Liste des sujets de stages M2 - Les formations à l`université de

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MASTER SCIENCES-TECHNOLOGIES-SANTE
MENTION SCIENCES-VIE-SANTE (SVS)
M2 RECHERCHE
spécialité
SIGNALISATION CELLULAIRE et MOLECULAIRE (SCM)
SUJETS DE STAGES et REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
des LABORATOIRES D’ACCUEIL
2016-2017
UNIVERSITE DE BOURGOGNE FRANCHE-COMTE
1
Résumé des possibilités et laboratoires/équipes d’accueil
Laboratoires site de Dijon
Equipe
Possibilités
d’accueil
page
UMR INSERM U866 / Université de
Bourgogne
Lipides, Nutrition, Cancer
- Protéines de choc thermique : mort cellulaire, différenciation
cellulaire et propriétés tumorigéniques
- Chimiothérapie, métabolisme des lipides et réponse immunitaire antitumorale
- Régulation génique dans l’hématopoïèse et la leucémogenèse
- Physiopathologie et pharmacologie cardio-métaboliques
- Physiopathologie des dyslipidémies
- Protéines de transfert des lipides et métabolisme des lipoprotéines
11
4
7
6
1
1
2
4
7
8
8
9
Evaluation de la réponse antitumorale du monoxyde d’azote (NO)
associé à des chimiothérapies standards ou nouvelles: analyse des
mécanismes d’action
2
10
1
11
Pôle déterminismes Génétiques et Environnementaux de l’Adaptation
des Plantes à des Systèmes de culture Innovants
- Equipe FILEAS (FILing – Abiotic Stresses) aux recherches centrées sur
l’augmentation du potentiel de rendement et de qualité des graines de
pois sous contraintes abiotiques
2
12
- Perception Sensorielle, Interactions Glie/Neurones
- Mécanismes de plasticité et perception chimiosensorielle
- Œil, nutrition et signalisation cellulaire
1
3
3
13
14
15
3
16
- Radiothérapie / Radiobiologie, Unité de recherche préclinique et
translationnelle
1
17
- Interaction Candida albicans - Hôte
1
18
- Imunorégulation et immunopathologie (équipe localisée à la faculté
de médecine de Dijon)
2
19
EA 7269 Université de Bourgogne /
EPHE
Immunologie et Immunothérapie
des Cancers
UMR 1347 INRA/Université de
Bourgogne/AgroSup Dijon
Centre des Sciences du Goût et de
l'Alimentation (CSGA)
UMR 6265 CNRS, INRA, Université
de Bourgogne,
AgroSup Dijon
Pôle Interactions plantes-microorganismes - ERL CNRS 6300
- Equipe Santé des plantes : mycorhizes et défense
EA4271 Génétique des Anomalies
du développement, IFR Santé STIC
/Université de Bourgogne
Département de
Radiothérapie/Radiobiologie
Centre Georges François Leclerc
UMR PAM Université de
Bourgogne-AgroSup Dijon
UMR Inserm 1098 / Université de
Bourgogne Franche Conté
Interaction Hôte-Greffon-Tumeur
et Ingénierie Cellulaire et Génique
2
Laboratoires site Besançon
Possibilité
d’accueil
page
EA3181/Université
de Franche-Comté
Carcinogenèse épithéliale
3
21
EA3922/ SFR IBCT FED 4234
Estrogènes, Expression Génique et
Pathologies du Système Nerveux
Central
1
22
- Laboratoire de virologie
- Laboratoire de bactériologie
1
1
23
23
EquipeThérapeutique immunomoléculaire des cancers
1
24
EA 4266/Université
de Franche-Comté
Agents Pathogènes &
Inflammation
UMR Inserm 1098 / Université de
Bourgogne Franche Conté
Interaction Hôte-Greffon-Tumeur
et Ingénierie Cellulaire et Génique
Equipe
Contacts
Responsable du M2R SCM, site de Dijon: Pr. David WENDEHENNE
Tel: 03 80 69 37 22
Email: [email protected]
Secrétariat du site de Dijon :
Tel : 03 80 39 50 32
Email : [email protected]
Responsable du M2R SCM, site de Besançon: Pr. Régis DELAGE-MOURROUX
Tél: 03 81 66 66 24
Secrétariat site de Besançon:
Tel: 03 81 66 65 67 (matin); Fax : 03 81 66 62 67
IMPORTANT
Les étudiants postulant au M2R SCM doivent obligatoirement préciser dans leur dossier de
candidature le laboratoire d'accueil où ils choisissent de réaliser leur stage ainsi que le sujet de
recherche sur lequel ils travailleront. Il est donc vivement conseillé de prendre contact avec les
équipes de recherche avant de déposer le dossier de candidature (les adresses emails et n° de
télephone des encadrants sont indiqués dans le présent document).
3
Sujets de stage, site de l'Université de Bourgogne (Dijon)
___________________________________________________________________________
Laboratoire d’accueil
UMR Inserm U866/Université de Bourgogne
Lipides, Nutrition, Cancer
7 boulevard Jeanne d’Arc,
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Laurent Lagrost
Coordonnées
Tél. : 03 80 39 33 53
Fax : 03 80 39 34 34
ou [email protected]

Equipe Protéines de choc thermique: mort cellulaire, différenciation cellulaire et propriétés
tumorigéniques
Responsable: Carmen Garrido ([email protected])
Possibilités d’accueil: 11
Sujet de Stage 1: Analyse de la structure et fonction des récepteurs TRAIL-R1 et TRAIL-R2 dans des
lignées cellulaires déficientes obtenues par «gene editing »
Maître de stage: O. Micheau
Tel: 03 80 39 34 68
E-mail: [email protected]
Sujet de stage 2: Rôle de HSF1 dans l’érythropoïèse précoce
Maître de stage: C. Garrido
Tel: 03 80 39 32 56
Sujet de stage 3: Rôle d’HSP27 extracellulaire dans la fibrose pulmonaire idiopathique et ses
exacerbations aigues
Maître de stage: P. Bonniaud & F. Goirand
Tel: 03 80 39 3284
Sujet de stage 4: Rôle des jonctions communicantes et de leurs protéines de structure, les
connexines, dans le développement des tumeurs solides
Maître de stage: D. Thuringer
Tel: 03 80 39 34 17
Sujet de stage 5: Rôle de HSP70/HSP110 dans le lymphome primitif B du médiastin
Maître de stage: G. Jego
Tel: 03 80 39 33 45
4
Sujet de stage 6: Vectorisation de médicaments par les lipoprotéines: application au cancer
colorectal
Maître de stage: F. Lirussi
Tel: 03 80 39 3284
Sujet de stage 7: Inhibition des HSPs en oncologie
Maître de stage: R. Seigneuric
Tél: 03 80 39 33 45
Sujet de stage 8: Rôle de la protéine de choc thermique Gp96 dans l’inflammation intestinale
Maître de stage: E. Kohli
Tél: 03 80 29 34 37 E-mail: [email protected]
Sujet de stage 9: Effet adjuvant de la sous-unité B de l’entérotoxine thermolabile d’E. coli : rôle de
l’apoptose des cellules T et de gp96
Maître de stage: C. Basset
Tél: 03 80 39 32 19
Sujet de stage 10: Coopération entre les protéines de chocs thermiques et la signalisation des
dommages à l’ADN dans l’homéostasie des cellules souches intestinales et en conditions
pathologiques
Maître de stage: O. Deminov
Tel: 03 80 39 32 84
Sujet de stage 11: La régulation du cycle circadien par HSF1 chez le poisson zèbre
Maître de stag : J. Chluba
Tel: 03 80 39 62 23
Références bibliographiques
IC, Demarest S, de Beauchêne IC, Belaid-Choucair Z, Sevin M, Maciel TT, Auclair C, Leboulch P,
Chretien S, Tchertanov L, Baudin-Creuza V, Seigneuric R, Fontenay M, Garrido C, Hermine O, Courtois
G. HSP70 sequestration by free a-globin promotes ineffective erythropoiesis in b-thalassaemia.
Nature 514, 242-246, 2014
Burgy O, Wettstein G, Bellaye PS, Decologne N, Racoeur C, Goirand F, Beltramo G, Hernandez JF,
Kenani A, Camus P, Bettaieb A, Garrido C, Bonniaud P. Bleomycin, while keeping bleomycin's
antitumor activity, lacks its pulmonary toxicity. Science Transl Med, In Press
Gobbo J, Marcion G, Cordonnier M, Dias A, Pernet N, Hammann A, Richaud S, Mjahed H, Isambert N,
Clausse V, Rébé C, Bertaut A, Goussot V, Lirussi F, Ghiringhelli F, de Thonel A, Fumoleau P, Seigneuric
R and Garrido C. Restoring anticancer immune response by targeting tumor-derived exosomes with a
HSP70 peptide aptamer. JNCI, In Press
5
Joly AL, Deepti A, Seignez A, Demidova A, Hebrard S, Schmitt E, Richaud S, Fourmaux E, Hammann A,
Collura A, Svrcek M, Jego G, Robinet E, Solary E, Demidov O, Kohli E and Garrido C. The HSP90
inhibitor, 17AAG, protects the intestinal stem cell niche and inhibits graft versus host disease
development. Oncogene, In Press
Zakaria AB, Picaud F, Rattier T, Pudlo M, Dufour F, Saviot L, Chassagnon R, Lherminier J, Gharbi T,
Herlem G and Micheau O. Nanovectorization of TRAIL with single wall carbon nanotubes enhances
tumor cell killing. Nano Letters 15, 891–895, 2015

