ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE

ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE
Dossier de demande d'allocation de recherche pour la rentrée 2012
Laboratoire d'accueil:
Département d’Oncogénétique du Centre Jean Perrin –ERTICA (N° en cours), CBRV, 28 Place Henri
Dunant
63001 Clermont-Ferrand.
Directeur du laboratoire du CJP : Pr Yves-Jean Bignon
Directrice de l’EA : Pr Frédérique Penault-Llorca
Directeur de thèse : Dominique Bernard-Gallon
Date d'obtention de l'HDR du Directeur de thèse :
20 Juin 1986 (Ancienne Thèse d’Etat)
Titre de la thèse : « Epigénétique, Soja : Une Etude dans les Cancers du Sein »
Exposé du sujet proposé:
Dans les populations asiatiques qui consomment beaucoup de soja, une incidence plus faible
de cancer du sein a été retrouvée. Ces données soutiennent l'hypothèse que les différences de mode de
vie, en particulier les changements alimentaires et autres interactions gènes-nutriments, jouent un rôle
important dans les cancers hormono-dépendants. Des études ont montré que la génistéine (principal
phyto-œstrogène) est un agent anticancéreux potentiellement chimio-préventif dans les cancers du sein
et entraîne des changements épigénétiques (méthylation de l’ADN et modifications des histones) :
modifications fréquemment associées à l’expansion d’une cellule cancéreuse hormis les mutations
directes de l’ADN.
Le projet consiste à comprendre l’implication des phyto-œstrogènes du soja. Par la méthode
d’immunoprécipitaion de l’ADN méthylé (MeDIP), qui permet d’étudier les modifications causées par
ces composés sur la méthylation, on a montré une action déméthylante de ces isoflavones au niveau
des promoteurs des gènes oncosuppresseurs. Ces résultats ont ensuite été confirmés par imagerie
confocale et western-blot qui ont permis de mettre en évidence une augmentation de l’expression des
protéines après traitement par les phyto-œstrogènes. Ces résultats laissent supposer leur rôle protecteur
dans la genèse des cancers du sein. La suite de ce travail est d’étudier les effets des phyto-œstrogènes
du soja (génistéine, daidzéine, équol) toujours sur les lignées continues humaines tumorales, mais au
niveau de la chromatine, sur les modifications post-traductionnelles des histones qui constituent un
mécanisme important dans la régulation de l’expression des gènes.
Liste des 8 meilleures publications du Directeur de thèse de 2007 à 2011
1-N. CHALABI, Y.J. BIGNON, D.J. BERNARD-GALLON. Expression profiling by whole-genome microarray
hybridization reveals differential gene expression in breast cancer cell lines after lycopene exposure. BBA 2007 ;
1769 : 124-130. IF=3.4
2-N.CHALABI, L. DELORT, S. SATIH, P. DECHELOTTE, Y.J. BIGNON, D.J. BERNARD-GALLON.
Immunohistochemical expression of RARα, RARβ and connexin 43 in breast tumor cell lines after treatment
with lycopene and correlation with RT-QPCR. Journal of Histochemistry and Cytochemistry 2007 ; 55 :877-883.
IF=2.4
1
3-D. BERNARD-GALLON, R. BOSVIEL, L. DELORT, L. FONTANA, A. CHAMOUX, N. RABIAU, F.
