.5- Etude immunogénétique de la tuberculose ostéo-articulaire (TOA) dans
lapopulation algérienne (H. AMROUN, S.S. SALAH) :
La tuberculose est une pathologie multifactorielle, impliquant plusieurs facteurs
génétiques, prouvés par plusieurs faits épidémiologiques ainsi que par différentes
études entreprises dans le monde. En ce qui concerne la tuberculose ostéoarticulaire, aucune étude immunogénétique n’a abordé, à ce jour, tant en Algérie
que dans le reste du monde.
Ce travail, entrepris à partir de l’année 2004, a consisté en l’étude de certains
polymorphismes de gènes, dont les produits sont impliqués dans la défense antiM.tuberculosis, et qui pourraient être impliqués dans la susceptibilité ou la
résistance à la tuberculose ostéo-articulaire.
Durant l’année 2008, nous avons étudié 8 nouveaux polymorphismes touchant les
gènes TLR1, TLR2, TLR4, TIRAP, CD14, MCP1, IL12, TNFα, IL1, IL1Ra, HLA
classe II (DR et DQ), HLA-E, NOS2, NOS3 et VEGF chez les sujets suivants :
• 114 malades atteints de TOA recrutés au niveau du service de rhumatologie, à
l’EHS Douéra.
• 104 sujets sains apparentés aux malades (ascendants et collatéraux).
• 204 sujets sains non apparentés permettant une comparaison des malades par
rapport à la population générale.
L’analyse des résultats permet de dégager les éléments suivants :
• L’analyse simple, montre l’absence d’association entre les polymorphismes
étudiés et la susceptibilité ou la résistance à la TOA, à l’exception de l’IL1Ra,
dont le polymorphisme de type VNTR (IL1Ra 86pb VNTR) a montré une
association de l’allèle 2 répétitions avec la susceptibilité à la TOA.
• L’étude de l’effet combiné de deux polymorphismes montre une association de la
combinaison du polymorphisme touchant le gène IL1B (IL1B -511) et des
polymorphismes touchant le gène de NOS2 (iNOS : inductible NO Synthase)
(NOS2 -277, -1026, -1659) avec la résistance à la TOA.Par contre, les
(polymorphismes de NOS2 sont associés en combinaison avec le polymorphisme
du TNFα (TNF-1031) avec la susceptibilité à la TOA.
• L’analyse stratifiée en fonction des formes cliniques de la TOA (forme axiale
et formes périphériques), montre une association du polymorphisme touchant le
gène de MCP1 (MCP1 A-2518G) avec la susceptibilité à la forme axiale. Enfin,
les résultats des fréquences alléliques et génotypiques du polymorphisme de
type VNTR qui touche le gène de NOS3 (NOS3 intron4 27pb VNTR) montrent
une différence significative entre les deux sous-groupes cliniques de la maladie.
Sur la base de ces résultats, nous nous proposons :
• De poursuivre le recrutement et l’augmentation de l’échantillonnage axé surtout
sur la cohorte de malades.
• D’étudier d’autres polymorphismes de gènes.
40
1.6- Etablissement des médianes de référence pour l’ α FP, la HCG, la PAPP-A et la
βHCG sériques chez les femmes enceintes en vue de l’évaluation du risque de
la Trisomie 21 (K. BELANTEUR) :
Durant l’année 2008, nous avons effectué le dosage sérique des paramètres du
2ème trimestre chez 23 femmes et ceux du 1er trimestre chez 07 femmes. Toutefois,
le nombre de sujets recrutés à ce jour s’avère toujours insuffisant pour établir les
médianes de référence des paramètres de la trisomie 21 dans la population
algérienne.
1.7- Etude des gènes de prédisposition à la maladie coeliaque de l’adulte
(K. BELANTEUR) :
Durant l’année 2008, nous avons réalisé le typage HLA classe II par PCR-SSP ainsi
que le polymorphisme MICA 129 par PCR-RFLP chez 33 malades coeliaques
adultes. Les résultats préliminaires sont les suivants :
• Pour le typage HLA, une augmentation de la fréquence des 2 allèles DQB1*02
(DQ2) et DQB1*0302 (DQ8) chez les malades par rapport aux témoins : 91% vs
43,4% et 18% vs 13% rspectivement. Cette différence est statistiquement
différente pour l’allèle DQ B1*02 (P=1,4 10-5).
• Pour le polymorphisme MICA 129, une augmentation de la fréquence du
génotype Met/Met chez les malades par rapport aux témoins : 18% vs 9%
respectivement. Mais cette différence n’est pas statistiquement significative
(P=0,2). Ceci est dû probablement au faible effectif.
• Pour ce qui est du polymorphisme HLA E, l’étude n’a pas été réalisée par
manque de réactifs.
Ce travail se poursuivra l’année 2009 et qui tiendra compte des formes cliniques et
de l’âge d’apparition de la maladie.
1.8- Etude de la fréquence des anticorps anti-CCP et de l’association des
antigènes HLA de classe II avec la polyarthrite rhumatoïde (S.S. SALAH,
H. AMROUN) :
La polyarthrite rhumatoïde (PR) est le plus fréquent des rhumatismes
inflammatoires chroniques. Il s’agit d’une affection auto-immune complexe,
multifactorielle relevant principalement de facteurs hormonaux, environnementaux,
neuropsychologiques, immunologiques et génétiques. Il est connu que cette
affection est associée à certains allèles HLA-DR et ce, dans différentes populations.
L’objectif de notre travail est d’étudier l’association entre les allèles HLA classe II
et la PR chez des patients algériens en comparaison avec des témoins sains. Notre
étude préliminaire concerne 159 patients non apparentés atteints de PR selon les
critères de l’American College of Rhumatology (ACR). Les données obtenues sont
comparées à ceux de 110 sujets sains, volontaires et non apparentés. Le typage
HLA de classe II a été fait par méthode PCR-SSP.
41
Notre cohorte comprend 136 femmes et 23 hommes (sex-ratio = 6) d’âge moyen de
50,15±13,25 ans. La durée moyenne de l’affection était de 12±9,5 ans. La moyenne
du DAS 28 était de 4,11 et le HAQ moyen était de 0,990±0,707. La PR était érosive
dans 73% des cas et séropositives dans 60%. Les anticorps anti-CCP2 étaient
présents chez 80.5% des patients. Le typage « générique » de DRβ1 montre que la
fréquence de l’allèle HLA- DRβ1*04 est significativement plus élevée chez les
patients atteints de PR par rapport aux témoins (p<0,00001, OR= 2,78 ; IC95%=
[1,74–4,53]). Cependant, l’allèle HLA-DRβ1*01 est présent chez 7,86% des patients
et chez 5,45% des témoins, mais cette association est non significative (p=0,36).
Les fréquences des allèles HLA-DRβ1*07 et DRβ1*08 sont significativement plus
élevés chez nos témoins par rapport aux patients (p<0,01, OR= 0,48 ; IC95%=
[0,262–0,871] ; p<0,02, OR= 0,17 ; IC95%= [0,017–0,854]). Quant à l’association au
sexe, elle n’est pas significative (p=0,72).
Durant l’année 2009, nous nous proposons, dans un premier temps, d’augmenter le
nombre d’échantillons de sujets atteints de PR et, dans un deuxième temps, de
rechercher plus précisément les différents allèles de susceptibilité à la PR qui
constituent l’épitope partagé ou « shared epitope ».
1.9- Bases moléculaires et génétiques des déficits primitifs en composants du
Complément (K. DJENOUHAT) :
La caractérisation des anomalies moléculaires à l’origine de l’angio-œdème par
déficit héréditaire en C1 Inhibiteur chez les familles diagnostiquées durant ces
15 dernières années fera l’objet, durant l’année 2009, d’une soutenance d’une thèse
de doctorat en Sciences Médicales.
Pour ce qui est du travail portant sur les déficits en fractions du complément
associés aux maladies auto-immunes, et plus particulièrement à la maladie lupique,
en poussée et en rémission, à manifestation cutanée ou systémique, avec ou sans
complication rénale, il est en cours de réalisation, en collaboration avec les services
de nephrologie, médecine interne et dermatologie de l’HCA. Il devra faire l’objet
d’une soutenance d’un mémoire de fin d’étude en résidanat durant l’année en cours.
1.10- Les allergies alimentaires dans la région d’Alger (K. DJENOUHAT) :
Durant l’année 2008, nous avons étudié, chez les sujets présentant une allergie
alimentaire à la tomate, l’arachide ou la noisette, la fréquence des réactions
croisées avec les allergènes du mélange de pollens de graminées.
Nous avons opté, comme CCD, pour la bromélain, glycoprotéine extraite de
l’ananas en raison, d’une part, de la grande similitude de structure entre le
carbohydrate de la bromélian et les glycoprotéines végétales, et, d’autre part de
l’absence d’allergie à la bromélain.
Les résultats préliminaires portant sur un 30aine de patients montrent que 10% des
sujets allergiques aux arachides et/ou aux amandes présentent une sensibilisation
c aux mélanges de graminées sans faire le moindre symptôme, et la recherche
des anti-CCD dans les sérums de ces patients s’est avérée positive.
Paradoxalement, nous avons constaté l’absence de ce type de réaction croisée
chez les sujets allergiques à la tomate.
Durant l’année en cours, nous comptons poursuivre le recrutement de malades en
vue d’aboutir à des résultats plus significatifs.
42
1.11- Mise au point d’un test d’activation des basophiles pour l’exploration des
allergies aux β lactamines. (K. DJENOUHAT, D. NACI).
Les β lactamines, dont le chef de file est représenté par la pénicilline, constituent
une famille d’antibiotiques très importante, tant sur le plan curatif que préventif.
Toutefois, leur inconvénient majeur réside dans leur pouvoir allergisant. c’est
pourquoi, il est crucial d’en faire le diagnostic et de différencier les vraies allergies
des effets pharmacologiques indésirables.
Ce diagnostic repose principalement sur les tests cutanés et les tests de
provocation standardisés qui, malheureusement, présentent un risque de choc
anaphylactique. Aussi, assiste t-on, actuellement, à l’émergence de plusieurs tests
biologiques qui sont tous en cours d’évaluation. Parmi ces tests, le plus prometteur
est le test d’activation des basophiles en cytométrie de flux (BAT).
Durant l’année écoulée, nous avons réuni l’ensemble des conditions en vue de sa
mise en place dans notre laboratoire, travail qui a fait l’objet d’une soutenance d’un
mémoire de fin d’études de résidanat en Immunologie. Restent à déterminer
sensibilité et sa spécificité afin d’évaluer son apport sur le plan diagnostique.
2- PROJETS NOUVEAUX
G Association des antigènes HLA de classe II avec la sclérose en plaques chez
des patients algériens (N. ATTAL) :
La sclérose en plaques (SEP), est une maladie inflammatoire chronique du système
nerveux central caractérisée par une destruction de la gaine de myéline nécessitant
l’intervention de 2 composantes l’une génétique, et l’autre environnementale.
Les études génétiques effectuées à ce jour révèlent que le système HLA, et plus
particulièrement la région HLA II, est probablement l’un des facteurs majeurs
déterminant la susceptibilité à cette maladie.
Dans un travail précédent, nous avons réalisé le typage sérologique des molécules
HLA de classe II (DR, DQ) chez 40 patients algériens atteints de SEP et 140 sujets
normaux. Les résultats ont montré que dans la population algérienne, il existait une
association significativement positive entre la SEP et les molécules DR15 et DQ6
avec des risques relatifs (RR) respectifs de 2,86 et 2,65 et qu’en outre, il existerait
une association négative entre cette affection et le DR1.
Nous nous proposons donc de continuer ce travail sur une cohorte plus importante
de patients et d’inclure des familles pour effectuer, d’une part le typage HLA II
générique par technique de PCR SSP, et d’autre effectuer un typage DR15 allélique,
chez nos patients DR15+, afin identifier les allèles DR15 en cause chez les patients
SEP algériens.
43
VI. PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS
1- PUBLICATIONS :
• R. DJIDJIK, M. GHAFFOR, M. BRUN, M. GHARNAOUT, S.S. SALAH,
W. BOUKOUACI, H. DJIDJIK, A. BENYOUNES, K. KOUMARAVELOU,
R. KKRISHNAMOORTHY, M.C. ABBADI, D. CHARRON, R. TAMOUZA (2008)
Constitutive nitric oxide synthase gene polymorphisms and house dust mite respiratory
allergy in an Algerian patients group.
Tissue antigens, 71(2):160-164.
• N. KACI-OUCHFOUN, F. HADJ-BEKKOUCHE, M.C. ABBADI, T. GERNIGONSPYCHALOWICZ (2008)
Purification, preliminary characterization and immunohistochemical localization of
POSVP21 in the sand rat (Psammomys obesus) seminal vesicles.
Theriogenology, 69: 525-535.
• R. DJIDJIK, N. ATTAL, M. BENIDIR, M. GHAFFOR, M.C. ABBADI (2008)
Mécanismes immunopathologiques des allergies IgE dépendantes : données récentes.
Rev.Alg.Immunol. Immunopath. 00: 08-17.
• N. ATTAL, E. ATTAL, M.C. ABBADI (2008)
Apport de l’isoelectro-focalisation avec immuno-révelation des IgG dans la mise
évidence des bandes oligoclonales rachidiennes au cours de la sclérose en plaques.
Rev.Alg.Immunol.Immunopath., 00:18-22.
• N. ATTAL, E. ATTAL, N. HADJ BEKKOUCHE, M. SAADI BELOUIZ, M. AIT KACI
AHMED, M.C. ABBADI (2008)
Apport du diagramme de Reiber dans l’interprétation du profil protéique rachidien.
Rev.Alg.Immunol.Immunopath., 00: 48-51.
• K. BELANTEUR, R. RAACHE, S. DAHMANI, A. A ISSOU, M.C. ABBADI (2008)
Détermination des valeurs normales des marqueurs tumoraux chez les sujets sains
algériens.
Rev.Alg.Immunol.Immunopath., 00::44-47.
• S.S. SALAH, H. AMROUN, N. HADJ BEKKOUCHE, N. OUIS, S. NACER,
M.C. ABBADI (2008)
Analyse des profils en auto-anticorps et corrélations clinico-biologiques chez 86
patients présentant une connectivite avec auto-anticorps anti-Ro/SSA.
Rev.Alg.Immunol.Immunopath., 00:28-33.
2- COMMUNICATIONS ORALES :
• S.S. SALAH
Exploration de la maladie cœliaque.
Journée de formation médicale continue du CHU de Bab El Oued.
17 Mars 2008, Alger, Algérie.
• S.S. SALAH, H. AMROUN, H. DJOUDI, M. BUSSON, R. ALLAT, A. TOUBERT,
R. KRISHNAMOORTHY, M.C. ABBADI, D. CHARRON, R. TAMOUZA
Association of Gender-specific association of the VEGF G-634C polymorphism with
Ankylosing
Spondylitis in an Algerian patient group.
22th European Conference of Immunogenetics and Histocompatibility,
2-5 Avril 2008, Toulouse (France).
Abstract in Tissue antigens, 2008, 71/4: 342-343.
44
• K. DJENOUHAT, H. MESSAOUDI, A. KETFI, M.C. ABBADI
Angio-oedème héréditaire de type III : Etude de 4 familles Algériennes.
3ème Congrès Francophone d'Allergologie,
9-11 Avril 2008, Paris (France).
• S.S. SALAH
Apport du laboratoire d’immunologie dans le diagnostic de la maladie lupique.
2ème rencontre multidisciplinaire sur le lupus.
24 Avril 2008, Oran, Algérie.
• H. AIT HAMOUDI, S.S. SALAH, A. HADJADJ, S.A. BEN KAALOUL, S. METATLA,
S. ZOUAOUI, M.C. ABBADI
Technologie multiplex : nouvelle méthode de dosage des anticorps anti-ADNn dans le
diagnostic et le suivi thérapeutique du lupus érythémateux systémique.
11ème congrès maghrébin de médecine interne/ 14ème journée nationale de médecine
interne.
3-4 Mai 2008, Alger, Algérie.
Problèmes de prise en charge de l’angio-œdème héréditaire en Algérie : à propos
d’une 60aine de cas.
11ème congrès maghrébin de médecine interne/ 14ème journée nationale de médecine
interne.
• N. ATTAL, M.C. ABBADI
Immuno-intervention dans LA PR
Service d’Immunologie, Institut Pasteur d’Alger.
1ères journées Algéro-françaises d’Immunologie/
d’Immunologie.
3èmes
Journées
Nationales
• H. AMROUN, S.S. SALAH, R. ALLAT, F. MECABIH, H. DJOUDI, S. AIT SAID,
I. ALLAM, N. ZAABAT, A. TAHIAT, M. BUSSON, M.C. ABBADI, D. CHARRON,
R. TAMOUZA
Association des polymorphismes fonctionnels de l’IL-1β (-511C/T et +3953C/T) et de
l’IL-1Ra (IL-1Ra 86pb VNTR) avec la spondylarthrite ankylosante dans la région du
Grand Alger.
1ères journées Algéro-françaises d’Immunologie/ 3èmes Journées Nationales
d’Immunologie.
• F. MECABIH, H. AMROUN, F. SADOUKI, S.S. SALAH, S. METATLA, H. DJOUDI,
M.C. ABBADI, R. TAMOUZA
Etude d’association des polymorphismes fonctionnels des gènes TIRAP et MCP-1
avec la susceptibilité ou la résistance à la tuberculose ostéo-articulaire en Algérie.
d’Immunologie.
• E. ATTAL, N. ATTAL, R. DEHBAOUI, S.S. SALAH, M. AIT KACI AHMED,
M.C. ABBADI
Syndrome hémichorée-hémiballisme révélateur d’un neuro-lupus.
d’Immunologie.
45
• S. CHAIB-MAMOUZI, Y. MEDDOUR, S. MAAMERI, N. BOUDIAF, R. DJIDJIK,
S.S. SALAH
Intérêt du dosage des anticorps anti-CCP dans la PR : Etude algérienne multicentrique
rétrospective sur deux ans.
d’Immunologie.
• S.S. SALAH, H. AMROUN, D. ACHELI, S. METATLA, S. NACER, N. AZEM,
N. HADJ BEKKOUCHE, N. ATTAL, H. DJOUDI, M.C. ABBADI
Etude de l’association des allèles HLA de classe II chez des patients atteints de
polyarthrite rhumatoïde en relation avec la production d’anticorps anti-CCP2 dans la
PR : étude monocentrique algérienne.
d’Immunologie.
• D. ACHELI, S.S. SALAH, S. LEHTIHET, S. METATLA, F. KASSOURI,
M.C. ABBADI, H. DJOUDI
Apport des anticorps anti-CCP dans la polyarthrite rhumatoïde : Expérience du service
de rhumatologie de Douéra.
d’Immunologie.
• S. NACER, S.S. SALAH, D. ACHELI, H. AMROUN, S. METATLA, S. ZOUAOUI,
M. CHEMLAL, N. HADJ BEKKOUCHE, N. ATTAL, H. DJOUDI, M.C. ABBADI
Comparaison des résultats du dosage du facteur rhumatoïde par néphélémétrie-laser
et par la nouvelle méthode d’immunofluorométrie sur billes (Technologie Multiplex).
d’Immunologie.
• K. DJENOUHAT, M.C. ABBADI
Prévalence et intérêt des anticorps anti-C1 q dans l’angio-œdème héréditaire par
déficit en C1inhibiteur.
d’Immunologie.
M.C. ABBADI, D. CHARRON, R. KRISHNAMOORTHY, R. TAMOUZA
Aspects pharmacogénétiques de la spondylarthrite ankylosante en Algérie.
Journée scientifique du Département de Pharmacie, Faculté de médecine d’Alger
18 mai 2008, Alger, Algérie.
• S.S. SALAH, M.C. ABBADI
Performances des examens immunologiques dans la prise en charge de la maladie
coeliaque.
7èmes Journées Nationales de Pathologie.
• S.S. SALAH, S. METATLA, S. ZOUAOUI, H. AIT HAMOUDI, M.C. ABBADI
Apport de la nouvelle technologie multiplex dans le diagnostic de la maladie
coeliaque : exemple de la gamme AtheNA-Coeliac, testés sur 178 sérums.
1er Congrès Euro-africain d’Allergologie et d’Immunologie Clinique.
18-20 Juin 2008, Alger, Algérie.
46
Etude clinico-épidémiologique de l’angio-œdème héréditaire en Algérie : A propos de
83 cas.
1er Congrès Euro-africain d’Allergologie et d’Immunologie Clinique.
18-20 Juin 2008, Alger, Algérie.
• N. KACI-OUCHFOUN, F. HADJ-BEKKOUCHE, M.C. ABBADI, A. BOUDRISSA,
T. GERNIGON-SPYCHALOWICZ
Site synthesis determination and partial sequence analysis of a major androgendependent protein from send rat (Psammomys obesus) seminal vesicles.
Conférence Internationale Rodens Spatium
24-28 Juillet 2008, Myshkin (Russie).
• D. ACHELI, S.S. SALAH, F. SADOUKI, S. LEHTIHET,
F. KASSOURI, R. ALLAT, M.C. ABBADI, H. DJOUDI
La polyarthrite rhumatoïde chez les patients algériens.
8èmes Journées de l’Appareil Locomoteur de l’HCA.
8-9 Octobre 2008, Alger, Algérie.
S.
METATLA,
• S. MAKRI, C. MAGHNOUCHE, D. OULBANI, N. ATTAL, S. SALHI, M. AIT KACI
AHMED
Etude clinique, paraclinique et évolutive de la SEP.
IVème Congrès Maghrébin de Neurologie.
7-8 Novembre 2008, Alger, Algérie.
• K. BELANTEUR, A. GUEDOIR, M. MESSATFA, R. RAACHE, H. AMROUN,
S.S. SALAH, A. LABIED, R. TAMOUZA, D. CHARRON, M.C. ABBAD
Gènes de susceptibilité HLA classe II et maladie coeliaque chez l’enfant algérien.
1eres journées de la Société Marocaine d’Immunologie.
14-15 Novembre 2008, Marrakech (Maroc).
• R. RAACHE, A. BENYAHIA, A. AMROUN, N. ATTAL, K. BELANTEUR,
M. AZZOUZ, A. BOUDIBA, M.C. ABBADI
Comparaison des antigènes HLA classe II entre les diabétiques dans la région d’Alger.
1eres journées de la Société Marocaine d’Immunologie.
14-15 Novembre 2008, Marrakech (Maroc).
• H. AMROUN, S.S. SALAH, R. ALLAT, H. DJOUDI, M. BUSSON, M.C. ABBADI,
D. CHARRON, R. TAMOUZA
Association des polymorphismes fonctionnels de l’IL-1β (-511C/T et +3953C/T) et de
l’IL-1Ra (IL-1Ra 86pb VNTR) avec la spondylarthrite ankylosante dans la région du
Grand Alger.
21ème Congrès Français de Rhumatologie
14-17 Décembre 2008, Paris (France)
Abstract in : Revue du Rhumatisme, 2008, 75: 996.
• H. AMROUN, S.S. SALAH, R. ALLAT, H. DJOUDI, M. BUSSON, M.C. ABBADI,
D. CHARRON, R. TAMOUZA
Etude de l’association HLA classe II et la polyarthrite rhumatoïde chez des patients
Algériens.
21ème Congrès Français de Rhumatologie
14-17 Décembre 2008, Paris (France)
Abstract in : Revue du Rhumatisme, 2008, 75: 1056.
47
3- COMMUNICATIONS AFFICHEES :
Association of Gender-specific association of the VEGF G-634C polymorphism with
Ankylosing Spondylitis in an Algerian patient group.
22th European Conference of Immunogenetics and Histocompatibility,
2-5 Avril 2008, Toulouse (France).
• E. ATTAL, N. ATTAL, R. BELABED, S.S. SALAH, H. AMROUN, M. AIT KACI
AHMED, M.C. ABBADI
Uvéo-cochléo-dermatose unilatérale d’origine auto-immune probable.
d’Immunologie.
• E. ATTAL, N. ATTAL, R. DEHBAOUI, S. SALAH, M. AIT KACI AHMED,
M.C. ABBADI
Syndrome hémichorée-hémiballisme révélateur d’un neuro-lupus.
d’Immunologie.
• H. AMROUN, S.S. SALAH, R. ALLAT, H. DJOUDI, M. BUSSON, H. CONTOURIS,
Tumor Necrosis Factor promoter polymorphism (TNF-α - 308) associated with
ankylosing spondylitis in Algerian patients.
d’Immunologie.
• K. BELANTEUR, F. LOUNES, I. ALLAM, H. AMROUN, A. GUEDOIR,
F. ASSELAH, A. LABIED, M.C. ABBADI
Intérêt du typage HLA dans le diagnostic de la maladie coeliaque.
d’Immunologie.
7èmes journées nationales de Pathologie.
• N. HADJ BEKKOUCHE, N. ATTAL, E. ATTAL, S. MARIR, M. SAADI BELOUIZ,
M. AIT KACI AHMED, M.C. ABBADI
Intérêt du dosage de la neuron specific enolase (NSE) dans le sérum et le liquide
céphalorachidien dans les atteintes neurologiques.
d’Immunologie.
• A. LOUAIL, N. ATTAL, N. HADJ BEKKOUCHE, N. BOUDABA, M.C. ABBADI
Les cryoglobulinémies : à propos de deux cas.
d’Immunologie.
48
• K. DJENOUHAT, S.S. SALAH, H. AIT HAMOUDI, M.C. ABBADI
Lupus érythémateux disséminé et angio-oedème héréditaire : un autre modèle de
maladie auto-immune associée au déficit en complément.
d’Immunologie.
• D. NACI, K. DJENOUHAT, K.D. BERRIMI, M.C. ABBADI
Fréquence des pneumallergènes dans les affections respiratoires allergiques dans la
région d’Alger : A propos de 3737 cas.
d’Immunologie.
• S.S. SALAH, A. LOUAIL, S. ZOUAOUI, S. METATLA, G. HAMMADI,
M. CHEMLAL, N. HADJ-BEKKOUCHE, N. ATTAL, M.C. ABBADI
Etude de la fréquence des anticorps anti-gliadine et anti-tTG chez des donneurs de
sang sains dans la région d’Alger.
• K. CHERGUELAINE, S.S. SALAH, H. AIT HAMOUDI, M.C. ABBADI
Intérêt de l’utilisation du test IMMUNO-DOT (IgG anti-gliadine/ IgG anti-tTG) en cas de
déficit en IgA sériques associé à une maladie coeliaque.
• K. DJENOUHAT, A. KETFI, K.D. BERRIMI, M.C. ABBADI
Reactivity to bromelain in patients with pollen and hazelnut cross-allergy
XXVIIth Congress of the European Academy of Allergology and Clinic al Immunology.
7-11 Juin 2008, Barcelone (Espagne).
• K. DJENOUHAT, M. GHARNAOU, K.D. BERRIMI, M.C. ABBADI
Occurrence of anti-C1q antibodies in hereditary angioedema.
XXIIth International Complement Workshop,
28 Septembre - 02 Octobre 2008, Bâle (Suisse).
• D. ACHELI, S.S. SALAH, C. HAOUHICHET, S. NACER, S. LEHTIHET,
M.C. ABBADI, H. DJOUDI
Étude de l’association HLA classe II et la polyarthrite rhumatoïde chez des patients
Algériens.
21ème Congrès Français de Rhumatologie.
14-17 Décembre 2008, Paris, France.
49
V. ACTIVITES DE FORMATION
1- THESES EN COURS :
• Etude des facteurs de prédisposition aux spondylarthropathies.
AMROUN Habiba (Thèse de Doctorat d’Etat en Sciences Médicales)
• Etude immunogénétique du diabète de type I dans la population infantile algérienne
BENYAHIA Amel (Thèse de Doctorat d’Etat en Sciences Médicales)
• Immunogénétique de la maladie de Crohn en Algérie : Marqueurs prédictifs
et pronostiques.
CHAIB Samia (Thèse de Doctorat d’Etat en Sciences Médicales)
• L’angioedème héréditaire par déficit en C1 inh : Etude immunogénétique
et immunopathologique.
DJENOUHAT Kamel (Thèse de Doctorat d’Etat en Sciences Médicales)
• La maladie coeliaque de l’enfant dans la région de Annaba : aspects
épidémiologique, immunopathologique et immunogénétique.
GADIRI-MERICHE Nassima Sabiha (Thèse de Doctorat d’Etat en Sciences
Médicales)
• Diabète insulino-dépendant : aspects immuno-pathologiques et immunogénétiques
dans la population algérienne.
RAACHE Rachida (Thèse d’Etat en Biochimie)
• Facteurs immunogénétiques impliqués dans l’initiation et le maintien des processus
inflammatoires chroniques. Application au modèle des spondylarthropathies en
Algérie.
SALAH Sofiane Samir (Thèse de Doctorat d’Etat en Sciences Médicales)
50
2- REALISATION DE MEMOIRES :
a) Mémoires en cours :
Nom et Prénom
de l’étudiant
Origine
Intitulé du mémoire
Promoteur
ALLAM Inès
Résidente Immunologie
4ème année
(Faculté de Médecine
d’Alger)
Etude immunogénétique de la
madie coeliaque de l’adulte en
Algérie
BELANTEUR
Khjadidja
BOUTARFA
Nassima
ème
année
4
d’Alger)
Intérêt du test au nitro-Bleu
Tétrazolium dans le diagnostic
de la granulomatose chronique
septique
KECHOUT
Nadia
CHERGUELAIN
Khaled
ème
année
4
d’Alger)
Identification des antigènes
solubles nucléaires par WB
dans le diagnostic
immunologique des
connectivites
KACI
Naima
OUIS Nouara
ème
année
4
d’Alger)
Polymorphisme génétiques des
cytokines et susceptibilité à la
Sclérose en plaques.
ATTAL
Nabila
NACER Saïda
ème
année (Faculté de
4
Médecine d’Alger)
Fréquence des anticorps antiCCP2 et étude de l’association
HLA de classe II chez des
patients atteints de polyarthrite
rhumatoïde.
SALAH
Sofiane
NACI Dalila
ème
année
4
d’Alger)
Diagnostic immunologique des
allergies aux βlactamines :
Mise au point d’un test
d’activation des basophiles par
cytométrie de flux
DJENOUHAT
Kamel
Mémoire de fin
d’Ingéniorat en génie
biologique
(USTHB)
Etude comparative de la
recherche de la cible
antigénique des anticorps antinoyaux par la technique
immuno-enzymatique type
ELISA et la cytométrie en flux
type Luminex lors de
l’exploration des connectivites.
SALAH
Sofiane
HADJADJ Amel
et BENKAALOUL
Samiha
AMAROUCHE
Kenza et HAMDI
Imène
Mémoire de fin
Etude du polymorphisme MICA
d’Ingéniorat en génétique
129 met/val et diabète type 1
(USTHB)
RAACHE
Rachida
51
b) Mémoires réalisés :
Nom et Prénom de
l’étudiant
Origine
AIT HAMOUDI Hiba
4ème année
d’Alger)
Exploration du complément
dans la maladie lupique
BELAIFA Samira
4ème année
d’Alger)
Gènes de susceptibilité HLA
classe II et SEP chez des
patients algériens
BENIDIR Mounira
ème
année
4
d’Alger)
Place de l’épitope partagé dans
la sus- ceptibilité et l’expression
clinico-biologique de la PR chez
des patients algériens
LOUZAI Yamina
ème
année
4
d’Alger)
Distribution des sous-types
HLA B27 chez des patients
avec SPA
Promoteur
DJENOUHAT
Kamel
ATTAL
Nabila
SALAH
Sofiane
AMROUN
Habiba
3- ACCUEIL DE RESIDENTS EN IMMUNOLOGIE (Faculté de Médecine d’Alger) :
Année de résidanat
ère
1
année
2ème année
Stages pratiques
50 heures
20h/semaine durant 26 semaines
06
13 planchages
13 analyses d’articles
36 semaines/résident
année
07
ème
année
07
4
Formation théorique
08
ème
3
52
Nombre
36 semaines/résident
04 mémoires
4- FORMATION HORS ENCEINTE DE L’IPA
Nom de
l’enseignant
Lieu de
l’enseignement
ABBADI
Mohamed Chérif
Faculté de
Médecine d’Alger
AMROUN Habiba
Faculté de
Médecine d’Alger
ATTAL Nabila
Faculté de
Médecine d’Alger
DJENOUHAT
Kamel
Faculté de
Médecine d’Alger
Destinataires de
l’enseignement
Niveau graduation
Pharmacie
♦ Immunologie Générale
(3ème année)
♦ Immunologie Appliquée
(4ème année)
Niveau graduation 3ème
année de Médecine
♦ Immunologie Générale et
Immunopathologie
Niveau Post-graduation
♦ Résidanat d’Immunologie
ème
Niveau graduation 3
année de Médecine
année de Médecine
Immunopathologie
Immunopathologie
Niveau graduation
Pharmacie
ème
année)
(3
ème
année)
(4
année de Médecine
Immunopathologie
Niveau graduation
Pharmacie
Faculté de
Médecine d’Alger
Faculté de
Médecine d’Alger
♦Immunologie Appliquée
(4ème année)
Immunopathologie
ème
année)
(3
ème
année)
(4
année de Médecine
Immunopathologie
Niveau graduation
Pharmacie
SALAH Sofiane
Samir
ème
année)
(3
année de Médecine
Niveau graduation
Pharmacie
KECHOUT Nadia
Type d’enseignement
année de Médecine
(3ème année)
(4ème année)
Immunopathologie
♦ Résidanat de Biologie Clinique
53
IV. FORMATION REÇUE PAR LE PERSONNEL DU SERVICE
Nom Prénom
NATURE DU STAGE
• AMROUN Habiba
• SALAH Sofiane
Samir
Séminaire-atelier de bioinformatique : Méthodes pour
l’étude des polymorphismes
génétiques.
54
Lieu
Durée
Centre de biotechnologie • Du 14/11/2008
au 15/11/2008
de Sfax – Tunisie.
Service de la tuberculose et des Mycobactéries
Chef de Service : Fadéla Boulahbal (Docteur en Médecine/Professeur INESSM)
I- ACTIVITE DE DIAGNOSTIC
L’activité de diagnostic de la tuberculose par l’examen microscopique et la culture est
assurée par le laboratoire de l’annexe du service sis Rue de Oued Kniss.
Les prélèvements sont envoyés par les Unités de Contrôle de la Tuberculose et des
Maladies Respiratoires (UCTMR) essentiellement de la Wilaya d’Alger mais aussi
d’autres wilayas, des services hospitaliers ou des structures de santé privées.
Pour toute culture positive la souche mycobactérienne est identifiée, et un test de
sensibilité aux antituberculeux est fait.
Diagnostic de la tuberculose pulmonaire pour les patients des UCTMR
UCTMR
Mois
Nombre de malades
Culture
positive
Culture
négative
Culture
contaminée
Janvier
111
8
93
10
Février
48
9
34
05
Mars
119
12
100
7
Avril
135
8
125
2
Mai
111
9
92
10
Juin
61
17
41
3
Juillet
45
6
35
4
Août
25
7
13
5
Septembre
53
10
38
5
Octobre
22
5
17
--
Novembre
30
4
26
--
Décembre
37
5
30
2
Total
797
100
644
53
Pour chaque malade, 3 prélèvements pour les patients jamais traités et 2 prélèvements
pour les patients en cours de traitement ou en fin de traitement sont mis en culture, les
examens microscopiques sont faits par les laboratoires de microscopie du centre de
santé.
Pour les prélèvements d'expectoration provenant d’une structure hospitalière, d’une
structure de santé privée non dotée d’un laboratoire de microscopie, un examen
microscopique est pratiqué avant la mise en culture du prélèvement. Le tableau suivant
donne les résultats de cette activitémise en culture de tout prélèvement. Le tableau
suivant donne les résultats de cette activité.
55
Mois
Nombre de
malades
M+C+
M-C+
M-C-
M+C-
Cultures
contaminées
172
12
17
123
1
19
Janvier
Février
146
07
08
112
3
16
Mars
192
14
26
143
1
08
Avril
197
19
22
150
1
05
Mai
170
24
27
112
0
07
Juin
166
18
24
112
2
10
Juillet
131
07
24
097
1
02
Août
165
11
27
115
4
08
Septembre
142
13
07
113
5
04
Octobre
190
16
21
145
2
06
Novembre
158
09
16
124
5
04
Décembre
167
10
27
119
1
10
1996
160
246
1465
26
99
Total
M = Microscopie
C = Culture
Au total, le laboratoire a pratiqué au cours de l’année 2007, 11 490 cultures sur
prélèvements d’expectoration provenant des structures publiques ou privées.
Diagnostic des tuberculoses extra-pulmonaires se fait par la mise en culture d’un ou
plusieurs prélèvements de nature variable selon la localisation de la maladie.
Le tableau suivant donne les résultats suivants.
Résultats des cultures des prélèvements de localisation extra-pulmonaires
Nature du
prélèvement
Résultats de la culture
Positif
Négatif
Contaminée
Total
Urines
14
1203
64
1281
Pus d’adénopathie
10
60
02
72
Ascites
004
42
04
48
L.Pleural
008
93
01
102
L.Synovial
002
23
00
25
Pus Divers
020
79
04
103
LCR
00
13
01
14
Autres
00
21
08
29
Biopsie
00
15
00
15
Le nombre de prélèvements positifs est de 58 soit 3,48%, et 82 prélèvements
contaminés soit 4,85%.
56
Tests de sensibilités aux anti-tuberculeux :
Les antibiogrammes des souches isolées au laboratoire de diagnostic dans le cadre de
l’activité de routine ne sont pas effectués systématiquement sur toutes les souches.
L'antibiogramme n'étant pas indispensable à la prescription du régime thérapeutique et
pour des raisons pratiques, des critères de sélection ont été mis en place :
- L’antibiogramme est pratiqué dans le cadre de la surveillance permanente de la
résistance chez nouveaux cas, sur un échantillon aléatoire à raison d’une souche
testée sur 5 souches isolées de malades jamais traités.
- Par contre, l’antibiogramme est effectué systématiquement sur toute souche isolée
de patient déjà traité (dont le traitement doit être repris pour une rechute, un échec
ou après une reprise évolutive après interruption précoce du primo traitement).
- Pour les souches isolées de localisation extra-pulmonaire et les souches isolées de
tuberculose de l’enfant.
Le laboratoire reçoit des cultures des souches de M.tuberculosis des laboratoires de
CHU pour antibiogramme (CHU Mustapha Alger, CHU Ibn Badis Constantine,
Laboratoire d’Hygiène de Wilaya d’Oran…).
Au cours de l’année 2008 le laboratoire a effectué 629 antibiogrammes sur les souches
de M.tuberculosis selon la méthode des proportions sur milieu solide de LowensteinJensen fabriqué localement.
Les souches isolées de malades nouveaux cas sont testées aux 4 antituberculeux
majeurs (INH, Rifampicine, Ethambutol et Streptomycine), celles isolées chez des
tuberculeux déjà traités sont testées à tous les antituberculeux utilisés pour le traitement
de ces cas récidivants (Ethionamide, Cyclosérine, Kanamycine et l'Ofloxacine). Pour les
cas particuliers (urgence signalée, mauvais état du malade, forte probabilité de souches
multirésistantes), une étude moléculaire pour la recherche rapide par PCR de la
résistance à l'isoniazide et la rifampicine est entreprise.
Nombre de test de sensibilité effectués en 2008 : 533
Avec : 480 antibiogrammes interprétés
53 antibiogrammes non analysables (négatifs, contaminés ou M.atypique)
57
Profils de résistance des souches isolées en 2008 (toutes catégories de malades confondues)
Souches résistantes à
Nombre de souches
% de souches
Streptomycine (SM)
5
1,0
Isoniazide (INH)
9
1,8
Rifampicine (R)
1
0,2
Ethambutol ( E )
0
/
12
2,5
INH/SM
INH/R
7
INH/SMRIF
28
INH/SM/RIF/E
12
INH/RIF/E
2
Total MDR
49
10,2
Total
76
15,3
404
84,1
480
100,0
souches sensibles :
Total
Diagnostic rapide de la résistance de M.tuberculosis à la rifampicine associée
à l’Isoniazide par la technique MTB-DR Plus.
La recherche des gènes de résistance à la rifampicine associée ou non à l'isoniazide est
effectuée par une technique de génotypage (MTBDR plus Hain Lifescience) et le résultat est
disponible au bout de 24 à 48 heures. Ainsi au cours de l’année 2008, 59 tests ont été
effectués chez des sujets présentant une tuberculose chronique, ou chez des sujets
présentant une microscopie positive et vivante en contact avec un tuberculeux ayant une
souche MDR connue.
Antibiogrammes effectués dans le cadre du contrôle externe de la qualité des tests de
sensibilité.
Dans le cadre du programme de l'assurance qualité des tests de sensibilité organisé par
l'OMS comptant pour le « round 2008 », notre laboratoire participe au contrôle organisé par
l'OMS. Dans cet exercice, nous avons reçu 30 souches de M.tuberculosis du laboratoire
chargé du contrôle (laboratoire de mycobactériologie de l'Institut de Médecine Tropicale
d'Anvers, Belgique,) pour faire les tests de sensibilité aux drogues majeures.
Par ailleurs, notre laboratoire fait partie du réseau OMS des laboratoires supra nationaux et
reçoit dans le cadre de l'activité assurance qualité, des souches de plusieurs pays pour
contrôle des résultats de leurs tests. Ainsi au cours de 2008, nous avons pratiqué des tests
de sensibilité sur 30 souches envoyées par le laboratoire national de référence pour la
tuberculose de Nouakchott (Mauritanie).
Activité de supervision et de contrôle du réseau national de laboratoires
- Réseau de microscopie
Le contrôle de l’activité du réseau de laboratoires de microscopie pour le diagnostic de la
tuberculose est institué depuis de nombreuses années et concerne chaque année plus de
50% des microscopistes exerçant dans les structures de santé publique.
Au cours de l’année 2008, les activités de supervision, de contrôle de qualité et de
formation ont été effectuées sur la base d’un programme pré-établi et inscrit dans le
biennum 2007-2008 de l'OMS.
58
Les visites de supervision ont été assurées particulièrement pour 12 sur les
17 UCTMR de la wilaya d’Alger :
Centre de microscopie
Commentaire général
Rais Hamidou
Défaillant, à revoir en urgence
Sidi Moussa
RAS, à suivre
Lazerge Bab El-Oued
RAS, à suivre
Rouiba
Les Sources
RAS, à suivre
Château Neuf
Bach Djarrah
RAS à suivre
El Harrach
RAS, à suivre
H-Dey
RAS, à suivre
Les Annasser
RAS, à suivre
Staoueli
RAS, à suivre
Douéra
RAS, à suivre
Au cours de l’année 2008, 56 secteurs sanitaires répartis sur 13 wilayas, ont été contactés
pour le contrôle de qualité des microscopiste par la technique de « test panel », (c'est-à-dire
par l’envoi d’un kit de frottis de crachats sur lame) constitué de 10 frottis de richesse connue.
50 secteurs sanitaires ont répondu, les résultats sont présentés sur le tableau suivant :
Contrôle de qualité externe des centres de microscopie année 2008
UCTMR avec réponse est correcte
UCTMR avec réponse
incorrecte (microscopiste
à recycler en urgence)
PAS DE REPONSE
Ghazaouat
Akbou (Bejaia)
Ain Ouassara (Djelfa)
Hassi Bahbah
Remchi
Biskra
Messaad (Djelfa)
Djelfa
Tlemcen
Berrouagui
Lakhdaria (Bouira)
Médea
Sig
Gouraya
Ain Bessam (Bouira)
Bejaia
Mohamadia
Cherchell
Ain Boucif (Médea)
Mascara
Si Okba
Kherrata (Bejaia)
Koléa
Sour El Ghozlane
Tolga (Biskra)
Tizi Ouzou
Ould Djellal
Hadjout (Tipaza)
Azzaga
Aokas
Tablat (Médea)
Azzeffoun
Ain El Hammam
M’sila
Méliana
Bouira
Ain El Melh (M’sila)
Ain Salah
Mechdellah
Boussaada (M’sila)
Saida
El Eulma
El Hassana
Boghni
Sidi Aich
Khenchellah
Mahdia
Ain Defla
Frenda
Khemis Miliana
Tiaret
Bougaa
Nedroma
Sétif
Chlef
Ouled Fares
59
- Formation des résidents :
Le laboratoire a accueilli 13 résidents en microbiologie pour compléter leur formation
technique dans le domaine du diagnostic et l’étude de la sensibilité des souches de
M.tuberculosis aux antibiotiques.
- Formation de personnels scientifiques :
Le laboratoire a accueilli en stage de formation aux techniques de laboratoire pour une
durée de 15 jours, une assistante de l’EHS d’El Kettar.
02 Vétérinaires ont été formés aux techniques d’isolement et d’identification de M.bovis
chez les animaux.
Formation de personnels étrangers :
06 techniciens de la République Arabe Sahraoui Démocratique (RASD) ont été formés aux
techniques de diagnostic de la tuberculose pour une durée de 15 jours.
Cours International de Mycobactériologie Médicale et de formation aux techniques
de laboratoire pour le diagnostic de la tuberculose (CIMM 2007)
Le Cours de Mycobactériologie Médicale (CIMM) s’est déroulé du 18 octobre au
13 novembre 2008 à l’Institut Pasteur d’Algérie
Le cours avait comme objectif principal de donner aux participants les connaissances
nécessaires pour diagnostiquer, traiter et prévenir les maladies à mycobactéries les plus
prévalentes comme la tuberculose et la lèpre. L’enseignement a couvert en outre les
aspects organisationnels et de gestion d’un réseau de laboratoire pour le dépistage des cas
contagieux et leur contrôle pendant le traitement dans le cadre d’un programme national.
Les séances de travaux pratiques ont permis l’acquisition des techniques bactériologiques.
L’enseignement s’est déroulé sous forme de conférences et de séances de travaux
pratiques à plein temps matin et après-midi.
Des conférenciers algériens et étrangers ont été sollicités pour donner des cours.
Les conférenciers algériens sont :
D. Larbaoui, P. Chaulet, N. Zidouni, L. Baough, S.Ali Halassa, Ammar Khodja,
M.Benabdelkader, D. Yala, M.Ifticene, M.Djouahra et F. Boulahbal.
Deux conférencières étrangères ont apporté leur aide: Dr Martine Debacker de l’Institut de
Médecine Tropicale d’Anvers Belgique, a été invitée pour traiter de M.ulcerans, agent de
l’ulcère de Buruli et Dr Cristina Guttierrez-Perez a donné des conférences et soutenu
techniquement les séances de travaux pratiques sur les outils moléculaires dans le
diagnostic, la surveillance épidémiologique et la détection des résistances en tuberculose.
Nom, prénom et origine des participants au CIMM 2008
Kimfumu LUSAMBU LEONIE
RDC
Marie Josée. KABEDI
RDC
KOUEGNIGAN Rerambiah Léonard
Gabon
MINIME LINGOUPOU Fanny
RCA
KEZUMUTIMA Peace
Burundi
RAZANAMPANAHY Rosine
Madagascar
RAVOLOLONANDRIANA Pascaline
Madagascar
LAHLOU Ouafae
Maroc
MATA-MINANA CHANTAL
RDC
KOUASSI KOUADIO Francis
Côte d’Ivoire
60
II. ACTIVITE DE RECHERCHE
1. Enquête « C » (F.B, D.Y)
Essai clinique international multicentrique pour l’évaluation d’un régime de traitement
combiné à dose fixe : 4 principes actifs associés dans la même combinaison à dose
fixe, au cours de la phase intensive (8 semaines) de chimiothérapie, suivi d’une
phase de continuation de 18 semaines avec l’association de deux principes actifs
dans la même combinaison à dose fixe.
Objectifs :
L'objectif de l'étude est de comparer l'efficience, l'acceptabilité et la toxicité de deux
régimes de chimiothérapie antituberculeuse chez des tuberculeux pulmonaires
nouveaux cas à microscopie positive.
Le régime à l'étude est un régime de 6 mois comportant l'administration quotidienne
pendant huit semaines de l'association éthambutol, Isoniazide, rifampicine et
pyrazinamide en présentation combinée fixe suivis de 18 semaines de l'association
rifampicine et isoniazide en combinaison fixe trois fois par semaines.
Ce régime est comparé au régime comportant les mêmes drogues mais en
présentation séparée durant la première phase suivi de 18 semaines d'administration
trois fois par semaines de RH en présentation combinée.
Au cours de cette enquête, 50 patients répondant aux critères d'admission ont été
inclus. Les examens microscopiques, les cultures et les tests de sensibilité ont été
pratiqués pour les 50 souches isolées. Un échantillon de chaque souche a été
envoyé au laboratoire de référence supranational (Institut de Médecine tropicale,
Anvers, Belgique) pour antibiogramme.
Dans le cadre de cette enquête nous avons reçu chaque année, la visite d'experts en
laboratoire envoyés par le laboratoire de référence supra national pour évaluer les
conditions de déroulement de l'enquête dans notre laboratoire.
Le suivi bactériologique des malades recrutés dans cette enquête s’est terminé en
décembre 2008.
Les résultats de cette enquête feront l’objet d’un article international dans la revue de
l’Union en 2009.
2- Apport de la biologie moléculaire dans l’épidémiologie de la tuberculose
(M.I, FZ.G)
Les tests de biologie moléculaire pratiqués depuis quelques années dans le service
ont été appliqués à l’étude de la transmission de la tuberculose dans la population.
Les tuberculoses à bacilles multirésistants (résistants à Isoniazide et Rifampicine au
moins), les tuberculoses à mycobacterium bovis ainsi que les souches isolées de
tuberculeux venant de zones géographiques déterminées, ont fait l’objet de tests
moléculaires pour l’étude de leur profil particulier. Deux techniques sont couramment
pratiquées dans le laboratoire ; le spoligotyping et la méthode RFLP
61
Application de la méthode RFLP :
Cette méthode a été appliquée à l’analyse épidémiologique des cas suspectés d’avoir un
lien épidémiologique.
Au cours de l’année 2008, 35 souches de M.tuberculosis isolées de malades ayant des
liens épidémiologiques très probables ont été analysées par la méthode RFLP.
Application de la méthode de Spoligotyping :
La méthode du spoligotyping permet à la fois d’identifier et de comparer les profils
moléculaires des souches de mycobactéries du complexe tuberculosis (M.tuberculosis,
M. bovis, et M.bovis BCG en particulier).
Au cours de l’année 2008, 58 souches ont été analysées par la technique de
spoligotyping.
Afin de comparer et analyser les différents profils moléculaires des souches transmises
dans la population, identifiée par RFLP et/ou par spoligotyping, les profils génomiques
sont introduits progressivement dans le logiciel Bionumerics.
Mission et participation à des manifestation scientifiques et ateliers :
Missions :
Dr D. Yala a effectué une mission d’expertise du réseau de laboratoires du PNLT de la
Mauritanie du 9 au 19 août 2008.
Pr. F. Boulahbal
A participé aux réunions préparatoires de la "conférence ministérielle d'Alger sur
la recherche pour la santé dans la région africaine "et à la Conférence ministérielle
qui s'est tenue au Palais des nations à Alger du 23 au 26 juin 2008
A participé au Comité technique d'évaluation des projets (TRC/GDF) à l'OMS Genève
du 23 au 27 septembre 2008
A assuré une consultation au Maroc auprès du PNT- Fonds Mondial 23 au 29 Mars 2008
A participé aux travaux du Global Laboratory Initiative organisé conjointement par l'OMS
et la Fondation Mérieux à Annecy- Verrier du Lac France les 8 et 9 mai 2008
A participé à l'Assemblée Générale de l'ONUSIDA au siège de l'ONU à New york, du 8
au 12 juin 2008. La mission était conduite par Monsieur Tou, Ministre de la santé, de la
Population et de la Réforme hospitalière
62
Manifestations scientifiques et ateliers :
- F. BOULAHBAL ; D. YALA : Organisation de la Journée d’étude sur l’enseignement à
distance en sciences médicales. Organisée par la Faculté de Médecine d’Alger. IPA
12 mars 2008.
- D.YALA, K. KAID: Organisation d’un séminaire-atelier sur la formation aux techniques
du e-learning sous l’égide de la Faculté de médecine d’Alger. Alger 13-15 juillet 2008.
- F. BOULAHBAL : Présentation sur les acquis du projet euro-mediterranéen sur le elearning appliqué à l'enseignement à distance de la tuberculose aux médecins
généralistes; IPA 12 mars 2008
- D. YALA. Démonstration de l’utilisation interactive d’un module sur la plate forme
« Emphis.org ». Journée d’étude sur l’enseignement à distance en sciences médicales.
Organisée par la Faculté de Médecine d’Alger. Alger IPA 12 mars 2008
- D. YALA, K. KAID. Présentation d’un dispositif e-learning (plat forme COSELEARN).
Journée d’étude sur l’enseignement à distance en sciences médicales. Organisée par
la Faculté de Médecine d’Alger. Alger IPA 12 mars 2008.
- AM. DJOUAHRA, D.YALA, M.IFTICENE et F.BOULAHBAL. Le développement du
diagnostic de la tuberculose pulmonaire au laboratoire. Journée mondiale de la
tuberculose ; Ecole sportive de Draria. 24 mars 2008.
- M. IFTICENE, FZ. GACEM, S. SLIMANI, Z. SEMRA, F. SMATI, D. YALA ;
F.BOULAHBAL. L’apport du test MTB-DR dans le diagnostic de la résistance de
M.tuberculosis à la rifampicine associée à l’Isoniazide. Journée Mondiale de la
Tuberculose. Ecole Sportive de Draria. 24 mars 2008.