Equipe Chimiothérapie, métabolisme des lipides et réponse immunitaire anti-tumorale
Responsable: Pr François Ghiringhelli ([email protected])
Sujet de Stage 1: Rôle des infiltrats immunitaires dans les glioblastomes humains
Maître de stage: F. Ghiringhelli
Tel: 03 80 39 33 71
Sujet de Stage 2: Evaluation et impact pronostic du micro-environnement tumoral dans les cancers
du sein de petite taille, RH+, N- ; et corrélation avec l’hétérogénéité moléculaire
Maître de stage: S. Ladoire
Tel: 03 80 39 33 71
Sujet de Stage 3: Impact de la chimiothérapie sur la polarisation Th1
Maître de stage: R. Boidot
Tel: 03 80 73 75 00, poste 3185
Sujet de Stage 4: NLRP3 et différenciation Th17
Maître de stage: F. Végran
Tel: 03 80 39 33 71
Sujet de Stage 5: Etude des mécanismes moléculaires conduisant à l'activation de linflammasome
NLRP3
Maître de stage: C. Rébé
Tel: 03 80 39 33 53
Sujet de Stage 6: Signalisation PD-L1 et cancer
Maître de stage: M. Rialland
Tel: 03 80 39 63 14
Sujet de Stage 7: Etude des mécanismes moléculaires de résistance aux agents anticancéreux:
modulation par des biomolécules naturelles
6
Maître de stage: Dominique Delmas & Virginie Aires
Tel: 03 80 39 32 26
E-mail: [email protected], [email protected]
Références bibliographiques:
Bruchard M, Rébé C, Dérangère V, Togbé D, Ryffel B, Boidot R, Humblin E, Hamman A, Chalmin F,
Berger H, Chevriaux A, Limagne E, Apetoh L, Végran F, Ghiringhelli F . The receptor NLRP3 is a
transcriptional regulator of TH2 differentiation. Nat Immunol 16, 859-870, 2015
Végran F, Mary R, Gibeaud A, Mirjolet C, Collin B, Oudot A, Charon-Barra C, Arnould L, Lizard-Nacol S,
Boidot R. Survivin-3B potentiates immune escape in cancer but also inhibits the toxicity of cancer
chemotherapy. Cancer Res 73, 5391-5401, 2013
Ladoire S, Enot D, Senovilla L, Ghiringhelli F, Poirier-Colame V, Chaba K, Semeraro M, Chaix M,
Penault-Llorca F, Arnould L, Poillot ML, Arveux P, Delaloge S, Andre F, Zitvogel L, Kroemer G. The
Presence Of Lc3b Puncta And Hmgb1 Expression In Malignant Cells Correlate With The Immune
Infiltrate In Breast Cancer. Autophagy 16:0, 2016
Courtaut F, Derangère V, Chevriaux A, Ladoire S, Cotte AK, Arnould L, Boidot R, Rialland M,
Ghiringhelli F, Rébé C. Liver X Receptor ligand cytotoxicity in colon cancer cells and not in normal
colon epithelial cells depends on LXRβ subcellular localization. Oncotarget 6, 26651-26662, 2015
Aires V, Limagne E, Cotte AK, Latruffe N, Ghiringhelli F, Delmas D. Resveratrol metabolites inhibit
human metastatic colon cancer cells progression and synergize with chemotherapeutic drugs to
induce cell death. Mol Nutr Food Res 57, 1170-1181, 2013

Equipe Régulation génique dans l'hématopoïèse et la leucémogenèse
Responsable: Laurent Delva ([email protected])
Sujet de Stage 1 : Régulation de la voie intrinsèque de l’apoptose par les IAP
Maître de stage: L. Dubrez
Tél: 03 80 39 32 26
Dubrez L, Rajalingam K. IAPs and cell migration. Semin Cell Dev Biol 9, 124-31, 2015
Marivin A, Berthelet J, Cartier J, Paul C, Gemble S, Morizot A, Boireau W, Saleh M, Bertoglio J, Solary E and
Dubrez L. cIAP1 regulates TNF-mediated cdc42 activation and filopodia formation. Oncogene 33, 55345545, 2014
Berthelet J, Dubrez L. Regulation of Apoptosis by Inhibitors of Apoptosis (IAPs). Cells 2, 163-187, 2013
Cartier J, Berthelet J, Marivin A, Gemble S, Edmond V, Plenchette S, Lagrange B, Hammann A, Dupoux A,
Delva L, Eymin B, Solary E, Dubrez L. Cellular inhibitor of apoptosis protein-1 (cIAP1) can regulate E2F1
transcription factor-mediated control of cyclin transcription. J Biol Chem 286, 26406-26417, 2011
Dupoux A, Cartier J, Cathelin S, Filomenko R, Solary E, Dubrez-Daloz L. cIAP1-dependent TRAF2
7
degradation regulates the differentiation of monocytes into macrophages and their response to CD40ligand. Blood 113, 175-185, 2009

