CV Prof. N. Boukhatem
Transcription
CV Prof. N. Boukhatem
Université Mohammed Premier Faculté des Sciences Oujda Prof. Noureddine Boukhatem Enseignant Chercheur Curriculum Vitae 2016 1 CURRICULUM VITAE Dr. BOUKHATEM NOUREDDINE 1. IDENTIFICATION Nom et prénom : BOUKHATEME NOUREDDINE Date de naissance : 27-12-1963 Titre professionnel : PROFESSEUR ENSEIGNEMENT SUPÉRIEUR grade B Organisme d'affiliation : FACULTÉ DES SCIENCES OUJDA Adresse professionnelle : DÉPARTEMENT DE BIOLOGIE, FACULTÉ DES SCIENCES, Bd MOHAMED VI, 60050 OUJDA Téléphone professionnel : 0536500601, Poste : 177 Télécopieur : 0536500603 Courriel : [email protected] ; [email protected] 1.2. DOMAINES D'EXPERTISE Génétique Cancer, Biologie moléculaire Génétique des Virus Présentation personnelle Je suis professeur à l'Université Mohammed Premier, depuis 1991 où j'enseigne la génétique. J'ai obtenu mon doctorat en génétique moléculaire des micro-organismes. Mes domaines de recherche sont liés à la génétique des virus, la génomique, la génétique du cancer et, plus récemment, la métagénomique en relation avec le cancer est devenue une de mes préoccupations majeures. J'étais directeur du Laboratoire de génétique et de biotechnologie de notre Faculté des Sciences d'Oujda, de 2002 à 2010. Je suis actuellement directeur du Laboratoire de contrôle d'analyse et de qualité depuis 2010. Je suis vice directeur du laboratoire de Physiologie Génétique et Ethnopharmacologie, mon équipe est coordinatrice du réseau bioinformatique marocains et coordinateur du réseau bioinformatique africains H3 pour le Maroc. J'ai aussi fait partie des différents projets de collaboration internationale (Belgique, France) et maintenant je prends un rôle actif au sein de H3ABioNet (Réseau de bioinformatique africaine, numéro Grant: 1U41HG006941-01; financé par NIH/USA). Mes compétences scientifiques sont centré autours des interactions hôte-microbe avec divers systèmes: 1.interaction drosophile- virus sigma, 2.interaction blé-rouille jaune, 3.interaction blé-odium, 4.interaction tomate-virus TYLC, 5.interaction plantes légumineuse-bactéries nodulantes et en utilisant différentes approches couvrant un large spectre de la génétique et de la microbiologie. Récemment, mes intérêts se sont portés sur l'interaction hôte-Microbe chez l'Homme; afin étudier les interactions entre le microbiome intestinal humain et le cancer du côlon Grace à de nouvelles approches dont la métagénomique et la bioinformatique. 1.3. DOMAINE DISCIPLINAIRE Sciences et techniques du vivant 2 2. FORMATION ACADÉMIQUE Diplôme Spécialité DOCTORAT D'ÉTAT GÉNÉTIQUE DOCTORAT D'UNIVERSITÉ DEA MAITRISE GÉNÉTIQUE DES VIRUS GÉNÉTIQUE DES MICROORGANISME GÉNÉTIQUE License Biologie Animale Institution, ville et pays Année d’obtention UNIVERSITÉ MOHAMED PREMIER, OUJDA Université Paris Sud, Orsay, FRANCE Université Paris Sud, Orsay, FRANCE Université Pierre et Marie Curie Paris, FRANCE UNIVERSITÉ MOHAMED PREMIER, OUJDA 2001 1991 1998 1987 1986 Université Pierre et Marie Curie Paris, France, Classé 34ème parmi les 500 premières universités au monde (Classement de Shanghai) Université Paris Sud, Orsay, FRANCE, Classé 42ème parmi les 500 premières universités au monde (Classement de Shanghai) 3. LANGUES Langue Mention Arabe Très Bon Français Très Bon Anglais Bon à Très Bon 4. EXPÉRIENCE PROFESSIONNELLE Poste occupé Institution, ville et pays Date du début (mm/aa) Date de fin (mm/aa) Professeur de génétique Faculté des sciences Oujda 11/1991 En cours Chercheur Département