- F. BOULAHBAL : JOURNEES d'Infectiologie de la Société d'Infectiologie de Sétif
29 et 30 avril 2008: Présentation d'une communication orale sur " La résistance de
Mycobacterium tuberculosis aux antituberculeux. Situation en Algérie et mesures à
prendre dans le cadre du PNT".
- AM. DJOUAHRA, D.YALA, M.IFTICENE ET F.BOULAHBAL. Le risque de
transmission de la tuberculose pulmonaire en milieu hospitalier. Poster 1ere journée
Hygiène hospitalière et de lutte contre les infections nosocomiales. Palais de la culture.
21 mai 2008.
- D. YALA. Membre du comité d’organisation de la 1ère Journée de Société Algérienne
de Microbiologie Clinique (SAMIC): thème « Maladies infectieuses émergentes et réémergentes » Palais de la culture, Alger le 29 Mai 2008.
- D. YALA, M.IFTICENE; FZ.GACEM, F. BOULAHBAL. Diagnostic rapide de la
résistance de M.tuberculosis à la Rifampicine et à l’Isoniazide. 1er journée de la Société
Algérienne de Microbiologie clinique « SAMIC ». au Palais de la Culture Alger. 29 mai
2008.
- M. IFTICENE ; FZ. GACEM ; S. SLIMANI ; Z. SEMRA ; F. SMATI ; D. YALA ;
F. BOULAHBAL. L’apport du test MTB-DR dans le diagnostic de la résistance de
M.tuberculosis à la rifampicine associée à l’Isoniazide. 1er journée de la Société
Algérienne de Microbiologie clinique « SAMIC ». au Palais de la Culture Alger. 29 mai
2008.
- AM. DJOUAHRA, D.YALA, M.IFTICENE et F.BOULAHBAL. Le développement du
diagnostic de la tuberculose pulmonaire au laboratoire. poster : 1er journée de la
Société Algérienne de Microbiologie clinique « SAMIC ». Palais de la Culture Alger.
29 mai 2008.
63
- D. YALA, F. BOULAHBAL. Impact of the environment factors on the transmission of
tuberculosis in the community. Conférence scientifique internationale du réseau des
Instituts Pasteur. 26-27 juin 2008 à Paris.
- SAHRAOUI Naima, MULLER Borna, YALA Djamel, OUZROUT Rachid, ZINSSTAG
Jakob, BOULAHBAL Fadila and GUETARNI Djamel. Diagnostic de la tuberculose
bovine en Algérie. Les 4ème Journées Scientifiques de Microbiologie. Monastir du 07 au
09 Novembre 2008.
Publication
- SAHRAOUI Naima, MULLER Borna, YALA Djamel, OUZROUT Rachid, ZINSSTAG
Jakob, BOULAHBAL Fadila and GUETARNI Djamel. Investigation about the bovine
tuberculosis in two Algerian slaughterhouses. African Journal of Agricultural Research
Vol. 3 (11), pp. 775-778, November, 2008.
- SAHRAOUI Naima., YALA Djamel, OUZROUT Rachid, BOULAHBAL Fadila
et GUETARNI Djamel. Enquête sur la tuberculose bovine dans deux abattoirs
d’Algérie. Archives de l’Institut Pasteur d’Algérie. T.66 2007/2008.
- Wright Abigail, F. BOULAHBAL et all (sous presse) The Lancet -D-08-04734. The antituberculosis drug resistance in the world, 2002-2007
64
Laboratoire des Bactéries Anaérobies et du Botulisme
Chef du laboratoire : Asmah Saïda MERAD (Ph. MAT. INESSM)
I. ACTIVITE DE DIAGNOSTIC ET DE REFERENCE
A. L’unité de diagnostic :
• Les techniques de diagnostic sont constamment remises à jour pour être améliorées
et le diagnostic est supervisé, toute l’année par Mme AS. MERAD.
• La mise en évidence, l’identification et les tests de sensibilité aux antibiotiques des
bactéries anaérobies à partir de prélèvements divers, reçus de tout le territoire
national, sont effectués afin d’établir la place qu’occupent ces bactéries dans les
différentes infections et l’antibiothérapie adéquate selon le type d’infection.
• Les milieux pour bactéries anaérobies subissent un contrôle de qualité et certains
d’entre eux sont préparés en chambre anaérobie par le personnel du service (milieux
de transport, milieux TGYV…).
B. L’unité de référence :
• Identification ou confirmation de diagnostic des souches anaérobies isolées dans
d’autres laboratoires.
• Surveillance continue et diagnostic de tous les cas suspectés de botulisme humain
et/ou animal.
1. PRELEVEMENTS EXAMINES
Les prélèvements n’étaient plus reçus à partir de Novembre 2007 pour cause de
déménagement à Dely Ibrahim.
1.1- Pus d’oreille
9 60 pus d’oreille provenant de patients souffrant d’otites moyennes chroniques ont
été traités.
9 46,6% d’entre eux contient des bactéries anaérobies, le plus souvent associées
aux bactéries aérobies et/ ou aux levures, avec en moyenne 03 bactéries
différentes par prélèvement.
Les bacilles à Gram négatif anaérobies prédominent (47,6%) avec par ordre de
fréquence des Bacteroides du groupe fragilis suivi de Prevotella puis de
Fusobacterium.
Dans le pus d’oreille d’une patiente de 21 ans, il a été isolé Capnocytophaga
ochracea associé à Pseudomonas maltophila, Fusobacterium nucleatum et Prevotella
melaninogenica.
Les bacilles à Gram positif anaérobies (42%) sont essentiellement constitués
de Actinomyces sp et de Propionibacterium acnes.
Les cocci à Gram positif (28%) sont des Peptostreptococcus sp.
65
Les bactéries aérobies isolées et identifiées en parallèle sont, par ordre de fréquence,
Pseudomonas aeruginosa (19), Streptococcus sp (14) dont 02 sont des Streptococcus
pneumoniae isolés chez des enfants de quatre et six ans, des Enterobactéries(13), des
champignons (13 Candida sp et Aspergillus), Staphylococcus aureus (07), enfin,
Haemophilus influenzae type b (03) isolés chez trois enfants dont deux sont âgés de
02ans et un de 18 mois..
1.2- Lésions du pied diabétique.
• 14 pus provenant de lésions du pied diabétique ont été analysés, 04 prélèvements
étaient négatifs.
• 08 prélèvements sur 10 contenaient des bactéries anaérobies le plus souvent
associées aux bactéries aérobies et deux fois associées aux bactéries aérobies et
aux levures.
Une moyenne de 3,4 germes est isolée par prélèvement.
Bacteroides du groupe fragilis sont isolés 05 fois, Prevotella 04 fois, Porphyromonas
03 fois, Peptostreptococcus 02 fois et Propionibacterium 01 fois.
Les bactéries aérobies associées sont, par ordre de fréquence, des streptocoques
(06), des entérobactéries (05), de staphylocoques (03) etPseudomonas sp (01).
1.3- Infections sur matériel d’ostéosynthèse
• 17 prélèvements ont été analysés, 05 sont négatifs.
• 08 prélèvements sur 11 contenaient des bactéries anaérobies le plus souvent
associées aux bactéries aérobies (06/08).
Une moyenne de deux germes est isolée par prélèvement.
Bacteroides du groupe fragilis sont isolés 04 fois, Prevotella sp ainsi que
Propionibacterium 02 fois, Actinomyces odontolyticus ainsi que Peptostreptococcus sp
01 fois.
Les bactéries aérobies associées sont, par ordre de fréquence,des staphylocoques(04),
des streptocoques (03), des entérobactéries (02) ainsi que des bacilles à Gram négatif
oxydatifs (02).
1.4- Abces du cerveau
• 09 prélèvements ont été analysés, 05 sont négatifs.
• Dans un abcès de l’angle fronto cérébelleux d’un enfant âgé de 09 ans,faisant
probablement suite à une otite mal soignée, il a été isolé Enterobacter cloacae,
Bacteroides thetaiotaomicron ,Prevotella sp et Peptostreptococcus sp.
• Dans un empyème sous dural d’un patient âgé de 22 ans il a été isolé Actinomyces
naeslundii et Prevotella sp.
• Dans un abcès du cerveau d’un patient âgé de 18 ans et souffrant de céphalées
depuis 15 jours, Capnocytophaga ochracea a été isolé.
• Dans un pus d’abcès intra crânien ponctionné chez une petite fille âgée de cinq
ans ayant une malformation de Dandy Walker,il a été isolé un Streptocoque alpha
hémolytique ne poussant qu’en anaérobiose en primo culture.
66
1.5- Pus divers
• 74 prélèvements divers ont été analysés, 27 d’entre eux étaient négatifs.
• 11 contenaient des bactéries anaérobies (19%).
• 06 bacilles à Gram positif (Propionibacterium acnes, Actinomyces odontolyticus),
Actinomyces sp ont été isolés d’un liquide synovial du genou et d’une ulcération
nasale.
• 05 bacilles à Gram négatif (Bacteroides fragilis, Porphyromonas sp, Prevotella
oralis).
• 02 Peptostreptococcus asaccharolyticus.
• Bacteroides fragilis a été isolé d’un abcès fessier, d’un patient diabétique.
• Porphyromonas sp a été isolé d’un abcès rénal provenant d’un enfant de deux ans,
et était associé à un Streptocoque et à un Proteus mirabilis.
• Le deuxième Porphyromonas a été retrouvé, associé à un Streptocoque et à un
Escherichia coli, dans un pus scrotal d’un patient diabétique.
• Le troisième, dans un abcès mammaire, associé à Peptostreptococcus
asaccharolyticus, Propionibacterium acnes et à un Streptocoque.
• Prevotella oralis, associé à un Streptocoque a été isolé d’un abcès du foie.
• 46 prélèvements ne contenaient que des bactéries aérobies soient seules soit
associées entre elles ou avec des Candida sp. Staphylococcus aureus vient en
premier suivi des Entérobactéries puis des Streptocoques et enfin, des levures ont
été isolées de trois prélèvements.
1.6- Selles
• 12 prélèvements de selles nous ont été adressés pour la recherche de Clostridium
difficile.
• Clostridium difficile a été isolé dans les selles diarrhéiques d’un enfant de 07 ans,
hospitalisé dans le service de pédiatrie de l’hôpital de Bologhine, souffrant de
déficit immunitaire profond en Ig A , d’une hépatite B évolutive post transfusionnelle
et d’une anémie hémolytique auto immune.
1.7- Prélèvements d’organes
• 19 prélèvements d’organes (rein, cœur, foie, caillette, rumen, rate, intestin)
provenant de mouflons à manchettes et de mouflons corses du parc zoologique
d’Alger nous ont été adressés pour la recherche de Clostridium perfringens et du
toxinotype dans le cadre d’une suspicion d’entérotoxémie.
• Clostridium perfringens a été isolé dans dix sept d’entre eux. Les souches ont été
conservées en attendant de recevoir les réactifs pour toxinotypage.
• 37 autres prélèvements d’organes provenant d’ovins (contenus d’intestin),
provenant de plusieurs wilayates, nous ont été, également, adressés pour la
recherche de Clostridium perfringens et pour toxinotypage.
• Clostridium perfringens a été isolé dans douze prélèvements et cinq d’entre eux
appartenaient au toxinotype D, par ELISA.
67
1.8- Recherche de toxine botulique : Test de toxicité sur souris et séroneutralisation
• Deux sérums, provenant respectivement d’un enfant de 04 ans qui, suite à
l’ingestion de fromage, a présenté un coma avec détresse respiratoire et d’un
adulte âgé de 26 ans présentant des troubles de la conscience et détresse
respiratoire suite à un repas pris dans un restaurant, ont été analysés.
• Dans les deux cas, le résultat était négatif.
1.9- Sérologie tétanos
• 05 sérums ont été analysés.
• Les taux d’anticorps antitétaniques retrouvés sont de :
9 2,20UI/ml ; 1,75UI/ml ; 1,24 UI/ml qui équivalent à une marge de protection à
long terme, avec un contrôle conseillé au bout de 05-10 ans.
9 0,57UI/ml qui équivaut à une protection fiable avec un contrôle conseillé au
bout de 02 ans.
9 0,044UI/ml qui correspond à un faible taux d’anticorps sans aucune protection
pour le patient et une recommandation d’injection de rappel immédiate ainsi
qu’un contrôle du taux d’anticorps 04-06 semaines plus tard. Ce patient, âgé de
60 ans et originaire de Tizi Ouzou, était hospitalisé pour trismus et paralysie
pharyngée certainement dus au tétanos.
1.10- Souches à identifier
• 53 souches nous ont été adressées soient dans des boites de Pétri soient dans
des tubes gélosés. Les germes identifiés sont les suivants :
9 Bacteroides fragilis (03)
9 Bacteroides thetaiotaomicron
9 Bacteroides capillosus
9 Prevotella intermedia
9 Porphyromonas asaccharolytica (02)
9 Peptostreptococcus asaccharolyticus (02)
9 Propionibacterium acnes (02)
9 Clostridium perfringens : Isolé de deux flacons d’ hémoculture d’un patient
opéré d’un adénocarcinome duodénal avec métastase hépatique depuis 15
jours et hospitalisé dans les urgences cardiaques pour endocardite infectieuse
sur valve mitrale suspectée être d’origine fungique ou à Entérobactéries.
9 Clostridium perfringens (06) : Isolés à partir de lait de vache cru, de moules, de
thon à l’huile et de levure de bière.
9 Clostridium perfringens (15) : Isolés des organes (foie, rate, intestin) de
poussins de chair, âgés entre 20 et 44 jours, de dindes et de lapins.
9 Clostridium sporogenes (03) : Isolés à partir de fromage fondu conditionné
dans des boites de conserve et de farine.
9 Clostridium cadaveris (01) : Isolés de levure de bière.
9 Clostridium septicum (01) : Isolé de lait de vache cru.
9 14 tubes gélosés ne contenaient pas de bactéries anaérobies.
68
III. ACTIVITE DE RECHERCHE
1. UNITE DE SURVEILLANCE DE LA RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES
- Bacteroides du groupe fragilis est un bacille à Gram négatif isolé dans tous les
types d’infection et résistant à de nombreux antibiotiques usuellement prescrits
(péni G, aminopénicillines, carboxypénicillines, céphalosporines de première et
troisième génération et même parfois à toutes les bêta lactamines par sécrétion
d’une imipènémase ,macrolides et lincosamides, aminosides, fluoroquinolones et,
depuis quelques années, les nitro imidazolés voient leur activité diminuée vis à vis
de certaines souches),aussi une surveillance continue est nécessaire.
La recherche d’une céphalosporinase est réalisée sur toutes les souches isolées et
elle est présente à 100%. Les CMI de toutes les souches de Bacteroides fragilis
sont effectuées.
- Le pourcentage des résistances est le suivant :
Antibiotique Bacteroides fragilis fragilis Bacteroides indologènes
Ampicilline 90 84
Cefalexine 100 92
Ticarcilline 48 84
Piperacilline 32 34
Cefotaxime 100 100
Imipeneme 0 0
Amox- Ac clavulanique 0 0
Cefoxitine 5,5 42
Chloramphenicol 0 0
Clindamycine 27 25
Tetracycline 42,5 42
Metronidazole 0 0
- La recherche de souches à sensibilité réduite vis-à-vis du métronidazole et l’étude
du gène codant l’imipénémase par PCR, seront effectives dès que les réactifs
commandés seront disponibles.
- La recherche des béta lactamases des souches de Prevotella sp et Porphyromonas
sp est en cours de mise au point. La pigmentation des souches gène la lecture,
aussi allons nous tenter une autre technique.
- Surveillance de la résistance aux antibiotiques de Clostridium difficile.
69
2. UNITE DE SURVEILLANCE DE CLOSTRIDIUM DIFFICILE
Nous avons reçu 05 selles diarrhéiques d’enfants âgés entre 16 mois et 07 ans et
hospitalisés dans le service de pédiatrie de l’hôpital de Bologhine.
Une seule souche a été isolée et provenait des selles d’un enfant de 07 ans
immunodéprimé et ayant une hépatite B active.
La recherche des gènes codant les toxines A et B a été réalisée.
La recherche des gènes codant la toxine binaire et le ribotypage seront étudiés
ultérieurement dès que les réactifs commandés seront disponibles.
3. UNITE DE SURVEILLANCE DU BOTULISME
Deux cas de suspicion de botulisme nous ont été adressés.
Nous n’avons reçu que les sérums qui étaient négatifs. Les aliments suspects n’ont
pas été envoyés.
Une thèse de doctorat sur la purification et la caractérisation des anticorps
neutralisant l’effet de la toxine botulique de type A est en cours par
Melle L. AMROUCHE
Cette étude est réalisée pour l’application au diagnostic de séroneutralisation de la
toxine botulique de type A.
4. UNITE D’AUTRE DES TOXINES ELABOREES PAR LES AUTRES BACTERIES
ANAEROBIES
- Recherche des souches de Bacteroides fragilis entérotoxinogènes.
Le gène codant l’entérotoxine est mis en évidence par PCR. 27% des souches
isolées de prélèvements divers sécrète une entérotoxine
- Recherche des gènes codant l’entérotoxine de Clostridium perfringens par PCR.
- Toxinotypie de souches de Clostridium perfringens isolées à partir d’organes
d’animaux par ELISA.
- Mise en évidence par PCR des gènes codant les toxines alpha, béta, epsilon de
Clostridium perfringens isolés à partir d’organes d’animaux
5. UNITE DE SURVEILLANCE DU TETANOS
- 05 tests ELISA ont été réalisés pour la recherche des anticorps anti tétaniques.
- Pour quatre d’entre eux, les examens ont été réalisés pour vérifier l’état
immunitaire des patients.
- Le cinquième examen a été réalisé pour confirmer un diagnostic clinique de
tétanos et provenait de l’hôpital de Tizi Ouzou.
6. SOUCHOTHEQUE
Toutes les souches anaérobies isolées sont conservées pour des études ultérieures.
Cette année 2008, nous avons été privés de notre congélateur, qui est resté au
niveau d’El Hamma en attendant que les problèmes d’électricité soient résolues à
Delly Ibrahim (IPA), de sorte que plusieurs de nos souches ont été perdues, ce qui
est fort regrettable.
70
III. ACTIVITES DE FORMATION
1. FORMATION DISPENSEE A L’IPA. (A.S. MERAD).
a - Post graduation :
Résidanat de microbiologie. (12) résidents ont été reçus dans le service cette
année 2008.
Thèse de doctorat de Melle Amrouche en collaboration avec le Laboratoire
recherche et développement sur les venins.
b - Graduation
2- FORMATION DISPENSEE EN DEHORS DE L’IPA (AS. MERAD)
Enseignement (cours, TP, planchages) aux étudiants de troisième et quatrième
année de pharmacie et aux résidents de microbiologie et de biologie clinique.
71
72
Laboratoire de Biologie Parasitaire
Chef de laboratoire : Fatma BACHI (Professeur en Parasitologie – Mycologie).
Le laboratoire de biologie parasitaire a pour mission le diagnostic, la recherche et la
formation.
Il se compose de 05 unités :
Unité toxoplasmose : Centre National de Référence.
Unité leishmaniose.
Unité helminthiases.
Unité coprologie parasitaire.
Unité biologie moléculaire.
6523 prélèvements, toutes analyses confondues ont été réalisées dans le laboratoire
de biologie parasitaire.
1- Unité toxoplasmose : Centre National de Référence Toxoplasmose (CNR
Toxoplasmose).
Ses missions sont :
¾ Diagnostic biologique de la toxoplasmose et le suivi sérologique des gestantes
afin de prévenir la toxoplasmose congénitale.
¾ Diagnostic biologique des choriorétinites toxoplasmiques.
¾ Diagnostic biologique des encéphalites toxoplasmiques
chez
les
immunodéprimés.
¾ Collaboration avec les gynécologues et les pédiatres pour la prévention puis la
prise en charge des toxoplasmoses congénitales.
¾ Contrôle de la qualité des Kits de réactifs Toxoplasmose.
¾ La formation
Les prélèvements adressés pour le diagnostic de la toxoplasmose sont divers et
peuvent être soit du sang (sérum), liquide amniotique, placenta, sang du cordon
ombilical, liquide céphalo-rachidien (LCR) ou humeur aqueuse (HA).
Le diagnostic de la toxoplasmose peut être direct ou indirect.
Le diagnostic direct repose sur l’inoculation du produit pathologique, liquide
amniotique, placenta, H.A ou L.C.R. par voie intra péritonéale à la souris Balb C et
de faire par la suite une sérologie murine et 45 jours après l’inoculation, sacrifier la
souris et rechercher les kystes de Toxoplasma gondii dans le cerveau.
Le diagnostic indirect séro-immunologique est réalisé par plusieurs techniques,
l’I.F.I, essentiellement pour la sérologie murine, l’ELISA BIORAD, Axsym M.E.I.A.
Le diagnostic séro-immunologique concerne les 2 classes d’immunoglobulines
pour une bonne interprétation du résultat et afin d’arriver à une conclusion
avec une conduite à tenir.
73
Pour dater la contamination maternelle au cours de la grossesse et évaluer le risque
fœtal, l’Indice d’Avidité est calculé chez toutes les gestantes ayant un résultat
suspect d’une toxoplasmose évolutive.
Concernant les choriorétinites toxoplasmiques et les encéphalites, les sérums sont
traités en parallèle avec l’humeur aqueuse et le LCR respectivement en Western Blot
pour confirmer ou infirmer l’étiologie toxoplasmique.
Ainsi le CNR Toxoplasmose a reçu :
9 Sérums : 4058 sérums, tous soumis à une recherche d’IgM et d’IgG, soit 4058
IgG et 4058 IgM.
Parmi les sérums positifs, 190 nécessitaient un Indice d’Avidité qui a été fait.
Puis à l’accouchement, 21 parmi les gestantes ayant fait une toxoplasmose
évolutive ont bénéficié d’un Western Blot en parallèle à leurs nouveaux nés pour
confirmer ou infirmer une toxoplasmose congénitale.
9 H.A : 04 en parallèle avec leurs sérums.
04 sérologies classiques reprises par Western Blot.
9 LCR : 02 en parallèle avec leurs sérums adressés pour suspicion d’encéphalite
toxoplasmique chez des sujets VIH positifs. Le diagnostic sérologique classique
suivi par le Western Blot a permis d’exclure cette étiologie.
9 LA : 01 prélèvement adressés dans le cadre d’un diagnostic anténatal pour une
inoculation à la souris.
9
Placenta : 22 inoculations à la souris qui sont revenues toutes négatives.
9 Sang du cordon : 17 ont fait l’objet d’une inoculation à la souris.
Les placentas et les sangs du cordon nous ont été adressés dans le cadre du
diagnostic néonatal de la toxoplasmose congénitale.
Le point positif du CNR Toxoplasmose pour l’année 2008 est le nombre de
prélèvement de placenta et du sang de cordon reçus. En effet, cela témoigne d’une
sensibilisation des gynécologues au problème de la toxoplasmose congénitale avec
une meilleure prise en charge de ce diagnostic.
Le deuxième point positif est la mise au point de la PCR dans le diagnostic de la
toxoplasmose. Cette mise au point a fait l’objet d’un mémoire de fin d’étude de
spécialité Parasitologie-Mycologie qui est en cours de rédaction et sera soutenu
Mars 2009.
2- Unité de Leishmaniose
Cette unité assure le diagnostic de la leishmaniose cutanée, la leishmaniose
viscérale et la leishmaniose canine. Le diagnostic de la leishmaniose cutanée repose
sur un examen direct d’un prélèvement (frottis colorés par le MGG) et une mise en
culture sur le milieu usuel. Quant à la leishmaniose viscérale c’est essentiellement un
diagnostic sérologique qui est fait par IFI et par Western Blot dans certaines
situations. Dans certains cas les pédiatres nous contactent pour une ponction de
moelle osseuse sur laquelle une recherche de leishmanies est effectuée.
Le diagnostic de la leishmaniose canine est posé par une sérologie en IFI, une
hémoculture et une leucocytoconcentration.
74
Cette unité a effectué 811 analyses dont :

209 prélèvements pour L. cutanée

08 ponctions de moelle osseuse

151 sérologies pour L. viscérale

53 sérologies pour L cutanée

380 sérologies pour L. canine

10 hémocultures
La Leishmaniose cutanée
209 prélèvements cutanés, frottis et culture sur milieux usuels avec :

33 examens directs positifs.

42 cultures positives.
Les sérologies, 53, étaient toutes négatives.
La Leishmaniose viscérales
151 sérums traités en IFI avec 09 positifs au delà du seuil de positivité alors que 23
ont montré une faible positivité, au 1/20 et au 1/40, qu’il fallait interpréter dans leurs
contextes cliniques et épidémiologiques, 15 parmi ces sérums ont bénéficié d’un
Western-Blot, ce qui a permis de corriger le diagnostic dans 11cas (WB positifs).
Dans le cadre du diagnostic de la leishmaniose viscérale, nous avons reçus
également 08 ponctions de moelle osseuse pour examen direct et mise en culture
La Leishmaniose canine
380 sérums traités en immunofluorescence indirecte (IFI) avec 54 positifs.
10 hémocultures dont 02 positives.
3- Unité Helminthiases
Cette unité s ‘occupe du diagnostic de 3 helminthiases essentiellement, l’hydatidose,
la bilharziose uro-génitale et la distomatose hépatobiliaire.
A côté du diagnostic de ces helminthiases, celui de l’amibiase et du paludisme est
assuré. Elle a reçu un total de 653 prélèvements.
a) Hydatidose
514 prélèvements sanguins ont été adressés au service pour une sérologie
hydatique
et
ont été
traités
en hémagglutination passive
(HAP),
immunoélectrophorèse (IEP) et/ou en immunodiffusion (ID). Sur les 514
prélèvements, 125 étaient positifs. Parmi les négatifs, 74 ont été traités en Western
Blot et 26 sont revenus positifs.
04 liquides biologiques ont été également adressés pour la recherche de crochets
hydatiques par un examen direct dont un était positif.
75
b) Bilharziose uro-génitale
29 urines : examen direct après centrifugation dont 28 négatives et une urine
positives (Africain d’origine malienne).
13 sérologies en H.A.P (Kit Fumouze), toutes négatives
c) Distomatose hépato-biliaire
04 sérologies par H.A.P et IEP, toutes négatives.
d) Paludisme
Au cours de l’année 2008, le service a reçu 46 sujets pour suspicion de paludisme et
qui ont été prélevés pour un frottis et une goutte épaisse. Un seul prélèvement était
positif, il avait montré Plasmodium falciparum.
e) Amibiase
43 sérologies amibiennes par la technique d’hémagglutination passive ont été
réalisées dont une s’est révélée positive.
4- Unité Coprologie parasitaire
955 prélèvements dont :

872 selles

26 scotchs test

57 prélèvements vaginaux
Les prélèvements de selles ont étés soumis à un examen direct et des techniques de
concentration, la technique de Ritchie modifiée, la technique de Willis, la technique de
Kato et la coloration de Kohn pour le diagnostic d’espèce des amibes. Pour certaines
selles et en fonction du contexte épidémiologique et clinique, la recherche de
Cryptosporidium par la technique de Ziehl Neelsen modifiée a été réalisée.
Les prélèvements provenaient des hôpitaux, personnel des restaurants et dans la
majorité des cas de malades externes.
Sur les 872 selles, 69 étaient positives.
Les parasites retrouvés sont :
♦ Kyste d’Entamoeba histolytica
♦ Kyste de Giardia intestinalis.
♦ Trophozoite de Giardia intestinalis.
♦ Kyste d’Entamoeba coli.
♦ Kyste d’Endolimax nanus
♦ Kyste de Pseudolimax butschlii
♦ Blastocystis hominis
♦ Arthrospores de Geotrichum.
♦ Oocyste de Cryptosporidium
76
Les prélèvements vaginaux ont étés traités par un examen direct.
Sur les 57 prélèvements vaginaux, 01 était positif.
Concernant les scotchs test de Graham, 26 examinés et 02 positifs avec œuf
d’Enterobius vermicularis.
II. ACTIVITE DE SANTE PUBLIQUE
Durant l’année 2008, le service n’a assuré aucune activité de santé publique en
dehors du diagnostic des malades. Aucune demande d’enquête n’a été formulée.
III. ACTIVITE DE PRODUCTION
A) Production de milieux de culture
4000
tubes de milieux N.N.N = gélose au sang de lapin.
1200
tubes de milieu sérum de lapin coagulé.
600
20
flacons de milieu C.C.S = cœur + cerveau + sang.
litres de milieu RPMI 1640.
200
tubes citratés
B) Les Antigènes parasitaires :
1200
Ag
lames d’Ag figuré de Leishmania pour la réaction d’IFI.
soluble de Leishmania pour le Western Blot.
Sensibilisation
des feuilles de nitrocellulose par l’Ag leishmanien pour Western
Blot.
Ag
soluble de Toxoplasma pour la mise au point du Western Blot.
Ag
hydatique lyophilisé. Cette production est le fruit d’un travail de terrain. En effet,
Monsieur L. Boudhane sortait durant tout le mois de ramadhan, comme chaque
année, sur les abattoirs pour ramasser les viscères parasités qui ont été traités au
niveau du laboratoire.
Hématies
de mouton sensibilisées par de l’Ag hydatique pour la technique H.A.P.
IV. ACTIVITE DE REFERENCE
Le L.N.R Toxoplasmose a eu à :
• Confirmer ou infirmer le caractère évolutif de la toxoplasmose chez 190 gestantes
adressées des CHU et du secteur privé et cela par l’Indice d’Avidité.
• Confirmer ou infirmer une toxoplasmose congénitale chez 21 nouveaux nés par le
Western Blot.
• Confirmer ou infirmer l’étiologie toxoplasmique de 04 choriorétinites par Western
Blot.
• Confirmer ou Infirmer l’étiologie d’encéphalite toxoplasmique chez 02 personnes
VIH positive par Western Blot
77
V. ACTIVITE DE RECHERCHE
Projet de développement :
¾ Mise au point du Western blot pour le diagnostic de la toxoplasmose.
Mémoire de fin d’étude en Résidanat de Parasitologie-Mycologie.
Mémoire en phase de rédaction pour une soutenance en Mars 2009.
¾ Mise au point de la PCR et son application au diagnostic de la Toxoplasmose,
mémoire de fin d’étude en Résidanat de Parasitologie-Mycologie qui sera soutenu
en Mars 2009.
¾ La LCC étant mise au point elle a fait l’objet d’un mémoire de fin d’étude en
Résidanat de Parasitologie-Mycologie dont la soutenance est prévue pour Mars
2009.
¾ Essai de plantes médicinales in vitro sur les formes promastigotes de Leishmania,
thème d’un mémoire de fin d’étude en Résidanat de Parasitologie-Mycologie dont
la soutenance est prévue pour Mars 2009.
Projet de Recherche :
Projet PICS : Statut écologique, démographique, génétique et sanitaire du magot
(Macaca sylvanus) en conditions limitantes en Algérie : intérêt pour une gestion
durable de la biodiversité
Résumé :
Sous la pression humaine, les magots d’Afrique du Nord ont subi une réduction
et une fragmentation de leur habitat avec formation d’isolats. Certains groupes
commencent à coloniser l’habitat urbain, causant des nuisances potentiellement
associées à des risques de transmission de maladies singe/homme. Notre étude
sera menée dans le Parc National de Gouraya(Bejaia). Des observations
ponctuelles seront faites dans le Parc National de Djurdjura à des fins de
comparaison.
Le but de notre projet est :
1- Préciser le statut démographique et génétique de la population de
dans le contexte global de l’espèce.
Gouraya
2- Tester le rôle éventuel d’une cohabitation homme-singe sur un transfert de
parasite entre les deux espèces.
3- Etudier les facteurs environnementaux responsables du commensalisme
observé.
4- Faire des recommandations dans le cadre d’une aide à la gestion des
populations de magots.
Le projet a été achevé le mois de Novembre 2008, un bilan de ce projet est en
cours de rédaction par les différents partenaires
78
Projet ANDRS jeune chercheur : Epidémiologie des leishmanioses à l’Est
Algérien
Résumé :
Les leishmanioses à l’Est Algérien, à l’instar du reste du pays, connaissent un
profond bouleversement épidémiologique.
En effet, la leishmaniose cutanée se caractérise par son extension à partir des
anciens foyers et devient de plus en plus fréquente au Nord coexistant dans la
zone d’endémie de la leishmaniose viscérale ce qui soulève des questions
d’ordre épidémiologique. Son diagnostic est facile, se fait par un examen direct et
une mise en culture sur milieu usuel. Mais ce milieu de culture, à savoir le NNN,
n’est pas disponible au niveau de ses zones d’endémies démunies.
Quant à la leishmaniose viscérale, problème de santé publique de part son
pronostic, son diagnostic n’est pas réalisé par manque de moyens.
Les deux situations contribuent à l’absence de données épidémiologiques.
C’est dans ce contexte que s’inscrit ce projet qui a comme objectifs :
1- Décentralisation du diagnostic des leishmanioses par la mise en place des
cultures et du sérodiagnostic.
2- Isolement et caractérisation isoenzymatique des isolats de
responsables des leishmanioses à Annaba.
leishmanies
Dans ce cadre, des souches de leishmanies ont été congelées pour un typage
isoenzymatique.
3- Evaluer la prévalence de la maladie dans la région avec ces particularités
épidémiologiques.
Projet ANDRS jeune chercheur : Epidémiologie de la toxoplasmose à l’Est
Algérien et prévention de la toxoplasmose congénitale.
L’objectif du projet est de connaître la séroprévalence de la toxoplasmose à l’Est
du pays ainsi que la prévalence des séroconversions et des toxoplasmoses
congénitales.
VI. ACTIVITE DE FORMATION
(a) Formation dispensée dans le laboratoire :
1-
Résidents en Parasitologie Mycologie : 04 résidents de 4ème année
9 Rezekallah Lila
9 Beldjehem Imene
9 Yebbous Bensaid Sid Ahmed
9 Benyahia Djamila.
Les 04 résidents étaient affectés à l’IPA dans le cadre de la réalisation de leurs
mémoires, sous la responsabilité du Pr. F. BACHI. Ces mémoires étaient insérés
dans le cadre des projets de développement du service
79
2- Passage de façon cyclique de deux stagiaires dans le cadre de la réalisation
d’une thèse de doctorat d’état. Il s’agit de :
¾ Dr Rokia MANSOURI : Epidémiologie des leishmanioses à l’Est Algérien.
(Projet ANDRS) : Directeur de thèse, Pr. F. BACHI
Cette thése touche à sa fin, elle est en cours de rédaction.
¾ Dr Leyla MESSERER : Epidémiologie de la toxoplasmose à l’Est Algérien
et prévention de la toxoplasmose congénitale (Projet ANDRS) : Directeur de
thèse, Pr. F. BACHI
3- Une conférence, intitulée la réponse immunitaire aux infections parasitaires
assurée par le Pr. F.BACHI aux résidents d’immunologie.
(b) Formation dispensée hors du laboratoire :
9 Enseignement hors l’Institut Pasteur d’Algérie.
Nom de l’enseignant : Pr. F. BACHI Parasitologie Mycologie.
Lieu de l’enseignant : INESSM Alger.
Destinataire :
Graduation : 3e année de médecine et 4e année de pharmacie.
Post graduation : CES Biologie clinique, Résidanat de Parasitologie - Mycologie
Type d’enseignement : Cours, TD, TP et planchages
80
VII. COMMUNICATION :
1. Evaluation in vitro de l’activité antileishmaniennede différentes espèces
d’Artémisia & Matricaria pubescens.
L. REZKALLAH(1) ; A. AÏT-AÏSSA (1) ; A. BENZETOUNI(1) ; M. BESSA(1) ; M.
ZEMOURI(1) ; Z. TAHARBOUCHT(1) ; F.BACHI(1) ; BEN-MOKADE ET SON
EQUIPE(2).
(1) Service de biologie parasitaire;Unité de Leishmaniose ; IPA.
(2) Laboratoire de gènitique; l’universitée de Khemis-Meliana.
XIIème Journée Nationale de Parasitologie-Mycologie, Sétif, 04 Juin 2008
2. Toxoplasmose congénitale : bilan de 06 ans
S. YEBBOUS BENSAID ; E. GOURBDJI ; L. TAOURIRT ; L. BOUDHANE ;
L. LAZIZI & F. BACHI
Centre National de Référence toxoplasmose, service biologie parasitaire
3. Hydatidose : les cas particuliers
D. BENYAHIA.D; ZENAIDI-MEZGHICHE.N;KHALEF.O & BACHI.F
Unité Helminthologie, Service de Biologie Parasitaire, IPA
XIIème Journée Nationale de Parasitologie- Mycologie, Sétif, le 04Juin 2008
4. Toxoplasmose oculaire : bilan de 6 années
I. BELDJEHEM ; E. GOURBDJI ; L. TAOURIRT ; L. BOUDHANE ; L. LAZIZI &
F. BACHI
CENTRE NATIONAL DE Référence Toxoplasmose, service de biologie
parasitaire
XIIème Journée Nationale de Parasitologie- Mycologie Médicale
Sétif, le 04Juin 2008
5. Prévention de la Toxoplasmose congénitale en Algérie: qu’en savonsnous?
F. BACHI, E. GOURBDJI, S. YEBBOUS BENSAID, L. TAOURIRT, L. BOUDHANE & L.
LAZIZI
CNR Toxoplasmose, Service Biologie Parasitaire, Institut Pasteur d’Algérie
6. Myiase Nasale
F. BACHI, I. ACHIR & H. ADJMI
XIIème Journée Nationale Parasitologie-Mycologie, Sétif, 04 Juin 2008
81
82
Laboratoire de Bio Pathologie
Chef du laboratoire : Anissa BOUHADEF (Docteur en Médecine/ Pr./ INESSM)
I. ACTIVITES DE DIAGNOSTIC
Début des activités en mars 2008 seulement, car tributaires de l’arrivée en février 2008
d’un équipement de base. Seuls un microtome et un microscope achetés par le
ministère, sont parvenues en février, ce qui a permis de démarrer les activités de
diagnostic en mars, par des techniques exclusivement manuelles, les autres
équipements n’étant pas disponible encore à ce jour.
Malgré des moyens humains insuffisants, des moyens matériels très insuffisants, les
unités suivantes sont fonctionnelles.
1- Unité d’histopathologie :
Les prélèvements adressés se sont diversifiés au cours de l’année, bien qu’aucune
information de l’existence de ce laboratoire n’ait été diffusée.
0272 Cas de biopsie
soit 2175 examens microscopiques.
0146 Cas de pièces opératoires
soit 272 examens macroscopiques.
2190 examens microscopiques.
Ils se répartissent selon les processus pathologiques :
Pathologie inflammatoire : 114 cas soit 980 examens microscopiques
Non spécifique
Spécifique dont : tuberculose, sarcoïdose, yersiniose,
parasitose et viroses.
Pathologie tumorale :
Bénigne 200 cas soit 2400 examens microscopiques.
Maligne : 104 dont 30 d’étiologie virale ou bactérienne
(HPV ou Helicobacter pylori).
Autres pathologies :
Dystrophiques
Dysmétaboliques
Héréditaires
Ils se répartissent selon les localisations multiples en particulier digestives,
gynécologiques, mammaire, ganglionnaires.
Ils se repartissent selon le sexe : autant de femmes que d’hommes.
Ils se repartissent selon l’age : de deux mois à 75 ans.
Le développement de cette unité dépendra de l’obtention des produits et
consommables indispensables pour le fonctionnement, et aussi de l’obtention des
automates d’inclusion et de coloration, les méthodes manuelles étant lourdes,
fastidieuses et demandant beaucoup d’attention et de minutie.
83
2- Unité de cytopathologie :
- Cytoponctions ; consultation et cytopathologie générale :
Sein
Ganglion
Thyroïde tumeurs solides
Répartition selon les pathologies : inflammatoires et tumorales (20 cas) soit 198
examens microscopiques.
Seules ces quelques consultations avec cytoponctions ont été pratiqués dans le
laboratoire, avec les risques encourus, car sans les conditions requises pour cette
activité qui nécessite une organisation rigoureuse :
• Local de consultation décent.
• Matériel de cytoponction.
• Trousse d’urgence pour éventuel choc vagual.
Car nous ne sommes pas situés à proximité d’un service de réanimation.
Et surtout la nécessité d’un médecin anatomopathologiste.
- Frottis : Cytopathologie gynécologique
Cytodiagnostic de dépistage :
A révélé un nombre important de lésions témoignant d’une infection à papillomavirus,
agent étiologique principal des cancers du col utérin.
910 Cas soit 2730 examens.
Répartition selon les pathologies : -lésions inflammatoires.
- Lésions précancéreuse et cancéreuses du col utérin dont de nombreuses liées à
l’infection à Papilloma virus (HPV).
Cette activité est appelée à se développer, le laboratoire étant sollicité comme centre
superviseur et expert, des unités de dépistage, à intégrer dans le programme
national de dépistage.
3- Unité d’immunohistochimie et d’immunocytochimie :
L’obtention de quelques anticorps a permis des études limitées, mais qui été d’un
grand apport pour le diagnostic précis, pour le pronostic, pour la prédiction de
réponses aux thérapeutiques ciblées.
Cette unité nous donne grande satisfaction, grâce à la compétence, la rigueur,
l’intelligence des techniciennes qui encore, procèdent manuellement.
Son développement dépendra aussi de l’apport de réactifs diversités et du
recrutement de personnel sérieux. (Pathologiste et biologiste), ce qui permettra de
pérenniser cette unité.
84
Répartition selon les anticorps utilisés :
Anticorps utilisé : CK, Hp, plasmacell, CD20, Bcl2, CD3, Chromogranine, NSE , CD3,
Ps100, CD45, AML, CD31, CD17, Her2 neu,BCRA1, EGFR, P53, CD10, HPV, Ki 67,
αfp, CD34, CD5, ALK, Granzyme B, TdT,CD99 .
Ont été traités 81 cas, soit 1215 lames examinées.
4- Unité de pathologie moléculaire :
En collaboration avec le laboratoire d’oncogénétique.
Mise en application des techniques d’hybridation in situ fluorescente (FISH) et/ou
chromo génique (CISH).
Les même techniciennes on débuté l’activité de pathologie moléculaire, permettant
de mettre évidence : amplification, délétion, ou translocation de gènes, qui
permettent le typage de certaines tumeurs et donc une prise en charge adéquate des
patients
- HPV DNA
- Gen point pour papillomavirus
- PNA-ISH pour EBV
- TOP II a isomérase pour le sein (thérapie ciblée)
- Géne MALT1 lymphome malin.
- FISH Her-2 neu
Les techniques sont actuellement maîtrisées. Le laboratoire de biopathologie de
l’institut pasteur a été le premier laboratoire de pathologie a mettre en œuvre ces
techniques, d’hybridation in situ avec succès (seul HPV FISH a été pratiqué au CHU
Beni Messous).
5- Banque tissulaire et tumorothèque :
Actuellement banque en paraffine.
La banque en congélation dépend de la réception de cryoconservateurs non encore
disponible et congélateur a - 80°
Ces banques conditionnées de façon rigoureuse représentent actuellement une
activité importante des laboratoires modernes de pathologie, car à partir de ces
prélèvements peuvent être effectuées de nombreuses techniques de pathologies
moléculaire (PCR, extraction d’ADN, extraction d’ARN, étude génétique, biopuces,
microarrays….), techniques qu’ils seraient nécessaire d’effectuer au niveau d’un
laboratoire de biopathologie.
6- Diapothèque :
Photos numérisées par manipulation à la photo microscope de lames de pathologies
rares et/ou intéressantes, disponibles dans l’ordinateur.
85
II. ACTIVITES D’ENSEIGNEMENT
1. Formation :
Théorique pour pathologiste affecté au laboratoire :
Diverses mises au point sur les pathologies observées en particulier
- Cancers du sein
- Helicobacter pylori et pathologies gastriques.
- Lésions précurseurs et cancers du col utérin, etc.……
Pratique : formation quotidienne au microscope sur des cas difficiles ou intéressants.
2. Formation des techniciennes du laboratoire au quotidien, pour
Mme Samira Seffak
Mme Naima Haddouche
Les techniques usuelles et d’histochimie.
Les techniques d’immunohistochimie.
Les techniques d’hybridation in situ.
Grâce à leur volonté, leur persévérance, leur efficacité, cette formation est
actuellement rentabilisée par les bons résultats obtenus.
Formation d’une biologiste stagiaire : Melle Karima TIMSILINE
Pour toutes les techniques de base d’histo et de cytopathologie, et pour l’organisation
optimale d’un laboratoire de pathologie.
3. Contrôle de qualité :
Coobservation des lésions gastriques à Helicobacter pylori avec l’équipe du
laboratoire du chu Beni Messous.
Coobservation du col utérin précancéreuse et cancéreuse avec docteur Berremila et
Dr Slimani, Mme Zitouni (INSP).
4. Formation hors IPA, au niveau de l’INSP :
Registre des cancers d’Alger (Pr. A. Bouhadef en tant que pathologiste responsable
du registre).
Dépistage du cancer du col utérin :
Cours, TD, et TP de cytopathologie pour la formation des gynécologues en
colposcopie.
Cours, TD, et TP de cytopathologie pour la formation complémentaire, recyclage
des colposcopistes.
86
III. ACTIVITES DE RECHERCHE
1- Direction du laboratoire de Recherche sur le Polymorphisme Génétique :
hébergée à l’IPA (voir notification rectorat d’Alger) Directeur : Pr. BOUHADEF
Directeur adjoint : Dr. TERKI
Le laboratoire de biopathologie en association avec le laboratoire de génétique
humaine (IPA) constitue la plateforme du laboratoire de recherche sur le
polymorphisme génétique, qui regroupe plusieurs équipes de recherche
pluridisciplinaires.
Ces recherches sont orientées vers les applications en santé publique , en particulier
pour les maladies héréditaires et les cancers , souhaitant valider et optimiser des
méthodes de prévention , des tests de diagnostic, des tests de pronostic, et des tests
de prédiction de réponse aux thérapeutiques ciblées ; ces études de pathologie
moléculaire par génomique et protéomique intéressent certains gènes d’intérêt pour
les cancers et permettent de développer des approches nouvelles cliniques,
génétiques, et biopathologiques qui mettent en œuvre toutes les équipes du
Laboratoire de Recherche du Polymorphisme Génétique qui comportent : cliniciens,
gynécologues, chirurgiens, radiologues, radiothérapeutes, pathologistes, généticiens,
epidemiologistes.
Les thèmes de recherches proposés sont actuellement axés sur les cancers du sein
et les cancers gynécologiques avec des projets de recherche.
2- Enquêtes de recherche :
¾ Col utérin : dépistage des lésions précancéreuses et cancéreuses et l’étude du
facteur Papilloma Virus. En collaboration avec :
Service d’épidémiologie ; Dr HAMMOUDA……………………….…INSP
Service de cytopathologie ; Mme ZITOUNI………….……………….INSP
Service de gynécologie ; Pr. AYACH…………………………...……S.S.ZERALDA
¾ Helicobacter pylori et implication sur la muqueuse gastrique, gastrite chronique,
ulcère gastrique, carcinomes, lymphomes).
En collaboration avec le laboratoire Algérien de recherche sur Helicobacter pylori
(Pr. TOUCHENES).
¾ Cancer du sein : facteurs pronostiques et prédictifs de réponse aux thérapeutiques
ciblées.
Etude du projet immunohistochimique et génétique des cancers du sein de la
femme jeune.
En collaboration : CPMC : Service d’oncologie……….Pr. BOUZID
Service de pathologie…………...…Pr. TERKI et Dr CHAHER.
Ces travaux permettent :
Une contribution à un diagnostic précis.
Une contribution à la recherche fondamentale en santé.
Une contribution à la recherche epidemiologique.
Mise au point de tests pronostiques et prédictifs de réponse aux thérapeutiques
ciblées.
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Ont une implication directe sur la prise en charge des patients et sur la recherche en
santé des processus lésionnels aussi bien à l’échelle génomique que protéomique.
3- Recherche en pathologie expérimentale chez l’animal :
Contribution histopathologique aux études des lésions chez la souris, provoquées
par venin de scorpion et venin de serpent.
En collaboration avec le service des venins (Pr LARABA).
IV. COMMUNICATIONS ET PUBLICATIONS
- Epidémiologie des cancers de la thyroïde : donnés du registre des tumeurs, Alger
Dr. Hamouda, A. BOUHADEF, journées HCA. Dec 2008
- Classification de bethesda et lésions epidermoides. A. BOUHADEF, journées de
l’INSP coloscopie et cytologie. Mai 2008
Les communications sur le programme Hp :
- Infection à Helicobacter pylori : aspect épidémiologiques»
Z. GUERCHI, S. NAIT KACI, F. MOUFFOK, N. MATOUGUI, H. BERRAH,
K. BOUZID, A. BOUHADEF, B. TOUCHENE.
- Profil hiostopathologique des gastrites chroniques à H. pylori : observations du
LARH.
A. BOUHADEF, S.A. BERMILA, N. NOUAR, F. ACHERAR, K. BOUZID,
Z. MEZOUI, S. SEFFAK, N.HADOUCHE, N. MATOUGUI, M.A. BOUDELLA,
R. LARRAS, M. MOUBRI, H. BERRAH, F. MOUFFOK, Z. GUECHI, B. TOUCHENE
- Aspects anatomopathologiques des gastrites à H.Pylori chez l’adulte :
notre expérience
K. BOUZID, F. ACHERAR, N. NOUAR, A. BOUHADEF, N. MATOUGUI,
M.A. BOUDJELLA, F. MOUFFOK, Z. GUECHI, H. BERRAH, B. TOUCHENE.
- Diagnostic microbiologique de l’infection à H.pylori chez l’adulte avant et après
traitement
F. KIAS, F. TALEB, F.MOUFFOK, N. MATOUGUI, M.A BOUDJELLA, Z. GUECHI,
H. BERRAH, A. BOUHADEF, K. BOUZID, B. TOUCHENE.
- Infection à Helicobacter Pylori chez l’adulte : Diagnostic par le praticien.
M.A. BOUDJELLA, N. MATOUGUI, A.TEBAIBIA, D. BOUTARENE, F. MOUFFOK,
A. BOUHADEF, K. BOUZID, Z. GUECHI, H. BERRAH, B. TOUCHENE.
- Infection à H.pylori chez l’enfant algérois : quel enseignement ?
R. LARRAS, M. MOUBRI, H. BERRAH, F. MOUFFOK, A. BOUHADEF,
N. NOUAR, K. BOUZID, Z. GUECHI, B. TOUCHENE
- Helicobacter pylori est facteur de risque majeur de l’atrophie gastrique chez
l’enfant.
R. LARRAS, M. MOUBGHI, H. BERRAT, A. BOUHADEF, F. MOUFFOK,
B. TOUCHENE. GASTRO.ENTERL.CLIN. BIOL, 2008, VOL32, N°1, 264.
88
Participation aux congrès :
- Carrefour pathologie Nov. 2008 Paris.
- Colloque international sur Helicobacter pylori Ghardaïa.
- Journées d’évaluation du programme national de dépistage du cancer du col de
l’utérus Décembre 2005
- Journées d’endocrinologie de l’HCA (Thyroïde, Décembre 2008).
V. PERSPECTIVES
En fonction des moyens disponibles humains et matériels (laboratoire fonctionnant
encore à ce jour sans équipements et avec un personnel insuffisant), des
perspectives intéressantes se font jour :
1. Recherche de lésions gastrique liées au polymorphisme génétique de Helicobacter
pylori d’autant que la collaboration avec les microbiologistes est étroite
2. Recherche sur les lésions précancéreuses et cancéreuses du col utérin
Par la mise en évidence en immunohistochimie et hybridation in situ des HPV à
haut risque.
Par l’étude sur cytologie et sur biopsie de la protéine P16 INKa en
immunohistochimie qui révèle les lésions de haut grade.
3. Recherche sur les cancers du sein de la femme jeune, de plus en plus fréquents
dans notre pays, paraissant avoir un profil particulier souvent lié antigène BRCA1.
Des études préliminaires au laboratoire montrent une grande proportion de ces cas
avec une expression immunohistochimique de BRCA1 qui mérite d’être complété
par des études génétiques.
CONCLUSION :
Le laboratoire de biopathologie, avec peu de moyens, maîtrise de nombreuses
techniques.
Des perspectives sont multiples tant pour la pathologie infectieuse que pour la
pathologie tumorale, en particulier les pathologies cancéreuses liées directement aux
facteurs bactériens (Hp), viraux (HPV) et aux facteurs génétiques (BRCA1).
89
90
Laboratoire d’Eco-épidémiologie parasitaire et génétique des
populations
Chef du laboratoire : Zoubir HARRAT (Docteur en Médecine, Maître de recherche)
A. Les leishmanioses : Le Centre National de Référence des Leishmania a réalisé les
activités suivantes :
1. Diagnostic sérologique des leishmanioses
Durant l’année 2008, 235 prélèvements sanguins ont été reçus, les sérums
testés par la technique d’Immunofluorescence indirecte (IFI), ont donné les résultats
suivants :
• 134 sérums canins : 07 Positifs, et 127 négatifs.
• 101 sérums humains : enquête sérologique du foyer de leishmaniose viscérale
d’ILLIZI : Tous négatifs
2. Les cultures
59 cultures de leishmanies effectuées à partir de différents organes chez différents
hôtes ont été pratiquées :
H Prélèvements cutanés : 48 cultures réalisées
27 prélèvements d’origine humaine (16 cultures positives et 11 négatives)
21 prélèvements d’origine animale (Psammomys obesus) tous négatifs.
H Hémoculture (chiens suspects de leishmaniose) : 09 cultures effectuées,
04 positives.