Laboratoire de Physiopathologie et Pharmacologie Cardio-Métaboliques (LPPCM)
Responsables: Catherine Vergely ([email protected]) et Yves Cottin ([email protected])
Sujet de Stage: Programmation périnatale du risque cardiovasculaire et métabolique par
l’alimentation
Maître de stage: C. Vergely
Tel: 03 80 39 32 92 ou 03 80 39 34 60
Rochette L. and Vergely C. Coronary artery disease: Can aminothiols be distinguished from reactive
oxygen species? Nat Rev Cardiol 2016 13, 128-130, 2016
Rochette L., Guenancia C., Gudjoncik A., Hachet O., Zeller M., Cottin Y. and Vergely C.
Anthracyclines/trastuzumab: new aspects of cardiotoxicity and molecular mechanisms. Trends
Pharmacol Sci 36, 326-348, 2015
Habbout A, Li N, Rochette L and Vergely C. Postnatal overfeeding in rodents by litter size reduction
induces major short- and long-term pathophysiological consequences. J Nutr 143, 553-562, 2013
Habbout A, Guenancia C, Lorin J, Rigal E, Fassot C, Rochette L and Vergely C. Postnatal overfeeding
causes early shifts in gene expression in the heart and long-term alterations in cardiometabolic and
oxidative parameters. PLoS One 8(2): e56981, 2013
Habbout A, Delemasure S, Goirand F, Guilland JC, Chabod F, Sediki M, Rochette L and Vergely C.
Postnatal overfeeding in rats leads to moderate overweight and to cardiometabolic and oxidative
alterations in adulthood. Biochimie 2012 94, 117-124, 2012

Equipe Physiopathologie des Dyslipidémies
Responsable: Bruno Vergès ([email protected])
Sujet de Stage 1: Obésité, diabète de type II et inflammation. Quel rôle pour le système
endocannabinoïde périphérique?
Maître de stage: P. Degrace & L. Demizieux
Tel: 03 80 39 37 36
Sujet de stage 2 : Influence des analogues du GLP-1 sur le sphingophospholipidome et la
fonctionnalité des HDL
Maître de stage: L. Duvillard
Tél : 03 80 29 36 46
E-mail : [email protected]
8
Jourdan T, Djaouti L, Demizieux L, Gresti J, Vergès B, Degrace P. CB1 antagonism exerts specific
molecular effects on visceral and subcutaneous fat and reverses liver steatosis in diet-induced obese
mice. Diabetes 59, 926–934, 2010
Jourdan T, Demizieux L, Gresti J, Djaouti L, Gaba L, Vergès B, Degrace P. Antagonism of peripheral
hepatic cannabinoid receptor-1 improves liver energy metabolism in mice: Evidence from cultured
explants. Hepatology 55,790-799, 2012
Jourdan T, Godlewski G, Cinar R, Bertola A, Szanda G, Liu J, Tam J, Han T, Mukhopadhyay B, Skarulis
MC, Ju C, Aouadi M, Czech MP, Kunos G. Activation of the Nlrp3 inflammasome in infiltrating
macrophages by endocannabinoids mediates beta cell loss in type 2 diabetes. Nat Med. 19, 11321140, 2013
Denimal D, Nguyen A, Pais de Barros JP, Bouillet B, Petit JM, Vergès B, Duvillard L. Major changes in
the sphingophospholipidome of HDL in non-diabetic patients with metabolic syndrome.
Atherosclerosis 246, 106-114, 2016
Denimal D, Pais de Barros JP, Petit JM, Bouillet B, Vergès B, Duvillard L. Significant abnormalities of
the HDL phosphosphingolipidome in type 1 diabetes despite normal HDL cholesterol concentration.
Atherosclerosis 241, 752-760, 2015

Equipe Protéines de transfert des lipides et métabolisme des lipoprotéines
Responsable: Laurent Lagrost ([email protected])
Sujet de Stage 1: Utilisation de liposomes ou de lipoprotéines pour vectoriser des agents
pharmacologiques modulateurs de la mitophagie afin de moduler de manière ciblée la réponse
inflammatoire des macrophages in vivo
Maître de stage: C. Thomas
Tel: 03 80 39 63 19
Sujet de Stage 2: Métabolisme de l'acide arachidonique et fonctions des cellules myéloides. Rôle de
LPCAT3
Maître de stage: D. Masson
Tel: 03 80 39 32 64
Sujet de Stage 3: Protéine de Transfert des PhosphoLipides (PLTP), inflammation à bas bruit et
maladies métaboliques
Maître de stage: J. Grober
Tel: 03 80 39 32 64
Sujet de Stage 4: Interaction biliaire et effets pro-inflammatoires des endotoxines bactériennes (LPS)
Maître de stage: S. Mandard
Tel: 03 80 39 32 66
9
Varin A, Thomas C, Ishibashi M, Ménégaut L, Gautier T, Trousson A, Bergas V, de Barros JP, Narce M,
Lobaccaro JM, Lagrost L, Masson D.Liver X receptor activation promotes polyunsaturated fatty acid
synthesis in macrophages: relevance in the context of atherosclerosis. Arterioscler Thromb Vasc Biol
35, 1357-65, 2015
Gautier T, Klein A, Deckert V, Desrumaux C, Ogier N, Sberna AL, Paul C, Le Guern N, Athias A,
Montange T, Monier S, Piard F, Jiang XC, Masson D, Lagrost L. Effect of plasma phospholipid transfer
protein deficiency on lethal endotoxemia in mice. J Biol Chem 283, 18702-18710, 2008
Ishibashi M, Varin A, Filomenko R, Lopez T, Athias A, Gambert P, Blache D, Thomas C, Gautier T,
Lagrost L, Masson D. Liver x receptor regulates arachidonic acid distribution and eicosanoid release in
human macrophages: a key role for lysophosphatidylcholine acyltransferase 3. Arterioscler Thromb
Vasc Biol 33, 1171-1179, 2013.
Nguyen AT, Mandard S, Dray C, Deckert V, Valet P, Besnard P, Drucker DJ, Lagrost L, Grober J.
Lipopolysaccharides-mediated increase in glucose-stimulated insulin secretion: involvement of the
GLP-1 pathway. Diabetes. 63, 471-482, 2014
Nicolas-Francès V, Arnauld S, Kaminski J, Ver Loren van Themaat E, Clémencet MC, Chamouton J,
Athias A, Grober J, Gresti J, Degrace P, Lagrost L, Latruffe N, Mandard S. Disturbances in cholesterol,
bile acid and glucose metabolism in peroxisomal 3-ketoacylCoA thiolase B deficient mice fed diets
containing high or low fat contents. Biochimie 98, 86-101, 2014

_________________________________________________________________
EA 7269 Université de Bourgogne – EPHE Associée à l’Inserm UMR866
Immunologie et Immunothérapie des Cancers
Evaluation de la réponse antitumorale du monoxyde d’azote (NO) associé à
des chimiothérapies standards ou nouvelles: analyse des mécanismes
d’action
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Ali Bettaieb
Coordonnées
Tel: 03 80 39 34 51
Fax : 03 80 39 34 34

