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Karim Oualkacha
Professeur Régulier
Département de Mathématiques
Université de Québec À Montréal
(UQÀM) Montréal, QC
H3C 3P8
Intérêts de Recherche
Statistique génétique
Statistique directionnelle
Statistique (générale)
Email : [email protected]
Tel. (1-514) 987-3000, poste 5226
Fax : (1-514) 987-8935
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Analyse de liaison de caractères complexes
Analyse de liaison de traits quantitatifs
Études d’association cas-témoins
Études d’association de traits quantitatifs
Études de variantes génétiques rares
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Analyse de données directionnelles
Analyse de rotations et déplacements
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Modélisation de dépendance complexe
Statistique multidimensionnelle
Modèles à effets aléatoires et modèles mixtes
Biostatistique
Expérience
Depuis Juin 2012
Professeur Régulier
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Chercheur Postdoctoral
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Professeur régulier (Statistique), Département
de mathématiques, Université du Québec à
Montréal
10/2011 à 05/2012
Statistique génétique, Institut Lady Davis de
recherches médicales, Hôpital général juif,
Université McGill
11/2009 à 09/2011
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Mathématique et Statistique, Département
d’Épidémiologie, Biostatistique, Université
McGill
Chargé de Cours
01/2008 à 12/2008
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Probabilités et statistique pour ingénieur, STT10400, Université Laval
Formation Universitaire
Ph.D. en Statistique, 2009
Université Laval. Directeur de Thèse : Louis-Paul Rivest.
Titre de la Thèse : Modèles statistiques pour des rotations et des déplacements de corps solides.
Maîtrise ès-sciences en Statistique, 2004
Université Laval., directeur de mémoire : Louis-Paul Rivest.
Titre de mémoire : Étude d’un modèle statistique pour les rotations.
Diplôme d’Études Approfondies (DEA)
Mathématiques d’Aide à la Décision (spécialité: Statistique), 2001
Université Cadi Ayyad, Maroc. Directeur de mémoire : Abdel-Aziz Nasroallah.
Titre de mémoire : L’utilisation de l’algorithme Metropolis-Hasting dans la simulation Monte
Carlo de chaînes de Markov.
Licence ès-sciences en Mathématiques Fondamentales, 1998
Université Cadi Ayyad, Maroc.
DEUG en Mathématiques et Physique, 1996
Université Cadi Ayyad, Maroc.
Publications
[1] Oualkacha, K., Cingolani, P., Dastani, Z., Li, R., Spector, T. D., Hammond, C. J., Richards,
J. B., Ciampi, A. and Greenwood, C. (2013). Adjusted Sequence Kernel Association Test for
Rare Variants Controlling for Cryptic and Family Relatedness. Genetic Epidemiology, Volume
37, Issue 4, pages 366–376.
[2] Dufresne, L., Oualkacha, K., Forgetta. V., Greenwood. CMT. (2013) Pathway Analysis for
Genetic Association Studies: To Do, or Not To Do? That is the Question. BMC proceedings.
[3] Oualkacha, K. and Rivest, L. P. (2012). On the estimation of an average rigid body motion.
Biometrika, 14 pages, doi: 10.1093/biomet/ass020.
[4] Oualkacha, K., Labbe, A., Ciampi, A., Roy, M.A. and Maziade, M. (2012). Principal
components of heritability for high dimension quantitative traits and general pedigrees. Journal
of Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, Volume 11. Issue 2, Article 4, 24
pages.
[5] Oualkacha, K. and Rivest, L. P. (2009). A new statistical model for random unit vectors.
Journal of Multivariate Analysis. 100, 70-80.
Articles Soumis ou en Rédaction Finale
[6] Oualkacha, K. and Rivest, L. P. (2013). A statistical model for rigid body displacments in
space. (À soumettre, 20 pages).
Communications dans des Congrès et Conférences dans des
Universités
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Oualkacha, K. Mulivariate association analysis of rare variants in family-based designs.
Canadian Human Statistical Genetics meeting, Estérel, Québec, Canada, 22-24 Avril, 2013.
Oualkacha, K. Rare variant association analysis for family-based designs. Conférencier
invité. Département des sciences biologiques (BioMed), UQÀM, 26 Février 2013.
Oualkacha, K. Rare variant association analysis for family-based designs. Conférencier
invite. Département de mathématiques et statistique, Université Laval, 7 Février 2013.