H Ponction ganglionnaire réalisée chez 02 chiens : toutes négatives
3. Diagnostic moléculaire des leishmanioses (PCR)
128 prélèvements ont subit des extractions d’ADN par deux procédés différents. Pour
75 d’entres eux l’extraction a été de type phénolique avec la méthode classique, et
pour les 53 autres l’extraction a été faite par colonnes Qiagen donnant des ADN de
meilleurs qualité.
Pour la PCR deux couples d’amorces ont été utilisées, R221-R332 et K13A-K13B.
Tab I : Résultats diagnostic par PCR des leishmanioses.
Nb
prélèvements
Positifs
Négatif
Concordance entre Ex Direct
et la PCR
Leishmaniose cutanée
64
33
31
100%
Leishmaniose canine
29
3
26
100%
35
*
31
100%
Désignation
Rongeurs
*
4
Il s’agit de 04 souris balb/C infestées expérimentalement au laboratoire
91
4. Cryonservation des souches
20 nouvelles souches ont été congelées à -196°C, elles se répartissent comme suit :
16 souches cutanées humaines (11 de Tunisie et 05 d’Algérie) et 4 souches
viscérales humaines (03 de Tunisie et 01 d’Algérie).
5. Typage des souches de Leishmania
L’identification des souches de Leishmania est faite par électrophorèse des
isoenzymes sur gel épais d'amidon et par isoélectrofocalisation sur gel de
polyacrylamide.
Nombre de souches typées : 22
Souches d’Algériee : 10 souches
a. Leishmaniose cutanée humaine (LCH) : 03 souches
• L.major zymodème MON-25 (03)
b. Leishmaniose canine (LVC) : 05 souches
• L. major zyodème MON-25 (01)
• L. infantum zymodème MON-1 (03)
• L. infantuml MON-34 (01)
c. Leishmania isolée chez le Chacal : 02 souches
• L.infantum MON-1 (02)
Tab II : liste des souches identifiées et leur lieu d’isolement en Algérie.
N° identification
de la souche
92
Origine
Localité
Résultat du typage
LIPA 72/08
chacal
Tizi-ouzou
L.infantum MON-1
LIPA 73/08
chacal
Tizi-ouzou
L.infantum MON-1
LIPA 76/08
Peau. homme
M’hire (BBA)
L.major MON-25
LIPA 79/08
Peau. homme
M’hire (BBA)
L.major MON-25
LIPA 1248
chien
Blida
L.infantum MON-1
LIPA 1249
chien
Blida
L.infantum MON-1
LIPA 2091
chien
Tizi Ouzou
L.infantum MON-34
LIPA 84/08
Peau. homme
M’sila
L.major MON-25
LIPA 2001
chien
Alger
L.infantum MON-1
LIPA 1228
chien
Alger
L.infantum MON-25
Souches de Tunis : 12 souches
• L.infantum zymodème MON-1 (03 souches)
• L.major zymodème MON-25 (05 souches)
Tab III : Liste des souches isolées en Tunisie et leur zymodème correspondant
LIPA 61/07 (LV45)
Origine
(LCH, LV)
LVH
Kairouan
TN
L.infantum MON-80
LIPA 59/07 (LV43CL)
LVH
Kairouan
TN
L.infantum MON-1
LIPA 63/07(TAT07 N3)
LCH
Tataouine
TN
L.major MON-25
N° identification de la souche
Localité
Pays
Résultat du typage
LIPA 71/07 (LV 47)
LVH
Kairaouan
TN
L.infantum MON-24
LIPA 68/07 (LV55)
LVH
Kairaouan
TN
L.infantum MON-80
LIPA 66/07 (LC20/07)
LCH
Tataouin
TN
L.major MON-25
LIPA 74/08 (LC23/07)
LCH
Sidibouzid
TN
L.major MON-25
LIPA 75/08 (LC 02/08)
LCH
Sidibouzid
TN
L.major MON-25
LIPA 77/08 (LC12/08)
LCH
Béja
TN
L.major MON-25
LIPA78/08 (LV59/07)
LVH
Bizert
TN
L.infantum MON-1
LIPA 82/08 (LV 03)
LVH
Nabeul
TN
L.infantum MON-1
LIPA 83/08 (LV 04)
LVH
Nabeul
TN
L.infantum MON-80
LVH : Leishmaniose viscérale humaine
LCH : leishmaniose cutanée humaine
6. Etude de la résistance des leishmania
La sensibilité des leishmania au Glucantime® a été testée in vitro, en culture cellulaire
sur cellules THP1, sur 10 souches (06 cutanées humaines, 03 souches canines et 01
souche viscérale). Le résultat a montré que toutes les souches à leishmania major et
leishmania killicki sont résistantes au Glucantime®. DL50 >45µg/ml.
Tab IV : Résultat du test de sensibilité des souches de leishmania au Glucantime
Code
Espèce
Forme clinique
DL50
Résultats
in vitro
LIPA 07/05
L. killicki MON 301
Leishmaniose cutanée humaine
54,5
Résistant
LIPA 10/05
L. killicki MON 301
> 60
Résistant
LIPA 29/06
L. major MON 25
> 60
Résistant
LIPA 31/06
L. major MON 25
> 60
Résistant
LIPA 32/06
L.major MON 25
Leishmaniose cutanée (Rongeur)
> 60
Résistant
LIPA 35/06
L. major MON 25
> 60
Résistant
LIPA 36/06
L. major MON 25
> 60
Résistant
LIPA 18/05
L. infantum MON 1
Leishmaniose canine
22,6
Sensible
LIPA 21/05
L. infantum MON 1
Leishmaniose canine
17,8
Sensible
LIPA 23/05
L. infantum MON 80
Leishmaniose canine
36,5
Sensible
93
B. Maladie de Lyme et Rickettsioses :
1. Activités du diagnostic
a) La maladie de Lyme (Test Elisa)
149 prélèvements provenant de patients suspects de la maladie de Lyme ont été
analysés par la technique ELISA. Le résultat des tests figure sur le tableau V :
Nbre de
prélèvements
149
Nature du prélèvement
Positifs
Total Positif
Sang
LCR
IgG
IgM
IgG+IgM
142
7
22
23
3
45
Tab V : Résultat d’analyse de la sérologie de Lyme effectuée sur 149 patients et leur
origine géographique :
Total positif : 45 (30.2%) : IgG (+): 22 patients; IgM(+) :23 patients ; (IgG + IgM +) = 03
patient
Les prélèvements du LCR ont été tous négatifs.
b) Les rickettsioses (test IFI)
Le diagnostic sérologique des rickettsioses réalisé chez 20 patients a été effectué sur
05 antigènes différents : Rickettsia conorii ; R. felis ; R. typhi ; R. aeschlimannii et,
Coxiella burnetii ;
Sur les 20 prélèvements reçus 18 se sont révélés positifs soit en IgG ou en IgM (tableau
VI)
Antigène
Positifs (IgG)
Positifs (IgM)
R conorii
7
R felis
1
3
R typhi
1
6
R aeschlimannii
-
-
C burnetii
-
-
9
9
TOTAL
Positifs (IgG+ IgM)
Tab VI : Résultat du test de diagnostic des rickettsioses selon les espèces éprouvées.
94
II. ACTIVITES DE RECHERCHE
Projet ACIP (Actions Concertées Inter Pasteuriennes)
Code : A-04-2007
Intitulé « Exploration éco-épidémiologique des foyers de leishmaniose cutanée
à Leishmania killicki »
Coordinateur du Projet : Pr. BOURATBINE A. (Institut Pasteur Tunis)
Partenaires: Institut Pasteur d’Algérie (Dr Z. HARRAT) ; Institut Pasteur de Paris
(Pr. P. BUFFET)
Objectif global :
L’objectif de ce projet est d’établir la prévalence de la LC à L. killicki en Tunisie et en
Algérie, de délimiter son aire de distribution géographique et d’en identifier les
vecteurs et les réservoirs afin d’optimiser les moyens de lutte et la prise en charge
des malades
Les travaux préliminaires ont débuté en octobre 2007.
Activités réalisées en 2008 : une première réunion de travail pour le lancement du
projet a été faite le 13 et 14 avril 2008 à l’Institut Pasteur d’Algérie en présence du
coordonnateur du projet : Pr. BOURATBINE, du Pr. K. AOUN et de l’équipe
algérienne.
Une mission entomologique a été effectuée a été effectuée dans le foyer de
Ghardaïa du 03 au 12 mai 2008, et une mission à Tataouine (Tunisie) du 7 au
17 octobre 2008. Deux biologistes de l’IPA ont bénéficié dans le cadre de ce projet,
d’une formation d’une semaine, à l’IP Tunis sur le diagnostic par PCR des
leishmanioses. Un stagiaire tunisien a été formé sur les principes du Système
d’Information Géographique à l’IPA pendant 10 jours.
Paludisme et environnement
Intitulé du projet : « Emerging Diseases in a changing European Environnement »,
Contrat GOCE n°010284-2
Eden est un nouveau projet intégré du 6ème PCRDT de la commission européenne,
il regroupe 48 partenaires issus de 24 pays. Il a démarré en Novembre 2004, il se
termine en Mars 2010.
Site web: http://www.eden-fp6project.net/.
Il est subdivisé en cinq sous projets, l’IPA participe au sous projet EDEN-Malaria
Coordinateur principal : Didier Fontenille (IRD) ;
Les partenaires du projet : Algérie (IPA). Institut Pasteur d’Algérie, coordinateur :
Dr Zoubir Harrat. France (IRD). Institut de Rechercher pour le Développement. Didier
Fontenille
coordinateur ;
(EID)
(Entente
interdépartementale
pour
la
démoustication).coordinateur : Francis Schaffner ; Roumanie (NIRDMIC) Cantacuzino
Institute. Coordinateur : Gabriela Nicolescu; Turquie (HUESRL) Hacettepe University :
coordinateur : Nurdan Ozer, Italie (ISS) Instituto Superiore di Sanità, coordinateur
Roberto Romi ; Espagne (UVEG) Universitat de València. Coordinateur : Maria Dolores
Barges ; Portugal (IHMT) Instituto Higiene e Medicina Tropical.coordinateur : Virgilio do
Rosario, Maroc (INH) Institut National d’Hygiène. Coordinateur : Radjaa El Aoued ; Pays
Bas (UMCN) University of Nijmegen. Coordinateur : Jean Pierre Verhave.
95
Les objectifs du projet EDEN sont d'identifier, évaluer et inventorier les écosystèmes
européens et Maghrébins et les conditions environnementales liées au changement
global, qui peuvent influencer la distribution et la dynamique spatiales et temporelles
des agents pathogènes. Le projet développera un ensemble de méthodes
génériques, d'outils et de qualifications telles que les modèles prédictifs d'apparition et
de diffusion, de détection précoce, de surveillance, et les outils et les scénarios de
contrôle, qui peuvent être employés par les décideurs pour l'évaluation des risques,
pour l'aide à la décision au niveau national ou régional. Une partie d'innovation
d'EDEN est de combiner les données spatiales (données d'observation de la terre,
Système d’Information Géographique, télédétection etc..) avec des données
épidémiologiques.
Le projet EDEN a choisi pour l'étude, une gamme d'indicateurs des maladies
infectieuses humaines qui sont particulièrement sensibles aux changements
environnementaux et seront étudiées dans un cadre scientifique commun (impliquant
la bionomie du vecteur et du parasite, son habitat, les différents sites et paysages les
favorisant, la santé publique, et les réservoirs animaux). Certaines de ces maladies
sont déjà présentes en Europe (maladies transmises par les tiques et par les
rongeurs, leishmaniose, West Nil), d'autres étaient endémiques dans le passé
(paludisme) mais qui peuvent réapparaître. EDEN intègre la recherche dans
47 principaux instituts de 24 pays avec l'expérience et les qualifications combinées
pour atteindre les buts communs du projet. La diversité éco-géographique du projet
couvre tous les écosystèmes européens appropriés du cercle polaire au nord, au
bassin méditerranéen et de son lien géographique avec l'Afrique occidentale au sud,
et, du Portugal à l'ouest au delta de Danube à l'est. EDEN est organisé en série de
Sous-Projects verticaux menés et contrôlés par les experts internationalement
identifiés, et sont liés ensemble par une série d'activités intégrant la biodiversité, la
détection d'un changement environnemental, la modélisation de la maladie,
l’interprétation des images de télédétection, l'information et la communication. La
structure de gestion proposée, comprend un comité de coordination et un groupe
consultatif, Elle tient compte de la diversité des partenaires et de la taille du projet.
Au cours de la quatrième année du projet, les activités suivantes ont été réalisées:
Description du paysage et du biotope de la région de Tinzaouatine (troisième région
modèle) pour l’étude des effets environnementaux sur l’émergence du paludisme
dans cette zone frontalière avec le Mali. Les effets de l’eutrophisation du lac Tonga
(2eme région modèle) sur la dynamique et la densité du vecteur Anopheles labranchiae
ont été analysés. La capacité vectorielle et les préférences trophiques de ce vecteur
ont été également évaluées.
Dr HARRAT Zoubir et Mr BOUBIDI Said-Chawki, ont participé à l’atelier de formation
sur la taxonomie moléculaire des moustiques au Museum d’Histoire Naturelle de
Londres en juin 2008. Durant leur formation, ils ont procédé à l’identification
moléculaire des anophèles vecteurs du paludisme collectés en Algérie.
Recherche sur la Peste : Collaborateur algérien (BITAM Idir)
Actions de Recherche en Réseau. Action n°P2.2092RR714
«Renforcement du réseau peste francophone sud dans le cadre d’un projet de
détermination des indicateurs de risque pesteux dans les modèles de foyers de peste
Algérien, vietnamien et malgache »
Projet de recherche financé par l’Agence Universitaire de la Francophonie (AUF)
Année de démarrage du projet : 2007. Durée du projet ; 2 ANS
Liste des personnes impliquées : BITAM Idir, BELHABRI Leila, Mohammed CHAKI,
Mahboub BENYATTOU.
96
Objectif : évaluation de la spécificité et de la sensibilité de la bandelette de
détection rapide des anticorps dirigés contre Y pestis chez les rongeurs et chez
l’homme.
Résumé du projet :
Dans le cadre de la surveillance entomologique et mammalogiques de la peste, une
nouvelle technique de détection d’AC rapide vis-à-vis de Yersinia pestis par
bandelettes été mise en point par l’équipe de l’IP de Madagascar. Ces bandelettes
devraient être testées sur le terrain par les équipes partenaires au projet.
Activités réalisées en 2008 : les bandelettes ont été testées sur une cinquantaine de
rongeurs (M shawi) capturés dans le foyer de peste déclarée dans la wilaya de
Laghouat en juin 2008.
Les résultats des analyses sont en cours d’évaluation.
PROJET ANR (Agence Nationale de Recherche Française). Emerging
phleboviruses around the Mediterranean.
Projet accepté en 2008. Financement à partir de 2009. Durée 3 ans.
Pays concernés : Algérie : Dr Idir BITAM, Unité d’Entomologie médicale, Service
d’Eco-épidémiologie parasitaire et génétique des populations, Institut Pasteur
d’Algérie.
France (Marseille – Paris) : Pr Remi CHARREL, Unité des virus émergents faculté de
médecine, Marseille. Pr Arezki IZRI, Laboratoire de Parasitologie Mycologie, Hôpital
Avicenne, Paris.
Tunisie : Elies ZHIOUA, Laboratoire d’Ecologie des systèmes vectoriels, Institut
Pasteur de Tunis.
Résumé : les Phlébovirus sont des virus émergents dans les pays du pourtour du
bassin méditerranéen. Ils ont pour hôte vecteur les phlébotomes. Les résultats
préliminaires des études effectuées au sud de France montrent la présence de
plusieurs nouveaux génotypes de ces virus. Le but de ce projet est d’évaluer leur
fréquence en Algérie et dans les pays partenaires du projet, de déterminer leur
variabilité génétique et leur distribution géographique.
III. ACTIVITES DE PRODUCTION
Production de l’antigène figuré leishmanien (formes promastigotes de Leishmania
infantum MON-1) pour le test d’immunofluorescence indirecte : 168 lames à 18 spots
ont été produites.
Les milieux de cultures :
Milieux NNN : 1611 tubes à vis de 20 ml
Milieux Sérum de Lapin Coagulé : 382 tubes. 2ml de milieu pour chaque tube.
Milieux CCS : 1543 flacons de 50ml, et 134 boites de ROUX de 1 litre.
Solutions :
9 Solution saline de tampon PBS pH 7,2 :7000ml.
9 Solution de conservation des souches : DMSO est de 2000ml.
RPMI + SVF à 15% (15 litres)
97
IV. AUTRES ACTIVITES DU SERVICE
• Mr GARNI contribué à la mise en service et la mise à jour du site web de L’Institut
Pasteur d’Algérie
• Collaboration avec l’équipe de Pharmacologie cellulaire et signalisation.
Département de biologie cellulaire et moléculaire (Pr Djerdjouri). USTHB, et avec
l’équipe de physiologie animale (Pr. Gernigon) sur La physiopathologie du
rongeurs désertique P. obesus (USTHB)
V. PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS
Publications
Z. HARRAT, A. BOUDRISSA- Ecologie des rongeurs réservoirs de la leishmaniose
cutanée zoonotique en Algérie. Rev Med Pharma.2008, 48, 22-26.
P. PAROLA, C. SOCOLOVSCHI, L. JEANJEAN, I. BITAM, PE. FOURNIER,
A. SOTTO, P. LABAUGE, D. RAOULT. Warmer weather linked to tick attack and
emergence of severe rickettsioses. PLoS Negl Trop Dis. 2008;2(11):e338.
PE. FOURNIER, L. BELGHAZI, C. ROBERT, K. ELKARKOURI, AL. RICHARDS,
G. GREUB, F. COLLYN, M. OGAWA, A. PORTILLO, JA. OTEO, A. PSAROULAKI
BITAM I, D. RAOULT. Variations of plasmid content in Rickettsia felis. PLoS ONE.
2008 May 28;3(5):e2289
L. DIB, I. BITAM, M. TAHRI, M. BENSOUILAH, T. DE MEEÛS. Competitive exclusion
between piroplasmosis and anaplasmosis agents within cattle. PLoS Pathog. 2008
Jan;4(1):e7
Publication dans les ouvrages :
Other tick-borne diseases in Europe, I. BITAM and D. RAOULT, chapitre de livre tickborne disease in Europe éditeur, Lispark D et Jaulhac B. Editon KARGER, Suisse
Communications
I. BITAM : Les maladies vectorielles et les changements climatiques dans le Maghreb.
Journée mondiale de la santé OMS sur le thème Changements climatiques et Santé
Organisé par la direction de la santé de Constantine, le 07 Avril 2008.
I. BITAM, T. KERNIF, B. BAZIZ, Z. HARRAT, P. PAROLA & D. RAOULT. Les Puces
et les maladies transmises en Algérie XIIème Journée Nationale ParasitologieMycologie, organisée à l’Université Ferhat ABBAS Sétif le 04 juin 2008
SC. BOUBIDI, A. MESSLEM, M. LAROUCI, S. CHAIB, P. CARNEVAL & Z. HARRAT
BIOLOGIE D’Anopheles multicolor (CAMBOULIU, 1901) A OUARGLA (SUD
ALGERIEN).
XII Journée Nationale de Parasitologie-Mycologie, Sétif, 04 Juin 2008.
SC. BOUBIDI, I. GASSEN, Y. KHECHACHE, K. LAMALI, B. TCHICHA,
C. BRENGUE, D. FONTENILLE & Z. HARRAT. Anopheles gambiae sl, vecteur de
paludisme en Algérie.
98
SC. BOUBIDI, A. MESSLEM, M. LAROUCI, S. CHAIB, P. CARNEVAL & Z. HARRAT.
Biology of Anophles multicolor (Cambouliu,1902) in Ouargla (South Algeria).
Xth European Multicolloquium of Parasitology, Paris, 24-28 August.2008.
SC. BOUBIDI, Z. HARRAT
Les leishmanioses en Algérie: État actuel.
Journée d’information sur l’hygiène du milieu, Constantine 4 Mars 2008
R. GARNI, I. KHERACHI, S. BENBETKA, Z. HARRAT : Apport de La PCR dans
le Diagnostic des Leishmanioses d’origine humaine et animale. XIIe journée de la
SAPMM. Sétif le 04/06/2008
Z. HARRAT, SC. BOUBIDI, A. BOUDRISSA, D. HAMMADI, D. FERRAZ,
F. BENHAMOUDA : Studies on the biology of malaria vector ( Anopheles labranchiae)
in the Tonga lake ( EL Kala /Algeria). Xth European Multicolloqium of Parasitology,
Paris, 24-28 August.2008.
Z. HARRAT, A. BOUDRISSA : Ecologie des rongeurs réservoirs de la leishmaniose
cutanée en Algérie. 3eme Journée d’Infectiologie de l’HCA. Alger 11 juin 2008
HARRAT Z : Place de la recherche sur le paludisme en Algérie. A propos du Projet
EDEN.
Z. HARRAT : Impact des changements climatiques sur les maladies à transmission
vectorielle en Algérie le cas des leishmanioses et du paludisme ; Journée sur les
changements climatiques et Santé MSPRH. 07 Avril 2008.
Z. HARRAT, R. HALIMI, Y. TARFANI, R. BOUAKKAZ- Dracunculose d’importation :
quatre cas confirmés dans le sud algérien. XII journée de la SAPMM. Sétif le
04/06/2008
Posters :
I. BITAM, P. PAROLA, D. RAOULT. Molecular detection of Rickettsia typhi and
Rickettsia felis in fleas from Algeria. IIV International Congress of Rickettsia and
Rickettsial diseases in Marseille, France Mai 2008
I. BITAM, T. KERNIF, B. BAZIZ, Z. HARRAT, P. PAROLA, D. RAOULT. First
detection of Bartonella species in rodents and headgehogs in Algeria. IIV International
Congress of Rickettsia and Rickettsial diseases in Marseille, France Mai 2008
I. BITAM, T. KERNIF, Z. HARRAT, P. PAROLA, D. RAOULT. First description of
Rickettsia aeschlimannii in tortoise ticks Hyalomma aegyptium from Algeria.
IIV International congress of Rickettsia and Rickettsial diseases in Marseille, France
Mai 2008
SC. BOUBIDI, I. GASSEN, Y. KHECHACHE, K. LAMALI, B. TCHICHA,
C. BRENGUE, D. FONTENILLE & Z. HARRAT. First report of Anopheles gambiae sl
in south Algeria.
Xth European Multicolloqium of Parasitology, Paris, 24-28 August.2008.
SC. BOUBIDI, B. MASSONNET, N. CORRE CATELIN, R. LACROIX, Z. HARRAT ET
P. REITER
Etude de la compétitivité de souches transgéniques d’Aedes aegypti (L.) porteuse
d’un nouveau système génétique létal (RIDL). XII Journée Nationale de ParasitologieMycologie, Sétif, 04 Juin 2008.
99
S. BENBETKA, A. BESSAD, I. KHERRACHI, R. GARNI, R. BENIKHLEF, G. MEZAI,
Z. HARRAT
Détection de Leishmania infantum MON-1 chez le chacal par amplification génique
VI. ACTIVITES DE FORMATION
1. Formation dispensée dans le service : (Tab VII)
Nom prénom
A. MOULOUA
T. KERNIF
Organisme
Université
de TiziOuzou
INA
Niveau d’étude
Doctorant
Doctorant
Début
Formation
Sep 2004
Sept 2007
Fin
Formation
Nature de travaux
réalisés
Encadrement
2010
Enquêtes sur la
leishmaniose
canine.
Echantillonnage de
phlébotomes de la
Kabylie
Dr Harrat
(Promoteur)
Sept 2010
Contribution à
l’étude des tiques
dures et puces
(Siphonaptères) et
les germes
transmis en Algérie
Pr. S.E.
Doumendji
Dr Bitam I
Pr. Kechemir
Dr I. Bitam I
A. DJERBOUH
USTHB
Doctorante
Sept 2007
Sep 2010
Etude de la
relation entre
Rickettsia
aesclimannii et
Hyalomma
dromaderii au sud
Algérien
LEMRANI.M
IP Maroc
Médecin
parasitologue
24 /11 /08
03/12/08
Identification des
phébotomes
Mr Boubidi SC
USTHB
Ingéniorat génie
biologique
23/03/2007
24/03/2008
Etude de la
sensibilité des des
souches de
leishmania au N
methyl glucamine
Dr Z. Harrat
S. Bencherifa
Université
de Blida
DES
En biologie
01/JUIN
30 JUILLET
2008
le test de
sensibilité des
leishmanies au
Tanin.
Dr Harrat
IPTunis
Doctorant
28/11/2008
04/12/2008
Initiation au SIG
Mr R. GARNI
ENPT
El Harrach
Doctorante
0101/2008
En cours
Culture cellulaire
Dr Z. Harrat
H. ZAIDI & H.
AOUADI
M. BOURAHLA
R. DERIOUCHE
A. TEBBABI
R. SALAH
100 Services et laboratoires de Diagnostic et Recherche
2. Formation reçue
• Mr BITAM Idir a obtenu avec mention très honorable le diplôme de docteur de
l’Université de la Méditerranée (Aix –Marseille II) dans la discipline « Maladies
Transmissibles et Pathologies Tropicales » soutenu le 21 février 2008
• Mr BENALLAL Kamel a obtenu une bourse de formation pour suivre le Master
International Médical et Vétérinaire (MIE) qui se déroulera à l’Université d’AbomeyCalavi (Bénin) et à l’IPParis d’octobre 2008 à Juin 2009.
• Dr HARRAT Zoubir et Mr BOUBIDI Said-Chawki, ont suivi une formation sur la
taxonomie moléculaire et bio informatique “Taxonomy Molecular Systematics and
Bioinformatics” au Museum d’Histoire Naturelle de Londres, département
d’entomologie (Pr. Ralph Harbach) du 16 to 26 Juin 2008. le stage consistait en une
introduction à la taxonomie des moustiques, à la systématique moléculaire et aux
outils de bioinformatique nécessaires pour l’interprétation des résultats de la
systématique moléculaire et classification phylogénétique. Cette formation rentre
dans le cadre du projet EDEN.
• Dans le cadre du projet ACIP A-04.2007, ayant pour thème « analyse
épidémiologique des foyers de leishmaniose cutanée à Leishmania killicki »,
Mme KHERRACHI Ihcen et Melle BENBETKA Sihem ont effectué un stage de
formation de 07 jours, du 30 juin au 05 juillet 2008 à l’Institut Pasteur de Tunis. Le
sujet de leur stage était l’application de nouvelles méthodes de diagnostic
moléculaire de la leishmaniose.
VII. COURS MISSIONS, SEMINAIRES, REUNIONS
1. Cours :
Cours de formation en entomologie du paludisme du 07/07/2008 au 17/07/2008 à
l’annexe de Sidi Fredj en collaboration avec l’OMS
Objectif : Général:
9 Renforcement du programme national de lutte contre le paludisme par
le renforcement de la surveillance entomologique et de la lutte
antivectorielle dans les wilayas méridionales du pays
Coordonnateur du cours : Dr Z. HARRAT
Collaborateurs : Dr D. Hammadi, Mr SC. BOUBIDI, Mr R. GARNI
Nbre de participants au cours : 20
Cours sur la microscopie du paludisme
Dr HARRAT Zoubir a participé au cours sur la microscopie du paludisme du 8 au
27 novembre 2008 organisé par l’INSP avec le concours de la Banque Africaine du
développement au profit des cadres africains.
Services et laboratoires de Diagnostic et Recherche 101
2. Séminaires :
Seminaire sur le consensus thérapeutique du paludisme ; participation de
Dr Z. HARRAT et SC. BOUBIDI
Thème : « Thérapeutique du Paludisme »
Lieu : Institut Pasteur d’Algérie Annexe de Sidi Fredj
Organisateur : INSP /OMS
Dates 12 Février 2008.
Dr Z. HARRAT et A. BOUDRISSA ont participé au séminaire atelier de formation des
biologistes sur le diagnostic biologique de la leishmaniose cutanée organisé par
l’Etablissement Public de Santé de Proximité d’El Meghaier (El Oued) du 23 au
25 décembre 2008.
3. Missions
Dans le cadre du projet ACIP A-04-2007, Dr HARRAT Zoubir, Mrs BOUDRISSA
Abdelkrim et BOUBIDI Said Chawki, ont effectué une mission à Tataouine (Tunisie)
du 04 au 15 octobre 2008 pour participer avec l’équipe tunisienne aux enquêtes
entomologiques et recherche du réservoir dans le foyer de leishmaniose cutanée à
L. killicki de Tatatouine.
- Prospection entomologique de l’épidémie du paludisme à Tinzaouatine :
Pour la deuxième année consécutive, Mr Boubidi Said Chawki (entomologiste),
a participé à la mission de prospection du foyer épidémique du paludisme
à Plasmodium falciparum de Tinzaouatine (Tamenrasset) survenu en novembre 2007.
Cette mission de 15 jours (24/03 au 05/04/2008), a été conduite par la direction de la
prévention de Ministère de la santé en collaboration avec l’INSP et l’IPA.
Les spécimens de moustiques collectés figurent dans le tableau VIII :
Espèces
Male
Femelle
Total
Anopheles gambiae. sl
12
43
55
Anopheles d’thali
04
06
10
Anopheles cinereus
09
16
25
Culex quinquefasciatus
18
35
53
43
100
143
Total général
Tab VIII : inventaire des moustiques collectés à Tamanrasset en avril 2008
4. Réunions
Dr Z. HARRAT a participé aux différentes réunions du Comité Technique National de
Pilotage de la campagne de lutte contre la leishmaniose cutanée à la Direction de la
prévention du MSPRH aux dates suivantes : 12/04/2008, 24 AVRIL 2008,
et 15/09/2008.
- La réunion du Comité National de lutte contre les zoonoses, le 17 juin 2008
au MSPRH
Annexe 1 : Calendrier des missions (santé publique) (Tab IX)
Dates
Lieu
personnel
Objet
22 au
25/03/2008
Larba Nath
Irathen (TiziOuzou)
I. BITAM
Enquête entomologique sur les phlébotomes
(projet sur les phlébovirus)
du 24/03 au
05/04/2008.
Tinzaouatine
(Tamanrasset)
SC. BOUBIDI
Enquête entomologique et sérologie du
paludisme dans la wilaya de Tamanrasset.
03 au
12/05/2008
Ghardaia
R. GARNI,
SC. BOUBIDI
A. BOUDRISSA
Enquête entomologique. capture de rongeurs
Projet ACIP 04/2007
09 au
15/05/2008
El Kala
Z. HARRAT
EDWARD
ZOLTAN
Mission entomologique. Projet EDEN -Mal
30/06 au
02/07/2008
Laghouat
SC. BOUBIDI
Prospection entomologique du foyer de peste
de Laghouat
14/09 au
17/09/2008
Lac Réghaïa
(Alger)
SC. BOUBIDI
Enquête entomologique sur les vecteurs du
paludisme.
31/08 au
03/09/2008
Sétif
I. BITAM
Enquête sur les réservoirs potentiels
(rongeurs) de l’épidémie de néphropathie
aigue infectieuse survenue à Sétif en juillet 08
Annexe 2 : Calendrier des missions à l’étranger : (Tab X)
Dates
personnel
destination
objet
Du 15 au
19/01/08
Z. HARRAT
Brno
(République
Tchèque)
Participation au troisième meeting du projet
EDEN.
Du 20 au
26/04/08
I. BITAM
Paris
Réunion pour la mise en place du réseau des
entomologistes du RIIP
Du 18 au
20/05/08
I. BITAM
Marseille
Congrès des Rickettsies
Du 07au
17/10/2008
Z. HARRAT
SC. BOUBIDI
A. BOUDRISSA
Tunisie
(TunisTataouine)
Participation à Prospection entomologique et
mammalogique du foyer de leishmaniose cutanée
à Leishmania killicki de Tatatouine dans le cadre
du projet ACIP 04/2007
18/10 au
05/12/08
I. BITAM
Marseille
Finalisation et soutenance de sa thèse de
doctorat d’état
Participation à l’enseignement :
Mr BITAM Idir a participé à l’enseignement aux cours suivants :
Cours Pasteur de Paris : intitulé du cours « Insectes vecteurs et santé humaine :
Les puces et maladies transmises. Du 12 au 14 /05/2008
Master Maladies transmissibles et pathologies tropicales, les puces siphonaptères,
IMTSSA PHARO, Marseille, France du 04/05 AU 24/05
Résidanat en parasitologie à la faculté de médecine Alger. Cours sur l’entomologie
médicale.
Intitulé : Les tiques dures et les maladies transmises.
Laboratoire des Entérobactéries et Vibrions
Chef du Laboratoire : Fawzia MOUFFOK (Pharmacienne/M.A Faculté de médecine)
I. INTRODUCTION
L'activité au sein du laboratoire Entérobactéries Vibrions se divise en 3 volets :
1. L’activité de référence :
Consiste à confirmer le diagnostic biochimique et antigénique des souches identifiées
dans les laboratoires périphériques.
Cette activité est relativement moins importante ; elle dépend de l'arrivée des souches
au laboratoire.
2. L'activité de recherche :
2 thèmes sont actuellement étudiés dans le service, « Campylobacters
themotolérants : Fréquence, épidémiologie, profil de résistance, et génétique
bactérienne dans le cadre d’une thèse de doctorat d’état et Salmonella hadar :
Fréquence, modes de transmission et profil de résistance.
.
3. L'activité de diagnostic :
Est l'activité principale du service, elle consiste d'une part à examiner les selles et
à ce titre, nous recherchons toutes les bactéries impliquées dans les infections
entériques à savoir
• E.Coli GEI pour les enfants de 2 ans et moins
• Salmonella
• Shigella
• Yersinia Enterocolitica
• Campylobacter Jejuni
De plus lorsqu'il y a indication nous recherchons - Staphylococcus aureus - Vibrions
cholériques.
Toute recherche positive est complétée par une identification du germe (biochimique
et antigénique) et la recherche de son activité vis à vis des antibiotiques
D'autre part pour le diagnostic des Fièvres typhoïdiques et paras typhoïdiques, nous
effectuons un sérodiagnostic de Widal et Félix sur le sérum des malades.
II. ACTIVITE DE REFERENCE
1. Identification des souches de Salmonella, Shigella et autres :
Elle consiste à confirmer les souches identifiées comme Salmonella et Shigella par
les laboratoires périphériques.
Cette confirmation est réalisée par 2 batteries de sérums : • Les sérums préparés par l'I.P.A.
• Les sérums importés
Au cours de l'année 2008, nous avons reçu au laboratoire 335 souches pour
confirmation de diagnostic 253 sont des salmonella. L'étude biochimique et
antigénique de ces souches a donné les résultats rapportés dans le tableau 1.
Tableau 1 : Répartition mensuelle des souches de salmonella et shigella confirmées en 2008
Salmonella
non
typhoidique
Salmonella
typhoidique
Shigella
Ssouches
non
réparties
Autres
germes
Total
Janvier
03
00
0
0
02
05
Février
06
01
0
0
01
08
Mars
28
01
0
0
02
31
Avril
45
00
0
09
54
Mai
19
00
0
0
16
35
Juin
47
00
0
0
08
55
Juillet
21
01
0
0
04
26
Aout
52
07
0
0
25
84
Septembre
01
01
0
0
06
08
Octobre
10
00
0
0
06
15
Novembre
10
00
0
0
05
14
242
11
0
0
82
335
Mois
Total
Le tableau 2 donne les résultats des Salmonella typhoïdiques des prélèvements par
wilaya.
Tableau 2 : Répartition des Salmonella typhoïdiques par prélèvement.
Sérovars
Nombre
S. Typhi VW
10
S. Paratyphi B
01
PVT
Eau
01
Copro
Hémo
01
09
00
09
provenance
Tipaza= 01
Djelfa =06
Tiaret =01
Alger =01
Sidi belabbes=01
Alger =01
Le tableau 3 indique la répartition des salmonella non typhoïdiques isolées en 2008
Tableau 3 : Répartition des salmonella non typhoïdiques par prélèvements
S.Braenderup
S.Infantis
04
Copro
Hémo
01
00
autre
Eau de mer = 02
Alger
Volaille = 01
21
06
00
Eau de mer = 01
Blida = 01
Aliment = 14
Alger = 20
Alger
S. Mbandaka
27
01
00
Aliment = 26
S. Muenster
08
00
00
Aliment = 08
Alger
30
08
01
Aliment = 17
Eau de forage = 01
Eau de mer = 01
Incubateur = 01
Bâtiment = 01
Sidi belabbes = 01
Kherrata = 08
Alger = 21
S. Virchow
02
01
00
Volaille = 01
Alger
S. Anatum
28
01
00
Aliment = 27
Alger
S. Montevideo
03
00
00
Aliment = 03
Alger
S. Albany
02
00
00
Aliment = 02
Alger
10
00
00
Eau de mer = 02
Alger
S. Enteritidis
S. Typhimurium
Aliment = 08
S. Agona
04
00
00
Volaille = 04
Alger
S. Ohio
12
01
00
Aliment = 11
Alger
S.Arizonae
10
00
00
Volaille = 10
Alger
S. Altona
15
01
00
Aliment = 14
Alger
03
00
00
Merguez = 02
Alger
S. Newport
S. Indiana
S. Hadar
S. Heidelberg
Pus = 01
06
01
00
Aliment = 05
Alger
08
01
00
Aliment = 06
Eau de mer = 01
Alger
09
06
00
Aliment = 03
Alger
Alger
S. Corvalis
28
05
00
Eau de mer = 09
Aliment = 14
S. Manhattan
01
00
00
Liquide d’ascite = 1
Alger
S. Liverpool
01
00
00
Volaille = 01
Alger
S. Panama
01
00
00
Merguez = 01
Alger
S. Kentucky
04
00
00
Aliment = 04
Alger
05
01
00
Aliment = 03
Alger
S.spp
Eau de forage = 01
Tableau 4 : Autres germes identifiés
Autres germes
Nombre
E- coli
01
Citrobacter youngae
05
Hafnia alvei
03
Proteus mirabilis
07
Shewan. putrefaciens
13
Citrobacter braakii
09
Citrobacter freundii
02
Proteus morganii
01
Pleisiomonas
01
2. Activité de référence pour le Vibrion cholérique :
Au cours de l’année 2008, nous avons reçu au laboratoire 169 souches de vibrions
du laboratoire des eaux, pour confirmation, qui ont données en définitif les résultats
suivants :
Tableau 5 : Résultats de l’identification des souches de Vibrions
Alger
Aéromonas
V. NAG
Autres
V. halophiles
Total
67
02
15
85
169
III- ACTIVITE DE RECHERCHE
1- Projet de thèse de Mme Alamir Hanane : « Campylobacters Themotolérants en
Algérie »
a. Recherche de Campylobacter dans les selles
Sur un total de 927 prélèvements, 15 souches ont été isolées appartenant toutes à
Campylobacter jejuni réparties comme suit
Tableau 6 : Résultats de la recherche de Campylobacter dans les selles en fonction du
sexe et de l’âge
Hommes
Femmes
04
05
Enfants
> 5 ans
< 5 ans
02
04
b. Recherche de Campylobacter dans les aliments
Sur un total de 100 prélèvements de volaille, 09 souches ont été isolées
appartenant toutes à Campylobacter jejuni
Tableau 7 : Résultats de la recherche des Campylobacter dans les aliments
Nature des prélèvements
total
Nbr de cas positifs
Volaille
100
09
Les 15 souches isolées et identifiées ont été testés du point de vue sensibilité aux
antibiotiques :
2- Projet de recherche sur la résistance des salmonella hadar : Belkader et
Mouffok 8 souches isolées des aliments ont été étudiés. L’étude de la sensibilité vis à
vis des antibiotiques a montré l’apparition de nouveaux anti biotypes d’où l’intérêt de
continuer à surveiller ce sérottype d’introduction récente en Afrique.
IV. ACTIVITE DE DIAGNOSTIC
1. Diagnostic des infections entériques.
Pour l’année 2008, nous avons effectué 821 examens de selles. Nous indiquons leur
provenance étiologique dans le tableau 8.
Tableau 8 : Provenance et résultats des examens de selles
Provenance
Quantité d’examens
Positifs
%
Gastroentérites
199
07
3,51
Bilans allergiques
200
01
0,50
Enquêtes
522
16
3,06
821
24
2,90
Totaux
Nous remarquons que 66% des souches isolées proviennent des enquêtes chez le
personnel de la restauration. (Porteurs sains).
Le tableau 9 indique la fréquence mensuelle des prélèvements des selles.
Tableau 9 : Fréquence mensuelle des prélèvements
Mois
Quantités
Positifs
Janvier
137
00
Février
068
00
Mars
073
06
Avril
087
04
Mai
085
03
Juin
092
01
Juillet
034
01
Août
034
01
Septembre
018
00
Octobre
116
00
Novembre
064
06
Décembre
018
02
821
24
Total*
L’identification des germes isoles a donné les résultats figurés au tableau 10.
Tableau 10 : Résultats de l’identification des germes isolés
Genres
Serovars
Quantité
Salmonella
Salmonella enteritidis
Salmonella kedougou
Salmonella heidelberg
Salmonella infantis
04
03
02
01
Shigella
Shigella sonnei
01
E. coli
E. coli 086 B7
01
Campylobacter
Campylobacter jejuni
12
Total
24
L’étude des souches a été complétée par un test de sensibilité aux antibiotiques.
2. Diagnostic indirect des salmonelloses par sérodiagnostic de widal et Félix
98 sérums ont été examinés qualitativement puis quantitativement, lorsque les
résultats sonts positifs à l’aide des suspensions, TO, TH, AO, AH, BO, BH. Au total,
nous avons 98 sérums dont 8 positifs.
Tabeau 11 : Répartition mensuelle des serums pour Serodiagnostic selon leur
provenance géographique
Alger
Blida
Boumerdes
Chlef
Totaux
00
00
11
Janvier
09
02
Fevrier
00
02
00
00
04
Mars
02
02
03
00
08
Avril
06
03
00
00
09
Mai
02
02
00
00
02
Juin
02
06
00
Juillet
09
04
01*
00
00
13
Aout
12
00
01*
00
00
03
Septembre
03
02
00
00
06
Octobre
07
01
00
00
07
Novembre
08
00
00
00
04
Decembre
06
00
00
00
03
02
Totaux
68
01*
01*
02*
25
02*
04*
02
02*S
16
98
*dont positif
COMMUNICATIONS
F. MOUFFOK, C. BELKADER : « Salmonelloses, réservoirs et modes de transmission :
résultats d’une étude menée de 2003 à 2007 ». 3ème journées de l’infectiologie de l’HCA
11 juin 2008.
POSTERS
1- H. ALAMIR, F. TALEB, F. MOUFFOK « Recherche de Campylobacter dans les
selles et étude de sa résistance aux antibiotiques entre 2005 & 2007 » premières
journées de microbiologie clinique sur les maladies émergentes et ré-émergentes.
29 mai 2008 au palais de la culture Moufdi Zakaria.
2- H. ALAMIR, F. TALEB, F. MOUFFOK : « Campylobactériose et douleurs » lors des
7èmes journées médicochirurgicales de Touggourt du 23 au 25 décembre 2008.
ACTIVITES DE FORMATION.
- Formation dispensée dans le Laboratoire sous la direction de Mme MOUFFOK avec
l’aide des techniciens du laboratoire
Nom et prénom
de l’eleve
Organisme
d’origine
S.
Boulahchiche
USTHB
R. Zehana
CQ
A. Rahmoune
USTHB
F. Seray
DES
S. Aouadj
USTHB
Boubekeur H
DES
A. Amrouche
Université de
Bejaia
S. Daouadji
Ingéniorat
Date de
début de la
formation
Date de la fin
formation
Mars 2008
Juillet 2008
Recherche des
Salmonella ds
produits aviaires
Mouffok
Mars 2008
Juuillet 2008
Resistance ATB
aux salmonella
Mouffok
Mars 2008
Juillet 2008
Mars 2008
Juillet 2008
Ingeniorat
nature des Sujet
Campylobacter
selles
Campylobacters
ds aliments
Promoteur
N. Hafferssas
Belkader
Alamitr H
Alamir H
Laboratoire des Entérovirus
Chef de laboratoire : Mohamed SEGHIER (D.M./Docent Faculté de Médecine)
I. INTRODUCTION
Les activités du laboratoire des entérovirus s’inscrivent dans les domaines :
• de diagnostic courant pour les maladies d’étiologie Entérovirale
• de santé publique dans le cadre de la surveillance de la circulation des poliovirus,
particulièrement sauvages, à l’échéance de l’éradication de la poliomyélite.
• de formation et de recherche appliquée.
II. ACTIVITE DE DIAGNOSTIC
Nature des
prélèvements et des
paramètres recherchés
Nombre de
prélèvements
traités
Selles pour la
recherche
201
d’entérovirus
LCR pour la recherche
d’entérovirus
Sérum : recherche
d’anticorps antipoliovirus 1, 2 et 3
Sérum : recherche
d’anticorps anticosackie B1 à B6
Technique utilisée
Nombre de positifs
Isolement sur cellules
17
(84 Paralysies
Identification par
Flasques
Séroneutralisation
Aiguës)
110
80
30
Isolement sur cellules
Identification par
Séroneutralisation
Germes isolés
Entérovirus non polio
0
Poliovirus (vaccinal)
0
Séroneutralisation
Anti P1+P2+P3
Anti P1+P2
Anti P1+P3
Anti P2+P3
Anti P1
Anti P2
Anti P3
Séroneutralisation
Anti Cox B1
Anti Cox B2
Anti Cox B3
Anti Cox B4
Anti Cox B5
Anti Cox B6
= 67
= 14
= 00
= 01
= 00
= 02
= 00
= 10
= 12
= 09
= 10
= 09
= 05
III. ACTIVITES DE SANTE PUBLIQUE
Le laboratoire des Entérovirus est érigé en un laboratoire de référence OMS pour la
surveillance de la circulation des poliovirus dans le cadre de l’éradication de la
poliomyélite.
Participation à des réunions, séminaires et stages :
- Dr. M. SEGHIER : Réunion annuelle de la commission nationale d’éradication de la
Poliomyélite pour la classification des cas de Paralysie flasque aigue (PFA).
- Mr A. CHOUCHANE a participé à l’atelier sur le recyclage des cultures cellulaires du
réseau des Laboratoires Polio organisé par l’OMS AFRO à l’Institut National des
Maladies Transmissibles (NICD) de Johannesburg, Afrique du Sud, du 10 au 18 avril
2008. Cela a permis d’introduire des améliorations dans la gestion des cultures
cellulaires.
- Dr. M. SEGHIER : Un atelier de formation s’est tenu du 02 au 15 novembre 2008 au
laboratoire régional de référence de l’Afrique du Sud (NICD, Johannesbourg). Il avait
pour objectifs de :
• Mettre à jour et donner une orientation sur les tests de différenciation intratypique
des poliovirus
• Fournir une orientation pratique sur les techniques de PCR en temps réel pour le
diagnostic des poliovirus
• Permettre au participant d’effectuer au sein de son laboratoire le transfert de
technologie.
- Dr. M. SEGHIER et Mr A. CHOUCHANE : Dans le cadre de l’évaluation de la prise
en charge du programme d’éradication de la poliomyélite, quatre séminaires
régionaux ont été organisés les 15, 17, 21 et 25 décembre à Mostaganem, Alger,
Constantine et Biskra respectivement. Notre laboratoire plateau technique du
diagnostic virologique a été le co-organisateur.
IV. SYSTEME D’ASSURANCE QUALITE
L’accréditation annuelle du Laboratoire de la Poliomyélite, de l’Institut Pasteur
d’Algérie, comme Laboratoire de Référence National agréé par l’Organisation
Mondiale de la Santé (OMS) pour la surveillance de cette maladie a été renouvelée
après la visite concluante du laboratoire, du 05 au 09 juillet 2008, par le Dr. Annick
DOSSEH, experte OMS, basée au point focal laboratoire, IST BURKINA FASSO. Elle
a porté sur :
- Un test de performance
- Un système d’assurance qualité fondé sur des procédures et des modes opératoires
écrits concernant les différentes étapes de l’analyse et les conditions de son
exécution, la sensibilité des cellules utilisées, les installations l’équipement et les
réactifs et consommables.
V. ACTIVITE DE RECHERCHE
1. Projet de développement
L’entretien de la banque de cellules (11 lignées) par la constitution de lots primaires
de cellules et de lots de travail, conservés dans de l’azote liquide, qui permettent le
renouvellement régulier des cellules utilisées au quotidien (03 lignées) afin de
préserver leur sensibilité, la plus efficace possible.
Préparation des antigènes de poliovirus et des entérovirus non polio utilisés pour le
diagnostic.
Pour la préparation des antigènes, il est essentiel d’utiliser des passages les plus
rapprochés possibles du passage de la souche prototype. En effet, les passages
répétés en culture cellulaire peuvent induire des changements imprévisibles dans
l’antigénicité.
2. Projet de recherche
G Evolution génomique des poliovirus d’origine vaccinale (VPO).
Directeur de projet : Dr M. SEGHIER
Collaborateurs : Dr. BOULAHBAL Dahbia Leila, Mr A. CHOUCHANE et
Mme S. BOURAOUDE.
L’étude porte sur des souches de VPO isolées chez des enfants se présentant à
la vaccination de rappel de 18 mois, au niveau du centre de vaccination de la
commune de Staouéli.
G Circulation des Entérovirus dans l’environnement.
Directeur de projet : Dr M. SEGHIER
Collaborateurs : Dr. BOULAHBAL Dahbia Leila, Mr A. CHOUCHANE et
Mme S. BOURAOUDE.
Cette étude va permettre de rechercher une éventuelle circulation silencieuse de
poliovirus sauvages dans les eaux usées à défaut de leur absence chez les
individus depuis l’année 1996. Elle va également permettre d’analyser les
poliovirus vaccinaux isolés et voir si leurs génomes seraient le siège de dérives
génétiques potentiellement menacentes pour le programme d’éradication de la
poliomyélite. De plus, une recherche d’entérovirus non polio sur une période
suffisamment longue va nous renseigner sur l’épidémiologie de ces virus, du
moins dans la région ciblée.
VI. PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS
1. Communications orales
Mohamed SEGHIER. Les virus de la grippe : L’émergence des sous types A. 1ère
Journée de la SAMIC Palais de la culture Alger, le 29 Mai 2008.
2- Communications affichées
M. SEGHIER, S. BOUDJADJA, M.BESSAUD & A. CHOUCHANE, "Coxsackievirus
A24 isolates causing an outbreak of Acute Hemorrhagic Conjunctivitis in Algeria".
Communication affichée à la Conférence Scientifique Internationale organisée par
l'Institut Pasteur. Paris 26 et 27 juin 2008.
VII. ACTIVITE DE FORMATION
1. Formation dispensée dans le laboratoire et/ou l’enceinte de l’IPA : formation
pratique aux techniques d’isolement sur cellules des Entérovirus et les méthodes
d’identification par séroneutralisation. La durée du stage est d’environ 5 semaines
pour chaque résident.
Nom et prénom de la
personne formée
Organisme
d’origine
HAMAILI
Linda
ATBA BEN ATBA
Amel
DROUAZ
Nadjoua
ABAZIZ
Hassiba
BELLOUFA
Amine
ARIB
Samia
SOUISSI
Mériem
RAMOUL
Hadia
HAMIDI
Moufida
ARIBI
Med Lamine
TLEMSANI
Med Adel
ABDAOUI
nadjoua Faculté de
SID
saliha Médecine
MEZAGHCHA
ouahiba
BENAKCHA
Naima
BENDJEMAA
Ali
SERRAR
Hinda
DJEBABRA
Souad
CHOUITER
Asma Insaf
MALKI
Ali
Niveau
d’étude
Période
de la
formation
Nature des
travaux
réalisés
Obs.
Encadrement
Dr SEGHIER
DEMS
2008
Résidanat
Dr. D.
BOULAHBAL
Mr
A.CHOUCHANE
me
M S.
BOURAOUDE
2. Formation dispensée hors du laboratoire
Nom de
l’enseignant
Dr SEGHIER
Lieu de
L’enseignement
Faculté de
médecine d’Alger
Destinataires de
l’enseignement
Etudiants en
médecine
Résidents en
Microbiologie
Volume horaire
annuel
70 heures
Type
d’enseignement
Virologie
Laboratoire de Génétique
Chef de Service : Mlle SERIDI Nabila (Chargée de Recherche) (de janvier à avril 2008)
Les activités du laboratoire de génétique concernent deux unités : Unité de Biologie
Moléculaire et Unité de Cytogénétique.
Unité de Biologie Moléculaire :
L’objectif de cette unité est le développement progressif de la recherche sur la biologie et
génétique du protozoaire du genre Leishmania pris comme un modèle d’étude.
1. Détection et identification moléculaire des parasites
Les activités se résument comme suit :
1- Sur une collection de 42 différents prélèvements, les tests PCR réalisés au
moyen de différents couples d’amorces, pour lesquelles les résultats étaient
négatifs (entre 27 et 42 échantillons), ont été repris afin de confirmer la négativité
ou de relever d’éventuel problème de condition de réaction.
2- L’évaluation de la sensibilité et la spécificité des applications en PCR ciblant le
kDNA, et le rDNA, était en cours de réalisation.
3- En matière d’identification de l’espèce, l’outil ITS1 appliqué en PCR pour la
détection et suivi d’une restriction enzymatique pour l’identification concomitante
des parasites au niveau des lésions était envisagé.
Unité de Cytogénétique :
Dans le cadre de la mise en place du diagnostic génétique des anomalies héréditaires,
l’établissement des caryotypes était poursuivi pour 9 autres patients.
Certains caryotypes normaux nécessitent des précisions quant aux anomalies de
structure (non de nombre) à savoir les translocations équilibrée, les inversions ou
duplications. Ces précisions avaient fait l’objet d’essais de mise au point de marquage
des chromosomes ou « Banding ». La poursuite de la mise au point de la technique était
en cours.