Possibilités d’accueil : 2
Sujet de Stage 1: paysage mutationnelle immunogène du cancer du sein HER2 + et triple négatif et
de son évolution au cours des chimiothérapies néo-adjuvantes
Maître de stage: C. Paul
Tel: 03 80 39 34 19
Sujet de Stage 2: Etude préclinique de l’effet anti-tumoral d’un mimétique de Smac utilisé en
combinaison avec la trinitrine.
Maître de stage: S. Plenchette
10
Tel: 03 80 39 33 59
Burgy O, Wettstein G, Bellaye PS, Decologne N, Racoeur C, Goirand F, Beltramo G, Hernandez JF,
Kenani A, Camus P, Bettaieb A, Garrido C, Bonniaud P. Deglycosylated bleomycin has the antitumor
activity of bleomycin without pulmonary toxicity. Sci Transl Med 8:326ra20, 2016
Lamrani L, Sassi N, Paul C, Yousfi N, Boucher B, Gauthier N, Labbé J, Seignez C, Racoeur C, Athias
A,Guerreiro R, Vergely C, Rochette L, Bettaieb A, Jeannin JF. TLR4/IFN pathways induce tumor
regression via NOS II-dependent NO and ROS production in murine breast cancer models.
OncoImmunology, In press
Cortier M, Boina-Ali R, Racoeur C, Paul C, Solary E, Jeannin JF, Bettaieb A. H89 enhances sensitivity of
cancer cells to glyceryl trinitrate through a purinergic receptor-dependent pathway. Oncotarget 30,
6877-6886, 2015
Seignez C, Martin A, Rollet CE, Racoeur C, Scagliarini A, Jeannin JF, Bettaieb A, Paul C. Senescence of
tumor cells induced by oxaliplatin increases the efficiency of a lipid A immunotherapy via the
recruitment of neutrophils. Oncotarget 30, 11442-11451, 2014
Isambert N, Fumoleau P, Paul C, Ferrand C, Zanetta S, Bauer J, Ragot K, Lizard G, Jeannin J-F and
Bardou M. Phase I study of OM-174, an intravenous lipid A analogue, with assessment of
immunological response, in patients with refractory solid tumors. BMC cancer 13:172, 2013

_________________________________________________________________
Pôle Mécanisme des interactions plantes-microorganismes - ERL CNRS 6300
UMR 1347 INRA/Université de Bourgogne/AgroSup Dijon
17 rue Sully,
BP 86510
21065Dijon Cedex
Responsable pôle
Responsable UMR
D. Wipf
P. Lemanceau
Coordonnées
Tél: 03 80 69 32 75
Secrétariat: 03 80 69 36 45
Fax : 03 80 39 37 53

Equipe Santé des plantes : mycorhizes et défense
Responsable: Daniel Wipf ([email protected])
Sujet de Stage: Identification d'interactants de la NADPH oxydase RBOHD au cours de la signalisation
induite par la cryptogéine
Maître de stage: K. Bouhidel
Tel: 03 80 69 34 62
11
Reinhardt H, Hachez C, Bienert MD, Beebo A, Swarup K, Voß U, Bouhidel K, Frigerio L, Schjoerring JK,
Bennett MJ, Chaumont F. Tonoplast Aquaporins Facilitate Lateral Root Emergence. Plant Physiol.
170, 1640-1654, 2016
Noirot E, Der C, Lherminier J, Robert F, Moricova P, Kiêu K, Leborgne-Castel N, Simon-Plas F, Bouhidel
K. Dynamic changes in the subcellular distribution of the tobacco ROS-producing enzyme RBOHD in
response to the oomycete elicitor cryptogein. J. Exp Bot 65, 5011-5022, 2014
Leborgne-Castel L, Bouhidel K. Plasma membrane protein trafficking in plant-microbe interactions: a
plant cell point of view. Front Plant Sci. 5:735, 2014
Adam T, Bouhidel K, Der C, Robert F, Najid A, Simon-Plas F, Leborgne-Castel N. Constitutive
expression of clathrin hub hinders elicitor-induced clathrin-mediated endocytosis and defense gene
expression in plant cells. FEBS let 586, 3293-3298, 2012
Leborgne-Castel N, Adam T, Bouhidel K. Endocytosis in plant-microbe interactions. Protoplasma 247,
177-93, 2010

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Pôle déterminismes Génétiques et Environnementaux de l’Adaptation des
Plantes à des Systèmes de culture Innovants
UMR 1347 AgroSup/INRA/Université de Bourgogne
17 rue Sully,
BP 86510
21065Dijon Cedex
Responsable
Christophe Salon
Coordonnées
Tél. : 33 80 69 32 38
Fax : 33 80 69 32 63

Equipe FILEAS (FILing – Abiotic Stresses) aux recherches centrées sur l’augmentation du potentiel
de rendement et de qualité des graines de pois sous contraintes abiotiques
Responsables: Richard Thompson
([email protected])
([email protected])
&
Karine
Gallardo
Sujet de Stage 1: Etudier du rôle des strigolactones dans la réponse du pois au stress hydrique par
analyse moléculaire et phénotypique de mutants de la voie de biosynthèse et de signalisation de
cette hormone.
Maître de stage: V. Vernoud
Tel: 03 80 69 32 54
12
Sujet de Stage 2: Validation de réseaux géniques connectant la nutrition soufrée à la réponse des
plantes au stress hydrique : étude d’expression et recherche de mutants TILLING pour des gènes clés
au cœur des réseaux.
Maître de stage: K. Gallardo
Tel: 03 80 69 33 91
Prudent M, Vernoud V, Girdodet S, Salon C. How nitrogen fixation is modulated in response to
different water availability levels and during recovery: A structural and functional study at the whole
plant level. Plant and Soil 399, 1-12, 2016
Noguero M, Le Signor C, Vernoud V, Bandyopadhyay K, Sanchez M, Fu C, Torres-Jerez I, Wen J,
Mysore KS, Gallardo K, Udvardi M, Thompson R, Verdier J. DASH transcription factor impacts
Medicago truncatula seed size by its action on embryo morphogenesis and auxin homeostasis. Plant
Journal 81, 453-66, 2015
Gallardo K, Courty PE, Le Signor C, Wipf D, Vernoud V. Sulfate transporters in the plant's response to
drought and salinity: regulation and possible functions. Front Plant Sci. 5, 580, 2014
Zuber H, Poignavent G, Le Signor C, Aimé D, Vieren E, Tadla C, Belghazi M, Labas V, Santoni A-L, Wipf
D, Buitink J, Avice J-C, Salon C, Gallardo K. Legume adaptation to sulfur deficiency revealed by
comparing nutrient allocation and seed traits in Medicago truncatula. Plant Journal 76, 982-96, 2013
D'Erfurth I, Le Signor C, Aubert G, Sanchez M, Vernoud V, Darchy B, Lherminier J, Bourion V,
Bouteiller N, Bendahmane A, Buitink J, Prosperi JM, Thompson R, Burstin J, Gallardo K. A role for an
endosperm-localized subtilase in the control of seed size in legumes. New Phytologist 196, 738-751,
2012