de Biotechnologie/ Centre wallon de recherches Agronomiques/ Gembloux/ Belgique 10/1997 10/2001 Directeur Laboratoire de génétique et biotechnologies 10/2003 10/2008 Directeur Laboratoire d’Analyses et Contrôle Qualité 11/2006 En cours Directeur Centre Universitaire du Développement de la Région de l’Orientale 02/2013 01/2016 3 Responsabilité universitaire Membre au conseil de l’université 2003/2006 Membre de la commission préparation du statue interne de l'université Membre de la commission du budget de l'université Membre de la commission Coopération et recherches scientifiques de l'université Membre de la commission pédagogique de l'université Membre du conseil de gestion de l'université Membre de la commission administrative paritaire 2010-2016 Vice chef de département 2005/2007 Membre aux commissions de département (Responsable de l’unité de génétique et membre de la commission du marché) 2002-2008. 5. ASSOCIATIONS PROFESSIONNELLES 1990- Membre fondateur, Association Marocaine des Biologistes (France), BIOMATEC 1995- Membre, Association Marocaine de Biologie of cellulaire, AMCB 2011- Membre, Société Marocaine de Télémédecine et e-Santé 2003, 2005 Membre du bureau local de SNESUP 2007 Secrétaire général Bureau local SNESUP 2007 Membre du bureau Régional de SNESUP 6. ACTIVITES D’ENSEIGNEMENT Responsable du module génétique et Biologie moléculaire Responsable du cours de génétique B3 Responsable du cours de génétique G3 Responsable de TP Génétique B3 Responsable de TP Génétique G3 Responsable du cours complément de génétique BV4 et BA4 Responsable du cours de génétique S3 Responsable de TP Génétique S3 Responsable de TP de l’élément 1 du module génétique et Biologie moléculaire Responsable du cours Régulation génétique Module Biologie moléculaire Responsable du cours amélioration génétique des plantes (DESA : production végétale) Responsable du cours les médicaments (DESA : chimie) Responsable de TP génétique et Biologie moléculaire DESA Ethnopharmacologie Responsable de Certificat d'Etudes Universitaires oncogénétique 4 Publication livre : Génétique Fondamentale: Avec modèles d'Examens Corrigés Éditeur Editions universitaires Européennes EUE, 2011 ISBN 3841785026, 9783841785022 Longueur 308 pages Encadrement : PFE, et Masters 7. PRODUCTION SCIENTIFIQUE Articles scientifiques Publication et citations (voir le lien ci dessous) https://scholar.google.fr/citations?user=0Bqmw7QAAAAJ&hl=fr 1. Abdellah HAMAL1 Abdelkarim GUAÂDAOUI1, Ilyass El-ALAMI1, Malika ABID2, Noureddine BOUKHATEM1, Mohammed LECHKAR3. Contribution to Botanical, Phyto-ecological and Phytochemical Studies of Calicotome villosa (Poiret) Link subsp. intermedia (C. Presl): A Phylogenetic Approach from Moroccan Species. International Journal of Green and Herbal Chemistry 5 (2), 093-111 (2016) 2. A Kopf, M Bicak, R Kottmann, J Schnetzer, I Kostadinov, K Lehmann,... .N Boukhatem, ...The ocean sampling day consortium. GigaScience 4 (1), 1 (20015). 3. Abdelkarim GUAADAOUI, Rafik SADDIK, Abderahime BOUALI1 , Noureddine BOUKHATEM, Nour Eddine BENCHAT , Abdellah HAMAL1. Betalains, polyacetylenes and tocols as biocompounactives: a concise review for enriching the bioactivity concept. International Journal of Nutrition and Food Sciences 3 (4), 230-237 (2014) 4. Boukhatem, N., Jdaini, S., Muhovsky, Y., Jacquemin, J.M. Del Rincone, C.L., Die,z M. J. &am;pam;p Bouali, A : Molecular characterisation of tomato yellow leaf curl virus Alm [Ma:Bk:02] in Morocco: complete sequence and genome