Encadrement de mémoire de fin d’étude (en cours de réalisation):
Nom & Prénom
des étudiants
Organisme
d’origine
Date du
début de la
formation
USTHB
Date de la fin de
la formation
Diplôme
Promoteur
Mars 2008
D.E.S en
Génétique
N. SERIDI
USTHB
Mars 2008
D.E.S en
Génétique
N. SERIDI
USTHB
Mars 2008
D.E.S en
Génétique
N. SERIDI
Université de
Bejaia
Mars 2008
D.E.S en
Génétique
N. SERIDI
- ATIA Youcef
- MEZIENE
BENTAHER
MEZIENE Hamza
- CHAIB A. Wahab
- CHEBBAH Souad
- ZIAMNI Kahina
- MALEK Fahima
Formation dispensée hors du service :
Nom de
l’enseignant
Lieu de l’enseignement
Destinataire de
l’enseignement
Module
N. SERIDI
FSB. USTHB
Etudiants en biologie
Génétique
N. SERIDI
FSB. USTHB
Licence Génétique
Génotoxicologie
N. SERIDI
FSB. USTHB
Licence Génétique
Immunogénétique
Laboratoire Hélicobacter Pylori
Chef de laboratoire : Fawzia MOUFFOK (Pharmacienne/ M.A/ INESSM).
INTRODUCTION
L’infection à H.pylori est l’une des infections chroniques les plus répandues dans le
monde : 20 à 90% des individus sont infectés selon les pays. Pour un pays donné, la
prévalence varie en fonction du statut socio-économique des individus et du degré de
promiscuité dans lequel ils vivent. La bactérie se transmet directement d’homme à
homme par voie orale et l’infection est acquise dans la jeune enfance le plus souvent au
cours d’une transmission intrafamiliale. Notre activité consiste à rechercher cette
bactérie soit directement par culture de biopsies gastriques ou indirectement par
recherche d’antigènes dans les selles ou d’anticorps dans le sang
I- RECHERCHE
1- Activité « Etudes des infections à Helicobacter pylori associé aux pathologies
gastro duodénales » : consiste essentiellement en une mise en culture des
biopsies, une recherche in vitro des antigènes d'Helicobacter pylori dans les
échantillons de selles et des sérologies H.P dans le sang. Cette activité est
effectuée dans le cadre de projets de recherche "laboratoire de recherche d'HP "du
ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche scientifique sous la
directions du professeur TOUCHENE et d’une ACIP durant l’année 2008, notre étude
conçernant “ Les infections à Helicobacter pylori associées aux pathologies
gastro-duodenales a porté sur :
- En 2008, 471 biopties anthrales et fundiques prélevés chez les adultes et les
enfants et reçus des hopitaux de Kouba, Parnet. Les résultats de cette étude
figurent au tableau 1.
Tableau 1 : Répartition mensuelle de la recherche de HP dans les biopsies
Quantité de biopsies
reçues
Culture positives
Antibiogramme
Janvier
52
13
13
Février
46
18
17
Mars
40
16
16
Avril
64
24
19
Mai
45
16
16
Juin
69
26
24
Juillet
44
17
15
Août
00
00
00
Septembre
22
05
5
Octobre
40
12
11
Novembre
24
07
07
Décembre
25
04
04
471
158
147
Mois
Total
- 137 sérums prélevés chez les memes malades sont examinés pour rechercher les
facteurs de virulence VacA et CagA par Western Bloot. Les résultats de ces tests
sont donnés par le tableau 2.
Tableau 2 : Facteurs de virulence des sérums examinés
Quantité de sérums
221
HP( + )
159
HP( - )
62
- 264 selles : examens non invasifs donc plus interessants en particulier chez
l’enfant. Les resultats de ce travail sont consignés dans le tableau 3.
Tableau 3 : Résultats de la recherche de H pylori dans les selles
Mois
Quantité de selles reçus
Positives
Janvier
29
15
Février
52
25
Mars
26
8
Avril
56
31
Mai
59
28
Juin
50
20
Juillet
46
16
Août
0
0
Septembre
0
0
Octobre
0
0
Novembre
0
0
Décembre
0
0
318
143
Total
2- ACIP Helicobacter pylori : Cette étude a débuté fin de l’année 2006
Patients inclus et souches H.pylori isolées :
De Juillet 2006 à Juillet 2007, nous avons collecté 111 biopsies de 111 patients inclus
dans l’étude, soit 75 femmes et 36 hommes âgés entre 17 et 70 ans, en collaboration
avec le service de médecine interne de l’Hôpital de Kouba.
Au total nous avons isolé 45 cultures positives à H.pylori soit une prévalence de 41%.
Tableau 1 : Résultats des prélevements étudiés dans le cadre de l’ACIP
Patients inclus
Nombre
Echantillons de sérums
111
Biopsies Gastriques
111
Positifs
• Antre
111
29 +16
• Fundus
111
00+16
29
• SAntre + Fundus
16
ADN (extraction par méthode classique :
Phénol / chloroforme).
• Antre
23
- Sensibilité aux antibiotiques des souches isolées :
Un antibiogramme a été réalisé pour les 45 souches isolées, aucune n’était
résistante à l’Amoxycilline ni à la cdlarithromycine.
8% de résistance à la Ccarithromycine.
42% de résistance au Métronidazole.
16% de doubles Résistance (Clarithromycine+Métronidazole).
Encadrement :
Mémoire de fin d’étude en vue de l’obtention du diplôme d’études universitaires
appliquées, Option Analyses Biologiques Biochimiques.
Sujet : Diagnostic indirect des infections à Helicobacter pylori.
Présenté par : Mlle Chemissa Amel Kamelia et Benmesbah Fadéla
Université : Houari Boumedien
3- PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS
- Publications :
1. F. MOUFFOK, F. TALEB, F. KIAS et all « Tests diagnostiques de l’infection à
Hélicobacter pylori chez l’enfant » Archives de l’Institut Pasteur d’Algérie T.66
2007/2008.
2. F. KIAS, F. MOUFFOK, F. TALEB, A. BOUHADEF, Z. GUECHI, N. MATOUGUI,
B. TOUCHEN : « Helicobacter pylori : Séroprévalence des facteurs de
virulence CagA et VacA et la diversité des souches en Algérie » Archives de
l’Institut Pasteur d’Algérie T.66 2007/2008
- Posters :
F. KIAS, F. TALEB, F. MOUFFOK, A. BOUHADEF, Z. GUECHI, B. TOUCHENE
« Diagnostic de l’infection à Helicobacter pylori chez l’adulte en Algérie »
communication affichée : 7èmes Journées médicochirurgicales de Touggourt,
21-26 Décembre 2008.
Laboratoire des Listeria
Chef du laboratoire : El-Hadj-Ahmed LEBRES (DVS-Maître de recherche)
Parmi les principales activités du Laboratoire des Listeria, notons :
• La surveillance bactériologique des denrées alimentaires importées en général de
pays où la listériose (maladie à transmission alimentaire certaine) sévit à l’état
endémique,
• La surveillance bactériologique également des denrées alimentaires produites
localement,
• la participation à l’élaboration de textes réglementaires (méthodes d’analyses et
spécifications microbiologiques) relatives aux denrées alimentaires en collaboration
avec le Ministère du Commerce.
• la maîtrise de la situation épidémiologique nationale, notamment dans la région
d’Alger, pour le moment.
• L’alerte à la direction de la prévention, Ministère de la santé, de la population et de la
réforme hospitalière, en cas de situation inhabituelle.
I. ACTIVITES DE RECHERCHE
1. Surveillance épidémiologique des listérioses par recherche, isolement,
dénombrement et identification des Listeria et de Listeria monocytogenes
particulièrement à partir du lait cru.
2. Surveillance épidémiologique des listérioses par recherche, isolement,
dénombrement et identification des Listeria et de Listeria monocytogenes
particulièrement à partir de denrées alimentaires diverses autres que le lait cru.
II. ACTIVITES DE DIAGNOSTIC
Au cours de l’année 2008, le laboratoire des listeria a effectué selon la méthode de
référence ISO 11290 partie 2, basée essentiellement sur le dénombrement de listeria
monocytogenes à partir des denrées alimentaires l’analyse de 834 prélèvements dont la
nature, le nombre et le pourcentage, figurent dans le tableau n°1 ci-après.
Tableau n°1 : Nature, nombre et pourcentage des produits analysés en 2007.
Nature des prélèvements
nombre
pourcentage
Viandes & produits carnes
235
28,17%
fromage
210
25,17%
Laits crus & P.D.L.
083
09,85%
Poissons congèles
024
02,87%
Poulets congèles
009
01,07%
Produits carnés cuits
161
19,30%
Fromages traditionnels
105
12,58%
Lingette, calot
007
00,83%
834
100%
Total
Les résultats du dénombrement des Listeria en fonction de la nature des denrées
analysées figurent dans le tableau n°2 ci-après.
Tableau n°2 : Résultats des analyses en fonction de la nature des denrées alimentaires
analysées.
Nature
Nombre de souches isolées Total prélèvements
Viandes & produits carnes
05
035
fromage
06
210
Laits crus & P.D.L.
02
083
Poissons congèles
02
024
Poulets congèles
00
009
Produits carnes cuits
03
161
Fromages traditionnels
04
105
Lingette, calot
00
007
22
834
Total
Les résultats de l’identification biochimique des souches isolées en fonction de la nature
des denrées analysées figurent dans le tableau n°3 ci-après.
Tableau n°3 : Résultats de l’identification biochimique des souches de Listeria en
fonction de la nature des denrées alimentaires analysées.
Nature des souches
L.
mono
Lait cru
L.
innocua
L.
ivanovii
0
/02
/
L.grayi
L.
welshimri
L.
ssp
Total des
souches
identifiées
02
Viande et produits
carnés
03
01
03
/
03
10
Fromage traditionnel
/
03
01
/
/
04
Fromage
commercialisé
/
/
03
/
03
06
Total des souches
03
04
09
/
06
22
Sur les 834 prélèvements effectués, nous avons isolé et identifié 22 souches de listeria
dont 03 monocytogenes, soit à un taux de 2,63%.
Par ailleurs, bien que seule listeria monocytogenes est pathogène aussi bien pour
l’homme que pour l’animal, le fait de la retrouver au taux de 2,63%, ceci reste non
négligeable vu que la listériose est classée comme maladie à transmission alimentaire
certaine rare mais grave de par les séquelles qu’elle peut engendrer tels que les
avortements, méningites, méningo-encéphalites, septicémies, troubles psychiatriques
allant jusqu’au décès.
Ces résultats signifient donc qu’on n’est pas du tout à l’abri d’une éventuelle flambée
épidémique, par conséquent, une étude relative à l’analyse du risque listeria
monocytogenes, fondée sur l’évaluation du risque, la gestion du risque ainsi que la
communication sur les risques mérite d’être entretenue dés à présent en collaboration
avec les pouvoirs publics.
Laboratoire de Microbiologie Vétérinaire et d’Epizootiologie
Chef du laboratoire : Abdelhamid TARIL (DV Maître de recherche) jusqu’à juillet 2008
Nacéra TOUARIGT (D.V./Chargée de recherche) à partir d’août 2008
L’activité du Laboratoire de Microbiologie Vétérinaire et d’Epizootiologie est scindée en 02, volets
bien distincts :
- Le premier volet regroupe des activités de diagnostic, de recherche et de formation
- Le deuxième volet réuni les activités de production, de contrôle et de développement du
vaccin anticlaveleux.
ACTIVITES DE DIAGNOSTIC ET DE RECHERCHE
1. Unité rage : diagnostic et recherche
L’unité rage assure le diagnostic de laboratoire de la rage, elle prend également en charge le
titrage des anticorps antirabiques par la méthode ELISA.
1.1. Le diagnostic
Le diagnostic de la rage au laboratoire (rage animale essentiellement) est un examen postmortem effectué par trois techniques :
- L’examen microscopique de frottis de matière cérébrale par immunofluorescence directe
(I.F.D.) pratiquée sur tous les prélèvements.
- L'inoculation aux souris de laboratoire par voie intracérébrale, et leur mise en observation
durant 28 jours, pour tous les prélèvements négatifs en I.F.D.
- L’inoculation de cultures cellulaires (neuroblastomes murins ou cellules N2a) également
pour les prélèvements négatifs à l’IFD.
Pour cause de défaillances des équipements et de certains réaménagements des locaux qui
n’ont pas été réalisés, l’inoculation des cultures cellulaires n’a pas été pratiquée au cours de
cette année.
1.2. Les prélèvements :
Les prélèvements pour le diagnostic de la rage sont effectués sur des encéphales.
L’extraction des encéphales est réalisée au niveau du service à partir :
• De cadavres entiers lorsqu’il s’agit d’animaux de petite taille, domestiques ou sauvages
(chiens, chats, chacals…).
• De tête uniquement pour ce qui concerne les grands animaux
Nous recevons également des cerveaux humains (adressés par les hôpitaux) pour confirmation
du diagnostic de la rage.
Les prélèvements proviennent de toutes les wilayas du pays, mais principalement des wilayas
du centre.
Il s’agit, dans la majorité des cas, d’animaux suspects (signes cliniques évocateurs, mort
suspecte, abattage pour cause d’agressivité), et susceptibles d’avoir transmis la rage.
Les demandes d’examen sont exprimées par les propriétaires d’animaux suspects, par les
personnes exposées, par des vétérinaires privés ou du secteur public et par les services de
prévention des différents secteurs sanitaires du pays.
Les prélèvements arrivés en mauvais état de conservation, voir même putréfiés, et impossibles
à traiter, sont nécessairement considérés comme positifs.
1.3. Résultats des examens réalisés
1.3.1. Immunofluorescence directe (IFD) :
Les résultats des examens microscopiques effectués sont rapportés dans le tableau 1.
Cette année, 297 prélèvements, toutes espèces confondues, ont été traités.
Sur les 297 prélèvements, 291 ont été examinés et ,137 se sont révélés positifs
On remarque que les chiens demeurent le principal réservoir de la rage avec 61,31% des
cas positifs.
Contrairement aux années précédentes, la rage bovine occupe la 4ème place avec 7,30%
des cas positifs. Nous avons aussi reçu un nombre important de cerveaux humains (8 sur
les 9 se sont révélés positifs), ce qui présente toujours une préoccupation de santé
publique.
Tableau 1 : Résultats des examens de rage par espèces
Reçus
Examinés
Positifs
% positivité par rapport au
total des examens positifs
négatifs
Impossibles
Chien
163
160
84
61,31%
76
3
Chat
069
067
15
10,95%
52
2
Ovin
021
021
12
8,76%
09
0
Bovin
017
016
10
7,30%
06
1
Cerveaux humains
009
009
08
5,84%
01
0
Equidés
006
006
06
4,38%
00
0
Caprin
006
006
02
1,46%
04
0
Lapin
001
001
00
0,00%
01
0
Rat
001
001
00
0,00%
01
0
Hamster
0v1
001
00
0,00%
01
0
singe
001
001
00
0,00%
01
0
Gazelle
0v1
001
00
0,00%
01
0
tortue
0v1
001
00
0,00%
01
0
297
291
137
100,00%
154
6
Espèces
TOTAL
*
1.3.2. Inoculation aux souris :
Les prélèvements négatifs à l’IFD, sont inoculés à des souris par voie intracérébrale.
L’inoculum est constitué par le surnageant de broyat de fragments de cerveau.
- Les souris inoculées sont gardées en observation pendant 28 jours, avant la confirmation du
diagnostic définitif.
Les 149 prélèvements négatifs à l’IFD ont tous été inoculés aux souris.
*
Prélèvements en état de putréfaction très avancé: examens impossibles. Ont été considérés comme Positifs.
1.3.3. Titrage des anticorps antirabiques :
Le titrage des anticorps antiglycoprotéiniques humains est réalisé par une méthode
immuno-enzymatique utilisant le kit "Platélia-Rage" (réactif BIORAD).
Le titrage des anticorps permet d’apprécier le degré d’immunité chez les sujets en cours de
traitement vaccinal antirabique ou vaccinés à titre préventif.
Il concerne essentiellement les personnes professionnellement exposées : vétérinaires
praticiens, étudiants vétérinaires, personnel des fourrières canines …
112 sérums ont ainsi été traités.
2. Unité de bactériologie et de sérologie vétérinaire
L’activité du laboratoire porte essentiellement sur le traitement de prélèvements de volailles
provenant :

D’entreprises de la filière avicole
De veterinaire praticiens
Des aviculteurs
Des laboratoires vétérinaires régionaux notamment pour l’identification ou le typage des
souches.
Outre le diagnostic bactériologique, l’unité prend également en charge le diagnostic
sérologique de la Leptospirose humaine et animale et de certaines maladies aviaires
(New-castell, mycoplasmoses).
2.1. Autopsies :
La plupart des prélèvements destinés aux examens bactériologiques et parasitologiques
sont réalisés au service même après autopsies d’animaux et examens nécropsiques.
5548 autopsies ont été ainsi pratiquées, à partir de 506 lots d’animaux.
Le tableau 2 rapporte la répartition de ces autopsies.
Tableau 2 : Nombre d’autopsies
Nature
Nombre d’autopsies
Nombre de lots
Pondeuses et poulettes démarrées
0180
036
Reproducteurs chair et ponte
0257
068
Poulets de chair
1506
259
Poussins ponte et chair
3555
307
Dindonneaux et dindes
050
013
5548
683
TOTAL
2.2. Examens bactériologiques
Les examens bactériologiques concernent :
• Les prélèvements réalisés au laboratoire après autopsie
• Les œufs : œufs de consommation, oeufs fécondés, œufs embryonnés
• Les organes d’animaux d’espèces et d’origines diverses : en général organes
d’animaux exotiques provenant du parc zoologique d’Alger, ou prélèvements réalisés
sur le terrain par des vétérinaires patriciens.
• Les écouvillons (effectués par les praticiens sur animaux malades)
• Les écouvillons réalisés dans le cadre du contrôle bactériologique des bâtiments et
des équipements d’aviculture, et pratiqués sur les murs, les mangeoires, les surfaces
des incubateurs et des éclosoirs, les cages, les bacs à eau, la litière, etc.
3480 examens bactériologiques ont ainsi été réalisés (tableau 3).
* EURL = Entreprise Unipersonnelle à Responsabilité Limitée
Tableau 3 : Nombre de prélèvements examinés
Nature
Volaille
(Poussins ponte et chair, poulets de chair, poulettes démarrées
pondeuses, reproducteurs ponte et chair)
Œufs de volailles :
(œufs de consommation, à couver et embryonnés)
Organes d’animaux
(buse, cerf de barbarie, zèbre, ours)
Souches à identifier : laboratoire vétérinaire de Draa Ben khedda
Nombre de lots
Nombre d’examens
683
2732
76
76
06
01
24
01
614
614
01
22
10
01
22
10
1413
3480
Divers :
• Ecouvillons de surface des locaux et des bâtiments et des
équipements d’aviculture.
• Pus de chien
• Fécés d’animaux (chien, faucon, paon)
• Aliments de volaille (finition, croissance et démarrage
TOTAL
Tableau 4 : Résultats des examens bactériologiques effectués
Origine
Examens positifs
Examens négatifs
Total
Volaille (Poussins, poulets de chair,
pondeuses, reproducteurs, dindonneaux)
156
527
0683
Œufs
(de consommation, à couver et incubés)
003
073
0076
Organes d’animaux
469
179
0648
Divers :
(Ecouvillons, pus, litières, aliments…)
469
179
648
Souches à identifier
01
00
01
638
794
1432
TOTAL
Les résultats des examens bactériologiques positifs sont consignés dans le tableau 5.
Tableau 5 : Résultats des examens bactériologiques positifs
Origine
Germes isolés
Volaille
• Pondeuses
E.coli
Salmonella gallinarum
pullorum
Salmonella infantis
Salmonella Enteritidis
E.coli
Salmonella gallinarum pullorum
Salmonella corvalis
y Reproducteurs (ponte et chair)
Nombre
22
07
02
01
32
34
01
01
01
37
E.coli
Streptococcus groupe D
Salmonella hader
Salmonella livingstone
Salmonella infantis
Salmonella Virchow
Salmonella gallinarum pullorum
Salmonella typhi murium
16
01
01
04
30
01
03
01
01
02
• Poulets de chair
Salmonella infantis
E.coli
01
07
01
17
Dindes
E.coli
Salmonella livingstone
06
02
01
01
01
Œufs
(œufs de consommation, à couver)
E.coli
Salmonella infantis
02
01
Organes d’animaux
E.coli
02
01
Bacillus
E. coli
Proteus mirabilis
Streptococcus D
Salmonella infantis
Staphylococcus saprophyticus
Staphylococcus auréus
Citrobacter Freundi
Citrobacter diversus
214
029
028
007
001
001
338
006
006
001
040
004
001
y Poussins ponte, chair et dindonneaux
Divers
(Ecouvillons
litière)
Aliments,
Souches à identifier
fientes,
61
26
11
03
03
01
2.3. Antibiogrammes
Un antibiogramme est réalisé sur tous les germes isolés à l’unité, à l’exception des
bacillus (gammes d’antibiotiques spécifiques de ce germe non disponibles) et des germes
isolés à partir d’écouvillons de surfacesde ce germe non disponibles) et des germes isolés
à partir d’écouvillons de surfaces.
174 antibiogrammes ont été effectués selon la méthode NCCLS (appliquée au laboratoire
depuis mai 1999), en présence de souches de référence :
2.4. Contrôles de qualité internes
Dans le cadre du réseau AARN pour la surveillance de la résistance des bactéries aux
antibiotiques, des contrôles de qualité sont réalisés une fois par semaine
264 antibiogrammes ont ainsi été réalisés au cours de ces contrôles et ce en presence
des souches de référence – E.coli ATCC25922, Staphylococcus aureus ATCC25923,
Pseudomonas aeruginosa ATCC27853 –selon les normes NCCLS et les données
obtenues sont saisies avec le logiciel "Whonet 5.4".
Tous les antibiogrammes effectués sur les germes isolés dans l’unité sont réalisés avec la
méthode NCCLS, en présence des souches de référence citées ci-dessus
2.5. Examens sérologiques
2.5.1. Sérodiagnostic des mycoplasmoses aviaires :
La méthode de diagnostic sérologique des mycoplasmes aviaires est une réaction
d’agglutination sur lame à l’aide d’un antigène coloré ; Les antigènes spécifiques utilisés
sont :
• Mycoplasma synoviae
• Mycoplasma gallisepticum
• Mycoplasma meléagridis
84 examens ont été effectués donnant les résultats suivants :
• Réaction à l’antigène Mycoplasma synoviae
- 18 positifs
- 12 Négatifs
• Réaction à l’antigène Mycoplasma gallisepticum
- 01 positif
- 28 Négatifs
• Réaction à l’antigène Mycoplasma méléagridis
- 25 Négatifs
2.5.2. Sérodiagnostic de la Leptospirose :
a. Techniques utilisées :
Les techniques utilisées pour le diagnostic sérologique de la leptospirose sont :
• La technique de macro-agglutination à l’aide de l’antigène TR (antigène thermorésistant)
• Le test d’Agglutination Microscopique ou MAT (Micro Agglutination Test). également
dénommée réaction d’agglutination-lyse (RAL), ou encore réaction de Martin et Petit, est
la technique de référence.
Cette réaction donne des renseignements de 02 types sur l’infection à leptospires
- Renseignements qualitatifs permettant la détermination du sérogroupe responsable de
l’infection ;
- Renseignements quantitatifs, donnés par le titrage des anticorps sériques permettant
l’évaluation du degré d’agglutination.
b. Résultats des examens effectués :
253 sérums ont été reçus dont 248 ont été examinés.
Le non traitement des 05 sérums est motivé par une hémolyse (01sérum) ou une
contamination (03 sérums) ou une quantité insuffisante ne permettant pas l’examen (01
sérum).
Tableau 6 : Résultats des examens sérologiques de leptospirose Macro-agglutination à
l’antigène TR
Sérums reçus
Sérums examinés *
Positifs
Négatifs
253
248
96
149
A noter que plusieurs sérogroupes peuvent être retrouvés dans un même prélèvement. C’est
le titrage des anticorps qui permet de se prononcer sur le sérogroupe responsable de
l’infection en cours. En effet, le Centre National de Référence des leptospires de l’Institut
Pasteur de Paris indique que le seuil de positivité correspond à un titre ≥1/100.
*
05 sérums n’ont pas été examinés
Tableau 7 : Sérogroupes de leptospire identifiés par le Test de Micro-agglutination (MAT)
Sérogroupe
Nombre de sérums positifs
(pour chaque sérogroupe)
Titre (UI/ml)
(pour chaque sérum positif)
Ictero-haemorragiae
26
6 x 1/ 100; 9 x1/ 200
8 x 1/ 400; 2 x 1/800
1 x 1/1600
grippotyphosa
02
2 x 1/ 100
03
1 x1/200 :1x1/400
1x1/800
03
1 x1/100 :1x1/200
1x1/800
Tarrasovi
01
1 x 200
Sejröe (sejröe)
05
4x 1/ 100
1x 1/ 400
Bataviae
03
3 x 1/ 100
Panama
01
1 x 1/ 100
Canicola
Sejröe hardjobovis
TOTAL
44
2.5.3. Sérologie virale (Maladie de NewCastle) :
Le diagnostic sérologique de la Maladie de Newcastle (également désignée sous le terme
de Pseudo-Peste aviaire), par le test de l’Inhibition de l'Hémagglutination (H.I.TEST) est
effectué, soit en parallèle avec le diagnostic nécropsique, et ceci pour confirmation de la
maladie, soit pour la surveillance de la séroconversion, après vaccination.
Les prélèvements (sang) sont en général réalisés au niveau du service, à partir d’animaux
vivants, mais nous recevons également des prélèvements réalisés sur le terrain même.
87 prélèvements ont été examinés ; les résultats obtenus sont consignés dans le tableau 8.
Tableau 8 : Résultats des H.I.Tests chez la volaille
Taux post-vaccinaux
1/20 à 1/5120
Maladie de New-Castle
> 1/5120
Négatifs <1/20
Total
Poulets chair
01
0
02
03
Pondeuses
07
0
02
09
Repro-chair
15
0
0
15
Repro-ponte
21
0
0
21
Poussins chair
07
0
0
07
Poussins ponte
02
0
0
02
Sang
26
0
04
30
79
0
08
87
Nature
TOTAL
2.6. Examens parasitologiques et mycologiques :
105 examens parasitologiques ont été réalisés au niveau du service dont 34 sont positifs.
Les résultats des examens positifs sont rapportés dans le tableau 9
Tableau 9 : Résultats des examens parasitologiques et mycologiques
Nature
Nombre
Négatifs
Positifs
18
Volaille
(poules pondeuses, poulets
de chair…)
79
61
• Coccidioses (Eimeria mivati) : 09
• Mycoses : 09
(Aspergillus
niger
Aspergillusfumigatus
Aspergillus flavus Aspergillus nidulans)
08
Coccidioses (Eimeria mivati) : 01
Mycoses : 07
(Aspergillus niger Aspergillusfumigatus Aspergillus
flavus)
Dindes
13
05
buses
02
02
00
Faucons
03
03
00
Paon
08
04
105
75
TOTAL
04
- Œufs de capillaria sp : 03
- Ookystes d’Eimeria Mitis : 01
34
II. ACTIVITES SCIENTIFIQUES :
• Projets de recherche :
1. Projet RABMED Control. (Détails Cf. rapport 2007)
Dr BELKAID E. (épouse ABDELATIF) : Coordinatrice pour l’Algérie.
Dr A. TARIL
Le projet RABMED Control intitulé « Identification écologique et épidémiologique des
facteurs clé de la dynamique et du contrôle de la rage en Afrique du Nord et
implications sur le statut de la rage dans le Sud-Ouest Européen » (Détails Cf. rapport
2007)
- Les travaux réalisés au cours de l’année 2008.
¾ Réunion de coordination regroupant les partenaires Algériens et Tunisiens
(Alger –IPA Kouba, (17au18 mars 2008)
¾ Dans le cadre de la mise en place du diagnostic de la Rage au laboratoire de
l’université de Menoufia (Egypte) Dr Ahmed Essify Maître assistant s’est
familiarisé avec les différentes techniques de diagnostic au sein de notre
laboratoire (16 au 23 Mars 2008).
¾ 2ème congrès du projet (E.BELKAID, A.TARIL, N.BENHABYLES, C.HADJIDJ) :
Université de Manoufia - EGYPTE, (19au22 avril 2008).
¾ Etude des chauves-souris en tant que réservoir potentiel du virus rabique en
Algérie :
Cette étude a été assurée par l’équipe de l’Institut Pasteur (Belkaid E., Taghlit M.
et Soufi A.) en collaboration des équipes de la direction des forets (Ministère de
l’agriculture) et avec l’assistance de l’expert espagnol Dr. SERRA COBO. J
Première mission (4 au 8 avril 2008) : prospection au niveau des gites naturels des
chiroptères :
Site de Chréa, Site de Bejaia.
¾ Suite à cette première mission d’exploration et aux résultats satisfaisants que nous
avons obtenues et que nous avons exposées au cours de la réunion du
Rabmedcontrol en Egypte et avec accord de la Communauté Européenne, il a été
décidé que l’étude soit poursuivie.
Deuxième mission (5 au 9 mai 2008) : exploration des sites de chiroptères
Sites de Kala et Annaba
¾ Etude épidémio-moléculaire des lyssavirus circulant en Algérie (accompli en
collaboration avec le service de biologie moléculaire de l’IPA) : sur une centaine
de souches ont été réalisé des extractions d’ARN, synthèse de DNAc
¾ Organisation de la formation d’enquêteurs (E. BELKAID)
Des vétérinaires du terrain, des inspecteurs vétérinaires des wilayates (Ministère
de l’Agriculture, et développement rurale) ont reçu une formation relative à
l’enquête CAP de la perception socioculturelle de la rage par la population en
Algérie, assurée par le Dr Benhabyles N, épidémiologiste, INSP, et Dr HADJIDJ
consultant du CREAD. (Sidi Ferruch, novembre 2008).
2. Projet ACIP RAGESTANBIO : (Détails Cf. rapport 2007)
Essai inter-laboratoire (technique d’immunofluorescence directe, technique d’ELISA):
Nous avons reçu dix (10) prélèvements de cerveaux de souris anonymisés et cinq
(05) sérums humains anonymisés du centre de référence de la rage de l’Institut
Pasteur de Paris) qui ont été traités au sein de l’unité. Les résultats ont été envoyés
et nous sommes en attende des conclusions. (décembre-2008)
¾ Dr. E. Belkaid
Participation au 25émé congrès Maghrébin vétérinaire Alger (Mai 2008) en qualité
de membre du comité d’organisation
¾ Journées de formation et d’information sur la rage INSP, animée par :
Dr BENHABYLES (INSP), Dr OUADAHI(MA), Dr ABED (EHSFLICI), Dr A. SOUFI
(IPA), Dr ISSAD M (IPA), Dr SLIMI D(MSPRH), Dr BELKAID E(IPA).
• Publications :
- ABOUN A., RAHAL, K. et coll.
"Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques"
9ème rapport d’évaluatioNBn – Edition 2008 - ANDS.
Laboratoire de Mycologie
Chef de laboratoire : Dahbia KELLOU (Pharmacienne Maître assistance INESM)
INTRODUCTION
Les activités du laboratoire sont réparties entre deux entités rappelées ci-dessous :
- Diagnostic mycologique
- Diagnostic sérologique
Le bilan de l’activité comportera trois parties :
Le laboratoire effectue le diagnostic mycologique et sérologique des mycoses
superficielles et profondes.
Par ailleurs, il est sollicité pour l’identification des souches au profit des structures de
l’I.P.A ainsi que pour d’autres organismes qui en font la demande.
1. Analyses Mycologiques
Tableau n°1 :
Types
Total
Positifs
Origine externe
Hôpital
Ongles
450
244
450
00
Cheveux
103
034
103
00
Selles
057
016
57
00
Squames
262
016
262
00
P. Buccaux
045
017
45
00
P. Vaginaux
019
004
19
00
Recherche de Demodex
010
005
10
00
Sarcoptes scabiei
016
001
16
00
Scotch test
006
003
06
00
Liquide D’ascite
001
000
00
01
P.Auriculaire
002
000
02
00
Liquide Dialyses
005
000
00
05
Pus
007
000
07
00
Urines
004
001
04
00
Crachat
001
000
01
00
P. Nasal
002
000
02
00
P .Conjonctival
001
000
01
00
P. Vulvaire
003
000
03
00
L.C.R.
001
000
00
01
L.B.A.
01
00
00
01
996
341
988
08
Total
Commentaires :
Caractéristiques
996 Examens au total ont été réalisés :
• Ongles
450 prélèvements soit
45,40%
• Squames
26,43%
• Cheveux
10,39%
• Selles
5,75%
Les prélèvements
• P.Buccaux
045 les prélèvements soit 4,54%
les plus pratiqués
• P. vaginaux
019 les prélèvements soit01,91%
• Sarcoptes
01,61%
• Demodex
1 %
988 demandes sont d’origine externe
08 demandes sont des hôpitaux.
2. Identification des souches
Tableau n°2 :
Provenance
Bactériologie Médical (A.T.B)
53
Bactériologie des Aliments
12
Anaérobie
18
Biologie Moléculaire
03
Laboratoire de contrôle
04
C.H.U. Setif
01
C.R.N.A.
18
PEPSI
07
Total
Commentaires :
Souches ont été identifiées comme suit :

Nombre de souches
Cladosporium sp
Fusarium sp
Aspergillus flavus
Penicillium sp
Trichoderma sp
116

Paecilomyces sp
Emericella nidulans
Aspergillus versicolor
Fusarium solani
Aureobasidium sp
Alternaria sp
Asperillus fumigatus
Scopulariopsis sp
Ulocladium sp
Aspergillus nidulans
Aspergillus niger
3. Diagnostic sérologique
Il comporte deux volets, à savoir :
La recherche des anticorps circulants
La recherche des antigènes circulants
3.1. Anticorps circulants :
Notre laboratoire effectue la recherche d’anticorps circulants pour les affections.
Profondes à savoir Aspergilloses et Candidoses profondes. Cette sérologie se fait
par les techniques de précipitation (Immuno électrophorèse) qui permettent de faire
le diagnostic et le suivi sérologique du patient.
3.2. Antigènes circulants :
La recherche d’Antigènes circulants à concerner les antigènes Aspergillaires,
Candidosiques et Cryptococciques.
L’intérêt de cette recherche est de poser un diagnostic précoce pour les
Aspergilloses et les Candidoses profondes.
En ce qui concerne la Cryptococcose, la recherche d’antigènes circulants permet de
poser le diagnostic d’une part et d’autre part de permettre la mise en route du
traitement le plutôt possible vu que le processus vital du patient est mis en jeu.
Le tableau suivant résume les examens réalisés et en donne la répartition par affection
Tableau n°3 :
Diagnostic sérologique
Total
Positifs
Négatifs
Recherche d’Ac circulants :
- Aspergilloses
- Candidoses
145 sérums
003 sérums
25
00
120
03
Recherche d’Ag circulants :
- Aspergilloses
- Candidoses
04 sérums
00 sérums
01
00
03
00
22
00
174
26
Sérologie cryptococcique
Total
02 LCR
00 Urine
20 sérums
148
II. ACTIVITE DE FORMATION
1. Formation des résidents de spécialité
Dans le cursus des résidents de spécialité Parasitologie –Mycologie, nous avons reçu
quatre résidents, d’octobre 2007 à octobre 2008.
Il s’agit des résidents suivants :
Mr ABIDAT Fayçal
(3ème année)
Mr CHOUIKH Cheikh
(2ème année)
Mr
MOURI Oussama
(2ème année)
Melle DELMA Fatima zohra
(2ème année)
Par ailleurs, nous avons reçu 04 résidents à partir d’octobre 2008 à octobre 2009.
Mme CHERIF HOSMI Messaouda (3ème année)
Mme BENZAID Samira
(3ème année)
Melle DORBANI Soror
(3ème année)
Mr
(3ème année)
LAOUEDJ Mohamed
Ces résidents consolident leur formation en mycologie tout en participant à toutes les
activités du laboratoire.
Mme BENZAID Samira a suspendu ses études depuis janvier 2009.
2. Formation des stagiaire externe à l’IPA :
Melle MAMACHE Aissa (Ingénieur en Biologie) a effectué un stage d’un mois du
17 février 2008 au 04 mars 2008.
2.1. Formation Universitaire (INESSM D’ALGER) :
Durant l’année 2008, Mme KELLOU Dahbia et Melle HAMROUNE Zohra, Maitre
assistantes, ont dispensé en enseignement Universitaire qui se répartit comme suit :
• Cours magistraux et TP pour les étudiants de 4ème de Pharmacie.
• Cours et TP aux résidents de biologie clinique.
• Planchages aux résidents de 1ère, 2ème, 3ème et 4ème de spécialité de Parasitologie
Mycologie.
• Enseignement théorique de Parasitologie- Mycologie destinée aux étudiants de
3eme année de médecine.
III. DIVERS
Entretien de la mycothéque :
Les souches de champignons sont entretenues régulièrement par le personnel du
Laboratoire, ces souches servent à la formation et à la préparation de nos antigènes.
Participation de Mme Kellou Dahbia et Melle Hamroune Zohra à la réunion de la
Société française de Mycologie Médicale qui a eu lieu à Tours en Mai 2008.
IV. COMMUNICATION
Participation à la journée de formation, continue organisée par le CHU Mustapha le
25 Décembre 2008.
Conduite à tenir devant les candidoses et Malassezioses.
Z. HAMROUNE
Participation à la journée de Parasitologie Mycologie Médicales qui s’est tenue à
Setif (Université Ferhat Abbas) le 04 juin 2008.
V. POSTERS :
1) Mycoses superficielles et Diabète : bilan de 03 années
F. ABIDAT, Z. HAMROUNE, A.B. BENELMOUFFOK, D. KELLOU
2) Place du Cryptococcus neoformans dans la mycoflore isolée à partir de fientes
de pigeons.
O. MOURI, C. CHOUIKH, FZ. DELMA, A.B. BENELMOUFFOK, Z. HAMROUNE,
F. ABIDAT, D. KELLOU
Soumission d’article aux archives de l’Institut Pasteur d’Alger.
Titre :
Onychomycoses diagnostiquées au Laboratoire de Mycologie de L’IPA de 2005 à 2007.
Z. HAMROUNE, D. KELLOU, A.B. BENELMOUFFOK
Laboratoire de Recherche et Développement sur les Venins
Chef du laboratoire: Fatima LARABA-DJEBARI (Professeur et Directeur de Recherche)
INTRODUCTION
Les envenimations scorpioniques et ophidiennes induisent dans la plupart des cas, des
perturbations au niveau des systèmes nerveux, cardiovasculaire et respiratoire.
L’œdème pulmonaire (envenimation scorpionique) et la nécrose tissulaire
(envenimations ophidiennes) sont souvent les altérations observées, les plus communes
à tous les sujets gravement envenimés. Ces altérations représentent les principales
causes d’amputation ou de décès lors d’une envenimation accidentelle.
L’immunothérapie reste le seul traitement spécifique de ce type d’envenimation. Cette
thérapie n’est efficace que si elle est entreprise dans les délais rapides et une posologie
adéquate d’un immun-sérum hautement neutralisant. Au vu de certains effets et signes
cliniques observés après envenimation, cette thérapie doit obligatoirement être associée
à un traitement symptomatique.
Démarche et les résultats actuels de nos travaux sont les suivants :
Dans le cadre de ce problème de santé publique, nos travaux s’insèrent dans la
continuité de d’une Recherche-Développement sur les envenimations. Plusieurs axes
sont ouverts à notre équipe. En effet, celle-ci œuvre en utilisant plusieurs approches :
- Une étude physiopathologie de plus en plus approfondie.
- Une étude sur les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués lors des
envenimations et ce afin de pouvoir proposer des traitements symptomatiques qui
seraient associés au traitement spécifique.
- Une étude sur l’optimisation et la standardisation de l’immunothérapie
- Une étude sur la mise en place et la validation d’un test Immunodiagnostic le plus
rapide possible.
- Une recherche qui s’intéresse à la purification et caractérisation de molécules
bioactives d’intérêt extraites à partir des venins étudiés.
Etude physiopathologique
Cette étude est abordée sur des modèles animaux pour:
1
Visualiser la distribution des constituants
compartiments vasculaire et tissulaires
2
Analyser les perturbations induites
toxiques
dans
les
différents
Pour cela nous utilisons plusieurs méthodes
- Un test ELISA Sandwich spécifique à nos espèces avec préparation au laboratoire
d’un conjugué non commercialisé.
- L’imagerie pour suivre les constituants du venin
- Le marquage radioactif pour suivre la biodistribution des constituants du venin chez
l’animal.
- La détection tissulaire du venin par immunofluorescence ou immunohistologie
- L’étude des lésions tissulaires est abordée par histologie mais aussi par l’étude des
marqueurs métaboliques.
Etude des mécanismes impliqués dans les envenimations
Cette étude est entreprise par la mise en évidence des effets observés lors d’une
envenimation expérimentale en présence et en absence d’inhibiteurs de certaines voies
de signalisation. Elle est également abordée en utilisant les biomolécules purifiées à
partir de ces mêmes venins. D’autre part, nous essayons d’expliquer et de détecter les
principales cibles des constituants des venins.par l’utilisation de bio-marqueurs et de
techniques d’immunodétection.
Nos études se sont focalisées sur :
- La mise en culture de lignées cellulaires lymphoïdes (lymphocytes T et B) et
myéloïdes (macrophages et mastocytes) afin de montrer les effets du venin in vivo et
in vitro. Le dosage de médiateurs inflammatoires (cytokines, Sélectines, enzyme et
bioamines) et l’utilisation d’inhibiteurs des voies d’activation de la réponse
immunitaire pour mettre en exergue les voies d’induction du processus
inflammatoire. Par ailleurs, le degré d’implication des macrophages dans la
présentation du venin et de ces toxines permettrait probablement de confirmer les
différences d’immunogénicité des toxines de venin (Aah I et Aah II) déjà mises en
évidence.
-
Une analyse de la cinétique de prolifération des cellules notamment, spléniques, en
présence du venin d’Aah et de ses composants toxiques (Ftox G-50) in vivo et in
vitro a été également réalisée.
- L’étude de la contribution de radicaux libres à la toxicité des venins, libérés par
l’action excitatrice des toxines neuronales a été également envisagée. Les radicaux
libres sont dosés dans les tissus d’animaux envenimés.
Les résultats obtenus montrent que le venin d’Aah augmente l’activité cytotoxique du
macrophage. En effet, l’étude in vitro révèle une production de cytokines proinflammatoires (IL-1β, IL-6, TNFα, IL-12 et IFNγ) et anti-inflammatoires (IL-10) d’une
manière temps dépendant. Le maximum de concentration du TNFα et d’IFNγ est
observé après 48 heures d’incubation cellulaire. La libération importante de L’IL-6, IL-12
et l’IL-1β n’est observée qu’après 96 heures, alors que celle de l’IL-10 est maximale
après 72 heures de mise en culture. Le venin d’Aah induit aussi un métabolisme oxydatif
(peroxyde d’hydrogène) et non-oxydatif (phosphate acide) du macrophage d’une
manière dose dépendante. En effet, à de faible dose de venin, le macrophage libère
d’importante quantité de H2O2 et de phosphate acide, alors qu’en présence de fortes
concentrations, le métabolisme du macrophage est essentiellement oxydatif.
La deuxième démarche expérimentale a consisté à analyser
les variations
fonctionnelles des reins après envenimation des rats en présence et en absence
d’immunothérapie. En effet, Le rein joue un rôle majeur dans le processus de filtration et
d’élimination des éléments toxiques et de leurs métabolites, il est par conséquent un
organe cible de plusieurs toxines. De ce fait, il est le siège de nombreuses modifications
physiologiques et histologiques après une envenimation.
Les prélèvements d’urine et de sang sont récupérés respectivement 4 heures et 24
heures après une envenimation des animaux avec une dose sublétale et une dose létale
de venin.
L’analyse des urines a permis de déterminer un taux élevé d’hématies et leucocytes
comparativement aux animaux témoins. Cette infiltration cellulaire peut être
probablement expliquée par une altération du cortex rénale. Dans le but de confirmer
cette atteinte rénale, des paramètres, marqueurs d’altérations tissulaires, ont été
analysés dans les deux échantillons biologiques : la lactate déshydrogénase (LDH), la
créatinine, l’urée, les protéines, les électrolytes et la glycémie.
La mesure de l’activité LDH et des paramètres biologiques dans le sérum après
envenimation montre une augmentation de son taux sérique. Cette augmentation est
dose dépendante.
Cette augmentation de l’activité de la LDH dans le sang est probablement due aux
altérations tissulaires y compris le rein vers le sang induites par le venin
D’autre part, l’étude des modifications métaboliques par le dosage des taux de la
créatinine, l’urée, les protéines, les électrolytes et la concentration de glucose dans le
sang et les urines des rats envenimés a montré une augmentation anormal du taux
du glucose, des protéines et du K+ dans le sang. L’augmentation de l’urée et de la
créatinine dans le sang accompagnée par leurs diminutions dans les urines est due
probablement à une altération de la filtration rénale.
L’administration de l’immun-sérum par voie i.p. 30 minutes après envenimation semble
neutraliser certains effets induits par le venin Aah. En effet, les anticorps constitués de
fragments F(ab’)2 dirigés contre la fraction toxique Ftox G-50 d’Aah, semble atténuer
certaines variations métaboliques induites par le venin Aah où une restauration
significative des variations métaboliques est observé 24h après envenimation.
Résultats sur la recherche de biomolécules d’intérêt :
L’étude des constituants des venins de Viperidae a permis de mettre en évidence des
molécules ayant des activités hémorragiques et myotoxiques. Deux de ces molécules
ont été purifiées et caractérisées. Leur structure est en cours par le biais de
collaborations internationales.
Chacune de ces approches a fait l’objet de publications et de communications.
PUBLICATIONS INTERNATIONALES
1- Oussedik-Oumehdi Habiba and Laraba-Djebari Fatima (2008) Irradiated Cerastes
cerastes Venom as a Novel Tool for Immunotherapy. Immunopharmacology and
Immunotoxicology, 30:37–52, 2008
2- Sonia Adi-Bessalema, Djelila Hammoudi-Trikia, Fatima Laraba-Djebari. (2008)
Pathophysiological effects of Androctonus australis hector scorpion venom: Tissue
damages and inflammatory response. Exp Toxicol Pathol (2008), Experimental and
Toxicologic Pathology 60 (2008) 373–380
3- Fatah Cherifi et Fatima Laraba-Djebari Caractérisation d’une fraction coagulante
isolée du venin de Cerastes cerastes Toxines et fonctions cholinergiques neuronales
et non neuronales 1 Editions de la SFET (2008) ; 153-154.
4- S. Sami -Merah, D. Hammoudi-Triki, D. Aroune, M-F Martin-Eauclaire et F. LarabaDjebari Incidence de la fraction toxique du venin d’Androctonus australis hector dans
la leucocytose pulmonaire Toxines et fonctions cholinergiques neuronales et non
neuronales 1 Editions de la SFET (2008) ; 129-130 .
5-
Sami-Merah Sassia, Hammoudi-Triki Djelila, Martin-Eauclaire Marie-France and
Laraba-Djebari Fatima (2008) Combination of two antibody fragments F(ab´)2/Fab: an
alternative for scorpion envenoming treatment International Immunopharmacology
2008 Oct;8(10):1386-94.
PUBLICATIONS NATIONALES
- L. ABIB, H. BOUKHALFA-ABIB, N. BENNACEF-HEFFAR ET F. LARABA-DJEBARI
Evauation de la toxicité des venins de Viperidae et de Buthidae irradiés au 60Co :
approaches biochimique et histologique. Archives de l’Institut Pasteur d’Algérie ISSN
0020-2460. pp7- 18
- DJ. HAMMOUDI-TRIKI, S. ADI-BESSALEM ET F. LARABA-DJEBARI. Action du venin
de scorpion sur la fonction rénale. Archives de l’Institut Pasteur d’Algérie ISSN 00202460. pp19-28
COMMUNICATIONS INTERNATIONALES
- F. CHERIFI, N. BENNACEF-CHAOU, F. SEBIA-AMRANE, L. HAMZA,
H. BOUKHALFA-ABIB, N. BENNACEF-HEFFAR, H. OUSSEDIK-OUMEHDI ET
F. LARABA-DJEBARI. (2008) Envenimation Ophidienne : Effets pathophysiologiques et
Immunothérapie. Conférence Scientifique Internationale des Instituts Pasteur. Paris, 2627 Juin 2008.
- S. ADI-BESSALEM, S. SAMI-MERAH, A. MENDIL, Dj. AROUNE, D. HAMMOUDI-TRIKI
ET F. LARABA-DJEBARI (2008). Immunothérapie antiscorpionique : Evaluation de
l´efficacité de différentes formes d´anticorps. Conférence Scientifique Internationale des
Instituts Pasteur. Paris, 26-27 Juin 2008.
- D. HAMMOUDI-TRIKI, S. ADI-BESSALEM, A. MENDIL, S. SAMI-MERAH AND
F. LARABA-DJEBARI (2008). Cardio-respiratory injury: correlation between circulating
scorpion venom and hemodynamic variations. 16TH European section meeting of the
international society on toxinology 7-10 September.
- L. ABIB ET F. LARABA-DJEBARI (2008). Immune response and immunoprotection
against scorpion venom. 16th European Section Meeting of the International Society on
Toxinology, 7-10 September 2008, Leuven-Belgium.
- F. CHÉRIFI, N. BENNACEF-CHAOU, F. SEBIA-AMRANE, L. HAMZA,
H. BOUKHALFA-ABIB., BENNACEF-HEFFAR. N, OUSSEDIK-OUMEHDI. H ET
LARABA-DJEBARI. F (2008). Envenimation Ophidienne : Effets pathophysiologiques et
Immunothérapie. 16th European Section Meeting of the International Society on
Toxinology, 7-10 September 2008, Leuven-Belgium.
- A. MEKSEM, F. LARABA-DJEBARI (2008) Purification, cristallisation et études
structurales préliminaires de CHA1169, récepteur membranaire TonB-dépendant de
Pseudomonas fluorescens Colloque de l’Association Française de Cristallographie (7-10
Juillet 2008 Rennes ; France
- F. CHERIFI, N. BENNACEF-CHAOU, L. HAMZA, F. AMRANE-SEBIA, A. SACI AND
F. LARABA-DJEBARI. Correlation between Body Distribution and pathophysiological
effects induced by Viperidae venoms before and after Immunotherapy. Global Issues in
Clinical Toxinology (Australian venom Research Unit) The University of MelbourneAustralia; 23–28 November 2008 (Accepted)
- H. OUSSEDIK-OUMEHDI, N. BENNACEF-HEFFAR, H. BOUKHALFA-ABIB AND
F. LARABA-DJEBARI, Which antigens for the antivenom preparation: Contribution of
gamma rays in venom detoxification and enhancement of neutralizing efficiency.
Global Issues in Clinical Toxinology (Australian venom Research Unit) The University
of Melbourne- Australia 23–28 November 2008 (Accepted)
COMMUNICATIONS NATIONALES
1- L. ABIB, S. ADI-BESSALEM, A. MENDIL, S. SAMI-MERAH, D. HAMMOUDI-TRIKI ET
F. LARABA-DJEBARI (2008). Vaccinothérapie : Effet Immunoprotecteur d’un Venin de
scorpion Irradié. 34ème Anniversaire de l’USTHB 19-24 Avril.
2- S. ADI-BESSALEM, D. HAMMOUDI-TRIKI, S. SAMI-MERAH, A. MENDIL, L. ABIB,
BILLIALD P., MARTIN-EAUCLAIRE, M-F ET LARABA-DJEBARI F. (2008). BioEngineering et Préparation Biotechnologique d’un Peptide de synthèse à visée
Vaccinothérapie. 34ème Anniversaire de l’USTHB 19-24 Avril.
3 - F. CHERIFI ET F. LARABA-DJEBARI. (2008) : « Bioanalyse des paramètres
hématologiques et métaboliques après administration d’une biomolécule
anticoagulante à visée thérapeutique » Communication affichée présentée les 19-24
Avril 2008 dans le cadre des activités scientifiques organisées par la Faculté des
Sciences Biologiques à l’occasion du 34 ème anniversaire de la création de l’USTHB.
4- F. CHERIFI ET F. LARABA-DJEBARI (2008) : « Biomolécule Anticoagulante de
Cerastes cerastes: Purification et Caractérisation » Communication affichée présentée
les 19-24 Avril 2008 dans le cadre des activités scientifiques organisées par la Faculté
des Sciences Biologiques 34 ème anniversaire de la création de l’USTHB.
5- H. BOUKHALFA-ABIB, N. BENNACEF-HEFFAR, H. OUSSEDIK-OUMEHDI ET
F. LARABA-DJEBARI. (2008) Utilisation de la radiopbiologie dans la détoxification des
venins de Viperidae : Apport dans la thérapie antivenimeuse. 34ème anniversaire de
l’USTHB. 19-24 Avril 2008. Alger.
6- H. OUSSEDIK-OUMEHDI, L. HAMZA, F. CHERIFI, F. AMRANE, H. BOUKHALFAABIB, N. BENNACEF-CHAOU, A. SACI, N. BENNACEF-HEFFAR ET F. LARABADJEBARI. (2008) Bidiversité des venins de Viperidae : Source de biomolécules
pharmacologiquement actives. 34ème anniversaire de l’USTHB. 19-24 Avril 2008. Alger.