KWIATKOWSKI, N. CHALABI, S. SATIH, Y.-J. BIGNON. DNA repair gene ERCC2 polymorphisms and
associations with breast and ovarian cancer risk. Molecular Cancer 2008 , 7 (1) : 36. IF=4.02
4-L. DELORT, S. SATIH, F. KWIATKOWSKI, Y.J. BIGNON, D.J. BERNARD-GALLON. Evaluation of
breast cancer risk in a multigenic model including low penetrance genes involved in xenobiotic and estrogen
metabolisms. Nutrition & Cancer 2010; 62 (2) : 243-51. IF=1.974
5-R. BOSVIEL, E. DUMOLLARD, P. DECHELOTTE, YJ. BIGNON, DJ. BERNARD-GALLON. Can Soy
Phytoestrogens decrease DNA methylation in BRCA1 and BRCA2 Oncosuppressor Genes in Breast Cancer Cell
Lines? OMICS 2012 Fev 17. IF=1.944
6- R. BOSVIEL, E. MICHARD , G. LAVEDIAUX , F. KWIATKOWSKI , YJ. BIGNON, DJ. BERNARDGALLON. Peripheral blood DNA methylation detected in the BRCA1 or BRCA2 promoter for sporadic ovarian
cancer patients and controls.Clin Chim Acta. 2011 Jul 15;412(15-16):1472-5. IF=2.388
7- M. ADJAKLY R. BOSVIEL, N. RABIAU, J-P BOITEUX, YJ. BIGNON, L. GUY , DJ. BERNARDGALLON. DNA Methylation and Soy Phytoestrogens: Quantitative Study in DU-145 and PC-3 Human Prostate
Cancer Cell Lines. Epigenomics, Dec 2011,.3, No. 6, 795-803. IF=3.429
8-R. BOSVIEL, J.,DURIF, P. DECHELOTTE, YJ. BIGNON, DJ. BERNARD-GALLON. Epigenetic
modulation of BRCA1 and BRCA2gene expression by equol in breast cancer cell lines. Br J of Nutr 2012; Jan 5;
1-5. IF=3.072.
Liste des thèses dirigées ou co-dirigées par le Directeur de thèse de 2007 à 2011
1. L. DELORT (15 novembre 2007). Allocataire de l’ARC. Lauréate en 2005 pour la bourse d'étude "Gabrielle
Mosnier", Clermont-Ferrand. Vacataire en Botanique, Faculté de Pharmacie, Clermont-Ferrand I.
2. S. SATIH (8 Décembre 2008). Allocataire du Centre Jean Perrin, Vacataire en Histologie à l'IUT de Génie
Biologique, Clermont-Ferrand I, Vacataire en immunologie à Polytech’Clermont.
3. N. RABIAU (10 mars 2010). Boursière CIFRE. (Jacques Dauplat, Directeur de thèse) Clermont-Ferrand II.
4. R. BOSVIEL (2 décembre 2011). Boursier Région Auvergne. Clermont I.
Liste des publications issues de la thèse des étudiants mentionnés ci-dessus (encadrés par Directeur)
S. SATIH, H. SAVINEL, N. RABIAU, L. FONTANA, Y.-J. BIGNON, D.J. BERNARD-GALLON Expression analyses of nuclear receptor
genes in breast cancer cell lines exposed to soy phytoestrogens after BRCA2 knockdown by TaqMan Low Density Array (TLDA). J Mol
Signal 2009 ; 4 (1) : 3.
L. DELORT, F. KWIATKOWSKI, N. CHALABI, S. SATIH, Y.J. BIGNON, D.J. BERNARD-GALLON.Central adiposity as a major risk
factor for ovarian cancer.Anticancer Research 2009 ; 29 (12) : 5229-5234.
D.J. BERNARD-GALLON, S. SATIH, N. CHALABI, N. RABIAU, R. BOSVIEL, L.FONTANA, Y.-J. BIGNON. Phytoestrogens
regulate the expression of genes involved in different biological processes in BRCA2 knocked down MCF-7, MDA-MB-231, and MCF-10a
cell lines.Oncology reports 2010 ; 23 : 647-653.
S. SATIH, N. CHALABI, N. RABIAU,Y.J. BIGNON, D. J. BERNARD-GALLON.Transcriptional profiling of breast cancer cells exposed
to soy phytoestrogens after BRCA1 knockdown with a whole human genome microarray approach. Nutrition & Cancer 2010, 62 (5) :659-67.
N. RABIAU, M. KOSSAI, M. BRAUD, N. CHALABI, S. SATIH, Y.-J. BIGNON, D.J. BERNARD-GALLON .Genistein and Daidzein Act
on a Panel of Genes implicated in Cell Cycle and Angiogenesis by PCR Arraysin Human Prostate Cancer Cell Lines.Cancer Epidemiology
2010 (Janv 22),En ligne.