Oualkacha, K., Cingolani, P., Dastani, Z., Li, R., Spector, T. D., Hammond, C. J., Richards,
J. B., Ciampi, A. and Greenwood, C. (2012). Adjusted Sequence Kernel Association Test for
Rare Variants Controlling for Cryptic and Family Relatedness. International Genetic
Epidemiology Society meeting, Stevenson, Washington, USA, 18-20 Octobre, 2012.
Oualkacha, K., Cingolani, P., Dastani, Z., Li, R., Spector, T. D., Hammond, C. J., Richards,
J. B., Ciampi, A. and Greenwood, C. (2012). Adjusted Sequence Kernel Association Test for
Rare Variants Controlling for Cryptic and Family Relatedness. Canadian Human Statistical
Genetics meeting, Niagara-on-the-Lake, Ontario, Canada, 29 Avril au 2 Mai, 2012.
Oualkacha, K., Labbe, A. et Ciampi, A. Principal components of heritability for high
dimension quantitative traits and general pedigrees. Congrès annuel de la Société Statistique
du Canada, Université de l’Acadie, Wolfville, Nouvelle-Écosse, Canada, 12-14 Juin 2011.
Oualkacha, K., Labbe, A. et Ciampi, A. Analyse en composantes principales d’héritabilité.
Atelier de “Computational Statistical Methods for Genomics and Systems Biology”, Centre
de Recherches Mathématiques (CRM), Montréal, Canada, 18-22 Avril 2011.
Oualkacha, K. et Rivest, L. P. Modèles statistiques pour les données de SE(p). Congrès
annuel de la Société Statistique du Canada, Université d’Ottawa, Ottawa, Ontario, Canada,
25-27 Mai 2008.
Oualkacha, K. et Rivest, L. P. Un modèle statistique pour les données directionnelles.
Congrès annuel de la Société Statistique du Canada, University of Western Ontario, London,
Ontario, Canada, 28-31 Mai 2006.
Oualkacha, K. et Rivest, L. P. Un modèle statistique pour les données directionnelles.
Colloque pan-québécois annuel des étudiants, ISM, Université Laval, Québec, QC, Canada,
23-25 Mai 2006.
Autres Présentations Orales
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Oualkacha, K. Mars 2012. Multivariate Adaptive Sequence Kernel Association Test for Rare
Variants Controlling for Cryptic and Family Relatedness. Club de Lecture de l’institut Lady
Davis de recherches médicales, Hôpital Général Juif, Université McGill.
Oualkacha, K. Décembre 2011. Adaptive Sequence Kernel Association Test for Rare
Variants Controlling for Cryptic and Family Relatedness. Club de Lecture de l’institut Lady
Davis de recherches médicales, Hôpital Général Juif, Université McGill.
Subventions de Recherche
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Subvention à la découverte CRSNG, “Modélisation Multivariée dans les études génétiques”,
2013-5 ans.
Autres Activités Professionnelles
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Membre de comité responsable du site web du département de mathématiques de l’UQÀM,
depuis juin 2012.
Membre du comité syndical du département de mathématiques de l’UQÀM, depuis juin 2012.
Membre de comité responsable du programme de remboursement de frais de déplacement
d’étudiants des universités canadiennes qui souhaitent participer aux congrès annuels de la
Société Statistique du Canada.
Membre de comité de lecture: Révision d’articles scientifiques pour Journal of Statistical
Applications in Genetics and Molecular Biology et Journal of Computational Statistics and
Data Analysis.
Ateliers et Formation
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Cycle de formation, Décembre 2011 : Atelier sur les méthodes d’analyse et l’interprétation
des données reliées au séquençage de nouvelles générations à ultra haut débit. New Residence
Hall de l'Université McGill, Montréal.
Cycle de formation, Juin 2010: Atelier sur les populations génomiques et l’épidémiologie
génétique, Centre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine, Centre de recherche, Montréal.
Compétences Spécifiques
Langages de programmation : C, Fortran, Perl.
Logiciels statistiques : R, WinBUGS, SAS.
Logiciels de statistique génétique : Linkage, Merlin, Solar, Mendel, SIMULATE, Simwalk2,
Mega2.
Information Personnelles
Citoyenneté : Marocaine et Canadienne
Langues : Arabe (avec facilité), Français (avec facilité), Anglais (parler, lire et écrire).