7- D. HAMMOUDI-TRIKI, S. ADI-BESSALEM, L. ABIB, S. SAMI-MERAH, A. MENDIL ET
LARABA-DJEBARI F. (2008). Immunotoxinologie et Pharmacodynamie des venins des
scorpions : Apport dans la thérapie anti-scorpionique. 34ème Anniversaire de l’USTHB
19-24 Avril.
8- L. HAMZA, F. CHERIFI, H. OUSSEDIK-OUMEHDI ET F. LARABA-DJEBARI. (2008)
Neutralisation des activités biologiques des venins de Viperidae par différents types
d’anticorps. 34ème anniversaire de l’USTHB. 19-24 Avril 2008. Alger.
9- A. MENDIL, S. SAMI-MERAH, S. ADI-BESSALEM, L. ABIB, D. HAMMOUDI-TRIKI, ET
LARABA-DJEBARI F. (2008).Pharmacocinétique du venin d’Androctonus australis
hector et de ses anticorps. 34ème Anniversaire de l’USTHB 19-24 Avril.
10- N. BENNACEF-HEFFAR, H. BOUKHALFA-ABIB, H. OUSSEDIK-OUMEHDI ET F.
LARABA-DJEBARI. (2008) Effet de l’irradiation gamma sur les venins de Viperidae et
leurs activités biologiques. 34ème anniversaire de l’USTHB. 19-24 Avril 2008. Alger.
11- S. SAMI-MERAH, A. MENDIL, S. ADI-BESSALEM, L. ABIB, D. HAMMOUDI-TRIKI,
ET F. LARABA-DJEBARI (2008). Développement de Nouveaux Schémas
Thérapeutiques dans l’Envenimation Scorpionique: Association de l’immunothérapie
avec des Molécules Thérapeutiques Pharmacologiquement Actives. 34ème Anniversaire
de l’USTHB 19-24 Avril.
VI- ACTIVITE DE FORMATION
1- Formation dispensée dans le laboratoire
Nom
prénom de Organisme
la personne d’origine
formée
Niveau
d’étude
Date de
soutenance
Nom de(s)
encadreur(s)
Nature des travaux réalisés
Formation Diplôme d’Ingénieur Génie Biologique
MERZOUK
SIHEMCHAHINEZ
ET
MESLEM
FAIZA
2008
Contribution à l’étude des variations
physiologiques de la fonction rénale
après envenimation scorpionique.
A.
BOUHENN
MUSTAPHA
, ABDOUN
SELMA ET
CHAYEB
HAKIM
2008
Préparation des anticorps spécifiques
au venin d’Androctonus australis
hector et leurs utilisation dans
l’immunothérapie expérimentale.
2008
D. HAMMOUDITRIKI
et F. .LARABADJEBARI
D. HAMMOUDITRIKI
et F. LARABADJEBARI
Contribution à l’étude des variations
physiologiques induites par le venin
D’Androctonus amoreuxi
BAKHTI
Fatima ET
GHARBI
Bahia
D. HAMMOUDITRIKI
et F. LARABADJEBARI
Formation DES
FORMATION de MAGISTER
MENDIL Amina
FSBUSTHB
Biochimie
Appliquée et
biotechnolog
ies
Thèse
soutenue 10
Mars 2008
.
Mise au point d’un test
immunodiagnostic rapide et
effet de la thérapie lors d’une
envenimation scorpionique
exprimentale
F. LARABADJEBARI
THESE DOCTORAT
ADI-BESSALEM
Sonia
FSBUSTHB
BiochImmuno
Novembre
Décembre
2008
Développement de
biomolécules thérapeutiques
antiscorpioniques : Apport de
l’Ingénierie Moléculaire
F. LARABADJEBARI
Missions du personnel du laboratoire
Recherche et Développement
Personnel de soutien :
SAADEDDINE Souad : Ingénieur d’Etat en Génie Biologique
Personnel chercheur IPA :
Pr. LARABA-DJEBARI Fatima : Directeur de Recherche (coordination des projets de
recherche du laboratoire techniquement et scientifiquement)
Dr. HAMMOUDI Djélila : Maître de Recherche et collaboratrice scientifique
Personnel Chercheur hors IPA encadré pour une formation post-graduée dans le
cadre du projet.
Thèses d’Etat
:8
Thèse de Magister : 1
Laboratoire VIH et Rétrovirus
Chef du laboratoire : Salima BOUZEGHOUB (DM/ MA INESSM)
Le laboratoire VIH et Rétrovirus, est le Laboratoire National de Référence de l'infection
VIH/sida.
Son rôle est d'assurer les activités suivantes :
• Le diagnostic et le suivi biologique de l'infection VIH
• La notification de tous les cas positifs à l'infection VIH et leur déclaration aux
autorités nationales (Ministère de la Santé et l'INSP).
• Le contrôle qualité des trousses de réactifs et de nouvelles méthodes de diagnostic.
• La formation du personnel de laboratoire chargé du diagnostic de l'infection VIH et
d'étudiants en graduation ou en post-graduation.
• La recherche scientifique : Mise en place de la technique de typage des souches et
de la technique d’étude des résistances aux antirétroviraux (génotypage).
- Le laboratoire a reçu pour l’année 2008 :
2044 prélèvements de sang pour le test de dépistage : parmi eux 09 sérums
trouvés positifs.
958 prélèvements de sang pour le test de confirmation : parmi eux 636 trouvés
positifs.
Donc au total, sur 3002 sérums reçus durant l’année 2008, on a diagnostiqué
645 sérums positifs.
Les
différents
tests
sérologiques
immunochromatographie, MEIA.
utilisés
:
Elisa,
Western-Blot,
- Le laboratoire a reçu 243 prélèvements sanguins pour la mesure de la charge
virale VIH.
L’analyse s’est faite sur le Cobas Amplicor et aussi sur un nouvel appareil de PCR
en temps réel qu’on a reçu cette année dans le service de virologie.
1. Activité de Notification :
On a notifié pour l’année 2008 : du 01 janvier au 31 décembre 2008 :
• 060 nouveaux cas de sida
• 585 nouveaux cas de séropositifs
Ainsi le total cumulatif de 1985 au 31 décembre 2008 :
897 cas de sida et 3495 cas de séropositifs.
La déclaration de ces cas d’infection VIH se fait au prés du Ministère de la santé et de
la réforme hospitalière, et à l’INSP. Il faut préciser que ces chiffres ne sont pas
représentatifs de la situation réelle de l’infection VIH mais juste une estimation globale
a cause de la sous-notification du nombre de cas lié à la défaillance du système de
surveillance de l’infection VIH en Algérie.
2. Activité de contrôle qualité :
Le laboratoire assure le contrôle des kits (trousses de réactifs) à usage diagnostic et
qui sont distribués par l’IPA.
Les différents kits reçus sont les suivants :
Nom du Kit
Nombre
Murex HIV 1-2-1
Abbott
Murex HIV 1-2-0
Abbott
Integral II HIV 1/2
Dade Behring
N° de lot
02
L124110, L211510
03
L144310, L195010, L211610
01
37372
a) Formation des résidents en microbiologie au sein du laboratoire
Nous avons reçu 13 résidents en Microbiologie (Faculté de Médecine d’Alger), pour
une formation pratique des techniques virologiques pour le diagnostic de l’infection
VIH. Le stage a duré 01 mois.
b) Ateliers de formation portant sur les techniques de dépistage de l’infection VIH.
• Organisation d’un atelier de formation pratique de type recyclage sur les tests de
dépistage de l’infection VIH (Test ELISA, Test rapide) destiné à 20 techniciens
supérieurs de laboratoire provenant des secteurs sanitaires de 12 wilayas.
Lieu : Institut pasteur .Annexe Sidi-Fredj du 24 au 28 Mai 2008.
Cet atelier rentre dans le cadre du programme de formation des techniciens
supérieurs travaillants dans les Centres de dépistages volontaires (CDV) et
organisé par le Ministère de la Santé et de la réforme hospitalière.
c) Réalisation de mémoire :
Nom des étudiants
Origine
Promoteur
encadreur
DERMOUCHE
F. Zohra
DJERIDI houssein
DJERROUD saida
Faculté des
sciences
biologiques
USTHB
Apport des tests
rapides dans le
diagnostic de
l’infection VIH
BOUZEGHOUB
salima
CHEROUF
abdelhak
d) Enseignement :
Nom de l'enseignant
Lieu de
l'enseignement
Destinataires
Type d'enseignement
Dr. BOUZEGHOUB
Faculté de
Médecine Alger
Résidents en
Microbiologie
Etudiants en
Médecine
Cours de Virologie
Planchages
e) Thèse de doctorat en sciences médicales (DESM) en cours :
Dr S. BOUZEGHOUB est inscrite en thèse.
Intitulé du sujet de thèse : Etude virologique des patients infectés par le VIH en
Algérie.
Directeur de thèse : Pr E. BELABBES
III. AUTRES ACTIVITES SCIENTIFIQUES
a) Participation du LNR, représenté par le Dr Bouzeghoub, à la 5éme réunion du
réseau régional de laboratoire de santé publique VIH/Sida qui s’est déroulée à
Dakar, Sénégal, du 23 au 25 Septembre 2008.
L’objectif général de l’atelier est de renforcer les capacités du réseau régional
VIH/Sida.
Les objectifs spécifiques de la réunion sont :
- Revoir le statut de la mise en œuvre des recommandations de la 4 éme réunion
- Revoir le statut présent et la gestion des services de laboratoire VIH
- Proposer des solutions pour maintenir la qualité et un support diagnostique fiable
pour les programmes VIH.
b) Participation aux réunions de travail pour la mise en œuvre de la stratégie nationale
de la prévention de la transmission mère-enfant du VIH (PTME) organisé par la
direction de la prévention au Ministère de la santé et de la réforme hospitalière en
collaboration avec l’UNICEF. Le lancement du programme est prévu pour Avril 2009.
IV. PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS
a) Publication :
Salima BOUZEGHOUB, Valerie JAUVIN, Patricia PINSON, Marie Helene SCHRIVE,
Anne Cecile JEANNOT, Achour AMRANE, Bernard MASQUELIER, El Hadj
Belabbes, and Hervé J.Fleury.
First observation of HIV-1 drug resistance mutation in Algeria.
AIDS Research and Human Retroviruses. Volume 24, Number 11, 2008.
b) Communications :
Salima BOUZEGHOUB
Expérience de l’Algérie dans l’extension des services de laboratoires de dépistage et
de suivi des patients en milieu à faible prévalence VIH.
5éme réunion du réseau régional de laboratoire de santé publique VIH/Sida.
DAKAR, SENEGAL, 23-25 Septembre 2008.
Salima BOUZEGHOUB
Les bonnes pratiques et les difficultés à surmonter lors du diagnostic sérologique des
porteurs de VIH.
Journée scientifique VIH/Sida : Association Algérienne pour la Planification Familiale
Institut Pasteur d’Algérie. Sidi-Fredj. 24 décembre 2008.
Laboratoire de la grippe et autres virus respiratoires
Chef de laboratoire : Fawzi Derrar (DM/Assistant en Microbiologie)
INTRODUCTION
Bien qu’habituellement considérée comme banale et bénigne, la grippe peut se révéler
redoutable, à titre individuel chez les sujets affaiblis et à l'échelon communautaire,à
l'occasion de l'émergence de nouveaux virus tels que le H5N1 ou le H9 ou comme
actuellement lors d’épidémies aviaires massives qui s’accompagnent de cas humains,
encore rares, mais souvent mortels.
Ces caractéristiques épidémiologiques sont une originalité de la grippe, due au pouvoir
de variation de ces virus, et justifie l’existence d'une surveillance mondiale, à laquelle
participe l’Algérie à travers son Réseau Sentinelle GROG.. Cette activité a été
officiellement reconnue par l’OMS en 2005, qui a inclus l’Institut Pasteur d’Algérie dans
le réseau mondial des centres nationaux pour la grippe et récemment comme
Laboratoire régional pour l’OMS/AFRO.
Le laboratoire a comme objectifs principaux :
- Diagnostic des infections respiratoires
- Formation
- Santé publique : investigation d’épidémies et surveillance de la circulation des virus
grippaux
- Recherche et assurance qualité.
1. Grippe :
Nombre de prélèvements
(écouvillonnage naso-pharyngé)
Nombre de positifs
Sous-types
A(H1N1)
Type B
457
41
68
17
* Notons que 07 souches H1N1 sont résistantes à l’Oseltamivir
2. Virus respiratoire syncytial (VRS) :
Nombre de
prélèvements
(aspirations nasopharyngées)
Nombre de
positifs
Typage (par RTPCR)
VRS type A
Typage (par RTPCR)
VRS type B
Génotypage
(Protéine G)
20
20
18
2
G2a
* Le génotypage a été effectué par un laboratoire tiers.
II. SANTE PUBLIQUE
Le laboratoire a été érigé en laboratoire de référence OMS pour la surveillance de la
circulation des virus grippaux.
A travers le réseau GROG, le Laboratoire en collaboration avec l’institut national de
santé publique sert d’appui et de conseil pour la tutelle afin de mettre en place un
système de surveillance actif.
Il permet aussi de donner un aperçu sur l’adéquation des souches virales circulantes
comparativement aux souches vaccinales annuelles.
Dans le cadre de la préparation à une pandémie de grippe d’origine aviaire, le
laboratoire fait partie du comité national multisectoriel de veille et de lutte contre la
grippe aviaire crée par arrêté ministériel et présidé par le Ministre de la Santé, de la
population, et de la réforme hospitalière,
Des réunions sont programmées pour débattre la situation internationale et discuter
des problèmes d’opérationnalisme du plan national.
Quatre réunions de réseau sentinelle ont eu lieu durant l’année 2008, deux à Alger,
une à Constantine, et une à Oran ; l’objectif principal étant d’évaluer les activités des
médecins et pédiatres du réseau et écouter les problèmes posés sur le terrain.
III. ASSURANCE QUALITE
Le Laboratoire de la grippe participe au projet WHO/EQAP (external quality
assessment Project) pour la détection des virus grippaux de type A.
Le projet porte sur la detection des sous-types H1,H3,H5 sur 10 échantillons
constitués d’ARN du virus grippal à identifier et envoyés tous les 06 mois par le
Laboratoire OMS de HONGKONG (Février et septembre)
Le laboratoire s’active aussi à mettre en place des procédures standard écrites.
IV. ACTIVITE DE RECHERCHE
1) Entretien de la banque cellulaire qui contient 06 lignées cellulaires et tester la
sensibilité cellulaire des cellules MDCK en utilisant les souches de référence du
virus grippal.
2) Recherche des virus grippaux dans l’environnement : en attente d’intégration
dans le projet RIVER de l’union européenne.
3) Etude comparative de la technique fluorométrique et de Chimiluminescence pour
la détection de la résistance des virus grippaux de sous type H1N1.
IV. Publications et formations :
1. Publications
- F. DERRAR, R. BOUGUEDOUR, A. BOUGUERMOUH
Grippe : aspects virologiques.
Revue Medico-Pharmaceutique
- IIème Rapport du réseau de surveillance de la Grippe 2007-2008
2. Communications :
F. DERRAR
Antiviraux utilisé contre la Grippe
Journée de clôture du réseau GROG. El AURASSI 03 juillet 2008
V. FORMATION
- Le Dr DERRAR a participé au Cours de virologie systématique de l’Institut Pasteur
de Paris durant la période du 07 avril au 25 juin 2008
- Melle AIT-AISSA a effectué un stage sur « la sensibilté des virus grippaux aux
Inhibiteurs de la Neuraminidase par technique fluorométrique » au Centre Mondial
de la Grippe à Londres (Angleterre) durant la période allant du 20 novembre
au 05 décembre 2008.
Laboratoire des Hépatites Virales
Chef de laboratoire : Aicha BENSALEM (DM/ M.A./ INESSM)
Le laboratoire des hépatites virales assure le diagnostic des hépatites virales A, B et C ;
les prélèvements sont envoyés par les 48 wilayas de l’Algérie pour les confirmations,
le sérotypage, le génotypage, la PCR qualitative et/ou quantitative dans le cadre des
bilans pré thérapeutiques et du suivi des patients infectés par le VHB et le VHC
et les patients traités par les antiviraux.
C’est l’activité principale du laboratoire. Les prélèvements nous proviennent des CHU,
EPH, EPSP, SEMEP, centres de dialyse publique et privé et les laboratoires
d’analyses médicales privés pour confirmation.
Pour l’année 2008 nous avons reçu 14 476 prélèvements.
1. UNITE DE SEROLOGIE :
Sérologie de l’hépatite virale B
Résultats négatifs
Résultas positifis
Nombre de tests
réalisés
AgHbs
2556
8517
11073
AgHbe
1895
298
2193
Ac anti Hbc
5891
2994
8885
Ac anti Hbe
651
2336
6987
Ac anti Hbs
4594
1218
5812
Ac anti Hbc IgM
442
34
476
Marqueurs
Sérologie de L’hépatite Virale C
Test efféctué
Résultas positifis
Nombre de tests
réalisés
3710
3290
7000
Ac anti VHC
Test efféctué
Résultats
négatifs
Résultas
positifis
Résultats
indétérminés
Nombre de
tests
réalisés
Immuno blot
633
311
316
1300
Test efféctué
Typables
Non typables
Nombre de tests
réalisés
SEROTYPAGE VHC
638
322
960
Sérologie de L’hépatite virale A
marqueur
Résultats positifs
Nombre de tests
réalisés
IgM VHA
465
161
626
Techniques utilisées : EIA et MEIA
2. UNITE DE BIOLOGIE MOLECULAIRE :
Test demande
Résultats
positifs
Résultats
négatifs
Zone grise
nombre de
tests
réalisés
478
399
93
970
PCR QUALITATIVE
ARN-VHC
QUANTIFICATION DE LA CHARGE VIRALE :
TEST DEMANDE
CHARGE VIRALE
DNA-VHB
CHARGE VIRALE
RNA-VHC
PCR quantitative classique
par Cobas Ampli cor
1095
920
PCR en temps réel
CAP/CTM
200
192
Total tests réalisés
1295
1112
NOMBRE DE TESTS DE GENOTYPAGE VHC EFFECTUES : 180 TESTS
II. ASSURANCE QUALITE
Contrôle de qualité externe
Le Système Régional d’Evaluation Externe de la Qualité (S.R.E.E.Q) : selon les
directives de l’OMS (HQ et AFRO), un panel de 10 échantillons de plasma, numérotés
de 1 à 10, tous provenant de donneurs de sang nous a été adressé pour contrôle
sérologique de l’hépatite virale B.
Ils sont caractérisés et pré testés selon le protocole recommandé par l’OMS et ils ont
été distribué à 18 laboratoires francophones.
Nos résultats étaient à 100% concordants.
Contrôle de trousses de réactifs
Nous réalisons le contrôle des trousses de réactifs (kits) de la sérologie de chaque
nouveau lot avant sa commercialisation par l’IPA.
Trousses contrôlées durant l’année 2008 :
NOM DES KITS
NOMBRE
MUREX Ag Hbs (ABBOTT)480 tests
08
Enzygnost Ag Hbs 96 tests
02
(DAD BEHRING)
MUREX Ac anti VHC 480 tests (ABBOTT)
05
MUREX Ac anti VHC 96 tests (ABBOTT)
01
INNOTEST Ac anti VHC 96 tests(Innogenetics)
04
TOTAL
20
Expertise de dérivés sanguins stables
Conformément à la décision n°5 du 29 juillet 2008. Nous avons repris l’expertise des
dérivés sanguins stables qui nous sont adressés par l’Agence Nationale du Sang
avant leurs commercialisations.
NOMBRE DE PRODUITS
CONTROLES
DESIGNATION
Vaccin anti D
05
ERYTHROPOIETINE HUMAINE RECOMBINANTE
07
FACTEUR IX
04
ALBUMINE HUMAINE 20%
18
FACTEUR VIII
03
INTERFERON 1 a
05
IMMUNOGLOBULINE HUMAINE NORMALE
04
TOTAL
46
III. ACTIVITE DE SANTE PUBLIQUE
Dans le cadre du programme nationale de lutte contre les hépatites virales B et C
trois enquêtes sérologiques ont été réalisées au sein de notre laboratoire.
• Enquête nationale chez les hémodialysés de juin 2007 à mai 2008,
Le nombre de prélèvements reçus 7502 sérums.
• Une deuxième enquête a été réalisé en mai : le nombre de prélèvements
3000 sérums.
• La troisième enquête en juin 2008 : nombre de prélèvements 285 sérums.
IV. ACTIVITE DE FORMATION
Au sein de l’IPA
• Etant intérimaire du Dr BOUZEGHOUB, nous avons organisé du 24
au 28 mai 2008 la formation d’une trentaine de techniciens supérieurs et de
biologistes des différents centres de dépistage volontaire (CDV) du VIH sur
demande du Ministère de la santé, de la population et de la réforme hospitalière.
La formation était assurée par Dr BENSALEM (IPA laboratoire des Hépatites
virales) et Dr MOHAMMEDI (EHS ELHEDI FLICI laboratoire central)
Mr CHERROUF et Mr TAMOURT OMAR (IPA LNR/VIH).
• Du 7 au 9 septembre 2008, nous avons reçu au sein du laboratoire des hépatites
virales Mr KOENRAAD EYEKEN (ABBOTT Molecular) pour la formation du
personnel sur la PCR en temps réel m2000 (Abbott), a bénéficié de cette
formation :
Du laboratoire des hépatites virales : Dr BENSALEM, Melle IGUER,
Melle MOSTEFAOUI, Melle TARFANI, Mme HAMMA et Mr KERIOUI.
Du LNR/VIH: Dr BOUZEGHOUB, Mr CHERROUF, Mr TAMOURT.
Du laboratoire Virus et cancers: Mr BANDOUI.
• DU 27 au 29 octobre 2008, nous avons organisé un workshop avec le laboratoire
Roche Diagnostics intitulé : PCR en temps réel et typage moléculaire ; avaient
participé à cette manifestation soixante dix personnes des différentes régions du
pays entre Chef de service, médecins spécialistes, biologistes et techniciens de
laboratoire …
• Les conférences ont eux lieu les matinées à la salle de cours de l’annexe de Sidi
Fredj et les ateliers pratiques les après-midi entre la salle de TP et le laboratoire
des hépatites virales.
• Sur demande du MSPRH, dans le cadre du programme de lutte contre
les hépatites virales B et C et dans le but d’installer des PCR en temps réel
au niveau des CDR dans les différentes régions du pays ; des médecins
spécialistes en biologie et des biologistes de l’IPA Constantine, l’IPA M’sila, l’IPA
Oran et l’EPH Tamanrasset ont suivi la formation de biologie moléculaire durant la
période du 27 au 29 octobre 2008.
• Formation des résidents de microbiologie :
Durant cette année nous avons reçu 14 résidents de la Faculté d’Alger, Batna et
Annaba. La durée du stage pratique au niveau du laboratoire des hépatites virales
est de quatre semaines.
Personnel encadreur : Dr BENSALEM, Melle IGUER, Melle MOSTEFAOUI,
Melle TARFANI, Mme HAMMA et Mr KERIOUI.
• Recyclage : nous avons reçu quatre stagiaires du Centre de Transfusion Sanguine
de Constantine (CTS) et une stagiaire de Djelfa pour une durée d’une semaine.
Encadrement : Dr BENSALEM, Melle MOSTEFAOUI.
Hors IPA : ENSEIGNEMENT
Nom de
l’enseignant
Dr A.BENSALEM
Lieu de
l’enseignement
Faculté de médecine
d’Alger
Destinataires
Etudiants en
médecine
Résidents en
microbiologie
Cours de virologie
Cours de bactériologie
Planchâges de virologie
Laboratoire des virus et cancers
Chef de laboratoire : Abdelmadjid Bouguermouh (Professeur)
Le laboratoire comprend trois unités :
Herpetovirudae
Papillomaviridae et Polyomaviridae
Maladies émergentes et réemergentes
INTRODUCTION
Le diagnostic a pu être assuré normalement cette année. Les activités de recherche ont
connu un ralentissement. Les projets financés dans le cadre de la coopération inter
universitaire Algéro- Française et par l’ANDRS arrivent à leur terme. Le laboratoire n’a
pas en outre été en mesure d’accueillir des doctorants qui apportent une aide
appréciable à ces activités.
Des bilans ont été rédigés à la demande du ministère de la santé, de l’enseignement
supérieur et de l’ANDRS.
Des projets nouveaux ont été élaborés.
Dans ce rapport seront présentés :
1. Les activités de diagnostic :
Des Herpesvirus : Herpes simple 1 et 2 (HSV1 et HSV2)
- Varicelle – zona (VZ)
- Cytomégalovirus (CMV)
- Epstein – Barr Virus (EBV)
Des Papillomavirus : HPV
- Des Polyomavirus
Des Arbovirus :
- West Nile (WN)
- Dengue
- Fièvre vallée du Rift (RVF)
Des Hantavirus
De la Syphilis
2. Les Activités de recherche :
L’EBV et pathologies associées
(Principalement le cancer du nasopharynx (NPC)
Le papillomavirus et pathologies associées
- Cancer et lésions précancéreuses du col de l’utérus
- Cancer du sein
La mise en place d’un réseau West Nile
3. Une enquête effectuée sur une épidémie de glomérulonéphrite aiguë survenue à Sétif
au mois de septembre-octobre 2008.
4. Le contrôle des réactifs syphilis
5. Les activités de formation et d’enseignement
Les thèses en cours de réalisation
¾ SEROLOGIE :
Herpes virus : Herpes simple (HSV), Varicelle-Zona (VZV), Cytomégalovirus
CMV).
- Recherche des IgM par Test ELISA (herpés simple (HSV)
Virus
Nombre de sérums
Nombre de Positifs
CMV
1502
86
HSV
0637
16
VZV
0090
04
- Recherche des IgG par le test ELISA pour les greffés (Hémodialysé)
Virus
Nombre de sérums
Nombre de Positifs
CMV
304
291
HSV
188
181
VZV
007
003
- Test d’avidité
Nombre de
prélèvements
Test d’avidité
Forte avidité
Faible avidité
IgG (CMV)
200
160
40
IgG (VZV)
10
07
03
Diagnostic de l’EBV et des pathologies associées :
- Nombre de prélèvements effectués par la technique EIA
Marqueurs recherchés
Nombre d’analyses effectuées
IgM anti VCA
818
IgG anti VCA
399
IgG anti EBNA
953
Avidité
114
- Nombre de prélèvements effectués par la technique Immunofluorescence
indirect (IFI)
Marqueurs recherchés
Nombre d’analyses effectuées
IgM anti VCA
726
IgG anti VCA
23
IgG anti EA
210
Diagnostic de la syphilis :
Antigènes
Nombre de sérums
Nombre de Positifs
TPHA
1859
178
VDRL
1859
060
- Sérologie quantitative du TPHA pour le suivi du traitement : 82 sérums.
¾ DIAGNOSTIC MOLECULAIRE :
Diagnostic du papillomavirus humain:
Nombre d’analyses
effectuées
Nombre de positifs
Hybridation Capture II
268
13
Amplification génique (PCR)
Amplicor -Roche-
176
7
Techniques utilisées
Diagnostic d’une méningite à liquide clair
Herpetoviriridae par PCR
LCR : herpes simple, varicelle –zona, cytomégalovirus, EBV : négat
II. ACTIVITES DE RECHERCHE
¾ Trois projets arrivent à leur terme :
- Un projet interuniversitaire algéro-français CMEP Tassili (A. BOUGUERMOUH
(IPA)
T. OOKA (Lyon)
- Deux projets ANDRS : responsable respectivement H. MELOULI (IPA),
A. KHENCHOUCHE (Université de Sétif).
¾ Un projet algéro-français INSERM se poursuit. Responsables :
A. BOUGUERMOUH, H MELOULI (IPA) B. MARIAME (Toulouse)
¾ Deux projets acceptés mais non encore financés :
- Projet « West-Nile » ANDRS : mise en place d’un réseau portant sur l’étude des
arbovirus
- projet dépistage HPV piloté par la direction de la population du ministère de la
Santé
¾ Deux projets doivent être soumis à l’ANDRS en 2009 (H. MELOULI et N. SADOUKI
(IPA))
Projets arrivés à terme
1er projet
Projet CMEP Tassili interuniversitaire Algéro-Français : portant sur le virus
Epstein Barr et cancers associés chez l’enfant et le jeune adulte.
Un bilan des résultats a été dressé lors d’un colloque d’évaluation et de prospection
du programme organisé à Alger pour les 25 ans de coopération interuniversitaire
algéro-française. La partie scientifique de ce bilan fera l’objet d’une publication à
soumettre aux archives de l’IPA.
Le laboratoire virus et cancers a bénéficié de trois projets CMEP-Tassili au cours des
20 dernières années : 91 MDU 181, 95 MDU 319 et 05 MDU 663.
Les principaux résultats ont été signalés dans les différents rapports annuels de l’IPA.
Résumé très succinct de ce bilan :
L’incidence du cancer du nasopharynx (NPC) est intermédiaire au Maghreb (3,5 à 10
pour 100.000 habitants) avec une atteinte de deux tranches d’âge 10-24 ans et 40-60
ans. Le virus d’Epstein-Barr est retrouvé dans 100% des cas associés à cette tumeur.
Il est également mis en évidence à un taux moins élevé dans les lymphomes
Hodgkiniens (LHD) et non Hodgkiniens (LNHD) à des âges inférieurs à 10 ans.
Cette collaboration s’est traduite par des résultats portant sur:
- Un transfert technologique Nord-Sud
- L’étude :
Du virus EBV, de ses gènes et des proto-oncogènes
De la réponse de l’hôte selon l’âge des patients.
1. Transfert technologique :
Des techniques de biologie moléculaire ont été transférées au laboratoire de virologie
de l’Institut Pasteur d’Algérie (IPA). Elles ont servi principalement à l’étude de l’EBV
et du HPV. De nombreux laboratoires algériens ont par ailleurs bénéficié de ces
technologies dans le cadre de stages au niveau de l’annexe de Sidi Fredj.
2. Etude du Virus
Des résultats obtenus dans le cadre des différents projets de coopération ont permis
de mettre en évidence :
¾ Le polymorphisme du virus avec :
- Une co-infection par deux types de virus portant les gènes EBNA 2A et EBNA 2B
chez les enfants et jeunes adultes atteints de lymphomes : LHD et LNHD.
Seul le virus portant le gène EBNA 2A est retrouvé, comme en Chine, dans les
biopsies du NPC.
- Des différences au niveau génomique entre les souches virales identifiées à
partir de NPC chinois et algériens.
- Des différences génomiques entre les souches virales présentes dans la tumeur
et les lymphocytes d’un même patient.
- Aucune différence notable n’a été observée dans le polymorphisme viral et dans
les proto-oncogènes entre les deux tranches d’âge.
¾ L’expression intéressante de certains gènes viraux :
- L’expression des gènes précoces BZLF1, BARF1, BGLF5, et d’un gène tardif
BALF4. Les résultats ont mis en évidence pour la première fois dans des cellules
tumorales provenant de biopsies fraîches et de tumeurs induites par les cellules
transplantées l’expression d’une DNase-EBV fonctionnelle bien distincte d’une
DNase cellulaire (Sbih-Lammali et al : Arch. IPA 2008)
- Une
expression transcriptionnelle BALF1 du
activité transformante probable chez la souris.
virus
d’Epstein-Barr
avec
¾ Les études dans le cadre de la collaboration franco-algérienne ont porté
principalement sur l’expression des gènes BARF1 et LMP1.
Des résultats originaux indiquent la présence de protéines LMP1 et BARF1 dans
le sérum de patients en particulier chez les jeunes enfants et les jeunes adultes.
Ces protéines pourraient jouer un rôle crucial dans l’activité cellulaire et
l’immuno-modulation. Elles sont de bonnes candidates pour le diagnostic et le
suivi du NPC.
3. Réponse de l’hôte :
Nous avons mis en évidence pour la première fois une différence de la réponse de
l’hôte en fonction de l’âge. Les IgA anti VCA et EA sont décelées chez très peu
d’enfants atteints de NPC par rapport aux adultes atteints de la même maladie
(31.2% contre 93.3%). Cette insuffisance d’IgA anti VCA et anti EA ne correspond
pas à un déficit global des IgA chez les patients. Les IgA anti DNase sont présentes
chez plus de 95% des enfants. Elles ne sont présentes que chez 3% des sujets sains.
(Meister babiċ et all Arch. IPA 2008)
Des anticorps anti BARF1 ont été retrouvés dans 100% des cas chez les patients
atteints de NPC et de Cancer gastrique. Un test de diagnostic et de suivi de la
tumeur par la recherche de ces anticorps absents chez le sujet sain.
2ème projet
Projet ANDRS : Intitulé du projet : Association du papillomavirus humain avec
le cancer du sein chez la femme
Code du projet : 02/02/03/04/199
MELOULI Hamid (Responsable de projet), A. BOUGUERMOUH, F. ZIDOUNI TAIBI,
S. DAHMANI, N. SADOUKI, D. BANDOUI, F. HARROUZ, M. AFIANE, K. BOUZID,
M. ARDJOUN, N. TERKI, N. DEKKAR
Parmi les objectifs fixés pour la troisième année du projet, nous avons effectué un
travail portant sur l’expression de deux protéines (p21WAF1/Cip1 et p27KIP1) qui inhibe
l’activité de plusieurs complexes cycline/cdks et bloque la progression du cycle
cellulaire.
L’évaluation de l’expression des protéines p21WAF1/Cip1 et p27KIP1 a été réalisée par
immunohistochimie EnVision+ de Dako. Nous avons utilisé l’anticorps monoclonal anti
p21WAF1/Cip1 /IgG2b isotype et l’anticorps monoclonal p27KIP1 (mouse IgG1 isotype).
Nos résultats seront publiés et discuter dans les prochaines archives de l’IPA.
3ème projet
Projet ANDRS : Etude de l’association HPV-EBV au niveau du cancer du col de
l’utérus :
Responsable du projet : Khenchouche Abdelhalim (Université de Sétif).
Chercheurs associés : SADOUKI Nabila, MELOULI Hamid, BOUGUERMOUH
Abdelmadjid IPA), GRABA Abdelaziz (CPMC), OOka Tadamasa
La possible association du virus Epstein-Barr (EBV) et du papillomavius HPV) a déjà
été signalée par quelques laboratoires dont le notre. La présence fréquente de l’EBV
au niveau du col n’est pas admise par tous.
Le rôle éventuel de cette association dans les mécanismes intervenant dans la
transformation des cellules épithéliales en cellules malignes reste à préciser.
58 biopsies de tumeur maligne du col, 37 frottis au niveau de lésions précancéreuses
du col, et 14 frottis chez des femmes ne présentant aucune lésion génitale ont été
étudiées.
Différents marqueurs EBV ont été recherchés par PCR ; RT-PCR, Immunoblot,
Immunohistochimie.
Le HPV a été détecté par PCR et par la technique d’hybridation-capture.
Les marqueurs EBV ont été mis en évidence bien plus fréquemment chez les
patientes porteuses de tumeur maligne que chez les femmes en bonne santé.
Une publication des résultats a été soumise à une revue internationale.
Projet en activité
Projet en coopération internationale
COOPERATION FRANCO - ALGÉRIENNE EN RECHERCHE MEDICALE, ACCORD
Inserm / DPGRF projet 2007 – 2008
MARIAME Bernard Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan U563 de INSERM
BOUGUERMOUH A, H. MELOULI, F. ZIDOUNI TAIBI, S. DAHMANI, N. SADOUKI,
D. BANDOUI, F. HARROUZ, D. DJENNAOUI, M. EL HADJENE
Objectifs et résultats préliminaires du projet
La quasi-totalité des sujets sont infectés par le virus Epstein-Barr (EBV), mais seule
une minorité est susceptible de développer un cancer. Nous ne savons pas si cette
situation reflète l’existence de sujets à risque ou bien de souches EBV
particulièrement tumorigènes. Si cette dernière hypothèse semble la plus plausible,
elle ne pourra être affirmée que dans les pathologies tumorales étroitement
associées à l’EBV tel que le carcinome du nasopharynx (NPC) avec une souche EBV
qui pourrait être différente des souches présentes dans d’autres sites non
pathologiques du même patient. Pour vérifier cette hypothèse, nous avons comparé
le gène BNLF1 de la souche EBV présente dans la tumeur et dans le lymphocyte
réservoir de patients algériens porteurs d’un NPC. Nos résultats montrent que tous
les patients sont infectés par plus d’une souche EBV. Lymphocytes et les cellules
tumorales du même individu sont systématiquement infectés par des souches virales
différentes.
Une publication en préparation doit présenter des résultats préliminaires.
Un atelier de biologie moléculaire à l’attention de 12 scientifiques de l’IPA, avec
travaux de laboratoire, est prévu au mois de mai 2009 dans le cadre de ce
projet.(organisateurs ; H. MELOULI-B. MARIAME).
Projets acceptés avec promesse de financement :
- 1er projet : mise en place d’un réseau pluridisciplinaire dit « West-Nile » avec
comme objectif l’étude des différents facteurs susceptibles d’intervenir dans
l’apparition d’une arbovirose en Algérie et des moyens de contrôle de l’infection.
Ce projet réunit des infectiologues, des entomologistes, des ornitologues,
des épidémiologistes, des vétérinaires, des virologues.
L’étude est prévue dans des zones de l’Est algérien, à Djanet et à Timimoun.
Une mise au point de la situation des arboviroses en Algérie est présentée dans le
numéro 48 de la revue Médicopharmaceutique paru en 2008.
- 2ème projet : Détection du papillomavirus à haut risque dans la prévention du
cancer du col de l’utérus : Ce projet piloté par la direction de la population a pour
objectif l’étude de la faisabilité du dépistage du HPV à haut risque à l’échelle
nationale.
La mise en place de trois laboratoires dans l’est, l’ouest et le sud algérien est
prévue le laboratoire de l’IPA servirait de référence.
Il mènera en outre, en collaboration avec dex services de gynécologie, une étude
permettant d’évaluer l’intérêt et la possibilité d’instituer en Algérie la détection du
HPV en dépistage primaire dans les lésions précancéreuses du col.
(A. BOUGUERMOUH cherraga 2008)
Le support financier d’une organisation internationale est attendu.
Projets à soumettre à l’ANDRS
Deux projets portant sur des gènes EBV et HPV pilotés respectivement par
H. MELOULI et N. SADOUKI doivent être soumis à l’ANDRS
Ces projets s’effectuent actuellement difficilement en raison de manque de réactifs.
Une publication portant sur le génotypage du HPV a paru dans les archives de l’IPA
en 2008 (N. SADOUKI et al).
Des résultats portant sur les marqueurs de l’EBV ont été présentés aux journées
nationales ORL d’Annaba (H. MELOULI 2008)
III. ENQUETE EPIDEMIOLOGIQUE
Epidémie de néphropathie aiguë à Sétif (Aout 2008)
Réception de 45 sérums prélevés chez 22 patients atteints de glomérulonéphrite
aiguë.
La clinique, l’évolution de la maladie sont en faveur d’une étiologie à Hantavirus.
Les résultats sérologiques en faveur de cette étiologie ne sont pas significatifs
de même que ceux obtenus avec les leptospiroses.
Des rongeurs ont été capturés.
L’étude doit se poursuivre.
Cette épidémie rappelle celle de Sidi-Bel-Abbes dont les résultats sont présentés
dans la revue Medicopharmaceutique (Souleimane A et al 2008).
IV. CONTRÔLE DE REACTIFS
Contrôle de réactifs destinés au diagnostic de la syphilis
Test TPHA (Lorne) lot N°303027
Test TPHA (Sorodia) lot N°VN 71110
Test VDRL (Immutrep) lot N°7013117
Test VDRL (Immutrep) lot N°7013116
V. FORMATIONS ET ENSEIGNEMENTS
Thèses d’Etat en préparation
MELOULI Hamid (IPA)
Le cancer du nasopharynx chez l’enfant et le jeune adulte : étude de la réponse
immunitaire du virus Epstein Barr et des proto-oncogènes dans les biopsies
tumorales.
Directeur de thèse : A. Bouguermouh. Z. Elkhebir
Soutenance prévue en 2009
KHENCHOUCHE Abdel halim (université de Sétif)
Etude du HPV et de son association possible avec l’Epstein Barr dans les lésions
précancéreuses et cancéreuses du col de l’utérus.
Directeur de thèse : A. Bouguermouh, T. OOKA
Publication soumise à une revue internationale. La soutenance sera réalisée dés
parution de l’article.
Thèse de DESM
EL HADJANE mohamed (Faculté de médecine. Alger) Approche immunologique du
NPC en Algérie : implications cliniques et immunologique.
Directeur de thèse : Pr D. DJENNAOUI (ORL).
Soutenance de mémoire de DES réalisée
Promoteur H. MELOULI
Encadreur technique : F ZIDOUNI-TAIBI et DAHMANI Salma
GUESSAB Sarah et ZERGOUG Fella (DES en biologie). Contribution à la mise au
point des conditions de détections de la protéine LMP1 du virus Epstein-Barr par
immunohistochimie (Application au diagnostic du cancer du nasopharynx). USTHB,
Faculté des sciences biologiques. Département de biologie des populations et des
organismes. 6 octobre 2008.
Ces résultats feront l’objet d’une publication internationale.
Formation
Accueil au Laboratoire des herpes virus de deux stagiaires Monsieur BOUZELAL Fethi et
KERKOUBA Mohamed de l’Université de Blida pour effectuer leurs manipulations dans le
cadre da la préparation de leur mémoire de fin d’études
Séjours en France de doctorants algériens
H. MELOULI : LABORATOIRE DE PHYSIOPATHOLOGIE DE TOULOUSE PURPAN
(UNITE 563) (B. MARIAME) : 11/12/08 au 12/02/09
Projet INSERM DGPRF
N. SADOUKI : Laboratoire CNRS de Lyon (T. OOKA) Projet 05 MDU 663 : janvier 2008
K. HOUALI : Laboratoire CNRS Lyon (T. OOKA) projet 05 MDU 663 novembre-décembre
2008
M. l HADJANE Laboratoire CNRS de Lyon (T. OOKA) Projet 05 MDU 663 : mai 2008
Séjours à Alger d’experts dans le cadre de la collaboration scientifique
Dr. T. OOKA : février (3 jours), décembre (2 jours) ! projet 05 MDU 663
Dr B. MARIAME (Toulouse), avril (3 jours) projet INSERM
Dr. O. PATHEY (Paris) : projet réseau West-Nile.
VI. PUBLICATIONS
A. BOUGUERMOUH, I. BITAM, N. SADOUKI, R. BOUGUEDOUR: Maladies
émergentes et réémergentes: revue générale. La Revue Médicopharmaceutique,
2008 48. 19-25.
A. BOUGUERMOUH, Z. BOUSLAMA, I. BITAM, N. SADOUKI, R. BOUGUEDOUR :
Ces arbovirus qui menacent l’Algérie. La Revue Médicopharmaceutique 2008 48 4652.
A. SOULIMANE, A. MERBOUH, B. BOUTERFAS, A. BOUGUERMOUH, I. BITAM,
K. BOUZID : A propos d’un épisode de néphropathie aigue épidémique à Sidi Bel
Abbes en été 2007, orientation causales. La Revue Médicopharmaceutique, 2008 48.
53-57.
A DERRAR, R. BOUGUEDOUR, A. BOUGUERMOUH. La grippe humaine et
animale. La Revue Médicopharmaceutique, 2008 49. 15-21.
V. COMMUNICATIONS
N. SADOUKI, A. KHENCHOUCHE, H. MELOULI, A. BOUDRICHE, D. BANDOUI,
F. HARROUZ, M. TIDADINI, G. AYACHE, A. GRABA, A. BOUGUERMOUH.
Dépistage du papillomavirus (HPV) dans les lésions cancéreuses et précancéreuses
du col de l’utérus au cours des vingt dernières années en Algérie.
1er Symposium International pour un Dépistage Optimal du Cancer du Col de l’Utérus
en Algérie. - 30 octobre 2008. –Hôtel El AURASSI- Alger
N. SADOUKI, A. BOUGUERMOUH
HPV et Cancers de la sphère ORL
Journées Nationales d’ORL - Faculté de Médecine d’Annaba 04 au 06/07/2008.
H. MELOULI, F. ZIDOUNI TAIBI, S. DAHMANI, M. ELHADJANE, D. DJENNAOUI,
A. BOUGUERMOUH : Apport des marqueurs sérologiques et moléculaires du virus
Epstein-Barr dans le diagnostic du cancer du naso-pharyn
Journées Nationales d’ORL - Faculté de Médecine d’Annaba 04 au 06/07/2008.
A. BOUGUERMOUH, D. BACHA
Rongeur et risques infectieux : introduction et revue générale.
3ème journées d’infectiologie de l’HCA – Alger 11 juin 2008.
A. SOULLIMAN, A. MERBAH, A. BOUTERFAS, A. BITAM, A. BOUGUERMOUH,
K. BENDISARI
A propos de la néphropathie épidémique de 2007 de Sidi Bel Abbes : orientation
causales. 3ème journée d’infectiologie de l’HCA - Alger 11 juin 2008 -
A. BOUGUERMOUH, H. MELOULI, N. SADOUKI, F. TAIBI, K. HOUALI,
H. KHENCHOUCHE, DJ. BANDOUI, F. HARROUZ (IPA), D. DJENNAOUI,
M. EL HADJANE (ORL), K. BOUZID, M. AFIANE, T. OOKA
Virus Epstein Barr et cancers associés : bilan d’une coopération interuniversitaire
Algéro-Française (CMEP-Tassili). Alger 16/12/2008.
A. BOUGUERMOUH, H. MELOULI, F. TAIBI, N. SADOUKI, M. EL HADJANE,
D. DJENNAOUI (ORL), K. BOUZID, M. AFIANE, T. OOKA ET AL.
Virus Epstein Barr et cancer du nasopharynx – Etude en Algérie.
XXth congress international academy of pathology Arab division. Alger 24-26
Novembre 2008
A. BOUGUERMOUH, N. SADOUKI, A. BOUDRICHE, A. KHENCHOUCHE,
R. SAADI, F. KEDDAD
Apport de la détection du HPV à haut risque dans le dépistage du cancer du col.
4eme journées d’évaluation du programme international de dépistage du cancer du
col de l’utérus. Direction de la population. Ministère de la santé. Cherraga 27-28
décembre 2008.
Activités des laboratoires
de contrôle de qualité
176 Laboratoires de Contrôle de Qualité
Laboratoire de Bactériologie des Aliments
Chef de laboratoire : Fawzia MOUFFOK (Pharmacienne/ M.A. / INESSM).
INTRODUCTION :
L’activité au sein du laboratoire de Bactériologie des aliments est très diverse. Il s’agit de
contrôler les aliments produits au sein des unités de production, donc les produits finis.
L’objectif est de vérifier la conformité du produit à des critères microbiologiques.
L’analyse consiste, en général, en la recherche des micro-organismes responsables
d’altération qui regroupent les germes capables d’altérer la qualité marchande de
l’aliment et les germes témoins de contamination fécale.
Dans ce cas, une première opération très importante consiste à échantillonner le produit.
Les produits importés subissent généralement le même type de contrôle mais leur
échantillonnage s’effectue au port par les services vétérinaires officiels.
Le deuxième type d’analyse consiste à mettre en évidence les germes suspects d’être à
l’origine de toxi-infections alimentaires. L’analyse se limite à prendre en charge le
plateau témoin et à rechercher les germes qui sont potentiellement pathogènes pour le
consommateur.
Le troisième type de contrôle touche les produits en cours de fabrication ou de
préparation (cuisines) ou bien la vérification de l’état hygiénique des lieux de fabrication,
de stockage. Pour ces produits des examens en cours de fabrication ou du produit fini
sont intéressants et utiles dans un cadre préventif. En cas de problèmes, l’enquête a
pour but de situer les contaminations quand elles existent et à envisager les moyens de
les enrayer.
Pour cela, une recherche de l’activité bactéricide des produits utilisés comme détergents
ou désinfectants est effectuée.
Au cours de l’année 2008, le laboratoire de bactériologie des aliments a procédé
à l’analyse bactériologique de produits divers dont la nature figure dans le tableau 1.
L’examen de ces produits consiste en la recherche, le dénombrement et
l’identification d’un certain nombre de paramètres (germes) spécifiques pour chaque
type de prélèvements.
Laboratoires de Contrôle de Qualité 177
Tableau n°1 : Nature des denrées analysées 2008
Nature des produits
Nombre
Pourcentage
Aliments de bétail
55
0,53
Bases désinfectantes
20
0.20
Conserves
427
4.16
Divers
701
6.82
Laits et Produits laitiers
7268
70,75
Plats cuisinés
267
2,60
Viande et Produits carnés
1534
15.0
10 272
100.00
TOTAL
Sur les 10 272 produits, nous avons effectué la recherche des paramètres dont la
répartition figure dans le tableau 2. Les recherches de Listera sont confiées au
laboratoire des Listeria chargé de cette recherche.
Tableau n°2 : Résultats selon les paramètres recherchés
Paramètres recherchés
Positifs
Négatifs
Total
Anaérobies sulfito-réducteurs
0004
10248
10 252
Coliformes totaux
0188
9637
9825
Coliformes fécaux
0173
9652
9825
Germes aérobies mésophiles totaux
2081
8171
10 252
129
9696
9825
82
9743
9825
185
0015
200
Salmonella
01
9824
9825
Staphylocoques aureus
07
9818
9825
2850
76 804
79 654
Levures
Moisissures
Pseudomonas aéruginosa
Totaux
Le tableau 3 ci-après, indique la répartition mensuelle des analyses effectuées par
produit :
Tableau n°3 : Répartition mensuelle des analyses effectuées au cours de l’année 2008
Nature
Denrées
Mois
Bases
Aliments
désinfe Totaux
Animaux
ctantes
Laits
Divers
Con
serves
Viandes
Plats
cuisinés
Janvier
587
43
40
073
20
05
00
0768
Février
504
49
21
103
33
06
06
0722
Mars
743
68
27
128
25
05
13
1009
Avril
686
55
42
098
38
03
01
0923
Mai
724
44
25
125
20
01
00
0939
Juin
848
50
33
134
27
05
00
1097
Juillet
536
92
44
117
20
03
00
812
Août
662
67
36
185
18
04
00
0972
Septembre
497
33
51
171
00
04
00
0756
Octobre
578
72
44
124
26
03
00
0847
Novembre
386
68
50
186
19
07
00
0716
Décembre
517
60
14
090
21
09
00
0711
Totaux
7268
701
427
1534
267
55
20
10272
Le tableau 4 indique la qualité bactériologique des produits analysés.
Tableau n°4 : Qualité bactériologique des produits contrôlés.
Nature des produits
BQB
MQB
Totaux
Aliments de bétail
055
00
0055
Bases désinfectantes
020
00
0020
Conserves
0426
01
0427
Divers
0625
76
0701
Laits et Produits laitiers
7239
29
7268
Viandes et Produits carnés
1530
04
1534
Plats cuisinés
0169
98
0267
10 064
208
10272
Totaux
Légende : - B Q B : Bonne qualité bactériologique
M Q B : Mauvaise qualité bactériologique.
III. ACTIVITE DE FORMATION
1. Formation dispensée dans le laboratoire. (Mémoires de fin d’études et thèses de
doctorat.)
Nom Prénom de
l’étudiant
Organisme
d’origine
Niveau
d’études
Début
formation
Date de fin de
formation
Nature des travaux
réalisés
L. ASSOUS
MS. ATROUZ
ASSAM
USTHB
DES microbiologie
Février
2008
Juillet
2008
Etude des ASR dans
plats cuisinés en
restauration collective
F. MOUFFOK
B. BOUDJELLAB
F. CHENTLI
L. LALLOUCHE
USTHB
DEUA
Février
2008
Juillet 2008
Qualité bactériologique
des plats cuisinés
F. MOUFFOK
H. BOUAZIZ
A.
BOUMENIKHRA
USTHB
DES microbiologie
Mars 2008
Juillet 2008
Recherche et
dénombrement des des F. MOUFFOK
listéria dans les denrées B. BOUDJELLAB
alimentaires..
Juillet
2008
Recherche et
dénombrement des
F. MOUFFOK
Staphylococcus auréus
B. BOUDJELLAB
dans les denrées
alimentaires
L. MAHDID
W. ZAKNOUNE
USTHB
DES
Microbiologie
Mars
2008
Nom de
encadreur
2. Stages dans le laboratoire dans le cadre du résidanat en microbiologie
Nom prénom
Qualité
Durée
Travaux
Encadreur
HOUHOUNE El batoul
Résident
1 mois
Stage
MOUFFOK
KADDARI fatima
Résident
1 mois
Stage
MOUFFOK
AZZOUG Saloua
Résident
1 mois
Stage
MOUFFOK
NOUAR Selma
Résident
1 mois
Stage
MOUFFOK
KHELLOUFI Achwak
Résident
1 Mois
Stage
MOUFFOK
MECHRARA Nezly
Résident
1 mois
Stage
MOUFFOK
KESSIRA Nawel
Résident
1 mois
Stage
MOUFFOK
ABIDI Med Lamine
Résident
1mois
Stage
MOUFFOK
BOUNEFFISSA Med Achraf
Résident
1 mois
Stage
MOUFFOK
3. Formation dispensée hors laboratoire
- Séminaires de formation et de recyclage en bactériologie des eaux et des
aliments au profit des techniciens des laboratoires de wilaya avec la collaboration
de la direction de l prévention, Ministère de la santé, de la population et de la
réforme hospitalière : Mme MOUFFOK, Mr AZIZI, Mr BOUDJELLAB, Melle GHAOUI.
- Pour les wilayas de l’est : Skikda du 30 mai au 5 juin 2008
- Pour les wilayas de l’ouest : Tlemcen du 28 juin au 3 juillet 2008.