N.CHALABI, V. COXAM, S. SATIH, M.J. DAVICCO, P. LEBECQUE, L. FONTANA, Y.J. BIGNON, D.J. BERNARD- GALLON.Gene
signature of rat mammary glands: influence of lifelong soy isoflavones consumption. Mol Med Reports 2010; 3 :75-81.
S. SATIH, N. CHALABI, N. RABIAU, R. BOSVIEL, L. FONTANA, Y.-J. BIGNON , D.J. BERNARD-GALLON .Gene expression
profiling of breast cancer cell lines in response to soy isoflavones using a pangenomic microarray approach. OMICS 2010 , 14 (3):231-8.
L. DELORT, S. SATIH, F. KWIATKOWSKI, Y.J. BIGNON, D.J. BERNARD-GALLON .Evaluation of breast cancer risk in a multigenic
model including low penetrance genes involved in xenobiotic and estrogen metabolisms.Nutrition & Cancer 2010; 62 (2) : 243-51.
A. VARDI, R. BOSVIEL, N. RABIAU, M. ADJAKLY, S. SATIH, P. DECHELOTTE, J.P. BOITEUX, L. FONTANA, Y.J. BIGNON,
L. GUY, D.J. BERNARD-GALLON. Soy phytoestrogens modify DNA methylation of GSTP1, RASSF1A, EPH2 and BRCA1 promoter in
prostate cancer cells. In Vivo 2010 ; 24(4):393-400.
N. RABIAU , P. DECHELOTTE, M. ADJAKLY, J-L. KEMENY , L. GUY, J.P. BOITEUX , F. KWIATKOWSKI, Y.J. BIGNON, D.J.
BERNARD-GALLON. BRCA1, BRCA2, AR and IGF-I gene expression in prostate cancer : Correlation between RT-qPCR and
immunohistochemical detection. Oncology Reports 2011; 26 : 695-702.
2
R. BOSVIEL, E. MICHARD , G. LAVEDIAUX , F. KWIATKOWSKI , YJ. BIGNON, DJ. BERNARD-GALLON. Peripheral blood DNA
methylation detected in the BRCA1 or BRCA2 promoter for sporadic ovarian cancer patients and controls.Clin Chim Acta. 2011 Jul
15;412(15-16):1472-5.
R. BOSVIEL, J.,DURIF, P. DECHELOTTE, YJ. BIGNON, DJ. BERNARD-GALLON. Epigenetic modulation of BRCA1 and BRCA2gene
expression by equol in breast cancer cell lines. Br J of Nutr 2012; Jan; 1-5.
R. BOSVIEL, E. DUMOLLARD, P. DECHELOTTE, YJ. BIGNON, DJ. BERNARD-GALLON. Can Soy Phytoestrogens decrease DNA
methylation in BRCA1 and BRCA2 Oncosuppressor Genes in Breast Cancer Cell Lines? OMICS 2012 Fev 17.
N. RABIAU , HK TRRAF, M. ADJAKLY, R. BOSVIEL, L. GUY , L. FONTANA, YJ. BIGNON, DJ. BERNARD-GALLON. miRNAs
Differentially Expressed in Prostate Cancer Cell Lines after Soy Treatment. In Vivo. 2011 Nov;25 (6 ):917-21.
M. ADJAKLY R. BOSVIEL, N. RABIAU, J-P BOITEUX, YJ. BIGNON, L. GUY , DJ. BERNARD-GALLON. DNA Methylation and Soy
Phytoestrogens: Quantitative Study in DU-145 and PC-3 Human Prostate Cancer Cell Lines. Epigenomics, Dec 2011,.3, No. 6, 795-803.
R. BOSVIEL, S. GARCIA, G.LAVEDIAUX, E. MICHARD, M. DRAVERS, F.KWIATKOWSKI, YJ. BIGNON, DJ.BERNARDGALLON. BRCA1 promoter methylation in peripheral blood DNA was identified in sporadic breast cancer and controls. Cancer
Epidemiology 2012.
