Microorganism identification system of Shimadzu

Microorganism identification system of
Shimadzu
Domaines d’Application
Identification de micro-organismes dans l’industrie alimentaire
Création d’arborescences complètes des micro-organismes de l’environnement
Identification de nouveaux micro-organismes efficaces pour la découverte de médicaments
Surveillance pour gérer et maintenir les collections de micro-organismes
Surveillance des micro-organismes et bactéries pathogènes dans le domaine clinique
Seulement 3 étapes de la préparation à l’identification.
Préparation de l’échantillon
Aucune coloration de Gram au préalable ou évaluation morphologique n’est nécessaire. Aucune
expérience spécialisée ou de connaissances pointues sur les micro-organismes n’est nécessaire.
L’analyse est possible avec quelques microgrammes d’échantillon contenant approximativement
105 bactéries. Comme une seule colonie peut être détectée, les colonies issues de plusieurs
souches bactériennes sur des milieux gélosés ne gênent pas l’analyse.
1ère étape
Déposer les bactéries collectées et la matrice sur une plaque MALDI adaptée.
La méthode de préparation des échantillons est extrêmement simple : juste mélanger les bactéries
et la matrice sur la plaque MALDI*1.
Les plaques MALDI jetables simplifient les manipulations. Vous pouvez choisir parmi les méthodes
préexistantes optimisées de préparation d’échantillon celle qui convient à vos besoins.
2ème étape
Faire l’acquisition avec le MALDI-TOF. Le spectre de masse unique pour l’espèce bactérienne est
obtenu très rapidement.
Les acquisitions sont réalisées en mode automatique en utilisant les méthodes prédéfinies. Aucune
expérience spécifique en spectrométrie de masse n’est requise. Il n’est pas nécessaire de contrôler
chaque spectre de masse.
3ème étape
On compare ensuite le spectre de masse acquis par rapport à une base de données enregistrée
dans le logiciel d’analyse pour classifier et identifier les micro-organismes.
Le processus complet de la recherche en base de données à la présentation des résultats est
entièrement automatisé. Aucun ajustement de paramètres n’est nécessaire
Les bases de données fiables apportent un soutien puissant pour
l’identification des micro-organismes.
Base de données de spectres de masse (SuperSpectra) entièrement validé.
Fully validated spectrum database
SuperSpectra™ - Nombre de spectres de masse enregistrés*2 : > 2,000
Les “SuperSpectra™” contiennent des groups de pics qui agissent en tant que marqueurs de
l’espèce bactérienne pour offrir une identification fiable dans des conditions de croissances
multiples. Ces groupes de pics « marqueurs » sont extraits à partir d’un minimum de 15 spectres
acquis pour chaque souche de micro-organismes obtenus dans différents laboratoires dans des
conditions très variées. Cela permet d’avoir un logiciel d’identification extrêmement performant.
L’identification des micro-organismes par MALDI-TOF souffrait auparavant de reproductibilité. Les «
SuperSpectra™ » permettent de s’affranchir de ces problèmes pour réduire de manière significative
les erreurs d’identification. Les « SuperSpectra™” et les autres bases de données contiennent
environ 40000 spectres de masse. Des bases de données sont également disponibles pour des
espèces bactériennes rares.
Des bases de données personnalisables pour supporter tous les
domaines (option)
Il est facile d’enregistrer un nouveau micro-organisme dans la base. Les opérations pour extraire le
groupe de pics “marqueurs” de l’espèce sont simples et intuitives. Cela permet à l’utilisateur de
développer rapidement sa propre base de données avec une haute qualité de spectres.
*1 Toujours inactiver les échantillons infectieux ou potentiellement infectieux avant de manipuler.
*2 Le nombre total de spectres de masse peut changer en raison de l'optimisation de la base de
données.