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UMR 6265 CNRS, 1324 INRA, Université de Bourgogne
Centre des Sciences du Goût et de l’Alimentation
9E boulevard Jeanne d’Arc,
21000 Dijon
Responsable
Luc Pénicaud
Coordonnées
Tél. : 03 80 68 16 49
Fax : 03 80 68 16 01
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Equipe Perception Sensorielle, Interactions Glie/Neurones
Responsable: Yaël Grosjean ([email protected])
Sujet de Stage 1 : Communication cellulaire : Rôle de Genderblind dans la communication cellules
gliales - neurones olfactifs.
Maîtres de stage: G. Manière et Y. Grosjean
13
Tel: 03 80 39 62 91
Ziegler AB, Augustin H, Clark NL, Berthelot-Grosjean M, Simonnet MM, Steinert JR, Geillon F, Manière
G, Featherstone DE, Grosjean Y. The Amino Acid Transporter JhI-21 Coevolves with Glutamate
Receptors, Impacts NMJ Physiology, and Influences Locomotor Activity in Drosophila Larvae.
Scientific Reports 6:19692, 2016
Alves G, Sallé J, Chaudy S, Dupas S, Manière G. High-NaCl perception in Drosophila melanogaster.
Journal of Neuroscience 34, 10884-10891, 2014
Grosjean Y, Rytz R, Farine JP, Abuin L, Cortot J, Jefferis GS, Benton R. An olfactory receptor for foodderived odours promotes male courtship in Drosophila. Nature 478, 236-240, 2011
Ai M, Min S, Grosjean Y, Leblanc C, Bell R, Benton R, Suh GS. Acid sensing by the Drosophila olfactory
system. Nature 468, 691-695, 2010
Grosjean Y, Grillet M, Augustin H, Ferveur JF, Featherstone DE. A glial amino-acid transporter
controls synapse strength and courtship in Drosophila. Nature Neuroscience 11, 54-61, 2008

Equipe Mécanismes de plasticité et perception chimiosensorielle
Responsable: Jean-François Ferveur ([email protected])
Sujet de Stage 1: Mécanismes génétiques et neuronaux impliqués dans l'imprégnation
chimiosensorielle précoce
Maîtres de stage: J-F. Ferveur & C. Everaerts
Tel: 03 80 39 37 82
Sujet de Stage 2: Rôle du co-récepteur ORCO dans la synthèse et la détection de phéromones
larvaires de drosophile
Maîtres de stage: J-P. Farine
Tel: 03 80 39 63 00
Sujet de Stage 3: Protéines de liaison et détection de molécules sapides
Maître de stage: S. Fraichard (Collaboration avec L. Briand, équipe 2 du CSGA)
Tel: 03 80 39 62 10
Bousquet F, Chauvel I, Flaven-Pouchon J, Farine JP, Ferveur JF. Dietary rescue of altered metabolism
gene reveals unexpected Drosophila mating cues. J Lipid Res 57, 443-450, 2016
Thibert J, Farine JP, Cortot J, Ferveur JF. Drosophila food-associated pheromones: Effect of
experience, genotype and antibiotics on larval behavior. PLoSONE DOI: 10.1371/journal.pone.
0151451, 2016
14
Farine JP, Cortot J, Ferveur JF. Drosophila adult and larval pheromones modulate larval food choice.
Proc R Soc Lond B 281(1784):20140043, 2014
Flaven-Pouchon J, Farine JP, Ferveur JF, Everaerts C. Transient and permanent experience with fattyacids changes Drosophila melanogaster behaviour and fitness. PLOS ONE 9(3), e92352, 2014
Bousquet F, Nojima T, Houot B, Chauvel I, Chaudy S, Dupas S, Yamamoto D, Ferveur JF. Desat
expression in neural and non-neural tissues separately affects perception and emission of sex
pheromones in Drosophila. Proc Natl Acad Sci U S A 109, 249-254, 2012

Equipe Œil, nutrition et signalisation cellulaire
Responsables: Lionel Bretillon ([email protected]) & Catherine Creuzot-Garcher
([email protected])
Sujet de stage 1: Plasmalogènes et métabolisme des cellules gliales au cours du développement
vasculaire rétinien : approche nutritionnelle préventive
Maître de stage: N. Acar
Tel: 03 80 69 32 69
Sujet de Stage 2: Implication du 24S-hydroxycholestérol dans la modulation de la fluidité
membranaire des cellules de Müller de la rétine au cours du glaucome
Maître de stage: S. Gambert-Nicot
Tel: 03 80 39 31 21
Sujet de Stage 3: Signalisation cellulaire des effets des acides gras au cours de la fibrose postchirurgicale du glaucome
Maître de stage: A. Bron & N. Acar
Tel: 03 80 39 32 69
Fax: 03 80 69 32 23
Fourgeux C, Martine L, Björkhem I, Diczfalusy U, Joffre C, Acar N, Creuzot-Garcher C, Bron A and
Bretillon L. Primary Open-Angle Glaucoma: Association with Cholesterol 24S-Hydroxylase (CYP46A1)
Gene Polymorphism and Plasma 24-Hydroxycholesterol Levels. Invest Ophthalmol Vis Sci 50, 57125717, 2009
Fourgeux C, Dugas B, Richard F, Björkhem I, Acar N, Bron AM, Korobelnik J-F, Leveziel N, Zerbib J,
Puche N, Creuzot-Garcher CP, Souied E, Bretillon L. Single Nucleotide Polymorphism in the
Cholesterol-24S-Hydroxylase (CYP46A1) Gene and its Association with CFH and LOC387715 Gene
Polymorphisms in Age-Related Macular Degeneration. Invest Ophthalmol Vis Sci 53, 7026-7033,
2012
Salvary, T., S. Gambert-Nicot, M. C. Brindisi, N. Meneveau, F. Schiele, M. F. Seronde, L. Lorgis, M.
Zeller, Y. Cottin, J. P. Kantelip, P. Gambert, S. Davani. Pravastatin reverses the membrane cholesterol
15
reorganization induced by myocardial infarction within lipid rafts in CD14(+)/CD16(-) circulating
monocytes. Biochim Biophys Acta 1821, 1287-1294, 2012
Saab S, Buteau B, Leclère L, Bron AM, Creuzot-Garcher CP, Bretillon L, Acar N. Involvement of
plasmalogens in post-natal retinal vascular development. PLoS ONE 9(6):e101076, 2014
Koehrer P, Saab S, Berdeaux O, Isaïco R, Grégoire S, Cabaret S, Bron AM, Creuzot-Garcher CP,
Bretillon L, Acar N. Erythrocyte phospholipid and polyunsaturated fatty acid composition in diabetic
retinopathy. PLoS ONE 9(9):e106912, 2014

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EA4271 GAD Génétique des Anomalies du développement
IFR Santé STIC/Université de Bourgogne
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Laurence Olivier-Faivre
Coordonnées
Tél: 33 80 39 33 53
Fax: 33 80 39 34 34
E-mail : [email protected]