Laboratoire de Bactériologie des Eaux
Chef de service : Fawzia MOUFFOK (Pharmacienne/ M.A/ INESSM)
INTRODUCTION
Le laboratoire d’analyse des eaux étudie les eaux de canalisations urbaines traitées pour
lesquelles la recherche des germes témoins de contamination fécale est suffisante.
Pour les eaux de puits non traitées, il faut compléter l’analyse par une recherche de
germes pathogènes.
Pour les eaux minérales, il est indispensable de tester la qualité marchande du produit
par une évaluation de la flore aérobie mésophile totale. Cette activité entre dans le
domaine de l’expertise puisque nous participons dans le cadre du comité national
désigné et présidé par le ministère des ressources en eaux à l’agrément des eaux à
embouteiller.
Pour les eaux de mer et de piscine, on devra rechercher, outre les germes de
contamination fécale, les germes pathogènes, les staphylocoques pathogènes et les
pseudomonas.
Depuis 6 ans, la surveillance de la qualité des eaux de baignade de la wilaya d’Alger est
confiée à nos soins. 3002 eaux ont été traitées cette année.
I- ACTIVITE DIAGNOSTIC
- Analyse des eaux de boisson : Au cours de l’année 2008, le laboratoire des eaux
a analysé 1022 eaux d’origine diverse dont la répartition est consignée dans le
tableau 1.
Tableau 1 : Répartition mensuelle et leur nature des analyses d’eaux
Robinet
Citerne
Eaux
Profondes
Bâches
Puits/Sondes
Eaux
Minérales
Piscines
Autres
Janvier
32
02
14
00
01
09
Février
60
01
12
01
04
15
Mars
96
02
22
00
01
06
Avril
75
06
34
00
05
03
Mai
55
06
25
00
00
02
Juin
60
04
45
00
10
07
Juillet
57
02
37
05
12
04
Août
37
00
32
00
02
04
Septembre
28
00
18
00
00
04
Octobre
47
08
23
00
01
03
Novembre
31
00
33
01
00
01
Décembre
42
03
18
03
00
06
Total
589
34
289
10
36
64
Mois
La qualité bactériologique des eaux analysées est rapportée dans le tableau 2 :
Tableau 2 : qualité bactériologique des eaux analysées
Qualité
Quantité
%
Bonne qualité
0405
040
Qualité suspecte
0316
030
Mauvaise qualité
0301
030
1022
100
Total
- Analyse des eaux de baignade :
Dans le cadre de la surveillance des eaux de baignade, nous avons reçu de Mai
à Août 1980 prélèvements effectués sur les cotes est et ouest d’Alger. Leur analyse
a donné les résultats suivants :
- 42% sont de bonne qualité bactériologique.
- 16% sont de mauvaise qualité bactériologique.
- 42% sont de qualité bactériologique acceptable.
18 souches de salmonella ont été isoles elles figurent au tableau 3.
Tableau 3 : Sérovars de Salmonella isolés des eaux de mer
Sérovars
Nombre de souches
Salmonella kentuckey
01
infantis
01
Paratyphi B
01
braenderup
01
hadar
01
entéritidis
01
typhimurium
02
indiana
01
corvalis
09
II. ACTIVITE RECHERCHE
1- Projet ACIP S2 Vibrio : « Impact des modifications environnementales sur le
développement des vibrions cholériques et non cholériques dans le bassin
méditerranéen ».
Dans le cadre de ce projet 145 échantillons d’eaux de mer ont été prélevés et
étudies du point de vue Vibrionaceae, qualitativement et quantitativement. Les
souches de vibrions cholériques et non cholériques isolées ont été adressées à
l’IPP pour étude moléculaire.
2- Recherche de Legionella pneumophila dans les circuits de distribution d’eau
chaude et les tours aérorefrigérantes (TAR) : introduite depuis le 10 mars. Les
résultats sont rapportés au tableau 4.
Tableau 4 : Recherche de Legionella pneumophila dans les circuits de distribution d’eau
chaude et les tours aérorefrigérantes (TAR) :
Quantité
enquêtes
Nombre de
prélèvements
positifs
Sheraton Oran
04
48
02
Sheraton Alger
04
58
03
Mercure
04
48
03
Sofitel
04
48
08
Thalasso Sidi Ferruch
02
24
03
Hôpital Beni messousµ
01
12
00
19
238
19
Lieu de L’enquête
Total
III. COMMUNICATIONS
- F. MOUFFOK, A. BENABBOU, Y. HAFFERSSAS : « Qualité bactériologique des
eaux naturelles » 2ème Journées internationales de toxicologie ; 3 & 4
décembre 2008 »
Poster
A. BENABBOU, S. SAADI, F. MOUFFOK : « Recherche et dénombrement de
Légionella Spp dans les eaux » 1ère journée de la SAMIC / 29 mai 2008 Palais de
la culture ; ALGER.
IV. MISSIONS
Autres missions pour prélèvements eaux : Dans le cadre des déplacements effectués
pour étudier la qualité des eaux forées à embouteiller, 36 déplacements ont été effectués
sur l’ensemble du territoire national par les chargés de mission suivants :
- GASMI Mohamed
: 14
- HAFFERSSAS Yacine : 12
- GAOUI Chafika
: 02
- BOUARABA Hocine
: 02
Missions d’inspection effectuées avec la participation de membres de la commission du
ministère des ressources en eaux ; Mme MOUFFOK Fawzia : 03.
V. FORMATION
1 COURS / Qualité bactériologique des eaux de boisson : pour le compte de
l’ADE 2 Cessions de 2 semaines : Cours et travaux pratiques à l’IPA de Sidi Ferruch
Organisation et coordination : Mme MOUFFOK et Mr LEBRES
Avec la participation de Mrs AZIZI, Melle GHAOUI, Mr M. BOUDJELLAB
1ère Cession du 06 au 17 mai 2008
2ème Cession du 02 au 14 juin 2008
2 Stages de formation de 2 groupes de 3 paramédicaux Sahraouis au laboratoire
pour la prise en charge de la colimétrie des eaux :
1 Groupe en mai ;
2ème groupe en juin :
VI. Encadrement de mémoire
Nom et prénom
de l’élève
Organisme
d’origine
F. BELKOUS
R. BOUSSAYOUD
USTHB
Ingéniorat
CQ et
analyses
Date de début
de la formation
Mars 2008
Date de la fin
formation
nature des Sujet
Promoteur
Juillet 2008
Surveillance des
eaux de mer et
prévention du
Cholera
F. MOUFFOK
Laboratoire de Contrôle de Qualité
Chef de laboratoire : Nadia TOUABTI (Docteur en Pharmacie – Docteur en Chimie)
- Année de création 199O
- Laboratoire autonome des services de production de l’IPA
PRESENTATION DU LABORATOIRE
A. ORIENTATION DU LABORATOIRE :
1. Le laboratoire a pour but le contrôle de qualité des produits finis :
- fabriqués par l’INSTITUT PASTEUR D’ALGERIE
- Importés par l’IPA sous forme de produits finis
2. Les produits concernés par le contrôle de qualité sont :
- Les vaccins à usage humains et vétérinaires.
- Les Extraits Allergéniques.
- Les sérums thérapeutiques.
- Les réactifs de diagnostic. à usage humains et vétérinaires
- Les antiseptiques et désinfectants.
- Les produits consommables (seringues, tubulures, gants,.....).
- Autres produits pour des contrôles microbiologiques, Pharmacotoxicologiques,
physico-chimiques (Eau purifiée à usage pharmaceutiques...).
B. ORGANISATION DU LABORATOIRE
LES UNITES DE CONTROLES
1. DEPARTEMENT TECHNICO ADMINISTRATIF :
Organisation et rôle :
- Échantillonnage.
- Gestion de l’échantillothéque.
- Gestion des références.
- Réception des lots à contrôler.
- Identification des lots et contrôle du conditionnement.
- Enregistrement des lots.
- Distribution des échantillons.
- Gestion des documents et des dossiers techniques
- Gestion de la réglementation inhérente au fonctionnement du laboratoire de
contrôle.
- Assurance qualité interne au laboratoire.
- Appliquer le système de qualité requis.
- Veiller à la bonne application des BPF-BPL.
- Rassembler les résultats de contrôle des différentes unités et veiller à leur
cohérence.
- Validation des résultats.
Liste des producteurs dont les produits biologiques (Vaccins, immunosérums
et produits thérapeutiques) nous sont parvenus en 2008 (Locaux et étrangers).
Produits biologiques :
IPA (Algérie), Sanofi Pasteur (France), Stallergénes (France), BB-NCIPD (Bulgarie)
Biofarma (Indonésie), Institut Butantan (Brésil), Shantha biotech (Inde), Baharat biotech
(Inde), Sérum institut of India (Inde), Institut of immunology (Croatie), Medion diagnostic
(suisse), GSK Glaxo-Smithkline (Belgique), Heberbiotec (Cuba), Vacsera (Egypte),
Wyeth (USA).
Produits réceptionnés par système de lots* :
* Nécessitent un échantillonnage
Produits IPA
Origine : IPA
¾ Vaccins à usage humain.
¾ Vaccins à usage vétérinaire.
¾ Immunosérums thérapeutiques à usage humain.
¾ Produits de diagnostic in vitro.
Produits importés :
Origine : Voir la liste des producteurs ci-dessus.
¾ Vaccins du PEV (Programme élargi de vaccination).
¾ Vaccins indiqués pour les voyageurs et utilisés pour la prophylaxie de certaines
maladies.
¾ Immunosérums thérapeutiques (antitoxiques et antivenins).
¾ Produits de diagnostic in vivo et in vitro.
¾ Produits thérapeutiques.
Produits biologiques réceptionnés utilisés comme référence* :
* Ne nécessitent pas d’échantillonnage
¾ Références (Vaccins et sérums).
Produits contrôlés en vue d’un enregistrement :
Origine : Producteurs étrangers et locaux
¾ Vaccins à usage humain (Obtention d’une AMM en Algérie auprès du ministère de
la santé).
¾ Vaccins à usage vétérinaire (Obtention d’une AMM en Algérie auprès du ministère
de l’agriculture).
Produits expertisés pour cause de rupture de la chaîne du froid :
Origine : SEMEP et EPSP
¾ Vaccins.
¾ Immunosérums.
¾ Produits de diagnostic in vivo.
SEMEP = Service d’épidemiologie et de médecine préventive
EPSP = Établissement public de santé de proximité
Assurance qualité interne au laboratoire :
Les méthodes d’analyse effectuées et les normes appliquées à notre laboratoire de
contrôle qualité sont des normes internationales.
Voici quelques références sur lesquelles nous nous basons pour établir nos méthodes
de contrôle, nos normes de contrôle, les activités du laboratoire.
- BPF appliquées aux produits biologiques selon l’OMS.
- BPF appliquées aux produits pharmaceutiques.
- Bonnes pratiques de laboratoire.
- Pharmacopée Européenne 5ème Edition.
- Pharmacopée Américaine USP.
- Normes Afnor pour la détermination de l’activité des antiseptiques et désinfectants.
Assurance qualité des produits biologiques selon l’OMS :
Appliquée par le biais :
De la mise en place d’une procédure d’échantillonnage des produits biologiques.
De la gestion des documents relatifs aux produits biologiques :
- Documents techniques.
- Documents réglementaires.
De l’élaboration des normes de contrôle.
De l’élaboration de procédures opératoires standardisées (POS) pour chaque contrôle.
Certaines procédures sont réalisées d’autres en cours.
Gestion du dossier de contrôle des lots des produits biologiques
- La fiche de prélèvement des échantillons
- La fiche de contrôle de la chaîne du froid
- La fiche navette du conditionnement pour les produits internes
- La fiche d’identification des produits
- La fiche de contrôle du conditionnement (produit fini)
- La fiche de distribution des échantillons aux unités de contrôle
- La fiche des résultats des unités concernées par le contrôle
- Le certificat d’analyse du laboratoire de contrôle
- Le certificat d’analyse du producteur
Mise à jour des procédures de contrôle, produits déjà contrôlés et nouveaux produits.
Mise à jour des normes de contrôle.
2. UNITE DE CONTROLE PHYSICO-CHIMIQUE :
pH, Temps de dissolution, Volume extraclible, Humidité résiduelle, Identification du
rouge de phénol, NaCl, Protéine totale, Azote protéique, Phénol, Aluminium,
Thiomersal, DO concentration bactérienne, Conductivité à 25°c, Nitrates, Métaux
lourds ,Substances oxydables, Chlorures pour les Vaccins, Sérums thérapeutiques,
Produits thérapeutiques, Produits de diagnostic et solvants.
- Préparation, stérilisation et contrôle des milieux de culture :
Pour les différentes unités du service. Gestion des produits chimiques, bases
déshydratés et réactifs.
3. UNITE DE CONTROLE VIROLOGIQUE :
- Contrôle d’identification des principes actifs par sérologie.
- Contrôle d’activité des vaccins viraux rougeole, polio oral sur cultures cellulaires.
4. UNITE IMMUNOLOGIE :
- Contrôle d’activité du vaccin Hépatite B adultes et pédiatrique par méthode Elisa.
- Contrôle d’activité du vaccin Grippal par méthode d’immunodiffusion SRID
(en projet).
5. UNITE DE CONTROLE PHARMACO-TOXICOLOGIE :
Contrôle in vivo des produits biologiques :
- Contrôle de toxicité anormale sur souris et cobayes.
- Contrôle de toxicité spécifique sur souris (Valence coqueluche)
- Contrôle des pyrogènes sur lapins.
- Contrôle d’activité : vaccin rabique souriceaux sur souris (en cours).
6. UNITE MICROBIOLOGIE I :
- Stérilité fongique et bactérienne.
- Contrôle des vaccins bactériens ; vaccin Typhoïdique Para TyphoïdiqueA et B,
vaccin cholérique, vaccin BCG.
- Contrôle des endotoxines.
- Diagnostic bactériologique.
- Souchothéque bactérienne.
7. UNITE MICROBILOGIE II :
Activité de l’unité : Contrôle des produits Pharmaceutiques et matières
premières :
- Contrôle de l’eau purifiée à usage pharmaceutique.
- Contrôle de pureté des produits non obligatoirement stériles.
- Contrôle d’activité des antibiotiques et des antiseptiques.
8. ACTIVITES DE L’UNITE POUR CONTROLE DES SERUMS DE GROUPAGE
- Entretien de l’animalerie et production de souris pour le contrôle.
- Gestion de l’échantillothèque et de la souchothèque du service.
- Secrétariat pour la gestion des dossiers de contrôle, établissement des certificats
de contrôle, intervention dans la rédaction des procédures de contrôle.
- Réparation, stérilisation et contrôle des milieux de culture du service.
- Laverie, décontamination.
ACTIVITES DE SOUTIEN :
- Entretien de l’animalerie et production de souris pour le contrôle.
- Gestion de l’échantillothèque et de la souchothèque du service.
- Secrétariat pour la gestion des dossiers de contrôle, établissement des certificats
de contrôle, intervention dans la rédaction des procédures de contrôle.
- Préparation, stérilisation et contrôle des milieux de culture du service.
- Laverie, décontamination.
Contrôle effectuée par système de lots en 2008
I. Produits biologiques
1. Vaccins IPA et importés
1.1- Vaccins IPA :
1.1.1. Vaccins IPA à usage humain
Désignation
Producteur
Nbre
C
NC
IPA
44
38
06
Sanofi-Pasteur-IPA
01
01
0
Total 2008
45
39
06
Total 2007
28
Vaccin rabique souriceaux inactivé
lyophilisé monodose
Vaccin grippal vaxigrip à virion fragmenté
multidoses*
Statistiques / 2007
* Conditionné par l’IPA
Lot
Nbre : Nombre
+37.8%
C : Conforme
NC : Non conforme
1.1.2. Vaccins IPA à usage vétérinaire
Désignation
Producteur
Lot
Nbre
C
NC
Vaccin rabique vétérinaire inactivé
lyophilisé Vet-Era
IPA
04
04
0
Vaccin claveleux cultures cellulaires à
virus atténué lyophilisé
IPA
01
01
0
Total 2008
05
05
0
Total 2007
28
Statistiques / 2007
-89.2%
1.1.3. Solvants IPA eau ppi, solution isotonique de NaCl, solution eau phénolée
Désignation
Solvant eau ppi
(1)
(1)
Producteur
Lot
Nbre
C
NC
IPA
45
45
0
Solvant solution isotonique de NaCl pour
vaccins claveleux
IPA
12
12
0
Solvant eau phénolée
IPA
01
01
0
Total 2008
58
Total 2007
68
Statistiques/2007
-14.7%
Utilisé pour la reconstitution du vaccin rabique souriceaux et vaccin rabique Vet-Era
58
0
1.1- Vaccins importés
Désignation
Lots
Producteur
Nbre
C
NC
01
Vaccin meningococcique ACWY135
(Mencevax) Multidoses
GSK
02
02
0
02
Vaccin hépatite B adultes
recombinant (Engerix-B) Multidoses
GSK
01
01
0
03
Vaccin pneumococcique
(Pneumo23) Monodose
Sanofi Pasteur
03
03
0
04
Vaccin polio oral vivant attenue
(OPV) Multidoses
Sanofi Pasteur
02
02
0
05
Vaccin fièvre jaune vivant attenué
(Amaril) Multidoses
Sanofi Pasteur
02
02
0
06
Vaccin grippal à virion fragmenté
(vaxigrip) Monodose
Sanofi Pasteur
07
07
0
07
Vaccin rabique cultures cellulaires
inactivé (verorab) Monodose
Sanofi Pasteur
07
07
0
08
Vaccin DTCOQ-Hib (TetrAct-Hib)
Multidoses
Sanofi Pasteur
08
08
0
09
Vaccin DTCOQ Multidoses
Sanofi Pasteur
01
01
0
10
Vaccin haemophilus type b conjugué
(Act-Hib) Monodose
Sanofi Pasteur
02
02
0
11
Vaccin BCG lyophilisé Multidoses
SII
04
04
0
12
Vaccin Td adultes Multidoses
SII
06
06
0
13
Vaccin DT pédiatrique Multidoses
SII
06
06
0
14
Vaccin DTCOQ Multidoses
SII
04
04
0
15
Vaccin hépatite B adultes
recombinant Monodose
SII
03
03
0
16
Vaccin rougeoleux vivant atténue
Multidoses
SII
05
05
0
17
Vaccin rabique cultures cellulaires
inactivé (Indirab) Monodose
Baharat biotec
11
11
0
18
Vaccin hépatite B pédiatrique
Shantha biotec
04
04
0
19
Vaccin polio oral vivant atténue
Multidoses
Biofarma
07
07
0
20
Vaccin hépatite B pédiatrique
(Heberbiovac)
Heberbiotec
19
19
0
Total 2008
104
104
0
Total 2007
84
Statistiques/2007
+20%
2. Immunosérums IPA et importés
2.1- Immunosérums IPA à usage humain
Désignation
Lot
Producteur
Nbre
C
NC
01 Sérum antiscorpionique
IPA
25
25
0
02 Sérum antirabique
IPA
05
05
0
03 Sérum antivipérin
IPA
03
03
0
Total 2008
33
33
0
Total 2007
32
Statistiques 2007
+3.1%
2.2- Immunosérums importés à usage humain
Désignation
Producteur
Lot
Nbre
C
NC
01
Sérum antiscorpionique d’origine
équine
Vacsera
03
03
0
02
Sérum antirabique d’origine
équine
Institut Butantan
04
04
0
03
Sérum antidiphtérique d’origine
équine
Institut of immunology
01
01
0
04
Sérum antitétanique d’origine
équine
SII
05
05
0
Total 2008
13
13
0
Total 2007
04
Statistiques/2007
+69.3%
3. Produits thérapeutiques importés
Lot
Désignation
01
Producteur
Nbre
C
NC
Extraits allergéniques DPt
(1)
Dermatophagoides pteronyssinus
Stallergénes
05
05
0
Extraits allergéniques DPt
Dermatophagoides pteronyssinus(2)
Stallergénes
06
06
0
03
Extraits allergéniques pollens de
5 graminées(1)
Stallergénes
01
01
0
04
Extraits allergéniques pollens de
(2)
5 graminées
Stallergénes
03
03
0
Total 2008
15
15
0
Total 2007
17
02
Statistiques/2007
-11.7%
4. Produits de diagnostic in vivo et in vitro
4.1. Produits de diagnostic in vivo importés
Désignation
01
Producteur
Tuberculine purifiée d’origine bovine
Lot
Nbre
C
NC
BB-NCIPD
02
02
0
Total 2008
02
02
0
Total 2007
02
Statistiques/2007
Stable
4.2- Produits de diagnostic in vitro IPA-Importés
Désignation
01
Sérum de groupage ABO-Rh
Nbre
C
NC
Medion dc –IPA
10
09
01
Total 2008
10
09
01
Total 2007
11
Statistiques/2007
(1)
0,1 IR, 1 IR, 10 IR coffret traitement
Lot
Producteur
(2)
-10%
10 IR coffret entretien
4.2. Produits de diagnostic in vitro IPA
Désignation
Lot
Producteur
Nbre
C
NC
01
Sérum agglutinant anti-salmonella polyvalent OMA
IPA
01
0
01
02
Sérum agglutinant anti-salmonella polyvalent OMB
IPA
01
0
01
03
Sérum agglutinants anti-Salmonella polyvalent H :1
IPA
01
01
0
04
Sérum agglutinants anti-Salmonella monovalent H : a
IPA
01
01
0
05
Sérum agglutinants anti-Salmonella monovalent H : b
IPA
01
01
0
06
Sérum agglutinants anti-Salmonella monovalent H : m, t
IPA
01
01
0
07
Sérum agglutinants anti-Salmonella monovalent O : 6 ; 8
IPA
01
0
01
08
Suspension antigénique Widal TO Bulk1
IPA
01
01
0
09
Suspension antigénique Widal TO Bulk2
IPA
01
01
0
10
Suspension antigénique Widal TH Bulk1
IPA
01
01
0
11
Suspension antigénique Widal TH Bulk2
IPA
01
01
0
12
Suspension antigénique Widal AH Bulk1
IPA
02
02
0
13
Suspension antigénique Widal AH Bulk2
IPA
02
02
0
14
Suspension antigénique Widal AO Bulk1
IPA
01
01
0
15
Suspension antigénique Widal AO Bulk2
IPA
01
01
0
16
Suspension antigénique Widal BH Bulk1
IPA
01
0
01
17
Suspension antigénique Widal BH Bulk2
IPA
01
01
0
18
Suspension antigénique Widal BO Bulk1
IPA
02
01
01
19
Suspension antigénique Widal BO Bulk2
IPA
02
02
0
Total 2008
23
18
05
Total 2007
10
Statistiques 2007
+56%
5. Produits contrôlés en vue d’un enregistrement (Obtention d’une AMM)
Désignation
Producteur
Lots
Nbre
01
Vaccin pneumococcique conjugué adsorbé à 7 valences
(Prevnar)
Wyeth
01
02
Vaccin DTCOQ-Hib 1 dose
SII
01
03
Vaccin hépatite B DNAr pédiatrique 1 dose sans thiomersal
SII
01
04
Vaccin hépatite B DNAr pédiatrique 1 dose sans thiomersal
(Revac)
Baharat biotech
01
05
Sérum antitétanique 1500UI
SII
01
06
Vaccin DTCOQ 1 dose
SII
01
07
Vaccin DT pédiatrique 1 dose
SII
01
08
Vaccin Td adultes 1 dose
SII
01
09
Vaccin Rougeole-Rubéole RR 10 doses
SII
01
10
Vaccin Rougeole-Oreillons-Rubéole ROR 1 dose
SII
01
11
Vaccin Rougeole-Oreillons-Rubéole ROR 10 doses
SII
01
12
Vaccin rabique Rabivax 1 dose
SII
01
13
Vaccin DTCOQ-HIB 1 dose
SII
01
Total 2008
13
Total 2007
00
Statistiques/2007
-
6. Produits expertisés pour cause de rupture de la chaine du froid
SEMEP = Service d’épidemiologie et de médecine préventive.
EPSP
= Établissement public de santé de proximité.
Échantillons envoyés par les structures susmentionnés pour expertise en cas de
rupture de la chaine du froid.
Désignation
Produits
Demandeur
Nbre
01
02 vaccins
EPSP-SEMEP de Souk-Ahras
02
02
02 vaccins
EPSP-SEMEP de Draa-Ben-Khedda
02
03
02 vaccins
EPSP-SEMEP de Boucha ouï /Cheraga
02
04
03 sérums
EPSP-SEMEP de Bousaada
02
05
03 vaccins
EPSP-SEMEP de Ouled Yaich /Blida 1ère fois
03
06
04 vaccins
EPSP-SEMEP de Ouled Yaich /Blida 2ère fois
04
07
08 vaccins et 1 sérum
EPSP-SEMEP de Bejaia
09
08
02 vaccins
EPSP-SEMEP de Baraki
02
09
10 vaccins et 3 sérums
EPSP-SEMEP de Tamlouka/Guelma
13
Total 2008
39
Total 2007
31
Statistiques/2007
+20.6%
II. Produits Pharmaceutiques
Désignation
Lot
Producteur
Nbre
C
NC
01
Eau Purifiée (Pureté)
Somedial
173
0
02
Alcool Iodé (Activité)
Saidal-el-harrach
01
01
0
Total 2008
174
01
0
III. Milieux de culture déshydraté :
Désignation
Analyse demande
Produits
Demandeur
Nbre
01
Gelose Hektoen
Test microbiologique
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
02
Gelose Nutritive
Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
03
Gelose Cled
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
04
Gelose Muller Hinton
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
05
Gelose Chapman
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
06
Gelose TSI entube
incline
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
07
Gelose Citrate de
simmons
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
08
Gelose Sabouraud
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
09
L’eau Physilogique
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
10
Milieu de Loweinten
jensen
Test Physico-chimie
Laboratoire DIMED
Azazga
01
Total 2008
10
Produits expertises : Contrôle microbiologique des Produits Pharmaceutique
Désignation
Lot
Demandeur
Nbre
C
NC
Pureté
01
Inverter (4mg)
Saidal-el-harrach
01
0
01
02
Zanitra plus (gélules)
Saidal-Biotic Gué de Constatine
06
0
06
03
Doliprane (200mg)
Biopharm
10
10
0
04
Sedacor solution buvable
Biopharm
01
01
0
Activité
05
Divosan plus
01
01
0
06
Divosan QC
01
01
0
07
Divodes FG
08
Gel Purell
01
01
0
01
01
0
Sarl Surgi-Tech Equipement
Physico-chimie
09
Gel Purell
Sarl Surgi-Tech Equipement
Total 2008
22
7. Vaccins et sérums de référence utilisés dans les contrôles
Désignation
Producteur
Nbre
Lot
Titre
01
/
140UI/Amp
SIIL-1/96
270UI/FL
Vaccins de référence
ère
01
Anatoxine diphtérique adsorbée
1
02
Anatoxine diphtérique adsorbée lyo
SII
09
03
Anatoxine diphtérique (Verocell)
Biofarma
02
04
Anatoxine diphtérique (Verocell)
Biofarma
01
ADS-86F
50UI/ml
05
Anatoxine diphtérique (Floculation)
SII
01
/
900LF/FL
01
/
250UI/Amp
ère
réf Europ
220UI/ml
06
Anatoxine tétanique adsorbée
1
07
Anatoxine tétanique
Biofarma
01
/
220UI/ml
08
Anatoxine tétanique adsorbée lyo
SII
11
T-1/96-A
210UI/FL
09
Vaccin Bordetella pertussis lyo
SII
04
01/04(1)
130UI/FL
10
SII
01
01/04(2)
115UI/FL
11
SII
01
01/04(3)
110UI/FL
12
Vaccin hépatite B (Test in vitro)
SII
05
SE50519-A
37μg/ml
13
Vaccin BCG
SII
16
PS002
2.0mg*
14
Vaccin rougeole lyo
SII
14
ME1/2004
3.580DICC50/0.5ml
04
ADS1/2004
1200UI/ml
lyo
réf Europ
Sérums de références
01
Antitoxines diphtériques (Floculation)
SII
02
Antitoxines diphtériques
Biofarma
01
86F
50UI/ml
03
Antitoxines tétaniques (in vivo)
SII
01
1/06
10UI/ml
04
Antitoxines tétaniques
Biofarma
01
ATS-8417
40UI/ml
05
Antitoxines tétaniques (Floculation)
SII
04
ATS -1/04F
500UI/ml
06
Antitoxines tétaniques Std national
Inde
État de l’Inde
01
TAT-1/06
900UI/FL
Toxines de référence
01
Toxine tétanique
Biofarma
02
0384
50LF/ml
02
Toxine tétanique (Cobayes)
Biocine
03
1762
DMM=150000/ml
03
Toxine diphtérique (Verocell)
Biofarma
02
0584
150LF/ml
04
Toxine diphtérique (Cobayes)
Biocine
06
08
DMM=4000/ml
8. État de l’échantillothéque (+4°C)
Désignation
Producteur
Nbre de lots
SII
Sanofi Pasteur
Sanofi Pasteur
SII
Sanofi Pasteur
GSK
SII
BB-NCIPD
Sanofi Pasteur
Baharat biotech
Sanofi Pasteur
Heberbiotec
Shantha biotech
SII
Biofarma , Sanofi Pasteur
Sanofi Pasteur
14
08
02
10 , 11
02
02
10
02
11
11
00
19
04
11
09 , 03
02
Vaccins importés
01
02
03
04
06
07
08
09
10
11
12
13
14
15
16
17
Vaccin DTCOQ
Vaccin DTCOQ-Hib (TETRACT-Hib)
Vaccin Hib (Act-Hib)
Vaccin DT, Td
Vaccin Meningo A+C
Vaccin Meningo ACWY
Vaccin BCG
Vaccin BCG
Vaccin rabique culture cellulaire (Verorab)
Vaccin rabique culture cellulaire (Indirab)
Vaccin grippal vaxigrip
Vaccin hépatite B pédiatriques
Vaccin hépatite B pédiatriques
Vaccin rougeoleux
Vaccin polio oral
Vaccin fiévre jaune Amaril
Sérums importés
01
02
03
04
Sérum antitétanique
Sérum antirabique
Sérum antiscorpionique
Sérum antidiphtérique
SII
Institut Butantan
Vacsera
Institut of immunology
11
07
04
01
Vaccins IPA
01
02
03
04
05
Vaccin rabique souriceaux á usage humain
Vaccin rabique á usage vétérinaire
Solvant eau ppi
Vaccin claveleux á usage vétérinaire
Solvant claveleux
IPA
IPA
IPA
IPA
IPA
74
04
86
13
35
IPA
IPA
IPA
11
28
04
BB-NCIPD
IPA-Medion-DC
04
20
Sérums IPA
01
02
03
01
02
Sérum antirabique
Sérum antivipérin
Produit de diagnostic
Tuberculine
Sérums de groupage ABO-Rh
Produits thérapeutiques
01
Extraits allergéniques
Stallergénes
05
IPA
IPA
IPA
25
03
07
Produits finis
01
02
03
Vaccin rabique souriceaux á usage humain
Vaccin rabique á usage vétérinaire
Sérums de groupage ABO-Rh
Bilan total de l’activité du laboratoire de contrôle qualité
En ce qui concerne le contrôle qualité des produits biologiques
Nombre de lots
Produits biologiques
2007
284
2008
308
Statistiques 2008
+7.8% par rapport à
2007
Contrôle d’un nouveau vaccin inclus dans le PEV Algérien en 2008
Réception d’un nouveau vaccin utilisé contre l’haemophilus influenzae type B
responsable de méningites purulentes et d’autres infections graves souvent mortelles
chez les enfants de moins de 5 ans.
La valence Hib, polyoside de l’haemophilus influenzae type B a été inclus dans le
programme élargi de vaccination (PEV) en Algérie en Août 2008 sous forme d’une
association avec le DTCOQ pour donner le vaccin associé DTCOQ-Hib.
Il est à noter que si la valence coqueluche pose problème et que par conséquent le
vaccin DTCOQ-Hib ne peut pas être utilisé, un vaccin monovalent Act-Hib lui est
substitué en ajoutant les valences D (Diphtérie) et T (Tétanos) dans le schéma vaccinal.
Donc le vaccin est disponible sous 02 formes.
1- Une forme associée
2- Une forme monovalente
1- Vaccin DTCOQ-Hib. Exemple (TETR-ActHib), vaccin associé, le vaccin DTCOQ
existait déjà seul dans le PEV.
2- Vaccin Hib. Exemple (Act-Hib), vaccin polyosidique monovalent haemophilus
inflenzae type B, vaccin Act-Hib activé à l’aide d’une protéine anatoxine tétanique
et conjugué à cette dernière pour augmenter son efficacité.
Grilles de contrôle internes au laboratoire
Mise en place de grilles de contrôle comportant tous les paramètres nécessaires pour un
contrôle en adéquation avec les normes de la pharmacopée Européenne et de l’OMS du
Vaccin Hib sous ces 2 formes précédemment citées.
POS (Procédure opératoire standardisés)
Procédure de contrôle
Les procédures suivantes ont été préparées.
- Toxicité spécifique de la valence coqueluche (Contrôle du vaccin DTCOQ).
- Détermination qualitative du thiomersal (conservateur antibactérien) dans les
vaccins.
- Recherche de l’activité du sérum antirabique équin par MNT (Test de neutralisation
sur souris).
- Recherche de l’activité du sérum antirabique équin par RFFIT (Test d’inhibition
rapide des foyers fluorescents).
- Métrologie des fioles.
Procédure annexe au contrôle d’activité des vaccins, sérums et produits de
diagnostic :
Vaccins et sérums de référence internationaux nécessaires au contrôle d’activité des
vaccins, sérums, produit thérapeutiques et produits de diagnostic.
Échantillonnage :
Mise à jour du tableau d’échantillonnage des produits biologiques qui s’explique par
l’ajout de 02 vaccins
Gestion des dossiers de contrôle :
Application de procédures permettant de mieux gérer la remise des résultats de contrôle
Bilans de contrôle périodiques :
Établissement de bilans périodiques des contrôles de lots des produits biologiques
Réceptions, libérations, non-conformités éventuelles et instances.
3- Production d’animaux de laboratoire :
But : Autonomie en animaux de laboratoire pour nos différents contrôles
- Production de souris blanches (NMRI)
: 6975
- Lapins
: 0045
- Cobayes
: 0220
- Souris OF1
: 4664
- Souris Balbc
: 1063
III. PRODUCTION DES MILIEUX DE CULTURE :
La majorité des milieux de culture, des tampons ainsi que l’eau distillée sont produits
au sein du laboratoire pour les besoins du laboratoire, afin de contrôler la stérilité et
la fertilité des milieux.
Milieux
Qualité (litre)
Gelose Neomycine
08
Gelose Nystatine
15
Milieu B.T
63
Milieu T.G
57
Gélose Chapman
Tampon Nystatine
20
Tampon Néomycine
29
Milieu PPLT
18
Milieu Pseudomonas
10
Milieu T.S.A
27
Milieu Mac conkey
10
Milieu B.C.P
11
Milieu S.S
14
Eau physiologique
25
Eau Distillée
52
Milieu Lugol
08
Thiosulfate sodium
16
Alcool Iodé
10
Milieux T.S.E
22
TOTAL
415L
IV. SOUCHOTHEQUE
Souches bactériennes et fongiques de référence disponibles:
SOUCHOTHEQUE :
Souches bactériennes et fongiques de référence disponibles:
- Mycoplasma pneumonia
CIP 103766T
- Bordetella bronchisepticum
CIP 53-157
- Salmonella enterica
CIP 60-62T
- Bacillus stearothermophilus
CIP 52-81
- Klebsiella pneumoniae
CIP 53-153
- Absidia corymibifera
CIP 1129 - 75
- Penicillium cyclopium
CIP1231 - 80
- Cladosporium cladosporidides
CIP 1232-80
- Clostridium sporogenes
CIP 79-3
- Micrococcus luteus
CIP 53-160
- Staphylococcus épidermidis
CIP 68-21
- Staphylococcus aureus
ATCC 25923
ATCC 29373
ATCC 209 P
- E. Coli
ATCC 10536
- E. Coli
ATCC 10531
- E.Coli
ATCC 25922
- Pseudomonas aeruginosa
ATCC 27853
- Streptococcus pyogenes
ATCC 19615
- Streptococcus pneumoniae
ATCC 6303
- Bacillus subtilis
ATCC 6633
- Bacillus cereus
ATCC 10876
- Proteus mirabilis
ATCC 35659
- Saccharomyces cerevisiae
ATCC 2601
- Candida albicans
ATCC 24433
- Aspergillus niger
ATCC 16404
Remarques : CIP
: Collection de l'Institut Pasteur
ATCC : American type culture collection
- Souches de référence d'E.coli pour les sérums agglutinants :
(Référence : vaccins bactériens)
- E.coli 0127
B8
- E.coli 0125
B15
- E.coli 0114
K90
- E.coli 0124
B17
- E.coli 0126
B2
- E.coli 0142
K86
- E.coli 055
B5
- E.coli 0111
B4
- E.coli 0119
B14
- E.coli 086
B7
- E.coli 026
B6
- Souche de référence de Salmonella pour les sérums agglutinants :
(Référence : vaccins bactériens)
- Salmonella enteritidis
- Salmonella typhimurium
- Salmonella paratyphi A
- Salmonella paratyphi B
- Salmonella manhattan
-Salmonella Newington
- Salmonella London
- Salmonella Oranienburg
- Salmonelle aberdeen
- Salmonelle kentucky
- Salmonelle tennessee
- Salmonelle newport
- Salmonelle carran
: Collection de l'Institut Pasteur
Remarques : CIP
ATCC : American type culture collection
- Souche de référence de VIBRIO pour les sérums agglutinants
(Référence : vaccins bactériens :
- Vibrio OGAWA
- Vibrio INABA.
Plusieurs mémoires fin d’études ont été élaboré par des étudiants :
• Encadrement des stagiaires : Melle MROUF Asma et Mr DAHAK Mohamed
Sofiane ; en vie de la réalisation d’un mémoire de fin d’études pour l’obtention du
diplôme d’Ingénieur d’état en Contrôle de qualité U.S.T.H.B portant sur le thème :
« Contrôle microbiologique (Pureté, activité) de la Pommade Mycocide suivi
du contrôle d’efficacités des milieux de culture utilisés ».
• Encadrement des stagiaires : Mr MOKRANI Mehdi, Mr MEZIANE Riad
et Mr ABDELLAHI Mohamed ; en vie de la préparation d’un mémoire de licence
(Microbiologie fondamentale et appliquée), entrant application avec le système
L.M.D U.S.T.U.B. portant sur le thème :
« Contrôle microbiologique de l’eau purifiée destinée à la production
pharmaceutique ».
• Encadrement de Melle BENKRID Said ; Ingénieur d’état en Génie Biologique pour
un stage pratique en microbiologie.
• Encadrement des stagiaires : Melle MROUF Hanane et Melle BENKHENNOUF
Amel ; en vie de la réalisation d’un mémoire de fin d’études pour l’obtention
du diplôme d’Ingénieur d’état en Contrôle de qualité U.S.T.H.B portant sur le
thème :
« Etude d’activité bactericide et fongicide des différents produits d’eau Javel
avec validité + stabilité : Eau de Javel
→ Erad
Eau de Javel
→ Bref
Eau de Javel
→ La Croix
• Encadrement de Melle BOUTELBA Imène pour un stage pratique afin de finaliser
sa thèse de fin d’études en vue de la préparation du diplôme d’ingénieur d’état
en Agronomie.
• Encadrement des stagiaires : Melle Hammodi Fethia et Melle Oumaza Hadjer ; en
vue de la réalisation d’un mémoire de fin d’études pour l’obtention du diplôme
Technicien supérieurs en industrie Agro-Alimentaire option contrôle de qualité
portant sur le thème :
« Etude comparative de la qualité physico –chimique entre la Gelée Royale et
la GeléeRoyale importée ».
• Encadrement des stagiaires : Melle Issiiakhem Nawel et Melle Smaani Hayat ; en vue
de la réalisation d’un mémoire de fin d’études pour l’obtention du diplôme
d’Ingénieur d’état en Contrôle de qualité U.S.T.H.B
• Portant sur le thème : « Contrôle de qualité des vaccin trivalent Anti
poliomyelitique oral TOPV ».
• Encadrement des stagiaires : Melle HANIFI Hassina, Mr BENYAHIA Nabil
et GUEMMOUR Insaf ; en vue de la réalisation d’un mémoire de fin d’études pour
L’obtention du diplôme d’Ingénieur d’état en Contrôle de qualité U.S.T.H.B portant
sur le thème :
« Contrôle d’activité des sérums de Groupage »
Activités des laboratoires
de production
208 Laboratoire de Production
Laboratoire de Production des Animaux de Laboratoire
Chef de Laboratoire : Nacéra TOUARIGHT (Docteur Vétérinaire, chargée de recherche)
Intérim depuis août : Mourad ISSAD (D.M.V.)
Depuis août 2008, date de départ du Dr TOUARIGT appelée à une autre fonction.
L’activité de production :
¾ Les souris : pour l’année 2008 nous avons enregistré une production de 4898
souris dont 2451 ont été vendu et 2394 ont été répartis dans les différents
laboratoires comme suit :
Service de parasitologie
Laboratoire des vaccins bactériens
190 souris
1120 souris
Laboratoire de recherche sur les venins
894 souris
Laboratoire des sérums thérapeutiques
190 souris
¾ Les rats : pour l’année 2008, 2368 rats ont été produit, dont 1776 ont été destinés
à la vente et 472 pour les différents laboratoires :
416 rats
56 rats
¾ Les lapins : pour l’année 2008, la production de lapins s’élève à XXX unité, dont
244 destinés cette année, pour la consommation interne uniquement :
122 lapins
28 lapins
Laboratoire des vaccins bactériens
70 lapins
Laboratoire rage production 1
10 lapins
Laboratoire contrôle qualité
06 lapins
Annexe de sidi fredj
04 lapins
Service d’immunologie
04 lapins
Laboratoire de Production 209
Laboratoire des Milieux de Culture
Chef de Laboratoire par intérim : Mohamed BENABDELKADER (Ingénieur en
Biotechnologies)
Au cours de l’exercice 2008, des études de mise au point et de développement d’une
gamme importante de milieux de culture destinées au laboratoire de contrôle qualité et
de diagnostic médicale, des suppléments et des additifs ont fait l’objet de travaux
d’évaluation et pour certains la production à l’échelle interne est assurée depuis plus
d’une année en attendant la diffusion des moyens adéquats pour entamer l’étape
industrielle. Plus de 390 produits différents sont fabriqués : milieux de culture hydratés,
déshydratés, d’additifs, suppléments sélectifs, colorants et réactifs annexes,
conditionnés en flacons, tubes, ampoules, flacons compte-gouttes, boites des
déshydratés et disques imprégnés.
Un contrôle de stérilité et de qualité est réalisé sur 2403 lots de produits qui sont
distribués par la direction commerciale à l’échelle nationale à tous les secteurs
sanitaires, CHU, laboratoires privés ainsi qu’aux laboratoires internes des différentes
annexes de l’Institut Pasteur d’Algérie.
Le Bilan de la production au cours du deuxième semestre de l’année 2008 a connu un
très important redressement par rapport au premier semestre de la même année.
Ce qui à permit d’enregistrer un totale de vente en milieux de culture par la comptabilité
commercial équivalent a 179.756.539,21DA, Cette augmentation en production des
milieux de culture est le résultat de la remise en marche et réparation de la répartisseuse
sertisseuse des flacons sirops. La vétusté de cet équipement dont l’acquisition datte des
années 80, était la cause principale de la baisse des bilans enregistrées à la fin de
l’année 2007 et début 2008, accentuées par les perturbations d’approvisionnement en
matière d’œuvres et produits chimiques enregistrés ces deux dernières années.
I. ACTIVITES DE PRODUCTION
1. Unité de production
a. Milieux hydratés prés a l’emploie, supplément sélectif , additifs , colorants et réactifs :
Durant l’année 2008, le volume de production des milieux de culture et réactifs de
diagnostic s’est élevé à 157 400 litres, tous milieux et réactifs confondus. La répartition
par type de conditionnement est rapportée dans le tableau n°1.
Tableau 1 : production par type de conditionnement
Type de conditionnement
Volume en litres
Quantité / unité
Tubes à vis
Tubes anaérobies
Tubes de conservation
42 215
24
55
2 446 000
8 000
17 800
Flacons perfusion 50 ml
Flacons sirops
Flacons compte – goutte
480
27 324
16 200
70 100
320
14 200
140 000
41 100
316 500
17 000
26
410
265
12 000
80 000
25 000
Ampoules 2 ml
Ampoules 5 ml
Ampoules 10 ml
Ce laboratoire assure aussi la préparation et pesé des solvants conditionnés par l’unité
pharmaceutique, Solvant à usage humain, solvant anticlaveleux en assurant l’étape de la
stérilisation.
Production de L’additif d’émulsion de jaune d’œuf au tellurite de potassium :
Les résultats très encourageants et même satisfaisants de mise au point
et développement de ce type de supplément et additifs nous à permit à cours terme
d’assurer localement (fabrication IPA) la production à l’échelle pilot de supplément du
milieu Baird Parker qui à fait l’objet d’importation extérieure depuis plusieurs années
afin de couvrir les besoins importants des différents laboratoires de diagnostic et
contrôle qualité de L’IPA et au territoire national.
Concernant l’étape industrielle, sa faisabilité est en cours d’étude vu l’investissement
que sa demande, que se soit en équipements (la chaîne de production) ou bien en
formation du personnel exécutant.
Désignation du produit
Quantité produite au cours de
l’année 2008 à la demande.
Présentation
Additif du milieu Baird
Parker
1600
Flacon perfusion
de 20ml
b- Milieux déshydratés et réactifs en disques :
1) Production des milieux de culture déshydratés :
La production manuelle des milieux et bases déshydratés au cours de l’année 2008
a touché 83 produits différents, et elle est représentée dans le tableau n°2.
Tableau n°2 : Production des milieux déshydratés au cours de l’an 2008 :
Quantité
Milieux de culture
4803
Bases déshydratés
427
Total
Présentation
Boite de 250 g
5230
2) Production des disques imprégnés : Elle est représentée dans le tableau n°3.
Tableau n°3 : Production des réactifs conditionnés en étuis au cours de l’année 2008 :
Présentation
Nombre d’Etuis (30 Disques)
Disques ONPG
Etuis de 30 disques
3286
Disques Sélénite de sodium
Etuis de 50 disques
9372
Total
12658
2. L’unité de conditionnement assure
L’étiquetage manuel et la mise en boîte des milieux en flacons ; en tubes à vis et des
réactifs en ampoules et comptes gouttes ;
Conditionnement des produits en fardeaux par la fardeleuse.
L’exécution des commandes émanant des différents laboratoires d’analyse de
l’Institut Pasteur d’Algérie et la livraison des produits conditionnés vers la Direction
commerciale.
II. ACTIVITES DE CONTROLE
Le laboratoire procède au contrôle de stérilité et de qualité des lots selon la répartition
indiquée au tableau 4.
Tableau n°4 : Bilan d’activité du laboratoire de contrôle des produits au cours de l’année
2008.
Nombre de lots contrôlés
Résultats et observations
Mois
Flacon
Tube
Amp
FCG
Totale
Janvier
087
67
07
04
165
01 milieu non conforme
Février
113
81
02
02
198
05 milieux non conformes
Mars
120
96
19
06
241
Avril
118
105
09
03
235
Mai
133
112
14
07
266
Juin
104
96
24
05
229
Juillet
094
79
03
03
178
Août
105
59
12
02
178
Septembre
081
82
15
08
186
Octobre
086
68
11
04
169
02milieux non conformes
Novembre
107
73
06
03
189
Décembre
079
81
04
04
168
Nbre total de lots contrôles
2403
Nbre total de lots non conformes
22 (0.91%)
Il ressort donc que, 0,91% des lots fabriqués sont de mauvaise qualité dont plus de
98% sont contaminés par le contact de l’air suite au mauvais sellage de la machine
de répartition et sertissage des flacons sirops. Les germes retrouvés font apparaître
une prédominance de Bacillus.
III. ACTIVITES DE RECHERCHE - DEVELOPPEMENT
Plusieurs sujets de recherche en production sont objets d’études au niveau du
laboratoire de contrôle qualité et développement des milieux de culture, certains ont
vu la lumière telle que la production de L’additif d’émulsion de jaune d’œuf au tellurite
de potassium, supplément du milieu Baird Parker, d’autres restent dépendants de la
disponibilité des réactifs spécifiques et des différents moyens en équipements
nécessaires à leurs réalisations, ces projets touchent les domaines suivants :
Mise au point d’un milieu chromogène pour l’identification présomptive des
Salmonelles :
Ce Milieu permet l’identification rapide des bactéries en se basant sur la pigmentation
spécifique de chaque espèce.
Le résultat obtenus sont très satisfaisants mais nécessitent encore une amélioration
de la qualité du milieu et l’étude est toujours en cours.
Evaluation d’un nouveau milieu chromogène pour l’isolement et l’identification
présomptive des Entérobactéries à partir des coprocultures :
Le but de ce travail est d’évaluer un nouveau milieu chromogène prêt à l’emploi en le
comparant à un milieu usuel utilisé au niveau des laboratoires d’analyses médicales.
Suite aux différents tests de caractérisation morphologiques et biochimiques nous
avons pu identifier 116 souches différentes à partir de 54 prélèvements de selles.
Les résultats obtenus ont montré une bonne sensibilité et une fiabilité de notre milieu
chromogène testé par rapport au milieu classique (GH) étant donné que nous avons
pu isoler tous les germes pathogènes et non pathogènes existant dans les
prélèvements et ces résultats ont concordés complètement avec ceux obtenus par les
laboratoires de référence.
Evaluation d’un milieu chromogène pour l’identification
Entérobactéries à partir des Aliments :
présomptive des
Notre étude avait pour but d’évaluer un nouveau milieu chromogène prêt à l’emploi
d’une part pour familiariser son utilisation par les biologistes des laboratoires de
bactériologie alimentaire et d’autre part pour pallier aux inconvénients des milieux
classiques.
Nous avons pu identifier 165 souches isolées à partir de 92 prélèvements
alimentaires isolés sur le milieu chromogène et sur milieu Hektoen.
Les résultats obtenus étaient très satisfaisants puisque ce milieu a montré une bonne
croissance, une bonne distinction des genres par apparition de couleurs spécifiques
et un bon isolement qui facilite le dénombrement des colonies. De même que les
résultats de l’identification présomptive nous ont permis une bonne orientation vers
le genre à identifier, ce qui a été confirmé par la galerie classique ou la galerie API 20
E.
En outre, l’isolement des bactéries pathogènes, notamment le genre Salmonella qui
avait une couleur mauve bien spécifique.
L’avantage qu’a montré notre milieu, notamment sa grande spécificité par rapport au
milieu Hektoen nous permet de recommander son utilisation dans les différents
laboratoires d’Analyses alimentaires afin de permettre un diagnostic rapide.
Le projet des milieux Chromogènes à pour objectif la production à l’échelle
industrielle de toute la gamme destinée au diagnostic courant, afin de diminuer leurs
importations.
Production et commercialisation de l’étalon SLO afin de réduire l’importation de
ce réactif nécessaire pour le dosage des ASLO.
Notre travail a consisté d’une part à la production de la Streptolysine O (SLO) à partir
de Streptococcus pyogènes (souche de référence) sur un milieu de culture spécifique,
il s’agit du milieu A 2, ce dernier a été choisie pour son bon rendement en SLO
comparé à d’autre milieux testes le titrage de la SLO produite était de 25 UI ce dernier
est très satisfaisant vu qu’il se rapproche de celui commercialisé (20 UI).
Et d’autre part on a tenu à vérifier la qualité de la SLO produite par dosage de
l’antistreptolysine O (ASLO) sur 340 sérums de malades par la technique
d’hemagglutination (macrométhode) qui est une méthode sérologique la mieux
normalisée et a été la première à être élaborée pour la mesure des anticorps dirigés
contre le Streptococcus pyogènes.
Les titres obtenus ont été comparés avec les titres préétablis par la technique de
nephélometrie sur BNA (automate) au niveau du service d’Immunologie IPA.
D’après les résultats de comparaison entre les deux techniques nous constatons que
sur les 340 prélèvements traités nous avons obtenus 97% de concordance ; ces
résultats sont très satisfaisants vu qu’ils confirment le bon titre de notre ASLO ainsi
que sa bonne qualité.
Des sujets de mémoires fonts l’objet d’études afin de continuer la validation de
l’étalon produit sur un échantillon beaucoup plus important et d’essayer de
miniaturiser la technique d’hemagglutination afin de la rendre plus pratique pour
l’utilisateur et éventuellement permettre sa future commercialisation.
Développement des galeries miniaturisées d’identification des principales
familles bactériennes responsables de pathologie humaine :
Etude qui vise à mettre sur le marché des galeries d’identification à l’usage des
laboratoires d’analyses médicales et de diagnostic alimentaire.
Des résultats satisfaisants ont été obtenus avec les galeries ENTERO I et ENTERO II
pour l’identification des Entérobactéries, ainsi que la galerie d’identification des BGN
non Entérobactéries et des Staphylocoques et Streptocoques, a l’exception de
quelques caractères qui sont en cours d’optimisation. L’étude de validation sur un
nombre important de souches récupérées chez des laboratoires internes de L’IPA et
d’autres externes est en cours de réalisation.