organisation. Journal of Plant Pathology 90: 109-112 (2008) 5. Hanane Benataa, Ourarhi Mohammeda, Boukhatem Noureddine, Berrichi Abdelbasseta, Hanaa Abdelmoumena, RosellaMuresuc, Andrea Squartinid, Mustapha Missbah El Idrissi : Diversity of bacteria that nodulate Prosopis juliflora in the eastern area of Morocco. Systematic and Applied Microbiology 31 (2008) 378–386 6. Boukhatem, N., Jdaini, S., Muhovski, Y., Jacquemin, J.M. &am;pam;p Bouali, A: Identification Bemisia tabaci (Gennadius; Homoptera: Aleyrodidae) based on RAPD and design of two SCAR markers. Journal of Biological Research-Thessaloniki 8: 167-176 (2007) 7. Bouali, A, Bellirou, A.,. Bouamali, B., Boukhatem, N., Hamal, A., Bouamali B., Enzymatic detoxification of jojoba meal and effect of the resulting meal on food intake in rats. Natural Product Research, Vol. 22, No. 7, 1–10 (2007). 8. Extraction of simmondsin and oil in one step from jojoba seeds. A.Bellirou a, B. Bouammali b, N. Elmtili c, N. Boukhatem a, A. Hamal, M. El-Mourabit a and A. Bouali . Industrial Crops and Products 21 (2005) 229-233. 9. Quantitative trait loci for resistance against Yellow rust in two wheat-derived recombinant inbred line populations. Boukhatem, N.; Baret, P. V.; Mingeot, D.; Jacquemin, J. M. Theoretical and Applied Genetics, 2002, vol. 104, no. 1, pp. 111-118 10. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis of markers associated with H5 and H22 Hessian fly resistance genes in bread wheat. Najimi, B.; Boukhatem, N.; El Jaafari, S.; Jlibene, M.; Paul, R.; Jacquemin, J. M. Biotechnologie Agronomie Societe et Environnement, 2002, vol. 6, no. 2, pp. 79-86 5 11. Mapping QTL involved in adult plant resistance to powdery mildew in the winter wheat line RE714 in two susceptible genetic backgrounds. Mingeot, D.; Chantret, N.; Baret, P. V.; Dekeyser, A.; Boukhatem, N.; Sourdille, P.; Doussinault, G.; Jacquemin, J. M.Plant Breeding, 2002, vol. 121, no. 2, pp. 133-140 12. Genetic and molecular features of S(uP), a gene that interacts with ref(2)P in male fertility of Drosophila melanogaster. Bichon, A.; Boukhatem, N.; Gay, P.; Dru, P.; Terzian, H.; Petitjean, A.-M.; Lemeunier, F.; Contamine, D.Molecular Genetics and Genomics, 2001, vol. 265, no. 2, pp. 354-361 Communications aux congrès 1. Composition of the gut microbiome of colorectal cancer patients from Morocco. Imane Allali; Noureddine Boukhatem; Leila Bouguenouc; Hanaa Hardi; M. Belen Cadenas; Karim Ouldim; Saaïd Amzazi; M. Andrea Azcarate‐ Peril and Hassan Ghazal. NGS' 16; Genom Annotation, April 4-6 2016; Barcelona; Spain 2. Etude de l’implication des polymorphismes des gènes MTHFR, ERCC2, SOD2 et IL6 dans la survenue du cancer du sein dans la population de l’Oriental du Maroc : Etude cas-témoins; Hanaa HARDI, Fadoua ZARHOUNI, Mohamed EL OUARDANI, Jalal NOURLIL3, Zouhour BOUGHALEB,, Jalal TALBI, Noureddine BOUKHATEM. The 2nd International Congress on Cancer, Beni Mellal (ICCBM2); May 19-21, 2016 - Beni Mellal - Morocco 3. Moroccan Clinical Avatar for Breast Cancer Risk Prediction in Moroccan Population. International 4th African Bioinformatics Conference, Casablanca. Yassine Souilmi1, Hassan Ghazal2,3, Noureddine Boukhatem2, Saaid Amzazi1, Peter J. Tonellato4 http://www.iscb.org/iscbafrica2013 4. Study of the association between the composition of the gut microbiota and the incidence of colon cancer in the Moroccan population using a metagenomic approach. International 4th African Bioinformatics Conference, Casablanca. Imane Allai1, Hassan