Sujet de Stage 1: Caractérisation du modèle souris Vps13b-/- dans le cadre de l’étude de la
compréhension des mécanismes cellulaires et moléculaires du syndrome de Cohen.
Maître de stage: L. Jego-Duplomb
Tel: 03 80 29 53 13
Sujet de Stage 2: Identification de nouveaux gènes dans des phénotypes extrêmes : à partir d’une
large cohorte fœtale.
Maître de stage: P. Kuentz
Tel: 03 80 29 53 13
Sujet de Stage 3: Evaluation du méthylome ovocytaire (analyse du méthylome ovocytaire par des
techniques développées sur whole genome et en single cell)
Maitre de Stage: Patricia Fauque
Tel: 03 80 29 50 31
Kuentz P, Mignot C, St-Onge J, Duffourd Y, Bonniaud B, Faivre L, Rivière JB, Vabres P. Postzygotic
BRAF p.Lys601Asn Mutation in Phacomatosis Pigmentokeratotica with Woolly Hair Nevus and Focal
Cortical Dysplasia.J Invest Dermatol, In press
16
Limoge F, Faivre L, Gautier T, Petit JM, Gautier E, Masson D, Jego G, El Chehadeh-Djebbar S, Marle N,
Carmignac V, Deckert V, Brindisi MC, Edery P, Ghoumid J, Blair E, Lagrost L, Thauvin-Robinet C,
Duplomb L. Insulin response dysregulation explains abnormal fat storage and increased risk of
diabetes mellitus type 2 in Cohen Syndrome. Hum Mol Genet 24, 6603–6613, 2015
Bruno C, Carmignac V, Netchine I, Choux C, Duffourd Y, Faivre L, Thauvin-Robinet C, Le Bouc Y, Sagot
P, Bourc’his D, Fauque P. Germline correction of an epimutation related to Silver Russell syndrome.
Hum Mol Genet. 24, 3314-3321, 2015
Choux C, Carmignac V, Bruno C, Sagot P, Vaiman D, Fauque P. The placenta: phenotypic and
epigenetic modifications induced by Assisted Reproductive Technologies throughout pregnancy. Clin
Epigenetics 7(1):87, 2015
Duplomb L, Duvet S, Picot D, Jego G, El Chehadeh-Djebbar S, Marle N, Gigot N, Aral B, Carmignac V,
Thevenon J, Lopez E, Rivière JB, Klein A, Philippe C, Droin N, Blair E, Girodon F, Donadieu J, BellannéChantelot C, Delva L, Michalski JC, Solary E, Faivre L, Foulquier F, Thauvin-Robinet C. Cohen syndrome
is associated with major glycosylation defects. Hum Mol Genet 23, 2391-2399, 2014
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Département de Radiothérapie/Radiobiologie
Centre Georges François Leclerc
1, rue du Pr Marion
21079 DIJON Cedex
Responsable
Dr Gilles Truc
Coordonnées
Tél: 33 3 80 73 75 19
Fax: 33 3 80 73 77 06
Axe Radiothérapie / Radiobiologie, Unité de recherche préclinique et translationnelle
Responsable: Pr Gilles Créhange ([email protected])
Sujet de stage: Etude de l’effet du fractionnement et du débit de dose de radiothérapie sur les
mécanismes de réparations des dommages de l’ADN radio-induits
Maître de stage: C. Mirjolet-Didelot
Tel: 03 45 34 80 75
Mirjolet C, Merlin JL, Dalban C, Maingon P, Azria D. Correlation between radio-induced lymphocyte
apoptosis measurements obtained from two French centers. Cancer Radiother, In press
Mirjolet C, Boidot R, Saliques S, Ghiringhelli F, Maingon P, Créhange G. The role of telomeres in
predicting individual radiosensitivity of patients with cancer in the era of personalized radiotherapy.
Cancer Treat Rev. 41, 354-60, 2015
17
Mirjolet C, Papa AL, Créhange G, Raguin O, Seignez C, Paul C, Truc G, Maingon P, Millot N. The
radiosensitization effect of titanate nanotubes as a new tool in radiation therapy for glioblastoma: a
proof-of-concept. Radiotherapy and Oncology, 108, 136-142, 2013
Crehange G, Mirjolet C, Gauthier M, Martin E, Truc G, Peignaux-Casasnovas K, Azelie C, Bonnetain F,
Naudy S, Maingon P. Clinical impact of margin reduction on late toxicity and short-term biochemical
control for patients treated with daily on-line image guided IMRT for prostate cancer. Radiotherapy
and Oncology, 103, 244-246, 2012
Didelot C, Brenner C, Deplus R, Danovi D, Pelicci PG, Amati B, Kouzarides T, de Launoit Y, Di Croce L
and Fuks F. Myc represses transcription through recruitment of DNA methyltransferase corepressor.
EMJO Journal, 24, 336-346, 2005
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UMR PAM Université de Bourgogne-AgroSup Dijon
1, Esplanade Erasme
21000 DIJON
Responsables
Patrick GERVAIS, Laurent BENEY
Coordonnées
Tél: 03 80 77 40 65

Equipe Interaction Candida albicans - Hôte
Responsable: Frédéric Dalle ([email protected])
Sujet de Stage: Etude des mécanismes cellulaires et moléculaires de la réponse au stress cellulaire de
la levure Candida albicans dans le contexte de son interaction avec la muqueuse digestive
Maîtres de stage: F. Dalle & M. Sautour
Tel: 03 80 39 33 48 (F. Dalle), 03 80 39 33 47 (M. Sautour)
Goyer M, Loiselet A, Bon F, L'Ollivier C, Laue M, Holland G, Bonnin A, Dalle F. Intestinal Cell Tight
Junctions Limit Invasion of Candida albicans through Active Penetration and Endocytosis in the Early
Stages of the Interaction of the Fungus with the Intestinal Barrier. Plos One 11, 149-159, 2016
Albac S, Schmitz A, Lopez-Alayon C, d'Enfert C, Sautour M, Ducreux A, Labruère-Chazal C, Laue M,
Holland G, Bonnin A, Dalle F. Candida albicans is able to use M cells as a portal of entry across the
intestinal barrier in vitro. Cell Microbiol 18, 195-210, 2016
Wächtler B, Citiulo F, Jablonowski N, Förster S, Dalle F, Schaller M, Wilson D, Hube B. Candida
albicans-epithelial interactions: dissecting the roles of active penetration, induced endocytosis and
host factors on the infection process. PLoS One 7, 2012
Wächtler B, Wilson D, Haedicke K, Dalle F, Hube B. From attachment to damage: defined genes of
Candida albicans mediate adhesion, invasion and damage during interaction with oral epithelial cells.
PLoS One 23, 6(2):e17046, 2011
18
Dalle F, Wächtler B, L'Ollivier C, Holland G, Bannert N, Wilson D, Labruère C, Bonnin A, Hube B. Cellular
interactions of Candida albicans with human oral epithelial cells and enterocytes. Cell Microbiol. 12,
248-71, 2010