Mise au point et validation d’une galerie en disques imprégnés pour
l’identification des entérobactéries :
Nous avons utilisé des disques de papier buvard imprégnés d’un milieu complet qu’on
a préparé au préalable (milieu qui permet à la fois la croissance des germes et la
révélation du caractère biochimique recherché et qui diffuse du disque vers la
suspension bactérienne)
Pour la validation, 421 souches appartenant à la famille des Enterobacteriaceae
isolées à partir de différents prélèvements biologiques ont permis l’étude comparative
de la galerie des disques imprégnés avec la galerie classique ce qui a donné des
résultats satisfaisants pour l’ensemble des caractères (le pourcentage moyen de
concordance est de 97.82%) avec un pourcentage de concordance de 100% pour
l’ONPG, Urée, Glu, Man, Ino, Rha, Ara.
Et un pourcentage de concordance qui varie entre 91.35% et 99.04% pour les
caractères TDA, Mel, Cit, Ind, VP, H2S, Sac.
D’après l’analyse de ces donnés , on remarque que le pourcentage de concordance
est supérieur à 90% et donc on constate que l’étude de la performance de cette
galerie de disques à l’égard de la galerie classique a donné une très bonne
concordance ainsi qu’une excellente corrélation avec le tableau conventionnel, ce qui
témoigne de la fiabilité de cette technique miniaturisée et la possibilité de son
utilisation pour l’identification de tous les germes appartenant à la famille des
entérobactéries.
Mise au point et validation d’une galerie en disques imprégnés pour
l’identification des Pseudomonadaceae :
Le même principe est utilisé pour la validation de cette galerie et nous avons utilisé
324 souches appartenant à la famille des Pseudomonadaceae isolées à partir de
différents prélèvements biologiques.
D’après l’étude comparative de la galerie des disques imprégnés avec la galerie
classique nous avons déduit que les milieux ont donné des résultats satisfaisants
pour l’ensemble de caractères avec un pourcentage de concordance de 100% Pour
les caractères ONPG, Urée, ADH, Cit, NR, et un pourcentage qui varie entre 86.45%
et 98.31% pour les caractères Esc et les sucres.
Le pourcentage moyen de concordance de cette galerie est de 97.71%.
L’intérêt de ce travail est la production dans le futur de ces deux galeries
miniaturisées en disques imprégnés pour l’identification des entérobactéries et des
Pseudomonadaceae, sous forme de kit de plaquettes avec cupules contenant
chacune deux disques imprégnés de milieu révélateur du caractère recherché. Muni
d’un catalogue analytique. Ces galeries permettent comme avantage par rapport à la
galerie classique de minimiser le risque de contamination ; gagner du temps en
manipulation et d’économiser en frais de production.
Des travaux de recherche et d’application sont en cours de réalisation dans le cadre
d’installation des BPF avec une assurance qualité des différents produits fabriqués
par le laboratoire, des études de stabilité physico – chimique, de fertilité et de stérilité
sont soumis aux échantillons prélevés des produits après stockage (absence de
chambre froide a +8°C). Le but de cette étude vise à rattraper dans le cas du possible
et selon les moyens diffusés, les anomalies enregistrées au cours de la production
suite à la vétusté de la majorité des équipements du parc de machines actuellement
en exploitation et de prévoir dans le future proche la conception des nouvelles
installations attendues pour réalisation au cours de l’année 2009 avec les nouvelles
machines de répartition et d’étiquetage qui nous permettra de combler les principaux
inconvénients afin d’assurer une production suivants les normes actuelles de
fabrication des milieux de culture prés à l’emploie : à savoir le souci de contamination
des milieux répartis en flacon sirops et aussi l’étiquetage conforme des produits finies
destinés au différents laboratoires de contrôle qualité bactériologique et de diagnostic
médical à l’échelle nationale.
IV. ACTIVITE DE FORMATION
1. Formation dispensée dans le laboratoire
Nom et prénom
de l’étudiant
elle
M SAIDI SOUMIA
er
M CHERIFI SAID
Origine
Université
de Blida
Niveau
Sujet du mémoire
Encadrement
DES
Validation de la galerie des disques
imprégnés de substrats révélateurs
pour l’identification des
Pseudomonadaceae isolés à partir des
prélèvements
M
me
BELLACHE
SOUAD
2. Formation assurée au sein de L’IPA.
Participation de Mer M. BENABDELKADER au grand cours International de
Mycobactériologie Médicale et de formation aux techniques de laboratoire pour
le diagnostic de la tuberculose (CIMM 2008) qui s’est déroulé durant les mois octobre
/ novembre 2008 à L’Institut Pasteur d’Algérie.
Laboratoire de Mise en Forme Pharmaceutique
Chef de Laboratoire : Fatma-Zohra BEGHDADI née GHANASSI (Pr. INESSM)
INTRODUCTION :
Le Laboratoire pharmaceutique est un service intermédiaire entre tous les services de
production et le service commercial.
Ce Laboratoire comprend trois unités qui sont :
* Une unité de lyophilisation ;
* Une unité de répartition liquide ;
* Une unité de conditionnement.
Il assure :
- La répartition des produits actuellement fabriqués par l’IPA ainsi que tous les produits
acquis sous formes de vrac (bulks) ;
- La répartition et la lyophilisation des vaccins antirabiques (à usage humain et
vétérinaire) ainsi que le vaccin anticlaveleux ;
- Préparation et répartition des solvants, phénolé et claveleux ainsi que le solvant à
usage humain ;
- La filtration stérilisante de certains réactifs ;
- Le conditionnement de tous les produits répartis.
I. ACTIVITES DE PRODUCTION
1. Descriptif général du processus de production utilisé :
Les produits sont reçus dans des allonges, soit stériles (pour les produits finis stériles
non autoclavables), soit non stériles ; dans ce cas, on effectue au sein du service une
filtration stérilisante du produit avant de procéder à la répartition.
Les produits stériles sont répartis selon le format voulu dans des ampoules à col
fermé ou dans des flacons stérilisés
A- Lyophilisation :
Au cours de l’année 2008, il a été procédé à 46 séances de lyophilisation sur le
lyophilisateur types SMIR (au niveau de l’annexe du Ruisseau) et 11 séances de
lyophilisation de vaccin vétérinaire sur le lyophilisateur LYOMEGA ST 40(au niveau
de l’annexe de Kouba).
Ont été lyophilisées les quantités de vaccins suivants :
Nom du vaccin
Nombre de lots
Quantités
Vaccin antirabique
à usage humain
46 lots
831700 fl
Vaccin antirabique à usage
vétérinaire
04 lots
30949 fl
Vaccin claveleux
09 lots
79573 fl de 100 doses
01 lot de vaccin antirabique à usage médical à été décongelé en cours de
lyophilisation.
B- Répartition liquide :
Cette unité assure la répartition des vaccins, sérums, réactifs et solvants en
ampoules et en flacons.
La répartition par unité de conditionnement et par produit est donnée dans les
tableaux suivants :
Ampoules de 10ml
Désignation des produits
Volume en litre
Nombre d’unité
551 litres
55990 amp
Sérum antirabique
115 litres
10595 amp
Sérum de cheval
6 litres
560 amp
Sérum antiviperin
72 litres
7388 amp
Sang de mouton
54 litres
5000 amp
Sang de cheval
180 litres
14400 amp
Urée indole
215 litres
21000 amp
Télurite de potassium
45 litres
4000 amp
BLMT
10 litres
850 amp
Ampoules de 2ml
Solvant à usage humain
Alun de fer
Volume en litre
Nombre d’unités
1745 litres
872000 amp
28 litres
113500 amp
Ampoules de 5ml
Tergitol 7 AGAR
Volume en litre
Nombre d’unités
27 litres
5000 amp
Hektoen
230 litres
45000 amp
Sulfite de sodium
105 litres
21000 amp
Témoin
20 litres
3600 amp
Lysine
20 litres
3600 amp
Ornithine
20 litres
3600 amp
Arginine
20 litres
3600 amp
Tween 80
26 litres
5000 amp
Adomitol
2 litres
350 amp
40 litres
3700 amp
Cellebiose
2 litres
350 amp
Sorbitol
5 litres
900 amp
2 litres 1/2
450 amp
Rhamnose
2 litres
350 amp
Galactose
3 litres
550 amp
Xylose
2 litres
350 amp
T.T.C tergitol
30 litres
5500 amp
T.T.C slanetz
35 litres
6500 amp
Glycérol
3 litres
550 amp
Salicine
5litres
900amp
2 litres 1/2
450amp
5 litres
950amp
Giolite cutoni
Millibiose
Rhamnose
Trehalose
Flacons de 50ml
Solvant anticlaveleux
Volume en litre
Nombre d’unité
860 litres
172000 fl
Suspension AO
40 litres
350 fl
Suspension AH
80 litres
750 fl
Suspension BH
40 litres
350 fl
Suspension BO
80 litres
750 fl
Suspension TO
40 litres
350 fl
Suspension TH
40 litres
350 fl
Enterovax
6 litres
130 fl
symptivac
5 litres
90 fl
Flacons de 5ml
Volumes en litre
Nombres d’unité
Sérum de groupage Anti A
200 litres
38000 fl
Sérum de groupage Anti B
200 litres
38000 fl
Sérum de groupage Anti A+B
200 litres
38000 fl
Sérum de groupage Anti D
200 litres
38000 fl
O.M.A
600ml
300 fl
O .M.B
600ml
300 fl
O : 6,8
400ml
300 fl
H:a
480ml
210 fl
H:b
250ml
218 fl
H:1
300ml
260 fl
250ml
250 fl
Hmt
Flacons de 20ml
Volumes en litre
Nombres d’unité
Jaune d’œuf
3 litres
200 fl
Solvant phénolé
10 litres
9000 fl
C- Conditionnement des produits finis :
Au cours de l’année 2008, l’unité conditionnement du laboratoire pharmaceutique a
procédé à la mise en boite des produits selon le tableau suivant :
Produit
Contenant
Vaccin antirabique à usage humain
48773 cof de 12 fl
Vaccin anticlaveleux fl de 100 doses
1064 cof de 100fl
3094 cof de 10 amp
Sérum antivipiren
505 cof de 10 amp
Sérums de groupage sanguin
Suspensions antigéniques de Felix et Widal.
43295 cof de 4fl
TO
TH
BO
AO
AH
BH
Sérum agglutinant anti- salmonelles polyvalent
OMA 01/2007
OMA 01/2008
OMB 01/2005
OMB 01/2006
sérum agglutinant monovalent
H:i
H:b
H:a
H:1
VI
H: g m
H:mt
H : gp
H : z 29
O:9
O :1,2
O :3,10,15
O : 1 ,3,19
O : 6. 7
O : 6. 7. 8
O : 8. 20
O : 11
O : 6. 8
708 boites
342 boites
582 boites
705 boites
348 boites
350 boites
150 boites de 1 fl
100 boites de 1 fl
080 boites de 1 fl
62 boites de 1fl
40 boites de 1fl
40 boites de 1fl
45 boites de 1 fl
52 boites de 1fl
20 boites de 1fl
40 boites de 1 fl
25 boites de 1 fl
25 boites de1 fl
62 boites de 1fl
30 boites de 1fl
05 boites de 1fl
20 boites de 1fl
32 boites de 1 fl
32 boites de 1fl
02 boites de 1 fl
02 boites de 1 fl
42 boites de 1 fl
Sérums agglutinants anti E coli
Sérum agglutinant E.coli trivalent I
Sérum agglutinant E.coli trivalent II
Sérum agglutinant E.coli trivalent III
Sérum agglutinant E.coli trivalent IV
38 boites de 1fl
41 boites de 1fl
36 boites de 1fl
36 boites de 1fl
Sérums agglutinant E.coli monovalent
O :127 B8
O :86 B7
09 boites de 1fl
08 boites de 1fl
O : 55 B5
O :26 B6
O :126 B16
O :119 B14
O :111B4
O :128B12
O : 124 B17
O :114 K90
O :125B15
O :142 k 86
13 boites de 1fl
08 boites de 1fl
08 boites de 1fl
08 boites de 1fl
13 boites de 1fl
10 boites de 1fl
09 boites de 1fl
02 boites de 1fl
08 boites de 1fl
05 boites de 1fl
SOLVANT ANTI-CLAVELEUX
SOLVANT PHENOLE
1201 cof de 100 fl
10 cof de 100 fl
Vaccin antigrippal de 10 doses
Vaccin antigrippal de 10 doses
N° Lot
Quantité
D 5825-2
29930 doses
Vaccin antigrippal de boite de 1
Vaccin antigrippal de 1 dose
N° Lot
Quantité
D 0665-1
157832 doses
D 0666-1
139000 doses
D 5760-1
215890 doses
D 5768 -1
67600 doses
D 0668-1
149142 doses
D 0743-1
50808 doses
D 0766-1
13950 doses
Total : 794222 doses
Formation dispensée hors du laboratoire :
Nom de l’enseignant
Lieu de
l’enseignement
Destinataires de
l’enseignement
Faculté de
Médecine
Etudiants de 3ème année
pharmacie
Cours théoriques de
pharmacie galénique
Résidents de 1ère, 2ème et
ème
année + DEMS de
3
pharmacie galénique
Conférences et planchages
Mme BEGHDADI née
F.Z. GHANASSI
Laboratoire des Sérums Thérapeutiques
Chef de service : Ahmed Chérif BENGUEDDA (Docteur Vétérinaire Spécialiste)
INTRODUCTION
Au cours de l’année 2008, les mêmes contraintes de 2007 ont négativement influé sur
les capacités de production du laboratoire tant du point de vue quantitatif que qualitatif.
Ceci nous a obligé à revoir à la baisse les prévisions affichées en début de saison
d’augmenter la production du laboratoire principalement en sérum antiscorpionique.
Ces contraintes ont fait l’objet de nombreux rapports et courriers adressés aux services
concernés et au plus haut niveau de l’autorité de tutelle. Les points soulevés ont portés
principalement sur :
La vétusté du matériel de production dont la majorité a été acquis au cours des
années 70 qui de plus est dans un état de dégradation très avancée ;
Le mauvais fonctionnement de la machine à répartir ce qui a entraîné des pertes
dépassant les 30% de notre production annuelle ;
L’état général du service tant du point de vue des locaux non conformes à des
productions pharmaceutiques ;
situation du personnel caractérisée par l’absence de recrutement dont l’un des
corollaires est la difficulté de définition des tâches et des responsabilités de chacun.
Malgré toutes ces contraintes, le service des Sérums Thérapeutiques a réussi, au prix de
lourds sacrifices de la part du personnel, à produire au cours de l’année 2008, 64.000
ampoules de sérum antiscorpionique, 12.000 ampoules de sérum antirabique et enfin
6.800 ampoules de sérum antivipérin. Ces chiffres montrent clairement que les objectifs
que nous ont fixé les membres du Comité de lutte contre les envenimations du Ministère
de la Santé ont été réalisés.
I. ACTIVITE DE PRODUCTION
1. Objectifs de production
Le laboratoire des sérums thérapeutiques produit :
• Le sérum antiscorpionique purifié (SAS) : produit à partir de venin d'Androctonus
australis Hector.
• Le sérum antivipérin purifié (SAV) : produit à partir des venins de la vipère à corne
(Cerastes cerastes) et de la vipère Lébétine (Vipera lebetina).
• Le sérum antirabique (SAR) dont le sérum brut est produit par le service des
vaccins et des sérums antirabiques.
2. Descriptif général du process
Les chevaux sélectionnés pour la production sont immunisés par injection de doses
croissantes d'antigènes préparés à partir de venins spécifiques.
Les chevaux sont ensuite ponctionnés et le sérum contenant les anticorps
antitoxiques est séparé par coagulation du sang.
Le sérum subit alors une série de traitements physiques et chimiques (purification) basée
sur :
1. Une double précipitation par des sels d'ammonium,
2. Un clivage des immunoglobulines par pepsination.
Les objectifs recherchés à travers cette purification du sérum sont doubles :
• Réduire les risques de sensibilisation induits par les immunoglobulines équines;
• Augmenter l'activité neutralisante du sérum.
Le produit obtenu en fin de purification est une solution de F(ab)'2 1 qui est répartie en
ampoules de 10ml, puis conditionnées soit en étuis individuels soit en coffrets
de 10 ampoules.
3. Programme et analyse de production
3.1- Objectifs définis en 2008
SAS
SAV
SAR
Total année
60.000
10.000
20.000
90.000
3.2- Quantités produites
a) Sérum antiscorpionique purifié
Lots libérés en 2008 :
Ampoules de SASp mises sur le marché :
Volume de SASp envoyé en répartition :
Pertes à la répartition :
Stock de SAS sous différentes formes :
21
49.000
545 litres
13,5%
80 l
b) Sérum antirabique purifié
3
Ampoules de SARp mises sur le marché :
5.500
Volume de SARp envoyé en répartition :
65 litres
15,5%
Stock de SAR sous différentes formes : environ 6.000 ampoules
c) Sérum antivipérin purifié
1
4
Ampoules de SAVp mises sur le marché :
9.500
Volume de SAVp envoyé en répartition :
102 litres
7%
Fragment de l'anticorps qui se lie à l'antigène
Récapitulation production 2008
SAS
SAV
SAR
Total année (ampoules)
49.000
9.500
5.500
64.000
4. Contrôle qualité
• Contrôles in process
Tout au long de la production divers contrôles (pH, teneur en protéines, teneur en
sulfates…) se font autant sur le sérum brut que sur le sérum en cours de purification.
• Contrôles internes du sérum purifié:
Activité neutralisante (séroneutralisation sur souris)
Stérilité (contrôles bactériologiques)
• Contrôles externe : ces contrôles sont réalisés par le laboratoire de contrôle de la
qualité de Kouba sur le sérum purifié réparti :
1. Contrôle physico-chimique :
Aspect
Protides totaux,
Teneur en NaCl,
Test du pH.
2. Contrôle de stérilité
3. Contrôle de Toxicité
5. Unité des sérums bruts
5.1. Production de sérum brut :
Effectif sas : 35 chevaux
Nombre de saignées :
Nombre d’immunisation :
Volume de sang collecté approx :
Volume de sérum brut :
23
25
2600 litres
1300 litres
Effectif sav : 05 chevaux
Nombre de saignée :
Nombre d’immunisation approx :
Volume collecté approx :
Volume de sérum brut approx :
014
020
500 litres
250 litres
5.2. Production pour milieux de culture :
Production sang de mouton approx : 0
Production sang de cheval approx :
Production sérum de cheval approx : 0
90 litres
210 lites
10 litres
Production sang pour autre service :
eco-epidemio parasitaire
Immunologie
Rage Kouba
LRDV
:
:
:
:
05 litres sang cheval
05 litres sang mouton
04 litres sérum cheval
02.5 litres sang mouton
5.3. Animaux de production :
Type de sérum
SAS
SAV
SAR
Chevaux en production
30
05
13
Chevaux en cours d’immunisation
4
0
0
Chevaux pour sang normal
04
Béliers
10
Brebis pour production embryons
30
Agneaux pour contrôle
25
En plus de l’entretien hygiénique et sanitaire (préventif et curatif) de l’effectif équin,
l’unité sérums bruts a pris en charge également l’effectif ovin depuis 2005.
6. Animaux venimeux
Pour les besoins de la production (collecte de venin), le service a reçu 15.900
scorpions de l’espèce Androctonus australis Hector responsable de la majorité des
cas d’envenimation scorpionique observés en Algérie. C’est donc le venin de cette
espèce qui est utilisé comme antigène pour la fabrication du sérum antiscorpionique
purifié de l’Institut Pasteur d’Algérie.
Le vivarium a été transféré à Dely Ibrahim qui a la charge de l’entretien des animaux
venimeux et de la récolte du venin.
Missions
Lieu
Participants
Objet
: NAAMA
: Dr A-C. BENGUEDDA, membres du comité
: Journée régionale sur l'envenimation scorpionique,
Lieu
Participants
Objet
: MOLSHEIM
: Dr A-C. BENGUEDDA
: Visite Usine Millipore et mise au point d’un protocole d’Ultrafiltration,
Lieu
Participants
Objet
: ANTONY
: Dr A-C. BENGUEDDA,
: Visite atelier d’Ultrafiltration.
Lieu
Participants
Objet
: TEHERAN
: Dr A-C. BENGUEDDA,
: Participation au 4ème Congrès du SRVP.
Laboratoire des Vaccins Bactériens
Chef de laboratoire : Fatiha GACEM (Biologiste spécialiste)
Le laboratoire Vaccins Bactériens est un laboratoire de production et de recherche.
La production concerne
02 vaccins à usage humain, 02 vaccins à usage vétérinaire et 51 produits biologiques de
diagnostic. Tous ces produits ont été mis au point au niveau du Laboratoire Vaccins
Bactériens.
La recherche quand à elle est active puisque nous comptons 08 projets dont 02 sont à
l’arrêt en attendant les locaux conformes, et chaque projet est à chaque fois finalisé par
la mise a point, la production et la commercialisation d’un ou de plusieurs produits
(vaccins ou produits biologiques de diagnostic).
Au laboratoire Vaccins Bactériens, l’année 2008, a été marquée par
La mise au point et la production du plasma de lapins par Monsieur Madadi
Mohamed Amine (projet initié en 2007 et finalisé en 2008).
Initiation du projet N°8 : l’étude de l’optimisation de la production du sérum
anti Closidium Chauvoei, bactérie anaérobie très stricte responsable de
maladie du charbon symptomatique chez les ovins et bovins.
la
1. VACCINS
1.1- VACCIN A USAGE HUMAIN
a. Vaccin typho- paraTyphoïdique A et B : T.A.B
Il s’agit d’un vaccin utilisé dans la lutte contre la maladie de la typhoïde. Il est
constitué d’une suspension de Salmonella typhi (750 000 bactéries/ml), Salmonella
paratyphi A (500 000 bactéries/ml) et de Salmonella paratyphi B (250 000
bactéries/ml) ; tuées par phénol et chauffage et diluées dans du soluté isotonique de
chlorure de sodium.
Ce vaccin est produit sur commande annuelle, conditionné dans des ampoules de
10ml et vendu par coffret de 10 ampoules.
En 2007, la commande annuelle a été arrêtée par le MDN.
b. Vaccin anti cholérique OGAWA-INABA
Il s’agit d’un vaccin utilisé dans la lutte contre la maladie du choléra. Il est constitué
d’une suspension de souches OGAWA et INABA (8 milliards de germes/ml) diluées
dans du soluté isotonique de chlorure de sodium.
Depuis 2006, nous n’avons pas eu de demande pour la production de ce vaccin.
1.2- VACCIN A USAGE VETERINAIRE
a. Vaccin anti charbon symptomatique : Symptivac
Il s’agit d’un vaccin utilisé dans les campagnes de vaccination contre la maladie du
charbon symptomatique des bovins et ovins. Il est constitué : d’anaculture et
d’anatoxine de Clostridium chauvoei (quantité suffisante pour obtenir chez l’animal de
contrôle 100% de protection après épreuve), d’aluminium sous forme d’hydroxyde et
de formaldéhyde.
La production a été arrêtée puisqu’on est en cours de la mise au point et la production
d’un vaccin bivalent anti charbon bactéridien-symptomatique demandé sur terrain.
En 2008, un lot a été produit comme échantillon demandé par les services de la
Santé Animale du Ministère de l’Agriculture pour le renouvellement de l’AMM
du vaccin Symptivac.
Lot N°
Quantité : Bulk
(en Litres)
Quantité de
flacons de 50ml
Nombres de doses
pour bovins
01/ 2008
05
90
1125
b. Vaccin anti entérotoxémie : ENTEROVAX
Il s‘agit d’un nouveau vaccin qui est utilisé pour la prévention contre l’entérotoxémie
des bovins, ovins, caprins et lapins. Il est constitué d’anaculture et d’anatoxines de
Clostridium perfringens type C et D, d’hydroxyde d’aluminium et de formaldéhyde.
Ces vaccins n’ont pas été produits vue que la commande établie par le Ministère de
l’Agriculture équivaux à 10 millions de doses et que ceci n’est possible qu’avec
l’acquisition d’un fermenteur semi industriel qui sera aussi utilisé pour la production
des autres vaccins du service.
En 2008, un lot a été produit comme échantillon demandé par les services de la
Santé Animale du Ministère de l’Agriculture pour le renouvellement de l’AMM du
vaccin Entérovax.
Lot N°
Quantité : Bulk
(en Litres)
Quantité de
flacons de 50ml
Nombres de doses
pour bovins
02/ 2008
06
110
2750
LE RENOUVELLEMENT DES AMM (AUTORISATION DE MISE SUR LE MARCHE)
DES VACCINS SYMPTIVAC ET ENTEROVAX EST EN COURS.
2. PRODUITS BIOLOGIQUES DE DIAGNOSTIC
Nous produisons 53 produits biologiques de diagnostic.
2.1- SUSPENSIONS ANTIGENIQUES
Il s’agit de suspensions de Salmonella typhi et Salmonella para typhi A et B qui sont
destinées au sérodiagnostic de WIDAL et FELIX.
- Pour l’antigène somatique : suspension TO, AO, BO.
- Pour l’antigène flagellaire : suspension TH, AH, BH.
Lot N°
Quantité Bulk
Quantité de flacons
de 50ml
TO
2008/ 01
40 L
750
TH
2008/ 02
40 L
750
2008/ 03
40 L
750
2008/07
40 L
750
2008/ 04
40 L
750
2008/09
40 L
750
BO
2008/ 08
40 L
750
BH
2008/ 06
40 L
750
8 Lots
320 L
6000
Suspensions Widal
AO
AH
Total
2.2- SERUMS AGGLUTINANTS :
Il s’agit de 46 sérums produits jusqu’à l’heure actuelle. Ils sont produits sur lapins qui
produisent des agglutinines de titre élevé.
Après répartition, les flacons sont conservés à -20°C au niveau du Service
Pharmaceutique et lorsqu’ils sont décongelés, une année de validation leur est
donnée.
La production des sérums est fonction des stocks existants au niveau du service
Commercial et Pharmaceutique. Les sérums produits sont les suivants :
- Sérums anti cholérique : 04
Monovalents : 02 : INABA et OGAWA
01 : O :139 (sur commande)
Polyvalent : 01 : INABA-OGAWA
- Sérums anti Escherichia coli : 16
Monovalents : 12 : O: 55 B5; O: 26 B6; O: 128 B12; O:125 B15; O: 86 B7; O: 119
B14; O:127 B8; O: 111 B4; O: 126 B16. O:114k90 O: 142 k86; O:142 B17
Trivalent : 04 : I (O111+O55+O)
II (O86+O119+O127)
III (O125+O126+O128)
IV (O114+O124+O142)
- Sérums anti Salmonelles : 27
Monovalents : 20
H:a; H:b; H:d; H: i; H:Z29; H:g,p; H:f,g; H;g,s,t; H:m,t; H:g,m.
O:4,5; O:1,2 O:9; O:1,3,19; O:3,10,15; O:6,7; O: 6,8.
O:11; O: 6,14,24; O: 8,20
Polyvalents : 06
H:G (g,m,f,p,s,t); H: 1 (1,2,5,6,7)
OMA; OMB. O: 6,7,8.
Vi
Les sérums qui ont été produits sont ceux qui sont arrivés à rupture du stock
existant au niveau du service Pharmaceutique et Commercial, il s’agit du :
2.2.1. Sérums anti Salmonelles Polyvalent :
a. Polyvalents :
Sérums
N° des Lots
Quantité en ml
H :m,t
04 – 2008
300ml
H:1
01– 2008
250ml
Nombre de flacons
de 1,2ml
b. Monovalents :
Sérum
N° du Lot
Quantité en ml
H :b
03 – 2008
150
Nombre de flacons de 1,2ml
2.2.2. Sérums anti Escherichia coli :
Aucune production n’a été programmé puisqu’il aucun manque de sérums anti
E.Coli n’a été signalé.
D’autres sérums ont été répartis en Janvier 2009, à savoir :
Sérums anti Salmonelles monovalents et polyvalents : nombres d’ampoules de
1,2ml.
O: 1,2 : 230 amp
O : 6,7 : 270 amp
OMA: 260 amp H : d : 170 amp
O: 1,3,19 : 180 amp O : 6,8 : 240 amp
OMB: 260 amp H : g,m : 150 amp
O: 6,14,24: 134 amp O : 6,7,8 : 220 amp
O:3,10,15: 225 amp
2.3- PLASMA DE LAPIN
Parmi les cocci Gram+, seules les souches de Staphylococcus aureus déterminent
la coagulation des plasmas citraté humains ou de lapin dans un délai de 24 heures.
Le solvant qui accompagne le plasma lyophilisé servira en même temps à la
reconstitution de ce plasma et à sa dilution.
Au service Vaccins Bactériens, nous avons mis au point et produit le plasma de lapin
lyophilisé pour épreuve de la staphylocoagulase de 2007 à2008.
Deux méthodes de production ont été utilisées :
- L’une au citrate trisidique
- L’autre à l’oxalate d’ammonium
Le plasma de lapin a été lyophilisé puis contrôlé au niveau de 04 Laboratoires:
- Service Contrôle de qualité : certificat d’analyse N° 222/LCQ/NT/07 du
10/06/07.
- Service de Bactériologie Médicale, Antibiothérapieet Hygiène Hospitalière :
Courrier du rapport du contrôle du 18/12/2007.
- Service Bactériologie Alimentaire, Entérobactéries Vibrillons : Rapport de
conformité verbal.
- Service Vaccins Bactériens : Service producteur
L’étude de son prix de revient par le service Finance a retardé la commercialisation
de ce produit jusqu’à l’heure actuelle.
III. PRODUCTION DE L’EAU APYROGENE PPI
Une quantité de prés de 40 litres d’eau apyrogène PPI à usage injectable, a été
produite pour le service Pharmaceutique.
A. Contrôle des produits
Tous nos produits sont contrôlés au niveau de notre service Vaccins Bactériens
durant la chaîne de production, lors de la préparation du bulk, avant répartition, et
après répartition.
Les contrôles effectués en fonction de chaque produit sont les suivant : contrôles
microbiologiques, biochimiques et toxico pharmacologiques (test d’inocuité et
d’activité sur animaux).
Un contrôle officiel est effectué sur le produit fini par le service Contrôle de
Qualité de l’IPA qui délivre les certificats de conformité.
B. ACTIVITE DE RECHERCHE-DEVELLOPEMENT
1. Vaccin anti charbon symptomatique-bactéridien (Projet N°3) F. GACEM, M.A. MADADI
Sur le terrain Algérien, la valence du charbon bactéridien est aussi importante que
le charbon symptomatique. Ce projet a été initié puis arrêté à la demande des
responsables de l’institution en attendant des locaux isolés pour la production de
ce vaccin.
2. Sérums anti Clostridium perfringens. (Projet N°4) M.A. MADADI - F. GACEM
- Sérum de toxinotypie de C.perfringens: A, B, C, D et E.
- Sérums titrés et calibrés de référence.
Mise au point de sérums de diagnostic par la détermination du type de C.perfringens
et de sérums de référence calibrés et titrés pour le contrôle de l’activité du vaccin
produit.
La mise au point ainsi que la fabrication de toxines purifiées, concentrées et calibrées
ainsi que la production de l’anti toxines servant à la toxinotypie et au contrôle de
l’activité par immunisation des lapins avec les toxines calibrées a été finalisée.
3. Vaccin à usage humain et vétérinaire anti tétanique : TOXINE ET SERUM
(Projet N°5) M.A.MADADI - F. GACEM
Un programme de développement de la toxine tétanique a été initié en septembre
1990 au niveau du Service Vaccins Bactériens par le Dr KADRA en collaboration
avec le Pr. BIZZINI expert de l’OMS et chef de service à l’institut Pasteur Paris et
avec le Dr Marshall de l’institut Pasteur du BRABANT, Belgique.
Durant cette période le groupe de travail installé a abordé les différentes étapes de
la production de la toxine tétanique brute. Le protocole de production de toxines
antitétanique servant à la production de sérum et de vaccin antitétanique est maîtrisé
au niveau de notre service.
L’étude des souches a été réalisée et une optimisation du milieu de culture pour
l’obtention du maximum de toxinogénèse a été finalisée et un lot expérimental a été
utilisé pour charger des chevaux.
Reprise du projet en 2003 :
Suite à la demande de Monsieur le Directeur Général de l’IPA le 05/02/2003, nous
avons repris le projet du vaccin et sérum anti tétani (arrêté pour non-conformité des
locaux avec accord du responsable de l’IPA).
Nous avons initié le travail par le contrôle de la toxine tétanique à savoir son titrage et
contrôle de son activité puis sa purification pour la production d’un petit échantillon de
vaccin servant à l’immunisation des chevaux.
Par la suite, la production de sérum devait être initiée par le chargement des chevaux
à l’IPA de Msila par Monsieur Madadi Mohamed Amine (suite à la demande du
Directeur Général et que ce travail devait être confidentiel).
Mais suite au tremblement de terre qui a secoué la wilaya de Boumerdes et d’Alger,
nous avons été chargé de produire en urgence des lots supplémentaires de Vaccins
anti typhoïdique et anti cholérique ainsi que tous les produits biologiques de
diagnostic pour répondre à la demande si il y’a des cas d’épidémies.
Travail restant à faire est :
• Production de sérums standard.
• Production semi industrielle ou industrielle de toxine, vaccin et sérum.
Ce travail demande des mesures draconiennes de sécurité vu le danger que
représente le germe à l’état végétatif et surtout à l’état sporulé. Des locaux ainsi que
le matériel adéquat servant uniquement au germe tétanique s’impose de lui-même.
Notre objectif est d’aboutir à la production industrielle de l’anatoxine tétanique
et du sérum anti tétanique étant donné la grande quantité de ce vaccin et sérum
importée chaque année par l’Algérie.
4- Etude de la virulence des souches productrices de vaccins (Projet N°6) F. GACEM
La virulence des souches vaccinales est la base de l’efficacité d’un vaccin. L’origine de
cette virulence est soit due aux antigènes somatiques, flagellaires ou bien aux toxines.
La virulence des souches est facilement perdue lors de la production des vaccins ou des
repiquages des bactéries. Cette virulence peut dans certains cas être récupérée par
passage sur cobayes.
L’étude de la virulence des souches vaccinales va nous aider à comprendre les
mécanismes qui la gèrent et à préserver aux souches leurs capacités toxinogènes et
immunogènes indispensables à la production de vaccins.
5- Vaccin multivalent à usage vétérinaire : (Projet N°7) M.A. MADADI - F. GACEM
Un programme de développement d’un vaccin multivalent à usage vétérinaire avec des
souches de terrain Algérien a été initié pour la mise au point et la production d’un vaccin
des toxi infections à bactéries anaérobies (entérotoxémies).
6. Sérum anti Clostridium chauvoei : (Projet N°8) F. GACEM
Un programme de développement de sérum anti Closidium Chauvoei, bactérie anaérobie
très stricte responsable de la maladie du charbon symptomatique chez les ovins et
bovins a été initié en 2008.
Il s’agi d’un sérum agglutinant à usage de laboratoire pour le diagnostic de la maladie du
charbon symptomatique (à usage vétérinaire) qui est non disponible chez les firmes
étrangères spécialistes dans la production de sérum.
Deux sortes de sérums sont en cours d’étude :
- sérum anti corps bactérien.
- Sérum anti – flagelles.
Deux méthodes sont utilisées pour cette étude :
- Poids de lapins différent.
- Calendrier d’injection différent.
- Méthodes de prise de sang différentes.
Renouvellement des notices des produits :
Les notices des produits biologiques de diagnostic sont en cours de renouvellent.
S’agissant d’un nouveau produit, la notice du plasma de lapin a été nouvellement faite.
1. Les notices qui sont en cours de renouvellement sont les suivantes :
- Sérums agglutinants de Salmonelles, absorbés pour agglutination sur lame
porte objet
- Sérums agglutinants pour le diagnostic des antigènes somatiques E.coli
entéropathogènes pour le nourrisson (EPEC)
- Identification sérologique des vibrio cholerae
- Recherche d’anticorps par agglutination : Suspensions Antigéniques pour le
sérodiagnostic de WIDAL et FELIX.
2. Nouvelle notice :
Plasma de lapin lyophilisé pour épreuve de la coagulase
Toutes ces notices sont envoyées à Monsieur le Directeur
correction et avis.
Technique pour
Par la suite elles seront envoyées au service de conditionnement pour pouvoir faire
un tirage et les commercialiser avec leurs propres produits.
Exposition et valorisation du vaccin Entérovax :
1. INTERVIEW PAR UN JOURNALISTE DE LA CHAINE DE TELEVISION
ALGERIENNE CANAL ALGERIE AU SIEGE DU MINISTERE DE
L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE, AU
SIEGE DE L’ANVREDET.
Le 15/04/2008 nous avons été filmés et interviewé par un journaliste de la chaîne
Canal Algérie sur projet innovant du vaccin Enterovax, anti entérotoxémie au siège
du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique où siège
l’ANVREDET (Agence Nationale de Valorisation des Résultats de la Recherche et
du Développement Technologique).
Ce reportage a été diffusé le jeudi 17/04/08 à 8h 45mn dans la rubrique Bonjour
d’Algérie, Journée de la Science pour faire connaître le vaccin Entérovax.
2. FORUM REGIONAL « PME /UNIVERSITE » (Blida)
- F. Gacem, MA. Madadi. 2008 (30/11/2008)
Mise au point et production d’un vaccin à usage vétérinaire anti
entérotoxémie en Algérie.
Forum régional « PME /Université »de Blida.
Suite à une invitation émanant de l’ANVREDET, nous avons participé au Forum
Régional « PME /Université » à l’hôtel Militaire de Blida comme porteurs de projet
rentrant dans le cadre de la valorisation du vaccin Entérovax.
3. FORUM REGIONAL « PME /UNIVERSITE » (Constantine) (15/12/2008)
Suite à une invitation émanant de l’ANVREDET pour participer au Forum Régional
« PME /Université » à Constantine, nous n’avons pas pu nous déplacer à cause
des problèmes de santé.
Importance du projet du vaccin Entérovax.
- Le projet du vaccin Entérovax mis au point et produit par Monsieur Madadi
Mohamed Amine et moi-même, a été sélectionné pour sa valorisation.
- Il est classé le premier de la liste des projets innovants dans le domaine de la
santé.
- Il a été retenu et présenté par l’Algérie sous la rubrique innovation (Santé) et
exposé lors de la Réunion du N.E.P.A.D en présence de Monsieur le
Président de la République et ses homologues Africains.
- Depuis l’an 2000, nous sommes les seuls et uniques représentants de l’Institut
Pasteur d’Algérie au sein de l’ANVREDET.
- La demande annuelle en ce vaccin par le Ministère de l’Agriculture équivaut à 10
millions de doses et que ceci n’est possible qu’avec l’acquisition d’un fermenteur
semi industriel qui sera aussi utilisé pour la production des autres vaccins du
service.
Le détail de ce projet a été rédigé dans le rapport d’activité 2007.
Brevet du vaccin Entérovax :
Le dossier du brevet du Vaccin Entérovax nous a été demandé par plusieurs
Ministres Algériens, pour sa protection à l’échelle Nationale et Internationale par
l’INAPI (l’Institut National Algérien de la Propriété Industrielle).
Les frais de l’enregistrement du brevet à l’échelle Nationale et Internationale seront
pris en charge par l’Agence ANVREDET dont le siège se trouve au sein du Ministère
de la recherche.
Ce dossier sera préparé dés que nous aurons les moyens nécessaires pour l’établir.
Laboratoire: Vaccins et Sérums Antirabiques
Chef de laboratoire : Mahfoud BRAHIMI (docteur en médecine vétérinaire).
1. Objectifs de production :
• Le vaccin antirabique à usage médical, inactivé et lyophilisé, répond aux besoins.
Il est conditionné en flacon de 2ml. Les prévisions de production pour l’année 2008
sont de 46 lots soit 850.000 doses théoriques.
• Le vaccin antirabique à usage vétérinaire produit sur culture cellulaire lyophilisé et
conditionné en flacon. Ce vaccin sera produit à la demande.
• Le sérum antirabique hétérologue est produit sur équidés hyperimmunisés.
Les prévisions pour l’année 2008 sont évaluées à 350 litres.
2. Programme et analyse de production :
2.1. Vaccin antirabique à usage humain :
Quantité produite (dose)
739.000 doses
Nombres de lots (bulks)
46 lots
Nombres de doses théoriques
851.000 doses
Numéros de lots
S.935 à S.980
Quantités perdues (doses)
112.000 doses
Nombres de lots perdus
06 lots
Les contrôles internes de qualité sont les suivant :
Contrôle de virulence sur souris
132
Test d’activité de virulence
132
Contrôle de stérilité
138
Test d’innocuité sur souris
040
2.2. Vaccin antirabique produit pour l’immunisation des équidés producteurs de sérum
antirabique et essai sur les nouveaux lyophilisateurs :
Nombres de lots immunisation
02 lots
Nombres de lots essai
05 lots
2.3. Vaccin antirabique à usage vétérinaire :
Quantité produite (doses)
28.820 doses
Nombres de lots
Nombres de doses délivrés
04 lots
28.520 doses
Numéros de lots
375 à 378
Les contrôles internes de qualité :
Test d’innocuité
004
Contrôles de stérilité
140
Contrôles d’activité
008
2.4. Sérum antirabique :
Quantité de sérum brut produit
Nombres de lots de 30 litres
Nombres d’équidés en production
498 litres
16 lots
13 équidés
Les contrôles internes de qualité :
Contrôle de sérum brut
02
Contrôle de sérum purifié
05
Contrôle de sérum de cheval (titrage)
03
2.3. Consommation durant l’année 2008 :
Acétone
Amphotéricine
Anticorps antinucléocapside rabique
conjugué à la fluescéine
Chambre labtek
06 litres
70mg
12 flacons
10 unités
Chlorure de calcium
125mg
Chlorure de sodium
07kg
Embouts micropipette
Ether
200 unités
10 litres
Glutamine
18g
Hydroxyde de sodium
1kg
Iode
1kg
Merthiolate
60g
D.M.E.M
Pénicilline
Phosphate de sodium monosodique
Potasse
150litres
200 unités
3.2kg
22.5kg
Seringue jetable 1 ml
400 unités
Seringue jetable 2.5 ml
100 unités
Sérum de veau fœtal
Streptomycine
Kanamycine
Trypsine
Tube stérile 5ml
10 litres
30g
550g
50g
1200 unités
II. PROJETS :
1. Récupération du virus à partir des culots de centrifugation résultant de la
préparation du vaccin antirabique médical.
Deux rinçages successifs sont faits, dans les deux cas le titre viral obtenu est
élevé.
Ce travail vise :
- La récupération maximale de virus dans le culot (technique d’épuisement)
- L’obtention d’un surnageant viral à faible taux de protéines d’origine cérébrales.
2. Culture en masse du virus rabique sur culture cellulaire. Ceci à pour objectif
la préparation du personnel à un éventuel passage à la fabrication du vaccin
antirabique médical sur culture cellulaire.
Un staff de 5 personnes suit ce projet à l’échelle pilote. Cependant nous
rencontrons des difficultés quant à la maintenance des appareils (système roller)
destinés à l’amplification des cellules et par conséquent du virus rabique.
3. Etude de la réalisation d’un moule pour la fabrication des boites à jeter pour souris :
Un des facteurs limitants de la production du vaccin antirabique médical sont les
boites à jeter : Ces boites sont importées, les délais de livraison longs gênent une
production continue et régulière des quantités de matières cérébrales à produire.
Nous avons étudié l’opportunité de leur fabrication en Algérie.
Une mission sur Oran a permis de pendre des contacts avec un fabriquant des
boites plastiques. La réalisation d’un moule servira à fabriquer ces boites à la
demande.
III. ACTIVITES SCIENTIFIQUES :
¾ Journée « 2ème journée de prévention et de sensibilisation contre la rage » ;
le 15 juin 2008 au centre culturel de bordj menaiel
Animateur et Président de séance : Dr M. ISSAD
¾ Séminaire « Sensibilisation a la sécurité vaccinale » ; le 29 et 30 juin 2008
à l’I.N.S.P.
Communication : « La chaîne de froid » présentée par le Dr ISSAD
¾ Journée d’information « Rage » ; le 19 octobre 2008 à Reghaia.
Animateur et Président de séance : Dr M. ISSAD
¾ Journée d’information « Rage » ; le 22 octobre 2008 à la maison de jeune
Saïd SENNANI Boumerdes
Communication : « La chaîne de froid et vaccins antirabiques » présentée par le
Dr M. ISSAD
¾ Séminaire « Rage » le 14 et 28 décembre 2008 à l’I.N.S.P
Communication : « le vaccin antirabique et la chaîne de froid » par le
Dr M. ISSAD
Laboratoire des Vaccins Viraux Vétérinaire
Chef de laboratoire : Abdelhamid TARIL (DV Maître de recherche) jusqu’à juillet 2008
Nacéra TOUARIGT (D.V./Chargée de recherche) à partir d’août 2008
De par sa spécificité, le laboratoire de Microbiologie Vétérinaire et d’Epizootiologie
assure, d’une part des activités de diagnostic, de recherche et de formation, et, d’autre
part, des activités de production, de contrôle et de développement de vaccins viraux
vétérinaires.
ACTIVITES DE PRODUCTION
1. VACCIN ANTICLAVELEUX SUR CULTURES CELLULAIRES :
Le vaccin anticlaveleux, auparavant produit sur moutons selon la technique traditionnelle
dite de Bidret et Bocquet, est fabriqué, depuis l’année 2000, sur cultures cellulaires,
après obtention de l’A.M.M. en mars 1999.
Le descriptif général du process de fabrication de ce vaccin est rapporté dans les bilans
annuels des années précédentes.
Les contrôles de qualité du vaccin (contrôles in-process) sont réalisés au niveau du
service. Le contrôle du produit fini est assuré par le Service Contrôle Qualité de l’IPA.
.
Souches entretenues au laboratoire :
a. Souches vaccinales :
- souche Casablanca (pour la production du vaccin sur mouton)
- souche RM65 : souche atténuée, adaptée sur culture de reins de mouton (pour
la production du vaccin sur culture cellulaire)
b. Souches d’épreuve (virulentes)
- souche Bertville (souche Sauvage)
- souche Maalba
- souche Moudjbara
Production :
La production du vaccin englobe un certain nombre d’activités qui portent sur :
• Production de cellules : les reins d’agneau servant à la production de cellules sont
obtenus à partir de fœtus qui proviennent des abattoirs d’Alger (abattoir de Rouiba
principalement) ou, à défaut, de brebis gestantes de l’élevage de l’Institut.
• Production de la culture virale : récoltes des suspensions virales obtenues après
infection des cellules rénales.
• Production de seed-lot (lots de semence) : ce sont des récoltes de suspensions
virales titrées, alicotées puis congelées ; elles sont destinées à l’infection
des cellules pour la production de la culture virale.
• Préparation de l’excipient de lyophilisation : milieu de Hanks additionné de
saccharose et d’hydrolysat de lactalbumine.
• Production des lots de vaccins.
Volume de la production :
La commande du vaccin anticlaveleux par le ministère de l’agriculture, pour la
campagne de vaccination de l’année 2008 nous est parvenue en septembre 2007.
Elle s’élève à 15.000.000 de doses, livrable avant décembre 2007.
Afin de répondre à cette commande, nous avons engagé le programme de
production 2008 en octobre 2007.
− D’octobre à décembre 2007, nous avons ainsi produit 20 lots de vaccins,
donnant 175 496 flacons de 100 doses, soit 17 549 600 doses.
La quantité totale de vaccin produite pour la campagne 2008 s’élève donc à
17.549.600 doses.
Production pour la campagne 2009 :
En prévision de la campagne 2009 nous avons produit une réserve de 06 pools
correspondant à 06 lots de vaccins durant le 1er semestre 2008 et une réserve de
36 pools correspondant à 36 lots de vaccin durant le 2éme semestre 2008.soit
environ 33 000 000 de doses. ce qui pourrait couvrir largement la campagne 2009.
2. ELEVAGES :
Elevage de moutons :
Le service contrôle un élevage de moutons de race Lacaune et Blanc du Massif
Central, importés à l’origine de France, pays indemne de clavelée : décembre 1994.
Ces animaux sont actuellement hébergés sur le site de Dely Ibrahim.
Ce sont des animaux « neufs », non vaccinés contre cette pathologie.
Elevage de souris :
Un élevage de souris Swiss est entretenu au service pour les besoins du diagnostic
de la rage. 100 couples de souris assurent la production suffisante à ces besoins.
Activités de l’Unité d’Epidémiologie
et d es C en t r es d e P r él èv e men t s
et de la Vaccination
246 Unité d’Epidémiologie et Centres de Prélèvements et de la Vaccination
Unité d’Epidémiologie d’Intervention et Vaccino-Vigilance
Chef d’Unité : Abderrezak SOUFI (Docteur en médecine, chargé de recherche).
L’unité a été créée en janvier 2005.Elle est située au niveau de l’annexe de l’Institut
Pasteur de Kouba.
1. Activité de contrôle et de surveillance épidémiologique
En étroite collaboration avec la Direction de la Prévention du MSPRH et les
différents services de l’Institut Pasteur d’Algérie, l’unité joue un rôle capital dans la
prise en charge des cas éventuels d’épidémie au niveau national, aussi elle
effectue un suivi des nombres de cas enregistrés.
L’unité procède en permanence à une évaluation de tout facteur de risque
environnemental qui peut fournir des explications ou des éclaircissements sur
l’émergence ou la réémergence de certaines maladies infectieuses.
En collaboration avec l’I.N.S.P, l’unité œuvre pour la mise en place d’un système
d’information géographique pour l’évaluation progressive de certaines pathologies
telles que les maladies du PEV, le scorpionisme et la rage.
Elle évalue continuellement la consommation annuelle en vaccins du PEV à
l’échelle nationale en se basant sur les consommations au niveau des EPSP,
EPH , EHS et les établissements sanitaires privés ; et les livraisons effectuées par
l’Institut Pasteur d’Algérie conformément au seuil du quota défini par la Direction de
Prévention du Ministère de la Santé Publique et de la Réforme Hospitalière.
L’unité fait partie du point focal chargé du règlement sanitaire international (RSI),
en collaboration avec différents Ministères et régie par la Direction de la prévention
du Ministère de la Santé, de la Population et de la Réforme Hospitalière.
Membre du bureau de coordination chargé du suivi de la gestion des états des
stocks des vaccins et sérums.
Membre permanent de la commission d’évaluation des offres nationales et
internationales (Bureau des marchés IPA).
L’unité est chargée en collaboration avec l’I.N.S.P sur l’évaluation et l’évolution
des cas des Manifestation post-vaccinal indésirables ceci dans le cadre de la
vaccination du PEV, vaccination et sérovaccination anti rabique et sérothérapie anti
scorpionique à l’échelle national.
Unité d’Epidémiologie et Centres de Prélèvements et de la Vaccination 247
2. Activités scientifiques
¾ Membre du comité national de lutte contre les zoonoses au MSP/RH.
¾ Membre du comité de pilotage du cours d’épidémiologie d’intervention, des pays
riverains de la méditerranée occidentale.
¾ Investigateur principal du projet de recherche ACIP sur le système d’information
géographique (SIG et télédétection en cours).
¾ Renforcement de la surveillance et contrôle de la leishmaniose et de
l’envenimation scorpionique et mise en place d’un SIG Health Mapper à l’échelle
des wilayas d’Algérie de 1980 à 2003 et étude plus grande échelle centrée sur
M’SILA avec analyse des données climatiques et environnementales.
¾ Membre du bureau des experts de la rage en Afrique
1ère réunion qui s’est déroulée à Abidjan en côte d’ivoire du 10 au 13 mars 2008.
¾ Préparation de la 2ème réunion du bureau des experts de la rage en Afrique qui se
déroulera à DAKAR (Sénégal) du 16 au 19 mars 2009.
¾ Réactualisation des notices pour les vaccins antirabiques vétérinaires et
humains.
• Formation :
- Formateur des personnes chargées de la vaccination du PEV à l’échelle des 48
wilayas du pays (I.N.S.P).
- Evaluation des cas MPVI dans le cadre de la vaccination du PEV à l’échelle
national en collaboration avec le Dr KEDDACHI, chargé du suivi des MPVI
(INSP).
• Communications :
¾ Journées médicales à l’hôpital de kolea le 06/01/08.
Thème : Prise en charge d’un cas de morsure et/ou griffure par animal.
¾ 1ère réunion du bureau des experts Africains de la rage à Abidjan côte d’ivoire
du 10 au 13 Mars 2008.
Thème : Situation épidémiologique de la rage en Algérie.
¾ 1ères journées médicales à Biskra le 09 et 10 avril 2008.
Thème : Prise en charge d’un cas de post-exposition par morsure et/ou griffure
occasionnée par un animal.
¾ 2ème journée de prévention et de la sensibilisation contre la rage qui a eu lieu
au centre culturel de Bordj Menaiel le 15/06/2008.
Thèmes :
9 Situation épidémiologique de la rage en Algérie.
9 Le Centre de Vaccination Anti-Rabique.
9 Prise en charge des personnes exposées au risque rabique.
¾ Formateur au séminaire de sensibilisation à la sécurité vaccinale le 29 et 30
juin 2008 à l’INSP.
¾ Animateur à la journée d’étude sur le règlement sanitaire international les 13,14
et 15 octobre 2008 à Sidi Fredj.
¾ Animateur à la journée d’information sur la rage le 19/10/08 à Réghaia.
¾ Journée d’information sur la rage organisée à la maison de jeunes Said
Sennani de Boumerdes le 22/10/08.
Thèmes :
9 Situation de la rage en Algérie.
9 Le Centre de Vaccination Anti-Rabique.
9 Chaîne du froid.
¾ Séminaire rage à l’I.N.S.P pour la wilaya d’Alger le 14/12/08
et le 28/12/08 pour les wilayates du centre :
9 Tipaza
9 Blida
9 Medea
9 Bejaia
9 Tizi ouzou.
Thèmes :
9 Présentation et fonctionnement d’un Centre de Vaccination Anti Rabique.
9 Chaine du froid et vaccins anti rabiques.
• Enquête sur le terrain
¾ Rab-Med control : Prospection des sites de chiroptères à Bejaia du 05 au 07
avril 2008.