Ghazal2,3, Noureddine Boukhatem, Saaid Amzazi. http://www.iscb.org/iscbafrica2013 5- Caractérisation Moléculaire du virus TYLCV de la région de Berkane Les journées Nationales de Microbiologie : rôle de la microbiologie dans le développement Socioéconomique. Jdaini,S., Boukhatem,N., Bouali,A 27-28 Mai 2005 Faculté des sciences, Oujda 6. An easy and a practical process of extraction of simmondsin and oil in one step from jojoba seeds. A.Bellirou, B. Bouammali, N. Boukhatem, A. Bouali And Berrichi. Les biotechnologies au Maroc, état des lieux et domaines prioritaires. Settat - Maroc. 06 Mai 2005 7. Tomato yellow leaf curl virus: Sequences comparisons with Almeria and Israel TYLCV isolates and identification of the virus from Berkane. Jdaini,S., Boukhatem,N., Bouali,A Les biotechnologies au Maroc état des lieux et domaines prioritaires. Settat - Maroc. 06 Mai 2005 8. Investigation of possible biological activity of simmondsin and its derivatives ère A.Bellirou, B. Bouammali, N. Boukhatem, A. Hamal and A. Bouali. 1 rencontre nationale sur les substances naturelles : la Valorisation et développement. UFR de valorisation des Substances Naturelles et environnement, Errachidia, Maroc, Septembre 2005 9. Effect of Detoxified Jojoba Meal on Food Intake in Rats ère A. Bouali, A.Bellirou, B. Bouammali, A. Melhaoui and M. Aziz. 1 rencontre nationale sur les substances naturelles : la Valorisation et développement. UFR de valorisation des Substances Naturelles et environnement, Errachidia, Maroc, Septembre 2005 10. Investigation of possible biological activity of simmondsin and effect of detoxified jojoba meal on food intake in rats. A.Bellirou, B. Bouammali, N. Boukhatem, A. Bouali and R. Touzani La 4ème Ecole FRANCO-MAROCAINE de Neurosciences Comportementales et Cognitives. Pathologies humaines et les déficits du développement : méthodes thérapeutiques. 1-2 Décembre 2005 Faculté des sciences, Kenitra 11. Synthesis and biological activity of simmondsin and its derivatives A. Bouali, A.Bellirou, B. Bouammali, N. Boukhatem, and A. Hamal. Colloque international chimie moléculaire et molecules bioactives. Meknes, Maroc, 4-5 Mai 2006 12. Selective extraction of simmondsine, a toxic component, and its quantification in the crude meal. A. Bellirou, A. Bouali, B. Bouammali, N. Boukhatem, and A. Hamal Deuxième symposium international sur les plantes aromatiques et médicinales 6 Marrakech 14-16 septembre 2006-12-22 13. Typing of tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) in Morocco S. Jdaini., A Bouali., Y. Mohofsky and N. Boukhatem. Université Mohamed 1er en partenariat avec le CUD. Partenariat pour le développement de la région orientale du Maroc 14. Quantification of simmondsin, a toxic component in the extract obtained from the ground jojoba seeds. A. Bouali., A. Bellirou, B. Bouammali, A. Bellerou and N. Boukhatem. Université Mohamed 1er en partenariat avec le CUD. Partenariat pour le développement de la région orientale du Maroc 15. Domestication, Amélioration et valorisation du Jojoba (simmondsia chinesis) au Maroc oriental A. Bellirou et A. Bouali., Université Mohamed 1er en partenariat avec le CUD. Partenariat pour le développement de la région orientale du Maroc 16. Recherche des Marqueurs moléculaires d’identification de sexe de jojoba Quaddouri, B., Boukhatem, N., Bouali, A et Hamal. A. Université Mohamed 1er en partenariat avec le CUD. Partenariat pour le développement de la région orientale du Maroc 17. Genetic diversity of Morocco populations