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UMR Inserm 1098 / Université de Bourgogne Franche Conté
Interaction Hôte-Greffon-Tumeur et Ingénierie Cellulaire et Génique
8, rue du Docteur Jean-François-Xavier Girod
BP1937
25020 Besançon Cedex
Responsable
Pr Philippe SAAS
Coordonnées
Tél. : 03.81.61.56.15
Fax : 03.81.61.58.00
Equipe Imunorégulation et immunopathologie (Equipe localisée à l’université de Bourgogne, faculté
de médecine de Dijon)
Responsable: Pr Bernard Bonnotte ([email protected])
Sujet de Stage 1: Caractérisation phénotypique et fonctionnelle des cellules immunosuppressives
dérivées des monocytes circulants chez l’homme, appelées HuMoSC (physiopathologie)
Maître de stage: B. Bonnotte
Tel: 03 80 29 34 32
Sujet de Stage 2 : Etude des effets des agonistes du récepteur à la thrombopoïétine sur la réponse
immunitaire chez des patients souffrant de thrombopénie immunologique (Physiologie d’une
maladie auto-immune)
Maître de stage: S. Audia & B. Bonnotte
Tel: 03 80 29 34 32
Janikashvili N, Trad M, Gautheron A, Samson M, Lamarthée B, Bonnefoy F, Lemaire-Ewing S, Ciudad
M, Rekhviashvili K, Seaphanh F, Gaugler B, Perruche S, Bateman A, Martin L, Audia S, Saas P,
Larmonier N, Bonnotte B. Human monocyte-derived suppressor cells control graft-versus-host
disease by inducing regulatory forkhead box protein 3-positive CD8+ T lymphocytes. J Allergy Clin
Immunol 135, 1614-1624, 2015
Audia S, Rossato M, Santegoets K, Spijkers S, Wichers C, Bekker C, Bloem A, Boon L, Flinsenberg T,
Compeer E, van den Broek T, Facy O, Ortega-Deballon P, Berthier S, Leguy-Seguin V, Martin L, Ciudad
M, Samson M, Trad M, Lorcerie B, Janikashvili N, Saas P, Bonnotte B, Radstake TR. Splenic TFH
19
expansion participates in B-cell differentiation and antiplatelet-antibody production during immune
thrombocytopenia. Blood 124, 2858-2866, 2014
Audia S, Samson M, Mahévas M, Ferrand C, Trad M, Ciudad M, Gautheron A, Seaphanh F, Leguy V,
Berthier S, Salles B, Martin L, Lorcerie B, Ortega-Deballon P, Facy O, Caillot D, Soudry-Faure A, Michel
M, Godeau B, Larmonier N, Saas P, Janikashvili N, Bonnotte B. Preferential splenic CD8(+) T-cell
activation in rituximab-nonresponder patients with immune thrombocytopenia. Blood 122, 24772486, 2013
Samson M, Audia S, Fraszczak J, Trad M, Ornetti P, Lakomy D, Ciudad M, Leguy V, Berthier S, Vinit J,
Manckoundia P, Maillefert JF, Besancenot JF, Aho-Glele S, Olsson NO, Lorcerie B, Guillevin L,
Mouthon L, Saas P, Bateman A, Martin L, Janikashvili N, Larmonier N, Bonnotte B. Th1 and Th17
lymphocytes expressing CD161 are implicated in giant cell arteritis and polymyalgia rheumatica
pathogenesis. Arthritis Rheum 64, 3788-3798, 2012
Audia S, Samson M, Guy J, Janikashvili N, Fraszczak J, Trad M, Ciudad M, Leguy V, Berthier S, Petrella
T, Aho-Glélé S, Martin L, Maynadié M, Lorcerie B, Rat P, Cheynel N, Katsanis E, Larmonier N,
Bonnotte B. Immunologic effects of rituximab on the human spleen in immune thrombocytopenia.
Blood 118, 4394-400, 2011
20
Sujets de stage, site de l’Université de Franche-Comté (Besançon)
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EA3181/Université de Franche-Comté
Carcinogenèse épithéliale
UFR Sciences Médicales et Pharmaceutiques
Rue A Paré 25 000 Besançon cedex
Responsable
Christiane Mougin
Coordonnées
Tél: 03 70 63 20 53
Fax: 03 70 63 20 47
ou [email protected]
Possibilités d’accueil : 3
Sujet de Stage: Activation des récepteurs nucléaires PPAR (Peroxisome Proliferator-Activated
Receptor) dans la carcinogenèse associée aux HPV
Maître de stage: S. Fauconnet
Tel: 03 63 08 22 29
Sujet de Stage: Rôle biologique de la liaison de l’oncoprotéine virale E6 d’HPV16 aux ARN dans le
processus de carcinogenèse
Maître de stage: A. Baguet
Tel: 03 63 08 22 65
Sujet de Stage: miR-375 et régulation épigénétique de l’expression des gènes précoces d’HPV16
Maître de stage: C. Mougin
Tél: 03 70 63 20 53
Plissonnier ML, Fauconnet S, Bittard H, Lascombe I. The antidiabetic drug ciglitazone induces high
grade bladder cancer cells apoptosis through the up-regulation of TRAIL. PLoS One 6(12):e28354,
2011
Culjkovic-Kraljacic B, Baguet A, Volpon L, Amri A, Borden KL. The oncogene eIF4E reprograms the
nuclear pore complex to promote mRNA export and oncogenic transformation. Cell Reports 30;
2(2):207-215, 2012
Jacquin E, Baraquin A, Ramanah R, Carcopino X, Morel A, Valmary-Degano S, Bravo I, de Sanjosé S,
Riethmuller D, Mougin C, Prétet JL. Specific methylation of HPV16 promoter region in cervical cancer
samples determined with HRM PCR method. J Clin Microbiol, 51:3207-15, 2013
Roche E, Lascombe I, Bittard H, Mougin C, Fauconnet S. The PPARβ agonist L-165041 promotes VEGF
mRNA stabilization in HPV18-harboring HeLa cells through a receptor-independent mechanism. Cell
Signal 26, 433-443, 2014
21
Hermetet F, Jacquin E, Launay S, Gaiffe E, Couturier M, Hirchaud F, Sandoz P, Prétet JL, Mougin C.
Efferocytosis of apoptotic hpv-positive cervical cancer cells by human primary fibroblasts. Biol Cell, In
press

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EA3922/SFR IBCT FED 4234
Estrogènes, Expression Génique et Pathologies du Système Nerveux Central
Université de Franche-Comté UFR Sciences et Techniques Bâtiment DF
16, route de Gray 25030 BESANCON
Responsable
Régis DELAGE-MOURROUX
Coordonnées
Tél: 03 81 66 66 24
Sujet de Stage: Implication de l’histone déméthylase KDM6 dans la transition épithéliomésenchymateuse et dans l’agressivité des tumeurs
Maîtres de stage: P. Peixoto & E. Hervouet
Tel: 03 81 66 55 67 & 03 81 66 65 42
Peixoto P, Blomme A, Costanza B, Ronca R, Rezzola S, Palacios AP, Schoysman L, Boutry S, Goffart N,
Peulen O, Maris P, Di Valentin E, Hennequière V, Bianchi E, Henry A, Meunier P, Rogister B, Muller
RN, Delvenne P, Bellahcène A, Castronovo V, Turtoi A. HDAC7 inhibition resets STAT3 tumorigenic
activity in human glioblastoma independently of EGFR and PTEN: new opportunities for selected
targeted therapies. Oncogene, In press
Hervouet E, Claude-Taupin A, Perez V, Gauthier T, Fraichard A, Adami P, Despouy G, Monnien F,
Algros MP, Jouvenot M, Delage-Mourroux R and Boyer-Guittaut M. The Autophagy GABARAPL1 gene
is Epigenetically Regulated in Breast Cancer Models. BMC Cancer 15:729, 2015
Pacaud R, Brocard E, Lalier L, Hervouet E, Vallette FM, Cartron PF. The Dnmt1/PCNA/UHRF1
disruption induces tumorigenesis characterized by similar genetic and epigenetic signatures.
Scientific Report 18;4:4230, 2014
Hervouet E, Nadaradjane A, Gueguen M, Vallette FM, Cartron PF. Kinetic of DNA methylation
inheritance by the Dnmt1-including complexes during the cell cycle. Cell Division 7:5, 2012
Peixoto P, Castronovo V, Matheus N, Polese C, Peulen O, Gonzalez A, Boxus M, Verdin E, Thiry M,
Dequiedt F, Mottet D. HDAC5 is required for maintenance of pericentric heterochromatin, and
controls cell-cycle progression and survival of human cancer cells. Cell Death Differ 19(7):1239-52,
2012

________________________________________________________________
22
EA4266/Université de Franche-Comté
Agents Pathogènes et Inflammation
Faculté de Médecine-Pharmacie
19, rue Ambroise Paré
25030 Besançon
Responsable
Georges Herbein
Coordonnées
Tél: 03 81 21 93 31