¾ Mission d’information et d’évaluation suite au décès des personnes victimes de
piqures de scorpion : BOUSSAADA le 03/08/2008.
• Publications :
¾ Fighting rabies in Africa (the official journal of the international society for
vaccines.
¾ Situation épidémiologique de la rage en Algérie (fascicule de la Santé) en
cours
¾ Prise en charge des personnes exposées au risque rabique .(Revue MedicoPharmaceutique) en cours.
• Projets en cours :
¾ Préparation de la réunion du bureau des experts de la rage qui se
Dakar-SENEGAL.
déroulera à
¾ Evaluation des infections à salmonelles en Algérie (Responsable du projet :
Pr. RAHAL).
¾ Collaborateur- expert : projet de recherche RebMed contrôle (rage des
chiroptères) 2007.
Centre des Prélèvements
Chef du Centre : Asma BRIKA (Docteur en Médecine)
I. L’ACTIVITE DU CENTRE DE PRELEVEMENT
Le centre des prélèvements est chargé de l’accueil et l’orientation des malades qui
viennent se renseigner et désirent effectuer leurs analyses spécialisées au niveau
des laboratoires de l’Institut Pasteur d’Algérie.
Il est chargé également :
- De la codification des paramètres et l’orientation de malades vers la facturation.
- Des inscriptions des malades sur les registres des rendez-vous.
- La prise des renseignements cliniques des malades.
- L’enregistrement de leurs analyses sur le registre qui correspond.
- Assure la coordination avec les laboratoires de l’IPA pour le devenir et la remise
des résultats.
Le centre s‘occupe aussi de la réception des prélèvements qui parviennent des
différents hôpitaux du territoire national.
Par ailleurs le centre assure l’envoie des résultats par fax pour les malades qui
habitent l’intérieur du pays.
Le centre de prélèvement reçoit une moyenne de 350 malades par jour.
Durant l’année 2008 : 28306 malades ont été enregistrés, leurs répartitions
service est comme suit :
par
1- SERVICE D’IMMUNOLOGIE :
L’unité
Les paramètres
AUTOIMMUNITE
MARQUEURS
TUMORAUX ET
HORMONES
ALLERGOLOGIE
HLA
FAN
5363
FR + ANTICCP
2007
ANCA
694
APL
2509
ANTI TISSU
2552
COELIAQUE
503
- Immuno électrophorèse des prot.
- Electrophorèse des prot + prot de Bences J
- C 3 - C4
- CRP, etc. ….
- Sang+ LCR
IMMUNOCHIMIE
Le nombre de
paramètre enregistre
Total
13628
3176
4936
1760
1113
PSA – ACE .
CA 19.9 – CA 15-3 – CA 125
α FP – β HCG
4178
HORMONES DE LA REPRODUCTION
HORMONES THYROIDIENNE
AUTRE : CORTISOL, ACTH, PTH ….
3065
IgE Total
IgE SPECIFIQUE
413
696
1109
HLA B5
HLA B 27
HLA Greffe
1450
1402
458
3310
Le nombre de prélèvements réceptionné
27161
Le nombre de malades prélevés est de 17616 malades
Le nombre de prélèvements réceptionnés pour le service d’immunologie est de :
27161 prélèvements.
Il est à noter que l’anti corps anti CCP a été lancé la fin 2008.
2. SERVICE DE VIROLOGIE :
Le nombre de malades enregistrés pour la virologie est de : 6617 malades.
Hors que le nombre de paramètres réalisés est reparti comme suit :
Les paramètres
Le nombre
Rubéole
1542
Syphilis
877
Hépatite A.B.C.
3725
HIV
758
EBV
505
Néo du Cavum
337
MNI
242
CMV-Herpes-Rougeole…
1577
Lyme-Ricketsie-Coxsackie
142
Chlamydia
98
TOTAL
9803
3. LABORATOIRE DE BIOLOGIE PARSITAIRE :
Le centre de prélèvement s’occupe de l’enregistrement et la réception de trois
paramètres :
Toxoplasmose, Hydatidose, Parasitologie des selles, en ce qui concerne la sérologie
leishmaniose, amibienne etc.…, les malades sont orientés vers le service de
parasitologie.
Le nombre de malades reçu est : 2784 malades.
Les paramètres sont repartis comme suit :
Les paramètres
Le nombre
Toxoplasmose
2117
Hydatidose
236
Parasitologie des selles
188
Leishmaniose
211
Amibiase
27
Bilharziose
5
TOTAL
2784
4. LABORATOIRE DE MYCOLOGIE :
Le centre de prélèvement reçoit les malades, codifie leurs paramètres et les oriente
soit pour un prélèvement sanguin lorsqu’il s’agit d’une sérologie, ou bien vers le
service de mycologie lorsqu’il s’agit d’un prélèvement dermatologique
Les paramètres
Le nombre
Sérologie aspergillaire candidose
57
Prélèvement dermatologique
492
Total
549
Le nombre de malades est de : 549.
5. LABORATOIRE DES ENTEROBACTERIES :
Le nombre de malades réceptionné est de : 367.
Les paramètres
Le nombre
Coproculture
307
Sérologie de Widal et Félix
028
Helicobactére pylori
024
Yersiniose
008
Total
367
6. SERVICE DE BACTERIOLOGIE :
Le nombre de malades prélevés est de : 247
Les paramètres
Le nombre
Sérologie de la brucellose
230
Sérologie de la coqueluche
017
Total
247
7. LABORATOIRE D’ANA-PATHOLOGIE :
Le centre de prélèvement a réceptionné 126 pièces pour le laboratoire d’Anatomie
pathologique.
AU RESUME :
Service
Le nombre de malades
Immunologie
17616
Virologie
6617
Parasitologie
2784
Mycologie
549
Entérobactérie
367
Bactériologie
247
Anatomie Pathologique
126
Total
28306
Au total : plus de 28306 malades ont été prélevés au centre de prélèvement.
Plus de 37851 prélèvements ont été enregistrés.
Centre de Vaccinations
Chef du centre : Samira HARCHI (Docteur en Médecine)
I. INTRODUCTION
1. Activité de Référence
Le centre a eu à prendre en charge et donner un avis définitif sur les différentes
méthodes de traitement antirabique.
Il a eu à corriger et à conseiller les différents secteurs sanitaires d’Algérie sur le
traitement antirabique.
.
2. Activité de Santé Publique
Cette activité comporte trois volets :
- Prévention antirabique
- Vaccinations internationales et autres
- Prévention anti-poison
3) Activité Scientifiques
a) Membre du comité de lutte contre les zoonoses au MSP/RH
b) Activités de formation et communications orales
Le centre antirabique a contribué à organiser des journées nationales et
séminaires sur la rage sur l’ensemble du territoire national en collaboration avec
les M.S.P et l’INSP.
II. ACTIVITES DE SANTE PUBLIQUE
Le Service des vaccinations a enregistré durant l’année 2008 : 14956 patients dont :
01926 consultants pour la prévention antirabique
13013 consultants pour les vaccinations internationales et autres
00017 consultants pour la prévention anti-poison
III. ACTIVITES DE SANTE PUBLIQUE ET CONSULTATIONS
Vaccination et Prévention Antirabique
1. Nombre de consultants : 1926
1.1- Répartition des consultants selon l’âge
Tranche d’âge
Moins (-) de 5
ans
6 à 15 ans
16 ans et plus
1926
143
331
1452
%
7,42
17,19
75,39
Nombre de
Consultants
1.2- Répartition des consultants selon le sexe
Sexe
Féminins
Masculins
1926
560
1366
%
29,08
70,92
Nombre de
Consultants
1.3- Répartition saisonnière des consultants
Mois
Jan
Fev
Mar
Avr
Mai
Jun
Jul
Août
Sep
Oct
Nov
Dec
1926
108
106
129
136
160
246
269
195
130
205
133
109
%
5,61
5,50
6,70
7,06
8,31
12,77
13,97
10,12
6,75
10,64
6,91
5,66
Nbre de
Consultants
1.4- Répartition des consultants selon le siège de contact
Siège de
Contact
Tête
Mains
Cou
Organes
Génitaux
Tronc
Memb.
Sup.
Memb.
infer.
Contact
1926
107
597
3
55
259
751
12
142
%
5,55
31
0.16
2.86
13.45
38.99
0.62
7.37
Nombre de
consultants
1.5- Répartition des consultants selon la situation de l’animal mordeur
Situation de
l’animal
Animal ayant un propriétaire
connu
Animal en fuiteou érrant
1926
709
1217
%
36,81
63,19
Nombre de
Consultants
1.6- Répartition des consultants selon que l’animal a un propriétaire, connu et
vacciné ou non-vacciné
Animaux
Connus
Vaccinés
Non-vaccinés
709
315
394
%
44,43
55,57
Nombre de
consultants
1.7- Répartition des consultants selon la nature de la lésion
Nature de
la lésion
Contact
Morsure
Griffure
1926
142
1193
591
%
7,37
61,95
30,68
Nombre de
consultants
1.8- Répartition des consultants selon le caractère de la lésion
Caractère de
La lésion
Profonde
Superficielle
Contact
1926
366
1418
142
%
19
73,63
7,37
Nombre de
Consultants
1.9- Répartition des consultants selon le nombre de jours écoulés entre la
contamination et la consultation
Nombre
de jours
de 0 à 5 J
de 6 à 15 J
1926
1836
72
18
%
95,33
3,74
0,93
Nombre de
consultants
16 jours et plus
1.10- Nombre de personnes traitées d’après le traitement appliqué
Traitement
Appliqué
Vaccination
continue
Séro-vaccinaton
continue
Vacc.ou séro-vacc
Intérrompu dès la
remise du certificat du
vétérinaire
1926
1186
168
572
%
61,58
8,72
29,70
Nombre de
consultants
2. ANIMAUX MORDEURS :
2.1- Répartition des consultants selon l’origine animale de la contamination
Chien
Chat
Rat
Souris
Singe
Veau
Brebis
Hamster
1926
937
570
273
61
18
14
11
11
%
48,65
29,60
14,17
3,17
0,94
0,73
0,57
0,57
Cheval
9
0,47
Lapin
7
0,36
Vache
5
0,26
Sanglier
3
0,16
Ane
2
0,10
Coq
1
0,05
Chèvre
1
0,05
Fennec
1
0,05
Mouton
1
0,05
Vaccin-Vétéra
1
0,05
2.2- Répartition des consultants selon les différentes wilayas d’Algérie (sur 1926
consultants)
WILAYAS
Nombre de Consultants
Alger
1542
Blida
194
Boumerdès
59
Medéa
15
Tizi-Ouzou
14
Bouira
9
Jijel
8
Ain-Defla
7
Mila
6
Sétif
6
Skikda
6
Tipaza
5
Batna
4
Béjaia
3
Chlef
3
M’sila
3
Ghelizane
2
Saida
2
Tebéssa
2
Tiaret
2
Ain-Témouchent
1
Biskra
1
Constantine
1
Djelfa
1
El-Bayadh
1
El-Taref
1
Mascara
1
Oran
1
SDF
1
Pays étrangers (Résidants)
PAYS
Nombre de Consultants
Chine
21
Congo
01
France
01
Irlande
01
Tchèque
01
3) Vaccinations Internationales et Autres
Type de
Vaccins
Méningite
DiphtérieTétanos
FièvreJaune
AntiGrippal
Hépatite
13013
6785
3403
1659
1051
115
%
52,14
26,15
12,75
8,08
0,88
Nombre de
consultants
La Prévention Anti-Poison
Origine de
la piqure
Serpent
Scorpion
Divers insèctes
(Arraignée, Millepattes, Piqure
d’oursins, Abeille)
17
9
6
2
%
52,94
35,29
11,77
Nombre de
Consultants
Activités des Antennes
264 Antennes de l’Institut Pasteur d’Algérie
Rapport d’Activité2008
Responsable : Foudil KHELIFA (DM / MA en microbiologie / INESSM / Constantine)
Durant l’année 2008 ; nous avons traité 4315 échantillons, 4015 patients ont été
prélevés sur place.
Les analyses se repartissent comme suivent :
1. HORMONES (THYROIDIENNES, FERTILITE), MARQUEURS TUMORAUX :
HORMONES THYROIDIENNES
NOMBRES DE TESTS
Technique
TSH
1227
MEIA
T3 Libre
0450
MEIA
T4 Libre
0763
MEIA
Ac anti TPO
0134
MEIA
NOMBRES DE TESTS
Technique
FSH
216
MEIA
LH
183
MEIA
PROLACTINE
188
MEIA
ESTRADIOL
114
MEIA
PROGESTERONE
051
MEIA
TESTOSTERONE
103
MEIA
B HCG
104
MEIA
NOMBRES DE TESTS
Technique
PSA TOTAL
1157
MEIA
PSA LIBRE
0278
MEIA
ACE
0079
MEIA
CA.19.9
0024
MEIA
CA125
0043
MEIA
CA15.3
0047
MEIA
AFP
0020
MEIA
HORMONES DE FERTILITE
MARQUERS TUMORAUX
Antennes de l’Institut Pasteur d’Algérie 265
2. CYTOMEGALOVIRUS (Recherche des : IgG, IgM) :
TYPE DE VIRUS
Nombre de Sérums
Nombre de positifs
Technique
CMV IgG
200
200
MEIA
CMV IgM
200
074
MEIA
3. SEROLOGIE DES HEPATITES VIRALES ET DU HIV 1-2 :
Marqueurs
Nombre de Sérums
Nombre de positifs
Technique
Ag Hbs
418
113
MEIA
Ac anti HBc
375
101
MEIA
IgM anti HBc
98
014
MEIA
Ag Hbe
113
013
MEIA
Ac anti Hbe
104
084
MEIA
Ac anti HBs
212
057
MEIA
Ac anti HCV
235
026
MEIA
IgM anti HAV
139
050
MEIA
HIV
198
004
MEIA
4. TOXOPLASMOSE, RUBEOLE
Désignation du test
Nombre de tests
Nombre de positifs
Technique
Toxoplasmose IgG
346
96
MEIA
Toxoplasmose IgM
067
9
MEIA
Rubeole IgG
310
299
MEIA
Rubeole IgM
082
0
MEIA
5. AUTRES ANALYSES
NOMBRES DE TESTS
Technique
TROPONINE CARDIAQUE
31
MEIA
CORTISOL
24
FPIA
FERRITINE
22
MEIA
Cette activité de recherche a porté sur la détection des mutants pré-core ainsi que sur
les génotypes du virus de l’hépatite B qui circulent dans l’est Algérien, chez les
porteurs chroniques de l’Ag HBS.
Cette recherche s’est faite en collaboration avec le Dr THIBAULT du service de
virologie de l’hôpital la Pitié – Salpêtrière (Paris).
Il à été démontré que 93% des virus étaient de génotype D, les mutants pré – core
sont eux largement majoritaires.
La détermination des génotypes peut en effet avoir un impact sur la prise en charge
thérapeutique.
III. PUBLICATION ; COMMUNICATION ; THESE :
1. COMMUNICATIONS :
-
Journées médicales chirurgicales de Tamanrasset les 22 et 23 janvier 08.
Les génotypes et la prévalence des hépatites virales B chroniques (A g Hbe
négatif) en Algérie. (Dr F. KHELIFA ).
-
XIème congrès maghrébin, 14ème journées nationales les 3 et 4 mai 2008 – Alger
Génotypes et relation génotypes / mutation des souches de virus de l’hépatite B
circulants en Algérie). (Dr F. KHELIFA ET Dr V. THIBAULT).
-
1ère journée de microbiologie clinique le 29 mai 2008 – Alger –
Prévalence des génotypes et des mutants pré C du virus de l’hépatite B dans le
nord – est algérien.
(Dr F. KHELIFA ET Dr V. THIBAULT).
2. PUBLICATION :
Auteurs : Dr F. KHELIFA ET Dr V. THIBAULT
Titre : Caractéristiques des souches virales responsables d’hépatites B chroniques
en Algérie du nord - est. Revue : Pathologie Biologie (02 Octobre 2008)
3. THESE :
Soutenance de la thèse de DESM du Dr KHELIFA FOUDIL le 17 juin 2008 portant
sur la place des mutants pré–core du virus de l’hépatite B chez les porteurs
chroniques de l’Ag HBS dans l’est algérien.
Antenne de M’sila
Responsable : Abdelkrim BOUDRISSA (Ingénieur d’Etat en Biologie)
Le présent rapport est subdivisé en trois volets :
- activités de diagnostic
- activités de recherche
- activités de formation
Laboratoire de biochimie
Nature de
prélèvement
Sang
Urine
Paramètre de recherche
Nombre
HBA1c
0281
Urée
1812
Créatinine
2589
A. Urique
0506
cholestérol
1773
HDL-LDL
0147
Triglycéride
1752
Transaminases
0445
Phosphatase Alcaline
0177
Bilirubine total
0222
Bilirubine directe
0075
Gama GT
0003
Phosphorémie
0198
Calcémie
2018
Fer sérique
0293
Chimie des urines
1824
Techniques
utilisées
Laboratoire d’hématologie
Nature de prélèvement
Sang total
Plasma (citrate)
Nombre de malade
FNS
/
Groupage
2912
VS
1199
TP
0249
Laboratoire de sérologie
Nature de prélèvement
Sang
hTSH
ANTI-TG
T3 libre
T4 libre
Anti-TPO
Testostérone
β hCG
FSH
LH
PRL
E2
Progestérone
PSA libre
PSA totale
ACE
CA19-9
CA15-3
CA125
AFP
Ag HBs
Ag Hbe
Ac anti Hbe
Ac anti HBc
Ac anti HBs
HCV
HIV
HAV(IgM)
CMV
Toxo G
Rub G
Toxo M
Rub M
Férritine
Syphilis
W. Rose
Brucellose
ASLO
CRP
FR
TIG
Nombre
941
10
423
426
48
59
60
139
120
116
31
47
268
386
60
49
21
27
32
918
636
635
644
625
306
294
69
99
520
461
16
13
25
383
139
08
304
485
329
00
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
MEIA
Hémagglutination
Hémagglutination
Agglutination
Agglutination
Agglutination
Agglutination
Agglutination
Les prélèvements pour analyses immunologiques : sont acheminés au laboratoire
central d’immunologie de l’IPA Alger
Nombre de paramètres
Bilan connectivite
92
Electrophorèse de protéines
38
Maladies cœliaques
58
Ac anti Gliadine
02
C3-C4
13
S de chlamydiae
01
IgG et IgM anti phospholipides
04
FAN
14
Profil protéique sérique
09
IgG, IgM anticardiolipide
27
IgG, IgM anti-B2GP1
30
Ac Anti Tissu
13
ANCA
32
1gE, Test monospécifique
01
Bilan SAPL
09
IgE spécifique total
01
Laboratoire de parasitologie
Nature de prélèvements
Selles
- Coproculture
Paramètre de
recherche
-salmonella
-V. colériques
-E. coli GEI
- E.parasitologique
- Scotch-test
Nombre
261
Culture
103
E. direct
Enrichissement :
Ritchie- Willis
00
E. direct
07
E. direct + culture
1648
E. direct + culture
Champignons
- E. mycologique
Leishmanies
Frottis
Laboratoire de bactériologie
Nombre
1319
E.D+ culture
P. vaginale
30
E.D+ culture
Pus
02
Culture
Gorge
01
Culture
urines
Laboratoire de contrôle de qualité
Aliments
131
Eaux
00
Projet ANDRS : soumission d’un projet : « Application du système d’information
géographique dans le contrôle et le suivi de la leishmaniose cutanée zoonotique dans
le bassin du Hodna.
Missions scientifiques
Dans le cadre d’une Thèse de Doctorat poursuite de l’exploration du nouveau foyer
de la leishmaniose cutanée zoonotique dans la région d’El Mhir wilaya de Bordj Bou
Arreridj, par des enquêtes sur le parasite, sur le vecteur et sur le réservoir.
Enquêtes entomologiques dans la région de Guerrara wilaya de Ghardaia, dans
certaines localités de la vallée Oued Righ.
Etudes sur le réservoir de la leishmaniose cutanée avec la capture de plusieurs
spécimens appartenant à différentes espèces Psammomys Obesus, meriones Shawi,
Meriones lybicus, Jaculus jaculs, Gundi etc…
Dans le cadre du projet ACIP A-04-2007 fait partie de l’équipe du laboratoire du
Dr HARRAT ayant effectuée une mission à Tataouine (Tunisie) du 04 au 15 octobre
2008 pour participer avec l’équipe tunisienne aux enquêtes entomologiques et
recherche du réservoir dans le foyer de leishmaniose cutanée à L. KILLICKI de
Tatatouine.
Dans le cadre du projet ACIP A-04-2007 un première mission du 03 au 12 mai 2008
à Ghardaïa et une deuxième mission du 18 au 24 Juin 2008 effectuée à Ghardaïa
et Ouargla Prélèvement de malades, enquêtes entomologiques et capture de
rongeurs.
Mission effectuée du 09 au 15 mai 2008 dans trois régions appartenant au Bassin du
Hodna M’sila, BBA, Bistra avec EDWARD ZOLTAN WAD sur l’inventaire des reptiles
les résultats de cette mission et des missions antérieures feront l’objet d’une
publication (en cours).
III. ACTIVITE DE FORMATION
L’annexe continue d’accueillir les étudiants de fin de cycle des départements de
biologie et de chimie (génie des procédés pharmaceutiques) de l’université
Mohammed Boudiaf de M’sila.
L’annexe reçoit également les stagiaires de l’école de formation paramédicale.
Participation en qualité de facilitateur au cours de formation en entomologie du
paludisme du 07/07/2008 au 17/07/2008 à l’annexe de Sidi Fredj en collaboration
avec l’OMS.
PROGRAMME DE LUTTE CONTRE LA LEISHMANIOSE
Responsable de formation destinée aux biologistes chargés du diagnostic
parasitologique des leishmanioses organisé par L’EPSP d’El Mghaeir du 22 au 25
décembre 2008. Ce cours a regroupé une quinzaine de techniciens biologistes de la
wilaya d’El Oued qui a pour objectif la maîtrise les techniques d’examen direct et
culture.
Participation aux différentes réunions du Comité Technique National de Pilotage de la
campagne de lutte contre la leishmaniose cutanée à la Direction de la prévention du
MSPRH aux dates suivantes : 12/04/2008, 24 AVRIL 2008, et 15/09/2008
PUBLICATION ET COMMUNICATION
Publications :
Z. HARRAT, A. BOUDRISSA (2008) - Ecologie des rongeurs réservoirs de la
leishmaniose cutanée zoonotique en Algérie. Revue Médico Pharmaceutique N°48
p26-30
Communication orale :
N. KACI-OUCHFOUN, F. HADJ BEKKOUCHE, M.C. ADDADI, A. BOUDRISSA,
T. GERNIGON-SPICHALIWICZ. : Site synthesis determination and partial sequence
analysis of a major androgen-dependent protein from sand rat (Psammomys obesus)
seminal vesicles.11th INTERTERNATIONAL CONFERENCE ON RODENT BIOLOGY.
Rodens et Spatium Myshkin, Russia 24 – 28 july, 2008.
Antenne d’Oran
Responsable : Leila BELHABRI (Docteur en médecine)
L’annexe Pasteur d’Oran est constituée de deux structures :
- un laboratoire
- un service commercial.
Le laboratoire assure trois activités principales.
I. ACTVITE DE DIAGNOCTIC
1. Bilans thyroïdiens
Analyses
Technique
Nombre
Thyrotropine (TSH)
MEIA
9322
Tri-iodothyronine libre (FT3)
MEIA
2628
Tyroxine libre (FT4)
MEIA
4549
Anti-thyroglobuline (Anti-TG)
MEIA
1283
Anti-thyroperoxydase (Anti-TPO)
MEIA
607
Technique
Nombre
Homme lutéotrope (LH)
MEIA
519
Hormone folliculostimulante (FSH)
MEIA
511
Testostérone (TET)
MEIA
181
Prolactine (PRL)
MEIA
446
Estradiol (E2)
MEIA
188
Progestérone (PGN)
MEIA
75
2. Bilans de fertilité
Analyses
3. Recherche et dosage de marqueurs tumoraux
Analyses
Technique
Nombre
Antigène carcino-embryonnaire
MEIA
87
Antigène de cancer Ca15-3
MEIA
103
Antigène spécifique de prostate PSA total
MEIA
1315
Antigène spécifique de prostate PSA libre
MEIA
277
Alpha 1 Foetoprotéine
MEIA
55
Antigène de cancer Ca19-9
MEIA
49
Antigène de cancer Ca 125
MEIA
26
4. Autres hormones
Analyses
Technique
Nombre
Cortisol
FPIA
00/Manque de réactifs
BHCG
MEIA
88
5. Diagnostic des maladies infectieuses
5.1- Sérologie des hépatites virales
Analyses
Technique
Nombre
IgG anti HAV
MEIA
0149
IgM anti HAV
MEIA
0132
Ag HBs
MEIA
1425
Ac HBs
MEIA
0383
Ag HBe
MEIA
0349
Ac HBe
MEIA
0308
IgG Ac HBc
MEIA
0271
IgM anti HBc
MEIA
0086
HCV
MEIA
0713
Technique
Nombre
TOXO IgG
MEIA
2489
TOXO IgM
MEIA
1036
RUB IgG
MEIA
2562
Rub IgM
MEIA
459
CMV IgG
MEIA
128
CMV IgM
MEIA
67
HIV
MEIA
682
Chlamydiae
ELISA
05
5.2- Autres
Analyses
1.6- Analyses mycologiques
Nature du prélèvement
Total
Ongles
94
Cheveux
09
Squames
05
Selles
02
Total
110
II. ACTIVITE DE REFERENCE
Mission à Laghouat du 02-07-08 au 06-07-08
Déplacement du Dr BELHABRI et Melle Alla à Laghouat a propos de quatre cas
humains suspect de peste bubonique.
Mission terrain à Laghouat du 26-07-08 au 30-07-08
Dr BELHABRI et Melle ALLA en collaboration avec deux techniciens de prévention.
Enquête entomomamalogique à 30km de Laghouat plus exactement à Ksar
El Hirane et à Bouterkfine
III. ACTIVITE DE RECHERCHE
• Etude des vecteurs et des réservoirs de la peste dans l’Oranie.(code 02/05
01/04 /036)
Méthodes : tous les deux mois, des captures de rongeurs sont effectuées dans les
zones à risque par des techniciens de la santé
Les indicateurs utilisés sont : la sérologie antif1 des rongeurs et l’analyse
bactériologique des rates.
• Données biologiques, épidémiologiques. cliniques et génétiques sur le
syndrome d’insulinorésistance chez l’adulte oranais (code 02/07/01/01/076)
Dr I. MEDJAOUI - laboratoire CNAS
Melle H. BELARIBI biologiste Institut pasteur annexe d’Oran
Le dosage de l’insulinémie à été réalisé chez 50 patients en plus des 421 de 2007
Un échantillon de 800 personnes a été prévu.
1- Stage de formation des biologistes :
Melle ALLA Khadîdja :
Stage à l’institut pasteur Madagascar du 21-05-08 au 11-06-08.
Diagnostic bactériologique de la peste humaine et animale.
Melle Mezaache Cherifa :
Juin 2008
Stage au laboratoire de parasitologie de l’institut pasteur d’Alger.
Dr L. BELHABRI
Melle TOUA Ahlem
Stage à l’institut pasteur de sidi Ferruch du 25-10-08 au 26-10-08.
Thème : PCR hépatite.
2. Réalisation de mémoires :
KALAIDJI
Amel
BOUCHENTOUF
Imene
Belbachir
Asma
Faculté de
pharmacie Oran
04/11/2007
au28/02/2008
Faculté de
pharmacie Oran
04/11/2007 au
28/02/2008
L’hypothyroïdie
suivi
et son
Dr L.
BELHABRI
Intérêt du dosage de PSA
dans l’exploration de la
glande prostatique
Dr L.
BELHABRI
3. Stages pratiqués au laboratoire :
Nom/Prénom
YAMALLAH
Khadidja
REZOUG
Radia
provenance
Date
Thème du
mémoire
Encadrement
Faculté de
pharmacie Oran
01/03/08
au 30/06/08
Rapport de stage
de l’activité du
laboratoire
Personnel du
laboratoire de
l’annexe
Activités du Service de la Formation
280 Service de la Formation
Service de la formation
Responsable : Sonia NEDIR (Licenciée en Sociologie)
PRESENTATION
En 2008, l'organisation du bureau de la Formation est restée rigoureusement la même
que durant les années précédentes, en dépit des multiples demandes d'amélioration
formulées.
Sans surprise, l'évolution de l'activité de gestion de la formation a présenté une tendance
générale semblable à celle des années précédentes.
I. LA FORMATION DES EMPLOYES DE L’IPA
1. FORMATION DES EMPLOYES EN EXTRA-MUROS (hors de l’IPA)
Service
Entérobactérie
s
Biologie
Parasitaire
Virologie
(Entérovirus)
Nom
Lieu
Période
Motif de la
formation
Financement
KIAS Farid
(Biologiste)
Institut Pasteur
de Paris
3 mois ½
7 janvier au 25
avril 2008
Cours
d’Informatique en
Biologie
IPA : billet d’avion + 2
jfmc*
IPP : bourse d’étude
BENZITOUNI
Amel (Biologiste)
Institut Pasteur
de Paris
1 mois ½
14 janvier au
26 février 2008
Cours sur la
Circulation des
agents infectieux et
maîtrise du risque
jfmc*
ANESBOULAHBAL
Dahbia
(Dr. Vétérinaire –
Chargée
d’Etudes)
Institut Pasteur
de Paris
2 mois ½
7 avril au 27
juin 2008
Cours de Virologie
Systématique
jfmc*
CHOUCHANE
Abdelkader
(Tech. Sup.)
National
Institute for
Communicable
Diseases
(NICD – OMS)
Afrique du Sud
8 jours
10 au
18 avril 2008
Cours de recyclage
sur les cultures
cellulaires du réseau
des laboratoires
polio.
DERRAR Fawzi
(MédecinChargé de
recherche – Chef
de service)
Institut Pasteur
de Paris
2 mois ½
7 avril au
27 juin 2008
Cours de Virologie
Systématique
AIT-AISSA Assia
(Biologiste)
National
Institute for
Medical
Research, Mill
Hill, London
10 jours
18 nov. au 1er
déc.
2008
Stage pratique:
Détection de la
résistance aux
inhibiteurs de la
neuraminidase
(résistance des virus
grippaux aux
antiviraux)
Virologie
(Grippe)
OMS : prise en charge
du séjour et du billet
IPA : 2 jfmc*
jfmc*
NIMR : prise en
charge séjour
IPA : billet
Service de la Formation 281
Service
Biologie
moléculaire
Antenne
d’Oran
Nom
Lieu
DRALI Rezak
(Biologiste)
Hôpital de
Marseille
(labo.
génétique mol.
– Pr Levy)
Motif de la
formation
1 mois
er
1 au 30 mai
08
Stage pratique de
perfectionnement :
Diagnostic
génétique
d’affections
neuromusculaires
communes en
Algérie
Stage pratique :
Explorations
moléculaires
approfondies de
familles présentant
une affection neuromusculaire.
Hôpital de
Marseille
(labo.
génétique mol.
– Pr Levy)
1 mois
er
1 au 31 août
2008
KARA-SLIMANE
Samira
(Biologiste)
Université de
la Méditerranée Aix
Marseille II
9 mois
20 sept. au 30
juin 2008
Master I : Conseil
en Génétique et
médecine prédictive
ALLA Khadidja
(Biologiste)
Institut Pasteur
de
Madagascar
(Unité Peste)
20 jours
20 mai au 10
juin 2008
Stage pratique : Le
diagnostic
biologique de la
peste humaine et
animale (bactério.,
séro.)
HAMADOUCHE
Tarik
(Docteur en
Biologie)
BENALLAL
Kamel-Eddine
(Biologiste)
Université
d’AbomeyCalavi
(Benin) : partie
théorique
Eco-Epidémio.
Parasitaire
EDDAIKRA
Nawel
(Biologiste)
ANNECHE
Ammar
(Tech. Supé.)
USTHB - Alger
3 mois et 1
semaine
. 11 sept. Au
18 déc. 2008
2 ans
(2
jours/semaine)
Année univ.
2006-2007
2007-2008
Prolongation
Pour
soutenance
2008-2009
(jusqu’à
février)
Sérum
Institute of
India
(Inde)
1 semaine
er
1 au 6 déc.
08
AIT-SAID Lamia
(Biologiste)
Ecole
Nationale
Polytechnique
- Alger
1 année
(partie
théorique)
Janvier à déc.
2008
TAHARDJEBBAR
Khadidja
(Biologiste)
USTHB (Alger)
en collabo.
Avec Agence
Française de
Francophonie
(campus
numérique)
7 mois
(en alterné voir
planning)
4 déc.08 au 30
juin 09
BOUMENDIL
Soraya
(Biologiste)
Contrôle de
Qualité
Période
Master International
d’Entomologie
Médicale et
Vétérinaire
Financement
Budget alloué par
l’Agence Française de
Myopathies : bourse
de séjour
IPA : billet+2jfmc*
Budget alloué par
l’Agence Française de
Myopathies : bourse
de séjour
IPA : billet+2jfmc*
Financement
personnel
IPP Budget ACIP :
billet + séjour
IPA : 2jfmc*
IPP : Bourse d’étude +
billet
(12000 euros)
IPA : 2jfmc*
Magister en Biologie
et physiologie
animale
Spécialité :
neurobiologie
cellulaire et
moléculaire
Cours : Contrôle
d’activité des
vaccins bactériens
et viraux par
méthodes
immunologiques.
Préparation d’un
Magister (Ecole
Doctorale) :
Biotechnologie et
environnement
Préparation d’un
Master en Santé
publique option :
Expertise et
ingénierie des
systèmes
d’information en
santé.
Financement
personnel
SII : prise en charge
du séjour + billet
IPA : 2jfmc*
Financement
personnel
Financement
personnel
Service
Virologie
(Virus et
Cancers)
Microbio.
Vétérinaire
Bactériologie
des Aliments
Vaccins
Bactériens
Direction des
Ressources
Humaines
Nom
MELOULI Hamid
(Biologiste
spécialiste)
AMARA-KORBA
Anissa
(Biologiste)
ALAMIR Hanane
(Magister
Sciences
Alimentaires)
BEKRAR Lamia
(Biologiste)
Lieu
Période
CHU de
Toulouse
(INSERM
U563)
2 mois
10 déc. 2008
au 10 fév.
2009
Ecole
Nationale
Polytechnique
- Alger
2 ans (en
alternance, 2
jours/semaine)
Année univ.
2006/2007
2007/2008
Institut
National
Agronomique
(INA) Alger
Université
d’Alger
Faculté des
lettres et
langues
3 ans
(janv.05 à juin
08)
(1
jour/semaine)
+ prolongation
Juin 08 à juin
09
8 mois
(2
matins/semai)
Motif de la
formation
Financement
Stage pratique :
Description de
l’infection par EBV
chez des patients
porteurs d’un
carcinome du
nasopharynx
Préparation d’un
Magister en Génie
de l’environnement
option :
biotechnologie
Projet
DPGRF/INSERM :
bourse de séjour
IPA : billet + 2jfmc*
Financement
personnel
Financement
personnel
Préparation d’un
Doctorat en
Sciences
sur les
campylobactérioses
alimentaires
Préparation d’une
Licence
d’Interprétariat
Arabe-Anglais
Financement
personnel
24 nov. 08 au
30 juin 09
NEDIR Sonia
(Sociologue –
Chargée de la
Gestion de la
Formation)
Université
d’Alger Faculté
des Sciences
humaines et
sociales Alger
1 année
(renouvelable)
Février 2008 à
Fév. 2009
(1jour /
semaine)
Préparation d’un
Magister en
Sociologie de la
Santé
Financement
personnel
AIT-MESBAH
Sihem
(Assistante
Administrative
Principale)
Ecole
ECO-FAM
(Alger)
1 année
(les jeudis)
6 nov. 08 au
27 nov.09
Préparation d’un
Diplôme d’Etudes
Supérieures en
Management
IPA
Service
Nom
TEYAR Faîza
(Cadre financier)
Direction des
Finances et
Compta.
AOUIGUER
Kamel
(Chef du Service
Contrôle)
GALLEZE
Fatma-Zohra
(Chef du service
Comptabilité)
IRKAKEN
Ouahiba
(DFC Adjointe)
AIT-MESBAH
Samir (Chef du
service
Patrimoine)
MANA Samia
(Chargée des
créances)
LAOUBI
Abdelmalek
(Comptable)
Lieu
Période
Motif de la
formation
Chambre du
Commerce et
de l’Industrie Alger
1 année et 8
mois
Mars 2008 à
octobre 2009
(cours du soir
+ week-end)
Préparation d’une
Post-Graduation
Spécialisée en Audit
Financier et
Comptable
Financement
10 jours
. 17 au 21 mai
08
. 31 mai au 04
juin 08
IPA
Institut
Supérieur de
Gestion et de
Planification
(ISGP) - Alger
DERAMCHIA ElHadi (Chef du
Service Client)
BELLILI Adada
(Chef de service
Finances)
DEBBAGH
Nacéra (Chargée
des Créances)
BENNOUR Dalil
(Chargé de la
Fiscalité)
YAHIAOUI Yahia
(Chargé du
recouvrement)
BRAHIMI Akila
(Chargée du
Contrôle des
achats)
Cours sur : Le
nouveau système
comptable et
financier
10 jours
. 24 au 28 mai
08
. 07 au 11 juin
08
Maintenance
Electronique
MEKKI Lyakout
(Ingénieur)
Ecole Dar El
Itkan - Alger
7 mois
Juin à déc. 08
(2 aprèsmidi/semaine)
Formation théorique
et pratique sur : Les
Techniques
Réseaux et Server
Approvisionne
ment
SANDJAKDINE
Fouzia
(TS Chimie –
Chargée des
Commandes)
“VEIL-TECH”
Office Riad El
Feth - Alger
3 jours
1er au 3
déc.08
Séminaire: Les
procédures
d’approvisionnements
IPA
Contentieux
BERKANI Lilia
(JuristeChargée des
Inventaires)
« ProspecoConseil »
Hôtel Mercure
(Alger)
2 jours
11 et 12 déc.
08
Séminaire :
L’inventaire et
l’assainissement
annuel des stocks
IPA
IPA
Au total, 38 employés ont été formés hors de l’IPA en 2008,
pour 39** stages de formation réalisés.
Ce chiffre accuse une tendance à la stagnation par rapport
à l’année 2007 (40 employés formés hors de l’IPA)
* : 2 jours de frais de mission complémentaires
* *: certains employés ont bénéficiés de 2 stages durant l’année.
Répartition par type de structure, des employés formés hors de l’IPA en 2008
• Structures scientifiques
: 20
(53%)
• Structures administratives
: 18
(47%)
Répartition par type de structure, des employés formés à l'extérieur de l'IPA
Scientifiques
53%
Administratifs
47%
L’effort de formation des employés de l’administration entamé en 2007,
s’est poursuivi en 2008.
Les chiffres s’équilibrent désormais entre formation de l’administration
et des laboratoires.
Nature des formations reçues en extra-muros en 2008
• Cours (formations théoriques)
• Stages pratiques
: 33
: 06
(33%)
(154%)
Nature des formations réalisées hors IPA en 2008
Stages pratiques
15%
Cours
85%
Chûte des formations pratiques (en labo.) en 2008. La quasi-totalité des
formations reçues sont théoriques (cours).
Durée moyenne des formations reçues en extra-muros en 2008
•
- de 1 mois
: 20
(51%)
•
1 à 6 mois
: 07
(18%)
•
7 mois et +
: 12
(31%)
Durée moyenne des formations reçues hors IPA en 2008
7 mois et (+)
31%
(-) de 1 mois
51%
1 à 6 mois
18%
Tout comme pour 2007, prédominance des formations de courte durée
en 2008. En revanche, nette avancée des formations alternées de longue
durée (Magister, Master, PGS) y compris dans l’administration.
Répartition par pays d’accueil, des formations reçues en extra-muros en 2008
•
Algérie
: 25
•
France
: 08
•
Inde
: 02
(5%)
•
Bénin
: 01
(3%)
•
Madagascar
: 01
(3%)
•
Royaume-Uni
: 01
(3%)
•
Afrique du Sud
: 01
(3%)
(63%)
(dont 04 à l’Institut Pasteur de Paris)
(20%)
Répartition par pays, des employés formés extra-muros en 2008
Afrique Sud
3%
Inde
5%
France
20%
Bénin
3%
Madagascar
3%
Royaume Uni
3%
Algérie
53%
En 2008, les formations extra-muros ont eu lieu pour la grande majorité
en Algérie et dans une moindre mesure en France (notamment à
l’Institut Pasteur de Paris).
Notons que les formations réalisées en France ont chutées de moitié par
rapport à 2007
Prise en charge financière des employés formés en extra-muros en 2008
Organisme financeur
Institut Pasteur de Paris
Nombre de formations
prises en charge
30
06
Nature du financement
La moitié sont des financements
complémentaires (billet d’avion +2
jours de frais de mission) et la moitié
sont des financements de frais
d’inscription.
Bourses d’étude, budget ACIP
Agence Française de
Myopathie (AFM)
02
Sérum Institute of India
02
Projet de coopération francoalgérienne DPGRF/INSERM
01
OMS
01
Prise en charge séjour + billet
NIMR - Londres
01
Prise en charge séjour
Financement personnel
08
Frais d’inscription universitaires,
Budget alloué
Prise en charge du séjour et billet
Bourse d’étude
Financement des formations hors IPA en 2008
NIMR Londres; 1
Coop. Franco-Alg.; 1 Personnel; 8
IPParis; 6
IPAlgérie; 30
Sérum Institute India; 2
OMS; 1
AFM; 2
L’Institut Pasteur d’Algérie en financements complémentaires et l’Institut
Pasteur de Paris par les bourses d’études, restent les principaux organismes
financeurs des formations réalisées par les employés en extra-muros.
Le financement personnel des employés, bien que relativement fréquent,
reste cependant négligeable du point de vue coût.
2. FORMATIONS DES EMPLOYES EN INTRA-MUROS (à l’IPA)
Structure
organisatrice
Direction
Générale
Intitulé du cours
Date
Cours de Statistiques
Session du
appliquées à la Médecine 04 fév. au
et à la biologie (CESAM) 30 juin 08
Lieu
Organisme ou
Enseignant
collaborateur
Nombre de
stagiaires
IPA
Observations
IPA
SidiFredj
Enseignante : Dr
Abrouk Samira
02 (sur 41)
Cours payant
remboursé au
personnel IPA
reçu
Les employés ayant reçu ces formations en internes sont:
Cours
Cours du CESAM
(session du 04 fév. au 30 juin 08)
Noms (Fonction – Service)
Observations
BENAMROUCHE Nabila
(Médecin M.Assistante- Sce Antibiothérapie)
Reçue à
l’examen
BENALLAL Kamel
(Biologiste – Sce Génétique)
Ajourné
Au total, en 2008 seuls 2 employés ont été recensés par le bureau de la
formation comme ayant reçu une formation en interne ( !)
Notons qu’au fil des années le recensement du nombre d’employés
formés en interne n’a cessé de baisser (77 en 2005, 48 en 2006, 15 en
2007).
Cela peut être dû :
G soit à un mauvais recensement dû à un défaut de communication
d’information entre le Bureau de la Formation et les
services/laboratoires.
G soit à une diminution effective du nombre de cours et ateliers
organisés en interne au profit des employés
II. ACCUEIL ET FORMATION DE STAGIAIRES A L’IPA
1. ACCUEIL DE STAGIAIRES PAR LES LABORATOIRES ET SERVICES TECHNICOADMINISTRATIFS, POUR PROJETS DE FIN D’ETUDE/RESIDANAT
(Gestion assurée par Melle Sabah MEBARKI – Direction des Ressources Humaines)
Répartition des stagiaires par Cursus
Etudiants Universitaires
Etudiants Centres
de Formation
Professionnelle
Résidents
Magister/Doctorat
DEUA/DES/Ingé.
Médecine
Pharmacie
20
87
10
12
107
10
22
138
Pas moins de 138 étudiants, résidents et autres stagiaires ont été accueillis
dans les laboratoires et services de l’IPA en 2008, légèrement moins qu’en
2007.
Ce sont essentiellement des étudiants de graduation universitaire, notamment
des DES et Ingénieurs en Biologie préparant leur projet de fin d’étude.
Dans une moindre mesure des Résidents en pharmacie et médecine
USTHB
Fac. Médecine et
Pharmacie d’Alger
Centres Formation
Professionnelle
(Alger)
Univ. Blida
Univ. Bejaia
Univ. Guelma
Univ. Tizi
Univ. Const.
Un.
Boum
E.N.
Polyt
IN
Agr.
Fac Med
Blida
Un. Lille
TOTAL
Répartition des stagiaires par organisme de provenance
83
21
10
06
05
03
02
02
02
01
01
01
01
138
La grande majorité des stagiaires accueillis dans nos laboratoires
sont des étudiants en provenance de l’USTHB.
Dans une moindre mesure, des résidents de la Faculté de Médecine
et Pharmacie d’Alger.
2. ACCUEIL DE STAGIAIRES POUR COURS ET ATELIERS
Structure
organisatrice
Direction
Générale
Labo. du H.I.V
Service de la
Tuberculose
Service de
Bactériologie
médicale
Intitulé du cours
Cours de Statistiques
appliquées à la
Médecine et à la
biologie (CESAM)
Atelier de formation en
tests de dépistage du
H.I.V
Cours International de
Mycobactériologie
médicale et formation
aux techniques de
mycobactériologie.
Atelier de formation du
réseau national de
surveillance de la
résistance des
bactéries aux
antibiotiques.
Date
Session du
04 fév. au 30
juin 08
Lieu
Organisme
ou
enseignant
collaborateur
41
IPA
(SidiFredj)
Enseignante :
Dr Abrouk
Samira
Session du
15 sept.08
au 9 fév. 09
24 au 28 mai
2008
Nombre de
stagiaires
IPA
SidiFredj
Ministère de
la Santé/
Global Fund
(programme
GFATM
Algérie)
. Dr.
Mohamedi (El
Kettar)
54
Cours payant
30
Participants :
Techniciens
supérieurs en
biologie,
provenant de
différentes
wilayas
OMS
10
Participants :
Biologistes
Africains de
labo. de
tuberculose
22 au 26 nov.
2008
IPA
Dely
Brahi
m
OMS
nc*
Participants :
27 au 29 oct.
2008
IPA
SF
Laboratoires
Roche
Diagnostic
70
Participants :
Médecins,
biologistes,
TS des CHU
18 oct. Au 30
nov. 2008
ème
2 Forum de PCR en
temps réel et typage
moléculaire des
laboratoires Roche
Participants :
médecins,
pharma, biolo,
et autres
scientifiques
IPA
Hamm
a
Thème : initiation aux
techniques de biologie
moléculaire appliquées
à la bactériologie.
Labo. des
Hépatites
(Virologie)
Observations
ère
Service de
Bactériologie
des Eaux
Formation théorique et
pratique en
bactériologie des eaux
au profit de
« L’Algérienne des
Eaux »
1 session :
10 au 22 mai
2008
?
ème
2 session :
02 au 14 juin
2008
* nc : chiffre non communiqué
37
IPA
SidiFredj
46
Participants :
Biologistes
des unités
d’analyse de
« l’Algérienne
des Eaux »
Pas moins de 288 personnes appartenant au corps de la santé algérien ou
étranger (médecins, biologistes, TS etc…), ont bénéficié d’un cours ou d’un
atelier de formation de l’IPA, en 2008.
Ce chiffre est en hausse par rapport à l’année précédente
(225 personnes formées en 2007)
RECAPITULATIF
Formation des employés de l’IPA en 2008
Au total, 40 employés de l’IPA ont été formés durant l’année 2008
38 employés formés hors de l’IPA (en extra-muros)
02 (!) employés formés à l’intérieur de l’IPA (en intra-muros)
Ce chiffre accuse une tendance générale à la baisse par rapport à l’année 2007 (51
employés formés)
G Les formations des employés en extra-muros (hors de l’IPA) :
• Ont eu lieu essentiellement en Algérie et dans une moindre mesure en France
• Ont été financées essentiellement par l’IPA et par le partenaire français (le
financement personnel, bien que fréquent, étant négligeable du point de vue coût)
• Ont été beaucoup plus théoriques (cours) que pratiques
• Ont été de courtes durées et de longues durées, très peu de moyennes durées
• Ont bénéficiées tant pour les scientifiques que pour les cadres administratifs.
G Les formations des employés à l’intérieur de l’IPA :
• Leur inexistence est responsable de l’écart creusé par rapport à 2007 concernant
le nombre total d’employés formés.
Il convient de rechercher les raisons de cet état de fait : absence de formations
internes offertes en 2008 ? Ou alors défaut au niveau de l’enregistrement et du
recensement des employés formés en interne ?
Formation d’étudiants et personnel de santé algériens ou
étrangers à l’IPA en 2008
Au total, près de 426 personnes : étudiants, médecins, pharmaciens, biologistes,
vétérinaires, techniciens de laboratoire et autre personnel de santé algérien ou
étranger, ont été accueillis pour une formation à l’Institut Pasteur d’Algérie, durant
l’année 2008.
Les formations ont consistées en cours et ateliers ou en stages pratiques en
laboratoire pour la préparation de mémoires ou thèses.
Ce chiffre confirme la tendance générale à la hausse en ce qui concerne l’accueil
des stagiaires dans notre Institut.
Activités de la Bibliothèque
296 Bibliothèque
Bibliothèque
Responsable : Fatma Zohra AIT-OUAMAR (Documentaliste)
La Bibliothèque a été crée le 31 décembre 1909 occupant un pavillon relié aux
laboratoires par une passerelle par précaution d’incendie.
Elle dispose d’un fonds documentaire spécialisé dans la microbiologie de :
- 15303 ouvrages
- 20972 tirés à part et brochures
- 15262 thèses
- Vidéo film : 04
- Cassettes : 06
- Diapositives.
Elle est ouverte au personnel de l’IPA, aux étudiants de l’université d’Alger préparant un
projet de recherche, aux chercheurs et aux personnels enseignants après autorisation.
I- NOUVELLES ACQUISITIONS :
Nous avons reçu en échange, et en don :
- Ouvrages
: 66
- Thèses et mémoires
: 01
- Brochures
: 25
La Bibliothèque reçoit régulièrement certains rapports et séries édités par l’OMS.
Echanges : dans le cadre des échanges avec différentes bibliothèques étrangères
nous avons reçu 51 titres périodiques.
Abonnement :
Réabonnement au J.O année 2008 (5 copies originales et leur traduction).
II. DIFFUSION DE L’INFORMATION :
Diffusion occasionnelle
- Bibliographie : 2 bibliographies ont été établies
- Bibliographies sélectives
Bibliothèque 297
Diffusion active :
La bibliothèque de l’IPA élabore une revue :
- Revue des sommaires : mensuelle ; elle permet de tenir les utilisateurs informés
des articles récemment permes dans les périodiques reçus.
- La revue de presse n’apparaît plus car les abonnements aux quotidiens nationaux
ont été suspendus.
La bibliothèque a enregistré 46 nouveaux lecteurs.
- Inscrits
: 29
- Occasionnels
: 17
IV. Prêts :
• Nombres de prêts externes :
- Ouvrages
: 51
- Périodiques
: 31
• Nombre de prêts internes :
- Ouvrages
: 75
- Périodiques
: 98
NB :
Le taux des prêts à nettement baissé ; du faite du déménagement des laboratoires
au NIPA.
Il est donc impératif d’informatiser la gestion de la Bibliothèque afin d’automatiser ses
services permettant ainsi des consultations à distance.
V. PRODUITS DOCUMENTAIRES ET COLLABORATION :
Sous la direction du Cerist la bibliothèque de l’IPA participe avec d’autres bibliothèques à
la mise à jour de deux catalogues nationaux déjà connus le CAT et le CAP.
VII. LES ARCHIVES DE LA BIBLIOTHEQUE
• Récupération :
- Service ATB : 2 chronos des fiches Diphtérie année 2004 et 2006
• Consultation :
- Service Parasitologie : 1 registre de Toxoplasmose année 2005 et 2006
298 Bibliothèque
Abréviations
300 Abréviations Utilisées
Abréviations Utilisées
Pr
Professeur
DE
Doctorat d’état
M.A.
Maître Assistant
D.M.
Docteur en Médecine
Ing.
Ingénieur
T. S.
Technicien Superieur
INESSM
Institut National d’Enseignement Supérieur en Science Médecine
ISN
Institut des Sciences de la Nature
USTHB
Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumédiène
MSPRH
Ministère de la Santé, de la Population et de la Réforme Hospitalière
CHU
Centre Hospitalo-Universitaire
EHS
Etablissement Hospitalier Spécialisé
INSP
Institut Nationale de la Santé Publique
CTS
Centre de Transmission Sanguine
CPMC
Centre Pierre et Marie Curie
HCA
Hôpital Centre de l’Armée
DEUA
Diplôme d’Etudes Universitaire Approfondies
DES
Diplôme d’Etudes Spécialisées
S.S.
Secteur Sanitaire
O.R.S.
Observations Régionales de la Santé
DSPS
Direction de la Santé et de la Protection Sociale (au niveau des wilayas)
IPA
Abréviations Utilisées 301
302 Abréviations Utilisées
Edition et Publications – ANDS - 2009
Abréviations Utilisées 303