of Bemisia abaci (Hemiptera : Aleyrodidae) based on Random Amplified polymorphic DNA-Polymerase chain reaction (RAPD). S. Jdaini, A. Bouali and N. Boukhatem. La journée nationale de l’environnement, Oujda le 5 juin 2006, Faculté des sciences 18. Investigation into the modification of simmondsin and search for possible biological activities A. Bouali., N. Boukhatem A. Hamal and B. Bouammali. Congrès international sur les plantes médicinales et aromatque. Faculté de médecine et de pharmacie Fes ; 22, 23 et 24 mars 2007 19. Etude de pathosystème: Tomate (Lycopersicon esculentum) TYLCV (tomato yellow leaf curl virus)/ mouche blanche (Bemisia tabaci) au nord est du Maroc. S. Jdaini, A. Bouali et N. Boukhatem Congrès international sur les plantes médicinales et aromatque. Faculté de médecine et de pharmacie Fes ; 22, 23 et 24 mars 2007 20. Effect of pure simmondsin and its synthesised derivatives on the food intake in Rats A. Bouali., A. Bellirou, N. Boukhatem And R. Touzani. Congrès international sur les plantes médicinales et aromatque. Faculté de médecine et de pharmacie Fes ; 22, 23 et 24 mars 2007 21. Chemical and enzymaic modification of simmondsin and its demethylated analogues A. Bouali, A. Bellirou, B. Bouammali and N. Boukhatem. 3ème symposium international sur les plantes aromatiques et médicinales, 1 er congrès international sur les molécules bioactives. Oujda : 28, 29 et 30 mai 2008 22. Food intake inhibitory activity of defeated jojoba meal and detoxified jojoba meal : dose response curves in rats. Bouali, A. Bellirou, B. Bouammali and N. Boukhatem. 3ème symposium international sur les plantes aromatiques et médicinales, 1 er congrès international sur les molécules bioactives. Oujda : 28, 29 et 30 mai 2008 23. Chemical ccomposition of moroccan jojoba seeds A. bellirou, A. Andriamananjara, N. Boukhatem, B. Bouammali and A. Bouali. 3ème symposium international sur les plantes aromatiques et médicinales, 1 er congrès international sur les molécules bioactives. Oujda : 28, 29 et 30 mai 2008 24. Molecular characterisation of tomato yellox leaf virus (TYLCV) in Morocco: complete sequence and genome organisation. S. Jdaïni, A. Bouali, J. M. Jacquemin, C. L. Del Rincone, M. J. Diez and N. Boukhatem. Deuxième édition du Congrés national Amélioration de la Production Agricole (APA2). Settat-jeudi-vendredi-03-04 Avril 2008. 25. Detection of Tomato Yellox Leaf Virus(TYLCV) in Morocco by PCR Analysis. S. Jdaïni, A. Bouali, J. M. Jacquemin, C. L. Del Rincone, M. J. Diez and N. Boukhatem. Deuxième édition du Congrés national Amélioration de la Production Agricole (APA2). Settat-jeudi-vendredi-03-04 Avril 2008. EXPÉRIENCE EN ENCADREMENT (DOCTORAT ET POST-DOCTORAT) Codirecteur de thèse de Melle JDAINI : soutenance en 2008 Codirecteur de thèse de Mme Hanane Daoudi : soutenance en 2011 Directeur de thèse de Mme Hanae Hardi : en cours 7 Directeur de thèse de Melle Fadoua Zerhouni : en cours Membre de jury de thèse de Melle Amal El Amrani Rapporteur et Membre de jury de thèse de Melle Nadya Mezzoug Rapporteur et Membre de jury de thèse de Melle Imane Agouti Membre de jury de thèse de Mr Ahmed Bellirou Membre de jury de thèse de Melle Samira jdaïni ORGANISATION DE CONGRES ET WORKSHOPS January 2013, 07-12 November 2012, 26-27 “Introduction to Bioinformatics Workshop 2013”, Rabat, Morocco http://medicalintelligence.org/ibi2013/ “Newborn Screening in Morocco”, Fez, Morocco http://www.medicalintelligence.org/nbsm2012 October 2012, 01- “NCBI Molecular Tools