Laboratoire de Virologie
Responsable: Georges Herbein ([email protected])
Sujet de Stage 1: Rôle du cytomégalovirus dans l’oncogenèse
Maîtres de stage: G. Herbein
Tel: 03 81 21 93 31
Le Douce V, Colin L, Redel L, Cherrier T, Herbein G, Aunis D, Rohr O, Van Lint C, Schwartz C. LSD1
cooperates with CTIP2 to promote HIV-1 transcriptional silencing. Nucl Acid Res 40 : 1904-1915,
2012
Cherrier T, Le Douce V, Eilebrecht S, Riclet R, Marban C, Dequiedt F, Goumon Y, Paillart JC, Mericskay
M, Parlakian A, Bausero P, Abbas W, Herbein G, Kurdistani S, Grana X, Benecke A, Van Driessche B,
Schwartz C, Candolfi E, Van Lint C, Rohr O. CTIP2 is a negative regulator of P-TEFb. PNAS. USA
110:12655-12660, 2013
Abbas W, Khan KA, Kumar A, Tripathy MK, Dichamp I, Keita M, Mahlknecht U, Rohr O, Herbein G.
Blockade of BFA-mediated apoptosis in macrophages by the HIV-1 Nef protein. Cell Death Dis 5:
e1080, 2014
Kumar A, Coquard L, Pasquereau S, Russo L, Valmary-Degano S, Borg C, Pothier P, Herbein G. Tumor
control by human cytomegalovirus in a murine model of hepatocellular carcinoma. Molecular
Therapy Oncolytics 3:16012, 2016
Kumar A, Wasim A, Colin L, Khan KA, Bouchat S, Varin A, Larbi A, Gatot JS, Kabeya K, Vanhulle C,
Delacourt N, Coquard L, Pasquereau S, Borsch A, König R, Clumeck N, De Wit S, Rohr O, Rouzioux C,
Fulop Jr T, Van Lint C, Herbein G. Fine tuning of PI3K-AKT pathway by HIV-1 Nef and blockade of Akt
activation by protease inhibitors results in limited HIV-1 recovery in a latently infected T cell line
model. Scientific Reports 6:24090, 2016

Laboratoire de Bactériologie
Responsable: Patrick Plésiat ([email protected])
23
Sujet de Stage 1: Caractérisation de la voie de signalisation de CmrA, un régulateur impliqué dans la
multi-résistance aux antibiotiques de la bactérie Pseudomonas aeruginosa.
Maître de stage: C. Llanes
Tel: 03 63 08 22 76 (ou 75)
LLANES C., POURCEL C., RICHARDOT C., PLESIAT P., FICHANT G., CAVALLO J-D., MERENS A. and
collaborators of the GERPA Study group. Diversity of ß-lactam resistance mechanisms in cystic fibrosis
isolates of Pseudomonas aeruginosa: a French multicentre study. Journal of Antimicrobial
Chemotherapy 68, 1763-71, 2013
FOURNIER D., RICHARDOT C., MÜLLER E., ROBERT-NICOUD M., LLANES C., PLESIAT P., JEANNOT K.
Complexity of resistance mechanisms to imipenem in intensive care units strains of Pseudomonas
aeruginosa. Journal of Antimicrobial Chemotherapy 68, 1772-80, 2013
RICHARDOT C., PLESIAT P., FOURNIER D., MONLEZUN L., BROUTIN I., LLANES C. Carbapenem
resistance in cystic fibrosis strains of Pseudomonas aeruginosa as a result of amino acid substitutions
in porin OprD. International Journal of Antimicrobial Agents, 45, 529-532, 2015
CHARRETIER Y., KOHLER T., CECCHINI T., BARDET C., CHERKAOUI A., LLANES C., BOGAERTS P.,
CHATELLIER S., CHARRIER J-P., , SCHENZEL J. Label free SRM-based relative quantification of antibiotic
resistance mechanisms in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates. Frontiers in Microbiology 6, 81,
2015
RICHARDOT C., JUAREZ P., JEANNOT K., PATRY I., PLESIAT P., LLANES C. Amino acid substitutions
account for most MexS alterations in clinical nfxC mutants of Pseudomonas aeruginosa. Antimicrobial
Agents and Chemotherapy 60, 2016

________________________________________________________________
Laboratoire d’accueil: UMR INSERM U1098
Université de Franche-Comté et EFS Bourgogne Franche-Comté
Interaction Hôte-Greffon-Tumeur et Ingénierie Cellulaire et Génique
8, rue du Docteur Jean-François-Xavier GirodBP1937,
25020 Besançon Cedex
Responsable
Pr Philippe SAAS
Coordonnées
Tél. : 03.81.61.56.15
Fax : 03.81.61.58.00
Equipe Thérapeutique immunomoléculaire des cancers (TIMC)
Responsable: Olivier Adotevi ([email protected])
Possibilités d'accueil: 1
Sujet de Stage: Etude des mutations et de la méthylation du promoteur du gène TERT dans le
mélanome et cancer du poumon: corrélation avec les réponses immunitaires anti-TERT
24
Maître de Stage: O. Adotevi
Tél : 03 70 63 22 12
Caroline Laheurte, Jeanne Galaine, Laurent Beziaud, Magalie Dosset, Jerome Kerzerho, Claire
Jacquemard, Béatrice Gaugler, Christophe Ferrand, Anne Dormoy, François Aubin, Pascale Jacoulet,
Virginie Westeel, Christophe Borg, Eric Tartour, Yann Godet, Bernard Maillère & Olivier Adotévi.
Immunoprevalence and magnitude of HLA-DP4 versus HLA-DR-restricted spontaneous CD4 Th1
responses against telomerase in cancer patients. Oncoimmunology, In press
Vauchy C, Gamonet C, Ferrand C, Daguindau E, Galaine J, Beziaud L, Chauchet A, Henry Dunand CJ,
Deschamps M, Rohrlich PS, Borg C, Adotevi O, Godet Y. CD20 alternative splicing isoform generates
immunogenic CD4 helper T epitopes. Int J Cancer 137; 116-26, 2014
Thiery-Vuillemin A, Laheurte C, Mansi L, Royer B, Pivot X, Borg C, Adotevi O. Immunomodulatory
effects of everolimus in a long responsive patient with metastatic renal cell carcinoma. J Immunother
37:51-54, 2014
Dosset M, Godet Y, Vauchy C, Beziaud L, Lone YC, Sedlik C, Liard C, Levionnois E, Clerc B, Sandoval F,
Daguindau E, Wain-Hobson S, Tartour E, Langlade-Demoyen P, Borg C, Adotévi O. Universal cancer
peptide-based therapeutic vaccine breaks tolerance against telomerase and eradicates established
tumor. Clin Cancer Res, 15; 18(22):6284-95, 2012
Godet Y, Fabre E, Dosset M, Lamuraglia M, Levionnois E, Ravel P, Benhamouda N, Cazes A, Le PimpecBarthes F, Gaugler B, Langlade-Demoyen P, Pivot X, Saas P, Maillère B, Tartour E, Borg C, Adotévi O.
Analysis of spontaneous tumor-specific CD4 T-cell immunity in lung cancer using promiscuous HLADR telomerase-derived epitopes: potential synergistic effect with chemotherapy response. Clin
Cancer Res. 15; 18(10):2943-53, 2012
25

Liste des sujets de stages M2 - Les formations à l`université de

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