Devenir des anciens étudiants mentionnés ci-dessus
L. DELORT : MCU au Laboratoire de Botanique – Faculté de Pharmacie, depuis 2008.
S. SATIH : Vacataire à l’IUT. CPE non titulaire à Thiers.
N. RABIAU: Attachée de recherche clinique – CHU Estaing depuis Décembre 2011.
R.BOSVIEL: ANPE.
Contrats obtenus pendant la période 2007-2011. Contrats de recherche en tant qu’investigateur.
1-CLARA Projets Structurants Axe III, 2008. 9.500 €. BERNARD-GALLON Dominique, BENNETAUPELISSERO Catherine, CAVINENC-LAVIER Marie-Chantal. Effets ambivalents des phyto-œstrogènes du soja
dans les cancers du sein.
2-Ligue Nationale Contre le Cancer (Comités de Cantal, Puy-de-Dôme et Allier), 2008. 25.000 €.Effets
ambivalents des phyto-œstrogènes du soja dans les cancers du sein. 75.000 €. Cofinancement d’un scanner
Agilent (145.000 €) avec le centre Jean Perrin.
3- Concours National 2010 d’Aide à la Création d’Entreprise de Technologies Innovantes. Ministère de
l’Enseignement Supérieur et de la Recherche, 2010. 30 000€. Nadège Rabiau. Lauréate de la catégorie « en
émergence » intitulé : De la signature moléculaire du cancer de la prostate à la création d’Oncodiag.
4- Ligue Nationale Contre le Cancer (Comités du Cantal, Puy-de-Dôme et Allier), 2010. 18.000 €. Effets
ambivalents des phyto-œstrogènes du soja dans les cancers du sein.
5- Ligue Nationale Contre le Cancer (Comités du Cantal, Puy-de-Dôme et Allier), 2011.
35.000€. Equipement- Cofinancement à 50% avec le CJP .
Observations
- En tant que Directeur de thèse, j’ai seulement Melle Aslihan Dagdemir en 1ème année de thèse (financé par
Protema Saglik Hizm. A.S. Dr Altan Yalçiner –Turquie) depuis Novembre 2011.
- Dans le laboratoire au CBRV, il y a aussi Melle M. Adjakly en 3ème année de thèse (financé par le CJP) avec
Pr L.Guy en Directeur de thèse. La soutenance est prévue le 30 Nov. 2012. Elle a une publication en 1er auteur
dans Epigenomics.
3
Département d’Oncogénétique du Centre Jean Perrin /CBRV– ERTICA (F. Penault-Llorca))
Directeur de thèse : Dominique Bernard-Gallon (Ingénieur biologiste CLCC)
[email protected]
Epigénétique, Soja : Une Etude dans les Cancers du Sein
Les phyto-œstrogènes sont des molécules naturelles qui entrent dans la consommation
humaine. Les plus étudiés sont les phyto-œstrogènes du soja. Les données épidémiologiques et
mécanistiques suggèrent que ces composés exercent un effet protecteur des cancers du sein lors
d’expositions précoces alors que des expositions plus tardives ne sont pas protectrices voire
accélèreraient la prolifération de tumeurs œstrogéno-dépendantes.
Nous nous proposons d’étudier différentes concentrations d’isoflavones du soja (génistéine,
daidzéine et S-équol) sur des lignées continues de cellules mammaires (MCF-7, MDA-MB-231, MCF
10a, SUM 1315) pendant 48h, mais au niveau de la chromatine, sur les modifications posttraductionnelles des histones qui constituent un mécanisme important dans la régulation de
l’expression des gènes. Pour cela, nous réalisons des immunoprecipitations de la chromatine (ChIP),
suivies d’études de différents gènes en ChIP-PCR dans le but de proposer un mécanisme d’action du
soja sur la régulation dans le tissu mammaire.
Bosviel, et al. (2012). Epigenetic modulation of BRCA1 and BRCA2 gene expression by equol in
breast cancer cell lines. Br J Nutr Jan : 1-5.
Bosviel, et al. (2012). Can soy phytoestrogens decrease DNA methylation in BRCA1 and BRCA2
oncosuppressor genes in breast cancer cell lines? OMICS Feb 17.
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