and Resources Workshop 2012”, Rabat, Morocco 03 http://www.medicalintelligence.org/ncbi2012/ “ Bioinformatics, Medical Information and Translational Medicine ”, January 2012, workshop, Rabat, Morocco 02-07 March 2011, 2831 January 2011, 10-15 http://www.medicalintelligence.org/bmitm2012/ “NCBI Molecular Biology Resources and Tools” workshop, Rabat, Morocco http://www.medicalintelligence.org/ncbi2011/ (webpage unavailable) “Computational Biology and Bioinformatics” workshop, Rabat, Morocco Organisation d’événements Scientifiques La série d’ateliers des outils et ressources bioinformatique de la National Center for Biotechnology Information (NCBI) qui est la source mondiale numéro 1 d’information biotechnologique et médicale. C’est le seul atelier dans le genre à se dérouler régulièrement depuis 2009 en dehors des USA. NCBI workshop : Tools and Resources I : Rabat, 14-19 December 2009 - NLM sponsorship NCBI workshop : Tools and Resources II : Rabat, 28-31 March 2011 - NLM sponsorship NCBI workshop : Tools and Resources III : Rabat, 01-04 October 2012 - NLM sponsorship Des ateliers d’introduction à la bioinformatique en faveur des étudiants Master, doctorants et chercheurs au niveau national, d’où leur organisation à Rabat, et qui sont sponsorisé par la National Library of Medicine, dont le NCBI fait partie. Bioinformatics : General Introduction workshop: Rabat, 10-15 January 2011-NLM sponsorship Medical Information & Translational Medicine workshop: Rabat, 2-7 January 2012, NLM sponsorship Série d’ateliers en dépistage néonatal, dont l’objectif est la mise en place du programme national de dépistage de maladies génétiques chez le nouveau né au Maroc. Cette sérié se fait en collaboration avec le NIH américain, et la multinationale Perkin Elmer. Newborn Screening in Morocco workshop I, 26-27 November 2012, Fes, Morocco, Newborn Screening in Morocco workshop II, 9-10 April 2014, Fes, Morocco, 8 8. GESTION D’UNE STRUCTURE DE RECHERCHE Directeur du laboratoire Génétique et biotechnologies végétales 2002-2006 Directeur du laboratoire Génétique et biotechnologies 2006-2008 Coordonateur local du pôle de compétence MiSoBioP 2003-2008 Membre de l’UFR Biochimie appliqué 2000-2004 Membre de l’UFR Biochimie appliqué 2004-2008 Membre de l’UFR DESA Production Végétale 2005-2007 Membre de l’UFR DESA ’’Chimie appliquée’’ 2005-2007. Membre de l’UFR DESA ’’Plantes Médicinales et Aromatiques : de l’Ethnobotanique à l’Ethnopharmacologie’’ 2005-2007 9. SUBVENTIONS ET CONTRATS DEJA OBTENUS Titre de la subvention /contrat Rôle (demandeur principal/codemandeur /collaborateur) NIH-National Institute Collaborateur of Health USA Montant (DH) 1 608 225 Source de financement Date du début (mm/aa) Date de fin (mm/aa) Gouvernement USA 2012 2017 CUD - Commission universitaire pour le Développement Responsable 1 100 000 Gouvernement Belge 2004 2012 PROTARS N° P51/30 collaborateur 300 000 ministère de l'enseignement 2002 2005 PGR collaborateur 500 000 ministère de l'enseignement 2003 2008 CUDRO Directeur 1 015 000 Revenu Formation continue 2014 - * Membre des instances de coordination du programme de coopération avec la Belgique CUD depuis 2004. * Gouvernement du royaume de Belgique, DGCI, bourse de coopération 1997-2001 * Visiteur dans le cadre du programme d’échange Maroc-USA : Fulbright Visiting, John Craig Venter Institute (San Diego, CA), de juillet à novembre 2012 10. AUTRES EXPERIENCES ET COMPETENCES Conseiller Municipale, Commune urbaine d’Oujda, mandat 2009 à 20015 9